いいえ、彼は誰かに悪態をついているわけではありません！ここでの「fucked up」は「messed up」や「unhappy」「damaged」と同じような意味です。ですので、その人が一緒にいてくれないなら自分は「unhappy（不幸）」になると言っているのですね。
例：The company will be fucked up if they don't sign a new deal soon. （早く新しい契約を結ばないと、会社はダメになるだろう。）
例：She'll be fucked up if she stays here any longer. （彼女はこれ以上ここにいたら酷いことになるだろう。）