Η επίδραση των θεραπειών για τον καρκίνο της ουροδόχου κύστης σε άλλες διεργασίες του σώματος ποικίλλουν ανάλογα με τον τύπο της θεραπείας. Η σεξουαλική λειτουργία, ειδικά η παραγωγή σπέρματος, μπορεί να επηρεαστεί από τη ριζική κυστεκτομή. Επίσης, βλάβη στα νεύρα της πυελικής χώρας μπορεί να προκαλέσει προβλήματα στη στύση. Οι κενώσεις του εντέρου μπορούν και αυτές να επηρεαστούν από ακτινοθεραπεία και να εμφανιστεί διάρροια.