Die Unterschiede zwischen FFP2- und FFP3-Masken liegen hauptsächlich in ihrer Schutzwirkung und den zulässigen Einsatzbereichen.
FFP2-Masken bieten eine Filtrationseffizienz von mindestens 94 Prozent gegen Partikel bis zu einer Größe von 0,6 Mikrometer. Sie bieten Schutz vor festen und flüssigen Aerosolen und können in Situationen wie dem Umgang mit Holzstaub, Metallstaub und biologischen Aerosolen (z. B. Bakterien und Viren) eingesetzt werden.
FFP3-Masken haben eine höhere Filtrationseffizienz von mindestens 98 Prozent gegen Partikel bis zu einer Größe von 0,6 Mikrometer. Sie bieten Schutz vor höher konzentrierten festen und flüssigen Aerosolen und können in Situationen, wie dem Umgang mit krebserzeugenden und radioaktiven Stoffen oder biologischen Aerosolen (z. B. Bakterien und Viren), eingesetzt werden. FFP3-Masken bieten einen höheren Schutz als FFP2-Masken, sind aber auch teurer und unbequemer zu tragen, da sie aufgrund ihrer höheren Filtrationseffizienz das Atmen etwas erschweren können.