Процеса на молекулярна дестилация се налага, когато суровото рибено масло съдържа замърсители или когато се използват риби, които стоят по-високо в хранителната верига. При производството на Норвежко Рибено Масло – сироп с лимонов вкус и Норвежко Рибено Масло – високо концентрирано и ултима, суровината се набавя от дребни риби, стоящи в началото на хранителната верига и затова този процес не се налага. При производството на рибено масло от черен дроб на акула се използва процес на молекулярна дестилация.