In generale, l'ecografia transvaginale non è dolorosa, ma alcune pazienti possono avvertire un leggero fastidio durante l'inserimento della sonda. Questo varia da persona a persona e dipende dalla sensibilità individuale e dal livello di rilassamento. Il medico esegue la procedura con delicatezza, e le pazienti sono incoraggiate a segnalare qualsiasi disagio in modo che l’esame possa essere adeguato alle loro esigenze.