Z uwagi na fakt, że ozon jest mocnym utleniaczem, należy zwrócić uwagę, aby w ozonowanych pomieszczeniach nie było zwierząt i roślin. Dodatkowo, warto zabezpieczyć bardziej skomplikowaną elektronikę (tv, komputer, itd.) oklejając ją folią. Pewną oczywistością jest konieczność uszczelnienia pomieszczeń tak, aby w jak najmniejszym stopniu gaz mógł się wydostać poza dezynfekowaną strefę. Jeżeli ozonowanie ma dotyczyć pomieszczeń z dużą ilością książek, nie powinno być wykonywane zbyt często. W papierze jest roślinna celuloza, która po zbyt intensywnym ozonowaniu lub zbyt częstych cyklach zacznie żółknieć.