به طور کلی، مزوتراپی یک روش نیمه تهاجمی و کم خطر است که دارای عوارض جانبی محدودی است اما برخی از عوارض مزوتراپی لاغری که ممکن است پیش بیاید عبارتند از : جای زخم در محل تزریق، ایجاد کبودی، حالت تهوع، درد، قرمزی و تورم، راش، حساسیت و درد خفیف.