Eine der größten Herausforderungen ist die starke Ausrichtung vieler Umgebungen auf extrinsische Motivationsfaktoren, wie Belohnungen oder Strafen. Eine weitere Herausforderung liegt in der individuellen Natur der intrinsischen Motivation; was eine Person motiviert, kann für eine andere irrelevant sein, was individuell angepasste Ansätze erfordert.