Ja, overdreven indtagelse af proteinpulver kan føre til fordøjelsesproblemer som oppustethed og diarré, især hvis pulveret indeholder mange tilsætningsstoffer eller kunstige sødemidler. Over længere tid kan et meget højt proteinindtag også belaste nyrerne, især hos personer med eksisterende nyreproblemer. Generelt anbefales det at holde sig til den anbefalede daglige mængde protein for at undgå potentielle bivirkninger.