Peter ascolta di nascosto, attraverso la finestra aperta, le fiabe che la signora Mary Darling racconta ai figli per farli addormentare. Una notte, però, Peter, nel tentativo di fuggire senza esser scorto, perde la sua ombra. Tornato a casa Darling per recuperarla, non riesce ad impedire il risveglio della figlia più grande, Wendy. La bambina aiuta, così, Peter a riattaccarsi l’ombra. Venuto a sapere che Wendy conosce un sacco di “storie della buona notte” la invita all’isola che non c’è per far da madre adottiva ai bambini della sua banda, i Bambini Perduti. “Sono bambini che cadono dalla carrozzina mentre la governante sta guardando dall’altra parte. Se nessuno viene a reclamarli entro sette giorni, vengono mandati lontano, nell’isola che non c’è”. Wendy acconsente e, così, assieme ai fratellini John e Michael, parte con Peter alla volta dell’isola. Il viaggio dura diversi giorni. Arrivati sull’isola che non c’è Wendy, per colpa della gelosia che Campanellino provava nei suoi confronti, viene colpita al cuore da uno dei Bambini Perduti che la scambia per un uccello. Wendy si salva solamente grazie al bottone a forma di ghianda regalatole da Peter. Campanellino viene, quindi, esiliata per una settimana e, in attesa che Wendy riprenda le forze, Peter e la sua banda iniziano a costruire intorno a lei una casetta dove possa stare a suo agio, mentre i suoi due fratellini divengono presto parte dei Bambini Perduti. Numerose sono le avventure vissute dai protagonisti, per esempio nella laguna dell’isola Peter e i suoi amici salvano Giglio Tigrato, figlia di un capo indiano, e vengono coinvolti in una battaglia con i pirati, fra cui Capitan Uncino. Peter viene gravemente ferito sopra ad una roccia mentre la marea sta salendo, ma per fortuna un uccello gli permette di usare il proprio nido come fosse una barca e così si salva. Mentre ci si prepara ad un prossimo imminente attacco dei pirati Wendy chiede a Peter che tipo di sentimenti egli provi nei suoi confronti, e questi le assicura ch’egli è come un suo figlio affezionato. Un giorno, mentre sta raccontando ai bambini delle storie, a Wendy tornano in mente i genitori e decide così di portar indietro i fratellini e tornare in Inghilterra ma, all’insaputa di Peter, Wendy e i fratelli vengono catturati da Uncino. Il perfido pirata cerca anche di far avvelenare Peter, mentre il bambino è addormentato; quando si risveglia apprende da Campanellino che Wendy è stata rapita. Per salvare l’amico la fata beve al suo posto il veleno rischiando, così, di morire per sempre: solo grazie alla fede dei bambini nelle fate riesce a salvarsi. Peter si dirige veloce verso la nave pirata e lungo il cammino incontra il coccodrillo che s’è mangiato la mano di uncino e una sveglia; salito sulla nave Peter finge di ticchettare come il coccodrillo, terrorizzando così Uncino. Mentre i pirati si lanciano alla vana ricerca dell’animale Peter riesce ad intrufolarsi nella cabina in cui sono tenuti prigionieri i suoi amici e li libera. La battaglia finale contro Uncino è presto vinta e il pirata finisce nelle fauci del coccodrillo. Alla fine Wendy decide che il suo posto è a casa assieme alla propria famiglia; Peter, nel tentativo vano di fermarla, la precede e chiude la finestra della sua cameretta così da farle credere che la madre l’abbia dimenticata. Ma non sapendo utilizzare la porta per uscire dalla stanza, è costretto a riaprire la finestra per volare via. I Bambini Perduti verranno adottati dai Darling, mentre Peter tornerà all’isola che non c’è, nel timore di dover diventar adulto. Prima d’andarsene, però, Peter promette a Wendy di tornare ogni primavera a trovarla. La conclusione vede Wendy che guarda fuori dalla finestra e prega rivolta al cielo affinché Peter non la dimentichi.