Istnieje kilka aspektów, które stanowią różnicę.
Bezpieczeństwo: IHHT sztucznie moduluje warunki tlenowe w kontrolowanym środowisku, podczas gdy trening wysokościowy naraża sportowców na stale rosnące obciążenie hipoksyjne podczas wspinaczki, a także doświadczanie malejącego ciśnienia hydrostatycznego podczas.
Czas trwania: IHHT składa się z krótkich, powtarzających się ekspozycji na hipoksję i hiperoksję w ograniczonym czasie, podczas gdy trening wysokościowy obejmuje sportowców spędzających dni, tygodnie, a nawet miesiące na wysokości.
Indywidualizacja: IHHT można dostosować do osoby ćwiczącej w zależności od celów, potrzeb i okoliczności, podczas gdy w treningu wysokościowym jest to trudniejsze lub niemożliwe.
Faza hiperoksji: IHHT obejmuje fazy o wyższym stężeniu tlenu, co nie ma miejsca w przypadku treningu wysokościowego.
Praktyczność: IHHT może być wykonywany w specjalnych ośrodkach treningowych lub przy użyciu przenośnego sprzętu, podczas gdy trening wysokościowy wymaga dostępu do obszarów górskich.