بخش مهمی از فرق بواسیر با سرطان مقعدی به علائم آن‌ها مربوط می‌شود. بواسیر باعث درد رکتوم می‌شود، در حالی که سرطان مقعدی با کاهش وزن ناخواسته، خستگی، ناراحتی مداوم شکم، تغییر عادات روده و احساس تخلیه نشدن کامل روده مشخص می‌شود. شیوه تشخیص و درمان این دو بیماری هم با هم متفاوت است.