Afortunadamente, Zylkene parece tener un riesgo muy bajo de efectos secundarios. El fabricante no menciona ninguno, aunque como nutracéutico y no como fármaco/medicamento, no están obligados a realizar ningún ensayo clínico antes de lanzar un producto.
Sin embargo, en el estudio de investigación de 2007 mencionado anteriormente, no se observaron efectos secundarios durante el período de aproximadamente 60 días en que se usó el producto en unos 30 gatos.