Если смотреть с точки зрения юридической, то правильно: "границы земельного участка".
Такому написанию есть много объяснений.
Во-первых, границы участка всегда должны иметь точки, через которые такие границы проходят - как минимум три точки или межевые знаки.
Во-вторых, участки бывают многоконтурные, т.е. "пятна" два и более, но это все есть один земельный участок. Соответственно границ у него будет много.
В-третьих, с юга, например, участок граничит с одним соседом, с севера - с другим. Это тоже разные границы участка, условно: южная и северная.