Le sucre va jouer un rôle en déréglant notre microbiote intestinal. Dans une étude, ils ont mis en évidence qu’un régime riche en sucre modifiait les proportions des bactéries intestinales. Ce dérèglement peut induire la hausse de bactéries pathogènes pour l’homme. La diversité de la flore intestinale est réduite en cas de régime riche en sucre. Cependant, la consommation d'un régime sain peut progressivement inverser ces changements [4].