Haines Junction konumundaki en sıcak aylar, genellikle 10 °F ortalama sıcaklıkla Temmuz ve Ağustos aylarıdır. Ocak ve Şubat, ortalama sıcaklığın -16 °C olduğu en serin aylardır. Eylül ve Ekim, yağış miktarının en yüksek olduğu aylardır.