علاج التهاب هاشيموتو يكون باعطاء المريض ادوية مدعمة من هرمون الغدة الدرقية ومتابعة الاستجابة لهل
اما بالنسبة للاجسام المضادة فالرجاء تحديد نوعها لانه يوجد انواع خاصة بالغدة الدرقية وانواع تكون اكثر شمولية
اما بالنسبة لمرض السكري فلا توجد ارقام محددة لنسبة الاصابة بمرض السكري ولكن هناك رابط بين هذه الانواع من الامراض فمن المستحسن متابعة مستوى السكر والتأكد من الطبيب المعالج