O Shopify oferece seu próprio gateway de pagamento chamado Payments, que também pode aceitar pagamentos com cartão de crédito. Ele lida com a maioria das moedas na maioria das regiões e funciona dentro do sistema. Se você não quiser usar este método ou quiser oferecer outros métodos de pagamento, você precisará de um processador de pagamentos terceirizado. Isso pode incluir PayPal, Amazon Pay, Stripe e outros. Eles entram em sua loja online e cuidam do lado financeiro para você. No entanto, o Shopify cobra taxas pelo uso de processadores de pagamento de terceiros.