Net als alle bouwwerken kan ook het isoleren van de spouw enkele nadelen met zich meebrengen. Wordt het bijvoorbeeld toegepast in een spouw met vuil of cementbaarden, dan ontstaan er al snel koudebruggen en die brengen vochtproblemen met zich mee. Nadelen van spouwmuurisolatie op zich, is dat het niet past bij elke soort gevelsteen, dampdichte verf, smalle spouwen en beschadigde gevels.