Le commissioni nel yield farming sono solitamente guadagnate dagli utenti che forniscono liquidità a un certo protocollo o piattaforma. Quando gli utenti fanno trading o effettuano transazioni utilizzando quella liquidità, pagano una commissione. Queste commissioni vengono poi distribuite tra tutti coloro che hanno fornito liquidità, in proporzione alla quantità e al tempo per cui hanno fornito tale liquidità. Tuttavia, le strutture delle commissioni possono variare a seconda della piattaforma e del protocollo.