De oorzaken van het prikkelbare darm syndroom zijn er velen. Er is niet een duidelijke oorzaak, en dit maakt het ook zo lastig om op te lossen. Veel voorkomende oorzaken zijn onder andere: - Een onjuiste balans van onze darmbacteriën - Een beschadiging van de darmwand - Een (bacteriële) maag en/of darminfectie - Verschillende leefstijl factoren - Hormoonhuishouding - Stress - Medicatie gebruik (vooral na antibiotica) - Onderliggende ziekten