Kraken biztonságban van. A cég fő hangsúlya a társaság ügyfelei vagyonának és személyes adatainak védelmére irányul. A kriptoeszközök 95+%-ának hideg pénztárcában tartása minden olyan vállalatnál bevett gyakorlat, mint a Kraken, miután a kriptoipar legelején történt feltörések sorozata. A tranzakciók és az ügyfelek személyes adatainak biztonsága érdekében a hálózatról leválasztott szervereket speciális tárolóhelyeken használják fel fegyveres őrökkel, akiket folyamatosan ellenőriznek, nem csak a felvételkor.