Η γενική αναισθησία είναι γενικά ασφαλής, αλλά όπως όλες οι ιατρικές διαδικασίες, ενέχει ορισμένους κινδύνους. Οι συνήθεις παρενέργειες περιλαμβάνουν ναυτία, έμετο, πονόλαιμο και μυϊκούς πόνους. Οι πιο σοβαρές αλλά σπάνιες επιπλοκές μπορεί να περιλαμβάνουν αλλεργικές αντιδράσεις, αναπνευστικές δυσκολίες και αλλαγές στον καρδιακό ρυθμό ή την αρτηριακή πίεση. Οι ασθενείς με ορισμένες ιατρικές παθήσεις, όπως προβλήματα καρδιάς ή πνευμόνων, ενδέχεται να έχουν αυξημένο κίνδυνο επιπλοκών. Ο αναισθησιολόγος λαμβάνει υπόψη όλους αυτούς τους παράγοντες κατά τον σχεδιασμό και τη χορήγηση της αναισθησίας. Είναι σημαντικό για τους ασθενείς να συζητούν το ιατρικό ιστορικό τους, την τρέχουσα κατάσταση της υγείας τους και τυχόν ανησυχίες με τον αναισθησιολόγο πριν από τη χειρουργική επέμβαση. Οι πληροφορίες αυτές βοηθούν στην ελαχιστοποίηση των κινδύνων και στην εξασφάλιση της ασφαλέστερης δυνατής εμπειρίας.