En el año 2002, dejó de funcionar repentinamente cuando hubo una grave inundación en la ciudad vieja de Praga como consecuencia del desbordamiento del río Moldava. Esta no fue la única vez que el reloj se paró: lo hizo también al final de la Segunda Guerra Mundial durante la invasión de las tropas nazis. Por esto, los checos creen que cuando el reloj deja de funcionar, algo malo le ocurrirá a la ciudad.