Une partie de Commander peut se jouer entre 2 et 6 joueurs mais plus généralement à 4. Les joueurs commencent la partie avec 40 points de vie. Cependant, si un joueur reçoit 21 points de dégâts ou plus infligés par un même commandant au cours de la partie, ce joueur perd la partie. Le dernier joueur en vie ou le premier à atteindre sa condition de victoire remporte la partie.