כדי למנוע צמיחת אצות, הקפידו על איזון כימי תקין, שמירה על זרימת דם וסינון נאותים, וצחצחו ושאבו בקביעות את קירות הבריכה והרצפה. בנוסף, שימוש בקוטל אצות יכול לעזור לעכב את צמיחת האצות.