Namiesto bežného interaktívneho protokolu klient-server, AdGuard DNS umožňuje používať špecifický šifrovaný protokol - DNSCrypt. Vďaka tomu sú všetky žiadosti DNS šifrované, čo chráni pred možným odpočúvaním žiadostí a následným odchytením a / alebo modifikáciou.