Hay tres desventajas principales que suelen discutirse en torno a la circuncisión. La primera es el evidente dolor asociado al procedimiento. El prepucio contiene muchas terminaciones nerviosas, lo que hace que el postoperatorio sea bastante doloroso para los hombres adultos.
Al tratarse de una intervención quirúrgica, otra desventaja es la posibilidad de complicaciones durante o después de la cirugía. Se ha informado de problemas para orinar o de que se ha extirpado demasiada piel. Y por último, está la posibilidad de que disminuya la función sexual.
Sin embargo, estas desventajas pueden variar de un paciente a otro. Y es que muchos hombres experimentan una recuperación rápida y sin complicaciones, y tampoco encuentran diferencias significativas en la sensibilidad del pene durante las relaciones sexuales.