A rootkit é difícil de detectar, pois se esconde profundamente no sistema operacional do dispositivo. Muitos rootkits são executados em um nível de privilégio mais alto do que a maioria dos softwares de segurança cibernética, o que é um dos motivos pelos quais eles são tão difíceis de detectar. Os rootkits podem sequestrar ou subverter softwares de segurança menos sofisticados, como as soluções antivírus tradicionais.