فیلتر استخر باید 6 ساعت بعد از شوک استخر شروع به کار کند.هدف از این کار این است که فیلتر آب را تمیز کرده و زمان کافی به شوک برای مخلوط شدن با آب را بدهد.اگر استخر مقدار زیادی جلبک داشته باشد فیلتر باید 24 ساعت شبانه روز به مدت 7 روز فعالیت کند.