عوارض اسکالپ سر عبارتند از: نقاط بزرگتر از حد نرمال، نقاط واضح‌تر از حد لازم، نقاط بیش از حد کوچک، نامتوازن بودن نقاط ، نقاط بیش از حد متراکم، نقاط با فاصله بیش از حد، نقاط با فاصله بیش از حد، محو شدن زودهنگام نقاط میکرو اسکالپ و تغییر رنگ نقاط اسکالپ سر که در صورتی که در یک مرکز معتبر و با تجربه اسکالپ سر انجام دهید دچار این عوارض نخواهید شد.