اگرچه مصرف مکمل‌های کلاژن برای اکثر افراد بی‌خطر است. اما به‌دلیل وجود آلرژن‌های غذایی رایج مانند ماهی، صدف و تخم مرغ، افراد مبتلا به آلرژی مزمن باید اجتناب کنند. برخی افراد هنگام مصرف مکمل‌ حالت تهوع و نفخ را گزارش کرده‌اند. علاوه بر این، ممکن است عوارض جانبی گوارشی مانند سوزش سر دل و احساس سیری ایجاد کند. اگر باردار یا شیرده هستید، بهتر است تحت نظر پزشک شروع به مصرف آن‌ کنید.