Almeno una volta all’anno tutti i produttori, i trasformatori e i commercianti di prodotti bio vengono sottoposti a controlli locali per verificare il rispetto delle prescrizioni. L’ente di certificazione deve effettuare controlli supplementari su almeno il 10 per cento delle aziende. Almeno il 10 per cento di tutti i controlli deve essere effettuato senza preavviso. L’ente di certificazione preleva inoltre dei campioni di residui dal 5 per cento delle aziende e li fa analizzare.