Rozdíl mezi těmito druhy whey proteinů je především v množství bílkovin a s tím se pojící vhodností použití. Koncentráty jsou levnější a často mívají méně bílkovin a naopak více tuků a sacharidů. U nich je většinou také na výběr z mnoha příchutí. Takové přípravky jsou vhodné při nabírání. Naproti tomu hydrolyzáty mohou mít až 100 % bílkovin, proto je nejvíce oceníte při dietě. Jsou ale také výrazně dražší. Kompromisem jsou izoláty, taková zlatá střední cesta.