Í júlí og ágúst er heitast hjá ferðalöngum sem njóta þess sem Myvatn hefur upp á að bjóða, en þessa mánuði fer meðalhitinn í 7°C. Janúar og desember eru svölustu mánuðir ársins, en þá fer meðalhitinn í -6°C. Að jafnaði rignir mest á svæðinu í október og desember.