De kostnader som orsakats av projektet och som rapporteras som faktiska kostnader ska föras in i projektbokföringen. Exempelvis förs personalens lönekostnader in i projektets bokföring endast om de ersätts som faktiska kostnader. Kostnader som ersätts som faktiska kostnader bokförs på motsvarande sätt i projekt där kostnaderna ersätts enligt en kostnadsmodell på sju procent och en procent. I fråga om operativt stöd bokförs alla kostnader som ersätts med operativt stöd i projektbokföringen.
Indirekta kostnader som ersätts som procentuellt belopp förs inte in i projektets bokföring.
I organisationens övriga bokföring ska alla kostnader bokföras enligt bokföringslagen.