Jak dotąd nie odnotowano żadnych skutków ubocznych oddziaływania leczniczego pola magnetycznego w dawkach terapii stosowanych wg. zaleceń producenta. Mimo to wprowadzono zasadę obowiązującą także w przypadku innych form fizykoterapii, by za przeciwskazania uznać: ciążę, rozrusznik serca, pompę insulinową, czynne choroby nowotworowe, epilepsję. Są to zwyczajowo stosowane w medycynie środki ostrożności.