عمق سوزن میکرونیدلینگ به طور معمول بسته به اهداف درمانی خاص و ناحیه ای از بدن که تحت درمان قرار می گیرد، متفاوت است. با این حال، عمق میکرونیدلینگ به طور کلی از 0.5 میلی متر تا 2.5 میلی متر است. برای درمان‌های سطحی با هدف بهبود بافت و رنگ پوست، معمولاً از سوزن‌های کوتاه‌تر در حدود ۰.۵ تا ۱ میلی‌متر استفاده می‌شود. درمان های عمیق تر که اسکارها یا چین و چروک های عمیق تر را هدف قرار می دهند ممکن است به سوزن هایی در محدوده 1.5 تا 2.5 میلی متر نیاز داشته باشند. عمق انتخاب شده برای میکرونیدلینگ با عواملی مانند نگرانی خاص پوست، نوع پوست و توصیه های یک متخصص مراقبت از پوست تعیین می شود.