La tècnica de MACS pot realitzar-se en qualsevol situació, encara que està especialment recomanada en els següents casos:
ADN amb elevat índex de fragmentació.
Cicles previs de FIV caracteritzats per la baixa taxa de fecundació o la mala qualitat embrionària, malgrat la bona qualitat dels òvuls.
Infertilitat seminal greu.
Pacients sotmesos a radioteràpia o quimioteràpia.
Avortaments de repetició sense una altra causa identificada.