Leczenie kanałowe zaczyna się zwykle od badań RTG, ponieważ pozwalają one lekarzowi zorientować się, gdzie dokładnie znajdują się zmiany chorobowe i jak daleko sięgają. Dzięki temu endodonta może precyzyjnie zaplanować przebieg zabiegu. Następnie ma miejsce opracowanie korony zęba, a więc w tym przypadku po prostu jej otwarcie – likwiduje się widoczną próchnicę i dociera do zainfekowanej miazgi zęba. Oczyszcza się, dezynfekuje i osusza kanały (lub kanał, w zależności od tego, jak daleko sięgają zmiany). Ostatnim etapem leczenia endodontycznego jest wypełnienie kanałów oraz odbudowa korony zęba.