Największymi wyzwaniami w codziennym gotowaniu dla osób z nietolerancjami pokarmowymi są identyfikacja i unikanie składników wywołujących reakcje alergiczne, co często wymaga dokładnego czytania etykiet i znajomości ukrytych alergenów. Ponadto, osoby te muszą poświęcić więcej czasu i wysiłku na planowanie posiłków oraz na poszukiwanie lub przygotowywanie zamienników dla tradycyjnych produktów, co może być czasochłonne i ograniczać różnorodność diety.