On distingue deux grands types de maladies de la thyroïde : l'hypothyroïdie et l'hyperthyroïdie. À celles-ci, s'ajoutent les thyroïdites (inflammations de la glande thyroïde) qui peuvent être soit auto-immunes soit non auto-immunes. Chacune de ces affections possède des caractéristiques qui lui sont propres.