En général, la pathologie peut réapparaître dans la nouvelle cornée qui a été greffée, bien que l'incidence soit différente dans chaque type de dystrophie. Par exemple, dans la dystrophie stromale réticulaire et granulaire, il existe des cas où la cornée greffée présente à nouveau des dépôts anormaux, conduisant à la nécessité d'une seconde greffe. En revanche, dans la dystrophie stromale maculaire, cela est très rare.