A Febre do Nilo Ocidental pode apresentar-se de forma assintomática e até de forma neurológica grave. Nas formas leves da doença, o indivíduo apresenta sintomas como: febre, vômito, enjoo, dores de cabeça e nos olhos, dor muscular, manchas vermelhas na pele, e linfadenopatia (alteração no tamanho e consistência dos linfonodos). Nos casos mais graves, ocorre o acometimento do sistema nervoso central, sendo a encefalite o quadro mais comum observado.