Az etanol egyedüli hatóanyagként való használatának a következő okai vannak: Az etanol 80% körüli koncentrációban hatékony a baktériumok, gombák, élesztőgombák, burkos és burok nélküli vírusok ellen, így széles körben hatásos. Más alkoholokkal ellentétben az etanol különösen kompatibilis a bőrrel. Az alkoholos kézfertőtlenítő szerek használata kíméletesebb a bőrhöz, mint a vízzel és szappannal történő kézmosás. A termékek gyakran bőrbarát formulaként is elérhetők. Az etanol 30 másodpercen belül megszárad a kézen, ezért optimálisan alkalmazható, és a munkafolyamatba integrálható. Az etanol nehezen hatol be a bőrbe, és a gőzök belélegzése sem kritikus a fertőtlenítés során. Az etanol egy természetben előforduló anyag, amelyet a szervezet képes lebontani. Az etanol azáltal hat, hogy nem specifikus módon elpusztítja a mikroorganizmusok létfontosságú fehérjemolekuláit. Az etanol nemcsak a specifikus anyagcsere-forgalmat blokkolja, amit a mikroorganizmusok esetleg megkerülhetnek. Az etanol a sejtek egészét pusztítja el, és nem létezik védekező mechanizmus ezzel szemben. Az etanol szagát általában kellemesebbnek érezzük, mint az 1- vagy 2-propanol szúrósabb szagát.