Ar dzīvnieku pārvadājumiem saistītā izmaksu amplitūda var būt ļoti plaša. Atbilstoši nepieciešamajam transporta veidam un dzīvnieka labturības prasību ievērošanas iespējām, kravas apjomam vai dzīvnieka parametriem un nepieciešamā piegādes ātruma, kādā dzīvnieku pārvadājumu nepieciešams realizēt konkrētajā maršrutā. Tāpat, atkarībā no maršruta, papildus jārēķinās ar izmaksām, kas var būt saistītas ar muitas formalitāšu kārtošanu.