ניתוח אף הינו ניתוח נפוץ שלא נחשב מסוכן, עם זאת קיימים בו סיכונים כמו בכל פעולה ניתוחית אחרת. אצל חלק מהמטופלים מופיעות תופעות לוואי קלות בלבד לאחר הניתוח אשר חולפות לאחר מספר ימים. אצל רוב המטופלים אין תופעות לוואי כלל.