La comptabilité CSE doit constamment être conduite de manière à séparer les charges et les recettes culturelles et sociales. De la même manière, ils doivent bien distinguer les produits et les dépenses économiques et professionnelles. Les délégués désignés de l’instance représentative des salariés doivent essentiellement éviter d’opérer un croisement entre les budgets.