Aus grundsätzlichen Erwägungen sollen Schwangere und stillende Mütter mit einem Arzt Rücksprache halten, wenn sie Fenchel zu medizinischen Zwecken konsumieren. Vorsicht ist gleichermaßen bei Säuglingen und kleinen Kindern angezeigt. In sehr seltenen Fällen wurde bei der Anwendung von Fenchel von allergische Haut-, Magen- und Darmreaktionen berichtet.