Обратите внимание на печати и подписи в документе, полученном в МФЦ, на нём стоят отметки ЗАГСа, а следовательно этот документ относится к ЗАГСу и апостиль на него можно поставить там же. МФЦ выступает в качестве посредника и самостоятельно не проставляет апостиль, а всего лишь передаёт ваши документы в ЗАГС.