Среди осложнений контагиозного моллюска можно назвать формирование рубцов на месте удаленных узелков, хронический конъюнктивит (если поражена область вокруг глаз), а также дополнительные бактериальные осложнения — фолликулит, поверхностная инфекция кожи и т. д.