Aphthen am Zahnfleisch kommen in verschiedenen Grössendimensionen vor. Die kleinsten Aphthen sind nur einen Millimeter gross. Es gibt aber auch riesige Aphthen von bis zu drei Zentimetern. Die mit ihnen einhergehende Verletzung der Mundschleimhaut ist meist tiefer, sodass es länger dauert, bis sie verheilen. Sehr grosse und tiefe Aphthen hinterlassen zudem häufig Narben auf der Schleimhaut.