Il semble y avoir confusion sur cette question. L'avoine certifiée Sans Gluten ou le gruau certifié peuvent être consommés par des personnes intolérantes ou cœliaques car ils ne contiennent pas de protéines de gluten. Cependant, l’avoine est souvent transformée dans les mêmes installations qui traitent les céréales contenant du gluten, comme le blé, l'orge et le seigle. Il en résulte de minuscules quantités de contamination dans l'avoine. Un autre facteur est que les fermiers qui cultivent de l'avoine cultivent souvent aussi d'autres céréales comme le blé, l'orge et le seigle dans le même champ. L'avoine peut être contaminée pendant la récolte, le chargement et le transport. Bien que le risque de contamination croisée ne soit pas suffisamment grave pour les personnes intolérantes et sensibles au gluten, cela peut entraîner de graves problèmes de santé pour ceux qui souffrent de la maladie cœliaque. Certains rapports démontrent qu'un pourcentage de personnes atteintes de la maladie cœliaque est incapable de tolérer l'avoine.