El tratamiento de administración de testosterona puede tener algunos efectos adversos: cefalea, acné, astenia, alopecia, alteraciones de la libido, ginecomastia (aumento del tamaño mamario en el hombre), priapismo (erecciones mantenidas durante un tiempo que excede al acto/deseo sexual), supresión de la espermatogénesis, atrofia testicular, hiperplasia prostática, carcinoma de próstata (en tratamientos a altas dosis), retención de líquido, aumento del calcio, disminución de niveles de glucemia, aumento de peso, aumento de glóbulos rojos, aumento de LDL-colesterol, etc.
Por todo ello, el tratamiento hormonal está contraindicado en casos de carcinoma de próstata, hepático o de mama en el hombre.