חומצה היאלורונית בשפתיים נחשבת לטיפול בטוח עם מיעוט של תופעות לוואי, אך בכל זאת ישנן תופעות לוואי שיש להיות מודעים אליהן. בין תופעות הלוואי האפשריות יתכנו שטפי דם קלים, תחושת כאב ואי נוחות, אדמומיות באזור המוזרק, נפיחות וגושים. תופעות לווי אלו נחשבות לתופעות קלות והן חולפות מעצמן ללא צורך בטיפול מיוחד. חלקן ייעלמו תוך מספר שעות, חלקן תוך מספר ימים. קירור האזור לאחר הטיפול יכול לסייע להפחית את תופעות הלוואי. ניתן לעשות זאת באמצעות רטיות קרות או שקיות קרח.