クロレラには、クロレラ・ブルガリスとクロレラ・ピレノイドーサの2種類があります。葉緑体の構造、細胞壁の厚さ、栄養成分に違いがあります。ピレノイドーサは、光合成とビタミン産生を高めるピレノイドを持っています。また細胞壁が厚く、重金属や毒素との結合に優れている。バルガリス菌は細胞壁が薄く、消化が良くタンパク質が豊富である。