কিছু লোক যারা মোডাফিনিল ব্যবহার করেছেন তারা মানসিক স্বাস্থ্যের সমস্যাগুলি জানিয়েছেন যেমন বিষণ্নতা যা ক্লান্তি এবং শক্তি হ্রাসে প্রকাশ পায়। এই ধরনের পার্শ্ব প্রতিক্রিয়া খুব কমই গুরুতর হয়ে ওঠে। বেশিরভাগ ক্ষেত্রে, মানসিক স্বাস্থ্য সমস্যাগুলি ওষুধের চেয়ে সম্পর্কিত অন্তর্নিহিত অবস্থার কারণে বেশি হয়।
মোডাফিনিলের মেকানিজমও অনন্য। এইভাবে, কিছু গবেষণায় আরও প্রমাণিত হয়েছে যে মোডাফিনিলকে আরও ভালো কার্যকারিতার জন্য অন্যান্য এন্টিডিপ্রেসেন্টের সাথে মিলিত করা যেতে পারে।