VDS sunucularda cPanel Kontrol Paneli ile Plesk Obsidian Paneli vardır. Sanal sunucular kontrol panelleri sayesinde herhangi bir komut kullanma gerekliliği kalmadan tüm yönleriyle yönetilebilir. Bu sayede yeni kullanıcılar ekleme, veri tabanlarını yönetme, popüler yazılımları yükleme, e-mail yapılandırmalarını sağlama, yedekleme ve geri yükleme gibi pek çok farklı işlem gerçekleştirilebilir. cPanel Linux üzerinden çalışan ve CentOS, CloudLinux ve RedHat olmak üzere üç platformu destekleyen bir kontrol panelidir. cPanel’den farklı olarak Plesk, Linux’un kendi içindeki varyasyonları da dahil olmak üzere daha fazla çeşitliliğe sahiptir. Plesk, cPanel’in desteklediklerine ek olarak Ubuntu, Debian ve openSUSE üzerinde de çalışır. cPanel’de WHM ile her kullanıcı özelinde ayrı erişim yetkisi oluşturmak mümkündür. Böylece kullanıcıların kullanabileceği seçeneklerle kaynaklar önceden belirlenir. Plesk panelde bulunan Abonelikler kullanıcının erişebileceği kaynaklarla planları belirleyen planla ilişkilidir. cPanel’de Plesk’e oranda daha karmaşık bir arayüz vardır. Plesk kontrol panelinde daha estetik ve sade bir düzen vardır. Ayrıca son kullanıcı ile yönetici arayüzleri arasında kolay bir geçiş imkanı vardır. cPanel’de PHP versiyon değişikliği, web sitesinin tam yedeğinin alınması, e-posta, domain ve subdomain oluşturma, mail yönlendirme gibi işlemler yapılırken Plesk’te DNS kayıtları düzenlenebilir, SSL sertifikası kurulabilir, ASP.NET ayarları yapılabilir, PHP versiyon değiştirilebilir, hata kayıtlarına ulaşılabilir, disk ve trafik kullanımı izlenebilir, web sitesinin tam yedeği alınabilir ve otomatik web yazılımları kurulabilir.