Это зависит о вашего желания. Настойка из целых плодов имеет ряд плюсов:
На приготовление уходит меньше времени, потому что не надо разделывать каждый фрукт.
Более прозрачная, чем из кусочков слив.
Имеет миндальный оттенок вкуса.
Но у нее есть огромный минус и минус поменьше:
Большой недостаток в том, что в косточках содержится ядовитая синильная кислота, поэтому ее нельзя долго хранить.
Еще одной проблемой может стать фрукт красивый снаружи, но гнилой внутри.
Поэтому удалять косточки или нет –  решать вам. Ориентируйтесь на свои вкусы и планы. Если планируете приготовить угощение для друзей на весь год, лучше потратить время и разделать фрукты.