HEPA filtr je speciální typ filtru, který dokáže zachytit velmi malé částice prachu a alergenů, které by mohly uniknout běžným filtrem. Vysavače s HEPA filtrem jsou ideální pro alergiky nebo pro domácnosti s domácími mazlíčky, protože dokážou lépe zachytit a odstranit alergeny z domácnosti. Vysavače bez HEPA filtru mohou být stále účinné v odstraňování prachu a nečistot, ale nemusí být tak efektivní v odstraňování alergenů.