Integrasjon av mange tredjepartsmoduler i en netthandelsplattform kan potensielt utsette systemet for en rekke sikkerhetsrisikoer. Noen av disse risikoene inkluderer datalekkasjer, uautorisert tilgang, og kompatibilitetsproblemer som kan skape sikkerhetshull. For å mitigere disse risikoene, er det essensielt å utføre grundige sikkerhetsevalueringer av hver applikasjon eller plugin før integrasjon, og bare bruke pålitelige kilder og velkjente leverandører. Det er også viktig å holde modulene oppdatert og regelmessig gjennomføre sikkerhetskjøring for å oppdage og rette opp eventuelle sårbarheter.