Para estudar na UNIPÊ com descontos de até 100%, o candidato pode ingressar via Bolsa Mérito Enem, na qual a bolsa é concedida proporcionalmente ao desempenho na prova. Ou por meio da Bolsa Mérito Acadêmico, na qual o estudante garante uma bolsa de estudo integral até o final do curso e sem limite de vagas ao fazer 75 pontos na Prova Tradicional.