サプリメントを飲んで、ママの尿が成分特有の匂いを強く感じるようであれば、母乳の匂いもサプリメントの影響を受けていると思います。そのため、匂いに敏感な赤ちゃんは母乳を嫌がったりすることがあるようです。もちろん、全く匂いを気にせず、母乳をよく飲む赤ちゃんもいます。
今、様々な種類のサプリメントが市販されていますので、個々の物についてはサプリメントの添付書をよくお読みになっていただければと思います。