Hier kommt es auf den Grad der Verschmutzung an. Da Arbeitsplatzmatten resistent gegen Wasser und Chemikalien wie Reinigungsmittel sind, können sie im Regelfalle genau so gereinigt werden wie der Rest des Fußbodens. Bei stärkerer Verschmutzung – und wenn der Rest des Bodens üblicherweise per Hochdruckreiniger gesäubert wird – ist darauf zu achten, dass die Matte industriell zu reinigen ist. Für den sensiblen medizinischen Bereich gibt es spezielle Matten, deren Oberfläche das Eindringen von Schmutz und Keinem verunmöglicht. Diese können so gereinigt werden wie der Rest des medizinischen Bereichs, in dem sie zum Einsatz kommen. Beim Einsatz in sterilen Räumen kann die Reinigung mit dem Autoklaven erforderlich sein. Hier ist die Größe zu beachten, da in der Regel nur eine maximale Mattengröße von 60 mal 90 Zentimeter autoklaviert werden kann.