Amoxicillin verhindert die Bildung der Bakterienzellwand, die zu ihrer Auflösung führt. Es beginnt 15 Minuten nach Einnahme der Pille zu wirken, und die Wirkung hält bis zu 8 Stunden an. Das Medikament wirkt sich nicht auf gesunde Zellen aus.
Zur Behandlung von Infektionen durch resistente Bakterien wird Amoxicillin mit Clavulansäure kombiniert. Eine zusätzliche Komponente neutralisiert die Penicillinase und ermöglicht es dem Antibiotikum, gefährliche Mikroorganismen zu zerstören.