ترخیص تجهیزات پزشکی از هر گمرکی امکان‌پذیر نیست و برای این امر برخی مبادی گمرکی خاص تعیین شده است. ترخیص تجهیزات پزشکی از گمرک خرمشهر، گمرک شهید رجایی بندر عباس، گمرک تهران، ترخیص از فرودگاه امام خمینی و بندر امام خمینی، گمرک ارومیه، گمرک سهلان و ترخیص تجهیزات پزشکی از گمرک آبادان.