Der Fachhandel bietet spezielle Tomatendünger in Form von Langzeit- bzw. Flüssigdüngern an, die an die Bedürfnisse von Tomaten angepasst sind. Wer ausschließlich natürlich düngen möchte, kann auch verdünnte Brennnesseljauche, Hornspäne, Hühner- und Pferdemist oder Kompost verwenden. Normaler Blumendünger ist nicht geeignet, er enthält häufig zu viel Stickstoff, der vor allem das Blattwachstum und nicht Blüte und Fruchtbildung fördert.