Najważniejszą różnicą pomiędzy myszką laserową i optyczną jest źródło światła, którego urządzenie używa do oświetlania powierzchni, po której mysz przesuwamy. W myszach optycznych jest to dioda LED, w laserowych – laser, lub inaczej dioda o bardzo wysokiej czułości. Myszy laserowe charakteryzują się dużą precyzją w oddawaniu ruchów na ekranie komputera, przez co często są wybierane przez graczy, jednak zwykle wymagają twardego podłoża, a najlepiej specjalnej podkładki, gdyż nawet niewielkie nierówności mogą zakłócać jej pracę. Z kolei myszy optyczne polecane są do zastosowań służbowych i prywatnych. Częściej mają mniejszy zakres regulacji DPI. Są jednak tańsze niż modele laserowe.