Depende do objetivo da viagem.
Se você estiver de passagem, dois dias são suficientes para explorar o centro, algum museu e o Horto.
Se você tem interesse em turismo religioso e na história de Padre Cícero, pode ser interessante ficar de 3 a 4 dias, para visitar com calma todos os pontos relacionados ao Padre e ao catolicismo, como museus, basílicas e grutas.
Vale lembrar que Juazeiro do Norte fica no sertão do Ceará, ou seja, não está perto da praia.