Основное противопоказание — индивидуальная непереносимость и острые воспалительные процессы в желудочно-кишечном тракте. Из-за содержащихся в яблоках кислот, чрезмерное употребление может повредить эмаль зубов, поэтому после еды следует прополоскать рот. Не рекомендуется есть Антоновку на пустой желудок, поскольку она может повысить кислотность.