همان‌طور که تیروئید کم کار بر سیستم هضم غذا تاثیر می‌ گذارد تیروئید پرکار نیز مشکلات زیادی برای دستگاه گوارش به وجود می‌ آورد. برای مثال نوع پرکار این عارضه سبب افزایش سرعت هضم غذا شده و حرکات مکرر روده و در نهایت اسهال را به دنبال دارد.