Derzeit sind etwa 200 verschiedene HPV-Typen bekannt, die in fünf Gruppen eingeteilt werden: Alpha-, Beta-, Gamma-, Mu- und Nu-HPV. Die weitere Einteilung erfolgt in Hochrisiko- und Niedrigrisiko-Typen. Dieses Risiko bezieht sich auf das onkogene Potenzial, also die Wahrscheinlichkeit, dass ein bösartiges Geschwulst entsteht.