口座振替にしてもデビットカードにしても、どちらも「決まった期日に即引き落とされる」ということに変わりはありません。
デビットカードの所持状況などを鑑みて、自分の好きな方を選んでOKでしょう。
ちなみに、デビットカードはクレジットカードと同様に支払いでポイントがつくものもあります。
格安SIMの支払いはもちろん、日常的にスーパーやコンビニ等で使う可能性があるなら、デビットカードを作っておいて損はないと思います。