Koffein wird hauptsächlich in der Leber abgebaut. Die Leber verwendet das Enzym CYP1A2, um Koffein in drei Hauptmetaboliten zu metabolisieren: Paraxanthin, Theobromin und Theophyllin. Diese Metaboliten werden dann über die Nieren aus dem Körper ausgeschieden. Die Fähigkeit der Leber, Koffein abzubauen, kann je nach genetischer Veranlagung und anderen Faktoren wie dem Alter, Geschlecht und der Einnahme bestimmter Medikamente variieren.