تكيس المبايض لا يعد مرض خطير، ولكن في بعض الحالات قد يزيد تكيس المبايض من مخاطر الإصابة ببعض المشاكل الصحية مثل اضطرابات الهرمونات، والعقم، وزيادة مخاطر السكري، وأمراض القلب، وغيرها من المضاعفات الأخرى.