Боль часто возникает из-за травмы ткани во время криохирургии. Может пройти некоторое время, прежде чем боль исчезнет после процедуры, в зависимости от обрабатываемой области и того, как заживает рана. Для контроля боли могут быть рекомендованы обезболивающие препараты.