カーネルの分割化手法は、マイクロカーネルやユニカーネルなどの代替カーネルアーキテクチャにも適用可能です。これらの代替アーキテクチャは、従来のモノリシックカーネルよりもセキュリティや信頼性の向上を目指して設計されていますが、それでも脆弱性や攻撃のリスクが完全に排除されるわけではありません。カーネルの分割化は、これらの代替アーキテクチャでも利用され、さらなるセキュリティ強化を実現することができます。
例えば、マイクロカーネルでは、カーネルの機能を小さなモジュールに分割し、それぞれを独立したセキュリティドメインで実行することが一般的です。カーネルの分割化は、このようなアーキテクチャにおいても異なる部分を隔離してセキュリティを向上させる役割を果たします。同様に、ユニカーネルでも、カーネルの機能をアプリケーションごとに最小限に組み込むことで、セキュリティを強化するための分割化手法が適用されることがあります。