No existe un momento determinado para consumir la proteína de soja, sino que esto depende de la finalidad con la que se ingiere dicho suplemento. En el caso de los deportistas, el mejor momento para tomar proteína de soja es inmediatamente después del entrenamiento, ya que el organismo es más eficiente en la asimilación de nutrientes («ventana metabólica»).
En cambio, cuando la proteína de soja no se consume con fines deportivos, el desayuno es una buena oportunidad para ingerirla porque la persona ha ayunado durante la noche y la absorción de nutrientes es mayor. La proteína en polvo se puede disolver en líquidos (agua, leche, batido de frutas o bebida vegetal) o se puede emplear para elaborar tortitas y gofres.