El tratamiento para la gastroenteritis se divide en partes: En primer lugar, está el recuperar la pérdida de líquido y sales producidas por los vómitos y la diarrea. Por ello se deben llevar a cabo soluciones de rehidratación oral, bebiendo agua en pocas cantidades, pero muchas veces al día, enfocadas en recuperar la cantidad de líquido perdida.
Además, se deben tratar los síntomas de la gastroenteritis con antiácidos, antiespasmódicos y analgésicos.
Por último, y en los casos más graves, se pueden colocar sueros intravenosos que permitan combatir la deshidratación en el paciente o también antibióticos en casos de sospecha de infección por bacterias específicas.