شیر مورد استفاده در تهیه پنیر سنتی لیقوانی شیر پرچربی است. به طور معمول در هنگام تهیه این پنیر چربی شیر را از آن جدا نمی‌کنند تا بافت پنیر نرم شده و لذیذتر شود. درواقع چربی پنیر لیقوان از نوع مفید است و از چربی شیر گوسفند به دست می‌آید و به‌هیچ‌وجه مواد افزودنی ندارد. بنابراین با رعایت مقدار مصرف آن مشکلی پیش نخواهد آمد.