Spożywanie owoców cytryńca chińskiego u większości osób nie wywołuje skutków ubocznych. Ekstrakty z owoców są bezpieczne i dobrze tolerowane przez organizm człowieka. Jednak przeciwwskazaniem do przyjmowania preparatów z cytryńca jest epilepsja i ciąża, a także nadciśnienie tętnicze, zaburzenia pracy serca, bezsenność oraz nadpobudliwość nerwowa.