妊娠中にピルを服用しても、赤ちゃんに大きな影響はありません。
さまざまな研究機関の研究から、妊娠後にピルを飲み続けて生まれた赤ちゃんの奇形率は高くなっていないというデータがあります。
参考：経口避妊薬服用後妊娠による心身障害児発生の防止対策に関する研究
妊娠が発覚した時点ですぐにピルの服用を中止しましょう。
ピルの臨床試験は妊娠中の利用を想定しておらず、予想外の副作用が出る可能性があるからです。
また、ピルの成分が母乳の量や質を低下させるというデータも報告されています。
妊娠中にピルを服用するメリットは基本的にないため、妊娠がわかった時点で服用を止めましょう。