Protonpumpehemmere (PPI) virker ved å hemme enzymet som produserer magesyre, mens histamin-2-reseptorantagonister (H2RA) fungerer ved å blokkere histaminreseptorene som stimulerer magesyresekresjonen. PPI-er er generelt mer effektive i å redusere magesyreproduksjonen enn H2RA-er.