Als je denkt dat je coeliakie hebt, is het belangrijk om naar de huisarts te gaan. De diagnose begint meestal met een bloedtest om te controleren op antilichamen die aanwezig zijn bij coeliakie. Als deze test positief is, kan er een biopsie van de dunne darm worden gedaan. Hierbij worden kleine stukjes weefsel uit de dunne darm gehaald om te onderzoeken of de villi beschadigd zijn.