判定保留の結果が出る理由としては、以下の3つが挙げられます。
・血液中の胎児由来のDNAが不足していた
・悪性腫瘍があり複数の染色体異常が疑われるため
・自己免疫疾患やヘパリン治療をしているため、あるいは双胎の一児初期流産（バニシングツイン）、モザイクがみられるため