「代理操作を登録」ボタンをタップすると、ギルドバトルの代理操作をリーダー（サブリーダー）に依頼することができます。 依頼の設定をした際には、ギルドチャンネルのバトルログに設定した旨のメッセージが自動送信されます。 代理操作の設定は、該当ギルドバトル終了後の翌5:00に解除されるため、ギルドバトルごとに設定が必要です。
代理操作の登録には回数制限があり、一定期間を過ぎるとリセットされます。 登録後、実際に代理操作が行われた場合のみ、該当のギルドバトルが終了した後に回数が1減少します。 ※メインパーティーとサブパーティーの代理操作が行われた場合でも、減少する回数は1となります。
「ログイン時自動登録」の設定をONにしていた場合、毎日の初回ログイン時に自動的に代理操作依頼が行われます。 ※依頼回数が残っていない場合は自動登録は行われません。
代理操作を登録しているメンバーがいる場合、ギルドバトル対戦中、攻撃パーティーに「代理操作」バッジが表示されます。 リーダー（サブリーダー）はバッジが表示されているパーティーを選ぶことで代理操作を行うことができます。 また、ギルドバトル対戦中でもサブパーティーを含む攻撃パーティーが未行動であれば、自身の攻撃パーティーをタップすることで代理操作の設定を変更できます。 ※期間限定ギルドバトルとギルバト頂上決戦では、自身の攻撃パーティーを長押しすることで代理操作の設定を変更できます。
代理操作を登録した場合、個人に発生する報酬は獲得できません。 代理操作を行ったリーダー（サブリーダー）は代理操作用の報酬が獲得できます。 ※代理操作を登録している場合、ギルドバトル不参加の扱いとなります。ギルドバトル参加ミッションは達成されません。