بر اساس تحقیقات انجام شده بر روی افرادی که جراحی بای پس معده انجام داده‌اند، این عمل می‌تواند بر سلامت دندان‌ها تأثیر منفی بگذارد، به‌ویژه به دلیل کاهش مصرف ویتامین‌ و مواد معدنی. بنابراین ممکن است بعد از جراحی بای پس معده افراد دچار پوسیدگی دندان شوند. برای جلوگیری از این مشکلات، مراجعه منظم به دندانپزشک و مصرف مکمل‌های ویتامینی ضروری است.