Oltre a tutti i vantaggi di Skrill, ci sono anche alcuni svantaggi di cui essere consapevoli. Lo svantaggio principale è che non ci sono costi aggiuntivi se qualcuno ritira le proprie vincite sul proprio conto Skrill, ma se qualcuno vuole trasferire denaro da Skrill al proprio conto bancario, il fornitore di servizi addebita già una commissione piuttosto elevata. Questo costo di transazione è così alto rispetto ad altri metodi di pagamento che deve essere preso in considerazione prima di scegliere Skrill come metodo di pagamento preferito in un casinò online.