Πριν χτιστεί το μουσείο, τα τεχνουργήματα στο εσωτερικό ήταν διάσπαρτα γύρω από το Κάιρο σε τζαμιά και άλλα κτίρια. Στη συνέχεια συγκεντρώθηκαν και αποθηκεύτηκαν στο τζαμί Al Hakem, όπου εκτέθηκαν σύντομα στην αυλή του. Οι εκθέσεις παρέμειναν εκεί έως ότου το Μουσείο Ισλαμικής Τέχνης στο Κάιρο άνοιξε τις πόρτες του το 1903.