الرفض بسبب تكشف آليات التعرف المناعي أن الطعم القرني المزروع لا ينتمي إلى الأنسجة المضيفة، من الشخص الذي أجريت له عملية الزرع. إنهم لا يعترفون بها على أنها خاصة بهم ويبدأون في رد فعل دفاعي يهدف إلى القضاء على هذا النسيج ، كما لو كان كائنًا دقيقًا غازيًا. نحن نعلم أنه في القرنية ، الطبقة ذات الحمل المناعي الأعلى هي البطانة. لهذا السبب نحاول الحفاظ على البطانة الداخلية للمريض تجنب الرفض. في الخلايا القرنية الصفائحية السابقة ، نحاول دائمًا الحفاظ على البطانة الداخلية للمريض والتقنيات الحالية تسمح بتشريح جميع الطبقات ، وصولًا إلى البطانة الداخلية ، بالكاد 20 ميكرون ، واستبدال كل شيء آخر. من خلال هذه الجراحة ، تمكنا من تقليل رفض الزرع وذاك تتجاوز الطعوم 10-15 سنة من البقاء، مقارنة بـ 5-10 قبل ذلك.