AbDiffuserは、SE(3)等変性を活用した新しいニューラルネットワークアーキテクチャであるAPMixerを使用しており、これはタンパク質ファミリー全般に適用可能です。具体的には、APMixerは固定長の配列表現を使用するため、異なるタンパク質ファミリーでも同様の手法が適用可能です。さらに、学習データから条件付き依存関係を自動的に学習することで、特定のタンパク質ファミリーに固有の制約や相互作用も考慮されます。そのため、他のタンパク質ファミリーへの応用も十分可能であり、各種複雑な立体構造や相互作用を捉えることが期待されます。