遺伝子治療は、欠陥のある遺伝子を健康な遺伝子に置き換えたり、修復したりする新しい治療法である。色覚異常の場合、遺伝子治療では、影響を受けた遺伝子の機能的コピーを目の錐体細胞に送り込み、色覚を回復させる。色覚異常に対する遺伝子治療の臨床試験は現在いくつか行われており、有望な結果が得られている。