Faits : A. Par jugement du 19 décembre 2014, rectifié le 5 mai 2015, le Tribunal régional du Jura bernois-Seeland a, notamment, condamné X._ pour extorsion et chantage, à une peine privative de liberté de seize mois, sous déduction de la détention provisoire de trente jours, avec sursis pendant deux ans. En outre, sur le plan civil, il l'a condamné à verser à A._, partie plaignante, un montant de 24'300 fr. à titre de dommages-intérêts, un montant de 2'000 fr. à titre d'indemnité pour tort moral et un montant de 500 fr. à titre d'indemnité pour ses dépenses. B. Par jugement du 27 janvier 2016, la 2e Chambre pénale de la Cour suprême du canton de Berne a rejeté l'appel formé par X._ et confirmé le jugement attaqué. En résumé, elle a retenu les faits suivants: B.a. Le 13 juin 2012, A._ a dénoncé X._ pour lui avoir demandé entre 2008 et 2012 des sommes d'argent pour couvrir ses manquements professionnels et modifier en sa faveur les rapports annuels d'évaluation professionnelle (ci-après: Focus). X._ a été interpellé alors qu'il venait de recevoir 2'000 fr. (deux billets de 1'000 fr.) remis par A._. B.b. Entre 2008 et 2012, X._ a proposé et accepté (après négociations) des versements de A._ pour modifier son évaluation Focus annuelle, à savoir 2'000 fr. le 17 mars 2008, 3'500 fr. entre le 9 avril et le 27 avril 2009, 2'000 fr. le 4 février 2010, 2'000 fr. entre le 2 février et le 9 février 2011 et 2'000 fr. le 14 juin 2012. X._ a reconnu avoir reçu les montants de 1'000 fr. pour l'évaluation 2009, 1'700 fr. en février 2012 pour l'évaluation 2010 et 2000 fr. le jour de son interpellation pour l'évaluation 2011 (jugement de première instance p. 64). Entre 2008 et 2012, X._ a proposé et accepté de l'argent de A._ pour couvrir les erreurs dans son travail, à savoir - des montants de 1'500 fr., de 1'200 fr. et de 1'700 fr., car A._ avait oublié ses clés sur le véhicule, - un montant de 5'000 fr. le 28 novembre 2008, car A._ avait oublié une caisse de courrier pour B._ SA; - un montant de 5'000 fr. le 9 décembre 2010, lorsque A._, blessé à la suite d'un accident, avait été conduit à la Poste de Tramelan par X._, - un montant de 1'700 fr., qui a été prélevé par A._ sur sa prime de 20 ans de fidélité le 15 février 2012, - des montants de 50 fr., remis à X._ chaque samedi où les deux parties étaient présentes, - des montants de 300 fr. le 20 novembre 2009, de 300 fr. le 11 dé- cembre 2009 et de 500 fr. le 21 octobre 2011. B.c. La première fois, en 2008, c'est A._ qui a proposé une somme de 1'000 fr. pour améliorer son évaluation. X._ a refusé l'offre et redéfini la situation selon ses propres termes, exigeant le paiement de 2'000 francs. Par la suite, X._ suggérait quand des paiements devaient avoir lieu et déterminait quelles sommes étaient acceptables. Si, certaines fois, A._ proposait un montant, le recourant négociait la plupart du temps celui-ci à la hausse. C. Contre ce jugement cantonal, X._ dépose un recours en matière pénale devant le Tribunal fédéral. En bref, il conclut, principalement, à son acquittement, à l'allocation d'une indemnité de 6'000 fr. en réparation de l'incarcération subie et de 40'455 fr. pour ses frais de défense, ainsi qu'au rejet de toutes les conclusions civiles. A titre subsidiaire, il demande l'annulation du jugement attaqué et le renvoi de la cause à la cour cantonale pour nouveau jugement.