Te terminy są często stosowane zamiennie, ale nie są tym samym. Deep web (głęboka sieć) to ta część Internetu, która nie jest widoczna w zwykłych przeglądarkach — uwzględnia ona nieindeksowane strony, na przykład strony ukryte za paywallem, dane medyczne i konta e-mail. Ciemna sieć to część deep web, która jest ukryta celowo i jest całkowicie zaszyfrowana (można uzyskać do niej dostęp tylko przez przeglądarkę Tor).
Podsumowując, deep web to cześć Internetu, do której nie można wejść z przeglądarki, a ciemna sieć jest zaszyfrowana w taki sposób, że wyszukiwarki nie indeksują stron, które się tam znajdują (potrzebujesz specjalnego oprogramowania, takiego jak przeglądarka Tor, by do niej wejść).