Östrogene, also wichtige weibliche Sexualhormone, haben auch einen Einfluss auf die Schilddrüse. Das liegt daran, dass Östrogene u. a. die Menge an sogenannten Bindungseiweißen im Blut erhöhen. An diese werden dann auch viele im Blut zirkulierende Schilddrüsenhormone gebunden, sodass diese dann nicht wirksam sind, und somit funktionell eine Schilddrüsenunterfunktion resultieren kann. Das wiederum führt in der Hirnanhangdrüse zu einer vermehrten Ausschüttung von schilddrüsenstimulierendem Hormon (TSH), was wiederum die Schilddrüse zu Mehrproduktion und Wachstum anregt, was wiederum das Risiko für verschiedene Schilddrüsenerkrankungen erhöht. Dieser Östrogen-Effekt ist auch eine mögliche Erklärung dafür, dass Frauen im Vergleich zu Männern etwa drei- bis viermal häufiger unter verschiedenen gut- und bösartigen Schilddrüsenerkrankungen leiden. Anscheinend hat auch das Verhältnis der Geschlechtshormone Östrogen zu Progesteron einen Einfluss auf die Schilddrüse. So wurde z. B. festgestellt, dass bei Patientinnen mit einer Hashimoto-Thyreoiditis überproportional häufig eine relative Östrogen-Dominanz besteht.