Międzynarodowe lotnisko na wyspie nosi nazwę Zakynthos Airport (ZTH) i znajduje się 6 km na południowy wschód od stolicy. W sezonie letnim tanimi liniami można się tu dostać bezpośrednio z Warszawy i Modlina. Biura podróży, w tym Rainbow, oferują wówczas również loty czarterowe na wyspę z Wrocławia, Bydgoszczy, Poznania, Gdańska, Bydgoszczy i Warszawy. Lot na Zakynthos trwa ok. 2,5 godziny.