חשוב לציין שישנם כמובן גם חיידקים טובים, אולם הימצאותם של חיידקים מזיקים עלולה להוביל במהרה להשפעות בריאותיות ומחלות קשות. מים מזוהמים הם מפגע תברואתי ראשון במעלה.