Le dispositif Garantie Innovation offre une garantie de prêts à moyen ou long terme ou de crédit-bail. Cette garantie inclut les prêts personnels aux associés pour réaliser des apports en fonds propres. Le programme fixe une quotité maximale de 60% et une commission de 0,80%.
Il y a cependant une limite aux risques qu'elle couvre : toutes banques confondues, le plafond de risques est fixé à 1,5 millions € sur une même entreprise ou groupe d'entreprises.