Le syngnathe zébré mesure 15 cm en moyenne et certains individus peuvent atteindre 20 cm.
Son corps est très allongé et fin, son museau mesure environ 1/5 de la taille de son corps et sa bouche est toute petite. Il est de couleur blanche et possède 20 à 30 anneaux assez larges qui sont généralement rouges, mais peuvent être noirs chez certains individus (les anneaux sont présents même sur le museau). La nageoire caudale est en forme de pagaie, elle est rouge avec les contours blancs et une zone jaunâtre est présente à sa base. Chez certains individus, il est possible d'observer une tache blanche au centre de la caudale.