Uma crítica comum aos jogos de plataforma é que todos os níveis parecem iguais. No entanto, em Vex 3, há muita criatividade em cada nível. Existem desafios únicos em cada fase, o que mantém a jogabilidade fresca e interessante. Um dos atributos mais convenientes do Vex 3 são os sinalizadores de checkpoint que você recebe. Quando os jogadores chegam a um desses pontos de controle, eles reiniciam seu ponto de respawn para aquela bandeira. Considerando o quão fácil é ser destruído neste jogo, ter pontos de respawn é muito conveniente. Em um jogo tão difícil como Vex 3, ter um pouco de ajuda torna o jogo muito mais fácil de vencer.