Seit 2018 sind die Kosten nicht mehr festgelegt. Bis Juli 2018 waren die Kosten der Begutachtungsstellen bundeseinheitlich geregelt und dienen heute als grobe Orientierung. Die Gebühren unterscheiden sich je nach Fragestellung. So lag der Preis bei einer MPU wegen Alkohol bei 402,22€, während eine MPU wegen Drogen bei 554,54 kostete.