Besonderer Wert wird auf die Untersuchung der Genitalorgane gelegt. Die Untersuchung erfolgt zunächst im Stehen; Sie werden gebeten, Hose und Unterhose auszuziehen. Penis, Hodensack und die Brustdrüsen werden auf äußerliche Veränderungen untersucht. Besonders wichtig sind der Ausschluss oder Nachweis einer Krampfader im Hodensack (Varikozele). Hierbei werden Sie gebeten, tief Luft zu holen, diese anzuhalten und dann zu pressen. Es kann dann der Füllungszustand des Venengeflechts im Hodensack und eventuell der Blutrückfluss bei Bachpresse überprüft werden. Die Untersuchung der Prostata mit dem Finger durch den After ist eine wichtige Untersuchung, da 30 % der Samenflüssigkeit aus der Vorsteherdrüse stammen.