Wenngleich Pilates und Yoga zum Teil ähnliche Ziele – wie beispielsweise Kräftigung der Muskulatur, Atmungssensibilität, Beweglichkeit und Konzentrationssteigerung – verfolgen, ist die Ausführung und das Übungsrepertoire doch unterschiedlich. Während im Yoga eine Position eingenommen, gehalten und vertieft wird, ist im Pilates die dynamische Bewegung durch die Positionen und der Bewegungsfluss wichtig. Im Gegensatz zu (östlichem) Yoga verfolgt Pilates auch keine spirituellen Ziele.