همان‌طور که اشاره شد، کار اصلی آمپول اچ سی جی تحریک تخمدان برای تخمک‌گذاری است. از آن‌جایی که این امر موجب افزایش سایز فولیکول‌ها (جهت آزاد کردن بالغ‌ترین تخمک) و همچنین بزرگ‌تر شدن تخمدان‌ها می‌شود، خطر شکل‌گیری کیست تخمدان را افزایش می‌دهد.
درواقع، بسیاری از فولیکول‌های بزرگ‌شده تخمک خود را آزاد نمی‌کنند و یا فاقد تخمک هستند؛ لذا تجمع آن‌ها در تخمدان می‌تواند کیست‌های تخمدانی کوچک و بزرگی را پدید آورد.