אורך חיי פילטר HEPA נע בין 4 ל-6 שנים. על מנת לשמור על יעילות טובה לאורך זמן חשוב להתקין לפניו קדם-מסנן, ולהחליפו אחת ל-6 חודשים. כמו כן, חשוב להקפיד על שגרת בדיקות תקופתיות, אחת לחצי שנה או אחת לשנה על מנת לוודא את יעילות המסנן, ולוודא כי המסנן לא סתום. נתונים אלו יכולים להשתנות לפי תנאי העבודה של הפילטר.