Der Naturschutz steht im Mittelpunkt der SEA LIFE Mission, sowohl weltweit als auch in lokalen Gebieten.
Überall auf der Welt arbeiten die SEA LIFE Aquarien mit dem SEA LIFE Trust zusammen, um spezifische Kampagnen umzusetzen und das Bewusstsein für den Umweltschutz zu schärfen, z. B. durch Aktionen wie den Global Beach Clean, der jedes Jahr an Orten auf der ganzen Welt stattfindet, von Neuseeland bis zu den USA.
Zusätzlich zu den weltweiten Aktivitäten unterstützen oder initiieren SEA LIFE Aquarien viele wichtige Schutz- und Tierrettungsprojekte in ihren Umkreis. Hierzu gibt eine Vielzahl von Projekten auf der ganzen Welt, darunter die Rettung, Rehabilitation und Auswilderung einer Reihe von Tieren wie Robben oder Meeresschildkröten sowie die Aufzucht und Auswilderung von Tieren wie der Europäischen Sumpfschildkröte in Speyer oder Schutzprojekte wie die vom Aussterben bedrohten Weißen Seepferdchen im Hafen von Sydney - die Liste wird immer länger. Genaue Informationen sind auf den einzelnen Websiten unter „Unser Engagement“ zu finden.