Les eaux doivent être évacuées vers le réseau d’assainissement de la commune. Dans certains cas, il est nécessaire de demander une autorisation auprès de la commune avant l’installation d’un sanibroyeur. Également, les eaux d’un sanibroyeur doivent être traitées de la même manière que les eaux usées domestiques. C’est-à-dire, dans une fosse septique ou une station d’épuration avant d’être rejetées dans l’environnement. C’est important que le système d’évacuation des eaux du sanibroyeur soit raccordé à la fosse septique ou à la station d’épuration.