วิธีธรรมชาติในการป้องกันฟันผุรวมถึงการบริโภคอาหารที่มีประโยชน์ต่อฟัน เช่น ผักผลไม้ที่มีใยอาหารสูง ชีส และนม การดื่มน้ำเปล่าอย่างสม่ำเสมอ และการเคี้ยวหมากฝรั่งปราศจากน้ำตาลซึ่งช่วยกระตุ้นการผลิตน้ำลายที่มีคุณสมบัติในการป้องกันฟันผุ