Att följa ett kostschema för fettförbränning kan vara utmanande för vissa människor. En av de vanligaste utmaningarna är att begränsa intaget av vissa livsmedel, särskilt kolhydrater, vilket kan vara svårt för dem som har en starkt förankrad matkultur eller som har svårt att motstå frestelser. Att anpassa sig till fasta perioder kan vara utmanande för personer med en aktiv livsstil eller för de som är vana vid att äta regelbundet under dagen. Det är också viktigt att vara medveten om näringsbrister och att säkerställa en balanserad kost med tillräckliga näringsämnen.