Un modèle en plastique se lave facilement à l’eau tiède avec un peu de savon. Cela afin d’éliminer complètement la salive restée à l’intérieur. Pour commencer, séparez toujours les 3 parties de la flûte si possible. Les mettre au lave-vaisselle peut aussi se faire. Attention toutefois à bien rincer chaque partie avant de les laisser sécher complètement. Pour la flûte en bois, utilisez un écouvillon pour atteindre l’intérieur du tube. De même pour nettoyer le bec, ou une vieille brosse à dents peut aussi faire l’affaire.