מערכת חיסונית מולדת היא עניין גנטי. עם זאת, אין הכרח שילד יוולד עם מערכת חיסונית חלשה במידה ולאחד ההורים יש מערכת חיסונית מוחלשת.  כמו כן, המערכת החיסונית חלשה יכולה להיווצר גם מפגם במערכת החיסונית הנרכשת.