زگیل‌های معمولی در اثر عفونت با ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) ایجاد می‌شوند که یک اصطلاح کلی برای بیش از 100 نوع ویروس است. برخی از گونه‌های HPV می‌توانند باعث ایجاد زگیل‌های معمولی در دست‌ها، انگشتان دست و سایر نواحی غیر تناسلی بدن شوند. سویه‌های دیگر HPV می‌توانند باعث ایجاد انواع مختلف زگیل در قسمت‌های مختلف بدن، از جمله زگیل‌های تناسلی قابل انتقال از طریق جنسی، یا شرایط مختلف، از جمله، در موارد نادر، سرطان دهانه رحم یا سرطان مقعد شوند.