Opłaty za uzyskanie eTA różnią się w zależności od okresu ważności i rodzaju dozwolonego wjazdu. W przypadku eTA ważnej przez pięć lat z wielokrotnymi wjazdami opłata rządowa wynosi 5,50 USD od wnioskodawcy. Oprócz tej opłaty mogą wystąpić inne koszty dodatkowe, takie jak opłaty manipulacyjne lub pomoc online w wypełnieniu formularza wniosku eTA.