En tant qu'île, il n'y a pas trente-six solutions pour rejoindre Santorin. La plus fréquente demeure le ferry : des départs se font depuis le port du Pirée à Athènes, depuis les îles voisines (ex : Milos, Ios...) et les principales îles touristiques des Cyclades (Paros, Naxos...). Deuxième solution, bien plus rapide que les ferries ou les hydroglisseurs par voie de mer, mais aussi beaucoup moins sympathique qu'une traversée, vous pouvez prendre l'avion depuis Athènes pour atterrir à l'aéroport de Santorin. Le trajet ne prend que 40 minutes. D'autres liaisons existent en saison touristique, depuis/vers la Crète ou Rhodes par exemple.