Najczęstszymi chorobami atakującymi maliny są antraknoza, zamieranie pędów (rzadziej szara pleśń) oraz wirusy takie jak żółta karłowatość maliny. Do szkodników należą m.in. mszyce, pryszczarek malinowiec i malinowiec. Ochrona przed nimi obejmuje stosowanie odpowiedniej agrotechniki, takiej jak usuwanie chorych części roślin, unikanie nadmiernego zagęszczenia, a także stosowanie odpowiednich środków ochrony roślin, zarówno chemicznych, jak i biologicznych. Ważne jest również stosowanie certyfikowanego materiału sadzeniowego.