Er zijn geen gezondheidsrisico's bij een QEEG, noch enige vorm van bijwerkingen. Zowel in de wetenschappelijke literatuur als in de klinische praktijk zijn geen gezondheidsrisico’s en bijwerkingen gerapporteerd voor dit type onderzoek. Er wordt enkel en alleen een registratie van het hoofd gemaakt en u krijgt geen injecties en elektrische  schokken. Ook wordt er niets in de hersenen gestopt.