Tveganja, povezana z IVF, so minimalna. Eden redkih zapletov hormonskega zdravljenja je hiperstimulacija (OOHS), pri kateri se jajčniki povečajo. Največja posledica hiperstimulacije je bolečina v spodnjem delu trebuha, občasno lahko pride do kopičenja tekočine v trebušni votlini. Te simptome pa današnja medicina brez težav zmanjša,  hiperstimulacija pa nato spontano popusti. Nosečnost po umetni oploditvi se ne razlikuje od naravne nosečnosti in obstajajo enaka tveganja (npr. prezgodnji porod, splav itd.).