Los equipos con rotor de ángulo fijo se mantienen siempre en un mismo ángulo con respecto al eje de rotación (normalmente de 30°) y permanecen con ese ángulo durante la centrifugación. Por el contrario, los equipos con rotor libre o basculante no son fijos, se desplazan al comenzar la centrifugación hasta una posición perpendicular con respecto al eje de rotación y se mantienen en dicha posición. Solo así se puede conseguir una capa óptima de gel de separación.