Pengolahan tersier diperlukan untuk menghilangkan kontaminan yang tersisa setelah pengolahan sekunder dan menghasilkan air limbah yang lebih bersih dan aman. Tahap ini melibatkan proses tambahan seperti filtrasi lanjutan, penjernihan kimia, atau pemisahan menggunakan proses biologis untuk menghilangkan zat-zat yang masih ada dalam air limbah.