Náklady závisia na type služby a jej rozsahu. Skladajú sa z dvoch zložiek – faktoringového poplatku a úroku. Faktoringový poplatok sa počíta z nominálnej hodnoty faktúry a úrok z financovanej čiastky. Štandardne sa cena financovania pohybuje medzi 0,5 - 2 % z hodnoty faktúry. U bezregresného faktoringu sa pripočítava bezregresný poplatok, ide o cenu za poistenie rizika neuhradenia pohľadávky.