Endometrios innebär att det har börjat växa vävnad som liknar livmoderslemhinna utanför livmodern. Endometriet är namnet på den vävnad som täcker insidan av livmodern. Det kan till slut bli stora områden av vävnad som kallas för endometrioshärdar, ofta på äggstockarna och bukväggen. Vävnaden kan också finnas på utsidan av livmodern, på urinblåsa, tarmar eller bukhinna. I sällsynta fall kan endometrios förekomma på helt andra ställen, till exempel i lungorna.
Dessa härdar orsakar svåra smärtor, framför allt i samband med mens. Den endometrieliknande vävnaden beter sig som livmoderslemhinnan och förtjockas, bryts ner och blöder ut varje menscykel. Men eftersom den sitter på fel ställe har den inte något sätt att komma ut ur kroppen, och blir instängd. Det kan leda till ärrvävnad och sammanväxningar.