Der portugiesische Einlagensicherungsfonds wird im Wesentlichen aus Mitgliedsbeiträgen der einzelnen Banken sowie aus Kapitalerträgen und verhängten Bußgeldern gegenüber Kreditinstituten finanziert. Die Höhe der Mitgliedsbeiträge wird unter anderem durch das Risikoprofil der Bank ermittelt. Je höher das Risiko ausfällt, desto höher ist der Beitrag. Die eingezahlten Mittel werden anschließend risikoarm und diversifiziert angelegt.
Übersteigen die benötigten Finanzmittel bei einem Bankenausfall jedoch den eingezahlten Betrag, kann der Einlagensicherungsfond bei Bedarf Sonderbeiträge erheben. Alternativ besteht zudem die Möglichkeit, dass zusätzliche Gelder unter anderem von anderen Einlagensicherungssystemen, der Bank von Portugal und auch vom Staat bezogen werden.