Die Gebühren für die Erlangung einer eTA hängen von der Gültigkeitsdauer und der Art der erlaubten Einreise ab. Für die eTA, die fünf Jahre lang gültig ist und mehrere Einreisen zulässt, beträgt die Regierungsgebühr USD $5.50 pro Antragsteller. Zu diesen Gebühren können noch weitere Nebenkosten hinzukommen, wie z. B. Gebühren für die Bearbeitung des Antrags oder für Online-Hilfe beim Ausfüllen des eTA-Antragsformulars.