Le rejet est dû à Les mécanismes de reconnaissance immunologique détectent que le greffon cornéen transplanté n'appartient pas aux tissus de l'hôte, de la personne à qui la greffe a été effectuée. Ils ne le reconnaissent pas comme sien et initient une réaction de défense visant à éliminer ce tissu, comme s'il s'agissait d'un micro-organisme envahisseur. On sait que dans la cornée, La couche avec la plus grande charge immunologique est l'endothélium.. C'est pourquoi nous essayons de préserver l'endothélium du patient pour éviter le rejet. Dans les kératoplasties lamellaires précédentes, on essayait toujours de maintenir l'endothélium du patient, et les techniques actuelles permettent de disséquer toutes les couches, jusqu'à l'endothélium d'à peine 20 microns, et de remplacer tout le reste. Avec cette chirurgie, nous avons réussi à réduire le rejet de la greffe et que le les greffons dépassent jusqu'à 10-15 ans de survie, contre 5-10 auparavant.