Uma vez identificado o garrotilho, é importante informar o veterinário para que possa ser administrado o antibiótico correto, que deve ser escolhido de acordo com a idade do animal e estágio da doença. Importante não se administrar um antibiótico sem orientação, pois é possível criar resistência para o tratamento e piorar o quadro dos animais.
O isolamento de animais doentes dos demais e a quarentena de animais recém-chegados, assim como higiene de cabrestos e materiais utilizados por outros animais, é a principal arma contra a contaminação, lembrando que prevenir é sempre melhor que remediar. ,