Bij het merendeel van de mannen treden de eerste klachten enkele dagen tot twee weken na besmetting al op. Bij vrouwen treden er vaak geen klachten op. Zowel mannen als vrouwen kunnen te maken krijgen met een branderig gevoel bij het plassen en een afscheiding.
Wanneer er in eerste instantie geen klachten optreden, kan dit op een later moment wel alsnog. Dit kan weken duren. Vaak gaat het hierbij om een opstijgende infectie.
Gonorroe kan na orale seks ook in de keel voorkomen. Wanneer er klachten optreden, gaat het vaak om een keelontsteking. Dit komt minder vaak voor, maar treedt eveneens enkele dagen tot weken na de besmetting op.