Lactose is een soort suiker dat van nature in melkproducten als whey voorkomt. Sommige mensen kunnen niet goed tegen lactose, waardoor veel whey shakes slecht vallen. Door de hoge zuiverheid van whey isolaat bevatten deze soort eiwitshakes echter weinig tot vrijwel geen suikers als lactose. ISO-XP van Applied Nutrition is bijvoorbeeld zo zuiver dat het slechts 0,1 gram lactose per shake bevat. Dit geldt echter niet voor alle shakes met whey isolaat, dus let bij het maken van een keuze altijd goed op de voedingswaarden.