أفضل وقت لتناول حبوب حرق الدهون هو قبل الوجبة الرئيسية التي تحتوي على دهون وكربوهيدرات، ليقوم حارق الدهون بتثبيط عمل إنزيمات الليباز وهي إنزيمات المعدة والأمعاء التي تقوم بتحليل الدهون، فيتم منع امتصاص الدهون في الجسم، ويتم فقدانها عن طريق البراز.