可能です。検査除外用のルールを作成することで、保護しないサイトを設定することができます。SiteGuard Proxy Edition（ゲートウェイ型）の場合、マルチインスタンス機能を用いて複数インスタンスを作成することで、サイト毎により細かなポリシーを適用することもできます。