Kernaufgabe der ZSVA oder AEMP im Krankenhaus ist die Aufbereitung von wiederverwendbaren Medizinprodukten wie Operationsbesteck zur Sicherstellung der Patientensicherheit. Zur Sterilgutaufbereitung gehören Reinigung, Desinfektion, Sterilisation, Sortierung und Verpackung ebenso wie die entsprechende Dokumentation dieser Vorgänge nach den geltenden gesetzlichen Vorgaben. Zum Qualitätsmanagement gehört in der ZSVA die räumliche und hygienische Trennung eines sogenannten „reinen“ und eines „unreinen“ Bereich. Durch Lagerung der bereits aufbereiteten medizinischen Instrumente auf der reinen Seite wird ihre Kontaminationen durch ungereinigte Instrumente verhindert.