La plus-value écologique est négociée au niveau du fournisseur/consommateur et appartient à la clientèle finale. C’est ce que stipulent les directives sur le biogaz de l’Association Suisse de l’Industrie Gazière (ASIG) et ce que garantit Energie 360°. Au niveau des pays, le bilan est établi conformément aux accords internationaux sur le climat, selon le principe dit de territorialité: les émissions évitées sont comptabilisées dans le pays où le biogaz a été produit et où le gaz naturel a été physiquement substitué. Les réductions de gaz à effet de serre générées par les importations de biogaz ne sont par conséquent pas prises en compte dans le bilan climatique suisse.