O cachorro engole o estágio do cisto do parasita e esse "monstrinho" para nos intestinos do cão, e se liga à parede intestinal para se alimentar. Se números suficientes estiverem presentes, sinais clínicos de dano na parede intestinal irão se desenvolver. Os trofozoítos, "Monstrinhos" se reproduzem dividindo-se e alguns se transformam na forma cística.
Assim o cachorro mostra sangue nas suas fezes que são cistos infecciosos. O tempo que leva da ingestão de cistos até a passagem nas fezes é de 5 a 12 dias em cães e de 5 a 16 dias em gatos.
Quando os cistos de Giardia são encontrados nas fezes de um cão adulto saudável eles são geralmente considerados um achado transitório e insignificante. No entanto, em filhotes e cães adultos debilitados, eles podem causar diarreia aguada e grave, que pode ser fatal se não for tratada.