Al igual que otros saurópodos, especialmente su primo el Brontosaurio, el dinosaurio Brachiosaurus habría sido lo suficientemente grande como para repeler a la mayoría de los depredadores: incluso los carnívoros más grandes de la época, como el Allosaurio, apenas tenían la mitad de su tamaño. En caso de que el Brachiosaurus encontrara alguna amenaza, su principal arma defensiva sería su larga cola, que habría utilizado como un látigo, de forma similar al Brontosaurio. Sin embargo, su cola era más corta en relación con otros saurópodos, y tendría menos alcance. Su piel también era dura y parecida al cuero, aunque seguiría siendo penetrable para los afilados dientes de los terópodos más pequeños.