Der Unterschied liegt in der Richtung, in der das Abwasser den Bodenfilter durchfließt: Bei horizontal durchflossenen Pflanzenkläranlagen fließt das Wasser auf der einen Seite in den Bodenfilter hinein und auf der anderen Seite hinaus. Ein Gefälle unterstützt den Fluss des Wassers. Beim vertikalen Durchfluss wird das Wasser oben aufgebracht und sickert dann nach unten durch. Es gibt auch Kombinationen aus beiden Varianten. Diese Hybridanlagen sind besonders effektiv.