Bien que la construction d'une maison container offre de nombreux avantages, elle présente aussi des défis spécifiques. Parmi ceux-ci, la préparation des conteneurs : les conteneurs d'expédition sont robustes et conçus pour résister à des conditions difficiles, ce qui peut rendre leur modification difficile. De plus, il est essentiel de traiter et de prévenir la corrosion pour garantir la durabilité de la maison. Enfin, il faut noter que toutes les entreprises de construction ne sont pas familiarisées avec ce type de projet, il peut donc être nécessaire de trouver un professionnel spécialisé dans la construction de maisons containers.