Het heeft echter limieten voor de bestandsgrootte en partitiegrootte, wat ongemak kan veroorzaken als u grote bestanden wilt opslaan. NTFS heeft meer voordelen dan FAT32 op het gebied van beveiliging, partitiegrootte en bestandsrechten, enzovoort. Als u een modern Windows-besturingssysteem gebruikt, kunt u interne harde schijven beter formatteren naar NTFS.