چایی بابونه در خود دارای فنول و آنتی اکسیدان های متفاوتی است. این مواد نقش به سزایی برای از بین بردن باکتری‌های ایجاد کننده جوش و آکنه ایفا می‌کنند. این دو ماده به خصوص فنول را یک مبارز با عفونت و باکتری می‌شناسند.