Si tiene una obstrucción del conducto biliar, no la tome. Algunas personas tienen dificultad para tragar jugo de rábano negro, lo que causa malestar gastrointestinal, así como reflujo o acidez de estómago. Posteriormente se debe reducir la dosis o, si persisten las enfermedades, se debe buscar un tratamiento alternativo. También puede consumir el jugo con un poco de aceite vegetal, que puede ayudar a proteger las paredes del sistema digestivo de la irritación causada por los compuestos de azufre en el rábano negro. Se ha observado una reacción alérgica que se manifiesta como urticaria generalizada en una persona que comió rábanos negros.