Je kan een erfelijke aanleg hebben voor het ontwikkelen van coeliakie. Als één van je ouders of broer of zus coeliakie heeft, wordt jouw kans op coeliakie verhoogt naar 1 op 10. Of iemand met een erfelijke aanleg ook daadwerkelijk coeliakie krijgt is afhankelijk van andere factoren, maar deze precieze oorzaak is nog steeds niet bekend. Ongeveer 95% van de mensen met het gen type HLA DQ2 of DQ8 ontwikkelen coeliakie.