Un componente importante de la faloplastia es la construcción de una uretra funcional que permita a la persona orinar de pie. Esto se consigue extendiendo la uretra existente usando tejido del sitio donante.
Para extender la uretra en los primeros centímetros, el cirujano utiliza tejido de la pared anterior de la vagina y un colgajo hecho con la piel de los labios menores. Luego se sutura a la uretra previamente creada en el falo.