Μετά την αλλαγή της σακούλας καθετήρα μπορείτε απλά να καθαρίσετε το εσωτερικό της με λευκό ξύδι και κρύο νερό (αναλογία ⅓ ). Αφού γεμίσετε το εσωτερικό της σακούλας με το υγρό, ανακαινίστε τη και αφήστε τη για δεκαπέντε λεπτά. Έπειτα, απλά αδειάστε το νερό με το ξύδι και αφήστε να στεγνώσει. Μία άλλη εναλλακτική είναι να χρησιμοποιήσετε χλωρίνη διαλυμένη σε νερό (αναλογία 1/10). Βεβαιωθείτε εάν οι τρόποι αυτοί καθαρισμού είναι συμβατοί με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Εξωτερικά μπορείτε να καθαρίζετε τη σακούλα του καθετήρα με κάποιο αντισηπτικό διάλυμα ή αντισηπτικά μαντηλάκια.