WooCommerce można zintegrować z systemami ERP/CRM za pomocą wtyczek lub poprzez bezpośrednie połączenie z WooCommerce REST API. Istnieje wiele gotowych wtyczek do popularnych systemów ERP/CRM, takich jak Salesforce, Zoho, czy SAP, które umożliwiają automatyczną synchronizację danych między sklepem a systemem zarządzania.