マイコプラズマ肺炎は市中感染といい、健常人がよくなる肺炎の１つです。妊娠中、胎児を守るため母体の免疫機能が変化します。
特に細菌に対する免疫は低下するので注意が必要です。結論からするとマイコプラズマ肺炎に対する根本的な治療は必要です。
そのためマクロライド系の抗生物質を使用してもらうといいでしょう。まったく影響がないとは言いませんが適切な量の内服で胎児への影響はあまり考える必要はないと思います。