Eine Wickelauflage kann manchmal etwas mühsam zu reinigen sein. Besonders wenn kein Bezug verwendet wird, der meist einfach in die Waschmaschine geworfen werden kann und die Auflage vor Schmutz schützt.
Achte bei der Reinigung unbedingt darauf, dass in allen verwinkelten Ritzen ordentlich sauber gemacht wird. Dort sammelt sich schnell Schmutz und kann empfindliche Babyhaut schnell irritieren.  Der integrierte feuchtigkeitsabweisende Bezug der meisten Wickelauflagen dient auch dem Zweck der schnellen Reinigung. Nimm hierfür einfach einen feuchten Lappen und wische die Oberfläche ab. Benutze hierfür ein Reinigungsmittel frei von Duftstoffen und schädlichen Chemikalien. Am besten du verwendest eine milde Reinigungsseife für Kleinkinder, die sich für leicht verschmutzte Oberflächen eignet.
Beachte die Hinweise auf der Wickelauflage, da einige Auflagen auch für die Waschmaschine geeignet sind. Andere müssen mit laufwarmen Wasser per Hand sauber gemacht werden. Modelle aus Kunststoff müssen meist per Hand gereinigt werden, während Baumwoll-Wickelauflagen in der Waschmaschine gewaschen werden.