محبوب ترین دوره‌ها در دانشگاه جانز هاپکینز حول رشته‌های بازرگانی و علوم پزشکی متمرکز است. همچنین تحصیل در رشته‌های STEM در دانشگاه جان هاپکینز از برترین‌ها در آمریکا است.