Crohns sygdom kan forårsage en række forskellige symptomer, der varierer fra person til person. Nogle af de mest almindelige symptomer inkluderer mavesmerter eller kramper, diarré, vægttab, træthed, feber og blod i afføringen. Nogle patienter kan også opleve mangel på appetit, kvalme og opkastning, led- og muskelsmerter eller hudproblemer som udslæt eller sår.