Palkkaan vaikuttavat myös lomat ja erilaiset poissaolot. Se milloin henkilö saa lomarahansa saattaa olla sidottuna loman pitämisajankohtaan tai sitten lomaraha maksetaan sovittuina kiinteinä ajankohtina. Poissaoloissa palkallisuus tai palkattomuus riippuu poissaolon syystä ja poissaolon kestosta. Tähän palkallisuuden tulkintaan eri palkanlaskentajärjestelmät tarjoava eritasoista automatiikkaa. Erikseen sovittaessa palkanlaskennassa saatetaan tarkastaa myös poissaoloon liittyvä todistus. Pitkistä sairauslomista tehdään yleensä Kela-hakemukset, joihin liitetään lääkärintodistus poissaolosta.