Тут может быть две ситуации:
Интернет-магазин ранее продвигался и занимает хорошие позиции в ТОП-10 по целевым запросам.
Сайт не продвигался, какого-либо трафика из поиска на нём нет.
В первом случае, при переносе магазина на новый движок, целесообразно предварительно обратиться к SEO-специалисту. Он оценит возможности новой платформы, скажет, насколько она приспособлена для поисковой оптимизации, и можно ли будет реализовать на ней все те функциональные решения, которые сейчас есть на сайте. После переноса оптимизатор проконтролирует насколько изменилась структура каталога, чтобы составить карту редиректов для разделов, которые сменили адреса. Таким образом получится избежать падения позиций сайта и сохранить текущий поисковый трафик.
Во втором случае, к спецам по поисковой оптимизации можно обратиться уже после переноса интернет-магазина, т.к. терять особо нечего. И уже с начала работы нового сайта, маркетологи приступят к его продвижению.