שביל ישראל לא עובר ביהודה ושומרון, והוא קרוב לשטחים רק באיזור ערד וגם שם מדובר על איזור הליכה בטוח מאד. עד כה, לא היו מקרים בהם מטיילים בשביל נפגעו - ולהפך, רוב המטיילים מדווחים על הכנסת אורחים נפלאה בכל חלקי המסלול.