京都市中京区に位置し、法華宗本門流大本山でもある本能寺は、織田信長が明智光秀によって討たれた「本能寺の変」で有名ですが、実は現存している本能寺で起こった出来事ではありません。
再建や移転が行われた本能寺は、日隆上人によって1415年に現在の佛光寺辺り(京都油小路高辻と五条坊門の間)に建立されました。創建された当初は「本応寺」と呼ばれていましたが、1433年に六角大宮に移転した際に「本能寺」と改められたのだそうです。
しかし、1536年の天分の乱によって本能寺は全焼してしまい、1545年に油小路蛸薬師へと移転したのです。7回の再建によって最大の規模となった本能寺で、あの有名な本能寺の変が起こりました。
1582年に本能寺の変が起こった際に、再び本能寺は焼失してしまうことに。そして、豊臣秀吉による都市計画によって現在の位置に移転したのが、1589年のことでした。
江戸時代後期に起こった天明・元治の大火災によって、伽藍は再び焼失してしまうのですが、昭和3年の1928年に本堂が再建されて、現在の姿に至るのです。