نیتریفیکاسیون رایج ترین روش برای حذف بیولوژیکی آمونیاک در فاضلاب است. در این فرآیند، تصفیه آمونیاک از طریق باکتری هایی که در حال حاضر در آب وجود دارند ، انجام می شود. این باکتریها آمونیاک را تجزیه می کنند و سرانجام باعث آزاد شدن گاز نیتروژن در جو می شوند.