Hat ein Mitarbeiter zwei oder mehr Arbeitsstätten, so muss der Arbeitgeber im Vertrag festlegen, welche als Hauptarbeitsstätte zählt. Für diese wird die Pendlerpauschale zur Berechnung der Fahrtkosten in der Steuererklärung genutzt. Die Fahrten zu anderen Arbeitsstätten zählen dann als Dienstreisen.