Der wesentliche Unterschied zwischen Datenschutz und Informationssicherheit liegt darin, dass der Datenschutz das Recht auf informationelle Selbstbestimmung und den Schutz von personenbezogenen Daten fokussiert, wohingegen die Informationssicherheit auf die Sicherung von Daten in Systemen abzielt. Der Datenschutz schützt also Daten von Bürgern und die Informationssicherheit die Daten von Unternehmen. Da aber auch in Unternehmen personenbezogene Daten verarbeitet werden, kommt es oftmals zur Überschneidung zwischen Datenschutz und Informationssicherheit.
Ein weiterer wesentlicher Unterschied ist aber, dass die Umsetzung des Datenschutz gesetzlich über die Datenschutzgrundverordnung (DSGVO) geregelt ist. Für die Umsetzung der Informationssicherheit gibt es zwar die Leitlinie für die Informationssicherheit des BSI, es handelt sich dabei allerdings nicht um eine gesetzliche Grundlage. Dadurch können Unternehmen unterschiedliche Konzepte einführen.