Eftersom EFR är anpassat för att kunna hantera olika rapporteringar och fiskerier erbjuder systemet en flexibel rapportering. Det innebär att du som användare själv kan styra hur du vill rapportera, så länge du följer regelverket för när rapporten måste vara inkommen till HaV baserat på regler för den specifika arten. Du kan alltså välja att skicka in rapporten efter varje resa eller låta den ligga öppen under pågående fiskerapporter för att fylla i under månaden för att skicka in allt vid ett och samma tillfälle.