Grafen jest materiałem, który w swojej naturalnej postaci jest nieszkodliwy dla zdrowia i środowiska. Jednak, podobnie jak w przypadku innych materiałów, potencjalne toksyczne skutki zdrowotne mogą wystąpić w zależności od sposobu produkcji, przetwarzania, a także długości i sposobu ekspozycji. Badania laboratoryjne na zwierzętach wykazały, że grafen może mieć szkodliwe skutki na zdrowie, takie jak uszkodzenie płuc, ale potrzebne są dalsze badania, aby dokładniej określić wpływ grafenu na zdrowie człowieka. W każdym razie, stosowanie grafenu w przemyśle i w badaniach naukowych wymaga przestrzegania odpowiednich standardów bezpieczeństwa i higieny pracy, aby minimalizować ryzyko toksycznych skutków dla ludzi i środowiska.