Септик имеет эффективность очистки около 60%, в то время как в случае автономной системы очистки сточных вод этот показатель составляет 95-98%. В первом случае реакция представляет собой анаэробное разложение. Автономные канализации работают на более глубоком уровне очистки, когда разрушение органических соединений происходит с помощью кислорода и микроорганизмов.