Jedná se o jeden z nejbezpečnějších platebních systémů na světě – za ochranu před hackerskými útoky jsou zodpovědné britské vládní regulační orgány, jejichž inovace dokáží překvapit a zmást každého hackera. Pokud jde o banální krádeže hesel, Skrill používá dvoufaktorovou identifikaci.