در این نوع سونوگرافی، که به نام اسکن NT یا فضای شفاف پشت گردن نیز شناخته می‌شود، از اولتراسوند برای ارزیابی خطر ابتلا به سندروم داون و دیگر ناهنجاری‌های کروموزومی و مشکلات قلبی مادرزادی در نوزاد استفاده می‌شود. متخصص زنان و زایمان این آزمایش را به همراه آزمایش خون در تست‌های غربالگری ترکیبی سه ماه اول بارداری برای تمامی زنان باردار درخواست می‌کند. سونوگرافی NT، اندازه‌گیری فضای شفاف در بافت پشت گردن نوزاد را انجام می‌دهد. این فضای شفاف در صورت وجود برخی ناهنجاری‌ها و مشکلات ژنتیکی در سه ماه اول بارداری ممکن است بزرگ‌تر از حد متوسط شود، زیرا مقدار بیشتری مایعات در این ناحیه جمع می‌شود. این اسکن باید بین هفته‌های ۱۱ تا ۱۴ بارداری انجام شود، زیرا تنها در این بازه زمانی پایین‌ترین قسمت گردن جنین به اندازه کافی شفاف است. آخرین فرصت برای انجام سونو NT روزی است که وارد هفته ۱۳ و روز ۶ بارداری می‌شوید. در برخی از مراکز، با استفاده از تجهیزات بسیار تخصصی، ممکن است ناهنجاری‌های ژنتیکی دیگر نیز در طول سونو NT شناسایی شوند. اسکن NT تهاجمی نبوده و نتایج آن به طور کامل قطعی نیستند. برای تأیید نتایج مثبت اسکن، انجام آزمایش‌های تشخیصی مانند CVS یا آمنیوسنتز ضروری است.