S&P500に投資をするにあたってこれといったデメリットはありませんが、強いて言うならば個別株に投資をするよりもリスク・リターンは低くなります。
短期的により大きなリターンを狙うのであれば個別株の方が適していますが、長期的にリスクを幅広く分散しながらリターンを狙いたいという方はS&P500指数に連動するインデックスファンドに投資をすることをおすすめします。