Väčšina výrobcov menštruačných kalíškov uvádza, že by sa mali vyprázdniť po štyroch až šiestich hodinách. Toto obdobie je však veľmi individuálne. Ak máte silnejšiu menštruáciu, možno budete musieť pohárik vyprázdňovať častejšie, najmä ak používate menšiu veľkosť pohárika. Na druhej strane, ak je menštruácia slabšia, pohárik môže vydržať bez vyprázdnenia viac hodín, ako uvádza výrobca. Nikdy však nenechávajte pohár na mieste dlhšie ako dvanásť hodín v kuse. Baktérie by sa mohli množiť, čo často vedie k infekciám alebo nepríjemným mykózam.