Добрый день!
1. Закупаете на юрлицо и с него же продаёте. Либо закупаете на ИП, ставите отдельный терминал и пробиваете на ИП косметику (так часто делают). Главное, чтобы Вы закупали и реализовывали через одно и то же лицо: ООО (клинику) или ИП.
2. Вне зависимости от способа оплаты договор заключать необходимо. Неприменение ККТ (отсутствие чека) - это отдельное нарушение, не нужно ради его сокрытия рисковать и нарушать ещё и порядок оказания платных медицинских услуг.