राष्ट्रीय जांच एजेंसी के विभिन्न क्षेत्रीय कार्यालय कोच्चि, गुवाहाटी, हैदराबाद, लखनऊ, मुंबई, कोलकाता, रायपुर, जम्मू में स्थित हैं।