Filsøs genoprettelse begyndte, efter Aage V. Jensen Naturfond købte Filsø i 2010. Naturfonden overtog Filsø den 1. oktober 2011, hvor genoprettelsen blev påbegyndt, og i 2012 stod den ny Filsø på 915 hektar færdig. Den omfattende genopretning betyder, at Filsø hører til blandt de største naturgenopretninger i nyere tid i Danmark.