Eine mobile Web-App verhält sich im Idealfall genau so wie eine native App, wird also vom Nutzer nicht wie eine Webseite wahrgenommen, sondern bietet stattdessen eine Benutzeroberfläche, die sich in das mobile Endgerät optisch und ergonomisch integriert. Darüber hinaus erreichen manche Web-Apps durch den Einsatz von JavaScript und HTML5 eine höhere Funktionsvielfalt bis hin zu Videospielen.
Eine mobile Web-App kann prinzipiell auch im Browser eines Desktop-Computers ausgeführt werden. Allerdings blockieren manche Web-Apps diesen Anwendungsfall und laufen nur auf einem mobilen Endgerät.
Mobile Web-Apps haben auf der iOS-Plattform die Besonderheit im Vollbildmodus zu funktionieren, lassen sich über einen WebClip (Home-Icon) starten und sind vom Nutzer kaum von einer nativen Applikation zu unterscheiden.
Die zur Verfügung stehende Datenübertragungsgeschwindigkeit spielt bei WebApps eine wichtige Rolle. Eine langsame Internetverbindung (teilweise auch bedingt durch schlechten Netzempfang) kann zu spürbaren Verzögerungen in der Interaktivität führen. Nachteile von Web-Apps sind, dass sie Hardware-Komponenten wie zum Beispiel Kamera oder Mikrofon nicht ansprechen können und dass viele Smartphone-Nutzer nicht wissen, wie sie eine Web-App installieren können.
Web-Apps sind für mobile Internetnutzer über den vorinstallierten mobilen Browser aufruf- und installierbar. Sie verhalten sich wie mobile Webseiten, verwenden jedoch modernste Programmiertechniken wie AJAX und bieten dadurch ähnliche Funktionen und Eigenschaften an wie native Apps, die fest installiert sind.
Sind in der Anforderungsspezifikation mobiler Apps die Integration von Hardwarekomponenten wie Kamera oder Mikrofon nicht vorgesehen, stellen Web-Apps eine echte Alternative dar. Neben den genannten hardwarespezifischen Aspekten gibt es noch Faktoren, die eine Web-App indirekt beeinflussen. Handelt es sich um eine reine Onlineanwendung, deren dynamische Inhalte stets nur über eine Datenverbindung verfügbar ist, sind Roaming-Gebühren im Ausland ein Hindernis für viele Nutzer mobile Web-Apps z.B. im Urlaub zu nutzen. Das Zwischenspeichern der benötigten Daten in einem lokalen Speicher (Cache) stellt einen praktikablen Ausweg dar, um diese auch im Offline-Betrieb zur Verfügung zu stellen. Allerdings ist die im Gerät zu speichernde Datenmenge extrem gering mit derzeit 2,5 bzw. 5 MB, sodass die meisten Apps nativ entwickelt werden müssen.
Das Unternehmen Adobe bietet die betriebssystemunabhängige Entwicklungsplattform Flex an, mit der sich Web-Apps in native Apps für den Apple App Store oder Google Play umwandeln lassen. Nitobi, ein weiterer Anbieter einer ähnlichen Entwicklungsplattform namens PhoneGap, wurde im Oktober 2011 von Adobe übernommen. Neben den Adobe-Produkten bieten weitere Unternehmen wie Ansca Mobile mit dem Corona SDK und Appcelerator mit Titanium Mobile Lösungen zur betriebssystemunabhängigen Entwicklung mobiler Applikationen an.