Le pilier II « Défis mondiaux et compétitivité industrielle européenne » répond aux priorités stratégiques de l'UE, telles que l'Accord de Paris sur le changement climatique, le Programme des Nations Unies pour le développement durable à l'horizon 2030 et les Objectifs de développement durable. Le Pilier II sera aligné sur les mesures prises dans d'autres pays et régions du monde pour obtenir un impact plus important. Il est regroupé en six groupes d'activités intégrés qui visent à créer des changements systémiques et durables pour la société et l'économie. Le Pilier II comprend six clusters :
- Santé
- Culture, créativité et société inclusive
- Sécurité civile pour la société
- Numérique, Industrie et Espace
- Climat, énergie et mobilité
- Alimentation, bioéconomie, ressources naturelles, agriculture et environnement
Le Pilier II est mis en œuvre principalement par une recherche collaborative et des projets innovants qui répondent à des défis prédéfinis et rassemblent des acteurs privés et publics, des utilisateurs finaux, des scientifiques, des technologues, des producteurs, des innovateurs, des entreprises, des éducateurs, des décideurs, des citoyens et des organisations de la société civile.
Le pilier II comprend également des missions de recherche et d'innovation et une série de partenariats avec des partenaires publics et privés.