मुख्य अंतर Emus4U को इन्स्टाल करने और Cydia को इन्स्टाल करने में होता है। Cydia आपके आईफोन को मैलवेयर के खतरे में डाल सकता है; लेकिन Emus4U ऐसा नहीं करता है और न ही कर सकता है। जब आप Cydia इन्स्टाल करते हैं, तो एपल आपकी वारंटी को अमान्य कर सकता है; लेकिन Emus4U के साथ ऐसा नहीं होता है।