برخی از کیست‌های تخمدان باعث کاهش باروری شده و برخی دیگر این‌طور نیستند. آندومتریوم‌ها و کیست‌های ناشی از سندرم تخمدان پلی کیستیک ممکن است توانایی زنان برای باردار شدن را کاهش دهند. با این حال کیست‌های عملکردی، کیست‌های درموئید و سیستادنوم‌ها مشکلی برای باردار شدن ایجاد نمی‌کنند، مگر اینکه بزرگ باشند. اگر پزشک کیست تخمدان را در دوران بارداری کشف کرد، درمان ممکن است به نوع یا اندازه کیست بستگی داشته باشد. بیشتر کیست‌ها خوش خیم هستند و نیازی به مداخله جراحی ندارند. با این حال اگر کیست به سرطان مشکوک باشد، دچار پارگی یا پیچ خوردگی شود (به نام پیچ خوردگی شناخته می‌شود) یا بسیار بزرگ باشد، ممکن است به جراحی نیاز داشته باشید.