تستخدم طبقات المياه الجوفية في العديد من الاستخدامات المختلفة، ومن بينها:
● تستخدم طبقات المياه الجوفية في الري الزراعي في المناطق التي يكون فيها الهطول المطري ضعيفًا أو غير متوفر، وذلك لتلبية احتياجات المزارعين وزيادة إنتاجية المحاصيل.
● يمكن استخدام المياه الجوفية كمصدر للمياه الصالحة للشرب، في حال كانت جودة المياه المحيطة بها غير صالحة للاستخدام البشري.
● تستخدم طبقات المياه الجوفية في الصناعة في العديد من الصناعات مثل الصناعات الدوائية والغذائية والكيميائية والنسيجية وغيرها.
● تستخدم المياه الجوفية في عمليات التنقيب عن المعادن والنفط والغاز، حيث يتم استخدامها في الحفر والتبريد وغيرها من العمليات اللازمة لاستخراج المعادن.