GNS3'te Cisco cihazlarını kullanmak için öncelikle resmi web sitesinden indirip yükleyiniz. Daha sonra kullanmak istediğiniz IOS dosyasını edinin. Örneğin, bir Router cihazı kullanıyorsanız, bunu Edit > Preferences > IOS Routers konumundan ekleyin. Ardından yeni bir proje oluşturun ve içe aktarılan cihazı çalışma alanına sürükleyin. Son olarak cihazı başlatın ve sanki fiziksel bir Cisco cihazıymış gibi testler yapın.