Да. Поэкземплярный учёт можно вести вместо объёмно-сортового или вместе с ним. Вести поэкземплярный учёт маркированных товаров — значит при приёмке передавать в «Честный знак» данные о каждом коде маркировки. В таком случае в накладной должны быть указаны коды маркировки каждого товара, а не только GTIN.