Algorand tiene una estructura de blockchain única de dos capas. La capa 1 tiene la capacidad de ejecutar procesos simples como contratos inteligentes o la creación de distintos tokens y NFTs, lo cual ayuda a garantizar su seguridad y compatibilidad.  Sin embargo, los contratos inteligentes complejos pueden ocupar más espacio en la blockchain y necesitar más poder de cómputo. Por ello, estos procesos están reservados para la capa 2, que es verificada fuera de la blockchain principal.