Fonzip, ödeme sistemleri konusundaki uluslararası standartları PCI-DSS en üst seviyede sağlamaktadır. Bu standartlar American Express, Discover Financial Services, JCB International, MasterCard ve Visa tarafından kurulmuş ve ülkemizden de Bankalararası Kart Merkezi'nin üyesi olduğu PCI Security Standards Council tarafından belirlenmektedir. Bunun dışında tüm Fonzip sayfaları 256 Bit SSL ile şifrelenmektedir ve tüm işlemlerinde 3D Secure kullanımı zorunludur.