De ligging in de Caribische Zee zorgt voor aangename zeewatertemperaturen rond Bonaire. De laagste temperaturen worden in de eerste maanden van het jaar bereikt: ongeveer 25-26 graden Celsius. Daarna warmt het zeewater op naar ongeveer 28 tot 29 graden in de periode augustus tot en met november.
In de eerste meters vanaf de kust is het zeewater dankzij opwarming door de zon vaak wat warmer. Het water in de Lac Baai is standaard ongeveer 2 tot 3 graden warmer dan het water in de zee.