Para além do cérebro, o sistema digestivo é o lugar onde existem mais neurónios. É nele que está alojado o sistema nervoso entérico, ou segundo cérebro.
A microbiota intestinal (também chamada de flora intestinal), é o nome dado aos microrganismos que habitam o intestino. A microbiota não é igual em todos os seres humanos, sendo que cada um de nós tem o seu próprio conjunto de bactérias e outros organismos no seu intestino.