Aunque a menudo se afirma que los instrumentos de madera son superiores a los de plástico, esto depende de la marca y el modelo en cuestión. Por lo general, una flauta de pico de madera no tiene el mismo tono penetrante que puede tener una flauta de plástico. Sin embargo, requiere más cuidados, ya que hay que aceitarla con frecuencia y limpiarla después de cada uso. Es susceptible a la humedad y, si no se cuida, puede deteriorar la flauta y hacer que se parta el cuerpo. Las flautas de plástico son lavables (¡perfectas para los niños pequeños!) y no requieren el mismo nivel de cuidado. Son más duraderas, resistentes a los daños causados por la humedad y suelen costar menos. Sin embargo, depende de la propia flauta y del reproductor en cuestión.