Jämfört med de flesta e-handelsplattformar blir installation av Magento en ganska komplicerande process utan ordentlig vägledning. För att installera Magento måste användare ställa in utvecklingsmiljön (operativsystem, webbserver, PHP, MySQL-databas). Användare måste också ladda ner själva Magento-programvaran och använda kommandoraden och installationsguiden för installation. Det finns ett alternativ att ladda ner med eller utan exempeldata, som är utformat för att bekanta användare med Magento-plattformen.