כמו בכל ניתוח, גם בארתרוסקופיה קיימים סיכונים, אך הם נמוכים יחסית. הסיכונים האפשריים כוללים:
זיהום, דימום, קריעת כלי דם, פגיעה עצבית ותגובה להרדמה.