バナジウムは火成岩の一種、玄武岩に多く含まれています。富士山一帯は、この玄武岩に覆われています。富士山に降る雨や雪が、20～40年という長い年月をかけて地下へと流れ込みます。その過程で玄武岩を水が通過し、バナジウムを含んだ天然水に変化します。他の山でもバナジウムを含んだ天然水は採水されていますが、富士山の天然水のバナジウム含有量には及びません。