Современная медицина использует различные методы диагностики трематодозов: микроскопия кала, анализ крови на наличие антител и генетические методы. Особенно эффективным является генетическая диагностика, которая может определить конкретный вид паразитов и позволяет подобрать наиболее эффективное лечение.