Comme toute intervention chirurgicale, la neurochirurgie comporte des risques, notamment des infections, des saignements, des lésions nerveuses et des réactions indésirables à l'anesthésie. Cependant, grâce aux progrès des techniques chirurgicales et de la technologie, les risques associés à la neurochirurgie ont considérablement diminué au fil du temps.