Que un alimento siga dando positivo, a pesar de la dieta de exclusión, puede ser por distintas causas:
Dieta inadecuada: contacto insospechado con el alimento.
Tiempo necesario: el tiempo para que el sistema inmune "olvide" una respuesta es variable (mecanismos de apoptosis). La cronicidad, el tiempo de evolución y el grado de deterioro inflamatorio del que parte cada paciente es variable y condiciona la evolución.
Reacción cruzada con otro alimento: el paciente es sensible a otro alimento que come y que comparte la misma proteína "diana" que el que está intentando excluir en su dieta.
Coexistencia de un otros mecanismos: presencia de anticuerpos IgE que modifican la inmunidad de memoria.