La neuralgia glosofaríngea consiste en ataques recurrentes de dolor intenso en la parte posterior de la garganta, en el área cerca de las amígdalas, la zona posterior de la lengua, una parte del oído y el área debajo de la parte posterior de la mandíbula. La causa es desconocida, pero a veces se trata de una arteria colocada de manera anómala que ejerce presión, esto es, comprime el nervio glosofaríngeo. Se trata de una molestia rara que comienza normalmente después de los 40 años y se manifiesta con una mayor frecuencia en los hombres. Pueden ser de ayuda los mismos fármacos que se usan para tratar la neuralgia del trigémino, los anticonvulsivantes (carbamazepina, gabapentina o fenitoína). Sin embargo, para conseguir un alivio permanente, puede ser necesaria la cirugía. El nervio glosofaríngeo se separa de la arteria que lo comprime colocando entre ellos una pequeña esponja (descompresión vascular).