Farelerin renkleri de türlerine göre değişkenlik gösterir. Renkleri; beyazdan açık kahverengiye, koyu kahverengiye, gümüşe, griye veya siyaha kadar değişebilir. Bazı fareler ikili renklenme de sergileyebilirler. Beyaz ve kahverengi, bu kombinasyonların en yaygın olanıdır. Evlerimizde sıklıkla karşılaştığımız ev farelerinin rengi ise açık kahverengi veya gri ve siyah arası bir renkte olurlar.