Il muesli può essere consumato in maniere differenti e mangiato sia a colazione che durante il pomeriggio come spuntino. Il modo più classico di mangiare il muesli è quello di aggiungerlo al latte (vaccino o vegetale) o alla yogurt al naturale oppure arricchito con altri ingredienti come la frutta fresca, soprattutto banane, kiwi, mirtilli, fragole, mele e pere, o la frutta secca, in particolare uvetta, mirtilli essiccati, ribes e bacche di goji. Il muesli, inoltre, può anche essere aggiunto a frullati a base di yogurt o kefir oppure, lasciato in ammollo nel latte per una notte, può essere consumato come una sorta di porridge freddo.