L'allergie est une réponse exagérée de l'organisme face à un antigène. Cet antigène, en général une protéine, est une molécule identifiée par notre système immunitaire comme potentiellement dangereuse. Il va donc y répondre en fabriquant des anticorps, comme il le ferait en présence d'une bactérie ou d'un virus. Cependant, dans le cas d'une allergie, cet antigène qui porte le nom d'allergène, va déclencher une réaction anormalement forte du système immunitaire. Concernant le pollen, ce sont les protéines qu'il contient qui vont faire réagir le système immunitaire. Celui-ci va alors libérer de l'histamine, molécule responsable des différents symptômes de l'allergie.