Hoewel endometriose een chronische aandoening is (wat betekent dat het voor een lange tijd problemen kan geven) zijn er wel degelijk manieren om er mee om te gaan. Zo worden ontstekingsremmers als Ibuprofen vaak gebruikt om de pijn te stillen. Ook de combinatiepil kan helpen, doordat deze er voor zorgt dat er geen eitjes worden vrijgegeven, waardoor menstruaties lichter en minder pijnlijk zijn.
Op chirurgisch gebied kan een kijkoperatie de symptomen verminderen en de vruchtbaarheid verbeteren, terwijl sommige vrouwen uiteindelijk kunnen besluiten om een hysterectomie te ondergaan, wat betekent dat de baarmoeder wordt verwijderd.