Vazektomi işlemi sonrası oluşabilecek komplikasyon ihtimali yüzde bir ihtimallidir. Bu cerrahi işlemi olmayı tercih eden kişiler arasından en sık görülen komplikasyonlar, operasyon bölgesinde oluşan kanamalar, enfeksiyon ve de sperm granülomu adı verilen kistik bir yapı oluşmasıdır. Sperm granülomu, herhangi bir şikayete sebep olmaz. Oluşan enfeksiyonlar genellikle antibiyotiklerle kontrol altına alınmaktadır. Yine operasyon bölgesinde oluşan kanamalar ise genellikle pansuman ile durdurulmaktadır.