Folsyre er generelt sikker at tage og bivirkninger er sjældne. Dog kan nogle mennesker opleve uønskede virkninger, såsom maveproblemer, søvnløshed, hudreaktioner og forvirring. Det er også vigtigt at bemærke, at høje doser af folsyre over en længere periode kan skjule symptomer på vitamin B12-mangel, som kan være skadelig, især for ældre voksne.