شبکه پالیگان چهار لایه مختلف دارد لایه اتریوم: این لایه شامل مجموعه‌ای از قراردادهای هوشمند است که در اتریوم اجرا می‌شوند. وظیفه اصلی این لایه کنترل بخش‌های مختلف شبکه پالیگان مثل تراکنش‌ها، استیکینگ و همچنین ارتباط بین اتریوم و زنجیره‌های مختلف در پالیگان است. لایه امنیتی: لایه امنیتی هم مانند لایه اتریوم، اختیاری است. با استفاده از این لایه، زنجیره‌ها می‌توانند از یک لایه امنیتی اضافی بهره‌‌مند شوند. لایه شبکه‌های اجباری پالیگان: این لایه دربرگیرنده شبکه‌های مختلفی است که همه آنها روی بلاکچین پالیگان ساخته شده‌اند. وظیفه اصلی این لایه تولید بلاک، اجماع داخلی و تلفیق تراکنش‌ها است. لایه اجرای اجباری: این لایه که برای اجرای قراردادهای هوشمند استفاده می‌شود، در واقع لایه پیاده‌سازی ماشین مجازی اتریوم یا همان EVM است.