Troyan virusu infeksiyasının bəzi əlamətlərinə kompüterin yavaş işləməsi, pop-up reklamlar, parametrlərdə və ya proqramlarda izah olunmayan dəyişikliklər, gözlənilməz qəzalar və ya donmalar daxildir. Bəzi hallarda infeksiyanın görünən əlamətləri olmaya bilər.