Os programas de formação dos participantes do Mais Médicos ficarão sob responsabilidade das instituições de educação superior vinculadas ao programa. O Art. 16 da Portaria 604 de 16/05/2023 estabelece que essas instituições ofertem cursos de aperfeiçoamento ou de pós-graduação lato ou stricto sensu para os médicos do programa, conforme os critérios apresentados em ato normativo específico, a ser publicado.