深夜電力が安い理由は、単純に「夜間は電気を使う人が少ないから」です。
電力会社は、日中も夜間もほぼ変わらない量の電気を発電しています。使用量の多い日中に合わせた発電量となっていることもあり、当然夜間は電力が余ってしまうのです。
使われなかった電気は捨てることになってしまうため「単価の安い『夜間プラン』として提供することで少しでも無駄を減らそうとしている」ということになります。