Kolposkopi işlemi; anestezi gerektirmeyen, ağrısız ve acısız oldukça güvenli bir inceleme yöntemidir. İnceleme sırasında biyopsi dışında vajina içerisinde herhangi bir uygulama yapılmaz. Bu nedenle kolposkopi yöntemi rutin muayene sırasında anestezi kullanmadan yapılabilir. Biyopsi alınsa dahi genellikle rahim ağzından veya rahim kanalından parça alınır. Bu bölgede yer alan duyusal sinirler çok az olduğu için hasta çoğu zaman parça alındığını dahi hissetmez. Kolposkopi yapılan hastalarda aynı işlem tekrar uygulanabilir. Kolposkopi sırasında biyopsi uygulandığında milimetrik boyutta parçalar alındığı için çoğu zaman küçük kanamalar dışında ciddi komplikasyonlar meydana gelmez. Biyopsi yapılan hastalarda, inceleme sırasında kullanılan asidik sıvılar nedeniyle birkaç gün vajinal akıntı yaşanabilir. Ancak nadiren de olsa bazı hastalarda kanamanın yanı sıra vajinadan kötü kokulu, sarı renkli akıntı, karın ağrısı, yüksek ateş gibi belirtiler görülebilir. Bu belirtiler çok nadir gözüktüğü için, belirtilerin geçmediği takdirde hastaların en kısa sürede doktora başvurması gerekir.