Birçok yunus türü Akdeniz'i evi olarak görmektedir; şişe burunlu yunus (Tursiops truncatus) sıklıkla şakacı bir şekilde sıçrarken ve teknelere eşlik ederken görülmektedir. Diğer türler arasında adi yunus (Delphinus delphis), kaba dişli yunus (Steno bredanensis) ve Akdeniz şişe burunlu yunusu gibi bölgesel alt türler bulunmaktadır. Yunusların dağılımının Akdeniz'deki belirli bir konuma göre değişebileceğini unutmamak önemlidir. Akdeniz'i sık sık ziyaret eden iki önemli balina türü minke balinası (Balaenoptera acutorostrata) ve mavi balinadır (Balaenoptera musculus).