Indien je besloten hebt om een aroma diffuser in huis te halen, dan is het een goed idee om even stil te staan bij het onderhoud. Zeker wanneer je de diffuser gebruikt in combinatie met etherische olie, zul je merken dat er vaak een gekleurde en/ of donkere waas achterblijft. Je kunt dit vergelijken met een soort van kalkaanslag. Dit kun je verwijderen door de verstuiver te vullen met wat water en citroenolie, en deze vervolgens even in te schakelen.
Een grondige schoonmaakbeurt van de aroma diffuser wordt echter wel elke 2 tot 3 weken aangeraden. Bij een grondige reiniging maak je, bij voorkeur gebruik van een combinatie van water met azijn.