A pesar de lo que mucha gente pueda suponer, Federer ha estado plagado de lesiones antes. Ha tenido lesiones de espalda, y actualmente se ha operado de la rodilla y no cree que vuelva a las canchas en 2023. Si bien esto puede no afectar su juego en el futuro, actualmente es un problema para su juego y su reconocimiento como uno de los mejores del año. A pesar de ello, sigue siendo uno de los mejores jugadores de todos los tiempos.