फ्लैगशिप” शब्द अर्थ है संगठन को सबसे महत्वपूर्ण बनाना और उसे प्राथमिकता देना। सरकारी योजना में फ्लैगशिप योजना उन योजनाओं को कहा जाता है, जो योजना सरकार की प्राथमिकता होती हैं। फ्लैगशिप योजनाओं में स्वास्थ्य, शिक्षा, पर्यावरण, सिंचाई, रोजगार, शहरी और ग्रामीण विकास और अन्य क्षेत्रों में या फिर सबसे महत्वपूर्ण क्षेत्रों के राष्ट्रीय मुद्दों से जुड़ी योजनाएं शामिल होती हैं।