Pokémon Bank hat Sonderzeichen, die auf die Herkunft der Charaktere hinweisen. Das Hisui-Zeichen weist beispielsweise darauf hin, dass das Pokémon ursprünglich in Pokémon Legends: Arceus auftauchte, während das schwarze Kleeblatt auf eine Verbindung mit der siebten Generation von Nintendo 3DS-Spielen hinweist. Helden, die in Gen 6-Spielen debütierten, sind wiederum mit einem blauen Fünfeck gekennzeichnet.