Lorsqu'il s'agit de groupage dans un conteneur, le transitaire doit prendre en compte les différents types de marchandises qui se trouvent dans son conteneur, c'est ce qui fait sa complexité. En effet, si une marchandise en endommage une autre, il est difficile de déterminer qui en est responsable. C'est pourquoi si la marchandise est périssable et nécessite des conditions particulières par exemple, elle devra être groupée, ou avec des marchandises similaires ou encore mise dans un reefer complet FCL.