Proces kontroly a hodnocení projektových žádostí probíhá ve dvou etapách:
Kontrola přijatelnosti projektové žádosti včetně kontroly formálních náležitostí
Hodnocení kvality a přeshraničního dopadu
Doporučujeme projektovou žádost před předložením zkontrolovat podle kontrolních listů pro kontrolu a hodnocení projektové žádosti (viz přílohy C.5 a C6 Programové příručky).