La gestion des déchets dangereux est un aspect crucial du nettoyage après un squat. Ces déchets peuvent inclure des seringues, des produits chimiques, des peintures, et d'autres substances toxiques. Il est impératif de les manipuler avec soin pour éviter tout risque de contamination ou d'accident. Les déchets dangereux doivent être collectés séparément, dans des conteneurs appropriés, et éliminés conformément à la réglementation en vigueur. Il est souvent nécessaire de faire appel à une entreprise spécialisée dans l'élimination des déchets dangereux pour garantir leur traitement et leur élimination sécurisés. Il est également important de documenter la gestion de ces déchets, en conservant des registres de leur collecte, transport, et élimination, pour assurer la traçabilité et la conformité aux normes environnementales.