U osób zdrowych zazwyczaj nie stwierdza się niedoboru L-karnityny. Zazwyczaj bowiem biosynteza i zdrowa dieta dostarczają organizmowi taką ilość L-karnityny, która zaspokaja jego podstawowe potrzeby. Zdarzają się jednak przypadki niedoboru L-karnityny w organizmie, a przyczyn tego stanu rzeczy może być wiele.