К сожалению, на каждом их этапов протокола ЭКО могут возникнуть осложнения. На этапе стимуляции возможны аллергические реакции и развитие синдрома гиперстимуляции яичников. Этап трансвагинальной пункции может осложниться кровотечением. После переноса эмбрионов в полость матки не исключен риск внематочной беременности.
Данные осложнения встречаются нечасто. В арсенале репродуктологов есть средства, которые позволяют свести возникновения данных осложнений к минимуму.