خانم های مبتلا به سندرم تخمدان پلی کیستیک احتمال بیشتری برای ابتلا به برخی مشکلات جدی سلامتی دارند. اینها شامل دیابت نوع 2، فشار خون بالا، مشکلات قلب و عروق خونی و سرطان رحم است. زنان مبتلا به سندرم تخمدان پلی کیستیک اغلب در توانایی خود برای باردار شدن (باروری) مشکل دارند.