जब मौसम विभाग को व्यवस्थित रूप से संचालित किया जाने लगा तो इसका मुख्यालय सबसे पहले शिमला में 1905 में स्थापित किया गया परंतु वर्ष 1928 में इसे पुणे में स्थानांतरित कर दिया गया लेकिन वर्तमान समय में या मुख्यालय नई दिल्ली में स्थित है।