Istnieje wiele przyczyn bólu brzucha, takich jak zespół jelita drażliwego (IBS), choroby zapalne jelit (IBD), refluks żołądkowo-przełykowy (GERD), bakteryjne nadrośnięcie flory jelitowej (SIBO), kamica żółciowa i kamica dróg żółciowych, przewlekłe zapalenie trzustki, wrzodziejące zapalenie jelita grubego, choroba Leśniowskiego-Crohna. Inne możliwe przyczyny to stres, alergie i nietolerancje pokarmowe, zaburzenia metabolizmu, nieprawidłowy poziom hormonów, zatrucia pokarmowe, nieodpowiednia dieta, menstruacja oraz nowotwory narządów jamy brzusznej.