Jedną z potencjalnych wad aborcji próżniowych jest możliwość zranienia ścianki macicy. Dzieje się tak w trakcie zabiegu, kiedy umieszczana jest specjalna rurka z możliwością zassania zawartości. Jeśli zabieg jest przeprowadzany przez mało niedoświadczonego lekarza, może naruszyć nią ścianę macicy co spowoduje jej naderwanie. Zdarza się to niezwykle rzadko. Zazwyczaj uszkodzenie wymagać obserwacji szpitalnej i leczenia w celu zahamowanie krwawienia.