프로폴리스에서 유용한 물질들을 얻기 위해서는 알코올이나, 이산화탄소를 이용한 추출 과정이 필요해요.
알코올을 이용한 주정 추출은 순도가 높은 편이라 널리 사용되는 방법이에요. 약 70% 정도의 알코올에서 플라보노이드가 가장 높게 추출되었다는 실험 결과가 있어요. 하지만 불순물이 남아있을 수 있고 알코올 향과 맛이 남아 섭취할 때 거부감을 느끼기도 해요.
이산화탄소를 이용한 초임계 추출은 알코올 향이 남지 않고 순도도 높기 때문에 품질이 좋지만, 가격이 비싼 편이에요.