Здравствуйте!
Выбор подсудности зависит от того, кому будут предъявлены требования.
Если хотя бы одной из сторон спора будет являться поручитель, обращаться стоит в суд общей юрисдикции. Если стороной спора будет являться должник, то обращаться стоит в арбитражный суд, поименованный в договоре.
Это если исходить из того, что поручитель - физическое лицо, не являющееся индивидуальным предпринимателем, а должник - юридическое лицо.
Потому что суд общей юрисдикции в соответствии со ст. 22 ГПК РФ рассматривает дела с участием граждан и организаций, вытекающие из гражданских, семейных, земельных, жилищных, трудовых правоотношений.
А арбитражный суд по ст. 27 АПК РФ разрешает дела по экономическим спорам, возникшие между юридическими лицами и только теми физическими лицами, которые имеют статус индивидуальных предпринимателей.
Если иск будет подан не по подсудности, то он должен быть возвращен судом в соответствии со ст. 129 АПК РФ или ст. 135 ГПК РФ.
Такого рода проблемы не редкость, юристы Dubravin&Partners сталкиваются с ними каждый день. Доверьте решение ваших проблем профессионалам!