エボラ出血熱による致死率は、これまでの感染状況や行われた医療的処置から推測することができます。こうした推測から、エボラウイルスの種類と感染者に対して提供される医療レベルによって、致死率が変わることがわかってきています。
データ的に致死率は25〜90％の範囲で変化しますが、おおむね50％程度です。ウイルスの種類による致死率のデータは、ザイール型が致死率約90％、スーダン型が致死率は約50％となっています。なお死に至る場合の症例では、発症後約1週間で死亡することが多いというデータがあります。