Vale salientar que, como a fibrose cística é multissistêmica, ou seja, afeta diferentes órgãos, as manifestações clínicas também são variáveis. O muco nos pulmões pode provocar, por exemplo, tosse persistente, infecções pulmonares frequentes, falta de fôlego e chiado no peito.
Quando afeta o sistema digestório, a fibrose cística pode provocar problemas como diarreia, baixo crescimento e pouco ganho de peso. Outro sintoma importante é a secreção de um suor mais salgado que o normal, sendo este o motivo pelo qual a doença é chamada de “doença do beijo salgado”