Inselhauptstadt ist Iraklio (Heraklion) mit etwa 150 000 Bewohnern. Auf Platz 2 und 3 liegen Chania und Rethymno. Auf den weiteren Rängen folgen Agios Nikolaos, Kissamos und Sitia. Sie alle säumen die Küste des Kretischen Meeres. Im Inselsüden, also am Libyschen Meer, ist Ierapetra die einzige Stadt.