Хлорелла, несмотря на свои полезные свойства, не подходит всем. Противопоказания к ее приему включают в себя: индивидуальную непереносимость, аллергические реакции, заболевания печени и почек в тяжелой форме, гемохроматоз (нарушение обмена железа), повышенную свертываемость крови и беременность. Также стоит с осторожностью принимать хлореллу людям с аутоиммунными заболеваниями. Хлорелла содержит йод, поэтому людям с аллергией на йод или с заболеваниями щитовидной железы следует быть осторожными.