Bij een prairieborder wordt géén worteldoek gebruikt. Planten met uitlopers en wortelstokken zullen het daardoor juist moeilijk gaan krijgen. Planten dienen zo diep mogelijk te wortelen en worden begrensd door het gebruik van een doek. Ook wordt de capillaire werking verstoord, wat resulteert in een té natte bodem bij natte omstandigheden of een verdroogde bodem bij droge omstandigheden. Het Prairie Garden systeem zal zo niet optimaal functioneren waardoor het gewenste beeld niet wordt behaald.