Wird die Trippererkrankung nicht behandelt, kann es zu chronischen Verläufen kommen. Die Infektion kann im Becken aufsteigen und bei Männern Entzündungen von Prostata, Nebenhoden und Samensträngen, bei Frauen Entzündungen der Eileiter und Eierstöcke, in späteren Stadien auch des gesamten Beckenraums auslösen. Diese Entzündungen können bei Frauen Eileiterschwangerschaften und chronische Unterleibsschmerzen verursachen. Bei Männern und Frauen können sie zu Unfruchtbarkeit führen.
In seltenen Fällen gelangen die Krankheitserreger auch in den Blutstrom und verbreiten sich im Körper. Dann können wiederkehrende Fieberschübe, schmerzhafte Gelenkentzündungen, Entzündungen von Sehnen und Sehnenscheiden, Knochen und Organen (Herz, Leber, Gehirn) auftreten.