Voor een aantal werkgevers met minder dan 50 werknemers geldt dat ook zij een interne meldregeling moeten hebben die voldoet aan de eisen van de Wet bescherming klokkenluiders. Voor werkgevers die vallen onder het toepassingsgebied van de in de delen I.B en II van de bijlage van de richtlijn genoemde Uniehandelingen geldt de grens van 50 werknemers niet (zie artikel 2, derde en eerste lid, van de Wet bescherming klokkenluiders). Het gaat om organisaties die werkzaam zijn op het gebied van financiële diensten, producten en markten, het voorkomen van witwassen van geld en terrorismefinanciering, burgerluchtvaart, maritieme arbeid en havenstaatcontrole, en op het gebied van offshore olie- en gasactiviteiten.
Hoewel er voor andere kleinere organisaties geen wettelijke verplichting geldt om een interne meldregeling te hebben, mag het natuurlijk wel. Ook voor kleinere organisaties is het van belang dat werknemers ergens intern en veilig vermoedens van misstanden kunnen melden (dat voorkomt gelijk dat werknemers zich genoodzaakt voelen naar buiten te treden). Maar deze kleinere organisaties hoeven geen interne meldregeling te hebben die voldoet aan de eisen van de Wet bescherming klokkenluiders. Wel geldt ook voor kleinere werkgevers dat zij op grond van de Arbeidsomstandighedenwet en het Arbeidsomstandighedenbesluit verplicht zijn om een arbeidsomstandighedenbeleid te voeren dat gericht is op het voorkomen van psychosociale arbeidsbelasting (daaronder vallen bijvoorbeeld de belasting door agressie en geweld, pesten, werkdruk en seksuele intimidatie).