В текущем сертификате на сотрудника есть информация как о физическом лице (сотруднике), так и об организации, от лица которой сотрудник подписывает документы. Но там нет информации о полномочиях сотрудника.
Сертификат физлица — это сертификат, где нет сведений о юрлице (ИНН, названия). В сертификате также не будет должности, только реквизиты физического лица. А все полномочия и информация, от лица какой организации подписывает, будут в машиночитаемой доверенности.