Biokraftstoffe werden aus erneuerbaren Rohstoffen hergestellt. Ihre Emissionen bestehen vorrangig aus Kohlendioxid, das die erneuerbaren Rohstoffe, wie z. B. Biomasse, über die Photosynthese aus der Atmosphäre binden. Fossile Kraftstoffe werden aus nicht erneuerbaren Ressourcen hergestellt und setzen Kohlenstoff direkt in die Atmosphäre frei. Aus diesem Grund haben Biokraftstoffe einen wesentlich geringeren CO2-Fußabdruck als fossile Kraftstoffe. Der CO2-Fußabdruck von Biodiesel und Ethanol ist im Vergleich zu fossilen Kraftstoffen um 60–80 % kleiner. Neste MY Renewable Diesel kann den CO2-Fußabdruck sogar um bis zu 90 % verringern.