Il limoncello ha una lunga durata ma può peggiorare la sua qualità nel tempo. Se conservato correttamente in un luogo fresco e buio o nel congelatore, può durare per anni. Tuttavia, se noti cambiamenti nel colore, nell'aroma o nel gusto, è meglio scartarli. Una volta aperto, è consigliabile consumarlo entro 12 mesi.