基本的にバーチャルオフィスを会社の本店にすることに問題はありません。少なくとも設立の登記申請はとおります。ただし、銀行がバーチャルオフィスを利用した法人口座開設について慎重になっている部分があります。そのため場合によってはその点につき弊害が生じる可能性があります（好みの銀行で口座開設できないかもしれません。）。