درمان عفونت و آبسه مقعدی در زنان و مردان به یک شکل است. اما آنچه که در مورد زنان لازم است در نظر داشته باشید این است که در دوران قاعدگی نیز همچنان از لگن آب گرم استفاده کنند. در این دوران دقت کنند که ناحیه تمیز و خشک بماند و مدت طولانی آلوده نشود. جلوگیری از فشار آوردن بر ناحیه مقعد و خودداری از زایمان و بارداری نیز برای درمان عفونت مقعدی زنان توصیه می شود.