کیست بارتولن ناشی از آندومتریوز نیست. اگر در مورد عوارض جانبی اندومتریوز نگرانی دارید، با پزشک خود صحبت کنید. علت کیست بارتولن می تواند عفونت های باکتریایی، عفونت های مقاربتی یا آسیب به ناحیه واژن باشد.