Abgesehen von Fehlinvestitionen ist das größte Risiko der physischen ETFs der unverschuldete Verlust der Wertpapiere. Das kann passieren, weil sich nahezu jeder ETF-Anbieter vorbehält, die Wertpapiere im Besitz des Fonds zu verleihen – und zwar an andere Anleger, die Leerverkäufe mit Short-ETFs tätigen. Der tatsächliche Besitzer des verleihenden ETFs erhält einen Teil der Leihgebühr. Das erhöht die Rendite, geht aber mit einem Risiko einher: Ist der Leihende zahlungsunfähig, erhält der Anleger seine Wertpapiere eventuell nicht zurück. Die Beteiligung an der Leihgebühr ist als Entschädigung für das Risiko zu betrachten. Denn Anleger tragen in einem solchen Fall das gesamte Risiko für die Wertpapierleihgeschäfte.