Poolroboter lagert man an einem trockenen und frostsicheren Ort, am besten auf einem Pool-Caddy und nicht direkt auf den Bürsten, um diese zu entlasten. Alternativ kann man den Poolroboter auch auf einer Schutzmatte auf dem Rücken lagern. Vor dem Einlagern muss der Poolroboter mit klarem oder leicht seifenhaltigem Wasser gereinigt werden, wobei keine Lösungsmittel verwendet werden dürfen. Nach dem Reinigen wird der Poolroboter gründlich mit klarem Wasser abgewaschen und man lässt ihn dann auf seinem Transportwagen trocknen.   Manche Fachfirmen bieten auch den Service an, dass sie Poolroboter gegen Gebühr über den Winter einlagern.