Tüp bebek tedavisi iki farklı şekilde gerçekleştirilir. Bunlardan biri, klasik tüp bebek tedavisi denilen, yani spermlerin laboratuvar ortamında direkt olarak yumurtaların yanına bırakılması ve kendi kendilerinin döllenme işlemini gerçekleştirmesiyle yapılır. Diğeri ise; mikroenjeksiyon yöntemidir. Bu yöntemde mikroskop yardımıyla sperm, direkt yumurtanın içine enjekte edilir. Hangi yöntemin kullanılacağı tamamen çiftin kararına göre belirlenir.