Aunque las aftas y los herpes se suelen confundir por su aspecto similar, no son lo mismo. El herpes es causado por un virus y suele aparecer entre la mucosa del labio y la piel que lo envuelve. Esta infección suele provocar fiebre, malestar general e inflamación de ganglios. Por el contrario, las aftas no son causadas por virus y aparecen en la parte inferior de la boca. No suelen provocar fiebre ni malestar general, a menos que se infecten o se contraigan junto con otras enfermedades.