Transsexualität ist in erster Linie kein Problem der Sexualität, sondern der Geschlechtsidentität, der sogenannten Transidentität und der Geschlechterrolle, dem Transgender. Betroffene haben ein starkes, anhaltendes Gefühl, dass sie im falschen Körper geboren sind und ihr biologisches und inneres Selbstverständnis ihrer Person nicht übereinstimmen. In der Fachsprache wird dieses Gefühl als „Geschlechtsinkongruenz oder geschlechtsspezifische Nichtkonformität“ bezeichnet. Von einer Störung sprechen Spezialisten aber erst, wenn diese Unstimmigkeit großes Leid verursacht und die Lebensweise von Transsexuellen stark beeinträchtigt. Betroffene wirken dabei oft ängstlich, depressiv und leicht reizbar.