Pucuk merah bisa ditanam dengan biji, tetapi prosesnya lebih lama dan sulit daripada dengan stek. Biji pucuk merah berasal dari buah pucuk merah yang sudah matang dan berwarna hitam. Biji pucuk merah harus direndam dalam air hangat selama 24 jam agar kulitnya lunak dan mudah dikupas. Setelah dikupas, biji pucuk merah bisa ditanam di media tanam yang sama dengan stek. Biji pucuk merah biasanya akan berkecambah dalam waktu 2-3 bulan.