Вероятно данная ЭЦП заблокирована сотрудником ИФНС. Необходимо обратиться в вашу налоговую инспекцию в отдел камеральных проверок для выяснения причин. Как правило, инспектор отдела камеральных проверок просит чтобы руководитель организации или индивидуальный предприниматель лично явились с паспортом и распечатанной копией сертификата ЭЦП.