La plupart des climatiseurs portables sont dotés d'un mécanisme qui permet d'évacuer l'eau excédentaire recueillie au cours du processus de refroidissement. Pour ce faire, on utilise généralement un tuyau d'évacuation qui peut être relié à une fenêtre ou à un tuyau d'évacuation situé à proximité. Certains modèles sont dotés d'un système d'auto-évaporation qui élimine la nécessité d'une vidange manuelle. Dans ce système, l'eau est évaporée et évacuée par le tuyau d'échappement. Pour éviter tout débordement et maintenir l'efficacité de l'appareil, il est essentiel de vérifier et de vider fréquemment le réservoir d'eau.