La causa exacta del flato no está completamente entendida, pero existen varias teorías. Una de ellas sugiere que el dolor podría deberse a la irritación del peritoneo parietal, causada por el estiramiento de los ligamentos que sostienen los órganos internos durante el ejercicio. Otras teorías apuntan a problemas con el flujo sanguíneo al diafragma o a técnicas de respiración y postura inadecuadas durante el ejercicio.