Bien que Threads présente des similarités avec Twitter, il existe plusieurs différences entre les deux réseaux sociaux. Sur Threads, l’ordre des publications est entièrement contrôlé par l’algorithme, contrairement à Twitter où les utilisateurs peuvent choisir entre les messages les plus populaires et les derniers messages publiés.
Threads se distingue également par son format de discussion en fils, offrant une meilleure organisation des conversations. De plus, Threads ne comporte pas de hashtags ni de moteur de recherche, contrairement à Twitter. Enfin, Threads est en cours de développement pour être compatible avec ActivityPub, permettant une interopérabilité avec d’autres applications utilisant ce protocole.