Серьезные исследования, проводимые в области изучения кератоконуса, до сих пор не смогли установить точную причину возникновения заболевания. Предположительно, возникновению кератоконуса способствует несколько факторов, таких как: генетическая предрасположенность, травмы роговицы, снижение функции желез внутренней секреции, вирусные инфекции (гепатит В), стрессы, аллергии, неблагоприятное воздействие внешней среды. Каждый из них может послужить спусковым механизмом развития заболевания.