Mt. Gox wurde mehrfach aufgrund gröberer Sicherheitslücken gehackt. Im Jahr 2014 stahlen Hacker bei einem der vielen Angriffe auf die Börse zwischen 2010 und 2013 rund 740.000 Bitcoin im Wert von heute 15 Milliarden US-Dollar. Zur Insolvenz trug jedoch auch die Veruntreuung von Geldern durch den CEO Mark Karpèles bei, der im Jahr 2019 für sein Vergehen verurteilt wurde.