Vor allem mit Beginn der Hochfieberphase können schwerwiegende Komplikationen auftreten, die unbehandelt zum Tod führen können. Durch die Ausbreitung der Typhus-Erreger im Körper können sich verschiedene Organe entzünden, teils mit Bildung von Abszessen. Es treten zum Beispiel folgende Erkrankungen auf:
Lungenentzündung
Hirnhautentzündung
Herzklappenentzündung
Gallenblasenentzündung
Bauchspeicheldrüsenentzündung
Knochen- und Knochenmarkentzündung
Daneben kann es zu schweren Darmschädigungen mit Wanddurchbrüchen und Blutungen in die Bauchhöhle kommen. Dies sind lebensbedrohliche Zustände, die einer sofortigen Behandlung bedürfen. Die durch die Sepsis gestörte Blutgerinnung kann zu Gefäßverschlüssen führen.