La lyophilisation est la méthode la plus utilisée pour la conservation des micro-organismes, car elle paralyse leur métabolisme cellulaire, ce qui est très important lorsqu’on travaille avec des bactéries, par exemple, celles-ci étant très sensibles à la chaleur et aux changements environnementaux.
Cette méthode permet donc la survie optimale des micro-organismes sur de longues périodes de temps, sans altérer leurs caractéristiques morphologiques et biologiques.