Der größte Unterschied zwischen Süß- oder Meerwasseraquaristik ist das Wasser. Während zur Pflege eines Süßwasseraquariums prinzipiell Leitungswasser verwendet werden kann, wird ein Meerwasseraquarium mit speziell angemischtem Meerwasser gepflegt. Der Handel bietet hierfür zahlreiche Meersalzmischungen und bereits fertiges Meerwasser an. Ein weiterer großer Unterschied besteht in der technischen Ausstattung. Besonders deutlich wird der Unterschied in der Beleuchtung mit völlig unterschiedlichen Spektren für Pflanzen und Korallen. Spezielle Filter und Filtersystem werden für ein gut funktionierendes Meerwasseraquarium benötigt, was besonders zur erfolgreichen Pflege von Korallen von größter Bedeutung ist.