Por lo general, la razón por la cual los polioles pueden causar efectos secundarios en el tracto intestinal es porque el cuerpo no puede digerirlos, pero las bacterias del intestino sí. Como resultado, dichas bacterias metabolizan el poliol y pueden producir gases, hinchazón y otros síntomas desagradables. El eritritol, por otro lado, no puede ser metabolizado ni fermentado por la mayoría de las bacterias, en consecuencia no provoca flatulencias o efectos laxantes.
Las personas que sufren de estómagos sensibles o síndrome de colon irritable han descubierto que el eritritol no acarrea síntomas adversos en la misma medida que otros polioles, por lo que si tú padeces de problemas gastrointestinales con otros sustitutos del azúcar, el uso de eritritol puede valer la pena.