Центр базируется в подмосковном поселке Кубинка-2. В марте 2013 года там началось строительство специального центра, который рассчитан на 500 бойцов спецназа, проходящих контрактную службу. Помимо Центра «Кубинка-2» в эту структуру также входят Центр специальной подготовки «Сенеж», 561-й аварийно-спасательный центр, Центр подготовки специалистов.