Sekä mustat seesaminsiemenet että valkoiset seesaminsiemenet sisältävät runsaasti vitamiineja, välttämättömiä tyydyttymättömiä rasvahappoja ja kivennäisaineita. Verrattuna valkoisiin, kellanruskeisiin tai ruskeisiin seesaminsiemeniin, mustat seesaminsiemenet säilyttävät ulkokuoret. Siten mustat seesamit ovat rapeampia ja niillä on vahvempi ja pähkinäisempi maku. Lisäksi kuorimattomat mustat seesaminsiemenet sisältävät hieman enemmän hyödyllisiä kasvikemikaaleja, antioksidantteja ja aminohappoproteiineja kuin kuoritut valkoiset seesaminsiemenet.