تعتمد نسبة نجاح عمليو زراعة نخاع العظم على عدد من العوامل، منها مدى التوافق بين أنسجة المتبرع والآخذ والحالة التي يتم علاجها من خلال زرع نخاع العظم وأيضًا قابلية جسم الآخذ للتأقلم مع الطعم المزروع. تبلغ نسبة زراعة نخاع العظم بشكل وسطي 70%، ويمكن ان تصل هذه النسبة إلى 90% إذا كان المتبرع من أفراد العائلة وتصل إلى 100% عندما يكون المتبرع هو التوأم الحقيقي للآخذ.