Meestal begint peniskanker met een rode plek, wrat, zweer of verdikking die tussen de eikel en de voorhuid groeit. De afwijking verdwijnt niet, maar wordt na verloop van tijd steeds dikker en groter. Meestal is het niet echt pijnlijk, maar irriteert het wel. Andere klachten die bij peniskanker kunnen voorkomen zijn: pijn, bloedverlies, nare geur, rode uitslag onder de voorhuid, korstjes onder de voorhuid, zwelling van de lymfeklieren in de liezen.