A rejeição se deve a Os mecanismos de reconhecimento imunológico detectam que o enxerto de córnea transplantado não pertence aos tecidos do hospedeiro, da pessoa a quem o transplante foi realizado. Eles não o reconhecem como seu e iniciam uma reação de defesa que visa eliminar aquele tecido, como se fosse um microrganismo invasor. Sabemos que na córnea, A camada com maior carga imunológica é o endotélio.. Por isso tentamos preservar o endotélio do paciente para evitar rejeição. Nas ceratoplastias lamelares anteriores, sempre tentamos manter o endotélio do paciente, e as técnicas atuais permitem que todas as camadas sejam dissecadas, até o endotélio de apenas 20 mícrons, e substituem todo o resto. Com esta cirurgia, conseguimos diminuir a rejeição do transplante e que o enxertos excedem até 10-15 anos de sobrevida, em comparação com 5-10 antes.