Ograniczenia grup fokusowych obejmują niewielką reprezentatywność próby, wpływ silnej osobowości uczestników oraz możliwość wystąpienia efektu dominacji. Aby zminimalizować te wpływy, badacze starają się starannie dobrać uczestników, stosować różnorodność w grupie, moderować dyskusję w sposób równy dla wszystkich oraz używać różnych technik, takich jak anonimizacja odpowiedzi, aby zachować obiektywność i rzetelność wyników.