Para utilizarlo en cosmética, el colágeno se obtiene de dos tipos de fuentes: naturales y sintéticas. Las naturales pueden ser animales o vegetales. Debido a que es más barato y fácil de obtener, se extrae principalmente del ganado bovino. Esto puede provocar reacciones alérgicas y de sensibilidad, además de transmisión de enfermedades.
Para evitar estos inconvenientes, se han desarrollado fuentes sintéticas de colágeno. Se trata de modificar las moléculas de colágeno para que sean más compatibles con el uso en humanos y no perjudiquen nuestra salud. El único "pequeño gran" inconveniente con este tipo de colágeno es que resulta ser más caro y menos efectivo que el natural.
En la actualidad se comienza a utilizar en mayor cantidad el uso de colágeno de animales marinos. Es una fuente natural de colágeno, por lo tanto más efectiva. No tiene riesgo de transmitir enfermedades ni de producir reacciones secundarias. Aunque el colágeno bovino sigue siendo el más utilizado, el marino podría reemplazarlo en un futuro muy próximo.
La siguiente tabla resume las ventajas y desventajas de las fuentes de colágeno: