هزینه عمل لیزر فیستول مقعدی بسته به میزان پیشرفت بیماری و حاد یا مزمن بودن شقاق متفاوت است و نمیتوان قیمت دقیقی برای لیزردرمانی جراحی شقاق در نظر گرفت.