على الرغم من أن عصير البقدونس يعتبر آمن بشكل عام، إلا أن هناك بعض الآثار الجانبية المحتملة عند تناوله بكميات كبيرة ويمكن أن يسبب تهيج المعدة أو تفاعلات تحسسية لدى بعض الأشخاص كما يجب على الأشخاص الذين يعانون من مشاكل في الكلى أو النساء الحوامل استشارة الطبيب قبل تناول كميات كبيرة من عصير البقدونس.