Il direttore è il custode e l’interprete dell’identità e della missione del museo, nel rispetto degli indirizzi dell'amministrazione responsabile. È responsabile della gestione del museo nel suo complesso, nonché dell’attuazione e dello sviluppo del suo progetto culturale e scientifico. È il responsabile ultimo dell’insieme dei processi gestionali, è garante dell’attività del museo nei confronti dell’amministrazione della comunità scientifica e dei cittadini.