Je nach Stärke der Glutenunverträglichkeit, äussert sich diese in mehr oder weniger starken Symptomen. Häufig sind Magen-Darm-Beschwerden wie Bauchschmerzen, Blähungen, Durchfall, aber auch Appetitlosigkeit und Müdigkeit sowie unerwünschter Gewichtsverlust können Indikatoren sein.