في الغالب لن يشعر المريض بقدر يُذكر من الألم عندما يخضع لجراحة زرع الشعر باستخدام تقنية FUE أو FUT، ولكن من الممكن أن يشعر المريض بشيء من الألم في فروة رأسه بعد الانتهاء من الجراحة، حيث يكون تعافي تلك المنطقة من الرأس مُزعجًا بعض الشيء.