Un'infezione delle vie urinarie è considerata complicata se il paziente è un bambino, una donna incinta, o presenta:
un'anomalia strutturale o funzionale del tratto urinario e un'ostruzione al flusso urinario;
recente chirurgia o esami invasivi a carico del tratto urinario
una malattia cronica (o altra condizione di rischio) che aumenta la probabilità di contrarre l'infezione e/o resistere al trattamento, come ad esempio
diabete scarsamente controllato,
malattia renale cronica,
o sistema immunitario compromesso.