Per quanto riguarda il prezzo, i fermenti lattici non sono eccessivamente costosi: ad incidere sul costo sono solitamente la composizione e la loro forma farmaceutica che va poi a determinare la quantità di fermenti presenti nella confezione.
Le formulazioni liquide sono solitamente vendute in confezioni meno capienti e hanno quindi un costo più basso (circa 10 €), mentre le formulazioni in capsule offrono confezioni più grandi e hanno un costo maggiore (tra i 20 e i 30 €).