در موزه مفاخر یزد وسایل زندگی و شخصی آیت‌الله خاتمی قرار دارد که علاوه‌بر جاذبه‌های معماری خانۀ آیت‌الله خاتمی، عکس‌ها و تابلوهایی از مشاهیر و اشخاص برجستۀ اردکان با زبان فارسی و انگلیسی برای بازدیدکننده‌ها به نمایش گذاشته شده است.