Shopify tilbyder forskellige abonnementsplaner, der passer til forskellige behov og budgetter. Planerne inkluderer Basic Shopify (fra $29 pr. måned), Shopify (fra $79 pr. måned) og Advanced Shopify (fra $299 pr. måned). Hver plan har forskellige funktioner, inklusive antallet af medarbejderkonti, lavere betalingsgebyrer og avancerede rapporteringsfunktioner.