Mekanisme autentikasi memastikan bahwa pesan yang disimpan di dalam antrean pesan Amazon SQS diamankan dari akses yang tidak terotorisasi. Anda dapat mengontrol orang yang dapat mengirimkan pesan ke antrean pesan dan orang yang dapat menerima pesan dari antrean pesan. Untuk keamanan tambahan, Anda dapat membuat aplikasi Anda agar mengenkripsi pesan sebelum ditempatkan dalam antrean pesan.
Amazon SQS memiliki sistem izin berbasis sumber daya tersendiri yang menggunakan kebijakan yang ditulis dalam bahasa yang sama dengan kebijakan AWS Identity and Access Management (IAM): contohnya, Anda dapat menggunakan variabel, sama seperti kebijakan IAM. Untuk informasi selengkapnya, lihat Contoh Kebijakan Amazon SQS di Panduan Developer Amazon SQS.
Amazon SQS mendukung protokol HTTP over SSL (HTTPS) dan Transport Layer Security (TLS). Kebanyakan klien secara otomatis dapat berunding untuk menggunakan versi terbaru TLS tanpa perubahan kode atau konfigurasi apa pun. Amazon SQS mendukung versi 1.0, 1.1, dan 1.2 dari protokol Transport Layer Security (TLS) di semua wilayah.