Les limitations actuelles de Microsoft 365 Archive incluent l'incapacité de gérer l'espace occupé à un niveau granulaire, l'impossibilité d'archiver les sites hub sans les désinscrire au préalable, et des restrictions sur l'affichage des données et le renommage des locataires dans les sites archivés. D'autres limitations concernent la gestion des sites SharePoint connectés à Microsoft Teams et les problèmes potentiels dans les locataires très grands ou multi-géographiques.