Die Hersteller empfehlen, für die Zubereitung der Pre-Nahrung abgekochtes Wasser zu verwenden. Das kann die Zubereitungszeit deutlich verlängern: Das Wasser muss erst abgekocht werden und dann auf die richtige Temperatur abkühlen. Es gibt Untersuchungen unabhängiger Institute, die zu dem Schluss kommen, dass das Abkochen des Wassers in vielen Fällen unnötig ist. Wenn das Wasser am Wohnort nicht durch Bleirohre fließt und eine gute Qualität hat, kann es den Untersuchungen zufolge manchmal besser sein als Flaschenwasser aus dem Supermarkt. Wer sich unsicher ist, kann die Qualität des Leitungswassers beim zuständigen Amt erfragen oder eine Probe untersuchen lassen.
Bei der Verwendung von Leitungswasser sollte das Wasser ein wenig vorlaufen, bevor die Menge für das Fläschchen abgenommen wird. Wenn das Wasser zu lange in den Rohren steht, kann das zur Keimbildung führen. Läuft es aus der Leitung eiskalt nach, ist das ein gutes Zeichen für Frische.