El factor más importante es la edad de las mujeres. Después de los 43 años, la tasa de éxito disminuye dramáticamente.
Tener más de tres ciclos previos de tratamiento de infertilidad fallidos a pesar de la buena calidad de los embriones en una clínica exitosa es también un factor de pronóstico negativo.
Las muestras de esperma que contienen predominantemente espermatozoides con graves defectos morfológicos pueden causar menores tasas de fertilización y embarazo.
El endometrio, la capa interna del útero que acepta los embriones, desempeña un papel importante en la implantación. Un endometrio más delgado disminuye las posibilidades de embarazo.
El hidrosálpinx puede afectar negativamente a la implantación. Son trompas de Falopio hinchadas y llenas de líquido. Este fluido regresa al útero y es tóxico para los embriones, aumentando el riesgo de fracaso de la implantación, el aborto y también la tasa de embarazos ectópicos. Estas trompas patológicas deben ser retiradas o bloqueadas antes de intentar un tratamiento de infertilidad.