المضاعفات هي المشاكل التي تحدث أثناء العمليات الجراحية أو بعدها ويُعاني معظم الأشخاص الذين خضعوا لعملية استئصال المرارة بالمنظار من مضاعفات قليلة أو لا يُعانون من أي مضاعفات على الإطلاق، وفي الغالب لا تُسبب عملية استئصال المرارة بالمنظار أي مضاعفات. ويرجع عدم تسبب عملية استئصال المرارة بالمنظار أي مضاعفات إلى الجروح البسيطة التي تُجرى أثناء الجراحة على عكس الجرح الغائر للجراحة المفتوحة، ولهذا لا توجد أي مضاعفات من النزيف بعد الجراحة أو مضاعفات لانتشار العدوى وأيضًا آلام بعد عملية المرارة بالمنظار لاتذكر.