Bolący pęcherz to przeważnie jeden z objawów zakażenia dróg moczowych. U mężczyzn najczęściej dochodzi do zakażenia cewki moczowej; u kobiet do zapalenia pęcherza moczowego. Zaburzenia mogą wynikać nie tylko z powodu wad morfologicznych, ale i zaburzeń hormonalnych, stanów zapalnych, a nawet zaburzeń psychicznych. Bolący pęcherz może oznaczać zarówno niedoczynność, jak i nadczynność organu.