هیچ دلیل قطعی برای افسردگی صبحگاهی وجود ندارد، اما ممکن است با عواملی مانند استعداد ژنتیکی، عدم تعادل هورمونی، یا اختلال در ریتم شبانه روزی مرتبط باشد.