Litauen har et tempereret, kontinentalt klima med varme somre og kolde, snefyldte vintre. Gennemsnitstemperaturen i juli, den varmeste måned, er omkring 18°C (64°F) og i januar, den koldeste måned, er omkring -5°C (23°F). De fleste somre er lune og tørre, mens vintre er kolde og blæsende. Der er også tendens til tørke i sommermånederne. Det regner ofte i november og december. Snefald kan ses fra oktober til marts, men det varierer meget fra år til år.