手動ペナルティと自動ペナルティで罰の重さは異なります。
手動ペナルティ：比較的重い
自動ペナルティ：比較的軽い
自動ペナルティは検索順位が低下する程度の罰が基本です。
それに対して手動ペナルティは、検索順位が大幅に下がったり、検索結果から除外されたりするなど、比較的重い罰が与えられます。