واتساپ به شما امکان می‌دهد از پیام‌ها و رسانه‌های خود در Android و iOS پشتیبان بگیرید. این یک ویژگی ضروری بوده، زیرا امکان بازیابی پیام‌هایی را که به طور تصادفی حذف شده‌اند را می‌دهد. در واقع این بکاپ‌ها حاوی پیام‌های رمزگشایی شده از موبایل شما هستند. فایل‌های پشتیبان ذخیره شده در آیکلود یا گوگل درایو رمزگذاری نمی‌شوند و از آنجا که این پرونده شامل نسخه‌های رمزگشایی شده از تمام پیام‌های شما است، از لحاظ نظری آسیب پذیر بوده و امنیت واتساپ را تضعیف می‌کند.