Hooikoorts ontstaat door het contact tussen de stuifmeelkorreltjes en je afweersysteem. Ten onrechte denkt je afweersysteem dat het stuifmeel een gevaarlijke stof is. Je lichaam is dus een beetje in de war en bereidt zich daarom voor op een volgende ‘aanval’ van het stuifmeel. Daarom maakt je lichaam alvast een antistof aan die zich hecht aan de zogeheten mestcel.
Tijdens de productie van deze antistof gebeurt er nog niks. Pas bij het volgende contact met het stuifmeel gaat het mis. Je immuunsysteem herinnert zich dat stuifmeel gevaarlijk is en de mestcel met daarin de antistof breekt open. Hierbij komt er een stofje genaamd histamine vrij. Histamine veroorzaakt de klachten van hooikoorts. De stof zorgt voor verwijding van de bloedvaten waardoor je een loopneus kan krijgen. Na verloop van tijd kan je neusslijmvlies opzwellen waardoor je neus verstopt raakt. Verder kan histamine zich ook aan bepaalde zenuwuiteinden hechten waardoor je last kan krijgen van jeuk, tranende ogen en irritatie.