Der vernetzte Unterricht ist das Kernstück des Marchtaler Plans. Er betrachtet die Dinge ganzheitlich, (immer vom Ausgangspunkt der religiösen Komponente des Themas). Der Vernetzte Unterricht hebt die herkömmliche Gliederung der Unterrichtsinhalte nach Fächern auf und stellt sie so dar, dass die ihnen innewohnenden Aspekte fächerübergreifend zum Tragen kommen. Vernetzt werden die Fächer Religion, Deutsch, Heimat- und Sachkunde, Kunsterziehung und Musik. Die Wechselbeziehungen der Unterrichtsinhalte, ihre theologische, ethische, soziale und personale Bedeutung sowie die Belange des Kindes sind integriert in eine ganzheitliche Sicht des Menschen. Im Vernetzten Unterricht lernen die Kinder, dass Sachen oder Vorgänge immer mehrere Seiten haben, lernen besser, Zusammenhänge zu erkennen und in Zusammenhängen zu denken.