تختلف مدة علاج نقص فيتامين ب عند الأطفال اعتمادًا على النوع المُحدد لفيتامين ب وشدة النقص والحالة الطبية الرئيسية المُسببة للنقص.
تختلف أيضًا مدة العلاج بناءً على عدة عوامل بما في ذلك: استجابة الطفل للعلاج إذ تختلف الاستجابة من طفل لآخر، على سبيل المثال في حالات النقص الخفيفة يمكن علاجها في غضون بضعة أسابيع من تناول مكملات فيتامين ب، أما حالات النقص الأكثر شدة قد يتطلب العلاج فترات علاج أطول تصل لعدة أشهر.