Każda agencja SEO posiada indywidualny cennik pozycjonowania Shopify. Z reguły przed rozpoczęciem działań i ustaleniem najbardziej optymalnego pakietu cenowego przeprowadza się audyt sklepu. Na jego podstawie zespół ekspertów dostaje informacje, jakie działania były dotychczas prowadzone na sklepie, jak szeroki ma być zakres prac oraz jak silna jest konkurencja. To na tej podstawie ustalana jest cena usługi.