ในน้ำยาฟอกสีฟันมีสารไฮโดรเจน เปอร์ออกไซด์ เป็นสารฟอกขาวที่ไม่ทำปฎิกิริยากับอนินทรีย์ อย่างเคลือบฟันหรือผิวฟัน เคลือบฟันที่เเข็งเเรงปกติก็จะไม่ถูกกัดกร่อน ดังนั้นความเชื่อที่ว่า ฟอกสีฟันส่งผลเสียให้ฟันบางลงจึงเป็นเรื่องเข้าใจผิด อย่างไรก็ตาม สารฟอกสีฟันสามารถส่งผลต่อสารอินทรีย์ในช่องปาก เช่น เหงือก เยื่อบุกระพุ้งแก้มได้ ทันตแพทย์จึงต้องทาน้ำยาเพื่อปกป้องเหงือกและเนื้อเยื่อบริเวณรอบๆ เพื่อป้องกันอาการระคายเคืองที่ตามมา