Ja, omdat pulsed electric field-processing een continu proces is dat weinig ruimte vraagt, kan het makkelijk worden geïmplementeerd in bestaande lijnen. Een PEF-verwerkingslijn voor celdesintegratie van vaste stoffen bestaat uit een transportsysteem met behandelkamer en een pulsgeneratorunit. Voor de milde conservering van vruchtensappen bestaat de opstelling gewoonlijk uit een toevoertank, een vloeistofpomp, een pulsgeneratorunit, een koeler (indien nodig) en een buffertank. De apparatuur kan worden gereinigd volgens CIP (Clean In Place) of SIP (Steam In Place) procedures.