סן דייגו ידועה בפארקים היפים ובשמורות הטבע שלה, ומציעה למבקרים ולמקומיים כאחד את ההזדמנות ליהנות מהחוץ ולהתחבר לטבע. הנה כמה פארקים ושמורות טבע מובילות בסן דייגו: פארק בלבואה: הפארק העירוני רחב הידיים הזה הוא יעד שחובה לבקר בו, הכולל מוזיאונים, גנים ושבילי הליכה. אל תחמיצו את הבניין הבוטני, את גן הידידות היפני ואת שביל קניון הדקלים. שמורת טבע מדינת טורי פינס: שמורת חוף זו היא ביתו של עץ האורן טורי הנדיר ומציעה מגוון מסלולי הליכה עם נוף מדהים לאוקיינוס. שבילים פופולריים כוללים את שביל גיא פלמינג, שביל נקודת הרייזר ואת שביל החוף. Mission Trails Regional Park: פארק גדול זה מציע למעלה מ-60 מיילים של מסלולי הליכה, רכיבה על אופניים ורכיבה על סוסים, כמו גם מרכז מבקרים ומגרש קמפינג. טפסו לפסגת הר קאולס לנוף פנורמי של העיר. אנדרטת קברילו הלאומית: ממוקם על חצי האי פוינט לומה, פארק זה כולל תערוכות היסטוריות, בריכות גאות ונופים עוצרי נשימה של מפרץ סן דייגו והאוקיינוס השקט. פארק מדברי אנזה-בורגו: רק כמה שעות מזרחית לסן דייגו, הפארק המדברי רחב הידיים הזה מושלם לטיולים רגליים, קמפינג וצפייה בכוכבים. בקר במהלך האביב כדי לראות את פריחת פרחי הבר המדברית. השמורה האקולוגית של לגונת סן אליחו: שמורת ביצות חוף זו מציעה שבילים לטיולים רגליים וצפייה בציפורים, כמו גם מרכז טבע עם תערוכות חינוכיות. שמורת קניון לוס פניאסקיטוס: שמורה גדולה זו כוללת מגוון בתי גידול, כולל יערות, שטחי עשב ואדמות ביצות. תיהנו מטיולי הליכה, רכיבה על אופניים ורכיבה על סוסים על השבילים הרבים. שמורת המחקר הלאומית של נהר טיחואנה: ממוקמת בסמוך לגבול ארה"ב-מקסיקו, שמורה זו מגנה על מגוון בתי גידול, כולל חופים, דיונות וביצות מלח. בקרו במרכז המבקרים וחקרו את השבילים לצפייה בציפורים וצפייה בחיות בר. Sunset Cliffs Natural Park: פארק החוף הזה מציע שבילי הליכה לאורך צוקים דרמטיים, עם נופים מדהימים של האוקיינוס ושקיעות יפהפיות. פארק הזיכרון של מריאן בר: ממוקם בקניון סן קלמנטה, פארק זה כולל מספר שבילי הליכה ורכיבה על אופניים דרך צמחייה צפופה ומציע מפלט שליו מהעיר. פארקים ושמורות טבע אלו מספקים הזדמנות לחקור את הנופים המגוונים של סן דייגו וליהנות מפעילויות חוצות כגון טיולים רגליים, צפרות ופיקניק.