La signature électronique qualifiée (SEQ) est la seule méthode reconnue par la réglementation eurtopéenne eIDAS comme équivalente à la signature manuscrite. Elle est en plus irréfutable.
Les deux méthodes qualifiées proposées sont .beID et itsme.
Il existe d’autres méthodes moins sécurisées de signatures électroniques, simples ou avancées, mais celles-ci n’offrent pas les mêmes garanties que la méthode qualifiée.
Par exemple une signature OTP (One-Time-Password)  est une méthode simple et facile, mais elle ne permet pas d’authentifier de manière sûre l’identité du signataire. Elle suffit néanmoins dans la majorité des cas où il n’y a pas de gros enjeux.
Consultez aussi le blog de itsme sur les 3 myths about Digital Signatures