Ano, služby poskytované v rámci Skrill jsou zpoplatněné. Běžný poplatek za zasílání peněz pomocí Skrill je 1,45% s minimálním poplatkem 0,50 EUR. Nicméně mohou být účtovány i vyšší poplatky – a to až 5,50%, pokud nebyl na účet Skrill proveden žádný vklad, nebo byl vklad proveden přes Neteller, Paysafecard nebo BitPay.