Zink påvirker autofagi ved at binde sig til autofagi-promotorer og regulere transkriptionen af gener, der er involveret i autofagi.
Zink er en kofaktor for mange enzymer og proteiner, herunder dem, der er nødvendige for autofagi. Når zinkniveauet er lavt, er der mindre aktivitet af disse enzymer og proteiner, hvilket resulterer i et fald i autofagi. Omvendt, når zinkniveauet er højt, er der øget aktivitet af disse enzymer og proteiner, hvilket øger autofagien.