Es muy importante tener en cuenta que la copa menstrual no es un método anticonceptivo. Actúa como barrera reteniendo el flujo menstrual, pero no frena el paso del esperma en la vagina. Además, no ofrece protección frente enfermedades de transmisión sexual. Por lo tanto, no debe ser empleada como anticonceptivo en ningún caso.
Sin embargo, ciertos modelos de copa menstrual pueden emplearse durante las relaciones sexuales. Es el caso del modelo diafragma desechable. Es especialmente flexible y suave, y se inserta más profundamente en la vagina. Las copas en forma de campana quedan más exteriorizadas, ya que se insertan en la parte baja de la vagina.