Το κύριο πλεονέκτημα του Markdown είναι ότι, σε αντίθεση με τον επεξεργαστή WYSIWYG, δεν απαιτεί κλικ σε κουμπιά για να επιτευχθεί η επιθυμητή μορφοποίηση. Επιπλέον, δεν περιορίζεται από το σχεδιασμό των προγραμματιστών λογισμικού. Το Markdown μπορεί να επεκταθεί με πρόσθετες λειτουργίες προσαρμοσμένες στις ανάγκες σας. Λειτουργεί τέλεια με σελίδες και έγγραφα που δεν είναι πολύ περίπλοκα και δεν θα χρησιμοποιηθούν σε πολλά μέρη.