Le gobiodon citron peut mesurer jusqu'à 6.6 cm.
La couleur du corps globale peut varier d'un individu à l'autre, du jaune au vert ou encore au noir. Il y a deux rayures parallèles bleu cyan verticales, légèrement obliques, une est haute au niveau de l'arrière de la tête et l'autre plus basse au niveau de la nageoire pectorale. Une autre paire de rayure similaire traverse l'œil. Il y a un liseré bleu le long de la base de la nageoire dorsale. Il y a une petite tache sombre à la base de la nageoire pectorale.