Mimo iż zapalenie pęcherza w wielu przypadkach przebieg bez powikłań, to jednak istnieje grupa osób, u których przewiany pęcherz może wywołać poważniejsze choroby. Dotyczy to osób z wadami układu moczowego. Zagrożone są również osoby starsze chorujące na cukrzycę czy niewydolność serca. Ostre zapalenie pęcherza może wywołać np. roponercze, urosepsę i przewlekłe zapalenie nerek.