La microscopie de l'ADN est une technique combinant la biologie moléculaire et la microscopie qui trouve son origine dans l'étude de l'organisation de l'ADN. La méthodologie sous-jacente peut être étendue pour visualiser une variété de cibles à haute résolution tout en conservant les informations spatiales. Par rapport à l'imagerie à super-résolution, la protéomique unicellulaire avec des niveaux de multiplexage plus élevés est possible en microscopie ADN grâce à l'utilisation d'anticorps marqués par de courtes séquences d'ADN. Ces conjugués anticorps-oligonucléotides (AOC) sont utilisés pour lier des brins complémentaires en vue de leur détection.