Nach der Ernte verarbeitet die Bodega El Coto de Rioja ihre Trauben in Oyón weiter. Hier befindet sich das Hauptquartier mit der hauseigenen Kellerei. Die Trauben werden nach der Ernte zunächst in Stahltanks vergoren. Anschliessend steht für den Ausbau der El-Coto-Weine ein riesiges Lager mit Barrique-Fässern aus 80% amerikanischer und 20% französischer Eiche zur Verfügung.
Rotweine von El Coto de Rioja werden mit einem hohen Anteil der Rebsorte Tempranillo oder sortenrein ausgebaut. Zu den Premium-Weinen der Bodega zählen:
Coto de Imaz
Coto Real
Der Coto de Imaz Gran Reserva wird beispielsweise aus 100% Tempranillo-Trauben gekeltert. Anschliessend reift er 24 Monate im Barrique-Fass und danach für weitere 36 Monate in der Flasche. Für die Herstellung des Coto Real werden ausschliesslich beste Trauben von alten Reben mit geringem Ertrag verwendet. Hierzu zählen 10% Tempranillo, 20% Garnacha und 10% Graciano. Die drei Weine reifen für 22 Monate in Barrique-Fässern. Erst hinterher werden sie verschnitten und für weitere 24 Monate in der Flasche gelagert.