Un microscope inversé est essentiellement similaire à un microscope composé, mis à part que les composants sont positionnés dans l’ordre inverse, d’où le nom de microscope « inversé ». Dans un microscope composé, vous pouvez vous attendre à trouver la source de lumière et le condenseur sous la platine et l’échantillon. À l’inverse, dans un microscope inversé, le condenseur et la source lumineuse sont placées au-dessus de l’échantillon.
Le positionnement de ces composants signifie qu’avec un microscope inversé, la lumière vient du dessus et l’image est ensuite visualisée par le dessous, ce qui rend ce type de microscope idéal pour la visualisation des récipients de culture, notamment les flacons en verre ou les boîtes de Pétri.