يتم ضمان خصوصية البيانات في CDSS من خلال تنفيذ بروتوكولات صارمة لأمن البيانات ، بما في ذلك تشفير البيانات ، وضوابط وصول المستخدم الآمن ، ومراجعات النظام المنتظمة. من الضروري أيضًا التأكد من أن النظام يتوافق مع قوانين خصوصية المعلومات الصحية ذات الصلة.