Проблемы развития электронной коммерции B2B включают необходимость создания удобного и интуитивно понятного интерфейса, а также обеспечение того, чтобы веб-сайт мог обрабатывать многочисленные транзакции. Кроме того, веб-сайты электронной коммерции B2B должны иметь возможность интеграции с внутренними системами, такими как управление запасами и обработка заказов.