生雲丹の旬は地域や種類によって異なり、日本で食用とされる種類は約６種類です。バフンウニの旬が３〜４月頃で今季となります。エゾバフンウニやアカウニなど他の種類の生雲丹は夏〜秋頃に旬を迎えます。