Во-первых, это —  экономия. Легче и дешевле сделать всё правильно сразу. Перерабатывать структуру сайта, а также добавлять или переделывать функционал обычно выходит дороже.
Во-вторых, предварительное seo-проектирование ускорит процесс поисковой оптимизации после запуска сайта. Вы сможете быстрее начать работы по продвижению, сайт раньше проиндексируется в поисковиках.