Apple Vision Pro, macOS, iOS ve iPadOS’un temelini alan visionOS işletim sistemiyle çalışıyor. Bu nedenle, bu işletim sistemlerinde çalışan pek çok uygulama Vision Pro ile uyumlu olacak. Ayrıca, Apple ve diğer geliştiriciler Vision Pro için özel olarak tasarlanmış yeni uygulamalar da sunacak.