Die Erweiterung von SMAI auf nicht-lineare Transformationen könnte die Integration von Einzelzellendaten verbessern, indem sie flexiblere Anpassungen an die Datenstruktur ermöglicht. Nicht-lineare Transformationen können komplexere Beziehungen zwischen den Daten erfassen und somit eine präzisere Ausrichtung ermöglichen. Dies könnte besonders nützlich sein, um lokale Diskrepanzen zwischen Zelltypen oder spezifischen Genen zu berücksichtigen, die in den linearen Modellen möglicherweise nicht erfasst werden. Durch die Integration nicht-linearer Transformationen könnte SMAI eine verbesserte Genauigkeit und Robustheit bei der Datenintegration bieten, insbesondere in komplexen biologischen Systemen.