L'endometriosi può manifestarsi in diversi punti, come nelle ovaie, nelle tube di Falloppio, dietro l'utero, nei legamenti uterini, nella cavità pelvica e, più raramente, in aree come la vescica o i polmoni.
A seconda di dove si sviluppa il tessuto endometriale, lo distinguiamo:
Endometriosi ovarica
Endometriosi tubarica o Fallopica
Endometriosi pelvica
Endometriosi rettale
Endometriosi intestinale
Endometriosi peritoneale