אוסטאופתיה יכולה להשפיע בעקיפין על בריאות העיכול על ידי שיפור הניידות של מבני הבטן ועמוד השדרה, ובכך לשפר את זרימת הדם ותפקוד העצבים לאיברי העיכול. עיסוי בטן עדין וטכניקות מניפולציה יכולות לעזור להקל על תסמינים כמו נפיחות, עצירות ובעיות עיכול.