Die möglichen Komplikationen hängen immer davon ab, welches chemische Peeling angewendet wurde. Generell gilt: Je oberflächlicher das Peeling ist, desto geringer ist das Komplikationsrisiko. Bei oberflächlichen chemischen Peelings in geringer Konzentration treten oft temporäre Rötungen und Schwellungen der Haut auf, die jedoch schnell wieder verschwinden. Bei mitteltiefen chemischen Peelings mit Trichloressigsäure (TCA-Peelings) kann es zu stärkeren Hautirritationen sowie Pigmentstörungen kommen. In sehr seltenen Fällen gehören unerwünschte Narbenbildungen oder Infektionen zu möglichen Komplikationen. Beim Phenol-Peeling, dem stärksten unter den chemischen Peelings, können ebenfalls alle oben genannten Komplikationen auftreten. Zudem besteht bei einem starken Tiefenpeeling mit Phenolsäure die geringe Möglichkeit einer toxischen Reaktion sowie Herzrhythmusstörungen.