あごのつけ根がカクカク鳴っているのは、おそらく顎関節の音ではないかと思います。成長とともに、顎関節を囲む組織がしっかりしてきて、音が減ってくると思いますので、しばらくはそのまま様子を見ても大丈夫かと思います。