ペースメーカーには影響はありません。
スタンガンがペースメーカー（心臓鼓動補助装置）へ与える影響に関しては、アメリカでの実際の実験において問題がないことが証明されています。
参考：Effect of Stun Gun Discharges on Pacemaker Function
スタンガンの電撃はペースメーカーという装置自体に悪影響を与えないとしても、ペースメーカーが必要なくらい弱っている心臓が電撃の痛みに対してどのような反応をするのかは未知数です。個人差もかなり大きいのではと推測されます。
しかし、そのようなリスクを踏まえても、実際に襲われる状況下においては正当防衛として身の安全を優先させるべきです。
スタンガンを使用する時はしっかりと5秒以上連続して通電させるようにしましょう。