Da die Ursachen des chronischen Erschöpfungssyndroms nicht eindeutig geklärt sind, gibt es kein Medikament zur gezielten Heilung. Ein CFS wird deshalb vor allem symptomatisch behandelt. Da es neben der ausgeprägten Erschöpfung auch zu Schmerzen wie Kopfschmerzen, Muskelschmerzen, Gelenkschmerzen kommen kann, können Schmerzmittel zur Linderung der Beschwerden verordnet werden. Beim Auftreten psychischer Probleme wie Angstzuständen oder einer Depression können Psychopharmaka indiziert sein.