אחסון מקומי הוא מאובטח יותר, אבל יש לו גם חסרונות. כשמסנכרנים את הסיסמאות על המכשיר בלבד, המידע נשאר אך ורק במכשיר הספציפי שמתשמשים בו, ואז גם קשה (או לפחות לא נוח) לסנכרן את הסיסמאות עם מכשירים אחרים. שירותים מובילים כמו 1Password מציעים אפשרות לבחור אם לשמור את הסיסמאות באופן מקומי או בשרתים שלהם.
מצד אחד, למנהלי סיסמאות מבוססי ענן כמו Dashlane יש שרתים מאובטחים מאוד שעליהם נשמר מידע מוצפן (בהצפנה ברמה צבאית שמעולם לא פוענחה). שמירת המידע ברשת, על הענן, מנהלי הסיסמאות האלה יסנכרנו אוטומטית את כל הסיסמאות שלכם כך שתוכלו לגשת אליהן בקלות מכל מכשירי המובייל והמחשבים שלכם.