Tutti i modelli dell’ultima Fabia dispongono della frenata automatica di emergenza Front Assist di Skoda, che interviene se non si reagisce a un incidente imminente. Sono presenti sei airbag e due punti di fissaggio Isofix per seggiolini per bambini nella parte posteriore. Altri nuovi sistemi di sicurezza sono disponibili sulla Fabia aggiornata, ma a pagamento.