הטיפול גם כן משתנה בהתאם למוקד שבו התפתחה הקנדידה. בגדול הוא מבוסס על תרופות אנטי פטרייתיות הניטלות בטבליות להחדרה נרתיקית, בתכשירים למריחה על העור, בטבליות, לכסניות, תמיסות או עירוי ורידי. עם זאת, לפעמים הפתרון הוא המניעה או טיפול בשורש הבעיה שגרמה לקנדידה להופיע. ישנם מטופלים שניסו שיטות טיפול רבות מעולם הרפואה האלטרנטיבית כגון נטורפתיה, רפואה סינית ועד אבחון מדויק בגלגל העין