Η συχνότητα χρήσης εξαρτάται από το μέγεθος και τη χρήση του βόθρου. Γενικά, συνιστάται η χρήση ενζύμων μία φορά το μήνα για τη συντήρηση του συστήματος και την αποφυγή συσσώρευσης αποβλήτων.