Soms kan een donor niet rechtstreeks aan zijn beoogde ontvanger doneren omdat hun bloedgroepen niet matchen. In zo’n geval kan cross-over transplantatie ofwel ruiltransplantatie een alternatief zijn. Bij cross-over transplantatie wordt een ander koppel van donor en ontvanger gezocht en staan beide donoren een nier af aan de ontvanger van het andere koppel. In sommige gevallen is het ook mogelijk door de bloedgroep heen te transplanteren (bloedgroep AB0 incompatibele niertransplantatie). Vraag ernaar bij een transplantatiecentrum.