「一般口座」では自分で売却損益を計算し確定申告を行う必要があります。
「特定口座」では証券会社が「年間取引報告書」を交付しますので自分で計算をする必要はありません。また、「源泉徴収あり」を選択していれば確定申告を行う必要もありません。
詳しくは、こちらをご覧ください。