Sprey boyalar ile ilgili en önemli sorunlardan biri de bu boyaların temizliği ile ilgili konudur.
Sprey boya elden nasıl çıkar sorusunun cevabı olarak kullanılan sprey boya çeşidine göre temizlik önerisi yapılabilir. Ancak sprey boyaların birçoğunun su bazlı olması onların bulaştıkları yerden çıkarılmasını basit bir sabunlu su temizliği ile mümkün hale getirir. Bu nedenle sprey boya temizliği kafalarda çok soru işareti bırakmaması gereken konular arasında yer almaktadır.
Metal yüzeye uygulanan bir sprey boyanın bu yüzeyden çıkarılması isteniyorsa selüloz özlü tiner ya da Hindistan cevizi yağı uygulanarak boyanın temizliği sağlanabilir. Boya sökücüler de sprey boyanın temizliğinde kullanılan en etkili yöntemler arasında yer almaktadır. Deneyeceğiniz yöntemler arasında en etkilisi sprey boyayı boya sökücü ile çıkarma yöntemi olacaktır.