La vapeur s'utilise pour des volumes plus importants, son principal intérêt est d'apporter de la chaleur, ce qui permet de saturer le local beaucoup plus rapidement. En effet, l'air chaud étant plus léger que l'air froid, le brouillard de vapeur et de produit désinfectant va rapidement monter dans l'atmosphère avant de retomber sur toutes les surfaces en contact avec l'air. Par contre, la désinfection à la vapeur augmente davantage le taux hygrométrique du local, contrairement à l'air comprimé. Pour les applications où le taux d'humidité de la salle ne doit pas dépasser certaines valeurs, on préfèrera utiliser l'air comprimé.