درمان ارتودنسی مرحله ای ممکن است عوارض جانبی موقتی مانند ناراحتی دندان ها، زخم های لثه ای و تغییرات در گفتار ایجاد کند. با این حال، این عوارض معمولاً قابل مدیریت هستند و به مرور زمان کاهش می یابند. رعایت بهداشت دهان و دندان و پیگیری منظم با ارتودنتیست به کاهش این عوارض کمک می کند.