SINEとLINE/LTRの発現パターンの違いには重要な生物学的意義があります。研究によると、SINEの発現はDNA修復経路の上昇と関連しており、これは他のRTEクラスとは異なるパターンを示しています。具体的には、SINEの発現が高いグループではDNA修復経路が活性化される一方、LINEとLTRの発現が高いグループでは炎症応答が関連付けられています。この違いは、SINEがゲノム不安定性を引き起こす可能性がある一方、LINEとLTRは炎症経路と関連していることを示唆しています。SINEは主にヒストン修飾によって調節され、DNAメチル化の影響を受けにくいとされています。このような違いが、SINEとLINE/LTRの異なる生物学的影響をもたらす可能性があります。