Vissa studier tyder på att probiotika kan ha en positiv effekt på allergiska sjukdomar, inklusive pollenallergi. Genom att balansera tarmfloran kan probiotika förbättra immunsystemets funktion och minska överkänslighetsreaktioner. Det rekommenderas att välja probiotikatillskott med olika stammar av goda bakterier för att få en bred effekt.