Obwohl sich Pilates und Yoga auf den ersten Blick sehr ähnlich sehen, bestehen bei näherer Betrachtung deutliche Unterschiede auf. Die Übergänge im Yoga sind fließender und harmonischer. Pilates ist eher dafür ausgelegt, Muskeln gezielt zu beanspruchen. Yoga hat einen philosophisch und religiös geprägten Hintergrund, welche in verschiedene Richtungen gehen können. Pilates ist Training zum Zweck, während Yoga religiöse und philosophische Elemente beinhaltet.