大きな違いは第1膜のプレフィルターと第4膜の消臭フィルターです。
プレフィルターは350は不織布、300はナイロン網です。
消臭フィルターは350はARC式、300は活性炭です。
不織布はプラ膜よりペットの毛を絡め取りやすくなっています。絡め取り易い分、フィルターの掃除がやや大変です。
ARCは恐らく触媒式（化学分解式）で大雑把にはペットなどの生き物、料理などの食べ物の匂いに特化したフィルターになっています。
350と300のフィルターは互換性があるので本体の色で買ってフィルターを別に買うのも手です。