Comme dans l’œuvre originale, l’arrivée d’un nouvel élève à Poudlard coïncide avec la célèbre cérémonie de répartition. Dès le début de l’aventure, le joueur est ainsi convié à un grand banquet et se retrouve au cœur de l’attention pour choisir sa future maison. Il doit répondre aux questions du Choixpeau magique pour rallier l’un des clans : Gryffondor, Poufsouffle, Serdaigle ou Serpentard. Selon le choix opéré par le joueur, la couleur de l’uniforme et la salle commune sont différentes. Les lignes de dialogues évoluent également en fonction de l’appartenance à l’une ou l’autre des maisons. Par exemple, les Gryffondor sont rivaux avec Serpentard et cette dualité se retrouve dans les rencontres entre les deux clans.