Toute vulnérabilité dans le protocole peut compromettre l’intégrité et la disponibilité du réseau. De fait, la sécurité revêt une importance capitale. Il existe différentes menaces. Les routeurs compromis peuvent émettre des annonces de routage incorrectes, par malveillance, et entraîner la redirection du trafic vers des destinations indésirables. Les protocoles peuvent aussi être submergés de trafic lors d’une attaque par déni de service (DoS), entraînant une dégradation des performances voire une interruption totale du service. En outre, les attaquants pourraient tenter de manipuler la table de routage pour diriger le trafic vers des destinations non autorisées. Face à ces risques, les protocoles doivent être équipés de mécanismes robustes pour les contrer. Certains d’entre eux prennent en charge des mécanismes d’authentification pour s’assurer que seuls les routeurs autorisés peuvent émettre des annonces. Une autre protection est le chiffrement des communications entre les routeurs, visant à empêcher la lecture non autorisée des informations de routage. La mise en place de filtres sur les annonces peut aussi empêcher la propagation de fausses informations.