تُعد رسوم دراسة الطب في القصر العيني زهيدة بالمقارنة بجودة التعليم المتبعة، وهذا من أهم الأسباب التي تدفع الأبناء للتوجه إلى القصر العيني لدراسة الطب.
تتشابه رسوم دراسة الطب في القصر العيني، في مختلف الدرجات العلمية (البكالوريوس - الماجستير - الدكتوراه)، فيلتزم الوافد بسداد 8000$ للسنة الدراسية الواحدة.
يسدد لطالب 1500$ للقيد في طب القصر العيني، ويتم سدادها مرة واحدة فقط في بداية العام الدراسي الأول.