Fish River Canyon มักร้อนที่สุดในช่วงมกราคมและกุมภาพันธ์ โดยมีอุณหภูมิเฉลี่ย 26°C มิถุนายนและกรกฎาคมเป็นเดือนที่อากาศเย็นที่สุด โดยมีอุณหภูมิเฉลี่ย 16°C เดือนที่ฝนตกเยอะที่สุดคือมีนาคมและมกราคม