В возможности масштабирования сайты на шаблоне проигрывают индивидуальной разработке вчистую: вы получаете только то, что предусмотрено типовым проектом. И не всегда реализовать ваши идеи возможно: это потребует дополнительных бюджетов, и не всегда это можно реализовать. Доработки могут потребовать полного рефакторинга, фактически – создания нового темплейта с нуля. Нет смысла экономить на индивидуальном проекте на начальном этапе, если окажется, что уже через несколько месяцев уже работающий сайт придётся переделывать.
Однако если вы уверены, что возможностей шаблона вам достаточно – не стоит переплачивать за разработку. Просто убедитесь ещё на старте, что в шаблоне есть абсолютно всё, что нужно. Тем более, что многие правки можно сделать и без рефакторинга, не внося глобальных правок в код.