Integracja z programem magazynowym polega na pobieraniu informacji z programu magazynowego o produktach i wysyłaniu jej do sklepu internetowego, gdzie zakładane są kartoteki produktów. Synchronizator cyklicznie dodaje nowe produkty do sklepu internetowego oraz aktualizuje stany magazynowe oraz ceny. Popularne programy magazynowe to: Subiekt, Optima, iFIRMA, wFirma, Fakturownia.