Existen figuras Funko que, tras estar unos meses en circulación, dejan de estar a la venta. Esto ocurre porque la compañía, por diversas razones, decide dejar de fabricarlos y distribuirlos temporal o permanentemente. Son los conocidos como Funko Pop! Vaulted, lo que en el argot de los coleccionistas significa que han sido «retirados a la bóveda» (vault en inglés).
Estas figuras pronto se convierten en ansiados objetos de coleccionismo por las que se llegan a pagar altos precios. No obstante, a veces ocurre que Funko decide relanzar alguna figura retirada con motivo de un evento especial, como un estreno cinematográfico. Ello provoca normalmente que los modelos vaulted de dicha figura se devalúen de manera importante.