デバイスのパフォーマンスに影響しないように、アップデート中にiPhoneを操作することは避けて、他のアプリの更新も行わない方が良いです。アップデート中はデバイスのリソースが限られているため、他の大容量の処理（写真や動画の転送など）を行わない方が安全です。
また、パソコンのiTunesなど有線接続を利用してアップデートする場合、デバイスをコンピュータから切断しないでください。切断されると、システムが崩壊したり、データが損失したりする恐れがありますよ。