En su mayor parte, los ETF son menos costosos que los fondos de inversión. Hay excepciones, y los inversores deben examinar siempre los costes relativos de los ETF y los fondos de inversión que siguen los mismos índices. Sin embargo, en igualdad de condiciones, las diferencias estructurales entre los dos productos dan a los ETF una ventaja de costes sobre los fondos de inversión.