Il prefiltro è una maglia grossa il cui compito principale è quello di filtrare le particelle più grandi dall'aria. Se manca il prefiltro, gli altri processi del filtro possono essere disturbati da particelle troppo grandi ed eventualmente intasarsi. In particolare, la longevità del filtro HEPA-13 è protetta. Queste particelle più grandi nell'aria includono polvere, capelli e polline di fiori più grandi.