Вероятность возникновения последствий лазерной литотрипсии минимальна. При доступе через мочевыводящие пути (уретру) могут случиться травмы мочеиспускательного канала, мочеточника, лоханки, кровотечение, рецидив почечной колики, стриктура (сужение) мочеточника и обострение хронической мочевой инфекции. Также определенное время после вмешательства могут наблюдаться кровь в моче, боли в животе, вздутие, запор, повышение АД и/или температуры, задержка мочеиспускания, тошнота и рвота.