Poiché l'endometrio si sviluppa in risposta agli ormoni che agiscono durante tutto il ciclo mestruale, estrogeni e progesterone, ha anche due fasi diverse:
Endometrio proliferativo:sta gradualmente aumentando di spessore grazie all'effetto degli estrogeni.
Endometrio secretor: segreto: sperimenta una maturazione e diventa ricettivo grazie al progesterone secreto dal corpo luteo.
Con un'ecografia è possibile misurare lo spessore dell'endometrio e sapere in quale fase si trova.