Gränsbevakningsväsendets huvuduppgifter är gräns- och sjösäkerhet samt militärt försvar av landet.  Brottsbekämpande myndighetens uppgift är att upprätthålla gränssäkerheten och den utvecklas som en del av EU:s integrerade gränsförvaltning. Upprätthållandet av sjösäkerheten baserar sig på internationella avtal som är bindande för Finland. Uppgifter som gäller gräns- och sjösäkerhet hör inte till Natos ansvarsområden, alltså förblir arrangemangen kring dem oförändrade.
Den militära integrationen i Nato verkställs under Försvarsmaktens ledning. Processen kommer att pågå i flera år och den kan även påverka Gränsbevakningsväsendets uppgifter inom militärt försvar av landet. Mer detaljerade inverkningar framgår under denna process.