W zakresie ortopedii i medycyny sportowej mezenchymalne komórki macierzyste mają zastosowanie w: * leczeniu zmian zwyrodnieniowych stawów: kolanowego, biodrowego, barkowego, * regeneracji kości np. w przypadkach braku zrostu, * leczeniu następstw urazów oraz uszkodzeń ścięgien, więzadeł, łękotek, mięśni, chrząstki stawowej oraz dysków międzykręgowych kręgosłupa (poprzez przyspieszenie procesu ich regeneracji), * przyspieszaniu procesu wgajania przeszczepu po zabiegach rekonstrukcyjnych np. więzadła krzyżowego przedniego (ACL) .