En usage interne : les fleurs de matricaire possèdent des vertus anti-inflammatoires, antiparasitaires, antioxydantes, détoxifiant, hypocholestérolémiante, anticancéreuse, antiphlogistique, anxiolytique, antiprurigineuse, carminative, spasmolytique, bactéricide, antispasmodique, antiulcéreuse.
En usage externe : la matricaire possède des propriétés antiallergiques, anti-inflammatoire et cicatrisante.
La matricaire est généralement indiquée dans le traitement des maladies usuelles : inflammation des voies respiratoires, inflammations et ulcères gastriques, maux de tête, spasmes intestinaux, grippe, crampes et ballonnements, inflammations et infections cutanées, troubles de la menstruation, dépressions nerveuses légères, cystites, anxiété, troubles du sommeil.
La matricaire permet aussi de traiter certaines pathologies comme les allergies et les rhumes des foins.