Hat man sich erst mal für ein Modell entschieden, kommt der nächste Schritt, die Wühlmausfalle richtig aufstellen. Drahtfallen werden ebenso wie Kastenfallen und Röhrenfallen direkt in den unterirdischen Gang der Wühlmaus platziert. Zangenfallen werden von oben in den Wühlmausgang platziert.
Bei den Schussfallen gibt es Modelle, die oberirdisch platziert werden, und Modelle die in die Wühlmausgänge gelegt werden. Beim Aufstellen der Fallen sollten immer Handschuhe getragen werden. Wühlmäuse riechen ansonsten den Menschengeruch und meiden die Falle.