最初に問診が行われ、続いて内診で子宮や卵巣の痛みや可動性を診ます。また、超音波検査で子宮や卵巣が大きくなっていないかを診ます。
大きくなっている場合は、MRIで悪性腫瘍の可能性や手術の必要性の確認が必要です。さらに血液検査を行って、腫瘍マーカーの値を診ます。子宮内膜症とチョコレート嚢胞では、腫瘍マーカーによって、CA19-9やCA125の値が高く出る場合があります。