Özel Magento sunucu barındırma, MySQL, Percona ve MariaDB dahil olmak üzere yenilikçi ve kanıtlanmış veritabanlarını kullanır. Belki de en yaygın kullanılanı ve en sık uygulananı MySQL'dir. Web uygulamaları ve dijital ticaret projeleri için ideal olan ilişkisel bir veritabanıdır.