Le fasi legate alla modalità Cross Docking sono due:
fase di accettazione degli invii, che prevede un controllo delle quantità e la verifica che la merce consegnata corrisponda a quanto indicato nel DDT;
fase di controllo della merce in entrata che verifica l'eventuale presenza di danni e la notifica al fornitore del ricevimento della merce.
Esistono altre fasi che riguardano l’uscita della merce dal magazzino:
fase di accorpamento: la merce viene accorpata in base alla destinazione;
fase di spedizione: la merce viene imballata e preparata alla spedizione;
fase di controllo: della merce in uscita sulla base dell’ordine del cliente.