Потому что это разные показатели - наценка и рентабельность.
Пример, закупочная цена товара 1000 руб, розничная цена с наценкой 20% -1200 руб.
Рентабельность при продаже данной продукции будет (1200 -1000 ) *100 / 1200=16,6%