Neben dem Königreich von Guge entstand ein zweites Machtzentrum, das im weiteren Verlauf die Geschicke Tibets entscheidend bestimmen sollte. Davon berichtet das fünfte Kapitel. Es handelt sich um das Kloster Sakya, dessen Name auf die graue Erde zurückgeht, auf der es erbaut wurde. Es war eine fürstliche Gründung. Die Äbte waren verheiratet und vererbten ihre Würde an einen Sohn oder einen Neffen. Unter ihnen kam schon der Gedanke der Reinkarnation auf.
Als Tibet unter mongolische Verwaltung kam, wurde der Abt Sakya Pandita, berühmt wegen seiner Gelehrsamkeit, an den mongolischen Hof berufen. Zusammen mit seinem zehnjährigen Neffen, Phakpa Lodron Gyaltsen, der mit seinem Charm den ganzen Adel begeisterte,  gelang es ihm, die wilden Mongolen zum Buddhismus zu bekehren. Obwohl sich ein Verhältnis entwickelte, das dem zwischen Kaiser und Papst ähnlich war, blieb Tibet ein mongolischer Vasallenstaat. Nach dem Tod des Onkels Abt von Sakya, freundete sich Phakpa mit dem Prinzen Kubilei, dem Verwalter Tibets an. Der übertrug ihm weitreichende Vollmachten im geistlichen und weltlichen Bereich. Das Kloster Sakya war nun das geistliche und weltliche Zentrum Tibets. Kubilei bestieg schließlich den chinesischen Kaiserthron und ließ sich von Phakpa zum Buddhismus bekehren. Phakpa aber fiel kurz darauf einem Giftmordanschlag zum Opfer. Danach ging es mit der Vormachtstellung Sakyas abwärts. Seine Äbte wurden weiter von den Kaisern unterstützt, mussten aber am Hof der Mongolen residieren. Wegen dieser engen Anlehnung an die Mongolen waren sie im Volk und bei den anderen Klöstern unbeliebt. Als die militärische Macht der Mongolen abnahm, schwand auch die Bedeutung Sakyas dahin.
Chang chub Gyaltsen, der zunächst als Mönch in Sakya gelebt hatte, baute für sich eine neue Machtstellung auf. Er ließ sich von den mongolischen Herrschern in Peking als Nachfolger der Sakya- Regenten bestätigen. Er tat alles, um den alten Glanz der Könige von Tibet wieder aufleben zu lassen. Als die mongolische Dynastie in Peking gestürzt wurde, gelang es ihm, Tibet unabhängig zu machen. Auch seine Nachfolger hielten an der Unabhängigkeit fest. Nach vielen Kämpfen und Auseinandersetzungen fiel die Macht an die Könige von Tsang.
Sakya und seine Abt-Könige haben als Staat im Staate auch neben dem Dalai Lama bis zur Eroberung durch die Chinesen überdauert.