Die Medizin unterscheidet bei durch HPV verursachte Warzen verschiedene Warzenarten:
Dornwarzen wachsen hauptsächlich an den Fußsohlen und den Fersen. Im Gegensatz zu anderen Warzen wachsen Dornwarzen an den Fußsohlen nach innen. Dies kann die Behandlung erschweren und zum Beispiel Schmerzen beim Laufen hervorrufen.
Planwarzen sind meist sehr kleine, leicht erhöhte Warzen, die vor allem im Gesicht, aber auch an den Händen und Unterarmen auftreten können. Aus der Verschmelzung mehrerer Planwarzen können sogenannte Mosaikwarzen entstehen. Diese haben ein typisches weißliches Erscheinungsbild. Größtenteils entstehen sie an den Fußballen oder unterhalb der Zehen.
Pinselwarzen haben ein charakteristisches fransiges, fadenförmiges Aussehen und treten meist im Gesicht auf.
Feigwarzen oder Genitalwarzen befallen ausschließlich den Genitalbereich und sind sexuell übertragbar. Ihr Erscheinungsbild sind kleine, feste Knötchen.
Gewöhnliche Warzen sind erbsengroße Hautwölbungen, die verhornen, schuppen oder rau werden können. Sie treten vor allem an den Händen, den Fingern, Füßen und Nagelrändern auf.
Weiterhin gibt es sogenannte Mollusken oder auch Dellwarzen genannt, die durch Pockenviren verursacht werden und bevorzugt Augenlider, Rumpf, Beugen, Genitalien befallen. Entgegen den gebräuchlichsten deutschen Bezeichnungen werden Mollusken jedoch nicht zu den Warzen gezählt. Da diese Viren besonders gut in aufgeweichte Haut eindringen können, werden Dellwarzen auch Schwimmbadwarzen genannt.
Auch bei sogenannten Stielwarzen handelt es sich nicht um echte Warzen. Stielwarzen sind kleine, hautfarbene Hautanhängsel, die vor allem am Hals oder an den Achseln auftreten können. Im Gegensatz zu echten Warzen werden Stielwarzen nicht durch Viren ausgelöst und sind auch nicht ansteckend.