Biobränslen tillverkas av förnybara råvaror. Deras utsläpp består i första hand av koldioxid som de förnybara råvarorna, t.ex. biomassa, binder från atmosfären genom fotosyntes. Fossila bränslen tillverkas av icke-förnybara resurser och släpper ut kol direkt i atmosfären. Det är därför biobränslen har ett betydligt mindre koldioxidavtryck jämfört med fossila bränslen. Koldioxidavtrycket för biodiesel och etanol är 60 - 80% mindre jämfört med fossila bränslen. Neste MY Förnybar Diesel kan skapa ett fotavtryck som är upp till 90% mindre.