כן, יש חלופות לצנתור כלילי. בהתאם למצב הרפואי, במקרים מסוימים אפשר לבצע צנתור וירטואלי, שהוא למעשההדמיה לא פולשנית של העורקים הכליליים באמצעות CT לב.
גם לצנתור הטיפולי יש אלטרנטיבות: במצבים חמורים, כאשר המחלה הכלילית מערבת מס' עורקים כליליים וההצרויות בעורקים מורכבות, מעדיפים לעיתים להפנות את החולה לניתוח מעקפים.