Am häufigsten werden die Proteine durch Elektroblotting vom Polyacrylamidgel auf eine Blotting-Membran übertragen. Bei einem Tank Blot (Nasstransfer) wird das Gel zwischen zwei mit Transferpuffer getränkte Pads oder Schwämme gelegt, und eine Membran wie Nitrocellulose oder PVDF wird auf das Gel gelegt. Der Stapel wird dann in eine Elektrophoresekammer gelegt, und es wird ein Strom angelegt, um die Proteine vom Gel auf die Membran zu übertragen. Der Transferpuffer enthält in der Regel ein Puffersystem, das einen pH-Wert und eine Ionenstärke aufrechterhält, die den Proteintransfer unterstützen, sowie Methanol oder Ethanol zur Steigerung der Transfereffizienz. Bei einem "halbtrockenen Transfer" umgeben mit Transferpuffer getränkte Filterpapierpads das Gel und die Membran. Das Sandwich wird in direkten Kontakt mit zwei Elektroden gebracht, über die ein elektrisches Feld angelegt wird. Nach dem Transfer wird die Membran blockiert, um eine unspezifische Bindung von Nachweisantikörpern zu verhindern, und dann mit primären und sekundären Antikörpern inkubiert, die für das betreffende Protein spezifisch sind. Die gebundenen Antikörper werden dann durch Chemilumineszenz oder andere Nachweismethoden nachgewiesen, und das Signal wird mit einem Röntgenfilm oder einem digitalen Bildgebungssystem erfasst.