Метод начисления ведения бухгалтерии имеет некоторые ограничения, которые требуют особого внимания со стороны организации. Во-первых, при использовании метода начисления необходимо следить за точностью и срочностью признания доходов и расходов. Отложенное признание доходов и расходов может существенно исказить текущую картину финансового состояния. Во-вторых, метод начисления требует более сложной и детальной бухгалтерии, так как требует учета не только фактической оплаты, но и всех обязательств и прав, связанных с доходами и расходами. Наконец, при использовании метода начисления необходимо быть особенно внимательными к вопросам своевременного учета и отражения всех доходов и расходов, чтобы избежать ошибок и искажений в отчетности.