Samodzielne wypełnienie wniosku Czyste Powietrze jest darmowe. Zrobi to też instytucja bankowa, jeśli decydujemy się na kredyt Czyste Powietrze. Możemy ponadto skorzystać z pomocy firm, które zawodowo zajmują się wypełnianiem wniosków. Taki koszt wynosi zwykle kilkaset zł.