درد کلیه ها که به آن پیلونفریت هم گفته می شود معمولا زمانی که کلیه ها دچار عفونت یا سرماخوردگی شوند یا در اثر التهاب یا آسیب بروز پیدا می کند. البته بیماری های مربوط به انسداد مجاری ادراری یا بزرگ شدن کلیه ها نیز می تواند منجر به درد در این عضو حیاتی شوند.