อากาศที่ Port Lincoln มักร้อนที่สุดในช่วงมกราคมและกุมภาพันธ์ โดยมีอุณหภูมิเฉลี่ย 21°C สิงหาคมและกรกฎาคมเป็นเดือนที่หนาวที่สุด โดยมีอุณหภูมิเฉลี่ย 14°C มิถุนายนและกรกฎาคมเป็นเดือนที่ฝนตกเยอะที่สุด