Implementar data mesh puede presentar varios desafíos. Entre ellos, el cambio cultural y la gobernanza de datos, la integración de tecnología, el cambio en el enfoque de los datos y en la adopción de usuarios. Estos desafíos pueden requerir un cambio en la forma en que las personas trabajan y colaboran. También en la forma en que se gestionan y protegen los datos en la empresa. Por otro lado, pueden requerir la implementación de una variedad de tecnologías y plataformas. Además, pueden requerir un esfuerzo de capacitación y comunicación para asegurarse de que los usuarios entiendan y aprovechen este enfoque.