De regeling mkb-winstvrijstelling wordt altijd toegepast. Dat betekent dat de vrijstelling ook wordt toegepast als je na aftrek van andere aftrekposten op papier fiscaal verlies draait. Of als je een slecht jaar hebt gedraaid en je geen winst, maar verlies draait.In het geval dat je onderneming verlies lijdt, is de mkb-winstvrijstelling nadelig. Na toepassing van de 14 procent aftrek wordt het fiscale verlies ‘gedempt’.Normaal gesproken mag je dat als ondernemer verrekenen met jaren waarin je wel winst draait, maar omdat het verlies op papier lager uitvalt, kun je minder verrekenen en betaal je per saldo misschien meer belasting.