Il n'existe pas de réglementations spécifiques pour l'abattage dans le secteur bio (ni dans l'Ordonnance bio fédérale ni dans le Cahier des charges de Bio Suisse). Il est d'autant plus important que les exigences légales répondent aux impératifs de protection des animaux et de la médecine vétérinaire. La viande Bourgeon qui est vendue par les grands distributeurs provient de grands abattoirs. Bio Suisse et différents partenaires font contrôler les abattoirs sur échantillonnage par la PSA. Les paysans Bourgeon qui font de la vente directe font en général abattre leurs bêtes par une petite boucherie des environs. L'abattage à la ferme ou au pâturage, comme il été souvent pratiqué autrefois, n'est aujourd'hui possible qu'avec une autorisation spéciale en raison des exigences très strictes en matière d'hygiène. Articles sur l'abattage à l'abattoir ou au pâturage: https://www.bioactualites.ch/production-animale/abattage.html