一番のメリットは「為替手数料を安く抑えることができる」点です。
住信SBIネット銀行で両替した場合、外貨預金なら1ドル6銭、外貨積立なら1ドル3銭の手数料のみです。
SBI証券で外貨両替すると25銭かかるため、住信SBIネット銀行で外貨預金をして、SBI証券へ振替するのが最もお得ですよ。