Най-често това може да бъдат нарушения на храносмилателната функция и на усвояването на елементи, генетични нарушения, приемът на някои категории лекарства, болест, повишена физическа активност и стрес. Повишена консумация/загуба на микроелементи се наблюдава и в периода на интензивен растеж на тялото, бременност и кърмене.