כן, קיימת אפשרות לערער על החלטות של המכון הרפואי או רופא התעבורה שאינן לטובת הנהג. הערעור יכול להיות מוגש בפני ועדה רפואית מיוחדת במשרד הרישוי. עורך דין בתחום יכול לייצג את הנהג ולהציג ראיות רפואיות מטעמו בהליך הערעור.