La raíz de valeriana es generalmente segura para un uso a corto plazo, pero su seguridad para un uso a largo plazo no se ha establecido mediante investigaciones exhaustivas. Algunos estudios han sugerido posibles efectos secundarios como dolores de cabeza, mareos y malestar estomacal con el uso prolongado en dosis altas o cuando se combina con ciertos medicamentos. Siempre es mejor hablar con su proveedor de atención médica antes de usar cualquier suplemento a base de hierbas con regularidad o durante un período prolongado.