अटल भूजल योजना का पहली बार प्रस्ताव प्रधानमंत्री नरेंद्र मोदी द्वारा मार्च 2018 में रखा गया था। परन्तु मंत्रिमंडल की सहमति न मिलने के कारन योजना लांच न हो सकी। डेढ़ वर्ष बाद इस योजना को प्रारम्भ किया गया।