Essendo una sostanza prodotta naturalmente nel corpo, il coenzima Q10 è generalmente ben tollerato. Con dosi fino a 100 milligrammi al giorno, di solito non ci sono effetti collaterali.
Se si verifica un sovradosaggio e non è presente la necessità aggiuntiva dovuta a malattie esistenti, come già detto, non si possono escludere i seguenti effetti collaterali
Mal di testa
Vertigini
Insonnia
Nausea
Eruzione cutanea
Dolore addominale