लाइसोसोम के अंदर अत्यंत शक्तिशाली पाचक रस होते है जो कोशिका के अंदर प्रवेश करने वाले विषाक्त, विजातीय पदार्थो को तो नष्ट करते ही है, कोशिका के ठीक से कार्य न करने वाले अंगको को भी नष्ट करके उसे साफ करने का कार्य करते है। कभी-कभी पूरी कोशिका ही बीमार हो जाती है और ठीक से कार्य नहीं करती, तब पूरी कोशिका को ही नष्ट करने के लिए, लाइसोसोम फट जाते हैं और एंजाइम अपनी ही कोशिकाओं को पाचित कर देत