Los riesgos de un procedimiento de trasplante de cabello incluyen infección, cicatrización y calvicie permanente o temporal. Los efectos secundarios pueden variar según la edad de la persona y el tipo de técnica de injerto utilizada en su caso.
El efecto secundario más común es la calvicie temporal o permanente, que puede ocurrir si los injertos no se colocan correctamente o si se colocan en un área donde no podrán crecer.