Чтобы поставить автограф на электронном документе, его отправляют в Госключ из Госуслуг или из внешнего сервиса электронного документооборота. Если используется второй вариант, то документ аналогично сначала появится на Госуслугах, а оттуда поступит в Госключ. Там надо следовать инструкциям и подписать его.