Die violette Farbe des Amethyst-Steins ist in vielen Farbvariationen vorhanden. Sie reicht von einem sehr hellen Rosa bis hin zu einem sehr dunklen Violett. Innerhalb des Steins ist der Farbverlauf ungleichmäßig. Oft gibt es einen Bereich im Edelstein, der besonders stark violett eingefärbt ist. Die Farbe des Edelsteins hängt meist von der Herkunft ab. Je nach Land und dem dortigen Fundort hat der Amethyst unterschiedliche Farbakzente. Diese sind in der Regel Violett, aber auch Grün oder Rot sind möglich. Ein grüner Amethyst wird Prasiolith genannt.