No hay un tiempo de duración de los síntomas definido, pero por lo general deben haberse experimentado durante al menos 3 meses en los últimos 6 meses para ser catalogado como Síndrome de Intestino Irritable.
Al ser un trastorno funcional que puede desencadenarse por múltiples factores (dietéticos, ambientales, infecciosos, medicamentosos, relacionados con el estado de ánimo y de la microbiota), los síntomas pueden tardar en desaparecer más o menos tiempo en función de los cambios que se realicen en la dieta, modificaciones de los hábitos de vida, tratamiento médico, complementos alimenticios, psicoterapia, acupuntura y técnicas de relajación.