本作が2008年7月19日に公開された際、初日舞台挨拶中に偶然にも地震が起こり津波警報が出ました。そのとき宮崎駿は「ポニョが来たのかな？」と発言したのだとか。また2011年の東日本大震災で東北地方が津波で大きな被害を受けてから、本作はしばらくテレビ放送されなくなりました。
この2つの出来事から「ポニョ」は津波を予言していたとささやかれるようになります。しかしテレビ放送は他の作品でもそういった配慮はされますし、監督の発言も偶然でしょう。