बवासीर से प्रभावित नसों के भीतर खून का थक्का बन सकता है। यह ब्लड फ्लो में रुकावट पैदा करता है और असहनीय दर्द एवं सूजन का कारण बनता है। इसे थ्रोम्बोस्ड हेमोराइड कहते हैं।
थ्रोम्बोस्ड हेमोराइड खतरनाक नहीं होता है, लेकिन बहुत अधिक दर्दनाक होता है।