Для этого есть документ Вывод из оборота с типом операции Корректировка остатков. Данный документ позволяет списать маркированный товары с остатков в ЧЗ. Однако если есть необходимость увеличить остатки, сделать самостоятельно это нельзя. Откорректировать остатки можно только обращением в техподдерку ЧЗ с предоставлением подтверждающих документов об остатках