Både Valtrex og aciclovir er rettet mod virussen på samme måde. Faktisk bliver Valtrex til aciclovir, når det indtages i blodet. Den væsentligste forskel er, at Valtrex giver en længere virkningsvarighed, hvilket betyder, at du ikke behøver at tage det så meget som aciclovir. Dette gør det at foretrække for nogle mennesker.