TOC analizatori obično se upotrebljavaju za mjerenje tijekom postupka pročišćavanja vode i u određenim fazama u procesu uporabe vode. Ključne primjene uključuju one u kojima TOC analizator može biti koristan: Praćenje učinkovitosti membrane nakon povratne osmoze Praćenje vijeka trajanja i učinkovitosti smole nakon deionizacije Održavanje niskih razina organskih spojeva nakon držanja u spremnicima čiste vode nakon završnog poliranja Provjera jesu li razine organskih spojeva niske prije povrata tijekom postupaka recikliranja i ponovne uporabe Praćenje učinkovitosti UV svjetla nakon uništavanja TOC-a pri pročišćavanju vode Provjera završne kvalitete vode prije distribucijskih linija na mjestu uporabe