W pierwszej fazie choroby występują napady gorączki, bóle głowy i stawów oraz obrzęk węzłów chłonnych, a miejsce ugryzienia jest swędzące i bolesne. W zaawansowanym stadium śpiączka afrykańska objawia się zmianami zachowania oraz zaburzeniami snu, koordynacji i czucia. Nieleczona choroba zazwyczaj jest śmiertelna.