A Reader alkalmazással könnyű a PDF-ek megjegyzésekkel való ellátása. Ha telepíti a Reader alkalmazást asztali számítógépére, a következőket végezheti el vele: PDF-ek annotálása jegyzetekkel; szöveg közvetlen bevitele az oldalra; kiemelési, aláhúzási és áthúzási eszközök; valamint képernyőre rajzolás a szabadkézi rajzeszköz segítségével. Ugyanezek a megjegyzéseszközök az Acrobat Reader mobilalkalmazásban is rendelkezésre állnak.