L'implementazione di un nuovo software di gestione magazzino richiede un approccio fortemente strutturato per avere successo, che convenzionalmente si compone di due fasi principali: la "fase strategica", in cui l'azienda definisce e descrive in dettaglio le proprie esigenze e i propri obiettivi, costruendo così il quadro di riferimento per le soluzioni WMS e i fornitori; e la "fase di selezione", in cui le offerte dei fornitori vengono raccolte, messe a confronto con le esigenze dell'azienda e selezionate, per poi arrivare alla designazione del fornitore.
Ciò che è davvero fondamentale per un'implementazione di un software gestionale WMS di successo - e che purtroppo ancora spesso si perde di vista - è che l'azienda acquirente concentri i propri sforzi nel determinare e dettagliare le proprie esigenze di business, piuttosto che elencare le caratteristiche che il nuovo software dovrebbe avere. È responsabilità dei fornitori giudicare come tali esigenze possano essere affrontate e supportate dal punto di vista tecnologico, e quindi formulare un'offerta adeguata in termini di tecnologia.