Dersom en gravid kvinne er smittet med klamydia, kan det medføre risiko for alvorlige komplikasjoner for både mor og barn. Det er en 15-25 prosent risiko for at det nyfødte barnet kan få øyeinfeksjon 5 til 12 dager etter fødsel, og en 5-15 prosent risiko for lungebetennelse 1 til 3 måneder etter fødselen. I tillegg kan klamydiainfeksjon hos gravide i sjeldne tilfeller føre til abort, for tidlig vannavgang, for tidlig fødsel, lav fødselsvekt og dødfødsel. Derfor er det viktig å bli testet for klamydia tidlig i svangerskapet og behandle det hvis det er nødvendig.