Министерство юстиции вносит запись о регистрации в свой реестр, Федеральная налоговая служба в свой. Сначала решение о регистрации НКО будет принимать Минюст. В случае положительного решения, ведомство перенаправляет документы в регистрирующий ФНС, которая вносит соответствующую запись в ЕГРЮЛ. Затем сведения дублируются в реестре Минюста.