Le mécanisme liant mal des transports et vomissements est encore mal connu. Selon l'une des théories expliquant ce phénomène, le cerveau "confond" mal des transports et ingestion d'une toxine, et le vomissement serait un réflexe de défense de l'organisme pour éliminer les toxines. Autre théorie avancée : le mal des transports surexcite certaines parties du cerveau, très proches de la zone responsable des vomissements. En raison de cette proximité, la surexcitation pourrait activer cette zone.