Главная причина - отсутствие приточной вентиляции в помещении. После выключения основной горелки котел продолжает забор воздуха по пути наименьшего сопротивления, так как в передней части котла больше всего технологических отверстий. Поэтому путь наименьшего сопротивления лежит со стороны запальной горелки. В случае, когда приток воздуха затруднен или полностью отсутствует, котел будет "задыхаться", пилотная горелка будет отклонятся от нормальных плоскостей работы и пламя будет уходить из зоны термопары.