تظهر بعض الأعراض الجانبية الشائعة عند تناول دواء انافرانيل ومن المفترض أن تختفي تلك الأعراض خلال أسبوع إلى أسبوعين، وفي حالة استمرارها قد يتجه الطبيب إلى تغيير الجرعة أو إيقاف تناول الدواء واستخدام البدائل.