Ketojenik beslenmede sık rastlanan bir yan etki olarak Keto Flu, bedenin savunma sisteminin yarattığı geçiçi bir sendrom olarak tanımlanabilir fakat sağlık problemleri olan, yüksek kilolu kişilerde bu tür diyetlerin başka riskli durumlara yol açması mümkündür. Keto flu baş ağrısı, mide bulantısı, baş dönmesi gibi semptomlarla ortaya çıkar. Gerginlik ve kas kramplarına neden olabilir.