بعد أن يُفحص الشخص بمنظار المثانة، فمن المرجح أن ينصحه الطبيب بتجنب المجهود الرياضي والممارسات الجنسية لمدة أسبوع أو اثنين وان يشرب الكثير من السوائل.
‏أغلب فحوص منظار المثانة تتم بدون مضاعفات. مع ذلك، يوجد احتمال قليل لإدخال العدوى إلى المثانة أو إصابة الإحليل أو المثانة. ووجود كمية قليلة من الدم في البول هو أمر طبيعي إذا حدث أثناء اليوم الأول بعد الفحص، ولكن إذا استمر بعد ذلك يجب إبلاغه للطبيب. كما يجب إبلاغه بأي عسر في التبول أو حمى، مما يمكن أن يشير إلى حدوث إصابة أو تلوث بالمثانة