Бывают редкие случаи, когда появляются большие внутренние области пораженной ткани, при этом процесс не затрагивает эмаль зуба. Это так называемый изолированный, или атипичный, кариес дентина. Отличается он от обычного кариеса тем, что эмаль остается здоровой, а поражается сразу дентин. Такая ситуация может возникнуть при длительном употреблении в профилактических целях медикаментов, содержащих фтор. Фтор оказывает укрепляющее действие на зубную эмаль, покрывающую дентин и образующую вокруг него что-то типа капсулы или оболочки, внутри которой развивается кариес.