Weizenkeimöl hat eine geringe Oxidationsstabilität. Einmal geöffnet sollte das Öl innerhalb sechs bis acht Wochen gebraucht werden.
Ungeöffnet ist das Weizenkeimöl bis zu einem Jahr haltbar.
Das Weizenkeimöl sollte kühl, gut verschlossen und im Dunklen gelagert werden, damit all seine gesundheitsfördernde Wirkstoffe erhalten blieben.