Krew pępowinowa jest pobierana podczas porodu, o ile matka wcześniej się na to zdecyduje. Krew pobierana jest od razu po przecięciu pępowiny - zarówno przy porodzie naturalnym, jak i w wyniku cesarskiego cięcia. Niestety nie zawsze jest możliwość pobrania dużej ilości krwi i z reguły pobiera się ok. 50-70 ml. Krew pobierana jest przez położną specjalizującą się w jej pobieraniu. Zestaw do pobrania krwi musi być dostarczony przez rodziców - otrzymają go z banku krwi pępowinowej.