Het klimaat in Comporta is over het algemeen gematigd. De Atlantische invloed brengt mildheid in deze regio. De zomers zijn warm en droog en de temperatuur is in de winter vrij mild voor Europa. Het is dus mogelijk om het hele jaar door naar Comporta te gaan.
De gemiddelde temperatuur bereikt 32°C in augustus en daalt tot 14°C in januari. De watertemperatuur ligt tussen 16°C en 22°C.
De maanden april, mei, juni, september en oktober zijn bijzonder aangenaam omdat het klimaat warm is en de regio minder bezocht wordt door toeristen.