24 दिसंबर 2014 को मदन मोहन मालवीय को भारत के सर्वोच्च नागरिक सम्मान भारत रत्न से सम्मानित किया गया। महामना एक्सप्रेस ट्रेन (नई दिल्ली और वाराणसी के बीच चलने वाली) को 22 जनवरी 2016 को भारत के प्रधान मंत्री नरेंद्र मोदी द्वारा हरी झंडी दिखाई गई थी।