Aunque los pulsioxímetros modernos cuentan con tecnología avanzada, existen algunas limitaciones que afectan la exactitud de las mediciones. Por esto, es importante conocer algunas de las situaciones puntuales que alteran los resultados de este aparato. Los pacientes con anemia intensa, hipotensión, insuficiencia cardiaca, shock hipovolémico, en estos casos es posible que la sangre no llegue adecuadamente a los dedos y la lectura no sea correcta.
Así mismo, pacientes con hipoxias graves cuya saturación de oxígeno es menor al 80% y en los casos de intoxicaciones con monóxido de carbono, la lectura será falsamente reducida. Por otro lado, agentes externos podrían alterar los resultados, tal como la presencia de esmalte en las uñas, uñas postizas o la mala ubicación del dispositivo .De igual manera, se ha detectado que en pacientes con la piel oscura, los valores suministrados son erróneamente altos.
Existen actualmente nuevos pulsioxímetros dotados con un plus de tecnología, que los hace capaces de identificar diferentes tipos de hemoglobina, tales como las hemoglobinas fetales, la metahemoglobina y la carboxihemoglobina.