As embarcações de mergulho possuem protocolos rígidos de descarte de resíduos para minimizar seu impacto ambiental. Freqüentemente, eles têm instalações de armazenamento de resíduos e sistemas de tratamento a bordo para gerenciar resíduos sólidos e líquidos. Métodos de descarte adequados são seguidos para evitar a poluição e cumprir os regulamentos marítimos.