Суть аутоиммунного тиреоидита заключается в том, что, по не вполне понятной причине, иммунная система дает сбой, в результате которого направляет всю свою мощь против собственных клеток щитовидной железы. В результате в щитовидной железе развивается воспаление, в исходе которого щитовидная железа разрушается и перестает вырабатывать достаточно тироксина.