Płytę główną należy diagnozować w przypadku występowania problemów z komputerem. Mogą to być błędy systemowe, problemy z uruchamianiem lub stabilnością systemu, czy też uszkodzenia komponentów. Diagnoza płyty głównej może być wykonywana przy pomocy specjalistycznego oprogramowania diagnostycznego, które pozwoli na identyfikację problemów i ewentualną naprawę.