Für die meisten Menschen, die die empfohlenen Mengen einnehmen, gilt Ornithin als sicher und gut verträglich. Bei einer Überdosierung von ein  Kombinationspräparat wie L-Ornithin-L-Aspartat (LOLA) können Nebenwirkungen auftreten (6).
Die häufig auftretende Folgeerscheinungen sind:
Übelkeit
Husten
Muskelkrämpfe
Durchfall