Plusieurs facteurs peuvent causer l’échec d'un projet de certification. Il peut s’agir d’un manque de préparation ou d’une mauvaise connaissance ou interprétation des dispositifs de la norme, d’une lacune sur la communication interne concernant la démarche qualité, de l’absence d’implication de la direction, d’une politique qualité non adaptée aux besoins réels de l’entreprise ou d’une mauvaise planification du projet de certification.