Ve skutečnosti pouhým smazáním aplikace nedojde k úplnému odstranění iMovie. K dispozici jsou další programy, které lze odinstalovat. Protože odstraňují všechny soubory související s iMovie spolu s iMovie, lze k odinstalaci iMovie použít programy jako AppCleaner nebo AppDelete. K přeinstalaci iMovie je nutné použít aplikační DVD Mac OS X nebo ILife CD.