Estland har et tempereret klima, der betyder, at somre er varme og våde, mens vintre er kolde og frostige. Gennemsnitstemperaturen i juli er 17°C, og gennemsnitstemperaturen i januar er -4°C. I løbet af sommeren er der mange solrige dage med temperaturer, der ofte stiger over 20°C. Regn er almindelig gennem hele året, især fra maj til september, men de største nedbørsmængder findes fra oktober til april. Sne er almindelig omkring november og varer til marts.