Die Kosten für eine Zertifizierung nach ISO 9001 kann man bei kleinen Unternehmen (KMU) in kaum komplexen Industriezweigen recht gut definieren. Hier kostet das Audit und die Ausstellung des Zertifikats zusammen ca. 1.500-3.000 EUR. Schwieriger verhält es sich bei Unternehmen mit komplexen Abläufen und zunehmender Unternehmensgröße. Hier kostet das sehr aufwendige Audit deutlich mehr, da die Risiken deutlich höher sind. Daher kann die Zertifizierung großer Kapitalgesellschaften  schnell über ca. 15.000 EUR kosten.