Диагностика болезни Крона у детей проводится на основании следующих лабораторных анализов: общего анализа крови для выявления анемии, лейкоцитоза, ретикулоцитоза, увеличения СОЭ; биохимического анализа крови с целью обнаружения гипоальбуминемии, гипопротеинемии, снижения уровня микроэлементов, гипокалиемии, повышения щелочной фосфатазы, А2-глобулина и С-реактивного белка; исследование кала на наличие эритроцитов, слизи, жиров; радионуклидное исследование крови для выявления сбоев в циркуляции желчных кислот и продуктов их обмена. На основании перечисленных анализов обнаруживается не только наличие болезни Крона, но и ее стадия.