जबकि अखरोट कई स्वास्थ्य लाभ प्रदान करते हैं, अत्यधिक सेवन से कुछ दुष्प्रभाव भी हो सकते हैं। अपनी उच्च कैलोरी सामग्री के कारण, अखरोट का अधिक सेवन वजन बढ़ाने में योगदान कर सकता है। इसके अतिरिक्त, यदि कुछ व्यक्तियों को नट्स खाने की आदत नहीं है, तो उन्हें पाचन संबंधी असुविधा, जैसे सूजन या गैस का अनुभव हो सकता है। अखरोट से एलर्जी वाले लोगों को एलर्जी प्रतिक्रियाओं से बचने के लिए अखरोट से पूरी तरह परहेज करना चाहिए।