Der Stoma stinkt, wenn der Aktivkohlefilter kaputt oder verstopft ist durch Essensreste, die der Magen-Darm-Trakt nicht verdauen konnte. Die neuesten Stomabeutel besitzen auch eine Folie mit Geruchsbarriere, die dafür sorgt, dass Gerüche im Inneren Bereich des Beutels eingeschlossen bleiben. Gerüche treten im normal Fall nur beim Wechseln oder Entleeren des Beutels auf.