Конечно можно.
При этом возможно несколько вариантов:
1) На вашем домене еще не размещен сайт. Тогда мы просто размещаем новый интернет-магазин на этом домене. Для размещения интернет-магазина на домене обратитесь в техподдержку.
2) На вашем домене уже размещен сайт и он действующий. При этом вы не хотите останавливать его работу. Тогда можно создать поддомен (домен третьего уровня вида parts.shop.ru) и разместить интернет-магазин на нем, а на вашем основном сайте сделать ссылку на этот интернет-магазин.