Test in vitro hanno dimostrato che gli estratti di scalogno, così come gli estratti di aglio e cipolla, mostrano proprietà antibatteriche contro funghi e batteri. I ricercatori hanno scoperto un particolare peptide negli scalogni che si pensa abbia un ruolo nelle loro proprietà antimicotiche. Altre proteine o peptidi nello scalogno potrebbero avere un ruolo, ma questo deve ancora essere dimostrato. Inoltre, è necessario condurre ricerche sull'uomo prima di poter concludere che l'assunzione di scalogno ha un impatto antibatterico.