PROTLLMは現在主にシーケンスモデリングを対象としていますが、他のモダリティ向けの入力インタフェースとして設計されています。将来的な研究では、PROTLLMをさらに拡張し、タンパク質構造や分子グラフなど追加のモダリティを組み込むことが考えられます。これは、特定のタスクやアプリケーションにおいてより豊富な情報源を取り込んだり、異なる種類のデータ形式に適応したりするために有益である可能性があります。