Si bien la remediación ambiental tiene como objetivo mitigar los riesgos asociados con la contaminación, el proceso de remediación en sí puede plantear ciertos riesgos. Estos pueden incluir exposición a sustancias peligrosas, posibles impactos en los ecosistemas, alteración de las comunidades locales y alteración temporal de los hábitats naturales. Las medidas de seguridad adecuadas y el control ambiental son esenciales para minimizar estos riesgos.