ফসল আবর্তনের অসুবিধাগুলি নিম্নরূপ একক ফসল চাষ করা অসম্ভব আরও জ্ঞান এবং দক্ষতা প্রয়োজন অনেক ঝুঁকি প্রয়োজন কাজ করার জন্য প্রচুর অভিজ্ঞতার প্রয়োজন অনেক এলাকায় ফসল আবর্তনের সীমিত জ্ঞান বড় ফার্মিং ফার্মে লাভের মতানৈক্য শস্য ঘূর্ণন দক্ষতা ভৌগলিক কারণের উপর নির্ভর করে গড়ে কৃষকদের জন্য দুর্বল লাভ ফসল ঘূর্ণন বাস্তবায়ন একটি স্বল্পমেয়াদী পদ্ধতির এড়াতে পারে ভুল বাস্তবায়ন ভালোর চেয়ে অনেক বেশি ক্ষতির কারণ হতে পারে