Det er flere ruter tilgjengelig for å klatre Mount Fuji, men de mest populære er Yoshida-ruten, Subashiri-ruten, Gotemba-ruten og Fujinomiya-ruten. Yoshida-ruten er den mest vanlige og godt vedlikeholdte ruten, og den har mange hytter og fasiliteter underveis. Subashiri-ruten er litt mindre overfylt og gir en annen opplevelse. Gotemba-ruten er mer utfordrende og mindre populær, mens Fujinomiya-ruten er kjent for å være den raskeste ruten til toppen. Valg av rute avhenger av dine preferanser, fysiske evner og tid tilgjengelig for klatringen.