میکروب‌های مختلف از روش‌های متفاوتی برای تولید متابولیت‌ها استفاده میکنن. این متابولیت‌ها برای تمایز بین گونه‌های مختلف میکروارگانیسم‌ها مفید هستن. الکل یکی از رایج‌ترین متابولیت‌های اولیه هست که توی فرایند تخمیر- تنفس بی‌هوازی برای تولید شراب و آبجو استفاده میشه.