اتوماسیون اداری و BPMS دو ابزار مکمل یکدیگر برای افزایش بهره‌وری سازمان در کناریکدیگر هستند.اتوماسیون اداری راهکاری جهت مدیریت داده‌های غیرساختارمند سازمان مانند: فایلهای متنی، تصویری، ویدیویی، ایمیلها و… می باشد. در حالیکه نرم‌افزار BPMS ابزاری برای مدیریت داده‌های ساختارمند مانند فرم درخواست مرخصی، درخواست خرید کالا و… است.