En la actualidad no es posible intercambiar Pokémon desde PC a DS, ya que Nintendo ha cerrado los servidores globales, que permitían a los jugadores de emuladores para PC intercambiar sus Pokémon con los jugadores de Nintendo DS.
Sin embargo, todavía es posible intercambiarlos si dispones de una tarjeta SD. Para hacerlo, tendrás que localizar dónde se guarda la partida de Pokémon en tu ordenador, pasar la partida guardada a una tarjeta SD y, más tarde, insertar la tarjeta en una Nintendo DS con el juego instalado. Ahora, bastará con que cargues tu partida del ordenador en la DS e intercambiar tus Pokémon utilizando cualquier red WiFi o con los infrarrojos de la propia Nintendo DS.