כאשר מדובר במערכת מודרנית מושם דגש רב על אבטחת מידע מקסימלית, כדי למזער סיכונים ופרצות מידע. מערכות ביומטריות מתקדמות משתמשות באלגוריתמים ביומטריים הכוללים הצפנת מידע מתוחכמת כדי ליצור תבנית. התבנית שנוצרת היא רק ייצוג מתמטי של טביעת האצבע הסרוקה, כלומר אוסף של נתונים בינאריים, כך שזה כמעט בלתי אפשרי ליצור תמונה של טביעת האצבע שלכם מחדש עם הנתונים האלו. אמצעי הגנה מתקדמים אלו הופכים את אחסון הנתונים לבטוח ביותר, וגם ללא שימושי מחוץ למערכת הביומטרית.