Najczęściej narzędzia endodontyczne odkruszają się w kanale z powodu jego skomplikowanej, zakrzywionej budowy. Ich fragmenty usuwa się pod mikroskopem, ze względu na to, że są niewidoczne gołym okiem. Nie warto tego problemu bagatelizować, ponieważ złamane narzędzie jest potencjalnie źródłem infekcji, która może doprowadzić nawet do zapalenia kości.