給与からは所得税が課税され、天引きされています。ですから交通費が時給に含まれている場合は、時給＋交通費に対して課税されます。 しかし、交通費が給与明細の中で別扱いになっていれば、その分は非課税になります。つまり、課税されるのは時給分だけですむわけです。 金額にするとそれほどではありませんが、後者の方がおトクになるのは事実です。