Mientras se sigan las dosis recomendadas diariamente y se tenga ayuda profesional, no hay riesgos relacionados con el consumo de L-Carnitina. No obstante, si la ingesta es indiscriminada o no se siguen las reglas, es posible experimentar diversos efectos secundarios.
Algunos aspectos negativos leves de tomar mucho contenido y realizar ejercicio son los mareos, la diarrea, las náuseas y la irritación estomacal, en algunos casos. Sin embargo, esto podría ser peor.
El consumo de L-Carnitina está pensado para acompañar una actividad física regular, por lo tanto, si se ingieren altas dosis del nutriente y no se queman las grasas, entonces los niveles de la trimetilamina n-óxido podrían aumentar y traer como consecuencia la obstrucción de las arterias.
Por otra parte, está prohibido su uso en personas que sufran de insuficiencia renal.