Der er flere udfordringer ved at forske i Aner. Manglende dokumentation og arkiver, især når det kommer til ældre generationer, kan være en udfordring. Derudover kan unøjagtigheder i dokumenter og transskriptioner vanskeliggøre forskningsarbejdet. Mange familier har også hemmeligheder eller tabubelagte historier, som kan gøre det svært at få adgang til fuldstændig information.