Почистить MacBook конечно можно, даже не имея кулеров небольшое количество пыли все же оказывается внутри. Это наглядно видно при замене аккумулятора или другом ремонте. А вот термопасту менять не стоит, ее там попросту нет :), также как радиатора, под которым она используется. Чтобы понять причину перегрева - приносите его нам на диагностику.