A Yuper aceita uma variedade de cartões de crédito, incluindo Visa, MasterCard, Amex, Elo e HiperCard, dando-lhe a liberdade de selecionar a opção de pagamento escolhida. A loja também oferece aos clientes a opção de pagar com boleto bancário. A empresa também oferece pagamentos parcelados sem juros por até 12 meses para tornar sua experiência de compra mais econômica. Com essas diversas opções de pagamento, o cliente pode finalizar suas compras com segurança, seja para comprar anticoncepcionais ou produtos maternos.