El Saccharomyces boulardii de Megalevure es una levadura y, por tanto, no se ve afectado por la toma de antibióticos. El resto de probióticos sí podrían verse afectados por el consumo de un antibiótico, por lo que se recomienda no consumir el antibiótico juntamente con Megalevure, simplemente separando ambas tomas dos horas será suficiente.