Black Berkey-Filter wirken auf 'mechanische' Weise, indem sie die Schadstoffe in den Millionen von Mikrokanälen zurückhalten, aus denen der Filter besteht, und auch dank anderer Schichten, wie der Ionenaustauschmembran oder der Aktivkohle. Für den rein mechanischen Teil wird geschätzt, dass die Filtrationsfeinheit unter 24 Nanometer (0,024 Mikrometer) liegt, was der Größe einiger effektiv gefilterter Viren wie MS2 oder Fr Coliphage entspricht.