Spricht man von „elementarem“ Magnesium, ist damit das reine Magnesium ohne organische oder anorganische Verbindung gemeint. Da Magnesium aber sehr reaktiv ist, kommt es nur als Salz vor, das bei der Einnahme im Magen zu elementarem Magnesium aufgespalten und langsam im Dünndarm resorbiert wird.
Welche Magnesium-Verbindung nun bevorzugt werden sollte, hängt hauptsächlich von der eigenen Verträglichkeit ab. Zu hoch dosiertes Magnesiumcitrat kann bei Personen mit einer höheren Empfindlichkeit zu einer Unverträglichkeit und damit zu Durchfall führen. Vor allem, wenn eine chronische Darmerkrankung bereits vorliegt.
Eine höhere Bioverfügbarkeit, die zwischen den verschiedenen Verbindungen unterschiedlich ausfallen kann, hängt von mehreren Faktoren ab und ist bei Magnesium und seinen Unterarten nicht eindeutig erwiesen.