Het eten van bacon brengt verschillende gezondheidsrisico's met zich mee. Door de hoge hoeveelheid verzadigde vetten en natrium kan het regelmatig consumeren van bacon leiden tot een verhoogd risico op hart- en vaatziekten. Daarnaast bevat bacon nitraten en nitrieten, conserveermiddelen die tijdens het koken kunnen worden omgezet in nitrosaminen, stoffen die mogelijk kankerverwekkend zijn. Het World Health Organization heeft bewerkt vlees, waaronder bacon, geclassificeerd als kankerverwekkend voor mensen, voornamelijk in verband met een verhoogd risico op darmkanker. Verder kan de hoge calorie-inhoud bijdragen aan gewichtstoename en obesitas bij overmatige consumptie.