کلر آب استخر می‌تواند باعث خشکی پوست سر و خشن شدن آن شود. این موضوع باعث از بین رفتن فولیکول‌ها و ریزش مو هم می‌شود. همچنین باعث تغییر رنگ مو و کدر شدن آنها هم می‌شود. از طرفی اگر شما موهایتان را کراتینه کرده باشید کلر آب استخر باعث بی‌اثر شدن کراتینه مو هم می‌شود.