Les risques d'une greffe de cheveux ratée sont multiples. En effet, il est possible que les nouveaux follicules pileux ne prennent pas et donc ne poussent pas. La cicatrice peut également rester visible ou s’aggraver si la plaie n’est pas correctement soignée. Les infections cutanées peuvent aussi être fréquentes lorsque le traitement postopératoire n'est pas suivi à la lettre. Enfin, une greffe ratée pourrait entrainer une perte de cheveux supplémentaire due à un stress excessif causé par l'intervention chirurgicale.