تسبب بعض المضادات الحيوية إسهالاً مائيّاً رخواً، لثلاث مرات أو أكثر في اليوم. يُصاب بهذا الإسهال 1 من كل 5 أشخاص يتناولون المضادات الحيوية. لا يحتاج هذا الإسهال إلى علاج، ويختفي في غضون أيام قليلة بعد التوقف عن تناول المضاد الحيوي. يتطلب الإسهال المرتبط بالمضادات الحيوية الأكثر خطورةً إيقاف تناول المضاد الحيوي أو تبديله في بعض الأحيان، والسبب هو أيضاً غياب البكتيريا المفيدة لصحة الجهاز الهضمي.
ختاماً؛ من المهم أن نستخدم جميعاً المضادات الحيوية عندما نحتاج إليها فقط، وباستشارة طبيب مختص لنتجنب آثارها الجانبية، ونكافح مقاومة البكتيريا للمضادات الحيوية.