L'utilizzo di pantoprazolo e magaldrato acido non si accompagna a possibili interferenze con il concepimento. Al tempo stesso, pur non essendoci estesi studi clinici sull'uomo, gli studi sugli animali e la lunga ed estesa esperienza di utilizzo nell'uomo senza segnalazione di particolari malformazioni ne indicano un possibile utilizzo sicuro in corso di gravidanza. Va però ricordato che circa il 4 per cento dei neonati ha problemi di malformazione, in cui l'incidenza del fattore farmaci è sicuramente al disotto dello 0.5 per cento.