To, jak należy wyczyścić podkładkę pod mysz, zależy od rodzaju materiału, z jakiego wykonany jest dany model. Podkładki szklane czy metalowe, a także większość z tych, wykonanych z materiałów sztucznych, możemy umyć za pomocą zwykłych środków do czyszczenia powierzchni z kurzu lub przeznaczonych do sprzątania mokrych chusteczek. Część z podkładek pod myszki możemy także wyprać w pralce – trzymajmy się tutaj jednak ściśle zaleceń producenta.