يختلف وقت تنظيف الخزان باختلاف نوع الخزان وحجمه وطريقة تنظيفه وفي كل الأحوال لابد أن يترك الخزان بعد التنظيف لمدة من ثلاث إلى خمسة ساعات قبل الاستخدام.