برخی از مدل‌های قفل بیومتریک از سرویس احراز هویت چند عاملی یا چند مرحله‌ای – معمولاً دو مرحله‌ای – استفاده می‌کنند. در این سیستم‌ها مرحله اول احراز هویت با استفاده از اثر انگشت یا تشخیص چهره و مرحله دوم بر اساس پین کد صورت می‌گیرد.