Aunque muchas firmas de archivos se adhieren a estándares ampliamente reconocidos, como los establecidos por la Organización Internacional de Normalización (ISO) o la Autoridad de Números Asignados por Internet (IANA), existen variaciones y formatos propietarios en diferentes sistemas operativos y aplicaciones de software. Sin embargo, se están llevando a cabo esfuerzos para promover una mayor interoperabilidad y estandarización en el uso de las firmas de archivos.