İşletim sistemi kontrol panel veya çalışması bakımından bir fark yoktur, asıl fark fiziksel sunucularda tüm kaynakların seçime göre tamamiyle size ait olmasıdır. Büyük projeler yada direk sunucu kaynağına erişim duyan SQL uygulamalarında fiziksel sunucuları seçmek yerinde olacaktır. Günümüz yeni teknolojilerle birlikte Cloud VDS sunucularla fiziksel sunucu performansları arasında çok bir fark kalmamıştır.