با استفاده از گن لاغری با کیفیت و در سایز مناسب، احتمال بروز مشکلات سلامتی کم است. با این حال، برخی از افراد ممکن است به دلیل احتمال وجود آلرژی به مواد استفاده شده در گن لاغری، مشکلاتی داشته باشند.