Ein übermässiger Konsum ist wie bei allen anderen Nahrungsmitteln auch beim Puff-Quinoa nicht zu empfehlen. Denn in Quinoasamen ist ein hoher Anteil an Saponinen und Phytinsäure enthalten, natürliche Stoffe mit denen sich die Pflanze gegen Fressfeinde schützt.
Obwohl beide Stoffe auch positive Eigenschaften haben, etwa wie die Verhinderung von Prostata-, Brust- und Bauchspeicheldrüsenkrebs, stehen diese in Verdacht die Aufnahme von Mineralstoffen im Körper zu verhindern. Mehr wie eine Hand voll Puff-Quinoa sollte es daher täglich grundsätzlich nicht sein.