Die CUT&RUN-Methode kann auf pflanzliche Gewebeproben angewendet werden. Ein wesentlicher Schritt zusätzlich zu den im Protokoll aufgeführten ist die Erzeugung von Sphäroblasten, damit die Plasmamembran für die Applikation der Antikörper und des MNase-Fusionsproteins permeabilisiert werden kann. Alternativ können Sie auch isolierte Zellkerne als Probenmaterial verwenden. Der CUT&RUN-Kaninchen-Anti-h4K27me3-Antikörper als Positivkontrolle ( ABIN6923144) und der CUT&RUN-Meerschweinchen-Anti-Kaninchen-IgG-Antikörper als Negativkontrolle ( ABIN101961) sowie die ConA-Beads ( ABIN6923139 oder ABIN6952467) sind für die Verwendung mit Pflanzenproben geeignet.