مانند هر عمل جراحی ، اسلیو معده و بای پس معده خطرات را به همراه دارد. این موارد می تواند شامل عفونت، خونریزی، لخته شدن خون و عوارض مربوط به بیهوشی باشد. بحث در مورد خطرات و عوارض احتمالی با جراح خود قبل از عمل جراحی بسیار مهم است.