প্যান্টোপ্রাজল হৃদস্পন্দনের ঝুঁকি বাড়াতে পারে, যা হৃৎস্পন্দন, অনিয়মিত বা জোরদার হৃদস্পন্দনের অপ্রীতিকর সংবেদন। এটি প্যান্টোপ্রাজোলের মতো প্রোটন পাম্প ইনহিবিটরগুলির সাথে যুক্ত একটি পরিচিত ঝুঁকির কারণ।