Anotování dokumentů PDF je v aplikaci Reader velice snadné. Pomocí aplikace Reader na vašem počítači můžete: anotovat dokumenty PDF pomocí lístků s poznámkami, psát text přímo na stránku, používat nástroje pro zvýraznění, podtržení nebo přeškrtnutí a kreslit na obrazovku pomocí nástroje pro volné kreslení rukou. Stejné nástroje pro přidávání poznámek jsou k dispozici také v aplikaci Acrobat Reader pro mobilní zařízení.