Pistolety do klejenia są bardzo bezpieczne, jeśli chodzi o bezpieczeństwo elektryczne, ale podobnie jak w przypadku wszystkich urządzeń elektrycznych i elektronicznych, nie należy ich pozostawiać bez nadzoru, kiedy są włączone. Dodatkowo, z uwagi na wysoką temperaturę topnienia kleju wynoszącą 150–180°C, należy zachować ostrożność podczas używania pistoletu do klejenia ze względu na niebezpieczeństwo doznania poparzeń.