Fermentacja miodu rzepakowego może wystąpić, gdy jest przechowywany w nieodpowiednich warunkach. Miód jest produktem naturalnym, który zawiera aktywne enzymy i może podlegać fermentacji, jeśli jest przechowywany w zbyt wysokiej temperaturze lub gdy zawartość wody w miodzie jest zbyt wysoka. Aby zapobiec fermentacji, zaleca się przechowywanie miodu w chłodnym, suchym miejscu i utrzymanie odpowiedniego poziomu wilgoci. Fermentacja jest niepożądana, ponieważ może zmienić smak i teksturę miodu, a także prowadzić do produkcji alkoholu i innych niepożądanych substancji.