Hlavnou nevýhodou je nutnosť nabíjania, ktoré môže zabrať aj niekoľko hodín. Elektrobicykle sú pomerne ťažké, čo zhoršuje manipuláciu, ovplyvňuje štýl jazdy a pri vybití sa s nimi celkom nadriete. V neposlednom rade ide aj o pomerne drahé zariadenie.