医療費控除の申請は、5年前までさかのぼり申請できます。確定申告期間は毎年2月16日から3月15日の30日間。前年に発生した医療費はこの期間に申告しないと無効になると考える人が多いが、医療費を含む還付申告は翌年の1月1日から5年間提出できます。ただし、この5年間通算できると誤解する人もいますが、各々の1年間（1/1から12/31）の医療費が10万円以上であることが条件です。