WebEx Communications была основана в 1995 году в Калифорнии эмигрантами из Индии и Китайской народной республики Субрахом Ияром и Мин Чжу. Изначально компания называлась Silver Computing к середине 1997 года сменила название на Stellar Computing, а в декабре — на ActiveTouch.
Первые годы компании были не простые. Ияр и Чжу было тяжело поддерживать Silver Computing на плаву и сводить концы с концами. Изначально основатели были против  венчурных инвестиций, но тяжелое положение заставило продать доли нескольким фирмам, включая Baan Investments.
В середине 1998 года компания представила программы для планирования и совместной работы ActiveTouch Server и ActiveMeetings. ActiveTouch договорилась с другими для включения своего программного обеспечения в их продукты. В конце 90-х был представлена бесплатная услуга WebEx для ActiveMeetings. Новая услуга позволяла проводить онлайн-встречи в режиме реального времени и обмениваться файлами прямо на сайте. WebEx поддерживала одновременное подключение до 6-ти пользователей. Важное конкурентное преимущество по сравнению с продуктами других фирм, таких как NetMeeting от Microsoft, было отсутствие необходимости установки одинакового программного обеспечения у всех участников встречи. Так как WebEx можно было использовать напрямую из браузера. Для облегчения проведения онлайн-встреч, ActiveTouch также предоставила услуги телефонной конференц-связи.
ActiveTouch активно продвигала услугу WebEx в корпоративной среде, используют разные маркетинговые приемы. Такие как раздачу Volkswagen Жук свои подписчикам. К осени 1999 года WebEx использовала более 25 000 предприятий, и более 100 заплатили за расширения услуги. В сентябре ActiveTouch в очередной раз сменила название и стала называться WebEx, Inc. А в начале XXI века на WebEx Communications, Inc., и подала заявку на публичное размещение акций на бирже NASDAQ.
К 2004 году оборот достиг 189 миллионов долларов. В 11-ти странах были открыты офисы и общее число сотрудников достигло более 1200 человек, услугами пользовались около 8 850 бизнесов. Несмотря на международное присутствие, основной рынок остался в США. Доля рынка WebEx выросла до 64%, хотя конкуренция продолжала оставаться сильной, поскольку Microsoft и Сиско приобрели ключевых конкурентов.
В 2007 году Cisco купила WebEx Communications, Inc. за 3,2 миллиарда долларов, доведя свою долю рынка веб-видеоконференция до 36% в США, при этом у ближайшего конкурента Microsoft в 26%. Примерно через год корпорация выпустила платформу с защищенными веб-видеоконференция WebEx Collaboration Cloud. На этом фирма не остановилась и продолжала разрабатывать улучшения и расширения для платформы Cisco WebEx.