In den meisten Fällen entsteht ein Kreuzbiss durch ein Ungleichgewicht der Muskeln im Mundbereich. Die Zunge kann dabei das Wachstum im Oberkiefer nicht unterstützen, was das Wachstum hemmt.
Teilweise kann ein Kreuzbiss auch erblich bedingt sein, zum Beispiel wenn der Unterkiefer im Vergleich zum Oberkiefer zu gross wächst. Unfälle oder Gewohnheiten wie zu langes Daumenlutschen können einen Kreuzbiss zudem begünstigen.