Handelt es sich um eine infektiöse Darmentzündung, wie die Magen-Darm-Grippe, sind meist Viren die Auslöser. Aber auch unsaubere oder verdorbene Lebensmittel sind mögliche Infektionsquellen. Bei den nicht-infektiösen Darmentzündungen sind die Ursachen vielseitig, je nach vorliegender Erkrankung. Beispielsweise wird bei Morbus Crohn eine genetische Veranlagung vermutet, während es für die Blinddarmentzündung bislang keine eindeutige Ursache gibt.