Και οι δύο αυτές ειδικότητες πραγματεύονται παθήσεις του γαστρεντερικού σωλήνα, ο οποίος ξεκινά από τη στοματική κοιλότητα και καταλήγει στον πρωκτό. Ειδοποιός διαφορά των δύο ειδικοτήτων είναι το σημείο εξειδίκευσης, καθώς και η χειρουργική ιδιότητα του πρωκτολόγου, έναντι του γαστρεντερολόγου.