Badanie NIFTY nie wykrywa rdzeniowego zaniku mięśni (SMA). Zasadniczo badania NIPT opierają się na technologii, która umożliwia wykrycie braku lub nadmiaru określonych chromosomów. W przypadku SMA chodzi jednak o zmianę w obrębie jednego genu, a nie o zmianę objętości materiału genetycznego. Oznacza to, że fizyczna wielkość nieprawidłowości w badanej ilości materiału genetycznego nie jest na tyle duża, aby można ją było wykryć za pomocą technologii NIPT.