Biorąc pod uwagę względy zdrowotne, mąka żytnia w porównaniu do mąki pszennej jest zdecydowanie lepszym wyborem. Mąka żytnia zawiera bowiem duże ilości błonnika pokarmowego. W swoim składzie ma również gluten, jednak jest on mniej aktywny. Dzięki temu osoby z alergią, mogą wziąć pod uwagę włączenie produktów żytnich do diety.