Настойка пустырника — спиртосодержащее средство, поэтому к опасностям самого растения добавляются противопоказания спирта. Он представляет опасность для беременных и кормящих, а также для детей. Кроме того, передозировка настойкой пустырника влияет на сердечный ритм и вызывает воспаление слизистой при наличии заболеваний желудка и кишечника.