再生治療が不可能な歯もあります。再生治療に大事な事は、「歯の周囲を完全にきれいにする」という事です。
既に周囲の骨が吸収されていて無く、歯の周囲を掃除した時点で支えられずに抜け落ちてしまうような歯は再生治療が困難です。
また、歯の根の分かれ目（分岐部といいます）が歯周病の場合、器具が十分に入っていかず完全な清掃が困難となり、再生治療が難しくなります。
お口の中全体的に骨がなくなっているような状態も、再生治療は困難です。