La principal enfermedad que afecta a la aracnoides, pero también a las demás capas es la conocida meningitis que produce síntomas como la rigidez de nuca, cefalea, fiebre y vómitos.
Pero además de esta patología, existe una muy particular conocida como quiste aracnoideo, que se genera solo en esta membrana y que aunque no presenta manifestaciones clínicas evidentes si necesita de un tratamiento médico enfocado en eliminar el quiste de esta área, ya que es una lesión que se forma por acumulación del líquido por fuera del espacio subaracnoideo que es donde debería estar.