E-ticaret sitesi yapımında, müşterilere sunulacak ödeme yöntemleri işletmenin ihtiyaçlarına ve hedef kitlesine göre değişir. Genel olarak, kredi kartı, banka havalesi, çek ve nakit gibi yöntemler sunar. Ayrıca, ödeme işleme hizmetleri (örneğin İyzico) de alternatif.