主な違いは2つあります。
1点目はプライベートトピック機能の有無です。プロプランはサポートフォーラムにプライベートトピックをたてることができます。スタンダードプランは公開トピックしかたてることができません。クライアントさまのサイト制作に Snow Monkey を使う場合などに情報を公開することができない場合はプライベートトピックを使うことをおすすめします。
2点目はダウンロードできるファイルです。スタンダードプランは snow-monkey.zip と my-snow-monkey.zip がダウンロードできます。プロプランはそれに加えてすべての有料アドオンもダウンロード可能です。有料アドオンを複数利用したい場合はプロプランのほうがお得になるかもしれません。