Le fattrici Alpaca danno alla luce un unico cria all'anno, con una gestazione che dura approssimativamente 11-12 mesi. I parti gemellari sono estremamente rari e comporterebbero rischi sia per il piccolo che per la madre. Le Alpaca sono ovulatori indotti, il che significa che le femmine possono essere fecondate in qualsiasi periodo dell'anno. Questo è un vantaggio per gli allevatori, poiché possono programmare la data dei parti in modo più conveniente. L'accoppiamento tra Alpaca dura da 5 a 30 minuti. Il parto avviene generalmente tra le 7 del mattino e le 14 del pomeriggio. Questo orario è favorito poiché durante la notte, nelle loro terre d'origine, le temperature rigide potrebbero mettere a rischio la sopravvivenza dei cuccioli per il freddo. Alla nascita, il cucciolo (cria) pesa tra i 6 e i 9 kg e riesce a stare in piedi da solo dopo un paio di ore. Dopo circa tre ore, prende il suo primo latte, e sarà allattato dalla madre per i successivi 6 mesi. Nelle prime 18 ore dalla nascita, il cria riceve il colostro attraverso il latte materno. Questo colostro è essenziale poiché fornisce al piccolo gli anticorpi necessari per combattere le infezioni. Le nascite delle Alpaca sono generalmente semplici e senza problemi. Le complicazioni sono rare. Il parto solitamente dura trenta minuti, ma in alcuni casi può protrarsi per alcune ore. Dopo la nascita, il cordone ombelicale del cria viene disinfettato. Circa quindici giorni dopo il parto, le femmine, che trascorrono gran parte della loro vita in gravidanza, sono pronte per accoppiarsi nuovamente. Per verificare in modo naturale se la femmina è effettivamente gravida, viene presentato il maschio e, se la femmina rifiuta l'accoppiamento (ad esempio sputando al maschio), si conferma che l'accoppiamento sia avvenuto con successo. In alternativa, è possibile utilizzare l'ecografia o analisi del sangue della femmina per rilevare la presenza dell'ormone della gravidanza, il progesterone.