Låg ämnesomsättning kan du t.ex. drabbas av på grund av en autoimmun reaktion i kroppen. Det innebär att ditt eget immunförsvar negativt påverkar sköldkörteln. Sköldkörteln kan även ha utsatts för skada, t.ex. om du har genomgått strålning eller kirurgi. Låg ämnesomsättning innebär att du har mycket låga nivåer av sköldkörtelhormoner.