در افراد مبتلا به IBS، عضلات روده بزرگ بیشتر از سایر افراد منقبض می‌شوند و این انقباضات کرامپ و درد ایجاد می‌کنند. از سوی دیگر، آستانه تحمل درد در افراد مبتلا به IBS کمتر است. بر اساس تحقیقات، ممکن است در دستگاه گوارش این بیماران باکتری‌هایی وجود داشته باشد که در بروز علائم نقش دارند.