Marlborough er opdelt i tre underregioner: Southern Valleys, Wairau Valley og Awatere Valley.
Southern Valley producerer de fineste, meget aromatiske Pinot Noir i terroir af lerjord. Wairau-dalen er kendetegnet ved en gammel flodbund, og på grund af det kølige og tørre klima i området kommer ældningen af ​​druerne ret tidligt. Vinene fra Wairau Valley er typisk stærke og kraftige med frugtige aromaer. Awatere Valley har meget forskellige geografiske karakteristika, da den strækker sig fra havet til bjergkæden Kaikoura. Pinot Noir fra Awatere Valley er meget aromatisk på grund af det lave udbytte, men den mest karakteristiske sort, der vokser her, er Sauvignon Blanc.