解決後もいろいろと調べてみると、windowsパスの文字数は「259文字」までのようで。 今回のようにファイルサーバーを利用している場合、普段の業務内容ごとや案件ごとにフォルダを細かく分け階層が深くなればなるほど、「259文字」の制限を超えてしまい、今回のような状況になってしまうようです。