המיקרופיגמנטציה מתאימה גם לטישטוש והסוואת צלקות שנגרמו מהשתלת שיער אך בכל מקרה מומלץ תחילה לעשות על הצלקת השתלת שיער בשיטת FUE כדי שיהיו זיפי שיער ובשלב מאוחר יותר אפשר לבצע את המיקרופיגמנטציה לטשטוש מוחלט של הצלקת.