يشكل الميكروبيوم علاقة تكافلية مع الحيوان ويفيد الحيوان - حيث يساعد على الهضم عن طريق إنتاج إنزيمات مختلفة تشارك في تكسير عناصر الغذائية. كما تحفز البكتيريا الموجودة في الأمعاء الاستجابة المناعية. لذلك ، فإن الميكروبيوم المتوازن ضروري لعملية الهضم الأمثل.