Laboratorium di Fakultas Peternakan Unsoed berfungsi untuk membantu penyelenggaraan kegiatan praktikum dan penelitian bagi dosen dan mahasiswa. Fakultas Peternakan memiliki 12 laboratorium yang terdiri atas : Laboratorium Produksi Ternak Unggas Laboratorium ini berada di lantai 1 sisi selatan gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Produksi Ternak. Fasilitas dalam laboratorium mendukung pelaksanaan praktikum dan penelitian yang berfokus pada ternak unggas. Laboratorium Produksi Ternak Potong Terletak pada lantai 2 sisi utara gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Produksi Ternak. Fasilitas dalam laboratorium ini dapat digunakan untuk kegiatan praktikum dan penelitian dengan objek ternak yang mampu menghasilkan produk dominan Laboratorium Produksi Ternak Perah Terletak pada lantai 2 sisi timur gedung fakultas serta menjadi subkoordinasi Bagian Nutrisi dan Makanan Ternak. Fasilitas yang dapat digunakan dalam kegiatan praktikum dan penelitian uji mutu susu serta tata laksana pemeliharaan ternak perah. Laboratorium Ilmu Nutrisi dan Makanan Ternak Terletak pada lantai 1 sisi timur gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Nutrisi dan Makanan Ternak, beberapa peralatan laboratorium yang tersedia dapat mendukung kegiatan praktikum, penelitian dan pengujian kualitas bahan pakan serta evaluasi kecernaannya. Laboratorium Ilmu Bahan Makanan Ternak Terletak pada lantai 2 sisi selatan gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Bagian Nutrisi dan Makanan Ternak, laboratorium ini memiliki peralatan yang mendukung pelaksanaan praktikum, penelitian dan pengujian bahan makanan ternak termasuk uji proksimat. Laboratorium Agrostologi Terletak pada lantai 2 sisi selatan gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Bagian Nutrisi dan Makanan Ternak, dengan beberapa peralatan yang dapat mendukung pelaksanaan praktikum dan penelitian pada tanah dan tanaman untuk bahan makanan ternak. Laboratorium Ekonomi Peternakan Laboratorium ini terletak pada lantai 2 sisi selatan gedung fakultas serta menjadi subkoordinasi Bagian Sosial Ekonomi Peternakan, memiliki sarana dan prasarana pendukung pelaksanaan praktikum dan penelitian dalam lingkup ekonomi peternakan. Laboratorium Sosial Peternakan Laboratorium ini terletak pada lantai 3 sisi barat fakultas serta menjadi subkoordinasi Bagian Sosial Ekonomi Peternakan, memiliki sarana dan prasarana yang mendukung praktikum serta penelitian sosial peternakan. Laboratorium Pemuliaan Ternak Terapan Laboratorium ini terletak pada lantai 2 sisi barat gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Ilmu Peternakan, dengan sarana dan prasarana yang mendukung kegiatan praktikum dan penelitian dalam bidang pemuliaan ternak secara konvensional maupun molekuler. Laboratorium Fisiologi dan Reproduksi Ternak Terapan Laboratorium ini terletak pada lantai 3 sisi timur gedung fakultas dan menjadi subkoordinasi Bagian Ilmu Peternakan, memiliki sarana prasarana pendukung praktikum dan penelitian sel gamet, kemampuan reproduksi ternak dan teknologi reproduksi ternak. Laboratorium Kesehatan Ternak Labortorium ini terletak berdampingan dengan laboratorium Fisiologi dan Reproduksi Ternak Terapan dan menjadi subkoordinasi Bagian Ilmu Peternakan. Memiliki sarana prasarana yang memfasilitasi pelaksanaan praktikum dan penelitian kesehatan ternak, identifikasi parasit dan zoonosis. Laboratorium Teknologi Hasil Ternak Terletak pada lantai 2 timur dan bersebelahan dengan laboratorium Produksi Ternak Perah serta menjadi subkoordinasi Bagian Ilmu Peternakan. Laboratorium ini memiliki sarana prasarana praktikum pengujian uji mutu dan pengolahan produk ternak serta hasil olahannya.