Nach wie vor ist unter den Menschen weit verbreitet, dass die Mikrowelle für die Zerstörung von wertvollen B- und C-Vitaminen verantwortlich ist. Allerdings ist dies nur der Fall, wenn das Gemüse zu lang zu stark erhitzt wird. Kochwasser wird im Gegensatz zum herkömmlichen Kochtopf nicht verwendet und somit können die Vitamine nicht an das Wasser abgegeben werden. Daher bleiben diese dann im Gemüse und werden nicht mit dem Kochwasser in den Ausfluss geschüttet.
Lebensmittel werden in der Mikrowelle auf Molekularebene erhitzt. Gesundheitsschädlich ist ein intaktes Gerät nicht, denn die Intensität der Strahlung ist unterhalb der zugelassenen Grenze. Die Struktur von Proteinen wird durch niederenergetische elektromagnetische Strahlung, nicht verändert. Diese ist übrigens nicht nur in der Mikrowelle zu finden, sondern auch beim Handy und WLAN.