Seitania voi myös pakastaa. Voit pakastaa seitanin joko taikinana tai valmiina kypsytettyinä paloina. Seitan säilyy pakkasessa hienosti, sen rakenne ja maku säilyvät ja sitä voi esimerkiksi helposti siivuttaa lastuiksi hieman kohmeisena. Seitania kannattaa tehdä suurempi määrä kerralla ja pakastaa sopivina annoksina.