Una de las ventajas de las mamparas anticontagio es que su limpieza es sencilla. Se pueden desinfectar con una solución de lejía diluida en agua (20 cc por litro de agua), con agua jabonosa o con alcohol al 70 %. En los dos primeros casos es importante dejar actuar el producto unos segundos antes de aclarar o secar con un paño estéril.