Im Regelfall benötigt ein Auflauf im Backofen noch eine wesentlich längere Garzeit als das Gratin, dass lediglich zum Überbacken in den Backofen geschoben wird.
Als Gratin bezeichnet man immer eine überbackene (gratinierte) mit einer (Käse)Kruste versehene Speise. Ein Auflauf muss hingegen nicht zwingend überbacken werden.