AtomStack támogatja a PayPal, Visa, MasterCard, American Express, Apple Pay és Klarna kártyákat. A fizetések bármilyen pénznemben benyújthatók, de javasolják, hogy az online rendelési folyamat során használt pénznemet párosítsa a könnyebb számítás érdekében. Ezenkívül előírták, hogy csak az ellenőrzött PayPal-tagok fizethessenek a rendelésekért a PayPal rendszeren keresztül.