Der Wirkstoff ist nicht ohne Grund Apothekenpflichtig. Denn wie alle Arzneien, hat auch Minoxidil Nebenwirkungen. Zu den bekannten Nebenwirkungen gehören Hauttrockenheit auf den behandelten Stellen, aufgrund des Alkohols kann es zu leichtem brennenden Gefühl kommen, falls es in Wunden oder in die Augen kommt. Möglich aber selten sind Kopfschmerzen, Juckreiz oder Hautrötungen. Ganz selten sind hingegen Schwindel, niedriger oder erhöhter Blutdruck sowie Übelkeit und Erbrechen. Es kann auch zu erhöhter Behaarung kommen.