Dantų kanalų gydymas vyksta dviem būdais – naudojant mikroskopą ir be jo. Sudėtingais atvejais būtina rinktis endodontinį gydymą mikroskopu. Surasti šaknies kanalus ne visada yra lengva - jie dažnai būna užakę ir tokie siauri, kad yra matomi tik pasitelkus vaizdą didinantį operacinį mikroskopą ir remiantis rentgeno nuotraukomis, taip pat pasitelkiami elektroniniai šaknų kanalų ieškikliai, ultragarso aparatai - viskas tam, kad specialistas galėtų tiksliai matyti danties anatominius ypatumus, galimus svetimkūnius šaknies kanale, pašalinti uždegiminius audinius ir itin smulkiais specialiais instrumentais saugiai pasiekti šaknies viršūnę.