WaterWindow is voortgekomen uit de samenwerking tussen waterschappen, Rijkswaterstaat en het ministerie van Infrastructuur & Waterstaat in het Big Data programma ‘Digitale Delta’. De betrokken partijen hebben besloten het platform zelfstandig verder te laten gaan. De werkmaatschappij WaterWindow (onderdeel Stichting WaterWindow) verzorgt nu hosting, beheer, onderhoud en exploitatie. Deze brede achtergrond én deelnemers aan WaterWindow maakt dit instrument zeer geschikt voor het delen van kennis en ervaringen op het gebied van beheer en  toegepaste innovatie.