Wie der Fachbegriff Follicular Unit Extraction sagt, werden die Haarwurzelgruppen einzeln aus dem Hinterkopf entnommen (Extraction), unter dem Spezialmikroskop auf Unversehrtheit geprüft und dann in die für die Implantation benötigten Gruppen mit jeweils 1 bis 3 oder 4 Haaren (Grafts) sortiert.
Diese Gruppen werden nach Einsatzgebiet gebildet. Dort, wo mehr Deckhaar benötigt wird, werden dichtere Grafts von z. B. 3 Haaren eingesetzt. Während an Stellen, wo normalerweise nur einzelne Haare stehen, auch nur Einzelhaare eingesetzt werden. Damit später auch die Wachstumsrichtung der Implantate mit dem natürlichen Wachstumsverlauf der Haare übereinstimmt, werden die Grafts auch dafür sortiert und vorbereitet.
Während der Präparation der Haare befinden sie sich in einer hygienischen Nährstofflösung. Bei größeren Transplantationen arbeiten zwei Experten parallel, um die Behandlungszeit der Patienten zu reduzieren.