Atherome stellen meist „nur“ kosmetische Probleme dar und müssen in aller Regel nicht entfernt werden. Vergrößern sie sich allerdings in kurzer Zeit extrem oder entzünden sie sich, so sollten sie operativ entfernt werden. Die Gefahr einer Abszessbildung oder des Platzens der Talgzyste sind zu groß. Im Falle eines Aufbrechens des Atheroms könnte es zu einer Verteilung von Krankheitserregern im ganzen Körper und einer generalisierten Infektion kommen. Bei einer Entfernung wird die Haut zuerst desinfiziert und anschließend die lokale Betäubung gesetzt. Mit einem Schnitt wird die Haut eröffnet und die Kapsel der Zyste präpariert, sodass diese möglichst im Ganzen entfernt werden kann. Abschließend wird die Wunde mit ein paar Stichen genäht.