Après Harran au Moyen-Orient dans le premier Dying Light, c'est autour de Villedor en Europe d'être le théâtre d'une pandémie et d'une quarantaine. Le virus original a été remplacé par une variante (sic), qui a anéanti 90 % de la population mondiale. Le reste de l'humanité vit derrière des murs et se divise en factions.