عمل تغییر جنسیت فقط شامل جراحی‌های فیزیکی و ظاهری نمی‌باشد، این افراد از چندین ماه پیش از جراحی تا چندین ماه پس از جراحی نیاز به برنامه‌های مشاوره روانپزشکی دارند. به دلیل اینکه این جراحی یک جراحی غیرقابل برگشت می‌باشد افراد باید کاملاً نسبت به عوارض و مشکلاتی که ممکن است پس از این جراحی با آن مواجه شوند آگاه باشند.