Mit der Generalquittung und Generalbereinigung sollen auch Haftungsrisiken des Geschäftsführers beseitigt werden. Sie werden aber zwischen der GmbH und dem Geschäftsführer vereinbart. Oft erfolgen solche haftungsreduzierenden Vereinbarungen im Rahmen eines Aufhebungsvertrags anlässlich des Austritts des Geschäftsführers aus der GmbH. Die Entlastung wird dagegen durch die GmbH-Gesellschafter beschlossen. Auf diesen Beschluss hat der Geschäftsführer keinen direkten Einfluss.