Jeżeli są widoczne jakieś rozbieżności w wygenerowanym bilansie pomiędzy aktywami, a pasywami, należy sprawdzić, za jaki okres bilans jest pobierany. Jeśli raport pobierany jest w połowie roku, należy pamiętać, żeby zaznaczyć opcję "dolicz Rachunek Zysków i Strat", ponieważ zazwyczaj na koniec roku dokonujemy przeksięgowania na wynik finansowy, stąd też powstają pewne rozbieżności kwotowe.
Po zaznaczeniu opcji wyżej wskazanej aktywa będą się równały pasywom, jeśli księgowania są dodane w sposób poprawny.
Jeśli to nie pomoże należy prześledzić wszystkie księgowania na kontach i sprawdzić skąd bierze się różnica. Może również wystąpić taka sytuacja, że plan kont/bilans był modyfikowany, i niektóre z kont z planu kont nie zostały podpięte pod odpowiednie pozycje bilansu.