Els fàrmacs i les teràpies naturals només aconsegueixen alleujar parcial o totalment els símptomes. D'altra banda, la cirurgia pot ajudar a millorar l'estat de salut de les dones amb endometriosis en gran manera després de l'eliminació de totes les plaques endometrials. No obstant això, aquestes solucions no són definitives, ja que l'endometriosi torna a aparèixer amb el temps. L'única manera d'eliminar per complet l'endometriosi és practicant una histerectomia, és a dir, l'extirpació de l'úter.