Die Kosten von ETFs ergeben sich im Wesentlichen aus der Gesamtkostenquote (TER), die bei Aktien-ETFs meist nur bei 0,04 bis 0,95 Prozent pro Jahr liegt und u.a. die Verwaltungsgebühren des ETFs enthält. Außerdem zeichnen sich viele ETFs für gewöhnlich durch niedrige Handelskosten und einen geringen Spread, als Differenz aus Kaufs- und Verkaufspreis, aus. Weitere Kosten wie Depotführungsgebühren, Transaktionskosten und Steuern bei ETFs können ebenfalls fällig werden.