Zbyt częste i zbyt długie korzystanie z wiatraka może być szkodliwe, zwłaszcza dla chorujących na astmę czy alergików. Przede wszystkim dlatego, że unosi cały znajdujący się wewnątrz pomieszczenia pył, kurz i inne szkodliwe dla organizmu zanieczyszczenia, które następnie wdychamy. Warto więc zachować umiar w używaniu tego urządzenia.