Очистке подлежат сточные воды, а также поверхностные и подземные воды, которые могут быть загрязнены промышленными и бытовыми отходами. Особое внимание уделяется водам, сбрасываемым промышленными предприятиями, сельскохозяйственными комплексами и городскими водоочистными станциями. Очистка также необходима для водоемов, используемых для питьевого водоснабжения и рекреационных целей.