Vaikka Skrill on monella tapaa loistava rahansiirtomenetelmä, on sillä myös omat heikkoutensa. Yksi näistä on se, että useat nettikasinot eivät myönnä bonuksia niille pelaajille, jotka toteuttavat talletukset Skrillillä. Toinen on se, että osa nettikasinoista saattaa periä lisämaksua Skrillin kautta toteutetuista rahansiirroista.