階層トピックモデリングは、EHRデータ内の複雑な疾患カテゴリーの解釈を向上させることができます。典型的なトピックモデルでは、単一レベルのトピック構造しか扱うことができませんが、階層トピックモデリングを導入することで、異なるレベルの抽象度や関連性を持つ複数のトピック間の関係性を捉えることが可能です。これにより、特定の病気や症状だけでなく、それらがどのように組み合わさって複雑な疾患カテゴリーを形成しているかを理解しやすくなります。例えば、ある高次元のトピック（例：心臓血管系）にはさらに細分化されたサブトピック（例：不整脈）が含まれており、これらサブカテゴリー間の相互作用や影響関係も明確化されます。