Die genaue Ursache für Transsexualität ist bis heute nicht ausreichend wissenschaftlich bewiesen. Spezialisten gehen von multifaktoriellen Gründen aus. So wird nicht nur eine angeborene Veranlagung als Ursache für Transsexualität diskutiert, sondern auch genetische und umwelt-/umfeldbedingte Faktoren.