Οι διαφορές μεταξύ MKV και AVI είναι οι μορφές κωδικοποίησης. Ένα άλλο MKV είναι ένα ανοιχτό δοχείο. Από την άλλη πλευρά, το αρχείο AVI είναι μια ιδιόκτητη μορφή κοντέινερ από τη Microsoft. Επιπλέον, ένα αρχείο AVI μπορεί να κρατήσει μόνο μια ροή βίντεο και ήχου. Αντίθετα, το MKV μπορεί να διατηρήσει πολλές ροές βίντεο και ήχου στο ίδιο κοντέινερ αρχείων.