En cuisine, vous pouvez mélanger la farine de soja avec de la farine neutre ne contenant pas de gluten. Ce mélange donne un réel goût de biscuits. De même, le plus conseillé est de toujours faire passer la farine de soja au tamis avant de l'utiliser. Vous pouvez aussi l'essayer dans vos soupes et vos sauces. C'est une farine qui profite à la réduction de la quantite de beurre et d’œufs dans les pâtisseries.