Każde otrzymanie zaliczki na poczet przyszłej sprzedaży powoduje powstanie obowiązku podatkowego w podatku VAT. Dlatego też każde otrzymanie zaliczki powinno być udokumentowane fakturą zaliczkową. Przepisy podatkowe nie ograniczają możliwości przyjęcia kliku zaliczek na poczet jednego zamówienia. Należy jednak pamiętać, że każda zaliczka musi zostać wykazana w rejestrze sprzedaży VAT. W przedstawionej sytuacji należało: wystawić fakturązaliczkową na wartość pierwszej otrzymanej zaliczki, wystawić fakturę zaliczkową na wartość drugiej otrzymanej zaliczki, w momencie dokonania sprzedaży wystawić fakturę końcową, na której powinny widnieć informacje o wcześniej przyjętych obu zaliczkach oraz informacja o tym ile, po uwzględnieniu zaliczek, pozostało do zapłaty.