Her ameliyatta olduğu gibi saç ekiminde de potansiyel komplikasyonlar olabilir. Kızarıklık ve iltihaplanma gibi saç ekimi sonrası komplikasyonlar meydana gelebilir. Ancak bunları en aza indirmek ekibin elindedir. Bu nedenle saç ekimi için bir klinik seçerken dikkatli olmalısınız. Bu seçimi yaparken ameliyat ekibinin tecrübesine, daha önce olumlu sonuç almış hastaların referanslarına ve ameliyatın yapıldığı steril, hijyenik ortama dikkat etmelisiniz.