Los filtros Black Berkey actúan de forma 'mecánica' al retener los contaminantes en los millones de microcanales que lo componen y también gracias a otras capas, como la membrana de intercambio iónico o el carbón activado. En cuanto a la parte puramente mecánica, se estima que la finura de la filtración es inferior a 24 nanómetros (0,024 micras), lo que corresponde al tamaño de algunos virus efectivamente filtrados como el MS2 o el Fr Coliphage.