Bisher gibt es noch nicht einmal Berechnungen des CO2-Rucksackes des Tunnels. Sein Bau und Betrieb werden sich allerdings höchstwahrscheinlich nie amortisieren.
Für einen gerechten Beitrag zum Pariser Klimaabkommen muss der Autoverkehr in Deutschland, laut einer Machbarkeitsstudie des Wuppertal Instituts, bis 2035 halbiert werden. Um das zu erreichen empfiehlt das Wuppertal Institut ein Moratorium für den Fernstraßenbau, um die Abhängigkeit vom Auto nicht weiter zu vergrößern. Der Schindhaubasistunnel wird dafür sorgen, dass mehr Autos unterwegs sein werden und verstößt damit gegen das Deutsche 1,5°-Ziel.
Unklar und noch nicht final untersucht sind auch die Auswirkungen auf das Wankheimer Täle. Dort steht bis jetzt ein Wald, in dem für den Tunnelbau Rodungen stattfinden sollen.
Barbara Lupp, die BUND-Regionalgeschäftsführerin, meint dazu: „Die Auswirkungen auf das “Wankheimer Täle” sind unklar. Der durch hohe Vielfalt ausgezeichnete, relativ klimastabile Mischwald und sein Fließgewässer könnten durch den Bau des Tunnels massiv betroffen sein. Dies würde auch seine Naherholungs- und Kühlfunktion für die Menschen in den dicht bebauten, angrenzenden Stadtvierteln beeinträchtigen.“
Tübingen hat sehr hohe Mietpreise. Ein Argument für den Tunnel ist, dass nach dem Rückbau der B27 alt auf der entstehenden Fläche neuer Wohnraum geschaffen werden und die WohnungssituaIon dadurch verbessert werden kann. Bei dem Argument wird aber nicht bedacht, dass für den Tunnel neue Zubringerstraßen gebaut werden und dafür Flächen versiegelt werden müssen. Im Gegenzug sollten also die Flächen nach dem Rückbau entsiegelt werden. In Tübingen wird seit Jahren darüber gestritten, ob für den Wohnungsbau neue Flächen versiegelt werden sollen oder nicht. Der Wohnungsbau an der B27 alt wäre einfach eine Flächenversiegelung über Umwege.