تفاوت این دو تکنیک در شیوه اجرای آن‌ها است. در روش میکروبلیدینگ، جوهر با استفاده از قلمی ظریف به زیر پوست منتقل میشود و راحت‌تر می‌توان آن را پاک کرد و تغییر مدل داد، اما در روش میکروپیگمنتیشن، تمام قاب ابرو با جوهر پر می‌شود و جلوه و حالتی غیرطبیعی ایجاد می‌کند. همچنین جوهر به اعماق پوست وارد می‌شود و ماندگاری بیشتری دارد.