Die Hauptindikation für eine Zystektomie ist ein bösartiger Blasenkrebs, welcher über die Schleimhaut der Blase hinweg in die Muskelwand der Harnblase eingewachsen ist. Ebenso kann es bei der Diagnose eines gynäkologischen Tumors oder bei Darmkrebs notwendig sein, die Harnblase ebenfalls zu entfernen, um den Patienten vom Tumor zu heilen. Aber auch gutartige Veränderungen wie eine Schrumpfblase oder Fistelbildungen zwischen den Beckenorganen können eine Blasenentfernung notwendig machen.