يعمل الثوم على علاج مشاكل الجهاز الهضمي من خلال تحفيز وزيادة البكتريا النافعة في المعدة والأمعاء تحديدًا القولون؛ وذلك لأنه يحتوي على الإنولين؛ مما يدعم عملية الهضم ويحسن من امتصاص الجسم للمغذيات.