Стоимость ПТЭ зависит от ряда факторов, включая сложность задачи, поставленные вопросы, объем необходимых исследований, необходимость привлечения специалистов других областей знаний, стоимость лабораторных исследований (при необходимости), условия проведения экспертизы (в том числе время суток и наличие выходных дней), местоположение объекта и другие факторы.
Точную стоимость ПТЭ можно узнать только после проведения первичного ознакомления с имеющимися документами и определения объема работ. Обычно стоимость ПТЭ оговаривается в договоре между заказчиком и экспертной организацией.