WeTransfer poważnie podchodzi do bezpieczeństwa i prywatności swoich użytkowników. Wszystkie przesyłane pliki są szyfrowane, a serwis działa zgodnie z przepisami RODO zapewniającymi ochronę danych użytkowników. W bezpłatnej wersji przesłane pliki są dostępne do pobrania przez 7 dni, zanim zostaną usunięte z serwerów, natomiast WeTransfer Plus umożliwia nadawcom ustawienie niestandardowej daty wygaśnięcia. Co więcej, użytkownicy WeTransfer Plus mogą dodać ochronę hasłem do swoich przelewów, zapewniając dodatkową warstwę bezpieczeństwa wrażliwych informacji.