A hisztamin intolerancia oka, hogy a szervezetben kevesebb DAO enzim termelődik, ami különböző tüneteket okoz. Az előforduló okok közé tartozik a szervezetben felszabaduló nagy mennyiségű hisztamin, a szájon át bevitt hisztamin és/vagy biogén aminok jelentős fogyasztása, valamint ezek kombinációja. meghaladja az egyéni toleranciaküszöböt, akkor széles körű "mérgezési" tünetek jelentkezhetnek.
A hisztamin intolerancia további lehetséges okai közé tartoznak:
- Magas hisztamin tartalmú, vagy hisztamin-felszabadulást elősegítő élelmiszerek vagy italok fogyasztása
- DAO enzim aktivitásának gátlása
- Emésztőrendszeri betegségek
- Genetikai hajlam
- Lelki okok