Er zijn verschillende manieren om een ​​Proxmox-server te beveiligen, waaronder het configureren van firewalls, het gebruik van sterke wachtwoorden, het up-to-date houden van de software en het beperken van netwerktoegang tot alleen noodzakelijke poorten en services. Bovendien ondersteunt Proxmox codering en andere beveiligingsfuncties om gevirtualiseerde infrastructuurbronnen te beschermen.