Η κατασκευή βόθρου πρέπει να γίνεται μακριά από τα θεμέλια του κτιρίου για να αποφεύγεται η διάβρωση τους σε περίπτωση διαρροής.
Είναι πολύ σημαντικό οι βόθροι να απέχουν τουλάχιστον 15 μέτρα από κάθε πηγή νερού ώστε να μην υπάρχει κίνδυνος μόλυνσης της.
Ένα περιοδικό άδειασμα βόθρου και η συντήρηση του είναι απαραίτητα στοιχεία για την ομαλή λειτουργία των στεγανών, απορροφητικών, σηπτικών και των βιολογικών βόθρων.
Οι διαστάσεις του βόθρου πρέπει να είναι ανάλογες του κτιρίου που θα εξυπηρετεί, καθώς είναι λογικό ότι θα χρειάζεται μεγαλύτερος βόθρος για μια ξενοδοχειακή μονάδα για παράδειγμα από ότι για μια μονοκατοικία.