Antibiyotik kullanımında dikkat edilmesi gereken en temel faktör bu sürecin doktor kontrolünde ilerlemesi gerektiğidir. Planlanan tedavi boyunca kullanılan ilaçlara, dozaja ve tedavinin süresine bireyin ihtiyaçlarına göre doktor karar verir. Bu sebeple tedavi sırasında ve sonrasında bu tavsiyelere uymak önemlidir.