Mäusebussarde nisten in Waldgebieten, die an offene Landschaften, Wiesen oder Felder, angrenzen. Der Nistbaum muss eine gewisse Größe erreichen, um dem großen Horst sicheren Halt bieten zu können, deshalb wird älterer Baumbestand bevorzugt. Es gibt unter Mäusebussarden allerdings auch Boden- oder Felsenbrüter.