عملية طبلة الأذن ليست خطيرة في العموم ولكنها مثل أي جراحة أخرى قد يصاحبها مخاطر ولكنها نادرة ومنها: تلف العصب الوجهي أو العصب المتحكم في حاسة التذوق، وتلف العظام الصغيرة في الأذن الوسطى، ما يؤدي إلى فقدان السمع، قد تشمل المخاطرالأخرى النزيف، والعدوى في موقع الجراحة، وردود الفعل التحسسية للتخدير.