Учитывая, что сеть IOTA не является блокчейном, можно подумать, что для нее не требуется механизм консенсуса. Тем не менее, чтобы обеспечить безопасность сети, в процесс проверки транзакции включена относительно простая задача доказательства работы.
Вокруг IOTA возникали сомнения о его безопасности. В прошлом исследователи заявляли об обнаружении уязвимостей в коде проекта.