El programa cuenta con 4 etapas: la postulación, la selección de emprendimientos, el programa de incubación, la selección de emprendimientos que recibirán capital semilla. Etapa 1 –  Postulación de emprendimientos: el periodo de postulación será publicado a través de los medios oficiales del MITIC y se extenderá hasta la fecha de cierre. Las postulaciones serán de manera virtual. Etapa 2- Selección de emprendimientos que participarán del programa de incubación: El Equipo Técnico de Selección evaluará las postulaciones recibidas y seleccionará a aquellas que obtengan mayor puntaje según los criterios mencionados en la Guía de Bases y Condiciones. Etapa 3 – Participación en el programa de incubación: Durante esta etapa, los emprendimientos seleccionados participarán de módulos de formación con expertos, mentorías personalizadas y preparación para presentar sus ideas en el Demo day. Etapa 4: Selección de emprendimientos que recibirán capital semilla: Aquellos emprendimientos que hayan cumplido con todos los compromisos podrán defender su propuesta ante el Comité de Selección de Proyectos, quienes basados en los criterios publicados en la GBC, definirán a los adjudicados del Capital Semilla y presentarán sus propuestas en el Demo Day. Etapa 5: Ejecución del capital semilla: Se publicará en el sitio web www.innovando.gov.py el listado de los emprendimientos seleccionados para recibir este beneficio, además se les notificará el resultado mediante una comunicación por correo electrónico a la dirección declarada inicialmente por el postulante.