هایفوتراپی درمانی غیرتهاجمی بوده از همین رو عوارض زیادی ندارد ولی اگر در کلینیک های غیرمتعبر و توسط افراد غیرمتخصص انجام شود میتواند همراه با درد و لک پوستی، تورم و هایپرپیگمنتیشن همراه باشد.