La production des aliments bios comporte en quelque sorte une prime environnementale qui s'explique par l'application obligatoire d’un cahier des normes très rigoureux, basé sur la protection de l’environnement.
Cette façon de produire génère nécessairement des coûts supplémentaires, puisque les producteurs sous régie biologique doivent relever de nombreux défis sans avoir recours aux pesticides et engrais chimiques de synthèse, lesquels sont interdits d’utilisation par les normes biologiques. Par exemple : en agriculture biologique, on remplace les herbicides de synthèse par des sarclages mécaniques et manuels et les engrais chimiques de synthèse par des composts et des engrais verts, alors qu’en élevage biologique, on remplace les stimulateurs de croissance par des périodes d'élevage plus longues.
Ces contraintes font en sorte que les prix sont généralement plus élevés, mais, en contrepartie, cette façon de produire permet d’éviter de refiler des coûts de dépollution aux générations futures.