تعمل مثبطات المناعة بطرق مختلفة حسب نوع الدواء، حيث يؤدي دواء ميثوتركسات إلى منع خلايا الجهاز المناعي من التكاثر، بينما يؤدي الكورتيكوستيرويد إلى تعديل نمط استجابة خلايا الجهاز المناعي، وتؤثر مثبطات المناعة الأخر من خلال تثبيط عمل الإنزيمات والمركبات الضرورية لحدوث الاستجابة المناعية مثل مركب PDE4 ومركبات الكيناز المختلفة.