Машиночитаемая доверенность не заменяет бумажную полностью. МЧД будут применяться в контексте конкретных информационных систем и набора полномочий.
На бумаге же этих ограничений нет, поэтому бумажные доверенности продолжают действовать, как минимум когда нужно уполномочить физическое лицо на те действия, которые находятся вне информационных систем.