Malakit genellikle kalp çakrasıyla ilişkilendirilir. Kalp çakrası veya Anahata çakrası, vücudun merkezinde bulunan ve sevgi, kabul, merhamet ve bağışlama gibi duyguların merkezi olarak kabul edilir. Malakit taşının yeşil rengi, bu çakrayı dengelemek ve aktive etmek için kullanılabileceğine inanılır.