Lazerle genital siğil tedavisinde en çok merak edilen konuların başında işlem sırasında acı ya da ağrı hissedilip hissedilmediği sorusu yer alır. Lazer tedavisi sırasında genital siğillerin yerinden koparılması, soyulması ya da kesilmesi gibi cerrahi durumlar söz konusu değildir. Lazer tedavisinde hastanın siğilleri lazer ışınları sayesinde kurutularak dökülür. İşleme başlamadan önce hastanın siğillerinin olduğu bölgeye lokal anestezi uygulanır. Bu nedenle hasta hem tedavi sırasında hem de tedaviden sonra herhangi bir acı ya da ağrı hissetmez. Lazerle genital siğil tedavisi sırasında hastanın siğillerinin olduğu alanda kızarmalar ve kabuklanmalar görülür. Bunlar 2-3 hafta içerisinde tamamen iyileşir. Bu süreçte hastanın kabuklanma yaşanan bölgelerinde iyileşmeden kaynaklı kaşıntı hissi oluşabilir. Ancak bunun dışında işlem sırasında ya da sonrasında hastanın günlük yaşantısını rahatsız edecek herhangi bir ağrı ya da acı hissi görülmez.