Endometriose ist gutartig. Die Erkrankung geht nicht mit einem allgemein erhöhten Krebsrisiko einher. In ganz seltenen Fällen kann sich allerdings auf dem Boden einer Endometriose ein bösartiger Tumor entwickeln - meist Eierstockkrebs. Endometriose tritt manchmal im Zusammenhang mit verschiedenen Krebserkrankungen auf. Dazu gehören zum Beispiel Nierenkrebs, Hirntumore, Schwarzer Hautkrebs, Lymphdrüsenkrebs und Brustkrebs. De klinische Bedeutung ist allerdings noch ungeklärt.