Klar kannst du das - solange sie noch nicht eingesammelt, also gecaptured, wurde (denn dann können wir davon ausgehen, dass die Flagge erreichbar ist und es gibt keinen Grund sie zu verschieben ;-)).
Das ist ganz einfach: öffne in der App die Kartenansicht und markiere deine gewünschte Flagge. Unter den Detail-Informationen "i" klickst du auf den Menüpunkt "Position". Nun kannst du die Flagge innerhalb des grünen Bereichs verschieben. Andere Flaggen in der Nähe werden dir zur Hilfe angezeigt, so dass es zu keinen Kollisionen kommen kann.