Orsaken till brunt vatten i toaletten kan vara närvaron av humus eller andra organiska ämnen i vattnet. Detta kan vara vanligt i fritidshus eller sommarstugor där vattnet kommer från naturliga källor som brunnar eller sjöar. Humus kan färga vattnet brunt och kan vara resultatet av löv, marknedbrytning eller näringsämnen i vattnet. För att få rent vatten och minska risken för brunt vatten kan användningen av humusfilter vara till hjälp. Dessa filter är konstruerade för att ta bort organiska ämnen och förbättra vattnets klarhet och kvalitet. Att installera ett humusfilter kan bidra till att säkerställa att vattnet som används i toaletten och andra avloppssystem är renare och inte färgas brunt av organiska föreningar.