Der Beschuldigte erfährt spätestens beim Ermittlungsrichter, in welche Justizvollzugsanstalt er verbracht wird. Meistens handelt es sich dabei um die zuständige JVA am Ort der Verhaftung. Der Wohnort hat hier keinen wirklichen Einfluss. Ist der Beschuldigte in Berlin wohnhaft, wird aber in München festgenommen, so wird er einer bayerischen Justizvollzugsanstalt zugeordnet.
Bei mehreren Festnahmen (Gruppe von Tätern) werden die Beschuldigten getrennt voneinander inhaftiert, wodurch auch verschiedene Justizvollzugsanstalten in Anspruch genommen werden. Auch die gesundheitliche Verfassung des Festgenommenen oder fehlende Kapazitäten vor Ort können bei der Zuteilung eine Rolle spielen.
Ein Recht auf Verlegung, etwa an eine dem Wohnort nahe JVA hat der U-Häftling nicht. Dennoch kann mithilfe eines Strafverteidigers versucht werden, eine Verlegung zu erreichen.