Ve vybraných indikacích lze použít i tzv. čistě malabsorpční operace, jejichž typickým představitelem je tzv. biliopankreatická diverze. Zákroky tohoto typu ze své podstaty ovlivňují (snižují) schopnost trávicího traktu trávit a vstřebávat některé složky potravy, takže dochází ke snížené možnosti zužitkovat energii (kalorie) obsaženou v potravě.