هر دو شاخه در زمینه‌های تقریباً یکسانی فعالیت می‌کنند. تفاوت اصلی آن‌ها در این است که رفتارشناسی حیوانات بیش‌تر روی شناخت رفتار حیوانات و دلایل آن تمرکز دارد اما روان‌شناسی حیوانات در کنار بررسی رفتار حیوانات روی فرآیندهای شناختی آنان نیز به پژوهش و کار می‌پردازد.