A biológiai szűrőanyagok, olyan anyagok, amelyek nagyon porózusak. Pórusaik úgy vannak kialakítva, hogy mérete ideális legyen a baktériumok számára. Ne legyen túl kicsi, hogy ne jusson be a friss víz, és ne tudjon gyorsan eltömődni, és ne legyen túl nagy, hogy ezzel csökkenjen a hasznos terület, ahol megtapadhatnak a baktériumok.
Seachem Matrix (felső kategória a felhasználói vélemények szerint)
Matrix Top (szerintem felső kategória és árban verhetetlen. Amit nem annyira szerettem benne, hogy nagyobb darabokból áll mint a Seachem Matrix, így kevesebbet tudtam a kosárba tenni.)
Eheim Substrat Pro (felső közép kategória felhasználói vélemények szerint)
Siporax (közép kategória felhasználói vélemények szerint)
Lávakő (sokan használják mert olcsó megoldás viszont nem olyan hatékony, mint a modern szűrőanyagok, nagyobb mennyiség kell belőle, továbbá porlad! A porladásnak köszönhetően, folyamatosan a szivacsokban a szűrő alján lesz egy iszap réteged, ami nem annyira jó.)