مصرف دارو باید طبق نظر پزشک متخصص، بر اساس انجام آزمایشات و مشاهدات بالینی باشد. اما استفاده از داروهای آنتی بیوتیک، کاهش‌دهنده اسید معده و مسدودکننده تحریک اسید معده در بین داروهای با منبع شیمیایی رواج خاصی دارد. همچنین استفاده از عناصر طبیعی مثل: عسل، سیر، آویشن و شیرین بیان نیز به درمان میکروب معده کمک خواهد کرد.