Sarımsak yetiştiriciliğinde, bitkinin gelişimini olumsuz etkileyen zararlıların başında kök nematodu, kök soğan akarı, sarımsak dört ayaklı akar ve soğan sineği sayılıyor. En yaygın görülen sarımsak hastalıkları ise sarımsak pası, siyah sarımsak küfü ve fusarium sarımsak olarak sıralanıyor. Sarımsakların, fazla yağışa maruz kalması mantar hastalıklarının yayılmasına imkan veriyor. Eğer yağıştan koruma mümkün değilse, geç dikim yapılması gerekiyor.