کود های زیستی می‌توانند به صورت مستقیم روی خاک پاشیده شوند یا با خاک مخلوط شوند. همچنین، می‌توان آنها را به صورت محلول در آب آبیاری اضافه کرد. سپس از طریق سیستم‌های آبیاری قطره‌ای به ریشه گیاهان رساند.