On l'utilise principalement en phase de récupération sportive, mais aussi à l'entraînement (en phase d'échauffement). Différents embouts, appelés têtes de massage, massent par mouvements de torsion (à l'instar du pétrissage dans le massage manuel ou l'automassage) par vibrations/percussions comme les vibrations obtenues par le martèlement du bout des doigts du masseur-kinésithérapeute, par pressions afin de masser les plans sous-cutanés en profondeur. Il est donc important que le pistolet de massage musculaire comporte plusieurs modes de réglages de vitesse et de puissance car plus le muscle est charnu, plus la pression doit être forte.