Der genaue Verlauf einer Anorexie ist von Person zu Person unterschiedlich. Sie dauert jedoch meist mehrere Jahre an. Im Durchschnitt dauert es sechs Jahre, bis eine Heilung eintritt. Auch nach Besserung der Symptome haben viele Betroffene noch deutliche Schwierigkeiten im sozialen Leben und in Beziehungen. Bei einem Teil der Betroffenen bleiben einige Symptome der Essstörungen bestehen. Auch Rückfälle sind möglich.
Anorexie ist die psychische Erkrankung mit der höchsten Mortalität. Diese erhöhte Sterblichkeit ist auf teils lebensbedrohliches Untergewicht sowie mögliche Suizidalität zurückzuführen.