Chemická impregnace pergoly zabrání napadení dřeva dřevokaznými houbami či hmyzem a kvalitní nátěr dodá dřevu požadovaný vzhled. Pergola může být natřená v přírodních odstínech dřeva nebo může být použit odstín imitující exotické dřevo. V současné době je moderní i nátěr v odstínech RAL, např. šedé či bílé.