ההבדל בין מסנני HEPA  ל-ULPA הוא ביעילות הסינון שלהם. כאשר מסנני ULPA בעלי יכולות סינון גבוהות יותר. הבדל זה נובע מצפיפות סיבי הזכוכית בנייר הסינון, ככל שהצפיפות גבוהה יותר כך יעילות הסינון טובה יותר. בגלל יעילותם היוצאת דופן, מסנני ULPA, נמצאים בשימוש בעיקר בתעשיית המיקרואלקטרוניקה, תעשיה יקרה מאוד ובה הטעות הקטנה ביותר, עולה ביוקר.