Zahlreiche Studien, die die Zusammenhänge zwischen der Darmflora und Neurodermitis bei Kindern und Jugendlichen untersuchten, wiesen nach, dass bestimmte Veränderungen des Mikrobioms das Risiko für Neurodermitis und Allergien erhöhen. Oft bestand ein Mangel an schützenden Bakterien sowie zu eine zu hohe Zahl an Entzündungskeimen im Darm der Betroffenen. Kinder, die viele E. coli Bakterien im Darm hatten, wiesen ein größeres Risiko auf, später Ekzeme zu entwickeln – je höher die Keimzahl, desto wahrscheinlicher. Auch die mit vielen Clostridien bekamen später ebenfalls häufiger Neurodermitis, Asthma und andere Allergien.
In Studien erwies sich unter anderem die längerfristige Einnahme von bestimmten Bakterienstämmen wie Lactobacillus rhamnosus, Lactobacillus reuteri, Lactobacillus fermentum odrr Bifidobacterium lactis als wirksam. Unter anderem ließen sich dadurch der Schweregrad von Ekzemen, Juckreiz und Hautrötung verbessern.