Storagenodes laufen auf Festplatten und die Daten auf Festplatten sind immer in einem Filesystem (FS) organisiert. Für den Betrieb eines Storagenodes sollte auf ext4 oder btrfs (Linux) bzw. NTFS (Windows) zurückgegriffen werden. Exfat ist explizit nicht zu empfehlen, da die Blocksize hier zu groß ist und der Storagenode beinahe das doppelte an Speicher auf der Festplatte benötigt. Zudem sind ext4 und NTFS Filesysteme mit Journals, die das Risiko eines Datenverlustes verringern.