Istnieją dwie główne metody wszczepiania bajpasów serca. Jedną z nich jest metoda, w której stosowane jest krążenie pozaustrojowe, drugą zaś taka, w której nie stosuje się krążenia pozaustrojowego. Pierwsza z nich jest o tyle bardziej niebezpieczna niż druga, że może nastąpić w niej uszkodzenie narządów lub tkanek.