Il costo di un e-commerce dipende da molti fattori. Ad esempio dalla piattaforma utilizzata, dalla quantità di prodotti inseriti, dalla complessità del design e della grafica. Se vanno inserite funzionalità aggiuntive spesso e necessario prevedere un costo annuo o mensile. Un altro fattore importante sono le caratteristiche del server che ospiterà il negozio on line. Questo dipende dal traffico che riceverà il server, dalle dimensioni del database e dal numero di immagini o video. Atlas Technologies propone siti web e-commerce a partire da 700€ (spese di hosting escluse).