Peppol-meddelanden representerar olika typer av elektroniska affärsdokument som i samband med köp- och säljtransaktioner kan skickas och tas emot av organisationer och företag som är anslutna till nätverket. Exempel på meddelanden är fakturor, kreditfakturor, ordrar, svarsmeddelanden, kataloger, punchout och mer. Meddelandena är XML-filer i ett speciellt format och använder Peppol-ID som identifierare.