L'alternativa principale all'uso della DGP è la diagnosi prenatale, che, per avere un effetto veramente preventivo, è necessariamente legata al prendere decisioni sull'aborto dei feti affetti.
Un'altra opzione consiste nel cambiare i gameti (ovuli o sperma) di uno o di entrambi i membri della coppia a rischio genetico.
Infine, e anche se oggi non è più necessario per la stragrande maggioranza dei casi, evitare di avere figli sarebbe una terza alternativa.