يتم اتخاذ بعض المعايير الهامة عند البدء في التعقيم والتي تعد من أساسيات عملية التطهير والتعقيم ومنها:
1. اختيار أنواع المعقمات والتي تتناسب مع خصائص المكان المراد تعقيمه.
2. الاهتمام باستخدام درجات حرارة مناسبة بحيث لا تضر عند استخدامها على الأقمشة أو البلاستيك.
3. التهوية الجيدة للمكان قبل تعقيمه وفي حالة استخدام بعض المواد الكيميائية بشكل خاص.