ひとり親方がインボイス発行事業者でなかった場合、消費税の納税額が大きく増える可能性があります。その場合に考えられる対応は以下の通りです。
ひとり親方に課税事業者への変更を促す
ひとり親方に消費税分の値引きを要求する
ひとり親方を自社の従業員として雇い入れる
別の業者へ依頼先を変更する