個人で請負契約を結んで収入を得ているシステムエンジニアの場合は「請負業」と見なすことができるため、個人事業税の課税対象になります。ただし、一般的な企業常駐型フリーランスのように準委任契約を結んで収入を得ているシステムエンジニアであれば「請負業」には当たらないと判断され、課税対象にはならないことが多いです。