Sí, es posible que existan algunos efectos secundarios de los medicamentos que se utilizan para la profilaxis luego de la una violación; como por ejemplo en el caso de los anticonceptivos de emergencia, que pueden atrasar o adelantar la menstruación o generar dolor de cabeza y sensibilidad en los senos. Aunque exista la posibilidad de que estos efectos se presenten, en general los medicamentos son seguros y es mayor el riesgo que se tiene (de tener una infección de transmisión sexual o un embarazo no deseado) que los riesgos asociados al uso de dichos medicamentos. Por lo tanto en caso de una violación es recomendable usar la profilaxis completa y según las indicaciones médicas.