قد يواجه بعض الأشخاص نقصًا في بعض الفيتامينات والمعادن بعد عملية تحويل مسار المعدة. ولكن يمكن تجنب ذلك من خلال اتباع نظام غذائي متوازن وتناول الفيتامينات والمكملات الغذائية الموصوفة من قبل الطبيب.