Las bacterias necesitan diferentes nutrientes para cumplir sus funciones básicas de desarrollo y reproducción,  que se obtienen de la descomposición de compuestos orgánicos e inorgánicos, mediante diversas rutas metabólicas como la respiración aeróbica y anaeróbica, fotosíntesis y fermentación. Los nutrientes necesarios para su crecimiento se dividen en: macronutrientes, que son elementos presentes en gran proporción (Carbono, Hidrógeno) y esenciales para reacciones y síntesis bioquímica,  y los micronutrientes, pueden ser oligoelementos metálicos o factores de crecimiento orgánicos y funcionan como coenzimas.