Los principales desafíos del Big Data incluyen la seguridad de los datos, el almacenamiento y el procesamiento de grandes cantidades de datos, y la gestión de datos no estructurados. También existen desafíos relacionados con el anonimato, la privacidad y la protección de datos personales. Por último, el Big Data también plantea desafíos relacionados con la verificación de los resultados de los análisis.