Faits: A. Le 6 novembre 2012, A._ et B._ ont requis un permis de construire deux chalets sur les parcelles n° 1050, respectivement 1060 de la commune de Rougemont. Le projet a suscité l'opposition, notamment, d'Helvetia Nostra. Par décision du 27 décembre 2012, la Municipalité de Rougemont a écarté l'opposition et délivré le permis de construire. Helvetia Nostra a saisi la Cour de droit administratif et public du Tribunal cantonal vaudois, laquelle a rejeté le recours dans la mesure où il était recevable - laissant indécise la question de la qualité pour agir d'Helvetia Nostra - par arrêt du 16 avril 2013. La cour cantonale s'est référée à un arrêt de principe du 22 novembre 2012 selon lequel l'art. 75b Cst. ne faisait pas obstacle à la délivrance de permis de construire avant le 1 er janvier 2013. Elle a mis à la charge de la recourante 1'000 fr. d'émolument judiciaire, les constructrices n'ayant pas été invitées à procéder. B. Agissant par la voie du recours en matière de droit public, Helvetia Nostra demande au Tribunal fédéral l'annulation de l'arrêt cantonal et le renvoi de la cause à l'autorité de dernière instance, subsidiairement la réforme de l'arrêt attaqué en ce sens que le permis de construire est annulé. Dans des arrêts de principe du 22 mai 2013, le Tribunal fédéral a notamment admis la qualité pour recourir d'Helvetia Nostra (ATF 139 II 271) ainsi que l'applicabilité directe des art. 75b et 197 ch. 9 Cst. (ATF 139 II 243 et 263). Sur le vu de ces arrêts, les parties ont été invitées à se déterminer par ordonnance du 10 juillet 2013. Le Tribunal cantonal s'en rapporte à justice. Une demande de suspension de la cause jusqu'à droit jugé au niveau cantonal sur l'opposition d'un tiers au projet, a été écartée le 22 août 2013. La Municipalité de Rougemont a indiqué que les constructrices entendaient utiliser leurs chalets comme résidences principales, avec mention correspondante au permis de construire et au registre foncier. Les intimées l'ont confirmé dans leurs observations, estimant que le recours serait ainsi devenu sans objet.