Le maintien d’une bonne qualité de l’eau est crucial pour le succès des opérations aquacoles. Des techniques telles qu'une surveillance régulière, une filtration appropriée, une aération et un échange d'eau sont utilisées pour garantir des conditions optimales pour les organismes d'élevage. De plus, la gestion des niveaux de nutriments, de la teneur en oxygène et de la température est essentielle à la santé et à la croissance des espèces aquatiques.