Pelyněk je vhodný hlavně jako lék na různé zažívací obtíže. Má pozitivní vliv na trávení, podporuje funkci žlučníku, zmírňuje křeče, plynatost či nevolnost a pomáhá při gastritidě. Kromě toho je účinný v boji proti parazitům, působí jako antioxidant, může zlepšovat příznaky Crohnovy choroby, a údajně pomáhá snižovat bolest, takže může pomoci pacientům trpícím osteoartrózou.