WMS, czyli „Warehouse Management System” („system zarządzania magazynem”) to najpopularniejszy rodzaj oprogramowania do obsługi magazynu. Propozycje tego typu często oferują bardzo wszechstronną i rozbudowaną funkcjonalność, by umożliwić kontrolowanie procesów o różnych wymaganiach i usprawnić przepływ towarów dowolnego typu. Dostępne opcje obejmują m.in. kontrolowanie stanów magazynowych, obsługę kompletacji czy przesyłanie instrukcji do urządzeń. Aby magazyn automatyczny działał w poprawny sposób, warto zwrócić uwagę, czy sprzęty są kompatybilne z wybranym oprogramowaniem.