Endo-Sleeve weist ein geringeres Komplikationsrisiko im Vergleich zu anderen Adipositas-Therapien auf und ist insbesondere auch für Patienten mit einem hohen OP-Risiko geeignet. In seltenen Fällen kann es Blutungen an den Nahtstellen im Magen geben oder Verletzungen des Magens sowie der Speiseröhre. Diese Nebenwirkungen können aber sehr gut mit konservativen, endoskopischen Eingriffen behandelt werden.