درمان زخم معده بدون عارضه دو یا سه ماه به طول می‌انجامد. این زمان برای زخم دوازدهه حدود شش هفته است. زخم می‌تواند به طور موقت بدون آنتی بیوتیک بهبود یابد. اما اگر باکتری از بین نرود، معمولاً عود می‌کند یا زخم دیگری در نزدیکی آن ایجاد می شود.