Medikal ambalajların sterilizasyonu için farklı yöntemler kullanılmaktadır. Etilen oksit gazı, plastik malzemelerin iç kısımlarına nüfuz edebilir ve bu nedenle birçok medikal ambalajda bu yöntem kullanılır. Buhar sterilizasyonu, medikal ambalajların bir kısmında kullanılır ancak büyük ebatlı ambalajların sterilizasyonu için uygun değildir. Gamma ışınları kullanarak sterilizasyon, ambalajlama işlemi sonrasında gerçekleştirilir ve özellikle tek kullanımlık tıbbi araçlar için idealdir. Herhangi bir sterilizasyon yöntemi kullanılırken ambalajların zarar görmemesi ve içerisindeki malzemelerin steril kalması önemlidir.