Een MRI van het bekken kan helpen bij het vinden van problemen zoals tumoren in de eierstokken, baarmoeder, prostaat, rectum en anus. Het kan ook worden gebruikt om te zoeken naar een anale fistel (een buisvormige doorgang van het anale kanaal naar een gat in de huid bij de anus) en om te zoeken naar de oorzaak van bekkenpijn bij vrouwen, zoals endometriose.