Różnice pomiędzy kolagenem rybim, bydlęcym, wieprzowym i wołowym dotyczą głównie ich składu aminokwasowego i struktury molekularnej. Kolagen rybi jest najbardziej zbliżony do kolagenu ludzkiego i jest najłatwiej przyswajalny przez organizm. Kolagen bydlęcy i wieprzowy, choć zawierają podobne aminokwasy, mogą być trudniejsze do przyswojenia. Wołowina i wieprzowina są też często źródłem kolagenu typu I i III, podczas gdy ryby dostarczają głównie kolagenu typu I.