Las causas de la disfonía pueden ser variadas. Algunas posibles causas son el reflujo ácido, los traumatismos en el cuello y la cara, las alergias alimentarias o respiratorias, los problemas dentales, la presencia de cuerpos extraños en las vías respiratorias superiores (como tumores o nódulos), trastornos neuromusculares como el Síndrome de Munchausen por Poder o el Parkinson, abuso del uso vocal excesivo (incluyendo cantar a voces), infecciones virales y/o bacterianas que afectan a las cuerdas vocales.