格安スマホでも、LINEは問題なく使えます。LINE通話も可能です。
ただし、新しいデバイスにLINEを登録するときは、電話番号の認証が必要になります。データ通信専用のプランは電話番号が付与されませんので、SMS機能付きのプランもしくは音声通話付きのプランを契約しましょう。
ID検索等の一部のサービスは格安SIMでは使えませんが、QRコード等の代替機能があるので安心してください。