Una crítica común a los juegos de plataformas es que todos los niveles son iguales. Sin embargo, en Vex 3, hay mucha creatividad en cada nivel. Hay desafíos únicos en cada etapa, lo que mantiene la jugabilidad fresca e interesante. Uno de los atributos más convenientes de Vex 3 son las banderas de puntos de control que se le proporcionan. Cuando los jugadores llegan a uno de estos puntos de control, restablecen su punto de reaparición a esa bandera. Teniendo en cuenta lo fácil que es ser destruido en este juego, tener puntos de reaparición es muy conveniente. En un juego tan difícil como Vex 3, tener un poco de ayuda hace que el juego parezca mucho más vencible.