Al igual que la mayoría de los medicamentos, los de quimioterapia tienen efectos secundarios. Es fácil confundir estos efectos secundarios con los síntomas del cáncer. Distintos medicamentos poseen diferentes efectos secundarios a corto y largo plazo. No todos los medicamentos de quimioterapia provocan todos los efectos secundarios. Por lo general, la quimioterapia daña las células que se están dividiendo, aquellas partes del cuerpo en las que frecuentemente se dividen células normales. La boca, los intestinos, la piel, el cabello, la médula ósea son comúnmente afectados. El cabello crece todo el tiempo. La piel se renueva constantemente. Lo mismo sucede con las paredes de la boca y del sistema digestivo, para ello, todos estos tejidos deben dividirse constantemente para producir nuevas células y esto hace que los síntomas sean temporales (durante el tratamiento).