これは、Android の一部のアプリやゲームで見られる既知の問題です。3.5mm ヘッドフォンを接続すると、コントローラーがお使いのデバイスに再接続します。ゲーム中にコントローラーの接続が切断され、再び接続すると、障害が発生するアプリやゲームもあります。
対象のゲームとの最大限の互換性を確保するために、有線ヘッドフォンのコントローラーへの接続と取り外しはゲームの開始前に行うようにしてください。
Bluetooth ヘッドフォンの場合、このような問題は起こりません。