בעצים רבים וביניהם עץ הלימון עשויים להיות מזיקים שחודרים אל תוך הפרי ולכן לא ניתן להשתמש בפרי. בנוסף המזיקים גם עשויים לגרום למחלות ואף מוות לעץ עצמו וגם להגיע מהעץ ולהתפשט לשאר הגינה וגם לבית עצמו.