Der in einer gesunden Harnblase vorhandene Urin ist keimarm, jedoch nicht wie lange angenommen frei von Bakterien. In der Harnröhre kommt der Urin mit weiteren Bakterien in Kontakt. Die Bakterienlast bzw. das Spektrum kann per Urinkultur bestimmt werden. Auch gibt es weitere Marker im Urin, die auf das Vorhandensein einer unphysiologisch großen Menge von Bakterien hinweisen können. Die Bakterienzahl gilt erst nach dem Überschreiten eines bestimmten Grenzwertes als unnormal und krankheitsverursachend.