Omega-3-rasvahapot ovat yleisesti turvallisia ja niiden ottaminen voi olla hyödyllistä terveydelle ja terveyden ylläpitämiselle pitkällä aikavälillä. Kuten melkein minkä tahansa muunkin ravintoaineen liikasaannilla, voi myös omega-3:n liiallisella käytöllä olla haittavaikutuksia, joita voivat olla oksentelu, pahoinvointi tai veren hyytymättömyys. Ehkäistäksesi haittavaikutuksia, on hyvä keskustella lääkärin tai ravitsemusterapeutin kanssa ennen ravintolisän aloittamista.