iPS細胞の大きな利点は4つです。1つめは、誰からでも作製でき、自分の細胞を使った医療が受けられます。臍帯血造血幹細胞のように新生児に限られることもなく、老若男女問わず誰の細胞からでも作製可能です。二つ目は、高い分化能を持っており、あらゆる組織や臓器の細胞に変化する能力を有しており、適応疾患が多いことです。3つめは、iPS細胞はほぼ無限に増殖する能力を有している為、移植に必要な十分な量の細胞を得ることができます。他の幹細胞は増殖能に限界があります。iPS細胞は細胞移植医療の理想的な原材料であると言えます。より幅広く再生医療に適用可能です。 臍帯血造血幹細胞 臍帯血は通常、出産して臍帯（へその緒）が切断された後に採取されます。臍帯血には、白血病やリンパ腫などの血液がんの患者や、鎌状赤血球症やウィスコットアルドリッチ症候群などの血液や免疫系の特定の疾患の治療に使用できる造血幹細胞が含まれています。臍帯血幹細胞と多能性幹細胞（iPS細胞およびES細胞）の主な違いの1つは、臍帯血幹細胞は血液細胞にのみ変化できるのに対し、多能性幹細胞はさまざまな種類の細胞に分化できるということです。したがって、臍帯血は「造血幹細胞移植」での使用が主な用途です。 間葉系幹細胞（MSC） 間葉系幹細胞は、人間の体の中に存在する幹細胞の一つで、臍帯血、骨髄、胎盤、脂肪組織、歯髄、その他の臓器からも分離できます。間葉系幹細胞の分化能は臍帯血に比べると多くの種類の臓器に分化することができますが、多能性幹細胞と比較すると限定的で骨細胞等、特定の種類の細胞にのみ分化することが出来ます。 歯髄幹細胞 歯髄幹細胞（DPSC）は、培養中および移植時にさまざまな種類の細胞への比較的広範な多能性分化を示す、内歯由来の間葉系幹細胞（MSC）の特定のタイプです。適応疾患は間葉系幹細胞と同じでiPS細胞に比べて限定されます。