Berdasarkan visi pengelolaan TNTC maka ditetapkan tujuan pengelolaan TNTC pada periode 2018 – 2027 adalah sebagai berikut: Menjamin kelestarian potensi potensi sumber daya alam hayati dan ekosistemnya berdasarkan kearifan lokal masyarakat setempat. Meningkatkan nilai manfaat potensi sumber daya alam hayati dan ekosistemnya dalam rangka meningkatkan kesejahteraan masyarakat di dalam dan sekitar kawasan TNTC melalui penelitian, ilmu pengetahuan, pendidikan dan menunjang budidaya, pariwisata dan rekreasi.