Det är olika från spelare till spelare. Många MP3-spelare ansluts via USB till en dator. Därefter sker överföringen av musiken antingen genom en specifik mjukvara som installeras på datorn, eller genom att man bara drar och släpper filer som när man hanterar mappar i största allmänhet. Vissa MP3-spelare medger även överföring av filer över trådlösa protokoll som Wi-Fi eller Bluetooth.