De kosten voor het verkrijgen van een eTA variëren afhankelijk van de geldigheidsduur en het soort inreis dat is toegestaan. Voor een eTA met een geldigheidsduur van vijf jaar en meerdere binnenkomsten bedragen de overheidskosten USD 5,50 per aanvrager. Naast deze vergoeding kunnen er nog andere bijkomende kosten zijn, zoals verwerkingskosten of online hulp bij het invullen van het eTA aanvraagformulier.