Это зависит от критериев Вашего тиража - повторяемости заказов, количества видов этикеток в заказе, срочности изготовления и т.д. Может быть важно даже такое условие, как выбор между использованием пантонов или достаточно CMYK.
В принципе, Вы можете ориентироваться на объем тиража. Цифровую печать обычно используют для тиражей до 1000 погонных метров. Для тиражей метражом более 2000  пм выгоднее заказывать флексопечать.