Η κρυοθεραπεία θεωρείται μια ασφαλής θεραπευτική μέθοδος με λίγες σχετικά επιπλοκές, οι συχνότερες των οποίων είναι η υπομελάγχρωση, η υπερμελάγχρωση και η δημιουργία ουλών.