Shopify se ha asociado con Microsoft para procesar pagos online desde Business Central. Esta conexión mejora ostensiblemente la experiencia de compra de los usuarios, es fácil de usar y ofrece una gestión empresarial integral a través de módulos de finanzas, ventas, servicios y operaciones.; todo dentro de la misma aplicación. El soporte incluye soporte para múltiples tiendas, sincronización bidireccional de artículos, clientes e inventario e importación de pedidos desde Shopify.