痔瘻の再発率は、治療（手術）の方法により差があります。
前述の2種類のうち、痔瘻のトンネルから外側をすべて取り除くタイプの切開開開放手術を行った場合は再発がほぼみられません。細菌の感染したトンネルやくぼみごと切除するため、少なくとも同じ場所での再発は無くなります。
対してトンネルをくりぬく形で開放する括約筋温存法では、肛門内部に手術後の傷跡が残ってしまうため、ここから傷が開いたりして再発する可能性もあります。とはいえ極端な下痢や便秘を起こさなければ、肛門の周囲を傷つけることはないはずです。もし発症してしまった場合は医師に相談するのはもちろん、より食生活や生活習慣に気を遣うことで再発を防止しましょう。