防水シーツとおねしょシーツは基本的には防水加工や撥水加工が施されたシーツのことを指しているため、違いはほとんどありませんが、おねしょシーツはその呼び名の通り、おねしょ対策として使われているため防水加工の他、吸水性も兼ね備えている商品が多いのが特徴。
その他にも、育児用・介護用として使用されているおねしょシーツは、防水シーツとは違い、防水加工のみで撥水加工は施されていません。理由としては、撥水加工がされていると伸縮性がなくなり寝心地が悪かったり蒸れやすい一面があるためです。