Ang kalakalan ng cotton, tulad ng anumang uri ng pangangalakal ng kalakal, ay nagsasangkot ng mga panganib. Kabilang dito ang pagkasumpungin ng presyo dahil sa hindi mahuhulaan na kondisyon ng panahon, mga pagbabago sa pandaigdigang supply at demand, espekulasyon sa merkado, at pagbabagu-bago ng pera. Mahalagang pamahalaan ang mga panganib na ito sa pamamagitan ng paggamit ng mga diskarte gaya ng mga stop loss order at pag-iba-iba ng iyong investment portfolio.