Le remboursement des frais professionnels est l’un des avantages du portage salarial par rapport au statut d’auto-entrepreneur. Des frais de déplacement tels que des dépenses liées au logement, aux repas et au transport peuvent ainsi être pris en charge. Lorsque ces frais sont engagés dans le cadre d’une mission spécifique, ils sont à la charge du client. Ils doivent alors faire l’objet d’une entente préalable avec le client. Les frais dits « de fonctionnement » ne sont pas liés à une prestation en particulier. Ils sont rétribués au salarié porté par son employeur (la société de portage) lors du versement de son salaire.
Cependant, ils ne font pas partie du revenu imposable du salarié, ces montants ne sont donc soumis ni aux impôts ni aux cotisations sociales.