Im Inneren einer Trenntoilette befindet sich ein Trenneinsatz, der dafür sorgt, dass feste und flüssige Ausscheidungen in getrennten Behältern aufgefangen werden. So entsteht ein in sich geschlossenes System, das weder Wasser noch Chemie benötigt. Somit kann eine Trenntoilette autark an jedem Ort eingesetzt werden. Der Trennmechanismus bringt zudem einige weitere Vorteile mit sich. Zum einen wird die Geruchsentwicklung unterdrückt, so dass die Nutzung einer Trenntoilette absolut geruchlos ist. Außerdem lassen sich die getrennten Ausscheidungen hygienisch entnehmen und in Eigenregie entsorgen.