سردردهای میگرنی معمولا در ناحیه فوقانی چشم‌ها و یا در قسمت گیجگاهی یک طرف کاسه سر احساس می‌شود، ولی امکان دو طرفه بودن  یا درد در قسمت‌های دیگری از سر نیز وجود دارد. شدت میزان سردرد میگرنی در افراد مختلف متفاوت است؛ با این وجود اکثر بیماران مبتلا به سر درد میگرنی از درد بسیار شدید، طولانی و آزاردهنده آن شکایت دارند. سردردها به صورت دوره‌ای بوده و در افراد مختلف طول مدت دوره ممکن است از چند هفته تا چند سال متفاوت باشد.