První část léčby potratové pilulkou začíná v lůžkovém zařízení pod dohledem lékaře. Žena dostane Mifegyn, což je lék obsahující účinnou látku mifepriston. Dávka Mifegynu se skládá ze tří tablet, které se polykají ve zdravotnickém zařízení. Po spolknutí léku žena zůstává pod dozorem lékaře po dobu přibližně jedné hodiny, aby bylo možné sledovat její stav a reakce na léčbu. Pokud nedojde k žádným komplikacím, je žena propuštěna domů, ale musí dodržovat několik důležitých kroků. Druhá část léčby probíhá obvykle za dva dny po užití Mifegynu. Žena se opět vrací do lůžkového zařízení, kde dostane lék obsahující prostaglandin. Prostaglandiny jsou hormony, které stimulují silné stahy dělohy a podporují její kontrakce. To je klíčové pro vypracování těhotenství a vyprázdnění obsahu dělohy. Krátký pobyt v lůžkovém zařízení je opět nutný (minimálně hodinu), aby lékaři mohli sledovat průběh potratu a případně reagovat na případné komplikace. Po podání prostaglandinu začíná proces potratu, který zahrnuje křeče a silné krvácení.