Hos Stokværk kan du bruge følgende betalingsmetoder: Visa, Visa Dankort, Dankort, Visa Elektron, Eurocard, JCB, Mastercard, American Express. Desuden understøtter butikken også betaling med Mobilepay. Du kan også bruge ViaBill til at foretage et køb, og så modtager du først varen og betaler derefter for den.