На голову пациента надевают ленту с лёгкими датчиками. Какого-либо воздействия на пациента не производится. Пациент находится перед экраном монитора, на котором демонстрируется видеофильм. Прибор регистрирует электроэнцефалограмму (ЭЭГ) над проекцией зрительной коры мозга пациента. Сигнал ЭЭГ передается в процессорный блок для анализа биотоков мозга в реальном времени. «Амблиотрон» постоянно производит вычисление величины суммарной активности нейронов зрительной коры по параметрам ЭЭГ и идентифицирует фазы усиления и ослабления этой активности.
В зависимости от фазы колебаний активности нейронов зрительной коры, «Амблиотрон» управляет включением и гашением экрана монитора. Таким образом, возможность просмотра видеофильма или отсутствие такой возможности зависит от качества работы зрительной коры мозга пациента. В ходе ежедневных повторений этой процедуры (обычно 20 получасовых сеансов) мозг пациента постепенно формирует новые рефлекторные связи, обеспечивающие более высокий уровень зрительных функций за счет стабильного повышения (при гиперметропии) или снижения (при миопии) возбудимости нейронов зрительной коры и оптимизации параметров их рецептивных полей.