Pur essendo una soluzione molto efficace per la privacy, il routing Onion non è completamente anonimo. Le agenzie governative lavorano senza sosta per tracciare la rete e, se ti capita di connetterti a uno dei nodi controllati da loro, la tua privacy sarà compromessa. Per non parlare del fatto che i governi hanno una miriade di altre tecniche di sorveglianza che nemmeno Tor può evitare.