En contraposición a la hibridación, la técnica de autopolinización la empleamos para reproducir las características especiales y deseables de un clon élite sin contaminarlo con genética externa. Esta técnica aporta gran estabilidad a la descendencia y las sucesivas generaciones.
Esta técnica fue utilizada en una de nuestras primeras variedades feminizadas y fotodependientes, nuestra S. A. D. Sweet Afgani Delicious S1 (SWS02).
Las autofecundaciones producen generaciones de semillas que tienden de forma muy rápida a la homocigosis y es uno de los métodos tradicionales para conseguir líneas puras en plantas alógamas, como es el caso de la marihuana. Con cada generación de autofecundación el 50% de los genes que se encuentran en heterocigosis, pasan a ser homocigóticos.
La técnica que utilizamos para conseguir la autopolinización de un clon hembra es la misma que utilizamos para conseguir semillas feminizadas. Se trata de conseguir polen viable de un clon de planta femenina y con este polen polinizar otro clon hembra de la misma planta de marihuana. Para conseguir polen de plantas hembra utilizamos una técnica de inversión del sexo que consiste en aplicar sobre las plantas un producto basado en el Tiosulfato de Plata. Esta aplicación induce la producción de flores masculinas, y en la dosis y forma de aplicación apropiada la producción de polen abundante y viable en una planta hembra.
La autopolinización es una técnica de mejora de relativa reciente aplicación en la mejora de variedades de marihuana ya que hasta que no se descubrieron las técnicas de inversión del sexo era imposible aplicar estas técnicas de mejora sin arrastrar genes de hermafroditismo hacia la descendencia. La única forma posible de autopolinizar una planta de marihuana hembra sin utilizar técnicas de inversión del sexo, sería utilizando individuos femeninos que mostrasen alguna flor masculina bajo estrés o de forma automática, para con este polen autopolinizar la planta, pero de esta forma estaríamos realizando presión selectiva sobre el grupo de plantas que más fácilmente muestran rasgos de hermafroditismo bajo estrés, y esto no interesa en absoluto en el caso de la marihuana.
Con las modernas técnicas de inversión del sexo estas plantas que muestran algún rasgo de hermafroditismo bajo estrés son eliminadas de cualquier proyecto de mejora de variedades feminizadas, por muy excelente que sea el clon lo que interesa es producir variedades 100% femeninas y para ello han de elegirse "clones élite" (selección clonal), con nulas o casi nulas tendencias a producir flores masculinas bajo estrés, estas plantas son conocidas como "hembras puras".
De esta forma los criadores de marihuana pueden abrir nuevos caminos en la crianza y mejora con la autopolización y todas las demás técnicas de mejora que contienen autopolinizaciones, como por ejemplo la “selección recurrente”. Ahora es posible explorar estas técnicas sin arrastrar los genes de hermafroditismo, realizando presión selectiva sobre los caracteres interesantes y excluyendo en cada generación estos genes promotores de hermafroditismo de la piscina genética, en busca de las conocidas en el mundo cannábico como hembras puras.
Para la notación de  autopolinizaciones se utiliza la letra "S" (del inglés "selfing"), por eso la S1, el número índica que se trata de la primera generación filial de una autopolinización.