A indústria da aviação e as companhias aéreas usam códigos da IATA (Associação Internacional de Transportes Aéreos), como JMK para ATH, para se referir a aeroportos. Dizer que um voo é de JMK para ATH significa a mesma coisa que dizer que um voo é do Aeroporto de Mykonos para o Aeroporto de Atenas Eleftherios V.. Outros códigos de aeroporto relevantes para essa rota são: Aeroporto de Tessalônica Thessaloniki Makedonia (SKG), Aeroporto de Heraclião N. Kazantzakis Apt. (HER), Aeroporto de Rodes Diagoras (RHO), Aeroporto de Thera Santorini (JTR), Aeroporto de Chania Souda (CHQ).