لا يمكن الشفاء التام من متلازمة القولون العصبي، ولكن يوجد بعض الأدوية والمكملات التي تخفف من الأعراض وتغيير حالة المريض، مثل بعض أنواع المضادات الحيوية، ومكملات الألياف، مثل مكملات السيلينيوم.