はい。可能です。本サービスページからはできませんが、ラベル印刷ソフト等を併用することでオリジナルデザインのQRコード付き整理券をお作りいただけます。詳しくは下記を御覧ください。
オリジナルデザインのQRコード付き整理券の作り方