「フレックスタイム制がある＝自分の希望どおりの時間帯に勤務できる」とは限りません。自分が希望する職種や配属予定の部署ではどのようにフレックスタイム制が導入されているのか、1日のタイムスケジュールなどを面接の場で聞いてみると良いでしょう。