ההבדל המרכזי בין שני השיטות הללו של הנהלת חשבונות בירושלים הינו באופן שבו מתבצע ניהול פנקסי החשבונות. בהנהלת חשבונות חד צידית הפנקסים למעשה כוללים רק את הרישום של ההכנסות וההוצאות. בהנהלת חשבונות כפולה לצד רישום ההוצאות וההכנסות מקיימים גם רישום של אופן הביצוע של התקבולים והתשלומים.