Препарат продается в готовом виде. Используют его только наружно, смазывая место поражения ватной палочкой, смоченной в растворе. Обработку проводят 2-3 раза в день до тех пор, пока не исчезнут признаки заболевания.
Для промывания полостей при цистите и уретрите метиленовый синий дополнительно разводят водой в соотношении 1:5000. Процедуру проводят 1-2 раза в день.