Esta respuesta se aplica tanto a temas como a plugins, ya que no se usan y ahí están ocupando espacio, por ejemplo. Pero aquí te presento más razones por las que eliminar temas o plugins que no se usan ni se usarán
Por la Seguridad: Cuando más plugins o temas haya , más fácil puede ser para un hacker entra o que te inyecten código
Las actualizaciones: Por seguridad y funcionalidad todo lo deberías tener actualizado, así que aunque no lo use lo debes de actualizar
El rendimiento: Cuando más archivos tenga una web , más probable es que te vaya lento. Un tema no activo , no afecta al rendimiento del sitio si está bien codificado, pero si no lo está te afectará.
El espacio: Efectivamente, todo ocupa espacio esté o no activo, así que si pones cosas que no usas y el plan se queda pequeño o vacías o amplias, si amplias evidentemente pagará más por un plan que tiene cosas que No se usan
El rendimiento de la base de datos: si un tema está inactivo y este ha añadido datos a la base de datos cuando si lo estaba, esos datos seguirán almacenados en la base de datos . En caso de eliminarse plugin o tema , esos datos innecesarios se eliminarán de la BD