La fosse toutes eaux reçoit et traite l’ensemble des eaux : eaux vannes comme eaux ménagères. Son processus de prétraitement de l’eau se déroule en trois étapes : la rétention des graisses et huiles, la collecte et la liquéfaction, le passage dans un préfiltre sur matériaux filtrant.
Les eaux usées qui s’écoulent dans la fosse toutes eaux vont d’abord être dégraissées, grâce à la paroi siphoïde. Ainsi, les graisses contenues dans les eaux de cuisines sont filtrées immédiatement, elles restent en surface, formant une écume. Ensuite, les eaux usées sont collectées dans la cuve. Les résidus et les éléments solides se liquéfient alors, formant une boue dans le fond de la fosse toutes eaux.
Les effluents liquéfiés passent alors dans un préfiltre, composé d’une cassette en polyéthylène ou de pierres de lave, également appelées « pouzzolanes ». Une fois les eaux usées passées dans le préfiltre, une canalisation les emmène jusqu’au système de traitement, champ d’épuration ou épandage.