尋常性白斑の原因ははっきりとわかっていませんが、皮膚のメラニン色素を作っている細胞（メラノサイト）に対する免疫系による攻撃が関わっていると考えられます。過度のストレス、やけど、日焼け、刺激などによる自己免疫疾患や抹消神経系の変化などが考えられます。