Экологический аудит не следует путать с оценкой воздействия на окружающую среду (ОВОС). Как экологический аудит, так и ОВОС являются инструментами управления окружающей средой, и оба имеют некоторую терминологию, например, «воздействие», «эффект» и «значительный», но между ними есть некоторые важные различия.
Оценка воздействия на окружающую среду является упреждающим инструментом, то есть проводится до того, как какое-либо действие будет выполнено. Поэтому ОВОС пытается предсказать воздействие на окружающую среду будущих действий и предоставить эту информацию тем, кто принимает решение о том, следует ли санкционировать проект.
Экологический аудит проводится, когда разработка уже ведется, и используется для проверки существующих практик, оценки воздействия текущей деятельности на окружающую среду.
Таким образом, экологический аудит дает возможность увидеть, что происходит в организации на данный момент.