不動産の共有持分が、相続人のいない被相続人の所有であった場合には、「相続人不存在確定」か「特別縁故者の請求の審判」が確定後、相続財産清算人が登記義務者となって「相続人不存在確定」を登記原因として持分移転登記をするのが通常です。
この際にかかる登録免許税を含めた費用については、他の共有者が負担します。