Nauttiessamme kreatiinia se kertyy vähitellen lihaksiin,joiden kreatiinipitoisuus kasvaa. Kyseessä ei siis ole kreatiinin välitön vaikutus – vaikutus rakentuu päivien ja viikkojen aikana. Se varastoituu lihaksiin kreatiinifosfaattina, jota kehosi käyttää luodakseen ATP:tä, eli yleisiä energiamolekyylejä. Kehossamme on neljä energiajärjestelmää, jotka kaikki voit tuottaa ATP:tä lihaksiin: glykolyysi, betaoksidaatio, sitruunahappokierto ja fosfageenit.
Fosfageenit ovat pohjimmiltaan kreatiinia. Levossa keho käyttää mieluiten betaoksidaatiota, joka tarkoittaa rasvojen pilkkomista. Vähän treenaavat henkilöt saavat 50-80 % energiastaan rasvasta. Mitä kovemmin treenaat, sitä mieluummin kehosi käyttää sokeria energiana, ja siksi se vaivihkaa lopettaa betaoksidaation. Kun intensiteetti kasvaa vielä korkeammaksi, myös sitruunahappokierto pysähtyy, sillä se ei pysy mukana – ja jäljelle jäävät vaoin glykolyysi ja fosfageenit. Kun treenaat äärirajoille asti, fosfageenit loppuvat ensimmäisinä. RFosfageenit/kreatiini ovat osa nk. alaktis-anaerobista aineenvaihduntaa, ja anaerobinen aineenvaihdunta tapahtuu juuri ennen kuin maitohapon muodostuminen alkaa.
Kreatiinin ansiosta lihaksissasi on enemmän fosfageeneja, joiden ansiosta maitohapon tuotantoa lykätään myöhemmäksi. Siksi sinulla on muutama sekunti lisäaikaa, ennen kuin maitohapot ilmoittavat läsnäolostaan. Tämä näkyy käytännössä voimaharjoitusten aikana siten, että saat tehtyä 1-2 lisätoistoa, tai että huomaat maitohapon syntymisen myöhemmin esim. 400 metrin juoksussa.