Przyjętą zaliczkę należy udokumentować fakturą zaliczkową, którą księguje się jedynie do rejestru sprzedaży VAT. Następnie w momencie dokonania sprzedaży, jeżeli zaliczka nie obejmowała 100% wartości zamówienia, wystawia się fakturę końcową, która uwzględnić powinna pozostałą (po odjęciu otrzymanej już zaliczki) kwotę do zapłaty oraz wykazać wcześniej przyjętą zaliczkę. W przypadku otrzymania 100% zaliczki sytuacja wygląda nieco inaczej. Organy skarbowe bowiem stoją na stanowisku, że gdy zaliczka obejmuje 100% zamówienia, nie powinno się już wystawiać zerowych faktur końcowych. W momencie sprzedaży wówczas należy jedynie pamiętać o wykazaniu wartości netto jako przychód w KPiR. Polecamy: Faktura zaliczkowa - wzór z omówieniem