درد یکی از شایع‌ترین نشانه‌های فیستول است. خروج مداوم چرک و ترشحات بدبو، التهاب و قرمزی پوست اطراف مقعد ،بی اختیاری مدفوع و تب و ... از جمله علائم فیستول مقعدی شدید هستند.