Comorbiditeit komt bij ASS geregeld voor. Dee aandoeningen kunnen met ASS in verband staan, maar ze kunnen ook toevallig voorkomen.
Enkele voorbeelden: obsessief-compulsieve stoornis, angststoornis, depressie, ADHD of ADD, eetstoornis of eetproblemen, het syndroom van Gilles de la Tourette, verstandelijke beperking, syndromale of chromosomale aandoeningen. Ook problemen met het zicht of gehoor kunnen voorkomen.