Wśród wskazówek, które można podać, aby bezpiecznie poruszać się w sieci Deep Web, możemy przytoczyć:
Nie używaj systemu Windows, Android ani iOS do przeglądania strony Deep Web. Nie są one tak bezpieczne jak Linux czy Mac OS mogą być. Zamiast tego użyj narzędzia, które posiada system operacyjny Tails.
Korzystaj z aktualnego oprogramowania do przeglądania strony Deep Web, w przeciwnym razie Twoja tożsamość zostanie ujawniona lub możesz stać się ofiarą cyberataków.
Nie zaleca się modyfikowania domyślnych ustawień przeglądarki, ponieważ może to zagrozić bezpieczeństwu i prywatności w Internecie.
Nie pobieraj żadnego pliku ani razu wewnątrz Deep Web, chyba że wiesz dokładnie, co zamierzasz pobrać. W tym sensie możliwe jest, że niektóre pliki zawierają pewien rodzaj skryptu i mogą ujawniać tożsamość użytkownika osobom trzecim.
Podczas przeglądania strony Deep Web nie należy wprowadzać osobistych wiadomości e-mail.