Ein Problem von Floating PV ist, dass es zu diesem Thema aktuell noch keine Langzeitstudien zur Auswirkung auf das Ökosystem gibt. Positive Effekte von Floating PV sind zum Beispiel die durch die Anlage verringerte Wassertemperatur, was die Algenbildung verringert.
Unklar ist bisher aber, ob die Verschattung der Seen noch andere, gegebenenfalls negative, Auswirkungen hat.