Wenn Beschwerden länger als 3 Monate bestehen und immer wieder Keime im Urin festgestellt werden, spricht man von einer chronischen Prostatitis. Bestehen Symptome ohne Keimnachweis, spricht man von einer abakteriellen Prostatitis oder dem Beckenschmerzsyndrom, dessen Ursachen vielfältig sein können. Die Therapie kann medikamentös erfolgen, auch physikalische Therapien zeigen Wirkung. Trotz eines oft monatelangen Verlaufs ist die Prognose im Allgemeinen gut.