জটিল মূত্রনালীর সংক্রমণের নিয়মিত অ্যান্টিবায়োটিক নাইট্রোফুরান্টোইন দিয়ে চিকিত্সা করা হয়। নাইট্রোফুরানটোইন মূত্রাশয় সংক্রমণের চিকিৎসায় সাহায্য করে, তবে এটির রেনাল টিস্যুতে প্রবেশ করার ক্ষমতা সীমিত থাকে এবং তাই লিভার বা কিডনি রোগে আক্রান্ত রোগীদের সতর্কতার সাথে নেওয়া উচিত।