大きな違いは脱毛効果です。
医療脱毛とエステ脱毛では、施術に使われる脱毛機器の照射出力が全く違います。
医療脱毛は医療従事者が施術を行うため、強力なパワーでの照射が可能です。短い期間・少ない回数で効果的な脱毛ができます。
エステ脱毛は照射出力が弱いため、回数を重ねる必要があり、満足するまでに長時間要してしまうというのがデメリットと言えます。