Depende del volumen de negocio de tu ecommece. Si dispones de una tienda online pequeña, WooCommerce ofrece lo indispensable para aquellas marcas que no esperan un crecimiento exponencial a corto plazo.
Por su parte, Prestashop ofrece más funcionalidades que puedes usar para hacer crecer tu negocio. Además, posee un amplio abanico de módulos y su comunidad es muy interactiva.
Te dejamos por aquí esta guía comparativa de Woocommerce vs Prestashop.