Procedūros metu gydytojas su specialiais instrumentais valo šaknies kanalą, daro ne mažiau kaip dvi rentgeno nuotraukas, o išvalytą šaknies kanalą užpildo specialiai tam skirta plombavimo medžiaga. Kanalų gydymui gali prireikti nuo 1 iki 4 apsilankymų – tai lemia danties šaknų skaičius ir uždegimo sunkumas.