Milbenstaubsauger lassen sich einfach in regelmäßigen Abständen reinigen. Das wichtigste Element ist der Filterbehälter, in dem der Staub aufgefangen wird. Er ist am besten nach jeder Anwendung zu reinigen: Zuerst den Behälter ausleeren und anschließend mit einem Pinsel säubern. Die Bedienungsanleitung gibt darüber Aufschluss, ob der Staubbehälter unter fließendem Wasser oder in der Spülmaschine gereinigt werden darf. Vor dem erneuten Einsetzen ist darauf zu achten, dass der Behälter trocken ist. Das Gehäuse kann mit einem feuchten Lappen abgewischt werden. Da in einem Matratzensauger viel Elektronik verarbeitet ist, ist der Kontakt mit fließendem Wasser zu vermeiden.