Je nach Art und durchführender Einrichtung variieren die Kosten. Bei Aidshilfen und Gesundheitsämtern sind die Tests kostenlos oder es fällt eine geringe Gebühr an. Außerdem werden die Tests in diesen Einrichtungen anonym durchgeführt. Auch Selbsttests für zu Hause sind anonym und Kosten etwa 20 Euro. In Arztpraxen sind die HIV-Tests nicht anonym. Bei einem begründeten Verdacht auf eine HIV-Infektion werden die Kosten meist durch die Krankenkassen getragen – andernfalls werden bis zu 50 Euro fällig.