در اصل، تفاوتی در عملکردها وجود ندارد. تفاوت‌های اصلی تعداد کانکتورهای ورودی/خروجی و انواع و تعداد سوئیچ‌ها و دکمه‌های کنترل است. AG06MK2 از استفاده همزمان دو میکروفن کاندانسر پشتیبانی می‌کند. AG03MK2 همچنین دارای یک فیدر 60 میلی‌متری برای CH1 است.