A fő különbség a kettő között a megcélzott ügyfélkörük. A WhatsApp a szoftver fogyasztói verziója, míg a WhatsApp Business az üzleti ügyfeleket szolgálja ki. A WhatsApp Business segítségével a vállalatok igazolást kaphatnak, így az ügyfelek kényelmesen megoszthatják velük az információkat. A WhatsApp Business API segítségével WhatsApp indítót is elhelyezhet webhelyén az ügyfelekkel való könnyebb kommunikáció érdekében.