Lazer fistül tedavisinde fistül iç ağızdan dış ağıza giden yol tespit edilir fistül yolu dediğimiz kanalın içi temizlenerek epital doku yok edilir daha sonra lazer işlemi uygulanarak fistül yolu kapatılır, bu işlem için tekrar etme riski oldukça düşüktür.