À ce jour, aucun effet secondaire significatif associé à l'utilisation du Biotrohn n'a été signalé. Cependant, il est possible de vivre des crises de guérison ou des réactions d'Herxheimer lors du processus de désintoxication ou de lutte contre une infection. Ces réactions peuvent se manifester par de la fièvre, des symptômes pseudo-grippaux, des maux de tête, des douleurs musculaires ou articulaires, des maux de gorge, des malaises, des sueurs, des frissons, des nausées, une éruption cutanée, un gonflement des ganglions, une faible fièvre, un gonflement, une diarrhée ou une constipation, des palpitations, une légère augmentation de la pression artérielle, symptômes cutanés, suintement de pus ou autres symptômes, tels que le bien-être ou le bonheur. Ces réactions indiquent que les toxines, parasites, champignons, virus, bactéries ou autres agents pathogènes sont éliminés plus rapidement que le corps ne peut le gérer lui-même. La principale difficulté avec la réaction de Herxheimer est que les gens arrêtent souvent le traitement qui a provoqué la réaction. Cependant, il n'y a aucune raison de s'alarmer. Il est recommandé d'arrêter le traitement pendant 1 à 2 jours et, une fois le corps récupéré, de poursuivre les programmes qui ont provoqué la crise de guérison jusqu'à la disparition des symptômes.