ชนิดของโปรตีนที่ใช้ในเอนทราซอลนั้นประกอบด้วยโปรตีน 2 ชนิดคือ เวย์โปรตีน และเคซีน โดยในเอนทราซอลจะมีสัดส่วนของโปรตีนทั้ง 2 ชนิดในอัตราส่วนที่เหมาะสมต่อการเสริมสร้างกล้ามเนื้อกล่าวคือ จะมีเวย์ โปรตีนอยู่ 75% และมีส่วนที่เป็นเคซีน อยู่ 25% โดย โปรตีนทั้ง 2 ชนิดนี้ จะมีหน้าที่และประโยชน์ที่แตกต่างกันออกไปคือ
เวย์ โปรตีน (Whey Protein): เป็นโปรตีนที่ย่อยง่าย ดูดซึมเร็ว เสริมสร้างกล้ามเนื้อได้อย่างรวดเร็ว และไม่มีอาการท้องอืด เคซีน (Casein): ย่อยและดูดซึมอย่างช้า ๆ จึงช่วยชะลอการสลายของมวลกล้ามเนื้อไว้ให้นานที่สุด