En ubalanse mellom inntak av omega-3 og omega-6 fettsyrer kan være skadelig. Moderne kosthold med høyt inntak av bearbeidede matvarer har en tendens til å være høy i omega-6 fettsyrer, og redusert inntak av omega-3 fettsyrer kan føre til ubalanse og potensielle helseproblemer som betennelse og økt risiko for visse sykdommer.