যে ক্রোমোজোম জীবের যৌন বৈশিষ্ট্য নিয়ন্ত্রণ করে তাকে সেক্স ক্রোমোজোম বলে। যেমন মানবদেহের ৪৬ টি ক্রোমোজোমের মধ্যে অটোজম ৪৪ টি সেক্স ক্রোমোজোম ২টি।