För- och nackdelar med radonbehandling diskuteras ibland kontroversiellt. Faktum är att samma sak gäller för radonkur som för andra medicinska tillämpningar med joniserad strålning (t.ex. röntgenstrålning): Långsiktiga biverkningar kan inte helt uteslutas, inklusive en minimalt ökad risk för lungcancer. Strålningsexponeringen är dock mycket låg under radonbehandlingen. Dessutom utsätts patienterna bara för det under en mycket kort tid. I slutändan är det en fråga om att väga fördelar och risker. I vilket fall som helst bör radonbehandlingar inte utföras som en "friskvårdsbehandling", utan endast om det finns en medicinsk nytta.