Verschmutzungen wirken im Prinzip wie Verschattungen und mindern den Ertrag der Photovoltaikanlage. Da die Module elektrisch in Reihe installiert sind, wirken sich bereits Teilverschmutzungen negativ auf die Leistung aus. Besonders problematisch sind Besiedlungen mit Flechten, die vom Modulrand in die Fläche wachsen.