Podczas frezowania CNC tworzyw sztucznych, skuteczne chłodzenie jest kluczowe dla utrzymania odpowiednich warunków obróbki. W większości przypadków, gdy dobrze dobrane są parametry obróbki, może wystarczyć naturalne odprowadzanie ciepła poprzez wiór. Jednak, gdy materiał zaczyna się topić, konieczne jest zastosowanie dodatkowych metod chłodzenia. W przypadku topienia materiału zaleca się zastosowanie sprężonego powietrza, które może być skierowane na narzędzie i obszar obróbki. To pozwala na szybkie schłodzenie narzędzia i powierzchni obrabianego materiału, zapobiegając nadmiernemu nagrzewaniu się i topieniu. W niektórych sytuacjach, zwłaszcza gdy frezowanie jest intensywne lub wymagane są bardzo niskie temperatury, można również skorzystać z chłodziw w postaci wody z dodatkami antykorozyjnymi i bakteriobójczymi. Chłodziwo jest podawane bezpośrednio na obszar obróbki, co skutecznie redukuje temperaturę narzędzia i materiału.