In der Homöopathie werden die Wirkstoffe, die für die Herstellung gebraucht werden, aus der Natur bezogen. Das können Pflanzen, deren Teile, tierische Wirkstoffe oder aber auch mineralische Stoffe sein. Seltener werden auch synthetische Wirkstoffe verwendet.
Bekannte Wirkstoffe sind Arnica, Belladonna, Echinacea oder Chamomilla. Diese Stoffe kommen unter anderem als Einzelmittel, Globuli oder Salben zum Einsatz.