Составной микроскоп предназначен для наблюдения тонких прозрачных образцов при большом увеличении. Он использует несколько линз для достижения высокого разрешения и обычно используется в биологических и медицинских исследованиях. Напротив, стереомикроскоп обеспечивает трехмерные (стереоскопические) изображения более крупных непрозрачных объектов, что делает его пригодным для таких задач, как вскрытие, контроль качества или проверка печатной платы.