化合物によってはプローブ位置が感度に大きく影響を与えることがあります。また、プローブ位置が偏っていると感度変動が大きくなる場合があります。
最適なプローブ位置が大きく変化した場合には、ESI スプレー状態が悪くなっている可能性がありますの