Oui, afin de maintenir un terrarium propre et hygiénique, le substrat doit être changé régulièrement. La fréquence dépendra du type de substrat utilisé et de l'espèce du reptile. Certains substrats peuvent nécessiter un remplacement plus fréquent à  cause de l'accumulation rapide des déjections ou de la décomposition naturelle du matériau.