Противопоказаниями к трансвагинальному УЗИ органов малого таза является целостность девственной плевы, острый воспалительный процесс на слизистой влагалища, сильное кровотечение, период реабилитации после некоторых гинекологических операций. Трансабдоминальное УЗИ органов малого таза не рекомендуется непосредственно после операций на мочевой пузырь. Такое ограничение обусловлено тем, что для проведения исследования нужно наполнить мочевой пузырь.