Misoprostol tidak terdeteksi dalam plasma darah, bahkan 5 menit setelah digunakan. Misoprostol memiliki waktu paruh 20-40 menit. Ini berarti bahwa setelah 20-40 menit zat tersebut telah kehilangan setengah dari aktivitas farmakologisnya. Dokter tidak dapat membedakan antara gejala aborsi medis dan keguguran.
Misoprostol dengan cepat dimetabolisme menjadi asam misoprostol yang dapat dideteksi menggunakan uji 'Assay'. Assay adalah prosedur pengetesan untuk mengukur keberadaan atau jumlah suatu zat dalam sampel. Tes ini sangat rumit dan hanya tersedia di fasilitas layanan kesehatan yang canggih. Tidak semua rumah sakit memiliki fasilitas tersebut.