小腸に狭窄がある場合、カプセルが排出されない恐れがあるため、パテンシーカプセルというものを用いて、事前に消化管の通り具合を確認してから検査を行います。一方、消化管内に病変があることでカプセルが滞留するとも考えられ、アクシデントというよりも、滞留が病気の発見につながるとも考えられます。カメラは生体適合プラスチックでできており、合併症を引き起こす心配はまずありません。カプセルが滞留して出てこないときは、しばらく下剤を服用しながら経過を観察します。それでも排出されない場合は、口と肛門の近いほうから小腸内視鏡を使ってアプローチしていき、原因を探りながらカプセルの回収を試みます。