Über die Frage der Sonderschulen wird in Politik und Praxis heftig gestritten. Die strikten Befürworterinnen und Befürworter der Inklusion sehen in der Behindertenrechtskonvention auch einen Auftrag zur Abschaffung der Sonderschulen. Dagegen steht die Argumentation, dass die Sonderschulen Teil des allgemeinen Schulsystems seien – und so auch zur Inklusion beitragen. In Bayern werden Sonderschulen sogar als „inklusive Schulen“ bezeichnet. Die meisten Bundesländer haben sich für die Beibehaltung von Sonderschulen, auch „Förderschulen“ genannt, entschlossen. Sie begründen dies mit dem „Elternwahlrecht“. Die Eltern sollen entscheiden können, welche Schulform für ihr Kind die beste ist.
Mark Rackles (SPD) sagte im Interview mit dem Schulportal auf die Frage, ob Inklusion langfristig nur ohne Sonderschulen gelingen könne: „Nein, davon geht auch die UN-Behindertenrechtskonvention nicht aus. Vermutlich braucht man einen Anteil von 10 bis 20 Prozent der jetzt bestehenden Sonderschulen. Mit der Konvention verpflichten sich die Länder nicht, die Sonderschulen abzuschaffen, sondern den Anteil an Sonderschulen so weit wie möglich zu reduzieren.“
Der Inklusions-Aktivist Raúl Krauthausen sprach sich im Interview mit dem Schulportal vom 27. November 2018 dagegen für einen konsequenten Ausstieg aus dem Förderschulsystem aus. Erst dann könne Inklusion tatsächlich gelingen. „Solange es Förderschulen gibt, wird es Lehrerinnen und Lehrer an Regelschulen geben, die sagen: Wir können dieses behinderte Kind hier nicht unterrichten. Ein echtes Umdenken werden wir erst erreichen, wenn wir den konsequenten Ausstieg aus dem System Förderschule beschließen“, sagte Krauthausen. Er selbst war vor mehr als 30 Jahren Schüler in der Fläming-Grundschule, einer der ersten inklusiven Schulen in Berlin. Damals habe es noch keine fertigen Konzepte gegeben – und trotzdem sei die Geschichte ein Erfolg. Im Dokumentarfilm „Klassenleben“ wird eine Klasse der Fläming-Grundschule ein Jahr lang begleitet. Zehn Jahre später ist erneut eine Dokumentation entstanden. In „Die Kinder der Utopie“ treffen sich die Schülerinnen und Schüler von damals als junge Erwachsene wieder. Das Schulportal hatte Inklusions-Aktivist Raúl Krauthausen und Regisseur Hubertus Siegert getroffen und mit ihnen über die Entstehung des Films gesprochen.