HACCPの制度化は改正食品衛生法によって全ての食品関連事業者に対して義務付けされましたが、現在法律によって明確に罰則は規定されていません。ただし、自治体が定める条例によって罰則が設けられる可能性もありますし、無視し続けると保健所から営業許可を取り下げられてしまうこともあるでしょう。