La transferencia embrionaria en ciclo natural consiste en transferir los embriones sin realizar el tratamiento previo de preparación endometrial. Para ello, simplemente se controla el ciclo natural de la mujer y se aprovecha la liberación endógena de estrógenos y progesterona.
El problema de este proceso es que no siempre las hormonas naturales son suficientes para favorecer la implantación y el embarazo. Esto dependerá de cada mujer y cada caso. En gestación subrogada, no suelen hacerse tratamientos en ciclo natural.