Eine bedeutende Komponente des angeborenen Immunsystems ist das so genannte Komplementsystem. - Das Komplementsystem basiert auf einer Gruppierung von circa 25 Proteinen im Blut (Plasmaproteine), die direkt oder indirekt ihren Beitrag leisten. Wenn das Komplementsystem aktiviert [durch: Antigen-Antikörper-Komplex (klassisch) oder Mannose-bindendes Lektin (MBL) oder pathogene Oberflächen (alternativ)] wurde, wird die so genannte Komplementkaskade gestartet. Die sich anschließenden Reaktionen laufen entsprechend zusammenhängend, aufbauend, schnell und unumkehrbar ab. Das Komplementsystem sorgt für eine Markierung von Erregern – Opsonisierung. Auf diese Weise sind die Riesenfresszellen (Makrophagen) in der Lage, die Erreger als fremdartige Zellen zu erkennen. Außerdem kann das Komplementsystem eine Auflösung (Lyse) von Antigen-Antikörper-Komplexen, welche im Blutkreislauf zirkulieren, bewirken. Eine weitere Funktion des Komplementsystems ist das Auslösen von Entzündungen (Inflammatio) des Körpergewebes, welche dazu führen sollen, dass Fremdkörper schneller aus dem Blutkreislauf beseitigt werden können. Wird das Komplementsystem der Immunabwehr aktiviert, dient dieses also zur Erkennung, Auflösung und zum Abtransport einer fremden Zelle, die nichts im Körper „verloren“ hat.