Stejně jako je tomu i u jiných investic taky u ETF fondů musíte počítat s určitými poplatky. Platíte například poplatek za zrealizování obchodu, spread, poplatek za úschovu cenných papírů případně konverzní poplatek. Poplatky i jejich výše se však samozřejmě liší v závislosti na konkrétním brokeru.