Badania psychofizjologiczne opierają się na różnych środkach oceny reakcji fizjologicznych. Niektóre powszechnie stosowane pomiary obejmują tętno, aktywność elektroskórną (zmiany przewodnictwa skóry), ciśnienie krwi, częstość oddechów, aktywność mięśni (EMG) i aktywność mózgu (EEG, fMRI). Pomiary te pomagają badaczom zrozumieć, w jaki sposób doświadczenia psychologiczne manifestują się w ciele.