Die Zahnzyste wird durch einen kleinen Einschnitt entfernt und der verbleibende Raum wird gereinigt und getrocknet. Wenn die Zahnzyste sehr groß ist oder den Mund beschädigt hat, kann der Chirurg einige Teile des Zahns entfernen, z. B. die Zahnwurzel und sogar einen Teil des Kiefers.