一般的には、含みます。源泉徴収票に書かれた数字を参照しましょう。
ただし、税金を計算するときなど、明確に算出しなくてはならない場合は、きちんと把握しておく必要があります。例えば、社会保険で年収を申告する場合、交通費を含みます。その他の場合では、交通費が非課税（所得税法では月10万円まで）の場合は総支給額に含みません。さらに詳しく自分の給与を知りたい方は、「年収の計算は交通費を含む？自分の給与を正しく知ろう」をご覧ください。