عفونت واژن یکی از مشکلات زنان است که سالانه تعداد زیادی زن را درگیر خود می‌کند. اگر باکتری در واژن نامتعادل شود ، عفونت‌های قارچی و واژینوز باکتریایی ممکن است ایجاد شوند .عفونت از عوارض نادر استفاده از کاپ قاعدگی است. اگر عفونتی رخ دهد، به احتمال زیاد از انتقال باکتری روی دست به فنجان است تا از خود کاپ قاعدگی.