Hunaja sisältää pieniä määriä siitepölyä, joka saattaa aiheuttaa reaktioita. Siitepöly on luonnollinen osa hunajaa, joten siitepölyherkkien kannattaa käyttää hunajaa pienissä määrin ja seurata mahdollisia reaktioita. Siitepölyallergikot voivat käyttää hunajaa siedätyshoitona nauttimalla sitä päivittäin kuukausia ennen kuin siitepölyä alkaa lennellä. Erittäin pahasta siitepölyallergiasta kärsivä voi kokeilla Suomalainen suodatettu hunaja 350g -hunajaamme, sillä sisältää vähemmän siitepölyä kuin muut hunajat. Siitä siitepölyä on vähennetty suodatuksen avulla.