NSX tukee salausta ja virtuaalisia yksityisverkkoja (VPN) eri verkkosegmenttien ja ulkoisten verkkojen välisten viestintäkanavien suojaamiseksi. Salaamalla verkkoliikennettä myös sisäverkon sisällä NSX varmistaa, että tiedot pysyvät suojattuina luvattomalta käytöltä tai salakuuntelulta. VPN:t luovat suojattuja yhteyksiä etäkäyttäjien, sivutoimistojen tai monipilvikäytön käyttöönottojen välille ja mahdollistavat turvallisen pääsyn verkkoresursseihin.