H.264 - это только видеокодек, который отличается от видео контейнера MP4. Конечно, кодек напрямую связан с качеством видео. Видеокодек H.264 может использоваться в MP4, MOV, а также в других популярных видеофайлах. Если вы хотите сохранить проект After Effects в формате MP4, вы можете принять во внимание H.264.