体外から照射された陽子線は、目的臓器に衝突すると瞬時にエネルギーを失い消えてしまいますので、それが体外に放射されることはありません。照射直後にごくわずか（影響のない非常に小さな数値）体内に放射能が生まれることがありますが、その多くは短半減期であり周囲の人や物に対して影響を及ぼすことはありません。