ارز دیجیتال نانو، چندین عنصر بلاک‌چین را با الگوریتم نمودار جهت‌دار غیر مدور (DAG) ترکیب می‌کند. تحت این ساختار، هر نانو بلاک‌چین مخصوص به خود را دارد که موجودی و سوابق تراکنش‌ها را در خود ذخیره می‌کند. به این سیستم، زنجیره حساب یا Account Chain نیز گفته می‌شود. تنها صاحب هر حساب به این بلاک دسترسی دارد. هر حساب می‌تواند به طور مجزا از سیستم به‌روزرسانی شود. این حد از کنترل و دسترسی، در پروژه‌های دیگر مشاهده نمی‌شود.