CCleaner Professional отключва няколко функции, които не можeте да използвате с фриймиум лиценза. Той осигурява по-задълбочено почистване и предлага допълнителни инструменти, като автоматични актуализации на софтуера, премахване на проследяващи реклами и други. Има възможност за закупуване на целия набор от продукти на CCleaner, които включват дефрагментиране и програма за възстановяване на файлове.