Ovaryen hiperstimülasyon sendromu (OHSS): İlaçlar kullanılarak yumurtaların toplanması sırasında, yumurtalıkların aşırı şişmesi sonucu oluşan bir durumdur. OHSS semptomları arasında şişlik, ağrı, bulantı, kusma, idrar yolu enfeksiyonları ve düşük tansiyon gibi belirtiler olabilir.
Embriyo transferi sırasında enfeksiyon: Embriyo transferi sırasında, rahim içine enfeksiyon girebilir.
Çoğul Gebelik: Çiftler gebelik şansının yüksek olması amacıyla çok sayıda embriyo transferi istesede çoğul gebelik çok istenen bir durum değildir, bazen erken doğum hatta bebek kayıplarına sebep olabilir.
Gebelikte kayıp: Tüp bebek tedavisi sonrası gebelikte de normal gebeliklerdeki gibi kayıp oluşabilir.
Psikolojik etkiler: Tüp bebek tedavisinde, çiftler üzüntü, endişe ve stres yaşayabilir.