Istnieje kilka metod szczotkowania zębów, należy je dostosować przede wszystkim do indywidualnych preferencji oraz stanu uzębienia. Szczotkowanie okrężne polega na przyłożeniu szczoteczki do zębów pod kątem 90 stopni i wykonywaniu nią ruchów okrężnych. Metoda ta może być stosowana przez dzieci, jednak jest ona mało dokładna, jeśli chodzi o oczyszczanie powierzchni stycznych zębów. Metoda szczotkowania zębów roll (inaczej metoda obrotowo-wymiatająca) jest zalecana dla osób z chorobami przyzębia. Polega ona na ustawieniu szczoteczki pod kątem 45 stopni i przesuwaniu nią po zębach, na przemian robiąc kolka i wymiatając resztki pokarmu. Taki sposób nie naraża na odsłonięcie szyjki zębowej. W celu wyszczotkowania zębów można skorzystać także z tzw. metody poziomej, jest ona polecana dla dzieci i osób starszych, polega na przyłożeniu szczoteczki do zębów i wykonywaniu ruchów poziomych. Dodatkowo warto zastosować także metodę pionową, która polega na wykonywaniu ruchów pionowych w celu oczyszczenia płytki nazębnej. Ostatnia z metod to szczotkowanie wibrujące, jest ono zalecane przede wszystkim dla osób z chorobami przyzębia oraz wrażliwymi dziąsłami i szyjkami zębowymi. Zakłada ona wykonywanie lekko wibrujących ruchów szczoteczką.