Em caso de afastamento por doença, o cálculo do salário líquido pode variar dependendo da duração do afastamento. Nos primeiros 15 dias, a empresa é responsável pelo pagamento integral do salário, com as deduções normais de INSS e IRPF. Após esse período, se o afastamento continuar, o trabalhador passa a receber um benefício do INSS, que pode ser menor do que o salário original, afetando o salário líquido. Durante esse período, alguns descontos podem ser suspensos ou reduzidos, dependendo da política da empresa e do contrato de trabalho.