הגעה לשורשי הסיבות מסייעת רבות בטיפול ומניעת מחלות. הרפואה הפונקציונלית מכוונת לבעיות הבסיסיות הללו כדי להגביר את התוצאות הבריאותיות ולהוריד את הסיכון למחלות כרוניות.