Τα οφέλη από την εφαρμογή ενός Συστήματος Διαχείρισης ποικίλουν ανάλογα με το Σύστημα Διαχείρισης που θα εφαρμόσει μια επιχείρηση (Ποιότητας, Περιβαλλοντικό, Ασφάλειας Πληροφοριών, Ασφάλειας Τροφίμων, Υγείας και Ασφάλειας εργασίας). Ωστόσο, ανεξάρτητα από το Σύστημα που θα εφαρμοσθεί υπάρχουν γενικά οφέλη όπως:
• Βελτίωση της ικανοποίησης του πελάτη και των ενδιαφερομένων μερών.
• Αύξηση εμπιστοσύνης, φερεγγυότητας και κύρους της επιχείρησης.
• Καθορισμός υπευθυνοτήτων και αρμοδιοτήτων σε όλο το εμπλεκόμενο προσωπικό.
• Βελτίωση της απόδοσης της επιχείρησης.
• Γρήγορη εκτέλεση διορθωτικών ενεργειών.
• Συμμόρφωση με απαιτήσεις νομοθεσίας.