Μόνο τα φυτικά κεριά μπορούν να λιώσουν στο φούρνο μικροκυμάτων. Παρόλα αυτά το λιώσιμο του κεριού σε φούρνο μικροκυμάτων είναι μία μέθοδος που δεν προτείνουμε διότι δημιουργούνται hot spots στο κερί, το οποίο έχει ως αποτέλεσμα να μην μπορούμε να ελέγξουμε την θερμοκρασία του, κάτι που οδηγεί στην ανομοιομορφία της θερμοκρασίας του κεριού και τη μεταβολή της σύστασης του. Η προτεινόμενη μέθοδος λιωσίματος κεριού είναι με τη χρήση μπαιν μαρί.