Ja. Die Code-Signierungs-Anforderungen sind von Plattform zu Plattform unterschiedlich. Für Java-JAR-Dateien gelten andere Anforderungen als für portable Windows-Datei. Auch für das Signieren von Anwendungen auf OS X und iOS gelten unterschiedliche Kriterien. Wie und wo Ihre Anwendung(en) verteilt wird/werden, kann auch ein Faktor für die Signatur-Anforderungen sein.
Bitte lesen Sie dazu die GlobalSign Code Signing FAQ-Seite für weitere Informationen.