En av de största hoten mot regnskogen är avskogning. Varje år förloras miljontals hektar av regnskogen på grund av jordbruksutvidgning, avverkning för timmer och produktion av kött och palmolja. Denna avskogning hotar inte bara den biologiska mångfalden utan frigör också stora mängder växthusgaser och påverkar klimatet. Andra hot inkluderar olaglig handel med djur och växter samt klimatförändringar.