ワードプレスのパーマリンク設定はSEOに大きく影響します。 「WordPressのパーマリンクの基本知識」でも解説していますが、Googleのガイドラインにパーマリンクに関する指定があります。 Googleが推奨する形式のパーマリンクにするかどうかでSEOにも影響が出ると考える方が自然でしょう。 また、一度決めたパーマリンクを途中で変更すると404エラーの原因になりますので、SEOに影響が出ます。 なので、Googleが推奨する形式のURLにするということと、一度決めたURLは変更しないようにしましょう。