El hermoso sonido que hoy en día distingue a la flauta travesera fue el resultado de años de investigación por el alemán Böhm, por lo tanto, el mecanismo interno es complejo, pero brinda resultados únicos.
La forma en la que la flauta funciona es haciendo que el aire circule dentro de su estructura cilíndrica después de soplar. Estas vibraciones junto a las controladas salidas de aire al tapar algunas válvulas producen el sonido que caracteriza al instrumento.