La gestation n'est pas sans risques pour la jument. Certaines complications peuvent survenir, comme une torsion de l'utérus, une avortement, ou une gestation jumelle qui peut être dangereuse. Des maladies spécifiques à la gestation, comme la métrite (inflammation de l'utérus) ou la mammite (inflammation des mamelles), peuvent aussi se déclarer. D'où l'importance d'un suivi vétérinaire régulier pour anticiper et traiter ces problèmes.