Trzymanie fletu w dłoniach nie jest trudne i zwykle przychodzi naturalnie. Warto jednak poznać podstawowe zasady, tym bardziej, jeśli jesteśmy osobami początkującymi i do końca nie wiemy, jak rozpocząć swoją przygodę z graniem. Lewą dłonią, a dokładniej kciukiem, zatykamy znajdującą się z tyłu (o góry) dziurkę. Trzy palce od kciuka są kolejno układane od góry na dziurkach korpusu. Następnie przystępujemy do ułożenia prawej dłoni. W tym przypadku kciuk stanowi niejako podpórkę, umieszcza się go mniej więcej na środku z tyłu. Cztery pozostałe palce należy ułożyć kolejno od kciuka w dół. Należy pamiętać, że lewa dłoń ma znajdować się na górze, a prawa na dole. Jak widać, trzymanie fletu nie jest trudne i można się szybko tego nauczyć.