بیشتر معاینات سونوگرافی بدون درد و سریع بوده و به راحتی قابل تحمل هستند. آن دسته از معاینات سونوگرافی که در آن‌ها مبدل باید به دهانه‌ای در بدن وارد شود، ممکن است درد و ناراحتی جزئی ایجاد کند. در صورت انجام سونوگرافی داپلر، ممکن است صداهای نبض مانندی بشنوید که با کنترل و اندازه‌گیری جریان خون، به صورت گامی تغییر می‌کنند.