تناول قهوة نظام الكيتو بكثرة قد يكون له آثار معاكسة فيحب الالتزام بكوب واحد في اليوم ويُشرب بدلاً من الوجبة، وليس كمشروب لتناوله مع وجبة الإفطار. قد يؤدي الاستهلاك المفرط للقهوة إلى زيادة الوزن وضيق في الجهاز الهضمي. كما أن استهلاك الدهون بكثرة يحد من كمية الدهون التي يحرقها جسمك ويزيد من مخازن الدهون أيضًا في الجسم.