Les principales menaces qui pèsent sur les mangroves proviennent des activités humaines et des changements environnementaux.
Les activités humaines comprennent l’aquaculture, le développement côtier, l’agriculture, l’industrialisation et l’introduction d’espèces envahissantes. Parmi celles-ci, l’aquaculture, en particulier l’élevage de crevettes, constitue un danger important, représentant une part substantielle de la perte de mangrove.
Le changement climatique exacerbe ces menaces, avec l’élévation du niveau de la mer et les événements météorologiques extrêmes qui perturbent les habitats des mangroves à l’échelle mondiale. Les espèces envahissantes aggravent encore le problème en supplantant la flore et la faune indigènes.