収支報告書はサークルや団体などへの限定的な関係者に対する収支報告を目的としている一方、決算報告書は複数のステークホルダーへの経営状況の報告のために作られます。また、取引認識（現金主義と発生主義）、関連法規の有無（収支報告書：無、決算報告書：有）などにも違いがあります。