Mange fakturahåndteringssystemer tilbyder også mulighed for at matche fakturaer med kontrakter. Det er især fordelagtigt for tilbagevendende fakturaer, hvor samme tjenester eller varer faktureres hver måned til et bestemt aftalt beløb. Hvis beløbet stemmer overens med den allerede godkendte kontrakt, kan disse fakturaer godkendes af systemet og sendes til betaling – helt uden manuel håndtering.