Czas przechowywania deszczówki zależy od zastosowanych sposobów filtracji oraz rodzaju i lokalizacji zbiornika. Woda opadowa pozbawiona zanieczyszczeń organicznych i składowana w szczelnej podziemnej cysternie (niska temperatura opóźnia rozwój mikroorganizmów) będzie przydatna do użycia nawet przez rok. Jeżeli nie jest filtrowana, a do tego znajduje się w otwartym zbiorniku, który jest wystawiony na działanie słońca i możliwy do zanieczyszczenia, to może “zakwitnąć” (rozrost glonów) lub „zgnić” (rozkład materii organicznej) już po kilku tygodniach.