La transformation particulièrement douce implique que les entreprises de transformation de produits Bourgeon utilisent à chaque fois le procédé de transformation le plus ménageant («doux»). Les étapes de transformation inutiles (p. ex. concentrer du jus de pomme ou d'orange puis le rediluer) ne sont pas autorisées. La chaleur et la pression ne sont autorisées que dans la mesure où elles sont nécessaires pour la sécurité des produits (p. ex. interdiction de la pasteurisation haute pour le lait pasteurisé). Les additifs ne sont autorisés dans les produits Bourgeon que dans le cas où il serait impossible de les fabriquer d'une autre manière. Sur les 400 additifs et auxiliaires technologiques existants, le Bourgeon n'en autorise que 46, et seulement en fonction des produits. Les arômes artificiels et naturels sont interdits de manière générale de même que la transformation chimique, les rayonnements et les traitements aux micro-ondes. Le but de la «transformation la plus douce possible» est de préserver les qualités naturelle et l'authenticité des denrées alimentaires Bourgeon. Dans un yogourt à la fraise Bourgeon, le goût de fraise provient uniquement des fraises utilisées et de rien d'autre. Et sa couleur reflète la véritable proportion de fruits. Il est également interdit de modifier la couleur du yogourt en ajoutant des colorants - même naturels - comme p. ex. du jus de betterave rouge. Et enfin le Bourgeon et ses strictes directives pour la transformation protègent les consommateurs contre les tromperies.