الفرق الرئيسي بين خرائط مواقع HTML و XML هو الغرض منها. تساعد خرائط مواقع HTML الزوار في التنقل، بينما تساعد خرائط مواقع XML محركات البحث على اكتشاف الصفحات. توصي Google باستخدام خرائط مواقع XML لأغراض تحسين محركات البحث.
عندما يتعلق الأمر بخرائط مواقع HTML، يوصي المحامي John Mueller بالتركيز على التنقل الواضح وبنية الموقع الجيدة بدلاً من استخدام خرائط مواقع HTMLويذكر أنه "لا ينبغي أن تكون هناك حاجة إليها أبدًا".