Zwar sind die Ursachen noch unklar, doch vieles deutet darauf hin, dass hormonelle Fehlfunktionen das Lipödem verursachen. Das Auftreten der Krankheit während Schwangerschaften, am Ende der Pubertät oder im Laufe der Wechseljahre ist ein Argument dafür. In diesen Phasen kommt es jeweils zu starken Veränderungen im Hormonhaushalt. Zudem kommt das Lipödem oft mehrfach innerhalb einer Familie vor, was auf eine genetische Veranlagung hindeutet. Leider konnte die Forschung bislang nicht die tatsächlichen Ursachen für die krankhaften Fettablagerungen feststellen.