Zum Schutz vor FSME gibt es eine Impfung. Der Impfplan in Österreich empfiehlt sie ab dem vollendeten ersten Lebensjahr. Die Impfung erfolgt in Form von zwei Injektionen im Abstand von ein bis drei Monaten sowie einer Auffrischungs-Impfung nach einem Jahr. Abhängig von Impfstoff-Hersteller und Alter der Patientin oder des Patienten, werden danach Auffrischungs-Impfungen alle drei bis fünf Jahre empfohlen. Der Impfschutz ist gut, die Nebenwirkungen sind gering.