Los pasajes comprados en Flybondi se pueden abonar de manera online con tarjetas de débito Visa Electron y Maestro o con tarjetas de crédito Visa de todos los bancos, American Express, Mastercard y Tarjeta Naranja.
Como segunda opción, también se pueden pagar los pasajes en efectivo a través de las plataformas Rapipago o PagoFácil.
En tercera instancia, es posible abonar en efectivo o tarjeta directamente en el Aeropuerto del Palomar pero teniendo en cuenta que se sumará cargos adicionales.