Os auxílios são políticas afirmativas da Unemat que visam favorecer a permanência dos alunos nos cursos através de apoio financeiro. As duas modalidades de auxílios são oferecidas através de editais anuais e os auxílios não tem renovação, ou seja, a cada ano aqueles que receberam auxílio devem se candidatar novamente ao benefício.
O valor do Auxílio Moradia é de R$ 250,00 e do Auxílio Alimentação é R$180,00, podendo o aluno candidatar-se e receber os dois benefícios acumulativamente. Alunos de qualquer período podem se inscrever nos Editais.