La limpieza periódica de la conejera es esencial para que los animales se sientan cómodos en su hogar. Al menos una vez a la semana hay que limpiar la conejera por completo, es decir, sacar todo el lecho, limpiar el suelo y poner lecho nuevo. Entre limpiezas es conveniente eliminar las heces y la orina acumuladas. Los conejos suelen preferir hacer sus necesidades en un rincón de la conejera, por lo que deberás poner especial énfasis en esta zona.