El rotulador permanente suele ser resistente al agua debido a los componentes de su tinta. Esta contiene un solvente principal, glicéridos, una resina y un colorante. Los pigmentos son los colorantes más comunes en los rotuladores permanentes, los cuales son en su mayoría insolubles en agua. Debido a esta propiedad, los rotuladores permanentes suelen resistir a la disolución por agua y humedad.
La resina también es un componente importante, ya que asegura que el colorante persista en la superficie una vez que el solvente se evapora. Puesto a que la resina es no polar, no puede disolverse en el agua (solvente polar). No obstante, si la tinta entra en contacto con solventes no polares como la acetona, esta disolverá la resina y se borrará la marca.