培養槽に対し、培養液が約6割程度になるように槽容量を選定します。発泡性が気になる場合は割合を減らします。基本的な培養は、温度・通気・撹拌となりますので、設置環境に、電気・冷却水・エアーが必要となります。微生物の培養に適切な条件を保つために、ｐＨ電極、ＤＯ電極などのセンサーとその制御装置、加えて条件を維持するために添加装置、を選定します。ジャーファーメンター(卓上・ラボスケール)の場合は、培養前にオートクレーブで滅菌を行いますので、培養槽の大きさに合わせたオートクレーブが必要になります。