Стоматит не является противопоказанием для чистки зубов, но сама процедура может вызывать дискомфорт из-за болевых ощущений. Во время болезни рекомендуется больше внимания уделять полосканию, а также сменить зубную щетку и обрабатывать её, чтобы не допустить распространение инфекции.