De Zuiderkerk is gelegen in het hart van Amsterdam en is goed bereikbaar met het openbaar vervoer. Het metrostation Nieuwmarkt bevindt zich op loopafstand van de locatie. Daarnaast zijn er 3 parkeermogelijkheden in de buurt: Q-Park Waterlooplein, Parking Centrum Oosterdok en Stadhuis Muziektheater.