L’autorité de gestion est chargée de la gestion et de la mise en œuvre d’un programme de financement public de la RDI, en particulier de la sélection des projets cofinancés. Elle veille à la régularité des opérations, au suivi qualitatif de la mise en œuvre du programme. Il peut s’agir d’un organisme public ou privé, national, régional ou local, voire l’État membre lui-même.