داروهای ضد ویروسی از تعداد دفعات و همچنین شدت دوره های عود هرپس مقعدی جلوگیری می کنند. هنگامی که هرپس مجددا در هر زمان عود پیدا کند، درمان مداوم ضد ویروسی می تواند به کوتاه کردن مدت زمان بیماری کمک کند.