CCleaner Professional antaa käyttöön useita lisäominaisuuksia, jotka eivät sisälly ilmaisversioon. Se puhdistaa järjestelmän perusteellisemmin sekä tarjoaa useita lisäominaisuuksia, kuten automaattiset ohjelmistopäivitykset, mainosseurantaan liittyvien tiedostojen poistaminen sekä paljon muuta. Voit ostaa halutessasi myös kaikki CCleanerin tuotteet yhdessä paketissa. Se sisältää mm. eheytystyökalun sekä ohjelman tiedostojen palauttamiseksi.