基本的には24時間いつでも使えますが、すべてのボックスが満杯のときは、配達人は荷物を預けることができません。「宅配ボックスに空きがないため」という理由で持ち帰ることになります。戸数の割に宅配ボックスの数が少なかったり、宅配便の利用が増えるお中元、お歳暮の時期などは特に満杯になりがち。また、「不在連絡票は確認したけれども、取り出し忘れてそのまま…」なんてケースも実はよくあるもの。長期旅行中に届いた荷物が宅配ボックスを長期間占拠したり、悪質な場合は個人のロッカーのように使う人もいるのだとか。
宅配ボックスはあくまでも「一時預かり所」。ボックスの数が限られているので、荷物を受け取らずにいると、他の居住者の迷惑になりかねません。宅配ボックスの管理者は、引き取り忘れの荷物がないか、長期保管荷物がないか、適時確認しています。あまりに空きがない日が続くときは、管理会社や管理組合に相談してみましょう。
また、コンピュータ式の場合は、停電になると電源が入らないため、カードやQRコードでの預け入れ・取り出しはできません。ただし、入庫出庫データは残っているので、電気が戻り次第自動復旧し、すぐに通常利用できるようになります。停電中にどうしても荷物を取り出したい場合は、特殊カギを使って手動で解錠してもらうことも可能です。