Die Gründung einer UG nach Musterprotokoll ist effizient und im Vergleich zur Erstellung eines individuellen Gesellschaftsvertrages kostengünstiger. Jedoch können in diesem Dokument keine passgenauen Vereinbarungen zwischen den Gesellschaftern getroffen werden. Die Vorgabe, dass Geschäftsjahr und Kalenderjahr identisch sein müssen, führt vor allem bei Gründungen kurz vor dem Jahresende zu Mehraufwand. Am Ende des Kalenderjahres ist dann verpflichtend ein Jahresabschluss zu erstellen – auch dann, wenn die Gesellschaft erst wenige Wochen zuvor gegründet wurde. Generell bietet der Gesellschaftsvertrag größere Flexibilität bei der Gestaltung der Geschäftsbeziehungen der Gesellschaft.