נדרשים קודקים ספציפיים להפעלת קובצי MKV. עם זאת, לחלק מנגני הווידאו המיינסטרים, כגון Windows Media Player, אין קודק מיוחד עבור MKV, כך שהם לא יכולים להפעיל אותו כראוי.