اولین ازدواج جنیفر با اوجانی نوآ در سال 1997 بود که سال 1998 به طلاق انجامید. بن افلک دومین معشوقه‌ی جنیفر لوپز بود که پیش از ازدواج، روابط آنها با هم قطع شد و پس از چندین سال دوباره در سال 2021 به هم بازگشتند و در آستانه ازدواج هستند. چند ماه بعد از جدایی اولیه آن دو، او با مارک آنتونی در یک مراسم خصوصی ازدواج کرد. آن‌ها سال 2008 صاحب دو فرزند دوقلو شدند. آن‌ها پس از 7 سال از یکدیگر جدا شدند. جنیفر و الکس رودریگز بازیکن بیسبال با انتشار عکسی در اینستاگرام در مارس 2019 نامزد کردند اما در سال 2021 از هم جدا شدند.