Кроме опасности перерождения в злокачественную опухоль, лейкоплакия опасна нарушением функции мочеиспускания, уменьшением функционального объема мочевого пузыря и рефлюксом (обратным движением) мочи, что может вызвать пиелонефрит с возможным развитием хронической почечной недостаточности и даже отказ почек.