Eine Herzinnenhautentzündung kann durch folgende Faktoren begünstigt werden:
bestehender Defekt am Herzen
vorangegangene Herzklappenoperation (künstlicher Klappenersatz)
zurückliegende Endokarditis
abgeschwächtes Immunsystems
häufig gelegte Venenzugänge (beispielsweise bei Dialysepflicht oder intravenösem Drogenmissbrauch)
Eine Herzinnenhautentzündung manifestiert sich zumeist an einem bereits geschädigten Klappenapparat, sei es auf angeborener oder erworbener Basis. Daher gelten Klappenfehler und Herzfehler als Hauptrisikofaktor für Herzinnenhautentzündungen. Denn diese sorgen für Strömungswirbel an immer gleichen Bereichen, die Läsionen der Herzinnenhaut begünstigen. Im Bereich dieser Läsionen lagern sich Blutgerinnsel auf und bieten günstige Ansiedelungspunkte für zirkulierende Bakterien, die schließlich das Herzinnenhautgewebe zerstören.