Jednym z rozwiązań wprowadzanych tą ustawą jest zmiana w wystawianiu faktur zaliczkowych. Do momentu wprowadzenia nowych przepisów, prawo nakazuje do każdej wpłaconej zaliczki z tytułu dostawy towarów lub świadczenia usługi, wystawić fakturę zaliczkową.
Z nowych przepisów wynika, że jeżeli podatnik w część lub całość otrzyma zapłatę w tym samym miesiącu, w którym dokonał dostawy towarów lub wyświadczył usługę, to nie będzie zobowiązany do wystawienia faktury zaliczkowej. Nowe przepisy nie będą miały jednak zastosowania do faktur wystawianych w szczególnych terminach (art. 106i ust. 3-8 ustawy o podatku od towarów i usług).
Dodatkowo podatnik, który nie wystawi faktury zaliczkowej, gdyż spełnił powyższą zasadę i udokumentował sprzedaż towarów lub świadczenie usługi fakturą końcową, będzie musiał wskazać datę otrzymania zaliczki, pod warunkiem, że data ta jest inna niż data wystawienia faktury.