Shiga toxin-producing Escherichia Coli (STEC) De bacterie Escherichia coli (E. coli) bevindt zich van nature in de darmen van mensen en dieren. De E. coli bacterie zal bij de mens niet altijd zorgen voor ziekte. Er zijn echter varianten van de E. coli die wel ziekte kunnen veroorzaken bij de mens. Een ziekmakende variant van de E. coli is de Shiga Toxin-Producing Escherichia Coli (STEC) en deze bacterie kan toxinen (giftige stofjes die een bacterie kan produceren en af kan geven aan zijn omgeving, bijvoorbeeld de bloedbaan van een mens) produceren die kunnen leiden tot ziektes als hemorragische colitis (bloederige en/of waterige diarree) en in sommige gevallen tot de ernstige hemolytisch-uremisch syndroom (HUS) (een syndroom met afbraak van rode bloedcellen, acuut nierfalen en verlaagde bloedplaatjes) dat zelfs kans geeft op het overlijden van de patiënt. Om deze problemen te voorkomen kan een product getest worden op de aanwezigheid van STEC bacteriën. Indien een STEC bacterie aanwezig blijkt te zijn in een product kan er vervolgens een test uitgevoerd worden om het serotype (specifiek subtype van een bacterie) van de bacterie te bepalen. De serotypes met het O-gen zijn de ziekteverwekkende varianten van STEC en het kan in sommige gevallen noodzakelijk zijn om aan te tonen om welke subtype het gaat. Het aantonen van Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) (uitslag de volgende werkdag) Om na te gaan of STEC aanwezig is in een monster kan er gebruik gemaakt worden van de PCR methode. Bacteriën bevatten net als de mens DNA, en dit DNA is net als bij de mens uniek. Met behulp van een apparaat dat DNA kan meten, de PCR, kan de aanwezigheid van STEC in een monster aangetoond worden. Voordat het monstermateriaal op de PCR gebracht kan worden moet er eerst een voorbehandeling plaatsvinden. Na de voorbehandeling moet het monster eerst 10 tot 22 uur (afhankelijk van het type monster) bebroed worden in de broedstoof zodat de bacterie zich kan vermeerderen. Na de bebroeding vindt er nog een kleine voorbehandeling plaats in het laboratorium om het STEC DNA vrij te krijgen uit de bacterie. Vervolgens wordt het monster op de PCR gebracht. Indien de STEC bacterie wel of niet aanwezig is volgt er een positieve of negatieve uitslag. Indien gewenst kan vervolgens het serotype van de bacterie bepaald worden. Bij de serotypering wordt er getypeerd op de 7 belangrijkste subgroepen in de STEC, namelijk O26, O45, O103, O111, O121, O145 en O157:H7 met behulp van de PCR. De subtypes van STEC kunnen ook via een biochemische methode bepaald worden.