Přestože ve většině případů jsou pojmy proteinová a keto dieta považovány za synonyma, podle některých zdrojů mezi nimi rozdíl je. V obou případech se snižuje příjem sacharidů, ale u proteinové diety jsou pak bílkoviny doplňovány spíše nízkotučnými produkty. U keto diety bývá oproti tomu příjem tuků vyšší.