عند إجراء التحضير للعملية بالشكل المناسب فمن المفترض أن تستغرق عملية زرع نخاع العظم مدة ساعة تقريبًا، وقد تطول فترة العملية في حالة ظهور مضاعفات أو مشاكل متعلقة بالزراعة