ישנם כמה הבדלים בין השיטות. תחילה בשיטת LASIK לא מסירים חלק מהקרנית אלא יוצרים באמצעות חיתוך, חלון ואז מבצעים את הטיפול. כמו כן, בשיטה זו שיפור הראייה ניכר כבר מהיום שאחרי הניתוח לעומת ה- PKR ששיפור הראייה מתרחש כשבועיים אחרי. PKR היא שיטה שמתאימה ובטוחה יותר למספרים גבוהים ולקרניות דקות.