Im Vergleich zu anderen erneuerbaren Energieerzeugungsformen sind die Investitionskosten zur Errichtung von Biomasseanlagen relativ gering, während die späteren Betriebskosten höher ausfallen. Dies kann dazu führen, dass die Anlagen nach deren Abschreibung wirtschaftlich nicht fortbestehen können oder ihren Betrieb auf günstigere fossile Brennstoffe umstellen.
Diesem Umstand trägt die Kommission in den Umweltschutz- und Energiebeihilfeleitlinien Rechnung, indem sie Betriebsbeihilfen für Biomasseanlagen auch nach deren Abschreibung als mit dem Binnenmarkt vereinbar ansieht, sofern bestimmte Voraussetzungen erfüllt sind. Dazu gehören die ausschließliche Verwendung erneuerbarer Energien sowie eine regelmäßige Überprüfung, ob die Betriebskosten nach wie vor über dem jeweiligen Marktpreis liegen.