شایع ترین عوارض جانبی که کاشت مو به همراه دارد جای زخم جراحی است که با هیچ روشی نمی توان از آن جلوگیری کرد. سایر عوارض جانبی عبارت اند از: ·         عفونت ها ·         پوسته شدن یا تخلیه چرک ها در اطراف محل های جراحی ·         درد، خارش و تورم پوست سر ·         التهاب فولیکول های مو ·         خون ریزی ·         نداشتن حس در اطراف محل های جراحی ·         مشخص بودن کاشت مو در سر