FAGAの原因は、女性ホルモンの減少が関係していると考えられます。女性ホルモンのエストロゲンが減少すると、男性ホルモンのテストステロンの働きが優位になってしまいます。他には遺伝的な原因や自律神経の乱れによって引き起こされることもあります。自律神経の乱れはストレス・睡眠不足・食生活などの生活習慣により引き起こされます。