Toisiolaki ei estä harvinaissairauksien tutkimusta. Harvinaissairauksien tutkimusta varten käytän-tönä on usein ollut koota näistä pysyviä sairauskohtaisia tietokantoja. Toisiolaki ei säädä näistä tietokannoista. Jotta tällaisia tietokantoja voidaan ylläpitää, niillä tulisi kuitenkin aina olla joku säädösperusta. Nykyisin tämä perusta on kuitenkin usein puuttunut. Osittain tilannetta on saatu korjattua määrittelemällä osa näistä tietokannoista THL-lain mukaisiksi laaturekistereiksi.