EMDR seanslarının süresi, hastanın ihtiyacına ve terapistin uygulama yöntemine göre değişebilir. Genellikle bir EMDR seansı 50 ila 90 dakika arasında sürer. Bununla birlikte, bir hastanın ihtiyacı doğrultusunda birkaç seans arasında daha uzun veya daha kısa süreli seanslar da yapılabilir. Terapist, hastanın durumunun belirlenmesi ve tedavinin planlanması için ilk seansta daha fazla zaman ayırabilir.