Crohns sygdom og colitis ulcerosa er begge inflammatoriske tarmsygdomme, men de adskiller sig i den del af fordøjelseskanalen, der er påvirket, og hvordan betændelsen manifesterer sig. Crohns sygdom kan påvirke ethvert område af fordøjelseskanalen fra mund til anus, og kan forårsage skip-lesions, hvor nogle dele af tarmen er sunde og andre er betændte. Colitis ulcerosa påvirker primært tyktarmen og endetarmen og manifesterer sig som kontinuerlig betændelse og sår. Symptomerne kan også adskille sig, hvor Crohns sygdom ofte forårsager mavesmerter, diarré og vægttab, kan colitis ulcerosa medføre blodig diarré og behovet for hyppigere toiletbesøg.