Kommt es bei dem Kontowechselservice zu Fehlern, die in Schäden für den Kunden resultieren oder gegen Fristen nicht eingehalten werden können, haftet in der Regel das Finanzinstitut, sofern dieses verschuldet wurde. Eine finale Aussage ist nicht zu treffen. Kunden können den Schadensersatz bei den Banken einklagen. Zum Beispiel Verzugszinsen bei verspäteter Zahlung oder die Kosten für Lastschriftrückgaben.