Einer der größten Nachteile der Portionskapseln ist die hohe Belastung für die Umwelt. Da hier jede einzelne Portion aufwändig verpackt ist und nicht nur der ganze Kaffee, häufen sich in Deutschland rund 2 Millarden Kaffeekapseln an, was einem Abfallberg von über 4000 Tonnen entspricht.
Problematisch ist daran vor allem, dass sie kaum recycelt werden können, da meist Stoffe wie Kunststoff oder Aluminium enthalten sind. Daher wird ein Großteil der Kapseln einfach verbrannt und die Abgase belasten die Luft. Außerdem benötigt die Herstellung solcher Kapseln sehr viel Energie und Ressourcen.
Allerdings werden auch Produkte hergestellt, die sich recyceln lassen und überhaupt weniger belastend für die Umwelt sind. Wem das besonders wichtig ist, sollte also vor dem Kauf die Packung genau studieren und auf einen entsprechenden Vermerk achten.