استفاده از کاربر root همراه با ریسک‌های امنیتی است. از آنجا که این حساب دسترسی کامل به سیستم دارد، هر گونه اشتباه یا دسترسی غیرمجاز می‌تواند منجر به آسیب جدی به سیستم شود. بهتر است فقط در مواقع ضروری از کاربر root استفاده کنید و از رمز عبور قوی و روش‌های امنیتی مانند SSH Key استفاده کنید.