جوش مقعدی به ندرت بدون درمان توسط پزشک از بین می‌رود. درمان ممکن است شامل تخلیه یا جراحی باشد. رایج‌ترین و ساده‌ترین روش درمان، تخلیه چرک از ناحیه عفونی توسط پزشک است.