マヒカハニーにはマヌカハニーにあるメチルグリオキサールという抗菌成分は含まれていません。しかし、マヒカハニーは通常行われている加熱処理の必要がないので豊富な栄養成分を失うことはなく、一般的なはちみつよりも3倍の殺菌作用があることが認められています。