金魚の長いフンは腸にたまっていたものが出た状態です。
金魚には胃がありませんから、消化が順調なら2～3cm程度の糞をこまめに排泄します。
あまりにも長いフンは消化不良を起こしていると言えます。
長いフンが続くようでしたら餌の量を控えめにするか、水換えを行い排便を促しましょう。