Programmering af en robotplæneklipper indebærer normalt brugen af en kontrolenhed eller en mobilapp, der følger med produktet. Ved hjælp af disse værktøjer kan man indstille klippetider, klippehøjde og andre præferencer. Man kan også programmere den til at undgå specifikke områder eller navigere omkring forhindringer. Det er vigtigt at følge producentens instruktioner for at sikre korrekt programmering.