Ne vždy je však užívání tohoto přípravku vhodné. Měli byste vědět například to, že znásobuje účinek antibiotik či tetracyklinu. Zesiluje také účinky léků na spaní nebo těch určených pro tlumení centrálního nervového systému. A může rovněž účinně zablokovat vstřebávání železa. Pokud tedy užíváte doplňky stravy nebo léky pro navýšení tohoto důležitého prvku v krvi, užijte je s dvou až tříhodinovým odstupem od přípravku Magnerot.