In der Regel ist die Behandlung einer Parodontose nicht schmerzhaft. Sie wird unter Betäubung durchgeführt, wenn dabei die tiefliegenden Zahnfleischtaschen gereinigt und schwer zu erreichende Beläge von dort entfernt werden müssen. Aus diesem Grund müssen Patientinnen und Patienten keine Schmerzen bei der Behandlung befürchten. Auch nach der Behandlung einer Parodontitis sind Schmerzen eher selten, dennoch kann es sein, dass je nach persönlichem Empfinden Schmerztabletten eingenommen werden müssen.
Der Zahn ist nach der Behandlung oft ein wenig empfindlicher zum Beispiel gegenüber Kälte, was beim Essen berücksichtigt werden sollte.