wwwの有無によってSEOに影響が出ることはありません。
ただし、wwwあり・なし双方でサイトにアクセスできる状態は問題です。
検索エンジンからの評価が分散される他、重複コンテンツとみなされ、評価が下がる可能性が出てきます。
正規化を行い、URLを一本化しましょう。