Военный комиссар непосредственно подчиняется начальнику штаба - первому заместителю командующего войсками военного округа (начальнику штаба - первому заместителю командующего Северным флотом). (В редакции Указа Президента Российской Федерации от 2022-02-19 № 803 - вступает в силу с 2022-02-19).