La fimosi, nei suoi diversi gradi di intensità, può portare a diverse complicazioni. L’impossibilità di retrarre il prepuzio impedisce la corretta pulizia del pene e durante la minzione può anche verificarsi un gonfiore sotto il prepuzio. Negli adolescenti e negli adulti la fimosi può causare dolore durante l'erezione e imoedire rapporti sessuali piacevoli. In più, forzando lo scorrimento del prepuzio, c’è il rischio di procurarsi in una parafimosi. Coloro che hanno una fimosi sono a maggior rischio di incorrere in una infiammazione del glande, nota come balanite, e altre complicazioni del pene.