Het snoeien van een bonsai vraagt speciale materialen en technieken. Voor een uitgebreide uitleg bekijk je best even een speciaal boek over bonsais of een filmpje op het net. Het belangrijkste aandachtspunt bij het snoeien van de bonsai is het wegsnoeien van gekruiste takken die tegen elkaar zitten. Doordat deze takken tegen elkaar wrijven ontstaan er wondjes waardoor ongedierte toegang krijgt in het hout van de boom. Ook gebroken takken kunnen beter meteen worden weggesneden net boven hun aanhechtingspunt met de stam.
Twijgjes snijd je best af zodat ze maar 3 tot 4 knooppunten hebben. Dit zijn dan ook de plaatsen waar de bladeren uit zullen groeien. Maak een zuivere insnijding vlak boven het 4de knooppunt zodat de boom niet te groot wordt en de aangroei van nieuwe takken wordt bevorderd. Het meeste snoeiwerk moet gebeuren tijdens de lente en de zomer wanneer de boom in zijn groeiperiode zit. De rest van het jaar houd je gewoon de boom in zijn vorm door uitspringers bij te snoeien.