Kontrol ünitesi genel bir terimken, mikrodenetleyici özellikle entegre bir devre olan ve hafıza, bir veya daha fazla işlemci, I/O portları ve diğer özellikleri barındıran bir çip tipidir. Mikrodenetleyiciler, kontrol ünitelerinin yapısında sıklıkla ana bileşen olarak kullanılır.