بالنسبة للتكاليف الدراسية في جامعات قبرص تعد رخيصة بالمقارنة مع جامعات أوروبا، إذ تبدأ تكاليف الدراسة في مرحلة البكالوريوس من 2000 دولار، وفي مرحلة الماجستير والدكتوراه فهي تبدأ من 4000 دولار تقريباً.
كذلك فإن رسوم الدراسة في جامعات قبرص تختلف بين التخصصات، مثلاً رسوم الدراسة في الطب البشري تبدأ رسومه من 10.000 دولار، وتكاليف دراسة طب الأسنان تبدأ من 6500 دولار.