Amöben können neben ihrer aktiven Form auch eine ruhende Dauerform, die sogenannten Zysten bilden. Während die aktive Amöbenform den oberen Dickdarm besiedelt, kommen die Zysten vor allem im unteren Dickdarm vor. Dort können sie entweder bis zu Jahre verbleiben oder über den Stuhl ausgeschieden werden. Die Zystenform der Amöben ist robuster und überlebt länger als die aktive, bewegliche Form der Amöben.