على الرغم من أن القولون العصبي هو مرض عضال لا يوجد علاج له، إلا أن القولون العصبي ليس مرضًا مميتًا، ولا يبدو أن المخاطر الصحية التي يمكن أن يسببها كبيرة. كما أنه لا يزيد من خطر الاصابة بالسرطان، ولا يتلف الأغشية داخل القناة الهضمية.