La sua principale limitazione è chiaramente che è incompatibile con molti materiali. La sterilizzazione a vapore danneggia la maggior parte dei polimeri. Può anche causare la corrosione di alcuni dispositivi metallici, in particolare gli acciai ad alto tenore di carbonio utilizzati per gli strumenti chirurgici e dentali, e causare l’opacizzazione dei taglienti non protetti.