El hidrógeno molecular (H2) es 88 veces más pequeño que la vitamina C. Al ser mucho más pequeño que otros antioxidantes, el hidrógeno es capaz de penetrar en el núcleo de las células, protegiendo el ADN del ataque de los radicales libres. La vitamina C elimina todo el oxígeno activo, sin discriminar el que es beneficioso del que es dañino. También los antioxidantes como las vitaminas C y E quedan oxidados al eliminar el oxígeno activo. Estas vitaminas oxidadas son reactivas y favorecen un entorno oxidado, en vez de uno reducido. El hidrógeno es el único antioxidante capaz de reciclar los antioxidantes ya oxidados, como las vitaminas C y E, y de mejorar la vitalidad y el sistema inmune, y no sólo eliminar el oxígeno activo sin más. El hidrógeno actúa sólo sobre el oxígeno activo dañino y lo convierte en agua, siendo al final eliminado con la orina. Y también es uno de los pocos antioxidantes capaz de atravesar la barrera hematoencefálica, por lo que también tiene un efecto antioxidante en el cerebro.