Obat pencahar dapat memberikan efek samping selama mengkonsumsinya dalam jangka pendek ataupun panjang. Namun sampai saat ini, tidak ada bukti risiko spesifik yang dapat mengganggu kesehatan usus. Berdasarkan pengalaman obat pencahar stimulan dianggap aman untuk penggunaan jangka panjang, namun harus mengikuti dosis petunjuk dan anjuran dari dokter. Sebab penggunaan obat yang terlalu lama dapat menimbulkan efek seperti diare, kram perut, dan kehilangan cairan tubuh. Penyalahgunaan obat pencahar secara kronis akan membuat kerusakan ginjal dan kelemahan otot tubuh.