Bem, os vírus não possuem estruturas físicas que permitam processos de fossilização. Porém, sabe-se hoje que mutações em vírus podem ocorrer em uma taxa até 1 milhão de vezes maior que mutações em genomas de eucariotos. Uma vez que um vírus seja integrado no genoma do seu hospedeiro, a versão integrada passa a mutar na taxa do genoma eucarioto, enquanto a versão circulante passa a mutar na taxa natural para o grupo viral.  Ao longo dos anos, o vírus circulante acumulará mutações que o vírus endógeno não possui, ou seja, o vírus endogenizado representa uma versão do vírus ancestral, ou, um vírus fóssil. E a área que estuda estes elementos foi então batizada de Paleovirologia. Estes elementos genéticos são gerados por um processo descrito como endogenização viral, que resulta em um vírus endógeno - um termo mais acadêmico para definir vírus fosseis - e pode ocorrer de diferentes maneiras.