Czas gojenia się nadżerki jest uzależniony od czynnika powodującego uszkodzenia w błonie śluzowej żołądka. W przypadku infekcji Helicobacter pylori leczenie trwa około dwóch tygodni. Gdy nadżerka powstaje w wyniku stosowania niesteroidowych leków przeciwzapalnych, a pacjent jest zmuszony do ich przyjmowania, jedyną opcją jest zastosowanie leków osłaniających, które zmniejszają wydzielanie kwasu solnego. Terapia będzie w tym przypadku długotrwała.