Avgifterna för att erhålla ett eTA varierar beroende på giltighetstid och vilken typ av inresa som tillåts. För ett eTA som är giltigt i fem år med flera inresor är den statliga avgiften USD 5,50 per sökande. Utöver denna avgift kan det tillkomma andra extrakostnader, t.ex. handläggningsavgifter eller onlinehjälp för att fylla i ansökningsformuläret för eTA.