Una categoria speciale di grassi sono gli acidi grassi trans. Questi contengono almeno un doppio legame nella configurazione trans, mentre la maggioranza di acidi grassi insaturi ha un doppio legame in configurazione cis.
Gli acidi grassi trans si dividono in grassi trans naturali, presenti nella carne e latte di ruminanti come conseguenza dell'azione di particolari microorganismi nel loro tratto digestivo, e grassi trans industriali, prodotti tramite il processo di idrogenazione di oli vegetali. Gli ultimi hanno caratteristiche tecnologiche favorevoli, perciò sono molto popolari nell'industria alimentare. Ma hanno anche un aspetto negativo, essendo nocivi per la tua salute. Il loro apporto è associato ad un'aumentata concentrazione di colesterolo nel sangue, che può portare ad un aumento del rischio di sviluppo di malattie cardiovascolari. Paragonati agli acidi grassi saturi, gli acidi grassi trans hanno un maggior effetto sull'incidenza di aterosclerosi.