Las bombas de agua son también un elemento básico en la acuarofilia. Se usan desde para elementos decorativos, como para el sifonado o limpieza del fondo.
Las burbujas generadas rompen la tensión superficial del agua, lo que permite un intercambio de oxígeno, que se lleva a cabo en los primeros milímetros de la superficie.
Son muy útiles en determinados casos, como en de no disponer de una salida del filtro que rompa esta tensión superficial. En un acuario plantado y con un buen filtro, es un elemento decorativo sin ninguna otra función.