Согласно поправкам в Федеральный закон от 6 апреля 2011 года № 63-ФЗ «Об электронной подписи», пользоваться сертификатом сотрудника юрлица можно еще год, а вот получить его после 1 сентября уже не выйдет. Можно будет оформить только сертификат физлица, а в нем нет данных об организации. Следовательно, при подписании отчета таким сертификатом нужны будут машиночитаемые доверенности (МЧД).
Все актуальные правила работы с сертификатами найдете в статье.