Rizika související s IVF jsou minimální. K ojedinělým komplikacím hormonální léčby patří hyperstimulace (OOHS), při které dochází ke zvětšení vaječníků. Hlavním projevem hyperstimulace je bolest v podbřišku, ojediněle může dojít k hromadění tekutiny v dutině břišní. Příznaky dokáže současná medicína snižovat, hyperstimulace pak ustoupí samovolně.
Těhotenství po umělém oplodnění se nijak neliší od přirozeného těhotenství a jsou s ním spojena stejná rizika (předčasné porodní bolesti, potrat atd.).