Die Kosten für eine Hybridheizung variieren je nach Systemkombination, Größe des Hauses und den individuellen Anforderungen. In der Regel liegen die Anschaffungskosten höher als bei herkömmlichen Heizsystemen, werden jedoch durch die staatlichen Förderungen und die langfristigen Einsparungen bei den Betriebskosten kompensiert.