یکی از مهم ترین موارد استفاده آب اکسیژنه برای پوست، در ضدعفونی پوست است. پراکسید هیدروژن دارای خاصیت ضد عفونی کننده و سفید کننده است و در نتیجه، برخی معتقدند که می تواند با عفونت ها مبارزه کند، لکه ها را کاهش دهد، پوست را روشن کند و علائم برخی شرایط را کاهش دهد. به گفته پزشکان، استفاده از محلول پراکسید هیدروژن ۱ درصد، می تواند آکنه را درمان کند.