Företagshälsovården är en skattefri förmån för anställda, uppdragstagare och aktiva delägare. För passiva delägare, som inte arbetar i verksamheten, är den däremot en skattepliktig förmån. Skattepliktig företagshälsovård ska beskattas i enlighet med sitt förmånsvärde, som utgörs av marknadsvärdet, inklusive moms. Marknadsvärdet är den verkliga kostnaden, alltså vad det skulle ha kostat att själv betala för vården. En skattepliktig förmån av företagshälsovård tas upp på lönebeskedet. Den utgör underlag för skatteavdrag och arbetsgivaravgifter.