Zalecane dawkowanie probiotyków zależy od specyficznego produktu i indywidualnych potrzeb zdrowotnych. Generalnie dawki probiotyków są wyrażane w jednostkach CFU (colony forming units) i mogą wahać się od miliardów do bilionów CFU dziennie. Zawsze należy przestrzegać instrukcji na opakowaniu produktu lub zaleceń lekarza.