برای کودکانی که مشکلات گوارشی دارند معمولاً شیر خشک‌هایی توصیه می‌شود که پروتئین‌های آن به‌ طور کامل هیدرولیز شده باشد؛ که برای انتخاب بهتری شیر خشک با پزشک خود مشورت نمایید. اکثر برندها شیر خشک مخصوص مشکلات گوارشی دارند.