Z muchovníku můžete vypěstovat zakrslý stromek s holým kmenem, nebo naopak klasický okrasný keř. V prvním případě odřízněte od nejsilnějšího kmínku všechny postranní větve zhruba 1 metr nad zemí. Ve druhém případě se seřezávají pouze kmínky, které jsou příliš blízko u sebe. Každoroční prořezávání pak není nutné, ale je dobré vždy v zimních měsících provádět udržovací řez. Odstraňují se starší větve, které jsou již odplozené.