افرادی که با آشفتگی جنسیتی مواجه هستند، ممکن است احساس کنند که جنسیتی که به آن تعلق دارند با جنسیت زندگی خود تطابق ندارد. آنها ممکن است احساس کنند که باید به جنسیتی دیگر تعلق داشته باشند و این احساس می‌تواند به افسردگی، اضطراب و استرس منجر شود.