Vaiheohjaus on prosessi, jossa subwooferin matalataajuisten äänien ajoitusta säädetään niin, että ne ovat synkronoituja pääkaiuttimien kanssa. Vaihe 0 on suositeltavaa, jos kaiuttimet ja subwoofer on sijoitettu samaan tilaan ja samaan suuntaan, kun taas vaihe 180 on suositeltavaa, kun subwoofer on sijoitettu kaiuttimia vastapäätä ja kaiuttimiin päin.