Pasternak należy przechowywać w chłodnym, ciemnym miejscu, aby zachować jego świeżość. Można je przechowywać w lodówce lub w chłodnej piwnicy. Pasternak można również zamrozić, aby dłużej zachował świeżość. Mrożony pasternak powinien być wykorzystany w ciągu 6 miesięcy.