במקרים בהם כתוצאה מבדיקת ניקור מותני רשלני נגרם נזק למטופל הפיצוי ייקבע לפי ראשי נזק מקובלים ובהתאם לפסיקות העבר בנושא. לדוגמא בית משפט השלום בבת ים-תל אביב קבע בעבר למטופל שסבל מזיהום עקב בדיקת ניקור מותני פיצוי של כמיליון שקלים.