Startup musi spełnić szereg obowiązków podatkowych, takich jak zarejestrowanie się jako podatnik VAT (jeśli przekroczy odpowiedni próg), prowadzenie księgowości, składanie deklaracji podatkowych i płacenie należnych podatków, takich jak podatek dochodowy od osób prawnych (CIT) lub podatek dochodowy od osób fizycznych (PIT), a także ZUS. Optymalizacja obciążeń podatkowych może obejmować skorzystanie z ulg podatkowych, takich jak ulga na badania i rozwój (B+R), korzystanie z preferencyjnych stawek podatkowych, czy też restrukturyzację działalności w sposób umożliwiający efektywniejsze zarządzanie kosztami i przychodami.