شهر باکو برترین منطقه از نظر تعداد بیمارستان در آذربایجان است و طبق آخرین آمار ، تعداد بیمارستان های این شهر 135 بیمارستان بوده است که حدود 25 درصد از تعداد بیمارستان های آذربایجان را تشکیل می دهد.