腸管穿孔を発症した原因によっては再発することがあります。また、高齢者は突発的な腸管穿孔を起こすことがあり、再発することが多々あります。腸管穿孔を発症した原因が外傷や内視鏡検査といった外的な力によるものである場合、再発する危険性は高くありません。
しかし、憩室炎・潰瘍・がんなどといった病気の影響で腸管穿孔が起こったケースでは再発する危険性があります。