Chłodzenie cieczą i powietrznym mają swoje unikalne zalety i wady. Chłodzenie cieczą jest skuteczniejsze w usuwaniu ciepła, co pozwala na wyższe taktowanie procesora bez ryzyka przegrzewania. Jest to szczególnie korzystne dla entuzjastów gier komputerowych i profesjonalistów wymagających dużej mocy obliczeniowej. Dodatkowo, chłodzenie cieczą jest zazwyczaj ciszej niż chłodzenie powietrzem. Wadami są natomiast wyższa cena oraz konieczność regularnej konserwacji systemu. Z drugiej strony, chłodzenie powietrzem jest prostsze do zainstalowania, tańsze i łatwiejsze w utrzymaniu. Jednak może generować więcej hałasu podczas intensywnej pracy komputera.