Sí, existen aplicaciones de terceros que facilitan ocultar tus mensajes de WhatsApp y protegerlos con una contraseña o código PIN. Esto suele hacerse creando una carpeta cifrada en tu dispositivo que almacena todas tus conversaciones privadas.
Algunas aplicaciones incluso ofrecen funciones avanzadas como la autenticación de dos factores y el bloqueo automático tras la inactividad, para que puedas estar tranquilo sabiendo que nadie más puede acceder a tus chats sin permiso.