بودجه‌بندی عملیاتی مزایای متعددی برای سازمان‌های دولتی و همچنین شهروندان یک جامعه در پی دارد. چرا که قدرت نظارت آنها را بر فعالیت‌های دولت افزایش می‌دهد و باعث بهبود شفافیت و پاسخگویی سازمان‌های دولتی نیز می‌شود.