زایمان سزارین معمولا یک جراحی ایمن می باشد، اما برخی از خطرات طی این جراحی ممکن است به وجود آید. مهم ترین خطرات ناشی از جراحی برای مادر شامل عفونت، از دست دادن خون، لخته شدن خون در پاها یا ریه ها و مشکلات روده است. این خطرات برای نوزاد، شامل آسیب دیدگی در هنگام زایمان و ریه های نابالغ یا مشکلات تنفسی در صورت زایمان زودرس است.