Używanie sonicznej szczoteczki do zębów nie różni się w większym stopniu od modelu tradycyjnego. Dziecko musi zadbać o to, żeby dotrzeć we wszystkie miejsca w jamie ustnej, tak żeby szczoteczka była w stanie dotrzeć w każdy zakamarek pomiędzy zębami. Równie ważny jest czas używania szczoteczki. Od tego zależy skuteczność całego mycia, dlatego modele dla dzieci wyposażono w timery. Powiadomią dziecko o tym, że spędziło odpowiednią ilość czasu na szczotkowaniu.