لا تعتبر حصى اللوزتين حالة خطيرة طبيا، لا سيما أنها لا تسبب عادة مضاعفات خطيرة ولا تكون أعراضها شديدة أيضًا. مع ذلك فإنه من الممكن أن تسبب عدوى عميقة أو التهابًا في اللوزتين أو التهاب الأذن الوسطى والخراج حول اللوزتين.