「To make it/something happen」とは何かをすることに成功する、あるいは何かを達成する、もたらすという意味です。この文脈では、その「it」とは授業中に起きているということですね。
例：We have to finish this project in one week. Let's make it happen! （私たちはこのプロジェクトを1週間以内に終わらせなければならない。達成させよう！）
例：The politician promised electoral form. To the public's surprise, he made it happen. （その政治家は選挙形態を約束した。世間が驚いたことに、彼はそれを実現させた。）