मोबाइल भुगतान में एन्क्रिप्शन, टोकेनाइजेशन और बायोमेट्रिक प्रमाणीकरण का उपयोग किया जाता है, जिससे वे पारंपरिक भुगतान विधियों की तुलना में बहुत सुरक्षित हो जाते हैं।