أثبتت بعض من الدراسات أن هناك علاقة بين تناول سيرترالين وحدوث المشاكل الصحية للحامل و التشوهات أثناء الحمل عند البعض، وعلى الجانب الآخر ترك وإهمال الاكتئاب عند الأم الحامل يُعرضها هي والجنين إلى مشاكل صحية، لذا لابد من التواصل مع الطبيب قبل تناوله لتحديد الجرعات المناسبة والتي يقل ضررها على الأم والجنين.
بالإضافة إلى أنه يؤثر على الرضاعة الطبيعية بشكل سلبي أثناء تناوله، لأنه يؤثر على عاطفة الأم ونومها، كما أنه يؤثر على هرمون السيروتونين في الثدي.