Pese a que ambos sirvan para elegir una inversión, y su análisis sea complementario, el VAN y el TIR no son iguales ni son lo mismo, pues existen algunas pequeñas diferencias:
El VAN está orientado a la estimación de las ganancias brutas de la empresa, mientras que el TIR ayuda a determinar la rentabilidad de un proyecto.
Asimismo, mientras que el VAN sólo permite medir los beneficios de quien invierte, el TIR está indicado en aquellos proyectos de corta duración o con un flujo de caja elevado.