Dziurki w trawertynie to naturalny ich element. Jeśli się ich obawiamy można wybrać trawertyn wypełniany - jest to materiał gładki z reguły matowy z wypełnionymi dziurkami gładzią szpachlową. Natomiast przy niewypełnionym trawertynie świetnie wypełni znajdujące się w nim dziurki fuga.