Pegasus Hava Yolları farklı uçak seçenekleriyle toplamda 42 ülkede 111 farklı destinasyona uçuş gerçekleştirmektedir. Batum, Menide, Riyad, Venedik gibi çok farklı noktalara uçmaktadır. Firmanın uçuş ağını MartiGo üzerinden görmek mümkündür.