Als de ecoloog tijdens de quickscan aanwijzingen heeft gevonden dat er beschermde diersoorten wonen in het te slopen gebouw(deel), moet dit nader worden onderzocht. Afhankelijk van de diersoort dient er onderzoek gedaan te worden of deze soort er daadwerkelijk woont. Bij sommige diersoorten moet dit zelfs in meerdere seizoenen van het jaar gebeuren. Dit kan vertraging opleveren voor het project. De prijs van het aanvullend ecologisch onderzoek is sterk afhankelijk van het type onderzoek wat gedaan moet worden.