Selv om iPhone er anerkjent for sin kvalitet og funksjonalitet, er det noen aspekter som kan betraktes som ulemper avhengig av individuelle preferanser. Noen kunder kan oppleve at iPhone-modellene er relativt dyre sammenlignet med alternative smarttelefoner på markedet. I tillegg kan noen modeller ha begrensninger når det gjelder utvidbar lagringsplass og mangel på tilpasningsmuligheter sammenlignet med andre operativsystemer som Android.