يؤدي تناول الليمون الاسود في بعض الحالات إلى حدوث بعض المشاكل مثل الغثيان والرغبة في التقيؤ والإصابة باضطراب المعدة، وذلك نظرًا عدم قدرة الجسم على امتصاص فيتامين ج بنسبة عالية.