Visio Professional 2013, ‏Visio Standard 2013 וכן Visio Plan 1 ו- Visio Plan 2 מציגים תבנית קובץ חדשה המבוססת על XML וגירסאות קודמות של Visio לא תמיד יוכלו לפתוח אותה. Visio Professional 2016 ו- Visio Standard 2016 משתמשים בפורמט הקובץ המבוסס על XML. אפשר לשמור קבצים שנוצרו בגירסאות החדשות של Visio בפורמט Visio 2003–2010 Drawing (VSD)‎, אשר גירסאות קודמות של Visio יכולות לפתוח. לשם כך, בתפריט 'קובץ', בחר 'שמור בשם'. לאחר בחירת מיקום, שנה את שמור כסוג ל- Visio 2003–2010 Drawing.