Нет, если вы приняли решение подавать документы онлайн, то помимо уменьшения пошлины за подачу документации, будут снижены пошлины за проведенную экспертизу, за выдачу свидетельства о госрегистрации, а также за продление срока действия этого свидетельства.
Так что стоит всерьез поразмыслить об именно таком способе взаимодействия с Роспатентом.