تنقسم الخلايا الجذعية الطبيعية إلى نوعين وهما: الخلايا الجذعية للبالغين والتي تؤخذ من الشخص البالغ، أو الخلايا الجذعية الجنينية والتي تؤخذ من الكيسة الأريمية للجنين من عمر 3-5 أيام.