扁桃腺は体の免疫システムの一部ですが、扁桃腺を切除しても全体的な免疫機能に大きな影響はありません。体には感染症と闘うための他の多くのメカニズムがあり、ほとんどの人は扁桃腺切除後に病気のリスクが増加することはありません。実際、慢性扁桃腺感染症の人は、扁桃腺を切除すると全体的に病気が減ることがあります。