Nein, normalerweise treten keine schädlichen Nebenwirkungen auf, selbst nicht bei Überdosierung.
Es kann nur manchmal bei einer hohen L-Carnitin Dosierung zu leichten Magen-Darm Problemen, wie Erbrechen, Übelkeit, Bauchschmerzen, Durchfall oder Bauchkrämpfen führen. Außerdem kann eine Dosis von über 3000 mg pro Tag zu Körpergeruch führen.