Ils servent tous les deux à réaliser l'étanchéité entre deux pièces.
Cependant, le mastic silicone est plus souple, plus élastique, est souvent brillant, mais ne se peint pas. Il est fortement recommandé pour les joints à l'extérieur, comme les joints de pare-brise. En effet, son élasticité lui permet d'adhérer durablement et ce, malgré les légères distorsions dues aux changements climatiques, ce qui lui permettra de contrer les éventuels passages de l'eau lors d'intempéries.
Le mastic acrylique possède une texture plus rigide est souvent mat, mais il peut être peint avec de la peinture pour voitures. Même s'il peut-être utilisé pour les joints d'étanchéité, sa résistance à l'humidité sur le long terme est moins bonne que son concurrent acrylique, car sa tendance à durcir le rend moins à même de contrer l'humidité ambiante.