Чаще всего врачи назначают амоксициллин, цифроплоксацин или тетрациклин. Прием антибиотиков позволяет уменьшить зону инфицирования или приостановить воспалительный процесс, если причиной болезни стало первичное инфекционное заболевание. Терапевтическое лечение кисты зуба предусматривает прием медикаментов внутрь или введение лекарства в кистозную полость.