APTは藻類の発生を抑制するよう設計されていますが、殺藻剤ではないためそれ自体で藻類を除去するものではありません。森の木々が光と栄養分を吸収して雑草に負けないように成長するのと同じように、水草が藻類に対抗できるようにサポートを行ない、水草の健全な成長のために十分な量を供給しながら、藻類を誘発する栄養素の量を適切ににコントロールします。藻類発生の原因や、特定藻類の管理法詳細ガイドを確認することをお勧めします