Organizarea ADN este o altă diferență între celulele eucariote și procariote. În celulele procariote, informația genetică este alcătuită dintr-o singură moleculă circulară de ADN asociată cu foarte puține proteine.În interiorul celulei, ADN-ul este ambalat într-o structură numită nucleoid. Cu toate acestea, știm că ADN-ul din celulele eucariote este organizat într-un mod mult mai complex. Informațiile genetice sunt prezente pe cromozomi, care conțin la fel de multe proteine ​​ca ADN-ul. Acesta este ambalat, secretat în timpul diviziunii celulare, transmis celulelor fiice și transcris (sub formă de ARN, implicat în sinteza proteinelor).