Нелеченый анкилозирующий спондилит может вызвать сильную боль и инвалидность, поскольку воспаление приводит к эрозии костей, кальцификации, рубцеванию тканей и образованию дополнительных костей. В конечном итоге суставы позвоночника могут срастись. У некоторых людей дополнительно развивается снижение жизненной емкости легких и хроническое воспаление сердца или глаз.