Belirteçleştirme, hacker saldırılarına karşı şifrelemeden daha az savunmasız görünebilir, ancak belirteçleştirmenin bazı dezavantajları da vardır. Şu anda, tüccarların tokenleştirme sırasında karşılaştığı en büyük sorun, mevcut sistemle birlikte çalışabilirliktir.