Probiotyki są odpowiednie w zasadzie dla każdego, kto chce wspierać swoje jelita, ale ich przyjmowanie pomaga też w wielu chorobach. Dlatego probiotyki mogą przyjmować nawet niemowlęta i dzieci.
Zdrowe dzieci nie powinny mieć problemów z przyjmowaniem suplementów diety zawierających probiotyki, ale zawsze należy to przedyskutować z prowadzącym je pediatrą.
Stosuje się je również do rehabilitacji jelit, kiedy flora jelitowa jest zaburzona. Dzieje się tak na przykład po antybiotykoterapii, ponieważ antybiotyki zwalczają nie tylko złe, ale i pożyteczne bakterie, a tym samym niszczą florę jelitową.