L'origan peut être utilisé en cuisine comme une herbe aromatique pour ajouter une saveur et une fragrance à divers plats. Il peut être ajouté aux sauces, aux marinades, aux soupes, aux pizzas, aux pâtes, aux viandes, aux poissons et aux légumes. On l’emploie également en tant qu'épice séchée ou fraîchement hachée. Il est conseillé de l’ajouter en fin de cuisson. Notez que l'origan a un goût fort et piquant, il faut donc en utiliser avec parcimonie pour ne pas surcharger la saveur des plats.