Les protéines végétales peuvent être moins digestibles que les protéines animales en raison de la présence de fibres et d'antinutriments. Cependant, des méthodes telles que la cuisson, le trempage, la fermentation et la germination peuvent améliorer la digestibilité. Certaines protéines végétales, comme les protéines de soja et de pois, sont hautement digestibles et comparables aux protéines animales.