في الحالات البسيطة التي لم تتعرض إلى مضاعفات شديدة الخطورة لا يتطلب الأمر إلى العلاج بالأدوية، بينما في الحالات التي تكون النزلة المعوية سببها التهاب بكتيري أو طفيلي يتم اللجوء إلى بعض الأدوية المضادة لتعمل على مهاجمة البكتيريا وتقيد نشاطها.