Wady korzystania z VPN mogą obejmować wolniejsze prędkości internetu ze względu na szyfrowanie i deszyfrowanie danych oraz czas potrzebny na przekierowanie ruchu przez serwer VPN, możliwość blokady niektórych usług czy stron przez dostawców, którzy wykrywają i blokują ruch VPN, oraz koszty związane z płaceniem za wysokiej jakości usługi VPN.