郵送の場合、返信用封筒を同封しておけば返送してもらうことができます。
税務署に直接提出する場合、その場で収受印を押してもらいます。
e-Taxで確定申告を行った場合、「メール詳細」という受信通知が、税務署の収受印の代わりになります。
詳しくは、こちらをご覧ください。