Anders als bei DNA fällt der Farbstoff des FlashGels während der Elektrophorese wieder von der einzelsträngigen RNA ab, wodurch diese nicht permanent sichtbar bleibt.
Nach Ende der Elektrophorese muss man ca. 10 Minuten warten, dann lagert sich der Farbstoff an und die RNA-Banden werden sichtbar.
Tipp: bei der Elektrophorese einen DNA-Marker mitlaufen zu lassen, hilft bei der Verfolgung der Lauffront.