Under spelets gång finns det ett par bonusfunktioner som ser till att höja spänningen och upplevelsen ytterligare i Reactoonz. Dessa funktioner aktiveras av olika kombinationer med symboler samt när wildsymbolen gör entré på spelplanen.
Till vänster om spelplanen finns det en mätare, i Reactoonz kallad Quantum Leap Charge Meter. Varje vinnande spelrunda laddar mätaren. När mätaren är fulladdad adderas ytterligare funktioner till spelet som aktiveras när rundan är färdigspelad.