La diferencia más obvia entre un pen drive y un flash drive es su utilización. Normalmente, el pendrive solo se utiliza como dispositivo de almacenamiento USB portátil, mientras que el término flash drive puede aplicarse en muchos ámbitos. Pendrive se suele referir a una unidad que se puede conectar directamente a un puerto USB, mientras que se puede acceder a una unidad flash a través de una conexión USB directa, por medio de una conexión USB con cable o guardada de manera interna dentro de un teléfono celular.