国税関係帳簿書類の電子データを改ざんしたり、正しい方法でデータを保存していなかったりした場合、罰則を受ける可能性があります。例として、青色申告の承認取り消し、重加算税の課税、会社法による過料などが挙げられます。税金の控除が適用されなくなったり、税金の割り増しや過料を支払ったりと、金銭的なペナルティを与えられるのがデメリットです。また、企業の信頼性にも関わる問題であることから、違反は避けなければなりません。