Normalerweise geht ein Knochenaufbau nur mit wenigen Risiken einher. Nach der Behandlung kann es zu Schwellungen, Blutergüssen sowie Rötungen im Behandlungsareal kommen. Diese klingen in der Regel nach wenigen Tagen selbstständig wieder ab. Weiterhin kann nicht ausgeschlossen werden, dass es durch das Eingreifen in den Mundraum zu Entzündungen oder Infektionen kommt, die sich jedoch im Nachhinein auch gut behandeln lassen. Sehr selten verwächst der eingebrachte Knochen nicht mit dem bestehenden Knochen, so dass er wieder entnommen werden muss. Weiterhin können bei der Behandlung Nerven verletzt werden, so dass es eventuell vorübergehend zu einem Taubheitsgefühl oder anderen Empfindlichkeitsstörungen kommt.