Na WTR Małopolska długie odcinki prowadzone są po oddzielonych od ruchu drogowego ścieżkach rowerowych, dlatego śmiało można stwierdzić, że ten szlak jest bezpieczny dla rodzin z dziećmi. Odcinki WTR Małopolska, które prowadzą po drogach publicznych, to odcinki o niewielkim ruchu samochodowym, za wyjątkiem 10 kilometrów na wyjeździe z Krakowa (droga do Niepołomic).