Tak, odrzucenie narządu jest potencjalnym powikłaniem przeszczepu. Układ odpornościowy biorcy może rozpoznać przeszczepiony narząd jako obcy i podjąć próbę zaatakowania go i zniszczenia. Aby zapobiec odrzuceniu, biorcy przepisuje się leki immunosupresyjne, które tłumią odpowiedź immunologiczną i zmniejszają ryzyko odrzucenia.