Indofood er udsat for en række risici, herunder fødevare sikkerhedsrisikoen, råvare prisrisikoen, konkurrence risikoen, risikoen forbundet med den globale opvarmning og klimaændringerne blandt andre. Selskabets ledelse er dog fuldt bevidste over risikoen, og har indført de nødvendige systemer for at formindske risikoen til acceptable niveauer.