Hoewel flash loans nieuwe mogelijkheden bieden, hebben ze ook een controversiële reputatie, omdat ze kunnen worden gebruikt om verschillende soorten aanvallen op DeFi-protocollen uit te voeren. Zodra een kwetsbaarheid is ontdekt, kunnen kwaadwillende actoren bepaalde functies van het protocol manipuleren met behulp van kapitaal dat via een flash loan is verkregen, waardoor ze winst kunnen maken en tegelijkertijd fondsen uit de slimme contracten kunnen aftappen.