В этом случае выбирайте тот формат файла, который лучше всего воспроизводится вашим ридером. Чаще всего проблемы возникают когда в читалках используют форматы файлов которые они не поддерживают. Для того чтобы в будущем избежать таких проблем изучите досконально стандартные форматы файлов которые ваша электронная книга без проблем может воспроизводить.