GHSの医学部向けコースとしては、定員１５人の「国立医学部コース」と、定員１０人の「私立医学部コース」があります。国立医学部コースは、国立医学部に必要なすべての教科をカバーしています。
国立医学部コースの最大の特徴は理系科目・文系科目にかかわらず、全科目の成績の成績を伸ばしていく「頭の良さ＝学力」をつけていく点にあります。５教科７科目の膨大な勉強をバラバラに（教え方のバラバラな講師たち）学んでも大きな伸びは期待できません。GHSはどの授業でも教科を超えた普遍的・一般的な思考力を目指して行われているので、いずれ生徒たちは教科の違いはあっても底に流れる本質は同じなんだな、と感得できる日、つまり「本物の学力・実力」が付く日が遠からず訪れます。「GHSのどの先生も同じことを言っている！」「これだけやっていけば絶対合格する！」と確信を持ちながら勉強できることが、一年という長い期間の中でメンタルの面でもとても大きな効果を発揮していきます。
私立医学部コースの最大の特徴は「実力をつけるために特化した授業」が豊富に組まれている点にあります。私立医学部は受験科目が４科目に絞られている分「深く・濃く」実力を養成していく期間を持つことができます。なので、１科目あたりの'伸び率'を最大にしていくことができるコースとなります。ですので、私立医学部コースは国立医学部コースに比べて、より出発点に不安がある人や、ぐんと伸びて難関の私立医学部に合格したい、という人におすすめです。