ניקוי עמוק במזגן עולה כ-₪541 בממוצע. המחיר מתייחס לניקוי של מזגן שגודלו עד 3.5 כ"ס. כאשר מדובר על ניקוי עמוק במזגנים גדולים יותר או במזגנים מיני-מרכזיים, עלות העבודה תתייקר בעד 40%. פעולת הניקוי העמוק במזגן חשובה לביצוע ויש לעשות אותה אחת לשנה לפחות. פעולה זו, מסייעת להארכת חיי המזגן, מונעת הצטברות של עובש וחיידקים וגורמת לאויר היוצא מהמזגן להיות נקי ובריא יותר עבור המשתמשים.