O modo de ação sobre o vírus é igual em Valtrex e aciclovir. Uma vez na corrente sanguínea, Valtrex transforma-se em aciclovir. A principal diferença é que Valtrex tem uma duração de ação mais prolongada e, por isso, não é necessário tomá-lo com tanta frequência como aciclovir, o que é preferível para algumas pessoas.