Не должно повлиять на оформление документов для регистрации ИП. Если в базах будет полное соответствие вашей ФИО в паспорте, в Снилс и ИНН. При оформлении неоторых документов могут возникнуть трудности, это зависит от человеческого фактора и выбранного варианта регистрации ИП. Однозначно документы необходиомо привести в порядок.