Die FSME-Viren befinden sich im Bereich der Speicheldrüsen der Zecken und werden direkt beim Einstich übertragen. Dennoch sollte die Zecke umgehend entfernt werden, um das Risiko, dass andere Erreger (z. B. Bakterien, die Borreliose auslösen) übertragen werden, zu reduzieren.