Forschungsergebnisse legen nahe, dass die Einnahme von Probiotika morgens auf nüchternen Magen die Überlebensrate der zugeführten Bakterien erhöht. Obwohl der pH-Wert im leeren Magen deutlich niedriger ist, durchlaufen die in Flüssigkeit aufgenommenen Bakterien innerhalb von 20 bis 30 Minuten den Magen und erreichen ihren Zielort, den Darm. Im Gegensatz dazu verbleiben die Bakterien, die mit der Nahrung aufgenommen werden, mehrere Stunden im Magen, wo sie aufgrund des pH-Werts geschädigt werden.