Tidak ada biaya tambahan yang harus dibayar oleh wajib pajak saat menggunakan e billing. E billing merupakan layanan gratis yang disediakan oleh DJP untuk memudahkan wajib pajak dalam melakukan pembayaran pajak. Namun, wajib pajak harus memperhatikan biaya administrasi yang mungkin dikenakan oleh bank persepsi atau kanal pembayaran lainnya saat melakukan transaksi pembayaran pajak.