La microbiota intestinal empieza a formarse durante los primeros momentos del nacimiento, pues dentro del útero el feto tiene un aparato digestivo sin bacterias. El tipo de parto, la lactancia materna, la edad del destete y el inicio de alimentación no láctea, influyen en la composición de la flora intestinal del niño y se ha vinculado a la prevalencia de enfermedades alérgicas y gastrointestinales, posteriormente (25).
Los nacidos por vía vaginal suelen adquirir una microbiota más abundante y variada en comparación con los casos por cesárea. De igual manera, los bebés alimentados con leche materna, en contraste con los que recibieron fórmulas infantiles. Se estima que a partir de los dos años el niño comienza a esbozar cuál será la composición de su microbiota en la adultez (25).
El uso de probióticos para aliviar afecciones digestivas en los niños se ha demostrado en varios estudios y las indicaciones más aceptadas, que varían según la cepa, son diarrea aguda infecciosa, diarrea asociada a antibióticos, síndrome de intestino irritable, asociación al tratamiento de erradicación del Helicobacter pylori, enfermedades inflamatorias intestinales, encefalopatía hepática y Esteatohepatitis no alcohólica (26).