معمولا علائم اچ پی وی خفیف است و به غیر از نشانه‌های ظاهری علائم آزاردهنده ای برای بیمار ایجاد نمی‌کند. اما در مواردی احتمال دارد بیمار مبتلا به زگیل تناسلی مردانه شاهد علائمی مثل درد، خارش و سوزش خفیف و گاهی خونریزی جزئی باشد.