Tillstånds- och tillsynsmyndighetens totala kostnader påverkas bland annat av antalet licenssökande och antalet licenser som beviljas och av utbudet utanför licenssystemet. Även om det inte går att göra några exakta uppskattningar av myndighetens personalbehov bedöms det öka avsevärt jämfört med nuläget. Dessutom behövs det finansiering för IKT-system som förutsätts av de nya uppgifterna.  Målet är att kostnaderna för tillstånds- och tillsynsverksamheten i fortsättningen i huvudsak ska täckas med tillstånds- och tillsynsavgifter som tas ut hos licenshavarna.