En muchos casos no es posible debido a que el gotero no cuenta con piezas extraíbles, por lo que es interesante la instalación de un pequeño filtro de esponja si el agua procede de un depósito. Ayudará a retener las partículas más grandes que pueda contener el agua y prolongará la vida de los goteros.
En los modelos que sí se pueden desmontar, la limpieza es muy sencilla. Con un cepillo no abrasivo y con agua tibia, fácilmente se irán eliminando las posibles incrustaciones que pueda haber. De todos modos y puesto que un gotero tiene un precio muy bajo, es más sencillo sustituirlo que jugársela a que se obstruya de todo y deje de echar agua.