Die Lebenserwartung von Männern mit Klinefelter-Syndrom unterscheidet sich nicht wesentlich von der der übrigen Bevölkerung, obwohl sie in der Regel etwa 2 oder 3 Jahre unter dem Durchschnitt für Männer liegt.
Männer mit dieser Erkrankung können ein völlig normales Leben führen. Sie haben jedoch ein erhöhtes Risiko für andere verwandte Gesundheitsprobleme wie Typ-2-Diabetes, Brustkrebs und Autoimmunerkrankungen wie systemischen Lupus erythematodes.