Die Preisspanne der Nattokinase-Präparate hängt von den Faktoren Menge und Hersteller zusammen.
Die günstigeren Varianten starten bei etwa 10 Euro pro 100 g, während es bei den hochpreisigen Nattokinase-Produkten bis zu 100 Euro pro 100 g steigen kann. Der durchschnittliche Preis liegt zwischen 40 – 50 Euro pro 100 g.