Satıcının pazaryeri sistemine entegre ettiği muhasebe programları, gerçekleştirilen her işlemi kontrol ederek çalışır. Örnek olarak müşterinin sipariş ettiği ürünü anında ve gecikmesiz bir şekilde satıcıya bildirir. Böylece satıcı gecikmeden ürünü kargoya verir ve kargonun teslim süreci ilgili entegre muhasebe programı üzerinden kolayca görülebilir.
Muhasebe programları, pazaryeri sisteminde gerçekleşen her işlemi takip eder ve satıcıya bildirir. Bu ve bunun gibi çok sayıda özelliği sayesinde pazaryeri sistemine entegre muhasebe programları oldukça kullanışlı ve pratik sistemlerdir.