De uitvoering van het groot onderhoud moet zodanig plaatsvinden dat er geen stikstofdepositie plaatsvindt in nabijgelegen Natura 2000 gebieden. Die maatregelen hebben ook als effect dat de uitstoot van fijnstof als gevolg van werkzaamheden beperkt blijven. In de plannen voor groot onderhoud is voorzien in een systeem dat ervoor zorgt dat fijnstof van het verkeer wordt beperkt. De Kiltunnel gaat hiervoor gebruikmaken van de innovatieve techniek van StaticAir om door middel van ionisatietechniek fijnstof uit de lucht te halen.