Una opción solo disponible para Shopify Plus. Para negocios al por mayor (mayoristas), Shopify ofrece la posibilidad de gestionar fácilmente, en el mismo panel de gestión de una tienda retail, todas las funciones para trabajar un B2B: lanzamiento de varios sitios web con el mismo back-end, rendimiento 24/7, escaparates dedicados, 20 canales de venta, precios personalizados, hasta 8.000 pedidos por minuto, opciones de pago, etc. Marcas como Adidas, Motorola o Tesla usan Shopify B2B.