そのご心配はございません
重ね葺きのリフォーム以外は既存屋根材を撤去してしまいますが、その場合下葺き(ルーフィング)までは必ず施工いたします。(気象状況により代用のシート類で養生ということも万が一にはございます。)
よって想定外の大地震や竜巻その他甚大なる気象変化以外は防水性能を保てますので、大雨が降ったとしてもどうぞご安心くださいませ。