Pantomogramu, tak jak jak innych zdjęć RTG, nie wykonuje się u kobiet w ciąży lub podejrzewających u siebie ciążę – z uwagi na szkodliwe działanie promieniowania rentgenowskiego na płód. Badanie może być przeprowadzone wyłącznie wtedy, kiedy jego korzyści diagnostyczne przewyższają potencjalne ryzyko – dotyczy to jednak urazów, a nie zabiegów stomatologicznych. Przeprowadzenie badania bywa również niemożliwe u pacjentów nieprzytomnych oraz niemowląt.