Les développeurs Mega se sont concentrés sur la fourniture d'une confidentialité maximale des données à ses utilisateurs. La plateforme a été soigneusement conçue pour se conformer aux lois locales et internationales existantes grâce à ses scripts côté client. Avec les scripts côté client, toutes les informations de chaque utilisateur sont cryptées avant d'entrer sur le serveur avec l'algorithme AES. Chaque information cryptée est stockée dans deux (2) serveurs situés dans deux (2) emplacements distincts garantissant la sécurité et la sûreté de tous ses utilisateurs contre tout phishing et vol de données.