پوشه و پرونده دو عنصر مهم در سیستم‌های کامپیوتری هستند، اما دارای تفاوت‌های مهمی هستند. این تفاوت‌ها عبارتند از:
محتوا: پرونده‌ها اطلاعات و داده‌ها را در خود ذخیره می‌کنند، مثلاً یک متن، تصویر یا ویدئو. از طرفی، پوشه‌ها به عنوان ظرفیتی برای ذخیره و سازماندهی پرونده‌ها عمل می‌کنند و خود دارای محتوای مستقل نیستند.
ساختار: پرونده‌ها به صورت فردی و مستقل در سیستم ذخیره می‌شوند و می‌توانند دسترسی، تغییر و حذف مستقیم داشته باشند. در مقابل، پوشه‌ها مجموعه‌ای از پرونده‌ها و زیرپوشه‌ها هستند و قابلیت ساختاردهی و سازماندهی را فراهم می‌کنند.
نامگذاری: پرونده‌ها معمولاً نام خاصی دارند تا بتوان به آنها ارجاع داد و از آنها استفاده کرد. در مقابل، پوشه‌ها نیز نام دارند اما معمولاً نامگذاری آنها بر اساس محتوا و موضوعی که در آنها قرار دارد، انجام می‌شود.
استفاده: پرونده‌ها معمولاً برای نگهداری و مدیریت اطلاعات و محتواها استفاده می‌شوند، در حالی که پوشه‌ها برای سازماندهی و دسته‌بندی پرونده‌ها و زیرپوشه‌ها استفاده می‌شوند.
ظاهر: پرونده‌ها به طور معمول با یک آیکون و نام مشخص نشان داده می‌شوند. از طرفی، پوشه‌ها با آیکون و نام خاصی نمایش داده می‌شوند که نشان دهنده وجود پرونده‌ها و زیرپوشه‌های درون آنها است.