Debido a que se encuentra ubicado en el interior del cráneo y en la región inferior del cerebro, las lesiones en el quiasma óptico son bastante infrecuentes. No obstante, existen algunos  problemas que pueden comprometer su correcto funcionamiento:
Hemianopsia
La hemianopsia se manifiesta como una ceguera o falta de visión que afecta únicamente a la mitad del campo visual. Se trata de una de las lesiones más habituales del quiasma óptico. Aunque, incluso en estos casos, es poco frecuente.
Glioma óptico
Los gliomas son tumores, casi siempre benignos, que crecen en diferentes partes del cerebro y que pueden afectar a uno o ambos nervios ópticos y al quiasma óptico.
A pesar de ser tumores benignos, dependiendo del tamaño y la zona, pueden presionar el nervio óptico, pudiendo llegar a afectar de forma severa a la visión del paciente.
Enfermedades relacionadas con la hipófisis
La hipófisis es una glándula endocrina situada en la base del cráneo y que regula gran cantidad de actividades hormonales. Existen algunos problemas y enfermedades relacionados con esta glándula que, entre otros síntomas, pueden provocar su aumento de tamaño. Cuando esto sucede, al igual que sucedía con el glioma óptico, si oprime el nervio óptico o el quiasma óptico puede comprometer la correcta visión del paciente.