Eine Vasektomie ist in der Regel eine komplikationsarme Operation. Leichte Schwellungen des Hodensacks und gelegentlich Blutergüsse sind normal. Selten können Verwachsungen, Wundheilungsstörungen, Nachblutungen, Infektionen oder ein Post-Vasektomie-Schmerzsyndrom auftreten. Das selbstständige Zusammenwachsen der getrennten Samenleiter ist äußerst selten. Die Samenflüssigkeit wird mehrmals nach der OP untersucht.