عوامل مختلفی در ابتلا به هاشیموتو نقش دارند که از جمله می‌توان به سن، جنسیت، بیماری‌های خود ایمنی، مصرف بیش از اندازه‌ی ید، ژنتیک و مواجهه با تشعشعات گوناگون به وجود می‌آید.