Hybenpulver anses generelt for at være sikkert og uden alvorlige bivirkninger. Dog kan nogle personer opleve mindre maveproblemer som oppustethed eller diarre, især når de først begynder at tage pulveret. Dette er normalt midlertidigt og forsvinder, når kroppen vænner sig til de ekstra fibre. Hvis bivirkningerne fortsætter eller er generende, anbefales det at kontakte en sundhedsprofessionel.