חשוב לדעת כי במסגרת טיפול הקצעת שורשים בו מתבצע ניקוי עמוק של כיסי החניכיים ייתכן כי ייעשה שימוש בטיפול תרופתי כולל הזלפה של אנטיביוטיקה לכיסים העמוקים שמתחת לקו החניכיים כדי למגר את הזיהום החיידקי. שיננית אינה מוסמכת לתת טיפול תרופתי ולכן מוטב לבצע את הטיפול אצל פריודונט (בסיוע של שיננית) על מנת למקסם את יעילות והצלחת הטיפול.