Aunque la ingesta del aceite MCT es segura para la mayoría de las personas, es posible que en algunos casos pueda ocasionar efectos indeseados como vómitos, náuseas, malestar estomacal y diarrea. Sin embargo, estos efectos suelen estar asociados a una dosis excesiva; por lo que si consumes la cantidad recomendada por el fabricante, probablemente no experimentes molestia alguna.