อาการแพ้ควันบุหรี่อาจทำให้เกิดอาการข้างเคียงได้หลายอย่าง ได้แก่ จาม ไอ หายใจมีเสียง หายใจถี่ แน่นหน้าอก ปวดศีรษะ อาการคันในตาหรือน้ำตาไหล และผื่นที่ผิวหนัง ในกรณีแพ้บุหรี่ที่รุนแรง การแพ้ควันบุหรี่อาจทำให้เกิดภาวะภูมิอนาฟัยแลกซิส (anaphylaxis) ซึ่งเป็นภาวะของโรคแพ้รุนแรงที่คุกคามถึงชีวิตได้ โดยจะมีอากาหายใจลำบาก ความดันโลหิตต่ำ และช็อกจนเสียชีวิตได้