Na riadenie výroby používa Business Central výkonný a vylepšený modul, ktorý nadväzuje na jeho obľúbeného predchodcu v systéme Dynamics NAV. Podobne ako ostatné časti systému Business Central je aj výrobný modul navrhnutý tak, aby sa dal ľahko rozšíriť o špecializované aplikácie dostupné na AppSource.