Инвазивные операции на желудке сопряжены с такими же рисками, как и прочие виды хирургического вмешательства. Опыт специалистов позволяет сократить возможность негативных последствий. После операции у пациентов могут возникать проблемы с перевариванием пищи из-за уменьшения размера желудка. Случаются головокружения, учащенное сердцебиение и тошнота после еды. В различных медицинских центрах Европы процент летального исхода во время хирургического вмешательства колеблется от одного до трех. В медицинском центре «Рабин» этот показатель не достигает 1 %.