クリスタEXを使う1番のメリットは、効率よく漫画が描けること。
例えば1つの作品（話数）を管理できるため、ファイルを開くと複数ページを一度に編集できます。
ページの入れ替えやセリフの一括入力、見開きページの作成も可能です。
こうした機能を活用すると、クリスタPROでは得られない効率性や利便性を体験できます。
またアニメに関しては、EXでないと3秒以上のアニメは作れないため、それ以上のアニメを作るならEXは必須といえます。