Ved valg af et pillefyr skal man overveje brændselsomkostninger, tilgængeligheden af træpiller, lagerplads til pellets, regler og reguleringer for emissioner, krav om regelmæssig vedligeholdelse og omkostninger ved installation. Det er også vigtigt at vurdere den nødvendige varmekapacitet i forhold til boligens størrelse og isolering.