Sí. Hasta una de cada cuatro personas no es hipnotizable; para tales individuos, es poco probable que la hipnoterapia sea efectiva. Los estudios de imágenes cerebrales han revelado diferencias en los patrones de conectividad cerebral entre aquellos que responden al hipnotismo y aquellos que no lo hacen. Específicamente, las exploraciones de individuos que pueden ser hipnotizados muestran una mayor coactivación entre el centro de control ejecutivo en su corteza prefrontal y otra parte de la corteza prefrontal que marca la importancia o relevancia de los eventos.
Otros que posiblemente podrían ser hipnotizados también pueden no responder a la técnica debido a un profundo escepticismo o resistencia a entrar en un estado hipnótico.