Skuteczność pozycjonowania sklepów internetowych zbudowanych na CMS Shoper, podobnie jak ma to miejsce w przypadku innych systemów, uzależnione jest od bardzo wielu czynników. Satysfakcjonujące efekty są wypadkową między innymi:
wieku domeny,
dotychczasowych działań,
struktury sklepu internetowego,
branży oraz poziomu i intensywności działań promocyjnych konkurencji,
zasięgu terytorialnego oddziaływania sklepu www,
zawartości, unikalności i jakości treści,
zmienności oraz aktualnych wymogów wyszukiwarek internetowych etc.