インターフェロンの効果は、感染しているC型肝炎ウイルスの遺伝子型とウイルス量によって決まります。 最近では、抗ウイルス薬のリバビリンとペグインターフェロンの併用で、インターフェロンが効きにくく、C型肝炎ウイルスの排除が困難な場合においても、治療効果を上げています。