Radiaalipuhallin ja aksiaalipuhallin eroavat toisistaan ilmavirran suunnan ja paineen osalta. Radiaalipuhaltimessa ilma liikkuu säteittäisesti ulospäin ja se tuottaa korkeampaa painetta, mikä sopii pölynpoistoon ja materiaalinkäsittelyyn. Aksiaalipuhaltimessa ilma liikkuu aksiaalisesti eli suoraan akselin suuntaisesti, ja se tuottaa suurempia ilmavirtoja mutta matalammalla paineella, mikä tekee siitä sopivan yleisilmanvaihtoon ja jäähdytykseen.