Auf der Lernplattform von Orthomol wird zwischen Lernprogrammen und Kursen unterschieden. Ein Lernprogramm besteht aus mehreren Kursen und ist immer einem Oberthema zugeordnet. So gibt es z.B. ein Lernprogramm zum Thema „Immunsystem“. Darunter fallen dann die Kurse zum Thema „Immunsystem für Erwachsene“, „Unser Darm“ oder „Immunsystem von Kindern“.