Ein Match-3-Spiel besteht zumeist aus einem komplett mit Spielsteinen gefüllten, viereckigen Spielfeld. Dort werden Kombinationen aus mindestens drei gleichfarbigen Spielsteinen gesucht, um diese aufzulösen. Dadurch entstehende Lücken werden durch von oben herabfallende Steine aufgefüllt, bis keine Züge mehr möglich sind. Ein Bubble Shooter stellt dieses Spielprinzip quasi auf den Kopf: An der Decke eines rechteckigen Spielfeldes befindet sich zu Beginn eines Levels eine bestimmte Formation aus Bubbles. Am Boden steuert der Spieler einen Schussmechanismus, mit dem Bubbles nach oben geschossen werden, um dort ebenfalls Kombinationen aus mindestens drei Bubbles zu erzeugen. Meistens müssen mit einer begrenzten Anzahl von Schüssen alle Bubbles auf dem Spielfeld aufgelöst werden.