Zu Beginn des Zyklus bewirkt das follikelstimulierende Hormon (FSH) der Hirnanhangsdrüse die Bildung von Eibläschen (Follikel) in den Eierstöcken. Die Follikel produzieren dabei Östrogene und Eizellen. In der Zyklusmitte bildet die Hirnanhangdrüse dann eine große Menge an luteinisierendem Hormon (LH), welches das Platzen des reifsten Eibläschens, den sog. Eisprung, bewirkt. Dieses gelangt in den Eileiter, zerfällt dort und wandelt sich zu einer kleinen Drüse, dem Gelbkörper. Er produziert das Gelbkörperhormon Progesteron. Gemeinsam bereiten Östrogene und Progesteron die Gebärmutter in jedem Zyklus auf eine Schwangerschaft vor. Die Östrogene sorgen schon während der Blutung für den Aufbau der Gebärmutterschleimhaut. Zudem machen sie den Gebärmutterhals für eventuell ankommende Samen durchlässig, indem sie den dort befindlichen Schleimtropf verflüssigen.
Nach dem Eisprung hält der Gelbkörper die Gebärmutter 12 bis 16 Tage in Bereitschaft für die Einnistung eines Embryos. Wenn es nicht zu einer Schwangerschaft kommt, nimmt seine Hormonproduktion ab, die Gebärmutterschleimhaut wird abgestoßen und die Monatsblutung beginnt. Manche Frauen leiden zum Ende ihres Zyklus unter der starken Abnahme der Hormonmenge, was sich unter anderem in Niedergeschlagenheit, Müdigkeit und Kopfschmerzen äußern kann. Diesen Zustand nennt man prämenstruelles Syndrom (PMS).