Das FSC selber vergibt weder Label noch Zertifikate. Die Vergabe von einem Siegel erfolgt über unabhängige Prüfinstanzen oder Organisationen, die jedoch vom FSC autorisiert wurden. Diese beurteilen zum einen die Waldwirtschaft und zum anderen die Unternehmen innerhalb der Produktionsketten, nach den jeweiligen FSC- Standards.
Eine FSC- Zertifizierung muss beim FSC selber beantragt werden, wofür für die jeweiligen Unternehmen immens hohe Kosten anfallen.