Zazwyczaj profil lipidowy oznacza się na czczo. W ciągu 14 godzin poprzedzających badanie nie należy przyjmować żadnych pokarmów ani płynów (poza wodą), a w ciągu 48 godzin – alkoholu. W niektórych przypadkach, np. kiedy chodzi wyłącznie o oznaczenie poziomu cholesterolu całkowitego lub HDL, w okresie przed badaniem można przyjmować pokarmy i płyny.