Kahve limon karışımı genellikle güvenli olarak kabul edilir, ancak herkesin vücut yapısı farklı olduğu için yan etkileri kişiden kişiye değişebilir. Bazı insanlar mide ekşimesi, ishal veya uyku sorunları gibi yan etkiler yaşayabilir. Aşırı miktarda tüketildiğinde kafein içeriği nedeniyle sinirlilik veya huzursuzluk hissi oluşabilir. Herhangi bir rahatsızlık durumunda kullanmayı bırakmalı ve doktorunuza danışmalısınız.