خطر کمبود تغذیه‌ای در تمامی روش‌های جراحی لاغری وجود دارد. ممکن است شخص به دلیل کوچک شدن معده و کوتاه شدن مسیر روده کوچک دچار سوءتغذیه شود. در این فرایند جذب مواد مغذی و ویتامین‌ها همانند جذب قند و چربی کاهش پیدا می‌کند. به همین دلیل باید معاینات و آزمایش‌ها به‌موقع انجام شوند و رژیم غذایی درستی رعایت شود تا خطر کمبود تغذیه‌ای کاهش پیدا کند.