Probiotiki so dobrodejni mikroorganizmi, za katere je bilo dokazano in potrjeno pozitivno delovanje na človeško zdravje. Predstavljajo dobrodejne mikroorganizme v mikrobiomu.
Uporaba besede probiotik po EFSA regulacijah od l. 2018 v EU ni dovoljena za označevanje izdelkov s probiotiki, zato se poimenovanje probiotikov nadomešča z besedami mikroorganizmi, EM, dobrodejni mikroorganizmi, dobrodejni mikrobi, dobre bakterije, ipd.