Comme toute méthode d'apprentissage, la méthode Montessori a ses limites. Par exemple, il peut être difficile pour certains parents de fournir un environnement suffisamment stimulant pour leurs enfants, ce qui peut entraîner un manque d’engagement et une perte d’intérêt. De plus, certaines activités peuvent ne pas convenir aux besoins spécifiques des enfants et peuvent ne pas aboutir aux résultats escomptés. Il est donc important que les parents prennent le temps de choisir les activités qui conviennent le mieux à leurs enfants.