Vzrok nastanka prhljaja še ni povsem jasen. Najpogosteje se kot možen vzrok navaja gljivica Pityrosporum ovale, ki se nahaja tudi na zdravem lasišču. Glivica napada površinske celice kože, posledica pa je povečano nastajanje krovnih celic ki ga opazimo kot prekomerno luščenje kože in nadležne luske na ramenih.