Гастроэнтерологи (болезни пищеварительного тракта) диагностируют и лечат заболевания детских болезней пищеварительного тракта: болезни пищевода, желудка и двенадцатиперстной кишки (воспаления, диспенции, гастроэзофагеальный рефлюкс и др.), кишечника (болезнь Крона, язвенный колит, целиакию, синдром мальабсорбции, аллергические заболевания пищеварительного тракта, синдром раздраженного кишечника, по разным причинам начавшийся понос или запор), заболевания печени, поджелудочной железы, желчи и протоков (гепатит различного происхождения, врожденные заболевания печени, панкреатит и др.). Консультируют родителей по вопросам расстройства роста, детского питания, недостаточного питания или ожирения, аллергии к пище, приема пробиотиков и пребиотиков. Исследуют и сотрудничают при лечении онкологических заболеваний, дополнительно назначают физиотерапевтические процедуры.