Un accélérateur d'entreprises est généralement financé par des fonds privés, des investissements de capital-risque, et parfois par des subventions publiques. Les investisseurs privés, souvent en échange de participations dans les entreprises incubées, apportent une grande partie des ressources. Les fonds publics peuvent également soutenir certaines initiatives par le biais de subventions ou d'aides.