Stolec przy jelicie drażliwym może wyglądać inaczej, niż przed rozwojem choroby. Przy biegunce jest luźny, przy zaparciach - twardy i zwarty. Niekiedy widoczne są w nim niestrawione resztki pokarmu, a także śluz. Niektórzy pacjenci z IBS obserwują u siebie tzw. stolec ołówkowaty, czyli wąski, o kształcie wstążki.