Onion-Seiten werden für eine Vielzahl von Zwecken verwendet. In der Regel geht es jedoch hauptsächlich um Datenschutz und Anonymität, sowohl für Benutzer als auch für Dienstanbieter. Es ist fast unmöglich, die Aktivitäten auf Onion-Seiten zu überwachen, einschließlich der Identität der Personen, die diese verwenden.
Dadurch bietet das Deep Web natürlich Potenzial für illegale Aktivitäten. Aber Onion-Seiten können auch edleren Zielen dienen, wie dem Zugang zu Informationen und unabhängigem Journalismus in Ländern mit staatlicher Zensur. Aktivisten, Whistleblower und Journalisten nutzen das Dark Web auch, um sicher mit Quellen und Nachrichtenorganisationen zu kommunizieren.