Aktywa Kraken Financial są kompletnie oddzielone od aktywów giełdy Kraken. Każdy podmiot ma oddzielne konta na przechowywane przez siebie aktywa cyfrowe i fiat. Aktywa cyfrowe klientów przechowywane na rachunkach powierniczych są oddzielone zarówno od aktywów Kraken Financial, jak i giełdy Kraken.