12週まで赤ちゃんは元気に成長しているのですから、まず大丈夫と考えます。新鮮血なら心配ですが、濃い茶色は古い血液と考えられるので、出血の痕のものが徐々に出てきているのでしょう。
ただし、茶色のオリモノがなくなるまでは無理しないでください。