Een koemelkallergie is een reactie van het immuunsysteem op melkeiwitten zoals caseïne en wei. Lactose-intolerantie treedt op wanneer het lichaam een melksuiker, die lactose wordt genoemd, niet kan verteren. Kinderen met lactose-intolerantie hebben niet voldoende van het enzym dat nodig is om deze melksuiker te verteren. Koemelkallergie en lactose-intolerantie worden allebei veroorzaakt door melk en hebben enkele gemeenschappelijke symptomen, zoals winderigheid, buikpijn en diarree. In tegenstelling tot koemelkallergie heeft lactose-intolerantie echter geen invloed op het immuunsysteem en veroorzaakt geen allergische reacties zoals netelroos, huiduitslag, fluitende ademhaling en aanhoudende loopneus en hoest.