در برخی موارد جراحی بای پس معده برای زنانی که قصد بارداری دارند توصیه نمی‌شود؛ زیرا گاهی کاهش وزن قابل توجه پس از جراحی می‌تواند منجر به کمبود ویتامین و مواد مغذی بدن شود و بر رشد جنین تأثیر بگذارد. بهترین کار این است که در این مورد با پزشک خود مشورت کنید.