دیونایزر آزمایشگاهی در شرکت‌های داروسازی جهت تولید آب دیونیزه در راستای انجام انواع آزمایش‌های طبی، تولید آب مقطر و تولید انواع دارو کاربرد دارد اما عمده کاربرد دستگاه دیونایزر صنعتی در تولید آب دیونیزه و آب فوق خالص است.