Faits: A. A.a A._ et B._ sont les filles de X._ et de dame X._. X._ est décédé en 1991; par testament, il a laissé à son épouse l'usufruit de la totalité de ses biens. Par pacte successoral du 8 mai 1998, dame X._ et A._ ont cédé à B._, à titre d'avancement d'hoirie et de partage, la totalité de leurs droits sur les 55 actions de la société X._ SA, ainsi que tous leurs droits et créances éventuels envers cette société. En contrepartie, B._ s'est engagée à ce que l'immeuble constituant la parcelle n° 2'151 de la commune de Y._ soit attribué en pleine propriété à A._, au moment de la liquidation de la succession de dame X._; il est précisé que cette attribution sera faite à la valeur vénale. Enfin, dame X._ a légué à A._ la quotité disponible de sa succession, afin de l'aider, le moment venu, à assumer les charges de la villa familiale. A.b Le 18 mars 2003, B._ a emprunté à A._ la somme de 200'000 fr., signant une reconnaissance de dette. Il y est prévu que cette somme portera intérêts à un taux toujours inférieur de 1% au taux hypothécaire de la Banque Cantonale de Genève, ce du 18 mars 2003 jusqu'au jour de la signature du partage de la succession de leur mère. A.c Dame X._ est décédée le 28 novembre 2003; la succession de son époux n'avait pas été liquidée avant son décès. B. B.a Le 22 novembre 2005, B._ a ouvert action en partage successoral. B.b Une expertise portant sur la valeur vénale de la propriété de Y._, tant actuelle qu'au mois de novembre 2003, a été ordonnée. Selon le rapport déposé le 16 janvier 2007, l'expert désigné a fixé la valeur vénale de ce bien immobilier à 2'570'000 fr. en novembre 2003, et à 3'680'000 fr. en janvier 2007; pour ce faire, il s'est fondé sur la seule valeur intrinsèque de la villa. B.c Par jugement du 13 mars 2008, le Tribunal de première instance du canton de Genève a ordonné le partage des successions de feux les époux X._, dit que les biens extants se composent de la villa de Y._ pour 3'680'000 fr., des 55 actions de la société X._ SA pour 186'402 fr., du mobilier pour 55'570 fr. et des créances ou autres titres pour leur valeur résultant des relevés bancaires au jour du partage effectif, et attribué à A._ la pleine propriété sur la villa de Y._, sous réserve du versement par l'intéressée d'une soulte à B._, dont le montant devra être calculé en tenant compte de la valeur des créances et autres titres. B.d Statuant sur appel de A._, la Chambre civile de la Cour de justice du canton de Genève a modifié ce jugement par arrêt du 20 mars 2009. Entre autres points, elle a dit que les actifs successoraux de la succession de X._ se composent de la villa de Y._ pour une valeur de partage de 3'680'000 fr., ainsi que des créances et autres titres pour la valeur résultant des relevés bancaires au jour du décès de X._, dit que les actifs successoraux de dame X._ se composent des créances et autres titres pour leur valeur résultant des relevés bancaires au jour du partage effectif de la succession de dame X._ et des 55 actions de la société X._ SA pour une valeur de 186'402 fr., dit que l'avance sur soulte, octroyée par A._ à B._ d'un montant de 200'000 fr. portant intérêts à un taux inférieur de 1% au taux hypothécaire de la Banque Cantonale de Genève du 18 mars 2003 jusqu'au jour du présent jugement, sera imputée sur la soulte due, et désigné un notaire avec mission de procéder à toutes les opérations utiles à l'exécution du partage. C. A._ interjette le 7 mai 2009 un recours en matière civile au Tribunal fédéral contre cet arrêt, concluant à sa modification en ce sens que, d'une part, la valeur de partage de la villa de Y._ devra être actualisée par l'expert désigné par le tribunal à la date la plus proche possible de celle du partage effectif de la succession de ses parents et, d'autre part, l'avance sur soulte de 200'000 fr. octroyée à B._ portera intérêt à un taux inférieur de 1% au taux hypothécaire de la Banque Cantonale de Genève du 18 mars 2003 jusqu'au jour de la signature du partage de la succession de dame X._. L'intimée n'a pas été invitée à déposer des déterminations.