Die Einsätze des Festwinkelrotors stehen in einem festen Winkel zur Rotationsachse (oft 30°) und verbleiben in diesem Winkel während der Zentrifugation. Die Einsätze des Ausschwingrotors hingegen sind nicht fest, bewegen sich zu Beginn der Zentrifugation in die senkrechte Position zur Rotationsachse und verbleiben dort. Nur so kann eine optimale Gel-Trennschicht erzielt werden.