Sistem e-faktur tersebut telah mengalami perubahan sebanyak 3 kali yakni yang pertama pada tahun 2020 dengan versi 3.0, menyusul pembaruan selanjutnya pada tahun 2022 dengan versi 3.1, dan pembaruan terakhir pada awal kuartal kedua tahun 2022 yaitu versi 3.2.