برخی از عوارض احتمالی عدم درمان زخم‌های معده عبارتند از: خونریزی زخم معده، شکل‌گیری زخم‌های عمیق در معده، عفونت معده ناشی از تجمع باکتری یا ترشحات زخمی و انسداد مجرای غذایی و عدم انتقال صحیح غذا از معده به روده که بسیار آزاردهنده خواهند بود.