Skutecznym sposobem na zwalczenie muszek owocówek jest usunięcie z kuchni wszelkiego rodzaju produktów, które je wabią. Można pochować owoce do lodówki, na bieżąco myć naczynia od soków i pamiętać o zakręcaniu słoików z konfiturami, a muszki owocówki zaczną powoli znikać. Długość życia owocówek pozbawionych pokarmu trwa około 3-5 dni. Jednak ze względu na wcześniej wspomniane szybkie tempo rozmnażania i przynoszenie owocówek wraz z zakupionymi owocami i warzywami, warto pamiętać o zastawieniu pułapki na muszki owocówki oraz o myciu zakupionych owoców i warzyw zaraz po przyjściu do domu.