يتم تناول فلاجيل 500 مرتين في اليوم لمدة 10 إلى 14 يوم لعلاج الثالثي. لعلاج عدوى المفاصل والتهاب العظام يؤخذ قرص بتركيز 500 ملجم 4 مرات يوميًا. تؤخذ جرعة 500- 750 ملجم لمعالجة خراج الكبد، ويتم تناولها 3 مرات كل يوم لمدة من خمسة أيام إلى عشرة أيام. تؤخذ جرعة 250 ملجم لمعالجة الجيارديا، ويتم تناولها لمدة أسبوع ثلاث مرات باليوم. لعلاج عدوى جروح الجلد يؤخذ قرص بتركيز 500 ملجم 4 مرات يوميًا. تؤخذ جرعة  250  ملجم لمعالجة رائحة الفم الكريهة، ويتم تناولها لمدة من خمسة أيام إلى سبعة أيام كل ثلاث مرات باليوم. لعلاج العدوى البكتيرية بالبطن يؤخذ قرص بتركيز 500 ملجم 4 مرات يوميًا. تؤخذ جرعة 500 ملجم لمعالجة جرثومة المعدة، ويتم تناولها لمدة من عشرة أيام إلى أربعة عشر أيام أربع مرات باليوم.