Biologische Abbaubarkeit von Stoffen beschreibt vor allem den Abbau durch natürlich vorkommende Mikroorganismen, z.B. Bakterien, Hefen oder Pilze. Diese zersetzen die Moleküle, um sich zu ernähren, und greifen dabei chemische Strukturen an, die anfälliger für den mikrobiellen Zerfall als andere sind. Daher werden zum Beispiel Pflanzenöle schneller biologisch abgebaut als Erdöl.