A Neteller tem diferentes taxas. Com o Pix, ela é de 0.99% para depósitos e pode chegar a 3.99% nos saques. Através de cartões Visa e Mastercard, é cobrada uma taxa de 2.5% nos depósitos, e no levantamento de fundos ela pode chegar a 7.5%. Em criptomoedas, as taxas variam de 1.50% a 1.30%, a depender do nível de sua conta. Em transações P2P com criptomoedas, ela é de 0.50%.