Wenn die Hypnose von einem fachkundigen und gut ausgebildeten Therapeuten durchgeführt wird, hat die Hypnosetherapie keine Nebenwirkungen. Allerdings gibt es einige Krankheitsbilder mit einer Kontraindikation. Das bedeutet, dass die Hypnose gar nicht oder nur vorsichtig und mit geeigneter Vorbereitung durchgeführt werden sollte. Dies ist z.B. bei bekannten Psychosen oder Traumata der Fall. Ein eingehendes Anamnesegespräch ist daher vor der Behandlung dringend erforderlich.