По ИИС-1 с дохода от продажи акций, если они были проданы дороже, чем приобретены, с дохода по купонам облигаций и дивидендам акций, с операций по продаже драгоценных металлов на бирже, а также в случае, если инвестор их продал с прибылью. По ИИС-2 и ИИС-3 есть льгота на уплату НДФЛ при закрытии счёта после минимального срока владения. Налог платить не потребуется.