Deși metodologia utilizată este cea mai bună disponibilă în prezent, uneori se poate întâmpla ca proba să nu conțină suficient ADN și să nu fie posibil să se ofere un rezultat fiabil. Acest lucru se poate datora multor factori, cum ar fi procesul de prelevare nu a fost efectuat corect sau că proba nu a fost păstrată în condiții de temperatură adecvate înainte sau în timpul expedierii.