وجود باکتری در مایع منی همیشه به معنای عفونت نیست,زیرا ممکن است باکتری در حین نمونه گیری به مایع منی اضافه شده باشد. باکتریهای استرپتوکوکوس و استافیلوکوکوس,به علت اینکه روی پوست قرار می گیرند،امکان جابجایی و ایجاد آلودگی را دارند.علاوه بر این عفونت مجاری ادرار یا انتقال باکتری اشریشیاکلای از معده به روده میتواند یکی دیگر از عوامل آلودگی مایع منی باشد.به طور کلی میتوان گفت منظور از عفونت مایع منی زمانی است که در هر میلی لیتر از مایع منی بالای ۱۰۰۰ باکتری وجود  داشته باشد که  این موضوع با علائمی مثل تعداد بسیار زیاد گلبولهای سفید (تقریبا بیش از ۱ میلیون در میلی لیتر) تشخیص داده می شود. با کشت نمونه ای از مایع منی در آزمایشگاه امکان شناسایی نوع باکتری عفونی  نیز فراهم می شود.