Le anomalie o difetti che si possono trovare negli spermatozoi sono le seguenti:
Difetti nella testa troppo piccola, troppo grande, due teste, a forma di palloncino, con grandi vacuoli....
Difetti nella parte centrale troppo sottile, troppo spesso, troppo corto, troppo lungo, spostato su un lato, senza collo...
Difetti nella coda troppo corta, troppo lunga, due code, arricciata, spaccata...
Nello stesso spermatozoo, ci può essere un'anomalia in una sola delle parti o una combinazione di alterazioni nella testa, nel collo e nella coda.
In ogni caso, se c'è solo un'alterazione nella morfologia, lo spermatozoo è considerato anormale.