میکروفیلتراسیون فرآیندی است که در آن اندازه حفرات بین 10-1/0 میکرون بوده و میکروارگانیزم ها نمی توانند از آن عبور کنند.
این فرآیند برای جداسازی موادی با سایز کلوئیدی می باشد که از مکانیسم غربال گری رای باقی ماندن ذرات بزرگتر از اندازه قطر حفرات استفاده می نماید.