Selen ist ein Spurenelement, das nicht nur sehr wichtig für die Synthese von Schilddrüsenhormonen ist, sondern zudem auch noch Entzündungsprozesse abmildern kann. Daher wird Selen auch bei Autoimmunerkrankungen der Schilddrüse wie der Hashimoto-Thyreoiditis oder dem M. Basedow eingesetzt. Es ist bislang allerdings wissenschaftlich noch nicht abschließend geklärt, ob die zusätzliche Einnahme von Selen durch Nahrungsergänzungsmittel bei diesen Erkrankungen tatsächlich die Funktion der Schilddrüse verbessert oder zu einem günstigeren Krankheitsverlauf führt. Das wird von vielen Experten bezweifelt. Anders sieht das bei schilddrüsenbedingten Glupschaugen aus. Diese treten im Rahmen einer sogenannten endokrinen Orbitopathie bei einem Teil der Patienten mit einem M. Basedow auf. In verschiedenen wissenschaftlichen Studien konnte gezeigt werden, dass die Rezeptur von 200 Mikrogramm Selen täglich einen nachweisbar günstigen Einfluss auf die endokrine Orbitopathie und die Glupschaugen beim M. Basedow hatten.