بله. این دو کنکور علاوه بر متفاوت بودن منابع و پذیرش دانشگاه‌ها، زمان برگزاری متفاوتی نیز دارند. همچنین در برخی رشته‌های وزارت بهداشت تعداد واحد‌های بیشتری نسبت به کنکور وزارت علوم گذرانده می‌شود.