Over het algemeen groeien wortels van een appelboom niet erg diep. Hoe diep de wortels groeien, is voornamelijk afhankelijk van het grondwaterpeil. Is het grondwaterpeil lager, dan zullen de wortels van de appelboom dieper groeien. Het is echter niet gebruikelijk dat de wortels dieper komen dan twee meter in de grond. Dit komt doordat op deze diepte er te weinig zuurstof is voor de groei van de wortels. Ook speelt mee dat het op deze diepte te koud wordt om goed te kunnen groeien.