Over het algemeen wordt collageen als veilig beschouwd en zijn er geen bijwerkingen of gevaren voor de meeste mensen bij normaal gebruik. Echter, sommige mensen kunnen milde bijwerkingen ervaren, zoals maagklachten, een opgeblazen gevoel of een allergische reactie. Mensen met allergieën voor collageenbronnen, zoals runderen of vis, moeten altijd voorzichtig zijn. Ook is het belangrijk om de aanbevolen dosering niet te overschrijden.