Le four à micro-ondes fait comme la grande majorité des moyens de cuisson d’aliments. Il détruit une partie des vitamines contenues dans ceux-ci. Le four à micro-ondes détruit également une partie des minéraux contenus dans les aliments. Cela dit, étant donné que la cuisson au four à micro-ondes est très rapide et que sa température n’atteint que très rarement les 100 °C, ce n’est pas très grave.