Manukahonung finns i olika graderingssystem när kvaliteten ska mätas. Det finns två graderingar som är vanligast och det är metoderna MGO eller UMF. Sedan finns det ytterligare några mindre grader som NPA, Active och Total Activity. Methylglyxoal (MGO) är ett ämne som är bioaktivt, det finns i honungen, och innehåller den MGO är den unik, för då innehåller den antibakteriella beståndsdelar som förhindrar bakterier att fastna på de mänskliga cellerna. MGO finns bara i manukahonung. Det är också MGO man använder för att mäta den antibakteriella motståndskraften som finns i manukahonung. Värdena brukar anges som 100+, 300+, 450+, 600+, där siffrorna talar om hur många milligram per kilo det finns av MGO. Ett plus efter siffran menas att det innehåller minst så mycket MGO, och det kan minst innehålla plus 100 mg per kilo. Ju högre värde desto bättre honung, så vill du ha den bästa manukahonungen ska du givetvis köpa en burk som innehåller mer än 600+.