Możesz zarządzać skanowaniem SLOW-PCfighter, używając SLOW-PCfighter menu. Kliknij "Registry Scan" i wybierz, co chcesz pominąć. W menu "Narzędzia" możesz odznaczyć pozycje, których nie chcesz skanować. Podczas skanowania komputera będziesz mógł zobaczyć, jakie klucze oraz pliki znalazł SLOW-PCfighter do usunięcia, a także możesz zignorować konkretne pozycje Rejestru. Kliknij na znak "+" z lewej strony każdej kategorii, aby zobaczyć wykaz znalezionych problemów Rejestru. Możesz zobaczyć liste ignorowanych w "Ustawienia -> Ignore list" w SLOW-PCfighter menu, tutaj możesz także "odignorować" w dowolnej chwili.