Existen ciertas patologías que hacen completamente imposible la realización de un injerto capilar, sea con la técnica que sea. Enfermedades como el lupus, la alopecia frontal fibrosante o la alopecia areata son problemas que no nos permiten trabajar correctamente y ponen en riesgo la salud del paciente.  Si poseemos una zona donante con una gran escasez de folículos o la tenemos dañada por culpa de un mal trasplante previo tampoco podríamos llevar a cabo la intervención. Tendríamos que realizar un tratamiento antes para regenerar la zona donante de forma apropiada.