Применение нифуроксазида во время беременности и кормления грудью нежелательно, так как его безопасность для этих групп пациентов исследована недостаточно. В каждом таком случае необходима консультация с врачом и, даже если потенциальная польза перевешивает риск, применение препарата должно быть тщательно продумано.