Las cuatro comisiones especializadas ejercen un papel clave en el desarrollo y revisión de las normas internacionales de la OMSA. Colaboran con su red científica mundial, son responsables del reconocimiento oficial del estatus zoosanitario, brindan asesoramiento sobre epidemiología, prevención y control de enfermedades animales y sobre otros aspectos de los programas de trabajo científico de la OMSA, se ocupan de cuestiones científicas y técnicas relacionadas con lo anterior y son responsables de evaluar las solicitudes, supervisar los programas de trabajo y administrar la red de laboratorios de referencia y de centros colaboradores de la OMSA. Cada comisión especializada, integranda por un presidente, dos vicepresidentes y tres miembros, se reúne formalmente al menos dos veces al año con el fin de discutir y acordar una serie de puntos de su respectivo plan de trabajo.