تكلفة البرمجيات المخصصة تعتمد على نوع التطبيق الذي تريد برمجته و طبيعة الاستخدام وعدد المستخدمين. فمثلاً نظام برمجي تستخدمه بنفسك لإدارة مخزون متجرك يختلف عن نظام سحابي تستخدمه شركة تجارية كبيرة لإدارة مخازنها. لهذا أسعار البرمجة الخاصة تبدأ من 500 دولار و قد تصل إلى 20000 دولار أو أكثر على حسب المشروع