WP Engine charakteryzuje się bezpiecznym hostingiem, który posiada kilka narzędzi, które zapobiegają włamaniom, zagrożeniom lub SPAMowi na hostowanych stronach. Wszystkie serwery, na których hostowane są domeny, posiadają wewnętrzną ochronę i wykrywanie zagrożeń.
Dostawca ten dysponuje zespołem ds. bezpieczeństwa, który wykrywa możliwe zagrożenia w czasie rzeczywistym za pomocą, między innymi, narzędzi SQL, XML i RPC. Ponadto, zapewnia hosting pakietów na różnych poziomach w celu uzyskania większego bezpieczeństwa.