Is meestal te wijten aan een te hoge concentratie ijzer in uw water. Concentratie ijzer moet beneden 0,2 mg/l zijn anders kunnen er door luchtoxidatie ijzeroxides neerslaan die bruine vlekken geven. Laat uw ijzerconcentratie meten.
Uitzonderlijk kan dit ook te wijten zijn aan een te hoge concentratie mangaan.
Bruine algen kunnen uiteraard ook bruine vlekken veroorzaken en kunnen verwijderd worden met een chloorshock.