Rajavartiolaitoksen päätehtäviä ovat raja- ja meriturvallisuus sekä sotilaallinen maapuolustus. Rajaturvallisuuden ylläpitäminen on lainvalvontaviranomaisten tehtävä ja sitä kehitetään osana EU:n yhdennettyä rajaturvallisuutta. Meriturvallisuuden ylläpitäminen perustuu Suomea sitoviin kansainvälisiin sopimuksiin. Raja- ja meriturvallisuuteen liittyvät tehtävät eivät kuulu Naton vastuulle, joten niiden järjestelyt pysyvät ennallaan.
Sotilaallinen integraatio Natoon toteutetaan Puolustusvoimien johdolla. Prosessi tulee kestämään vuosia ja se saattaa vaikuttaa myös Rajavartiolaitoksen sotilaallisen maanpuolustuksen tehtäviin. Yksityiskohtaiset vaikutukset selviävät tämän prosessin aikana.