Procedura in vitro z komórką jajową dawczyni jest stosunkowo bezpieczna, ale tak jak każda interwencja medyczna, wiąże się z minimalnym ryzykiem skutków ubocznych. Przed rozpoczęciem leczenia lekarz omawia z pacjentką wszystkie potencjalne ryzyka i skutki uboczne oraz przeprowadza dokładną ocenę jej stanu zdrowia. Ponadto, przestrzeganie zaleceń lekarza, uczciwa komunikacja oraz regularne kontrole mogą pomóc w minimalizowaniu ryzyka i zapewnieniu jak największej bezpieczeństwa podczas tego procesu. M. in. może wystąpić nieprawidłowa reakcja na przyjmowane leki, infekcja intymna, niepowodzenie zapłodnienia i implantacji zarodka.