Istnieją inne metody diagnozowania problemów z pęcherzem, takie jak badania moczu, ultrasonografia czy tomografia komputerowa. Wybór metody zależy od objawów pacjenta, stanu zdrowia i specyfiki problemu. Cystoskopia jest jednym z najdokładniejszych sposobów diagnozowania problemów z pęcherzem, ponieważ pozwala bezpośrednio na obejrzenie wnętrza pęcherza.