Die Renaturierung von Filsø begann, nachdem Aage V. Jensen Naturfond den Filsø im Jahr 2010 gekauft hatte. Der Naturfond übernahm den Filsø am 1. Oktober 2011, begann mit der Renaturierung, welche in 2012 mit dem neuen Filsø mit einer Fläche von 915 Hektar fertiggestellt wurde. Die umfangreiche Renaturierung macht den Filsø zu einer der größten Naturrenaturierungen der vergangenen Jahre in Dänemark.