على الرغم من أن الكوكايين و الكريستال ميث لهما نفس التأثير عند التعاطي إلا أن هناك فرق بينهما في الأضرار والانسحاب ومن هذه الفروق:
يتم سحب سموم الكوكايين بشكل أسرع من الكريستال ميث الذي يبقى لفترة أطول.
استجابة خلايا الدوبامين الميثامفيتامين أقوى بكثير من استجابتها للكوكايين.
على الرغم من أن وظيفة كل من الكريستال ميث والكوكايين هي إطالة مدة عمل الدوبامين في الدماغ إلا أن الكريستال ميث يقوم بذلك بشكل مُختلف عن الكوكايين مع زيادة إفراز الدوبامين في الدماغ، مما يحدث ضرراً أكبر في خلايا الدماغ.