טיפול נוירופידבק אינו מסוכן כלל כל עוד מדובר באיש מקצוע מיומן ומוסמך בתחום. בטיפול אין כל פעילות פולשנית ואין הכנסה או הוצאה של משהו למוח. המכשיר קורא בלבד פעילות מוחית חשמלית שמתרחשת אצל המטופל.