زرشک به دلیل داشتن ماده فعال بر‌برین، می‌تواند با برخی داروها تداخل داشته باشد. از جمله این داروها می‌توان به داروهای رقیق‌کننده خون (مانند وارفارین)، برخی آنتی‌بیوتیک‌ها و داروهای دیابت اشاره کرد، زیرا بر‌برین ممکن است اثر این داروها را تقویت کرده و یا کاهش دهد. بنابراین، بهتر است قبل از مصرف زرشک همراه با داروها، با پزشک خود مشورت کنید.