مصرف طولانی مدت سرترالین روی میل جنسی افراد اثر می گذارد و مشکلات نعوظ یا کاهش میل جنسی را بهمراه دارد.البته این عوارض پس از تمام شدن طول درمان به مرور از بین می رود اما در برخی موارد نادر حتی پس از قطع دارو نیز ممکن است این مشکلات ادامه پیدا کند.