Soweit nicht andere Bundesgesetze abweichende Bestimmungen enthalten, gilt der allgemeine Teil des Geoinformationsgesetzes für die ganze Bundesgesetzgebung. Alle Geobasisdaten, die in der Bundgesetzgebung geregelt sind, sollen grundsätzlich diesen allgemeinen Regelungen folgen. Die Kapitel drei (Landesvermessung), vier (Landesgeologie) und fünf (Amtliche Vermessung) des GeoIG (SR 510.62) gehen abweichenden Vorschriften in anderen Bundesgesetzen vor. Bei Änderungen von Fachgesetzen müssen diese das GeoIG berücksichtigen.