Chaque composant des machines est conçu pour perturber le moins possible la faune et la flore environnantes des sites de travail. À titre d'exemple, le système de propulsion réduit les vibrations et peut être réglé par un système de tangage hydraulique pour les eaux peu profondes. Toutes les huiles hydrauliques utilisées dans les systèmes mécaniques sont d'origine végétale et biodégradables afin d'éviter toute contamination due à d'éventuelles fuites. En plus de participer aux opérations environnementales quotidiennes, les Amphibex sont fabriqués dans un environnement à faible émission de carbone et des arbres sont plantés chaque année pour compenser l'empreinte environnementale de leur fabrication.