ارتفاع سقف وافل بستگی به نوع کاربری ساختمان، طراحی داخلی و مواد ساختمانی دارد. اما در کل، ارتفاع سقف وافل باید حداقل ۳ متر باشد تا فضای شناور تر و احساس بهتری را به ساکنان فراهم کند.
در صورتی که این ارتفاع کمتر از ۳ متر باشد، فضای کمیاب خواهد بود و احتمال ایجاد احساس تنگی و بستری بودن بیشتر است. البته ممکن است در برخی موارد خاص مانند ساختمان‌های فضای باز و یا محیط‌های صنعتی، ارتفاع سقف وافل به کمتر از ۳ متر کاهش یابد.
به هر حال، در طراحی ساختمان و انتخاب ارتفاع سقف باید به نیازهای کاربران ساختمان، محیط کار و تاثیرات احتمالی بر روی سلامتی آنها توجه کرد.