از اوزون درمانی در معالجه بیماری های زیر استفاده می‌شود:
درمان اطفال، عصب شناسی، زنان و زایمان، اورولوژی، ارتوپدی، آسیب شناسی، زیبایی شناسی، پوست، در بیماری های عفونی، در درمان برخی عارضه های پاتولوژیک برای از بین بردن هیپوکسی بافت، بهبود متابولیسم، در مبارزه با ویروس‌های بیماری‌زا، باکتری‌ها و قارچ‌ها استفاده میشود