始末書の提出は、社員の非を追及するという意味があるため、納得のいかない社員側から反発を受けることもあります。始末書の提出を拒まれたときに、せめて再発防止のため顛末書を出させるという対応がおすすめです。詳しくは「始末書・顛末書の提出を拒否されたときの対応」をご覧ください。