Met de optie 'Later betalen' kan de aanvrager met uitstel van betaling doorgaan met de inschrijving en reisaanvraag in de EES. Alvorens naar de landcontroleposten te reizen, wordt een aanvrager met een onbetaalde EES-aanvraag geadviseerd om online een CaP-betaling te doen om de QR-code voor scandoeleinden bij de controlepost te krijgen. Aanvragers die kiezen voor 'Later betalen' ontvangen het factuurreferentienummer en EES-referentienummer per aangetekende e-mail. U kunt online betalen door gebruik te maken van creditcard/debet- of factuurbetalingsservices via online bankieren. Aanvragers kunnen ook betalingen doen via bankloketten. Voor een online betaalwijze met een creditcard/debetkaart dient een aanvrager in te loggen bij de EES en op de knop 'QR ophalen' te klikken. Voer de factuur en het EES-referentienummer in om door te gaan met de betaling van CaP voor de geregistreerde reisaanvraag. Na een succesvolle betaling wordt de QR-code gegenereerd en verzonden naar het geregistreerde e-mailadres van de aanvrager. Voor factuurbetalingsdiensten via internetbankieren moet de aanvrager inloggen op het internetbankieren en kiezen voor betaling aan Royal Customs & Excise Department. Voer het factuurreferentienummer en het bedrag van de CaP-betaling in. Na betaling logt de aanvrager in bij de EES en klikt op de knop 'QR ophalen'. Voer het referentienummer van de betaalde factuur in. Voor een succesvolle betaling wordt de QR-code gegenereerd en naar het e-mailadres van de aanvrager verzonden. Dezelfde stap om de QR-code te krijgen, wordt ook toegepast bij betaling via bankloketten, met het verschil tussen het uitdelen van het rekeningreferentienummer aan de bankbediende en handmatige betaling aan de balie.