دانشگاه وارمیا و مازوری دارای 17 دانشکده و 65 برنامه دانشگاهی است ، هر ساله حدود 25000 دانشجو برای تحصیل در دانشگاه وارمیا و مازوری تحصیل می کنند ، در سال های 2004 و 2008 برای دومین بار از بین 70 دانشگاه به عنوان دانشگاه دوستدار دانشجو معرفی شد ، در 16 دانشکده و 24 رشته ، دانشگاه وارمیا و مازوری صلاحیت اعطای مدرک دکترا را دارد.