Während Ciloxan und sein Ciprofloxacin-Reservoir nach wie vor starke Gegner gegen die meisten bedrohlichen Krankheitserreger sind, gibt es wachsende Bedenken hinsichtlich der Entstehung mikrobieller Resistenzen. In solchen Fällen wird es von enormer Bedeutung, seine Anwendung mit umsichtigem Urteilsvermögen und der wohlüberlegten Abwägung alternativer Behandlungsmethoden zu verbinden.