Een besnijdenis is niet gevaarlijk. Echter bestaat er, zoals bij elke operatie, altijd een kleine kans op complicaties. Zo kunnen infecties en bloedingen voorkomen. Wat minder vaak voorkomt Ook kan het bij besnijdenissen op latere leeftijd voorkomen dat de man seksuele problemen ervaart door een vermindering van de gevoeligheid van de eikel.