Wie in der Homöopathie kann auch bei der Bioresonanztherapie die sog. Erstverschlimmerung auftreten. Die Erstverschlimmerung ist eine Verstärkung der Symptome, bedeutet aber, dass der Körper auf die Bioresonanztherapie reagiert und ein Regulationsprozess in Gang gesetzt wurde. Auftretende Reaktionen und Erstverschlimmerungen sollten dokumentiert und im Laufe der Bioresonanztherapie berücksichtigt werden. Der erfahrene Therapeut unterscheidet, ob bei den auftretenden Reaktionen eine homöopathische Erstverschlimmerung vorliegt – oder eine Verschlechterung der Krankheit.