FlowBank s'engage à assurer sa santé financière et à servir ses clients selon les normes les plus élevées. FlowBank est agréée par l'Autorité fédérale de surveillance des marchés financiers (FINMA). Tous les comptes clients sont protégés conformément à la réglementation bancaire suisse. FlowBank est également membre d'esisuisse, qui protège les liquidités de ses clients jusqu'à 100 000 CHF.