欠勤による控除と残業による残業代の支給（加算）は別物ですので、相殺はできません。 １か月の給与の総額の中で前記の控除分と加算分が相殺されるような形になることはありますが、当然ながら残業代に含まれる時間外手当などの割増賃金部分まで相殺されることはなく、仮に割増賃金部分が支払われなければ違法となります。