درمورد علت فوبیا نظریه های گوناگونی مطرح شده که هر کدام به جنبه خاصی از این اختلال متمرکز هستند. به عنوان مثال بر اساس نظریه شرطی سازی، فوبیا به دلیل همراهی و تداعی موضوع فوبیک با یک خاطره ناخوشایند ایجاد می شود. بر این اساس فردی که تجربه دردآوری در زمینه دندان پزشکی داشته ممکن است به شدت نسبت به دندان پزشکی دچار هراس شود. از سویی بعضی نظریه پردازان به آمادگی تکاملی ما نسبت به بعضی موقعیت های فوبیک تاکید می کنند و معتقدند انسان ها از یک آمادگی ذاتی برای ترسیدن از موضوعاتی که برای اجدادشان خطرناک بوده برخوردارند. این دیدگاه به فوبی عنکبوت یا مار اشاره می کند که برای اجدادمان خطرناک بوده در مقابل ما نسبت به موضاعت به روزتر اما خطرناک تر مانند تفنگ یا چاقو فوبیا را تجربه نمی کنیم.