חתימה אלקטרונית ב-PDF היא דרך פשוטה ולעיתים לא פורמלית לחתום על מסמכים דיגיטליים, כמו הקלדת שמך או לחיצה על כפתור "אני מסכים". חתימה דיגיטלית, לעומת זאת, מאובטחת ומורכבת יותר, משתמשת בהצפנה מיוחדת כדי לוודא שמסמך לא השתנה וכדי לאשר את זהותו של החותם. שימו לב ש-PDF Extra תומך בשני סוגי החתימות.