עמלת ההיוון נגבית בין ההפרש של הריבית אותה חתם ההלווה ביום לקיחת ההלוואה לבין הריבית הממוצעת ביום לקיחת הלוואה לבין הריבית הממוצעת במועד הסילוק לפי הנמוך מבינהם. אם הריבית הנוכחית של ההלוואה נמוכה יותר מהריבית הממוצעת על משכנתאות הנהוגה במשק (על פי מסלול ההלוואה) ביום הפירעון המוקדם אזי לא תהיה עמלה. עמלה זו נגבית הן בעת פירעון מוקדם של ההלוואה והן בעת מחזור ההלוואה למסלול אחר.