Nie, exFAT to nie to samo co FAT32. Chociaż firma Microsoft opracowała oba systemy plików, mają one wyraźne różnice. FAT32 to starszy system plików z ograniczeniami dotyczącymi rozmiaru pliku (maksymalny rozmiar pliku to 4 GB) i pozbawiony niektórych nowoczesnych funkcji. Z drugiej strony exFAT został wprowadzony, aby rozwiązać ograniczenia FAT32, oferując obsługę większych rozmiarów plików, lepszą kompatybilność z różnymi urządzeniami i systemami operacyjnymi oraz lepszą odporność na fragmentację plików.