コンジローマに感染したからといって、不妊の明らかな原因になることはありません。
ただし分娩までに治っていないと、経膣分娩をする際に、コンジローマの原因ウイルス（ヒト乳頭腫ウイルス）が赤ちゃんに感染し、コンジローマ咽頭腫（のどにできるイボ）などができてしまうことがあります。しかし、分娩までに治してしまえば、まず大丈夫です。
ただし、子宮頸がんには関係するウイルスなので、子宮頸がん検診は定期的に受診したほうがよいでしょう。