मनरेगा की योजना और कार्यान्वयन के लिए ग्रामीण विकास मंत्रालय द्वारा नामित या अधिकृत व्यक्ति जिम्मेदार है। मनरेगा योजना का सञ्चालन ग्राम पंचायत स्तर पर सरपंच यानि ग्राम प्रधान के देखरेख में किया जाता है। इसके लिए ग्राम पंचायत सचिव और रोजगार सहायक भी जिम्मेदार होते है।