С глаголом to be в Past Perfect все довольно просто. Следуем правилу образования Past Perfect: had + третья форма глагола. Глагол to be является неправильным глаголом, его третья форма – been. Получаем следующее: had + been: «By the time he turned 16 he had been to concerts only twice» – «К тому времени как ему исполнилось 16, он лишь дважды побывал на концерте»