BPJS Ketenagakerjaan adalah program jaminan sosial untuk pekerja, sementara BPJS Kesehatan memberikan jaminan kesehatan untuk seluruh masyarakat Indonesia.
Keduanya sama-sama bagian dari program BPJS yang bertanggung jawab kepada presiden. Perbedaan BPJS Kesehatan dan BPJS Ketenagakerjaan paling terlihat dari segi manfaat yang diberikan.