Przy wyliczaniu wysokości premii mieszkaniowej brane są pod uwagę wskaźnik rocznej inflacji bądź wskaźnik zmiany cen metra kwadratowego mieszkań (w zależności od tego, która wartość będzie przy tym wyższa). Dla każdego miesiąca oddzielnie obliczana jest premia bazująca na sumie wpłaconych przez klienta wpłat na Konto mieszkaniowe. Kwoty z poszczególnych miesięcy sumują się.
Oddzielnie względem premii naliczane jest oprocentowanie bankowe. W przypadku premii nie ma znaczenia procent składany. Oprocentowanie zapewnione przez bank działa właściwie na tych samych zasadach, jakby Konto mieszkaniowe było standardowym rachunkiem oszczędnościowym.