मलेरिया के लिए हाइड्रॉक्सीक्लोरोक्विन और क्लोरोक्विन दोनों पहले अप्रूव किए गए. हालांकि, क्लोरोक्विन हाइड्रॉक्सीक्लोरोक्वाइन से कई साइड इफेक्ट पैदा करता है. इसके परिणामस्वरूप, हाइड्रोक्सीक्लोरोक्विन का इस्तेमाल आज ही किया जाता है. हाइड्रोक्सीक्लोरोक्वाइन को रूमेटॉइड आर्थराइटिस और लूपस के इलाज के लिए भी अप्रूव किया जाता है, जबकि क्लोरोक्विन नहीं है.