EPUBは本のように読むことを目的としているため、幅広い機器に合わせて書式が変わります。PDFはデータのような役割があり、書式が固定されています。
一方でEPUBよりPDFに対応したブラウザや機器が多いため、PDFのほうが多くの人にデータを共有しやすいです。