O clima na trilha da selva Inca muda muito no primeiro dia. No entanto, o clima é muito quente em Santa María, Santa Tereza e Aguas Calientes. Todas essas cidades estão localizadas abaixo de Cusco e não estão a mais de 2.400 metros acima do nível do mar. A temperatura ao longo do ano fica entre 10 ° C e 25 ° C. Somente na parte de ciclismo você vai precisar de um agasalho e um impermeável.