Besonders nachhaltig und effektiv gelingt die Desinfektion mit chlorfreien Chlordioxidsystemen. Hier wird hoch reaktives Chlordioxid vollautomatisiert in das Wassersystem vor Ort eingefüllt. Auch der in Rohren festgesetzte Biofilm wird so effektiv entfernt. Im Gegensatz zu Chlor baut es seine Desinfektionswirkung nicht mit steigendem pH-Wert ab und ist bei geringer Konzentration sehr wirksam. Wichtig dabei ist, dass das Desinfektionsmittel in alle Bereiche der kontaminierten Anlage kommen kann, um direkt auf die Keime wirken zu können.
Vorteile und Nachteile der chemischen Desinfektion: Durch den Abbau des Biofilms im System werden die Legionellen sicher und ohne Geruchsbildung abgetötet. Allerdings können bei unsachgemäßem Einsatz von Chemikalien unerwünschte Nebenprodukte entstehen. Bei der chemischen Desinfektion-Methode muss der Prozess daher von Profis detailliert dokumentiert werden.