Os doentes que sofrem de “pedras nos rins” apresentam como sintoma mais relevante uma dor intensa no flanco (nas "cruzes", na zona dos rins), nas costas ou no abdómen -  a temida cólica renal. Esta dor muitas vezes associa-se a náuseas e vómitos.
Se o cálculo se encontra na parte final do ureter ou na junção entre o ureter e a bexiga, são também frequentes sintomas de armazenamento do aparelho urinário inferior (aumento da frequência urinária, vontade súbita de urinar, ardor miccional).