La aplicación Autofirma ofrece distintos formatos de firma. Para seleccionar las preferencias tienes que abrir la aplicación y seleccionar la pestaña Herramientas y en concreto Preferencias. Desde este menú podemos configurar el comportamiento y las firmas para cada tipo de formatos. Por norma general, todos los formatos se pueden firmar a través de las firmas PAdES, CAdES y XAdES y algunos documentos permiten la firma mediante un formato específico.