O diagnóstico da Síndrome de Munchausen pode ser um desafio devido à complexidade do transtorno. Quando um paciente apresenta queixas médicas persistentes sem causa identificável, a hipótese da síndrome começa a ser considerada. Uma avaliação cuidadosa do histórico do paciente, assim como avaliações físicas e psicológicas são realizadas para confirmar o diagnóstico.