Auch ohne Behandlung können Warzen verschwinden, da die Immunabwehr des Körpers die verursachenden Viren versucht abzutöten. Das dauert jedoch teilweise oftmals Monate bis sogar Jahre.
Vor allem bei Kindern erfolgt eine schnellere Spontanheilung als bei Erwachsenen, bei Jungen schneller als bei Mädchen. Generell kann man damit rechnen, dass innerhalb von 2 Jahren die Hälfte aller Warzen ohne Behandlung von selbst verschwinden (2).