Die Dauer einer URS ist von vielen Faktoren wie Größe, Lokalisation und Menge der Steine abhängig. Aber auch die individuelle Anatomie und Steinzusammensetzung können sich auf die Operationsdauer auswirken. Die Operation eines kleinen Harnleitersteins kann unter Umständen nur 15 Minuten in Anspruch nehmen. Die Entfernung eines großen Steins in einem schwer zugänglichen Nierenkelch kann 90 Minuten oder mehr betragen.