Powstało wiele podziałów postaci klinicznych endometriozy, lecz najczęściej używana jest ta stworzona w oparciu o miejsce jej występowania. Nie wnikając w szczegóły należy powiedzieć, że może ona pojawić się zarówno w obrębie narządów płciowych, m.in. w obrębie mięśnia macicy (najczęściej), jajowodzie, jajniku czy pochwie, jak również w zupełnie innych narządach bliskich takich jak pęcherz moczowy czy jelita.