Ze względu na brak deski klozetowej bidety w mniejszym stopniu gromadzą na swojej powierzchni bakterie w porównaniu do misek WC, przede wszystkim z powodu braku kontaktu z naszym ciałem. Istnieje natomiast możliwość dokupienia deski bidetowej, maskującej jego wnętrze. Pomimo mechanizmów samooczyszczających powinniśmy ten element wyposażenia potraktować dokładnie tak samo jak toaletę, ubikację, wannę czy też kabinę prysznicową - czyścimy je przy wykorzystaniu dobrze znanych środków przeznaczonych do pielęgnacji powierzchni w pomieszczeniach sanitarnych.