Obowiązek podatkowy z tytułu podatku VAT z faktury zaliczkowej powstaje w momencie otrzymania zaliczki (pomimo tego, że wystawić fakturę obecnie można do 15 dnia miesiąca następującego po tym, w którym otrzymano zaliczkę). Przyjmując zaliczkę w miesiącu zawieszenia, i tak koniecznym byłoby złożenie deklaracji VAT-7 za ten miesiąc. Organy podatkowe różnie traktują kwestię przyjmowania zaliczek podczas zawieszenia, gdyż w każdym przypadku uwzględniają przede wszystkim charakter działalności. Dlatego też do takich praktyk należałoby podchodzić bardzo ostrożnie. Jeżeli przyjęcie zaliczki traktowane byłoby jako wykonywanie działalności, konieczne byłoby odwieszenie działalności już w miesiącu otrzymania zaliczki i opłacenie z tego tytułu pełnej składki zdrowotnej ZUS oraz częściowych społecznych (proporcjonalnie do okresu odwieszenia w danym miesiącu).