على الرغم من أن تم استخراج العديد من بطاقة التكامل التي وصل عددها إلى مليون بطاقة، وتم طرق المرحلة الثانية من البطاقة، كما قاموا بإنشاء استمارة كشف طبي برقم جديد، حيث انها تحمل رقم 119 وهي خاصة بالمرحلة الثانية، إلا أن هناك بعض الأسباب التي تؤدي إلى رفص البطاقة، من هذه الأسباب:
• تسجيل بعض البيانات الخاطئة التي تؤدي إلى رفض البطاقة.
• رقم الهاتف، يقوم بعض أولياء أمور ذوي الإعاقة بتسجيل أرقام هواتف خاطئة، مما يصعب الوصول إليهم، وبذلك يتم الرفض.
• أيضًا عدم تعاون المسئول عن البطاقات المتكاملة مع مكاتب التأهيل مع ذوي الإعاقة يؤدي إلى الرفض.