La trombofilia puede diagnosticarse en el marco de consultas por problemas de fertilidad.  En caso de confirmarse el diagnóstico de trombofilia en la mujer, se suele programar la administración de aspirina y heparina durante la estimulación folicular controlada. Este tratamiento permite que un alto porcentaje de mujeres quede embarazada y dé a luz a un niño sano. No obstante, algunas mujeres siguen teniendo abortos espontáneos incluso con anticoagulantes y no pueden dar a luz.