Да, по закону и новый, и уже работающий сотрудник вправе выбирать удобный ему банк для получения зарплаты, даже если все остальные в компании на зарплатном проекте другой кредитной организации. Достаточно написать заявление об изменении реквизитов для получения средств и предоставить его работодателю.