Не съществува една-единствена бактерия, която да причинява пародонтит. Както обикновено в природата, нещата са по-сложни. Пародонтитът е свързан с дисбаланс на бактериалната флора, който благоприятства по-агресивните бактерии, които са по-вредни за тъканите.