Postopek potrditve računa poteka tako, da elektronska naprava ustvaril elektronsko podpisano XML datoteko s podatki o izdanem računu in jo pošlje na FURS. Informacijski sistem FURS nato poslane podatke preveri in pošlje elektronski napravi posebno enkratno identifikacijsko oznako računa, ki se izpiše na računu. Identifikacijska številka je sestavljena iz oznake poslovnega prostora zavezanca, oznake elektronske naprave za izdajo računov in zaporedne številke računa. Postopek traja kakor 2 sekundi; v tem času mora informacijski sistem davčnega organa obdelati sporočilo s podatki o računu in vrniti zavezancu sporočilo z odgovorom (čas od trenutka vstopa sporočila v informacijski sistem davčnega organa do trenutka izhoda sporočila z odgovorom iz informacijskega sistema davčnega organa). S takšnim postopkom FURS pred izdajo potrdi izdani račun. Enkratna identifikacijska številka računa, ki je izpisana na računu, dokazuje oziroma predstavljala potrdilo, da je bil račun ustrezno evidentiran na FURS.