A helyben történő tárolás biztonságosabb, viszont hátrányai is akadnak. Amikor szeretnénk a jelszavainkat szinkronizálni helyben, az adataink bizonyosan soha nem fogják elhagyni a számítógépünket — azonban így nehéz (vagy legalábbis kellemetlen) feladat a jelszavak szinkronizálása minden számítógépünk és más eszközeink között. A top márkák, mint például a 1Password felkínálják a választási lehetőséget a felhasználók számára, hogy a jelszavakat helyben vagy a cég szerverein tárolják-e.
Ezzel szemben a felhő alapú jelszókezelő programok esetében, mint például a Dashlane, nagyon biztonságos szervereket üzemeltetnek abból a célból, hogy a titkosított felhasználói adatokat eltárolják (az adatok titkosítása katonai szintű titkosítási módszerrel történik, melyet soha nem törtek még fel). Mivel így a felhasználói adatok elérhetők online, ezek a jelszókezelő programok automatikusan szinkronizálják a jelszavainkat. Ezután máris könnyedén és kényelmesen hozzáférhetünk a jelszószéfhez mobil és asztali számítógépes eszközeinken.