Los suplementos de complejo B están considerados como una opción segura para el consumo del público general. Como estas sustancias son de tipo hidrosoluble, su exceso se excretará de forma natural por medio de la orina. A pesar de que el cuerpo almacena pequeñas cantidades de algunos compuestos (como la B12), resulta casi imposible que ocurran complicaciones derivadas de su acumulación excesiva.
Sin embargo, es una investigación efectuada en varones sanos se observó que la suplementación con dosis excesivas de vitaminas del complejo B (1000% de la IDR o más) podrían incrementar las probabilidades de sufrir algunos tipos de cáncer. Esto no sucede con las vitaminas B que se obtienen mediante el consumo de alimentos o con la suplementación moderada.