پروبیوتیک‌ها برای رسیدن به سه هدف اصلی خود، یعنی افزایش تعداد باکتری‌های مفید، کاهش تعداد باکتری‌های مضر و کاهش التهاب به زمان نیاز دارند. برای بیشتر افراد، 2 تا 3 هفته بعد از شروع مصرف پروبیوتیک، تاثیرات قابل توجه خود را نشان خواهد داد.