Противопоказанием к бариатрической операции может стать язвенная болезнь желудка и злокачественное новообразование органов желудочно-кишечного тракта. Также запрещено проведение реконструктивных операций пациентам с психическими расстройствами и ВМИ менее 30 кг/м2.