यूजीन गोल्डस्टीन के द्वारा सन 1886 में प्रोटॉन को H+ के रूप में सबसे पहले देखा गया था. लेकिन प्रोटॉन की खोज अर्नेस्ट रदरफोर्ड (1917-1920) द्वारा अपने गोल्ड फ़ॉइल प्रयोग के द्वारा किया गया था.