كانت وفاة الامام البخاري في إحدى قرى سمرقند الأوزبكستانية وقت صلاة العشاء في اليوم الأخير من شهر رمضان ليلة عيد الفطر عام 256 هـ بعد أن اشتد عليه المرض، وقد بلغ من العمر وقتذاك اثنين وستين عاماً، ويذكر أنه كان يدعو قائلاً ((اللهم إنه قد ضاقت علي الأرض بما رحبت فاقبضني إليك)).