הכיבוש הפרסי בסביבות שנת 513 לפני הספירה היווה נקודת מפנה משמעותית בהתפתחותה של דרום תרסיה. לאחר נסיגתם בשנת 479 לפני הספירה הפרסים השאירו ואקום כוח פוליטי, אותו מילאו שליטים תראקיים, שהקימו את מדינתם שלהם וטבעו מטבעות משלהם. האימפריה התראקית הגדולה ביותר הוקמה על ידי האודריסי, שהכניע חלקים גדולים מאזור התראקיה מדרום-מזרח תראקיה. לשליטיהם היו יחסים טובים עם אתונה מחד, ועם האימפריה הבוספורנית מאידך.
תצורות מדינה אלה שינו את העולם השבטי של תראקיה, אשר למרות שפע של שמות, מעט ידוע בסופו של דבר.
האימפריה התראקית התפרקה כאשר תראקיה בשנת 341 לפני הספירה. לפני הספירה הפכה למחוז מקדוני. תראקיה עמדה גם במאה ה -3 לפני הספירה. לפני הספירה לתקופה קצרה תחת שלטונם של הקלטים.