Czas trwania fizjoterapii zależy od leczonego schorzenia, stopnia jego zaawansowania i reakcji na leczenie. W większości przypadków fizjoterapia jest zalecana na okres od czterech do sześciu tygodni. Niektóre schorzenia mogą jednak wymagać dłuższego okresu fizjoterapii. Fizjoterapeuta opracowuje plan leczenia dostosowany do potrzeb i celów pacjenta.