Минимальный остаток - это сумма, которая минимально была у вас на счету за весь период нахождения средств. Она зависит от снятий. Если первоначальная сумма была 100 тыс., а вы сняли 99 тыс, а потом снова положили 100 тысяч, то минимальный остаток будет 1 тыс. рублей.
Именно на эту сумму будет начислен доход по ставке 1% год.