Οι αιτήσεις για το ΚΟΤ υποβάλλονται ηλεκτρονικά μέσω της ιστοσελίδας της ΗΔΙΚΑ. Κάθε χρόνο γίνεται επανέλεγχος των προϋποθέσεων ένταξης στο ΚΟΤ. Οι δικαιούχοι του ΚΟΤ θα πρέπει να υποβάλλουν αίτηση ένταξης κάθε χρόνο εντός ενός μήνα από τη λήξη της προθεσμίας υποβολής των δηλώσεων φόρου εισοδήματος φυσικών προσώπων καθώς και της ενδεχόμενης παράτασής της.