Enerzijds omdat men anders kan hervallen en nog erger ziek worden doordat antibiotica niet enkel de slechte bacteriën aanvallen maar ook die bacteriën die nuttig zijn voor de weerstand van het lichaam. Wanneer men te vroeg stopt kunnen de slechte bacteriën die nog over zijn plots de eveneens verzwakte goede bacteriën overwinnen en anderzijds omdat hoe langer bacteriën op die manier samenzijn met antibiotica zonder dat het hen volledig de das omdoet, hoe sneller deze stammen resistent worden voor het betreffende antibioticum.