L’endomètre peut être stimulé naturellement (avec la production naturelle d’oestradiol) ou artificiellement (par l’usage d’oestradiol en cachets ou patches). Dans ce second cas, l’état de l’endomètre est analysé régulièrement par des échographies, jusqu’à obtenir l’épaisseur souhaitée. Dans le cas où l’ovulation ne se produit pas, on administre aussi de la progestérone par voie vaginale ou sous-cutannée jusqu’à ce que l’endomètre soit prêt pour l’implantation embryonnaire. Si l’ovulation a lieu de forme naturelle, les ovaires produiront de la progestérone à cet effet. Que ce soit en cycle naturel ou artificiel, le nombre d’embryons qui será transféré ne change pas la marche à suivre.