Die Prophylaxe dient der Vorbeugung von möglichen Erkrankungen der Zähne, des Zahnfleisches und des Kiefers. Das Hauptaugenmerk gilt dabei der frühen Diagnose der beiden Volkskrankheiten Karies (Kariesprophylaxe) und Parodontitis (Parodontalprophylaxe). Hierbei kommt die professionelle Zahnreinigung (PZR) ins Spiel. Bei dieser werden alle Zähne, Zahnzwischenräume und der Zahnfleischrand gründlich gereinigt und alle harten sowie weichen Zahnbeläge wie Plaque und Zahnstein entfernt. Auch dunkle Verfärbungen und Ablagerungen werden bei dieser Behandlung entfernt. Zahnärzte empfehlen, mindestens zweimal jährlich (bei parodontal erkrankten bis zu viermal jährlich) eine Zahnreinigung machen zu lassen. Doch zur zahnmedizinischen Prophylaxe gehört weit mehr als die professionelle Zahnreinigung. Sie beinhaltet sämtliche vorbeugende Maßnahmen zur Vorsorge und Vermeidung von Erkrankungen sowie grundlegende Empfehlungen wie die korrekte Zahnpflege zu Hause, das gründliche Zähneputzen mit fluoridhaltiger Zahnpasta, regelmäßige Kontrollen beim Zahnarzt und eine gesunde Ernährung. Ziel ist es, die eigenen Zähne so lange wie möglich zu erhalten, vom ersten Milchzahn kleiner Kinder bis zu den bleibenden Zähnen im hohen Alter.