SRYの性能は、ゲノムサイズや染色体構造の複雑さなどの要因によって異なります。例えば、SRYはY染色体の場合、男性特異的なマーカーを選択するために半分の深さのk-merを使用します。このため、ゲノムサイズが大きい場合や高いヘテロ接合性を持つ染色体の場合、SRYの性能は向上する可能性があります。また、SRYは、集団構造やシーケンスエラーの影響を受けるため、厳密なサンプリングプロセスを経て性別特異的なマーカーを同定します。これにより、SRYの性能はデータセットの特性に応じて変化する可能性があります。