NAS-servers kunnen zeer veilig zijn als ze correct zijn geconfigureerd. Dit omvat het instellen van sterke wachtwoorden, het regelmatig bijwerken van de NAS-software, het inschakelen van versleuteling en het gebruik van firewalls of VPN's voor externe toegang. Net als elk ander netwerkapparaat is het echter belangrijk om zich bewust te zijn van potentiële beveiligingsrisico's en passende maatregelen te nemen.