الآثار الجانبية لمضخة القضيب يمكن أن تشمل:
جلطات صغيرة الحجم النقط الحمراء . يحدث هذا بسبب نزيف تحت سطح الجلد من القضيب.
خدر، وبرودة الجلد أو مزرق اللون. وهذا يمكن أن يحدث عندما استعمال الأربطة القابضة .
ألم أو كدمات.  معرفة كيفية استخدام مضخة القضيب بشكل صحيح تساعدك على تجنب إصابة القضيب .
شعور بحصر السائل المنوي . قد تشعر بأن السائل المنوي منحصر عند القذف ، أو قد يكون القذف مؤلماً.
مضخات القضيب لديها بعض العيوب الأخرى المحتملة.