El IFAPA tiene como objetivo ser un instrumento ágil y eficaz en su funcionamiento y operatoria, realista y pragmático en sus diferentes programas de actuación. Apostando e impulsando la investigación, la innovación tecnológica y la capacitación en el ámbito de la agrícola, pesquera y de las industrias alimentarias de Andalucía. Además, contribuye a la modernización de los sectores agrarios, pesquero y alimentario. Así como a la mejora de la competitividad a través de la capacitación y formación online de los diferentes intervinientes de cada sector productivo.