屋上防水工事は工事の内容や工事費より、「必要経費」か「資本的支出」に分かれます。
国税庁が定めた修繕費の判定のための形式基準では次のようになっています。
・工事金額が60万円未満
・修繕費が前期末の固定資産取得価額のおおむね10％相当額以下
上記のいずれかに該当すると「必要経費」とすることができますが、不明な場合は税務署や税理士に確認することをおすすめします。