در میکرواینجکشن، یک اسپرم به هر تخمک بالغ بعد از مرحله تحریک تخمک گذاری تزریق می‌گردد. انجام این کار حدودا 20 دقیقه زمان لازم دارد اما ناگفته نماند که این مدت زمان به تعداد تخم های بالغ بستگی دارد. تخمک ها با استفاده از دستگاه انکوباتور مورد بررسی قرار می‌گیرند که آیا بارور شده اند یا همچنان نابارور هستند.