ผู้ป่วยโรค PWS มียีนส์ที่เป็นปัญหาบางตัว เนื่องจากยีนส์ที่ได้รับผลกระทบนั้นอาจแตกต่างกันในกลุ่มผู้ป่วย อาการจึงแตกต่างกันไปด้วย อาทิ ความเตี้ย ทักษะการเข้าสังคมมีปัญหาในช่วงวัยทารก ลักษณะใบหน้าที่มีลักษณะเฉพาะ ความผิดปกติในการเรียนรู้ ปัญหาด้านพฤติกรรมและทางจิต การเข้าสู่วัยเจริญพันธุ์ช้าและปัญหาโรคอ้วน