لا تسبّب خزعة الخصية الشعور بالألم لدى المريض، فهي تتمّ تحت تأثير التخدير الموضعي في معظم الأحيان. بعد الانتهاء من العمليّة يمكن وصف المسكّنات اللازمة للمريض في حال الشعور بالألم أو الانزعاج لمدّة تتراوح بين 24 إلى 72 ساعة.