No totes les persones amb TEA necessiten un tractament farmacològic. No hi ha medicaments que puguin tractar els símptomes principals d'aquest trastorn, però si que hi ha fàrmacs que ajuden a controlar alguns símptomes relacionats. Per exemple, la medicació pot disminuir els problemes d'atenció, les alteracions en l'estat d'ànim, les convulsions o la impulsivitat.