Probiotika samozřejmě nemusíte přijímat výhradně ve formě různých doplňků stravy. Běžně se totiž vyskytují také v některých potravinách, jejichž požíváním do těla dostáváte probiotika přírodní cestou. Mezi takové potraviny patří například kefír, jogurt, acidofilní mléko, podmáslí, kysané zelí, jablečný ocet, kvašené okurky, bryndza, zrající sýry nebo exotické kimchi, kombucha, natto či tempeh.