עמותה אשר מחזורה הכספי (שמגיע באמצעות תמיכה ממשלתית, תרומות, דמי חבר ומכירה של מוצרים ושירותים) עולה על 1.1 מיליון ש"ח מחוייבת למנות רואה חשבון מבקר. תפקיד רואה החשבון המבקר הוא לבדוק את תקינות הדוחות הכספיים של העמותה, ולהגיש דין וחשבון מפורט. רואה החשבון המבקר חייב להיות אדם אחר מרואה החשבון שמונה לשמש כועדת הביקורת של העמותה (במידה והעמותה מינתה רואה חשבון חיצוני במקום ועדת ביקורת פנימית).