多コンフォーマー構造モデルの生物学的意義を検証するためには、いくつかの実験的アプローチが有効です。まず、タンパク質の異なるコンフォーメーションがどのように機能や相互作用に影響を与えるかを調査するために、構造生物学的手法が有用です。X線結晶構造解析やクライオ電子顕微鏡法を使用して、タンパク質の多様なコンフォーメーションを観察し、それらがどのように相互作用や機能に関与しているかを解明します。
さらに、生化学的アプローチも有効です。例えば、タンパク質の異なるコンフォーメーションが特定のリガンドとの結合にどのように影響するかを調べるために、結合実験や分光法を使用することが重要です。また、タンパク質の異なるコンフォーメーションが特定の生物学的プロセスにどのように関与しているかを調査するために、細胞内でのタンパク質の挙動を観察する細胞生物学的アプローチも有用です。