Si l'infection à chlamydia est traitée à temps, il n'y a pas d'effets secondaires
Une infection à chlamydia non traitée peut se propager chez les femmes et provoquer une maladie inflammatoire pelvienne (MIP) chez les femmes et une inflammation de l'épididyme chez les hommes.
La maladie inflammatoire pelvienne peut avoir pour effet secondaire que l'ovule fécondé a du mal à passer de l'ovaire à l'utérus, ce qui empêche la femme de tomber enceinte.
Une infection à chlamydia peut déclencher le syndrome de Reiter, mais cette affection peut également survenir à la suite d'une infection intestinale. Le syndrome de Reiter est une maladie rare caractérisée par des douleurs dans une ou plusieurs articulations, qui peuvent être sensibles et gonflées, une inflammation des voies urinaires, une inflammation des yeux et une éruption sur les muqueuses et la peau. La maladie touche principalement les hommes jeunes qui ont un type de tissu particulier
Chaque année, la chlamydia rend 500 couples stériles et incapables d'avoir des enfants parce qu'ils ont eu la chlamydia. La seule façon pour ces couples d'avoir des enfants est de recourir à l'insémination artificielle.
La chlamydia provoque chaque année la grossesse extra-utérine de 300 femmes danoises.