NemID app tilbyder flere sikkerhedsfunktioner som PIN-kode og biometrisk godkendelse (afhængig af enheden). Det eliminerer også risikoen ved at miste eller beskadige fysiske nøglekort eller nøglevisere. Derudover er NemID app regelmæssigt opdateres for at imødekomme de nyeste sikkerhedskrav.