Behovet av behandling skiljer sig åt, bl.a. beroende på om orsaken är bakterier eller virus. I de allra flesta fall går halsfluss över på egen hand. Om du har halsfluss till följd av bakterier kan den behöva behandlas med antibiotika. Detta avgörs av den behandlande läkaren då antibiotika endast ska användas då det verkligen behövs med tanke på utvecklingen av antibiotikaresistens. Tänk på att fullfölja hela kuren om du får antibiotika, annars ökar risken för återinsjuknande och resistensutveckling. De som får halsfluss många gånger kan behöva operera bort halsmandlarna för att bli av med problemen. Då ska du ha haft halsfluss tre till fem gånger under ett eller två års tid, och blivit behandlad med två sorters antibiotika (klindamycin och cefadroxil) utan effekt.
När det beror på virus hjälper inte antibiotika, då behöver du vänta tills kroppen själv bekämpar infektionen. Du kan dock ta receptfria smärtstillande och/eller febernedsättande läkemedel för att lindra symptomen under sjukdomens gång. Tänk på att det även finns receptfria smärtläkemedel som är speciellt inriktade på halsont. Det kan vara skönt med kall och varm dryck för att mjuka upp halsen, även yoghurt och glass kan ha liknande effekt. Vanliga halstabletter kan också vara bra för att mjuka upp halsen.