Fatti: A. A.a. Con precetto esecutivo 14 maggio 2014 in realizzazione di pegno immobiliare dell'Ufficio di esecuzione di Bellinzona, la banca B._AG ha escusso la società A._SA per l'incasso di fr. 35 milioni oltre interessi. Oggetto del pegno sono le unità di proprietà per piani intestate alla debitrice, sulle quali sorge il Centro commerciale C._. A.b. A seguito dell'opposizione della debitrice, la banca procedente ha adito la competente Pretura del Distretto di Bellinzona con istanza 30 maggio 2014 e ne ha chiesto il rigetto in via provvisoria. Con sentenza 5 febbraio 2016 il Pretore aggiunto ha accolto l'istanza e rigettato l'opposizione, con conseguenza di tassa e spese a carico della debitrice opponente. B. Con la qui impugnata sentenza 13 luglio 2016, la Camera di esecuzione e fallimenti del Tribunale di appello del Cantone Ticino, adita dalla debitrice con reclamo 18 febbraio 2016, ha respinto il gravame e confermato il giudizio di prima sede, segnatamente il rigetto dell'opposizione. C. C.a. Con ricorso in materia civile 28 luglio 2016 al Tribunale federale, la società A._SA (qui di seguito: ricorrente) chiede in via principale l'annullamento della sentenza impugnata, l'accoglimento del suo reclamo contro la sentenza pretorile e, di conseguenza, la reiezione dell'istanza di rigetto provvisorio della propria opposizione, con conseguenza di tassa e spese a carico della controparte. In via subordinata chiede l'annullamento della sentenza impugnata e il rinvio della vertenza all'autorità inferiore. C.b. L'istanza ricorsuale di concessione dell'effetto sospensivo al ricorso è stata respinta con decisione presidenziale 7 settembre 2016. C.c. Nel merito, la banca B._AG (qui di seguito: opponente) chiede che il ricorso, nella misura in cui sia ricevibile, venga respinto. Il Tribunale di appello, riconfermandosi nella motivazione e nelle conclusioni del giudizio impugnato, ha rinunciato ad esprimersi. Le determinazioni dell'opponente e dell'autorità inferiore sono state trasmesse alla ricorrente a tutela del suo diritto di essere sentita.