El aislado de proteína de suero se procesa más que el concentrado de proteína de suero, lo que da como resultado un mayor contenido de proteína por porción y menores cantidades de carbohidratos y grasas. El aislado también suele tener menos contenido de lactosa, lo que lo convierte en una mejor opción para las personas con intolerancia a la lactosa. El concentrado, aunque es un poco menos puro, retiene más nutrientes beneficiosos que se encuentran en el suero.