Křen můžeme uchovat klasicky v chladničce, v mrazničce, můžeme si jej nasušit nebo naložit například s octem. Při skladování v chladničce je důležité, abyste mu dopřáli dostatečnou vlhkost. Můžete jej skladovat v misce s vodou nebo zabalit do mokrých novin a do mikrotenového sáčku. Vodu či mokrý papír jednou za čas vyměňte a křen zkontrolujte. Takovým skladováním by měl křen vydržet v chladničce až 1 rok.