Le aziende che producono prodotti Gemma sono controllate almeno una volta all'anno per verificare il rispetto delle prescrizioni Bio Suisse. I controlli bio sono eseguiti da enti di controllo rispettivamente di certificazione accreditati, riconosciuti dalla Confederazione. Se tutti i requisiti sono adempiuti, l'ente di certificazione rilascia il certificato per prodotti biologici. La Gemma può essere impiegata unicamente in presenza di un contratto di licenza Gemma stipulato con Bio Suisse. Per i prodotti bio di licenziatari Bio Suisse, oltre al certificato per prodotti biologici viene rilasciato un certificato Gemma.