À l'âge adulte, le moustique fait partie de l'alimentation des araignées, des insectes comme les libellules, des oiseaux comme les hirondelles, des lézards, ou encore des chauve-souris. Ces dernières sont d'excellents chasseurs de moustiques : une chauve-souris peut chasser jusqu'à 600 moustiques par heure, soit 5000 par nuit ! L’installation d’un nichoir à chauve-souris permet par exemple de réinsérer l’animal en milieu urbain et de lutter activement contre le moustique sans aucune utilisation d’insecticide.
Les moustiques sont également chassés à l'état de larve. Évoluant à la surface de l'eau, ils peuvent être la proie d'invertébrés aquatiques ou de poissons larvivores.