وقتی که آب از مراحل مختلف تهیه می گذرد بسته به چه مصرفی برسد باید در حد لزوم ضدعفونی شود. منظور از ضدعفونی کردن، از بین بردن کلیه عوامل بیماری زا از طریق اضافه کردن عوامل فیزیکی و شیمیایی می باشد.
برای آبهای آشامیدنی، ضدعفونی کردن آب بسیار ضروری است.