کلونینگ یکی از روش‌های مولکولی برای تکثیر ژن‌ها در محیط آزمایشگاهی است. در این روش ژن مورد نظر به‌وسیله آنزیم‌های محدودکننده، نوکلئازها و لیگازها وارد ژنوم یک پروکاریوت یا مخمر می‌شود. تعیین نوع آنزیم محدودکننده، تعداد جایگاه‌های برش آنزیم و نوع انتهای ایجاد شده پس از برش قبل از شروع کلونینگ اهمیت زیادی دارد. نرم‌افزار ژن رانر امکان بررسی این پارامترها را فراهم می‌کند و برای استفاده از این امکان از کلید میانبر Ctrl + N یا مسیر استفاده کنید.