علت اصلی به وجود آمدن موهای زیرپوستی بعد از لیزر، اصلاح موهای زائد برخلاف جهت رویش آنها است. زمانی که موها برخلاف جهت رویش خود اصلاح می شوند، ممکن است قسمتی از ساقه مو در زیر پوست باقی بماند. این قسمت از مو می تواند باعث تحریک پوست و ایجاد موهای زیرپوستی شود.