Der Schlauchmagen ist weniger invasiv als die Magenbypass-Operation, bei der chirurgisch eine neue Verbindung zwischen Magen und Dünndarm hergestellt wird. Der Schlauchmagen hat auch weniger potenzielle Komplikationen und die Patienten sind nicht mit dem anhaltenden Problem von Nährstoffmangel konfrontiert. Trotz dieser positiven Eigenschaften gibt es Patienten, die für dieses Verfahren nicht in Frage kommen oder deren körperliche Verfassung einen Magenbypass als bessere Option erscheinen lässt.