Официальные пошлины ЕАПО за совершение юридически значимых действий в соответствии с ЕПК довольно высокие, однако для заявителей из стран-участниц ЕПК, в том числе для российских заявителей пошлины, связанные с подачей евразийской заявки, получением евразийского патента, передачей и восстановлением прав на евразийскую заявку или евразийский патент снижены на 90%.
Выбор интересующих стран, в которых евразийский патент будет действовать, осуществляется на этапе оплаты первой годовой пошлины за поддержание патента в силе. На этом этапе патентообладатель указывает страны и оплачивает пошлину, которая представляет собой сумму национальных пошлин за поддержание патента в силе для каждой из выбранных стран.
Евразийская процедура регистрации изобретения может быть выбрана в качестве региональной стадии (национальной фазы) по международному патентованию по процедуре РСТ.