Spatial CUT&Tag kombiniert die Charakterisierung von genomweiten Proteinbindungsmustern an Chromatin mit mikrofluidikgestütztem Barcoding, um die räumlichen Informationen der Probe zu erhalten, gefolgt von Hochdurchsatz-Sequenzierung. Bei CUT&Tag (Cleavage Under Targets & Tagmentation) lenkt ein Antikörper gegen ein Protein von Interesse ein Protein-A- und/oder G-Tn5-Transposase-Fusionsprotein zu einer definierten Genomregion für die Chromatinfragmentierung. Amplifikations- und Sequenzierungsprimer werden an die Transpositionsprodukte angehängt, die anschließend sequenziert und kartiert werden. Spatial CUT&Tag umfasst zwei Markierungsschritte unter Verwendung eines mikrokanalgesteuerten Flusses vor der Sequenzierung, um die in situ-Lokalisierungsinformationen der Chromatinfragmente zu erhalten.