Falls das entsprechende SSD-Protokoll (SATA oder PCIe) unterstützt wird, sind M.2-SSDs mit B+M-Schlüssel auf verschiedenen Motherboards systemübergreifend kompatibel. Einige Motherboard-Hostverbinder sind nur zur Aufnahme von SSDs mit M-Einkerbung und andere wiederum nur für SSDs mit B-Einkerbung konzipiert. Zur Lösung dieses Problems wurden SSDs mit B+M-Schlüssel konzipiert. Jedoch reicht es nicht aus, nur eine M.2-SSD in einem Steckplatz anzustecken, da dies auch von einem gemeinsamen Protokoll zwischen M.2-SSD und dem Motherboard abhängt.