Parallelamente alla carriera di attore e regista, Ben Stiller ha doppiato diversi film d’animazione. Tutto iniziò nel 2002, quando prestò la sua voce per un episodio de I Simpson. Dal 2005 al 2013 ha doppiato i lungometraggi Madagascar, Bee Movie, Madagascar 2, Megamind, Madagascar 3 – Ricercati in Europa, Le follie di Madagascar.