Diversi fattori contribuiscono alla determinazione del prezzo degli ETF e incidono sui costi dei singoli ETF. Il costo totale dell’investimento in un ETF dipende in larga misura dalla strategia di portafoglio scelta e dall’asset class in cui investe il fondo. Gli ETF applicano commissioni inferiori rispetto ai tradizionali fondi comuni, tuttavia presentano un'ampia varietà di condizioni di prezzo diverse. Gli spread degli ETF variano anche in relazione all'attività degli ETF.