Neuere Indikationen liegen im Bereich der Reproduktionsmedizin, denn das Co-Enzym Q10 hat positive Auswirkungen auf die Spermien und Eizellen. Die Keimzellen sind besonders anfällig für Schädigungen durch oxidativen Stress, was sich negativ auf die Eizell- und Spermienqualität, die Befruchtungsrate, die frühe Embryonalentwicklung und die Einnistung des Embryos auswirkt.
Eine tierexperimentelle Studie mit Mäusen aus dem Jahr 2010 konnte zeigen, dass hohe Dosen Co-Enzym Q10 zu einer Verbesserung der Eizell- und Embryoqualität sowie zu einer Steigerung der Schwangerschaftsrate führen.
Die bei Frauen mit dem Alter zunehmende Fehlbildungsrate kann durch die Einnahme von Co-Enzym Q10 zum Teil reduziert werden. Dies ist vermutlich auf die verbesserte Energiebereitstellung in den Eizellen während des Energieintensiven Prozesses der Chromosomenverteilung im Rahmen der Reifeteilung zurückzuführen.
Bei Männern konnte in vielen Studien nachgewiesen werden, dass die Beweglichkeit der Spermien durch Co-Enzym Q10 gesteigert werden kann.
Eine Studie aus dem Jahr 2016 konnte sogar nachweisen, dass die Verabreichung von Co-Enzym Q10 bei Frauen unter Chemotherapie die Fruchtbarkeit schützen kann. Dies könnte theoretisch bedeuten, dass die regelmäßige, langfristige Anwendung von Co-Enzym Q10 bei Frauen die fruchtbaren Jahre verlängern könnte, allerdings gibt es hierfür bisher keine nachprüfbaren Studien.