Den enda behandlingen är just nu symtomlindrande, till exempel intravenös vätska till den som är uttorkad, antibiotika ifall det blivit bakteriella infektioner i såren som utslagen orsakat, samt smärtlindrande läkemedel när det behövs. De flesta behöver ingen behandling.
Det finns vaccin godkänt i USA och Kanada för användning som skydd mot apkoppor. Vaccinet är ännu inte godkänt i EU, men Sverige har fått ett mindre antal doser. Folkhälsomyndigheten har rekommenderat att doserna ska användas för personer som haft nära kontakt med någon som har apkoppor. De vaccin som finns tillgängliga kommer inte kunna stoppa spridningen av viruset, utan det krävs andra åtgärder.