Da Direktbanken meistens über kein eigenes Filialnetz verfügen, stellt sich bei Kunden von Direktbanken häufig die Frage, ob und wie sie Geld auf ihr Konto einzahlen können. Für Einzahlungen bei Direktbanken gibt es je nach Bank zwei Möglichkeiten:
Ist die Direktbank als Tochter an eine Filialbank angeschlossen, so lässt sich bei der übergeordneten Filialbank meist kostenfrei Geld auf das Konto einzahlen. Verfügt die Direktbank nicht über einen Mutterkonzern mit Filialnetz, so muss bei Drittbanken Geld eingezahlt werden. Das ist meist jedoch nicht gerade günstig. Die Drittbanken erheben für eine „Fremdeinzahlung mit Überweisung“ entweder Pauschalgebühren von bis zu 15 Euro, oder aber prozentuale Gebühren mit Mindestgebühr.