Με βάση τη σύστασή τους οι λίθοι, δηλαδή οι πέτρες, διαχωρίζονται σε διαφορετικές κατηγορίες καθώς και έχουν διαφορετικούς τρόπους αντιμετώπισης:
Λίθοι ασβεστίου: είναι οι πιο συχνές «πέτρες» που οδηγούν σε λιθίαση. Το ασβέστιο είναι το βασικό στοιχείο της πέτρας και δημιουργεί διάφορες ενώσεις με οξαλικά οξέα, φώσφορο κ.α.
Λίθοι στρουβίτη: είναι συχνοί σε γυναίκες με επαναλαμβανόμενες λοιμώξεις ουροποιητικού συστήματος.
Λίθοι ουρικού οξέος: είναι πιο συχνοί σε άνδρες.
Λίθοι κυστίνης: δημιουργούνται σε άτομα που πάσχουν από κυστινουρία, μια κληρονομική νόσο που εμφανίζεται τόσο σε άνδρες όσο και σε γυναίκες.