Sox9以外の転写因子も角膜上皮の恒常性維持に重要な役割を果たしています。例えば、Klf4、Fos、Hif、Jun、Junb、Klf3などが挙げられます。これらの転写因子は、LSCからTACへの移行時に発現が上昇し、非対称分裂や終末分化に関与しています。特に、Notchシグナル伝達経路は、角膜上皮の細胞運命を調節する重要な役割を果たしており、Notch1の欠損は角膜上皮の細胞運命の変化につながることが知られています。