טיפולי נוירופידבק לא כרוכים בתופעות לוואי שלעיתים עלולות להיות קשות יותר מהתסמינים שבהם התרופות אמורות לטפל. בניגוד לכדורים, בתום סדרת טיפולי נוירופידבק אין רגרסיה, חזרה לאחור, והתוצאות הטובות נשמרות לאורך זמן ממושך מכיוון שהמוח כבר התאמן לשמור על הפעילות התקינה.