La fibra soluble de la chía puede ser fermentada por la flora bacteriana del colon (la última porción del intestino), lo que estimula el crecimiento de las bacterias beneficiosas y limita el desarrollo de patógenos. Por eso, se dice que esta semilla es un prebiótico.
La actividad prebiótica de la chía regula la función intestinal e inhibe el crecimiento de células tumorales en el colon.
Para aprovechar los beneficios prebióticos de la chía, se debe consumir entera o en polvo.