Bei einer Brachytherapie liegt die Strahlenquelle entweder in unmittelbarer Nähe zum Tumor oder sie wird direkt in den Tumor eingebracht. Dabei legen die Strahlen im Körper nur einen kurzen Weg zurück. „Kurz“ heißt im Griechischen „brachys“, deshalb wird diese Behandlung auch als „Brachytherapie“ bezeichnet. Bei einer Brachytherapie verbleiben radioaktiv strahlende Teilchen in der Prostata. Diese stellen eine Kontraindikation für die HIFU-Therapie dar. Für diese Fälle eignet sich die IRE/NanoKnife-Behandlung.