عفونت‌ها در مردان و زنان ممکن است به نازایی منجر شوند. گاهی اوقات، عفونت در مجاری کلیه و ادراری می‌تواند انتقال اسپرم را مختل کند. در زنان نیز، عفونت‌های دستگاه تناسلی می‌توانند مشکلاتی به وجود آورند؛ به عنوان مثال، عفونت لوله‌های فالوپ و رحم ممکن است باعث اختلال در انتقال و جایگزینی تخمک و تخم شود. علاوه بر این، برخی از عفونت‌های منتقله جنسی می‌توانند مشکلات جدی ایجاد کرده و به نازایی منجر شوند. از جمله این عفونت‌ها می‌توان به ایدز اشاره کرد.