Wird eine thermoelektrische Kühlbox über einen gewissen Zeitraum nicht verwendet, sollte sie vor dem Abstellen gründlich von innen und außen gereinigt werden. Wie bei einem Kühlschrank auch, ist es ratsam, wenn der Deckel der Kühlbox bei der Lagerung nicht geschlossen wird, damit die Luft zirkulieren kann. Für die Aufbewahrung ist ein trockener und gut belüfteter Ort empfehlenswert, damit die Elektrik keinen Schaden nimmt und keine unangenehmen Gerüche aufkommen. Damit die Kühlbox immer schnell zur Hand ist, wenn sie kurzfristig benötigt wird, sollte sie nicht mit anderen Lagergegenständen zugebaut werden.
Die Kabel (12 V und 230 V), mit der die Kühlbox betrieben wird, sind fest mit dem Gerät verbunden und können zumeist in kleine Aufbewahrungsnischen geschoben werden. Nutzen Sie bei einer länger geplanten Lagerung diese Möglichkeit, vor allem, wenn die Box im Keller gelagert wird, damit es keinesfalls zu einem Verbiss durch Mäuse kommen kann.