Na klimat Japonii mają wpływ monsuny. Na północy terytorium panuje klimat zimny, umiarkowany i południowy podzwrotnikowy. Temperatury w zimie wahają się od -9 °C do 16 °C, a latem od 20 °C do + 28 °C.
Latem Japonię nawiedzają ulewne deszcze, które w sierpniu zamieniają się w monsuny.