Die Behandlung von Enteritis hängt von der zugrunde liegenden Ursache ab. In den meisten Fällen umfasst die Behandlung von Enteritis Maßnahmen zur Linderung von Symptomen und zur Vermeidung von Dehydration wie eine ausreichende Flüssigkeitszufuhr und Elektrolytersatz. Bei bakteriellen Infektionen können Antibiotika verschrieben werden, während bei viralen Infektionen eine symptomatische Behandlung empfohlen wird. Bei schweren Fällen oder Komplikationen kann eine Krankenhauseinweisung erforderlich sein.