自治医科大学の大きな特徴の1つとして、高い医師国家試験合格率が挙げられます。 自治医科大学の医師国家試験合格率は、ここ9年間全国1位をキープしており、最新の2021年の国家試験では合格率100%でした。 また、留年する学生も非常に少なく、95%の学生が6年間で卒業します。