على الرغم من تعدد استخدامات خل التفاح وفوائده الكثيرة التي تعود على البشرة، إلا ان استخدامه بشكل مُركز قد يؤدي إلى الاضرار بها، فقد يؤدي الى الحرق الكيميائي للبشرة كما يؤدي إلى جفافها بشدة.