Er zijn twee soorten douane entrepots, namelijk een publieke douane entrepot en een particuliere douane entrepot. Een publieke douane entrepot is beschikbaar voor iedere onderneming. Deze douane entrepots worden vaak gebruikt voor het opslaan van niet-uniegoederen voor een korte periode. Particuliere entrepots zijn gereserveerd voor de opslag van goederen voor de houder van de douane entrepot. De houder van deze vergunning is ook verantwoordelijk voor de opslag van de goederen.