Fizjoterapia stomatologiczna jest bezpieczna, o ile jest prowadzona przez wykwalifikowanego fizjoterapeutę i pacjent przestrzega zaleceń terapeuty. Ważne jest, aby przed rozpoczęciem terapii poinformować fizjoterapeutę o wszystkich istniejących schorzeniach i dolegliwościach, aby wykluczyć przeciwwskazania.