Los generadores de ozono funcionan con el sistema de circulación de la piscina. Cuánto más tiempo se ejecuta el sistema mayores son los beneficios que el usuario obtendrá del generador de ozono. Típicamente 6-8 horas por día es suficiente, aunque esto se puede reducir a 4 horas durante un uso bajo. El sistema debe funcionar durante 24 horas después de un uso intensivo, cómo una fiesta.