Les doses de vaccins sont réparties en fonction du nombre d’habitants figurant parmi les populations éligibles, suivant un principe d’égalité. En clair, la répartition est donc effectuée selon des critères démographiques et non épidémiologiques. Quand de nouveaux publics sont à leur tour concernés par la campagne vaccinale, cette répartition est adaptée en conséquence. Certaines régions pourraient bénéficier d’un effort accru lors de l’ouverture de la vaccination à tous les adultes, prévue mi-juin, en raison de leur pyramide des âges.
Deux exceptions corrigent à la marge ce grand principe général. Tout d'abord, des doses du vaccin de Moderna sont parfois livrées dans certains territoires particulièrement touchés. Enfin, un effort supplémentaire est réalisé dans certains territoires d'outre-mer confrontés à une situation délicate.