Обе платформы имеют значительные отличия. Zapier, к примеру, имеет большее количество интегрированных приложений, чем Integromat. И логичным будет ответ, что выбор зависит от вашей задачи.
Например, в Zapier есть возможность добавления Javascript кода, при помощи которого можно создать гибкое преобразование данных.
А Integromat, в свою очередь, предоставляет больше возможностей по контролю над сценарием.