Podczas transakcji system eparagony.pl otrzymuje dane ze sklepu (systemu sprzedaży) i urządzenia fiskalnego i wyłącznie na ich podstawie wydaje dokumenty fiskalne w wersji elektronicznej.  Repozytorium eparagony.pl, dzięki współpracy z producentami kas rejestrujących, przed przyjęciem eparagonu potrafi zweryfikować, że dokument faktycznie został wygenerowany zgodnie z prawem oraz może stanowić dowód sprzedaży dla nabywcy czy odprowadzenia podatku VAT przez sprzedawcę. Taki eparagon jest więc zawsze aktualny, prawdziwy oraz co ważne, żadna strona transakcji nie jest w stanie manipulować danymi transakcyjnymi ani ich usunąć.