في حين أن البابايا صحية ، فإن تناولها بكميات كبيرة جدًا قد يؤدي إلى بعض الآثار الجانبية مثل اضطراب المعدة بسبب محتواها من الألياف. تحتوي البابايا غير الناضجة أو شبه الناضجة على مادة اللاتكس ، والتي يمكن أن تسبب تقلصات الرحم ، وتفاعلات الحساسية ، وربما تضعف الكلى إذا تم تناولها بكميات كبيرة.