La whey native n'est structurellement pas différente d'une whey traditionnelle, mais le lait utilisé est issu de bêtes de pâturage et ne subit pas d'étape de transformation chimique ou à haute température. La teneur en acides aminés essentiels est légèrement plus élevée, et sa digestibilité est aussi supérieure. La whey native et la whey "fromagère" sont assez similaires, mais elles se distinguent par leur procédé de fabrication.