Flixbus permite clienților cu dizabilități care se deplasează cu dificultate să aibă scaunul cu rotile pliabil, astfel încât șoferul să îl poată depozita în compartimentul pentru bagaje, iar depozitarea este gratuită. De asemenea, magazinul oferă bilete gratuite pentru însoțitorii persoanelor cu dizabilități, dar persoana cu dizabilități trebuie să prezinte șoferului documentele necesare.