مدت زمان عمل فرنکتومی بسته به پیچیدگی‌های هر کیس می‌تواند متفاوت باشد. به طور کلی، حدود 15 تا 30 دقیقه طول می‌کشد تا تمام فرآیند تکمیل شود.