Значимым моментом принято считать 3-месячный срок с момента развития заболевания. При благоприятном исходе за это время происходит полное выздоровление, при этом сохраняются функционирующие нефроны. Относительно благоприятным исходом является выздоровление, но с остаточными изменениями, когда часть клеточных структур почки погибает. Неблагоприятным прогнозом острого пиелонефрита принято считать гибель большей части нефронов, на месте которых впоследствии разрастается соединительная ткань. Нефросклероз диагностируется через 3 месяца после установления диагноза острого пиелонефрита.