Links im Footer sind schwächer als interne Links im Header, aber nicht automatisch unwichtig. Durch den Footer kannst du z. B. PageRank auf SEO-relevante Seiten leiten, die im Hauptmenü unpassend wären.  Du kannst dort außerdem all jene Verlinkungen unterbringen, die möglichst schnell zugänglich sein müssen (Impressum, Datenschutzerklärung).