Les risques associés au microneedling sont peu nombreux et généralement bénins. Les effets secondaires les plus courants sont : des rougeurs, des gonflements et de légers saignements qui disparaissent généralement dans les 24h après la séance. Plus rarement, des infections peuvent survenir au niveau de la zone traitée. Cependant, ce risque peut être évité en faisant appel à un professionnel de santé qualifié pour réaliser ce traitement.