Rozwój biotechnologii ma znaczący wpływ na hodowlę i genetykę koni, umożliwiając precyzyjne mapowanie genomu koni, co pozwala na identyfikację i selekcję pożądanych cech genetycznych, takich jak wytrzymałość, szybkość czy zdrowie. Techniki takie jak CRISPR mogą być wykorzystywane do edycji genów w celu poprawy cech lub eliminacji chorób genetycznych. Ponadto, biotechnologia umożliwia rozwój technik reprodukcyjnych, takich jak zapłodnienie in vitro i klonowanie, co może zmienić metody hodowlane i zachować geny cennych osobników.