Generellt sett har räntefonder en lägre risk än blandfonder och aktiefonder, men det betyder inte att räntefonder är riskfria. Alla räntefonder har en ränterisk, vilket betyder att de påverkas i mindre eller större utsträckning av stigande och sjunkande marknadsräntor. Långa räntefonder påverkas mer än korta räntefonder, vilket gör att risken i en lång räntefond är högre än i en kort.
Företagsobligationsfonder påverkas också av kreditrisken hos de företag som gett ut obligationerna, det vill säga risken att de utgivande företagen inte ska kunna betala tillbaka lånet eller gå i konkurs. I vissa företagsobligationer är risken så pass hög att de påminner om aktiefonder.