Die Hauptursache für die Diagnose „Scheidenpilz“ ist eine geschwächte Scheidenflora. Ist sie intakt, weist sie Erreger souverän ab. Zu den Faktoren, die sie schwächen, zählen Hormonschwankungen wie sie für die Schwangerschaft, die Wechseljahre oder die zweite Zyklushälfte vor der Regelblutung typisch sind. Der Hintergrund: Schwankungen im Östrogenspiegel (eventuell auch durch eine Hormonersatztherapie) verändern das natürliche Gleichgewicht im vaginalen Milieu. Mit der Folge, dass sich Keime wie der Scheidenpilz leichter vermehren können.
Auch Medikamente wie Antibiotika, Immunsuppressiva, Arzneimittel mit Kortison oder die Antibabypille können Pilzinfektionen begünstigen. Antibiotika sind dafür bekannt, dass sie zwar krankmachende Bakterien erfolgreich bekämpfen, allerdings zerstören sie die nützlichen Milchsäurebakterien.
Ein weiteres Risiko für die Entstehung eines Vaginalpilzes bergen Erkrankungen, die das Immunsystem beeinflussen, wie beispielsweise Diabetes mellitus oder eine Schilddrüsenunter oder -überfunktion. Als Ursachen nicht zu unterschätzen sind außerdem Stress, psychische Belastungen und eine falsche Intimhygiene.