Den största skillnaden ligger i att kompostkvarnar i regel ”bara ” klara av grenar som har en maximal tjocklek på 3–5 centimeter. En flismaskin är större och mer kraftfull i sin utformning vilket betyder att den kan ta sig an betydligt större och tjockare grenar. Du kan dessutom mata flismaskinen med betydligt fler grenar åt gången. Rent funktionsmässigt är det inga större skillnader på en kompostmaskin och en flismaskin. Därför är det ibland svårt att dra en tydlig linje mellan vad som är vad. Flismaskiner är vanligare i industriell verksamhet där man ofta har större behov av att skörda stora partier snabbt. De allra flesta flismaskinerna drivs av bensin just för att kraftfullheten behöver vara större när man ska sönderdela tjocka grenar. Gemene flismaskin är även markant mycket dyrare än vad en kompostkvarn är. En bra flismaskin finns sällan att hitta för ett pris under 15 000 kr.