両方とも相手の企業を指す呼称ですが、御社は話し言葉で、貴社は書き言葉で使います。御社を使う場合は、面接や電話。貴社を使う場合は、履歴書や職務経歴書、メールなどです。病院や銀行、役所など一般企業以外では別の呼称を使用します。詳しくは「「御社」と「貴社」にはどんな違いがある？正しい使い方まとめ」で解説しています。