Son una serie de patologías que se caracterizan porque las partes que componen al sistema inmune atacan a sus mismos tejidos, por lo que generan síntomas típicos dependiendo de la célula que se está afectando. Entre ellas encontramos al lupus eritematoso, la esclerosis múltiple y la alergia al gluten como unas de las más frecuentes en la población.
Este tipo de enfermedad es denominada autoinmune, ya que las células del mismo cuerpo crean un ataque hacia tejidos que se encuentran sanos, por lo que termina con la destrucción de los mismos, y así crea disfunciones en diversos órganos.