Windows 11 SE er begrænset i de apps, der kan installeres, og de indstillinger, en slutbruger kan administrere. Systemet er designet ud fra feedback fra lærere, der ønsker et enkelt miljø uden distraktioner for deres elever, og IT-administratorer, der ønsker, at enheder skal være nemme at administrere og give god ydeevne året rundt. Appinstallation, avancerede funktioner og ændringer i indstillingerne administreres af IT-administratorer i stedet for slutbrugere for denne særlige version af Windows 11.