mRNAコドン最適化の問題設定において、考慮すべき要因はまだ存在します。例えば、タンパク質の安定性や機能性に影響を与える他の要因、特定の生物種におけるコドン使用の傾向、目的とするタンパク質の発現量や速度などが挙げられます。さらに、mRNAの安定性や翻訳速度などの要素も重要であり、これらを考慮することでより効果的なコドン最適化が可能となります。