من خلال مقارنة بين تطبيق سيجنال وتطبيق واتساب نلاحظ أيضًا أن تطبيق سيجنال يتميز بكونه يتبع لشركةٍ لا تهدف للربح (مؤسسة غير ربحيةٍ)، حيث يقول مطورو التطبيق أن هدفهم من إنشائه هو تأمين خصوصية المستخدمين بالدرجة الأولى من المتطفلين أو الشركات التي ترغب بالوصول لهذه البيانات والمعلومات. تشفير النسخ الاحتياطي وحذف الرسائل يقدم التطبيق ميزة تسمح للمستخدم بحذف رسالة أو مجموعة من الرسائل بشكلٍ كلي بعد وصولها لصندوق البريد الخاص بالمستقبل بخمس دقائق. لا يمكن للطرف المستقبل القيام باستعادة الرسالة المحذوفة تلقائيا حتى لو لم يتمكن من قراءتها خلال الدقائق الخمس.