Średnia początkowa dawka klomifenu powinna wynosić około 150 mg dziennie i powinna utrzymywać się na tym poziomie przez 1-2 tygodnie.  Potem dawkę powinno się obniżyć do 100 mg przez kolejne 1-2 tygodnie, a ostateczna dawka klomifenu powinna wynosić do 25-50 mg dziennie przez ostatni tydzień PCT.  Dokładne dawki są zależne od osoby i powinny być ustalane na podstawie wyników badań krwi.