Noturus flavipinnis est caractérisé par une couleur jaunâtre au niveau du dos et blanchâtre sur le ventre. Il est recouvert d'une zone sombre au niveau de la nuque et de taches au niveau de la nageoire dorsale et à la base de la nageoire adipeuse.
Il possède également une tache en forme de croissant au niveau de la nageoire caudale. Lesnageoires médianes sont tachetées de noir.