نظراً لأهمية المضادات الحيوية في علاج مشاكل اللثة والأسنان لكنها مثل كثير من الأدوية توجد بها عدة آثار جانبية منها:
● الحساسية.
● الدوخة.
● الإسهال.
● الغثيان.
● العدوى الفطرية.