Mapowanie skrzynki pocztowej to proces łączenia skrzynki pocztowej z odzyskanego pliku EDB ze skrzynką, która już istnieje na serwerze docelowym, przed zapisaniem danych. Stellar Repair for Exchange udostępnia funkcję Mailbox Mapping, która pozwala wyeksportować dane skrzynki pocztowej z naprawionego pliku EDB do wybranej skrzynki na żywym serwerze Exchange lub Office 365. Program automatycznie wyszukuje i mapuje skrzynki pocztowe użytkowników o tej samej nazwie i adresie e-mail na serwerze docelowym. Po automatycznym mapowaniu, jeśli status skrzynki jest wyświetlony jako "unmapped", Stellar Repair for Exchange tworzy nową skrzynkę użytkownika na serwerze docelowym i eksportuje dane ze źródłowego pliku EDB do nowej skrzynki. Umożliwia także ręczne mapowanie skrzynek.