Il est conseillé de nettoyer soigneusement la pompe après utilisation pour éviter les infections. Ceci est particulièrement important lorsque la pompe est utilisée sur différentes personnes. Vous pouvez facilement le nettoyer sous le robinet, mais un nettoyant pour jouets convient également. Si la pompe se compose de plusieurs pièces, il est judicieux de la démonter et de nettoyer toutes les pièces séparément, de sorte qu'aucune saleté ne reste entre elles.