متاسفانه از رمز گذاری سرتاسری پشتیبانی نمی کند و فقط پیام ها را رمزگذاری می کند و برای مکالمات،تماس های ویدیویی و صوتی این قابلیت در دسترس نیست.همچنین اسکایپ روی پلتفرم هایی که از طریقشان پیام ارسال می کنید نیز حساس است و باید برای هر مکالمه یک رمز گذاری مجزا انجام دهید.