Shopify تفرض مجموعة من الرسوم، بما في ذلك رسوم الاشتراك الشهري ورسوم معالجة الدفع ورسوم بطاقة الائتمان. بالإضافة إلى ذلك، هناك تكاليف إضافية يجب مراعاتها بالنسبة للموضوعات والتطبيقات وأسماء النطاقات. ومع ذلك، لا يزال من الممكن أن يكون أرخص من بناء متجر من الصفر.