Wie bei vielen Gewürzen und Lebensmitteln kann es auch bei Szechuan Pfeffer zu allergischen Reaktionen kommen, obwohl dies relativ selten ist. Personen, die allergisch auf Zitrusfrüchte oder ähnliche Pflanzen reagieren, sollten vorsichtig sein, da Szechuan Pfeffer zur gleichen Pflanzenfamilie gehört. Mögliche Symptome einer allergischen Reaktion können Hautausschläge, Juckreiz, Schwellungen und Atembeschwerden sein. Bei Verdacht auf eine Allergie sollte der Verzehr von Szechuan Pfeffer vermieden und ein Arzt konsultiert werden.