Fatti: A. Il 22 ottobre 2003 l'Ufficio federale dei trasporti (UFT) ha rilasciato alla Carì 2000 SA la concessione n. 3841, valida fino al 31 ottobre 2023, concernente la costruzione e l'esercizio di una seggiovia a quattro posti a movimento continuo da Brusada al Lago di Carì. Detta decisione prevedeva inoltre che entro la fine di agosto 2004 l'impianto di sciovia preesistente andava demolito e rimosso. B. Il 5 ottobre 2005 la Carì 2000 SA ha chiesto la revisione parziale dell'atto di concessione, nel senso di stralciare l'onere concernente la rimozione della sciovia. A sostegno della propria domanda ha fatto valere che la sciovia era stata completamente rinnovata pendente la procedura di concessione e che avrebbe potuto funzionare per altri 15 anni. L'istanza è stata respinta dall'UFT il 2 maggio 2006. La Carì 2000 SA si è quindi rivolta, il 29 maggio successivo, all'allora autorità ricorsuale competente, il Dipartimento federale dell'ambiente, dei trasporti, dell'energia e delle comunicazioni (DATEC). Il 1° gennaio 2007, in seguito alla revisione totale dell'organizzazione giudiziaria federale, l'impugnativa è stata trasmessa al Tribunale amministrativo federale per motivi di competenza. C. Il 24 giugno 2009 la Pretura del Distretto di Blenio ha dichiarato il fallimento della Carì 2000 SA e il 30 settembre successivo è stato nominato l'amministratore speciale dalla prima assemblea dei creditori. D. Il 17 dicembre 2009 l'UFT ha concesso alla Nuova Carì società di gestione Sagl (alla quale la ricorrente aveva concesso in affitto gli impianti sciistici) il rinnovo fino al 15 aprile 2010 della concessione decaduta il 31 maggio 2009 per la seggiovia Carì Croce - Brusada (impianto n. 73.176, concessione n. 3428) nonché ha approvato l'esercizio della seggiovia Brusada - Lago di Carì (impianto n. 73.187, concessione n. 3841). E. Nel frattempo, più precisamente il 10 dicembre 2009 il Tribunale amministrativo federale ha interpellato l'amministratore speciale del fallimento sulla questione dell'interesse della massa fallimentare al mantenimento del ricorso e il 28 aprile successivo, su richiesta delle parti, ha sospeso il procedimento per diversi mesi. Il 21 dicembre 2010, dopo aver ancora una volta consultato le parti, la citata autorità ha stralciato il ricorso dai ruoli per mancanza d'interesse pratico attuale a ricorrere. F. Il 22 dicembre 2010 l'UFT, fondandosi sulla sua precedente decisione del 17 dicembre 2009, ha concesso alla Nuova Carì società di gestione Sagl un nuovo termine fino al 15 aprile 2011 per l'esercizio delle seggiovie Carì Croce - Brusada (impianto n. 73.176, concessione n. 3428) e Brusada - Lago di Carì (impianto n. 73.187, concessione n. 3841). G. Il 1° febbraio 2011 la massa fallimentare Carì 2000 SA, rappresentata dall'amministratore speciale, ha inoltrato dinanzi al Tribunale federale un ricorso in materia di diritto pubblico con cui chiede che la decisione di stralcio sia annullata, che venga constatato il suo interesse pratico attuale a ricorrere e che la causa sia rinviata all'autorità precedente per la decisione di merito. Chiamati ad esprimersi, il Tribunale amministrativo federale ha rinunciato a presentare osservazioni, mentre l'UFT ha chiesto la sospensione del procedimento fino alla conclusione della procedura fallimentare, rispettivamente fino al chiarimento del futuro esercizio delle istallazioni di Carì, ma perlomeno fino al 30 settembre 2011. H. Dopo la pubblicazione su siti giornalistici online della notizia secondo cui in seguito ad un'asta tenutasi il 14 luglio 2011 a Faido gli impianti sciistici di Carì erano stati acquistati dalla Garaventa AG, il Tribunale federale ha invitato le parti ad esprimersi sul quesito di sapere se la lite non era diventata priva d'oggetto, rispettivamente sull'opportunità di ritirare il ricorso nonché sulla questione della ripartizione delle spese e ripetibili. Le rispettive risposte di cui si dirà, se necessario, nei successivi considerandi, sono giunte il 9, 10 e 16 agosto 2011.