Pelanggaran HAM berat di Indonesia belum banyak yang bisa diselesaikan oleh adanya beberapa kendala, antara lain: a. Kurangnya usaha pemerintah untuk menyelesaikan segala kasus pelanggaran HAM secara tuntas b. Pelaku kejahatan HAM berat yang masih berkuasa sehingga masih memiliki pengaruh dan posisi strategis. c. Belum adanya mekanisme hukum yang baik serta mandiri untuk mengadili pelaku pelanggaran HAM berat. d. Masyarakat takut untuk bersaksi serta memberikan dukungan bagi para korban pelanggaran HAM berat.