Setiap bank memiliki kebijakannya masing-masing terkait biaya transfer antar bank. Ada yang membebaskan biaya transfer antar bank apabila memiliki saldo rata-rata per bulan sekian rupiah. Namun, umumnya biaya transfer antar bank adalah sebesar Rp6.500 atau Rp2.500 bila menggunakan layanan BI Fast.