Es uno de los escenarios anteriores, donde la proteína no está realizando su función prevista, lo que puede causar una enfermedad genética. Dependiendo de la función de la proteína faltante o anormal, el individuo portador de la mutación puede verse afectado en diferentes partes del cuerpo y desarrollar los síntomas de la enfermedad. Hasta la fecha se han identificado alrededor de 5.600 trastornos de un solo gen.