Ryzyko związane z in vitro jest minimalne. Jednym z rzadkich powikłań leczenia hormonalnego jest hiperstymulacja (OOHS), w której jajniki się powiększają. Głównym objawem hiperstymulacji jest ból w podbrzuszu, czasami może dochodzić do gromadzenia się płynu w jamie brzusznej. Obecna medycyna może łagodzić objawy, hiperstymulacja następnie samoistnie ustępuje. Ciąża po sztucznym zapłodnieniu nie różni się od ciąży naturalnej i wiąże się z tym samym ryzykiem (przedwczesny poród, poronienie itp.).