O tratamento da balanopostite depende do agente causador. No caso da balanopostite por candidíase, recomenda-se o uso de medicamentos antifúngicos, como clotrimazol, miconazol ou nistatina. No entanto, cada pessoa é única, e o melhor remédio só pode ser determinado por meio de um diagnóstico e tratamento individualizado conduzidos por um profissional de saúde.