Les protocoles de recherche en ornithologie pour identifier de nouvelles maladies zoonotiques incluent la capture et l'échantillonnage d'oiseaux, l'analyse des échantillons pour détecter des agents pathogènes, le suivi de la santé des populations aviaires, et l'évaluation des risques de transmission interespèces, en collaboration avec des épidémiologistes et des vétérinaires.