A litíase urinária é tratada a curto prazo (tratamento urgente da cólica renal), a médio prazo (eliminação do cálculo causador da dor) e a longo prazo (eliminação de outros cálculos e prevenção da formação de novos cálculos bem como o crescimento de cálculos já existentes).
O tratamento da dor aguda passa pelo alívio da mesma e pela cateterização interna do ureter (com um stent ureteral) ou colocação de uma nefrostomia (um catéter que retira a urina do rim para o exterior), para "derivar a urina", ou seja, para fazer com que a urina não fique acumulada nos rins. Deste modo, alivia-se a dor e recupera-se a função do rim que, obstruído, está em sofrimento.
O tratamento de médio prazo (a fragmentação do cálculo, se o mesmo não for espontaneamente eliminado) passa pelo tratamento electivo do mesmo, através de técnicas minimamente invasivas como a litotrícia externa ou a ureterorrenoscopia com litotrícia interna, com laser.
O tratamento a longo prazo passa por alteração de hábitos e comportamentos, como o aumento da ingestão de líquidos e as alterações alimentares. Em alguns casos, pode ser útil efectuar uma alcalinização da urina (nos casos de cálculos de ácido úrico). Se o doente apresentar outros cálculos, além do que causou a cólica, pode ser necessário fragmentá-los e retirá-los, com uma das técnicas acima indicadas.