הקשיים העיקריים בהרחקת יונים באזורים אורבניים כוללים את הצורך בשמירה על סביבה נקייה ובריאה לאנשים, המניעה מהרס נכסים ושימור הסביבה הטבעית. בנוסף, ישנם מנגנונים משפטיים ורגולטוריים שעשויים להגביל את היכולת להרחיק יונים.