استفاده از پروتکل‌های امن مانند HTTPS، به‌روزرسانی‌های مداوم نرم‌افزاری، تغییر دوره‌ای اطلاعات ورود به پنل مدیریت، استفاده از دیوار آتش و فعال کردن احراز هویت دومرحله‌ای ازجمله مهم‌ترین روش‌های ترتقای امنیت سایت فروشگاهی هستند.