Liszaj płaski nie jest zaraźliwy. Wykwity mają charakter samoograniczający się i ustępują w przeciągu 1-3 lat, choć nie zawsze. To przewlekła choroba, której objawy okresowo zaostrzają się i wyciszają. Potrafią być bardzo uciążliwe, często nawracać i wywoływać skutki uboczne. Trwałym śladem po liszaju są np. długotrwałe przebarwienia pozapalne, bliznowacenia i zrosty. Jeśli choroba obejmuje owłosioną skórę głowy, istnieje ryzyko wystąpienia łysienia zanikowego. Powikłaniem liszaja płaskiego paznokci może być utrata płytki paznokcia. Natomiast liszaja płaskiego jamy ustnej uznaje się za stan przednowotworowy. Mimo tego, iż zmiany skórne nie są zaraźliwe, a po pewnym czasie ustępują samoistnie, leczenie liszaja to konieczność. Odpowiednio dobrana terapia pozwala złagodzić dokuczliwe objawy, skrócić czas trwania choroby i uniknąć powikłań.