É super simples. Abra o app MEI Fácil e siga os passos abaixo:
Toque na aba Cobrar cliente;
Veja se o boleto está na aba Vencidos ou À vencer;
Depois de selecionar o boleto, no final da tela você verá a opção Cancelar boleto. Toque nela, confirme e pronto!
Vale lembrar que quando o boleto é cancelado, não é possível voltar atrás. Confirme se seu cliente não vai pagar mesmo.