Die Richtlinie stellt betroffene Organisationen vor diverse Fragestellungen. Manche dieser Fragestellungen können erst abschließend beantwortet werden, wenn die nationale Gesetzgebung verabschiedet ist, oder sich eine gesamtheitlich akzeptierte Vorgehensweise am Markt der Umsetzungsideen etabliert hat. Die technische Umsetzung aller vorgesehenen Meldekanäle muss gewährleistet werden und die lückenlose und, aufgrund von Personalfluktuation, auch regelmäßige Aufklärung der Mitarbeiter hat zu erfolgen. Hier werden sich anhand der laufenden Praxis bestimmte Mindeststandards etablieren. Das Whistleblowing muss durch eine proaktiv geleitete Unternehmenskultur zu einem selbstverständlichen Bestandteil der allgemeinen Compliance, bis hinunter zum kleinsten Glied der Mitarbeiterkette werden. Whistleblowing muss als Möglichkeit der Unternehmensoptimierung wahrgenommen werden und darf nicht als eine Art Nestbeschmutzung gesehen werden. Es steht zu erwarten, dass elektronische Hinweisgebersysteme zu den ganz überwiegend wichtigsten Meldekanälen werden, so dass auf IT-Seite der betroffenen Unternehmen frühzeitig entsprechende Überlegungen und Maßnahmen angestrengt werden sollten.