Några utmaningar med fågelmating kan vara att vissa fågelarter kan bli beroende av fågelmatare och kanske inte söka naturlig föda. Dessutom kan vissa fågelmatare vara mottagliga för skadedjur som ekorrar eller råttor. Det är dock möjligt att minimera sådana problem genom att välja en fågelmatare med skyddsfunktioner och genom att använda olika typer av mat för att undvika beroende.