گاهی ممکن است تعدادی از زگیل‌های تناسلی مردانه بدون نیاز به هیچ روش درمانی از بین بروند. اما باید دقت کرد که ناپدیدشدن علائم به معنای نابودی کامل ویروس (HPV) نیست. در نتیجه می‌توان انتظار داشت که علائم زگیل تناسلی را در مردان به‌دفعات زیاد مشاهده کرد.