Die nicht-obstruktive bzw. sekretorische Azoospermie kann verschiedene Ursachen haben: genetische Faktoren (Delektionen, Chromosomenveränderungen), erworbene Faktoren (Operation, Trauma), äußere Faktoren (Bestrahlung, Toxine, Medikamente) oder Hodentumor.
Abhängig von der Ursache der nicht-obstruktiven Azoospermie kann es eine Behandlung geben, die eine Wiederherstellung der Spermatogenese ermöglicht. Dies würde es den Spermien ermöglichen, wieder im Samen zu erscheinen.