В зависимости от исследуемой области пациент находится в положении лежа, стоя или сидя. На его кожу наносится специальный гель на водной основе. Врач водит датчиком по телу пациента, при этом отражения ультразвуковых волн от исследуемого органа фиксируются и с помощью специального ПО отображаются на мониторе УЗИ-аппарата. Презерватив используется при трансректальном и трансвагинальном исследовании для обеспечения стерильности.