Insgesamt verwendet man bis zu drei verschiedene Brennstoffzellentypen in Heizungsanlagen für Häuser. Jede Brennstoffzelle hat eine eigene Membran- und Zellstruktur und arbeitet unter unterschiedlichen Temperaturen.
Der Hauptunterschied zwischen den Brennstoffzellen ist, ab welcher Temperatur und mit welchen Elementen die Brennstoffzellen gebunden werden um Energie zu erzeugen.Die nachfolgende Tabelle fasst die wesentlichen Unterschiede der Brennstoffzellen, welche sich für die häusliche Einrichtung eignen, zusammen.