De fleste mennesker tolererer Ginkgo Biloba godt, men som med alle kosttilskud, kan der være potentielle bivirkninger. Nogle mennesker kan opleve hovedpine, maveproblemer, hudreaktioner eller svimmelhed. I sjældne tilfælde kan nogle mennesker have en allergisk reaktion på Ginkgo Biloba. Det er også vigtigt at bemærke, at Ginkgo Biloba kan interagere med visse lægemidler, især de der påvirker blodkoagulation. Tal altid med din læge eller sundhedsudbyder, før du begynder at tage Ginkgo Biloba eller ethvert andet kosttilskud.