L'aerazione fornisce ossigeno ai batteri che si generano naturalmente nelle acque reflue. Ciò consente loro di moltiplicarsi e digerire in modo efficiente i contaminanti disciolti. Le acque reflue sono un ambiente anaerobico, pertanto con l'esaurimento dell'ossigeno i batteri smetterebbero di agire. Reintroducendo l'aria con una soffiante o un compressore, i batteri possono non solo continuare ad agire come prima, ma addirittura moltiplicarsi e divenire più efficienti.