يؤثر التهاب الأسنان على المعدة، حيث تضعف البكتيريا الفموية قدرة المعدة على مقاومة العدوى.
تؤدي أيضًا استجابة الجسم للبكتيريا الفموية الضارة إلى استجابة الجهاز المناعي الذي يساهم أيضًا في إضعاف المعدة.