Debian 12 inclut de nouveaux paquets dans les domaines de la médecine et des sciences de la vie. Parmi les applications incluses, on trouve le paquet shiny-server qui facilite la création d'applications Web scientifiques utilisant R, ainsi que le support de l'intégration continue pour les paquets maintenus par l'équipe Debian Med. Les utilisateurs peuvent installer les méta-paquets nommés "med-*" pour installer les paquets maintenus par l'équipe Debian Med.