Bubbles Shooterista on tehty monia eri versioita. Esimerkiksi Sniper ja Classic. Sniper on aikaperusteinen ja sen tavoitteena on räjäyttää kuulat mahdollisimman vähäisillä laukauksilla, kun taas Classic on niin sanotusti ajaton peli, jonka avulla voit tehdä eri strategioita ja suunnitella laukaukset omaan tahtiisi.