FFmpeg ليس آمنًا للاستخدام. هناك مخاطر أمنية أثناء استخدام هذه الأداة ، خاصة عندما تسمح بتنسيقات عشوائية. ونظرًا لأن FFmpeg يدعم تنسيقات مختلفة ، فهو عرضة لتنفيذ التعليمات البرمجية التعسفية.