Anne ve fetüse bağlı değişik faktörler bebeğin kısa boylu doğmasına etki edebilir. Örneğin annenin gebelik sırasında geçirdiği enfeksiyonlar, madde kullanımı, beslenme durumu, plasenta bozuklukları bebeğin kısa boylu doğmasına yol açan nedenlerden bazılarıdır. Bununla birlikte birçok genetik bozuklukta bebekler küçük doğarlar. Bebeğin kısa boylu doğması büyüme hormonu eksikliği bulgusu değildir.