Det finns en mängd olika sätt som du kan ta dig till olika delar av Samos från flygplatsen på. Bland annat finns här en mängd olika bussar som går under de flesta timmar på dygnet och som du kan ta dig till olika delar av ön med. Det rör sig i de flesta fall om de så kallade KTEL-bussarna. Ett annat alternativ är att i stället åka taxi. Du finner taxibilarna utanför flygplatsens terminal, och de kan bland annat ta dig in till staden Samos. Det går också att hyra bil på flygplatsen som du sedan kan använda dig av för att ta dig runt på ön. De biluthyrningsföretag som finns på flygplatsen har sina kontor i dess ankomsthall.