Hamburg'da temel havaalanı, Hamburg Havalimanı'dır (Hamburg Airport - Flughafen Hamburg). Şehir merkezine yaklaşık 8-10 km uzaklıkta bulunan bu havalimanı, uluslararası ve yerel uçuşlara hizmet vermektedir. Ayrıca küçük ölçekli uçuşlar için kullanılan Hamburg Finkenwerder Havalimanı da vardır, ancak bu daha çok Airbus tesislerine hizmet eden özel bir havalimanıdır.