לפטריית מרפא ישנם שתי חלקים נפרדים: התפטיר, אשר צובר מזון ואנרגיה לייצור פטריה; הפטרייה וגוף הפירות המכיל גם את הנבגים שהפטרייה מייצרת. לכל חלק בפטרייה תפקיד והשפעה שונה על האדם. כמו כן, ישנה משמעות לאופן הצריכה והכמות של תוסף פטריות מרפא, בין אם מדובר באבקה, תמצית או קפסולה.
חלקי הפטריה מהם מפיקים תוספי בריאות הם גופי הפרי (גבעול והכיפה) והתפטיר (מיסליום, המערכת המסועפת של קורי הפטרייה שנמצאת מתחת לאדמה).
תוספי תזונה מיוצרים משילוב של מיצליום עם גוף הפרי. המיצליום או גוף הפרי מיובשים נטחנים ומהאבקה המתקבלת ממצים את החומרים הפעילים של הפטריה. הסיבה לכך היא שתוספים מגופי הפטריות מבוססים על 100 אחוז פטריות. לעיתים המיצליום המיובש נטחן עם הדגן עליו גודל המצע, תוספם אלה פחות מומלצים מאחר וכמות הפטריה אותה אנו רוצים ליטול כתוסף תזונה היא בכמות נמוכה בגלל תכולת הדגן. תוסף איכותי של פטרית מרפא מכיל רק מיצוי של הפטריה בלבד. המיצוי מכיל את הריכוז גבוה של פוליסכרידים, שהם החומרים הפעילים בפטריה.