Spółka została powołana w 2004 r. przez Uniwersytet Jagielloński w Krakowie w celu budowy i zarządzania infrastrukturą Life Science Parku, a także zapewnienia szerokiego zestawu usług dla przedsiębiorców i naukowców rozwijających nauki przyrodnicze. Od 2013 r. JCI konsekwentnie rozwija ofertę, w tym przede wszystkim o usługi badań kontraktowych realizowanych w należących do spółki laboratoriach oraz badań klinicznych prowadzonych w dedykowanym, specjalistycznym ośrodku Centrum Badań Klinicznych JCI.
Jagiellońskie Centrum Innowacji oprócz działalności usługowo- badawczej m.in w obszarze wyrobów medycznych, pełni rolę Instytucji Otoczenia Biznesu. Jest miejscem, gdzie firmy technologiczne oraz zespoły badawcze mogą rozwijać swoje produkty celem ich wprowadzenia na rynek. Połączenie rynkowych kompetencji Zespołów MDR Regulator oraz Pure Clinical wraz z zapleczem naukowo-badawczym JCI jest korzystne nie tylko dla Obu Partnerów, ale przede wszystkim dla potencjalnych kontrahentów poszukujących kompleksowej oferty na rynku – powiedziała dr Anita Burkat-Dulak, Pełnomocnik Zarządu ds. Projektów Innowacyjnych.