En realidad el proceso constructivo de una piscina ecológica puede variar mucho dependiendo de cada caso.
Mientras que en unas situaciones se tendrá que empezar desde cero, en otros casos se pueden aprovechar las instalaciones previas destinadas a una piscina tradicional. Y no todas las piscinas naturales están igual de tecnificadas ni cuentan con el mismo sistema de filtrado.
Por ejemplo, algunas piscinas naturales se construyen sin hacer apenas obra: Simplemente se excava el terreno, se impermeabiliza y se instalan las plantas acuáticas y el resto de elementos. Por otro lado, otras piscinas naturalizadas se construyen empleando hormigón o bloques armados.