Szybkość pendrive’a to potoczne określenie prędkości zapisu i odczytu. Od parametrów tych zależy czas kopiowania plików z dysku twardego komputera (prędkość zapisu) oraz szybkość otwierania zapisanych na pendrivie plików (prędkość odczytu). Możliwe do osiągnięcia prędkości są uzależnione zwłaszcza od rodzaju pamięci flash oraz interfejsu. Powszechnie dostępne na rynku są pendrive’y USB 2 i USB 3.0. Można również znaleźć urządzenia z interfejsem USB 3.1 i 3.2. Maksymalna prędkość transferu w przypadku pendrive’ów USB 2.0 wynosi 60 Mb/s, USB 3.0 do 625 Mb/s, USB 3.1 do 1,25 Gb/s, a USB 3.2 do 2,5 Gb/s.