קיימים מספר סיכונים הקשורים לקידוחים אופקיים, לדוגמא: פגיעה בתשתיות קיימות, נזק לסביבה, תאונות עבודה. לכן חשוב לבחור בחברה מקצועית לצורך הפעולה.