Die Architektur der Kapitänshäuser ähnelt stark der von Friesenhäusern. Beide Haustypen gehören zu den Giebelhäusern, stammen ursprünglich aus dem Norden Deutschlands und weisen einen markanten, vorgezogenen dritten Giebel als architektonisches Stilmittel auf. Doch sie haben einen entscheidenden Unterschied: die Neigung ihres Giebels.
Während der Neigungswinkel eines Kapitänsgiebels 45 Grad beträgt, haben die „Friesengiebel“ oder auch „Zwerchgiebel“ bei Friesenhäusern einen deutlich steileren Neigungswinkel von 65 Grad. Anders als der Kapitänsgiebel setzt der Friesengiebel außerdem direkt über dem Eingangsbereich des Einfamilienhauses an und ziehen sich weniger weit in die Höhe. Ein weiteres Unterscheidungsmerkmal: Friesengiebel werden häufig auf Zwerchdächern verbaut, Kapitänsgiebel hingegen nicht.