Отсутствие лечения гранулемы зуба, прогрессия воспаления приводит к деструкции корня и утрате зубной единицы. Не исключаются более опасные осложнения, которые сопровождаются формированием ограниченного абсцесса, флегмоны, остеомиелита челюсти. В тяжелых ситуациях хронический очаг воспаления приводит к персистенции инфекции и развитию гайморита, инфекционного миокардита, а иногда и сепсиса.