อุปกรณ์หลายตัวที่ใช้แฟลชการ์ดจะรู้จักเฉพาะระบบไฟล์ FAT32 Windows จะรับระบบไฟล์เริ่มต้นเป็น exFAT สำหรับไดร์ฟบันทึกข้อมูลต่อพ่วงขนาดเกินกว่า 32GB และจะไม่สามารถเลือกเป็น FAT32 ได้ ขณะใส่การ์ดเข้าที่อุปกรณื การ์ดจะแสดงผลว่าไม่ได้ฟอร์แมต วิธีที่ดีที่สุดคือการฟอร์แมตการ์ดในอุปกรณ์ที่ใช้กับการ์ดเป็นหลัก