Ja, wird sie. Obwohl Zitronenmelisse sehr robust und wenig anfällig ist, gibt es doch ein paar Sachen, die sie sich einfangen kann. Echter Mehltau, Blattfleckenkrankheit und Rost gehören dazu, aber auch Schild- und Blattläuse mögen Zitronenmelisse. Wanzen, Zikaden und der Grüne Schildkäfer lieben die Pflanze ebenfalls.