Ile trwa zapalenie spojówek, zależy od podłoża problemu. Ostre zapalenie wirusowe zwykle mija w ciągu kilku dni. Zakażenie bakteryjne może dawać objawy dłużej, lecz skraca je odpowiednie leczenie. Zapalenie spojówek na tle alergicznym i wynikające np. z zespołu suchego oka może mieć charakter przewlekły lub sezonowy.