Je nach persönlicher Grenze der Histamintoleranz, variieren die Form und der Grad der Ausprägung einer Unverträglichkeit von Patienten zu Patienten. Zu den häufigsten Symptomen einer Histaminintoleranz zählen Beschwerden auf der Haut, wie Nesselsucht, Juckreiz sowie gerötet und erwärmte Hautstellen. Oftmals ist auch der Magen-Darm-Trakt in Form von Bauchschmerzen, Krämpfen, Durchfall und Blähungen betroffen. Zusätzlich kann es zu Beschwerden wie Kopfschmerzen, Migräne, Müdigkeit, Herzrasen und einer laufenden oder verstopften Nase kommen.