Die Ärzte und Apotheken, die mit DoktorABC zusammenarbeiten, unterstehen der Kontrolle von zwei voneinander unabhängigen Institutionen. Die Ärzte und die Apotheken besitzen eine Lizenz und unterstehen den zuständigen Aufsichtsbehörden des jeweiligen EU-Staates. Auf der anderen Seite werden die Ärzte und die Apotheken auch streng von DoktorABC überprüft, auch hinsichtlich der Zulassungen als Facharzt sowie der zusätzlichen Qualifikationen.