Leczenie sepsy polega na jak najszybszym (już w pierwszych godzinach) zaaplikowaniu antybiotyków, preparatów przeciwzakrzepowych, nasercowych oraz płynów. Najważniejszym zadaniem stojącym przed lekarzami jest ustalenie, które bakterie/grzyby/wirusy spowodowały sepsę, należy zatem wykonać posiew krwi.