Bei professioneller Ausführung der Bohrungen ist eine Gefährdung des Grundwassers nach menschlichem Ermessen nahezu ausgeschlossen. Trinkwasser stammt nahezu ausschließlich aus oberflächennahen Erdschichten. Um dieses Grundwasser zu schützen, wird vor dem Beginn der Bohrarbeiten ein Standrohr aus Stahl gesetzt und zementiert. Dieses reicht in 70 bis 80 Meter Tiefe, bis unterhalb des ersten Grundwasserstauhorizonts. Innerhalb des Standrohres finden die Bohrarbeiten statt. Die erste Bohrsektion wird bis an die Oberfläche im Standrohr einzementiert. Weiterhin müssen alle angewandten Methoden die Vorgaben des Trink- und Grundwasserschutzes vom Umweltbundesamt erfüllen. Bohrungen müssen mehrwandig aufgebaut werden und so eine sichere Barriere zwischen Tiefenwasser und umliegendem Gestein darstellen. Das geförderte Tiefenwasser kommt zu keinem Zeitpunkt in direkten Kontakt mit den umliegenden Gesteinsschichten. Zudem werden sowohl die Bohrungen als auch das geförderte Thermalwasser ständig überwacht.