На начальных стадиях развития болезни можно лечить бартолинит без применения хирургических методов. В остальных случаях без операции заболевание переходит в хроническую форму, развиваются осложнения, среди которых - воспаление репродуктивных органов и распространение инфекции по организму, формирование свищей, угроза выкидыша при беременности, риск развития инфекционных заболеваний у плода.