Bei der Darmflora-Analyse wird der Kot Ihres Pferdes analysiert. Hierbei werden gezielt Bakterienstämme identifiziert, die in einer gesunden Darmflora (physiologische Darmflora) vorkommen. Diese werden quantifiziert und Sie bekommen einen Anhaltspunkt, ob die Darmflora verschoben ist, also beispielsweise Keime, die darin vorkommen sollten, reduziert vorliegen oder sogar ganz fehlen.
Auch wird auf obligat pathogene Keime und Bakterien untersucht, also beispielsweise Durchfallerreger, Salmonellen oder Chlostridien.