اندوسکوپی معده برای جراحی اسلیو مانند هر عمل جراحی دیگری ممکن است عوارض جانبی داشته باشد. برخی از عوارض جانبی رایج شامل خونریزی، عفونت، تهوع و استفراغ طی چند روز بعد از عمل است. خوشبختانه احتمال بروز این عوارض در صورت انجام جراحی توسط جراح‌های ماهر ترکیه به حداقل می‌رسد و از این بابت جای هیچ‌گونه نگرانی نیست.