В одном из последний обновлений добавили возможность выполнять перерасчеты удержаний. Возможно в 2016г. перепроводились документы, регистрирующие плановые удержания сотрудников. Перерасчет удержаний выполняется в документе Начисление зарплаты-Вкладка Доначисления-Подвкладка - Удержания. Если удалить в документе записи по перерасчету удержаний и провести, то они вернутся в разделе Зарплата-Сервис-Перерасчеты. Если перерасчет удержаний делать не нужно, необходимо отменить регистрацию перерасчета в разделе Зарплата-Сервис-Перерасчеты.