ПЭТ КТ не проводят при беременности и лактации, туберкулёзе в открытой форме. При почечной недостаточности и сахарном диабете обследование назначают с осторожностью. Кроме того, перед исследованием проводится тестирование на переносимость радиофармпрепарата или его компонентов.