Problematika tejto otázky je zložitá a závisí od viacerých parametrov. Ani jeden z variantov fajčenia tabaku nemožno nazvať „zdravším“. Pokiaľ sa o vodnú fajku delíte s viacerými ľuďmi, tabak je kvalitný a nepáli sa a fajka je správne vyčistená, potom môže byť teoreticky menej škodlivá, pretože nedochádza k spaľovaniu. Vedecky však táto skutočnosť nie je preukázaná a tak sa nemožno prikloniť ani na jednu stranu. Za zdravší variant možno považovať iba ak sú namiesto tabaku použité kamienky.