Omdat je in tegenstelling tot bij een bv geen aandeelhouders of leden hebt, hebben bestuurders van een stichting veel vrijheid. Grote stichtingen hebben meestal een raad van toezicht die toezicht houdt op het beleid en de bedrijfsvoering. Het Openbaar Ministerie en belanghebbenden, zoals donateurs, kunnen de rechter bij wanbeheer vragen om een bestuurder te ontslaan. De rechter kan ook de stichting ontbinden.