سکته آمبولی یا Embolic Stroke زمانی اتفاق می‌افتد که لخته خون در جایی غیر از مغز درون بدن تشکیل شود و به آرامی به سوی شریان‌های مغزی حرکت کرده و در عروق مغزی قرار بگیرد. بعد از انسداد رگ ها و عدم خون‌رسانی به مغز، سکته اتفاق می‌افتد.