تحریک مغناطیسی مغز یک درمان غیرتهاجمی است که بیشترین تأثیر را در بیمارانی دارد که قبل از شروع حمله میگرنی دچار نوعی اختلال بینایی به نام اورا می‌شوند. در این روش، وسیله‌ای روی جمجه بیمار قرار می‌گیرد که پالس‌های مغناطیسی تکی یا تکرار شونده را به قشر پیش پیشانی مغز ارسال می‌کند تا فاز اورای حمله میگرنی را مختل کرده و از ادامه‌ی حمله جلوگیری کند.