Да, вы можете использовать любые доступные сервисы по ведению учета ИП. Все зависит от стоимости и качества услуг. Еще рекомендуем проверять учтены ли вычеты по основным налогам при формировании квартального расчета налогов или подачи годовой отчетности. Как правило банковские сервисы просто рассчитывают 6% налог к уплате без учета вычетов и предлагают вам оплатить. Очень часто в доход попадают внесения личных средств ИП на р/с, их банк трактует как внесение выручки от продаж и налогооблагаемым доходом. Итог: сервисы не заинтересованы экономить ваши средства, сводят все автоматом без учета некоторых возможностей. За ними необходимо следить и перепроверять, как и за бухгалтерами.