Οι πιο πολύτιμες κάρτες στο Digimon TGC είναι οι μυστικές σπάνιες κάρτες. Στην πραγματικότητα, υπάρχουν μόνο δύο τύποι σε κάθε πακέτο των 115. Εκτός από το SEC, αυτό που τις κάνει να διαφέρουν από τις Super Rares είναι το χρυσό περίγραμμα γύρω από την κάρτα. Αυτά τα σύνορα είναι πολύ πιο λεπτομερή από αυτά των Σούπερ Σπάνιων.