Als er trombose is ontstaan, werkt de lange lijn minder goed, maar het stolsel zorgt niet altijd voor lichamelijke klachten. Of je klachten krijgt hangt af van de plek waar de trombose zit.
Bij pasgeborenen met een lange lijn in de navel die een stolsel in de poortader krijgen, kan leverfalen ontstaan, maar de meeste stolsels zitten in de vena cava, de ader die in je hart uitkomt bij de rechterboezem. Of ze zitten vast aan het uiteinde van de lange lijn in de rechterboezem zelf.
Van de oudere kinderen met lijntrombose heeft 50% een diep veneuze trombose, meestal in de armen of benen. Je krijgt dan bijvoorbeeld een pijnlijke, dikke arm of een pijnlijk dik been. De andere 50% krijgt trombose in de hersenen. Dat noemen we sinustrombose. Je krijgt dan vaak heel erge hoofdpijn, maar je kunt ook een epileptische aanval krijgen of je bewustzijn verliezen.