局所に限定されているがんや、従来の方法では治療が難しいがんが対象となっています。陽子線はX線による治療と比較して正常な組織への線量を減らすことができますので、従来の放射線では治療が難しいケースにも適用できる可能性があります。また、手術のできない患者も対象となる場合もあります。しかし、病気の広がりを画像で捉えられないようなもの、血液のがんなどには向きません。