Ze względu na wysokość ciśnienia w trakcie zabiegu w komorze hiperbarycznej z tlenoterapii nie powinny korzystać osoby świeżo po zabiegach w okolicach klatki piersiowej oraz w obrębie układu oddechowego, a także osoby mające rozrusznik serca. Z komory hiperbarycznej powinny zrezygnować również osoby cierpiące na zapalenie nerwu wzrokowego, niektóre choroby płuc, odma płuc, infekcje wirusowe, nowotwory w czasie leczenia chemioterapią, a także kobiety w ciąży.