Manche Wacholder (z.B. Virginawacholder) bekommen im Winter ganz natürlich eine braune Nadelfarbe. Das sieht im ersten Augenblick bedenklich aus, ist aber kein Problem für einen Bonsai. Pünktlich im Frühjahr werden die Nadeln wieder grün.
Auch viele Wacholdersorten werden etwas brauner im Winter. Solange der Wacholderbonsai gut gepflegt ist, ist das kein Problem.