La séparation de l'hydrogène dans un mélange s'effectue généralement par des techniques comme l'électrolyse, qui décompose l'eau en oxygène et hydrogène, ou des méthodes de séparation par membranes, qui filtrent l'hydrogène basé sur sa taille et ses propriétés chimiques. Les gaz peuvent aussi être séparés par cryogénie ou adsorption à pression variable (PSA).