Les complications sont exceptionnelles. Les plus souvent citées sont la micro-infection au niveau d’une microgreffe et l’élargissement de la cicatrice de prélèvement.
La principale complication que les gens gardent à l’esprit est l’aspect inesthétique en « champ de poireaux » ou « cheveux de poupée ». Cet aspect ne doit plus se voir. En effet, les techniques actuelles de greffe de cheveux utilisant le procédé de greffe en unités folliculaires assurent un résultat esthétique et naturel garanti.