Die traditionelle Futonmatratze ist mit Baumwolle gefüllt, während moderne Futonmatratzen unterschiedliche Füllungen haben können, wie zum Beispiel Schaumstoff, Latex oder Kombinationen aus verschiedenen Materialien. Jede Füllung hat ihre eigenen Vor- und Nachteile in Bezug auf Komfort, Unterstützung und Haltbarkeit. Während Baumwollfüllungen fest und stützend sind, bieten Schaumstoff- und Latexfüllungen mehr Komfort durch ihre Anpassungsfähigkeit.