Rota virüsü enfeksiyonları genellikle 3-7 gün sürer. Ancak süre bireyden bireye, enfeksiyonun şiddet derecesine ve diğer faktörlere bağlı olarak değişebilir. İlk birkaç gün içinde şiddetli ishal, kusma ve ateş gibi semptomlarla karakterize olan akut evre genellikle zirve yapar. Enfeksiyon ilerledikçe semptomlar genellikle geçer ve çoğu insan belirli bir tıbbi tedavi olmadan iyileşir.
Semptomlar düzeldikten sonra bile, virüs dışkıda birkaç gün boyunca yayılmaya devam edebilir ve bu da başkalarına bulaşma riski oluşturabilir. Rota virüsü enfeksiyonu sırasında ve sonrasında, virüsün yayılmasını önlemek için özellikle el yıkama gibi iyi hijyen uygulamaları önemlidir. Ciddi durumlarda veya komplikasyon içeren durumlarda, tıbbi müdahale gerekebilir ve özellikle bebeklerde ve küçük çocuklarda dehidratasyon yakından izlenmelidir.