جانشین پروری در سازمان با تغییرات همراه است و کارمندان ممکن است که در مقابل تغییرات مقاومت داشته باشند. از دیگر سو انتخاب بهترین زمان برای اجرای فرآیند جانشین پروری می تواند سخت باشد و سازمان را با چالش هایی مواجه سازد.