Jeśli występuje ostre i przewlekłe zapalenie gruczołu krokowego, to najczęściej odpowiedzialne są za nie bakterie, zwykle E.coli, które wymagają zastosowania odpowiednich antybiotyków. Można się jednak spotkać z niebakteryjnym zapaleniem prostaty, którego przyczyny nie są dokładnie znane. Wymienia się jednak czynniki ryzyka, takie jak: nadmierne narażenie na stres, zaburzenia autoimmunologiczne i hormonalne, problemy psychiczne i emocjonalne.