Faits: A. A._ a présenté auprès de la commune de Leysin une demande de permis de construire une maison d'habitation comprenant quatre logements et six garages. Helvetia Nostra a formé opposition. Par décision du 7 septembre 2012, la Municipalité de Leysin a écarté l'opposition. Helvetia Nostra a saisi la Cour de droit administratif et public du Tribunal cantonal vaudois, laquelle a rejeté le recours dans la mesure où il était recevable - laissant indécise la question de la qualité pour agir d'Helvetia Nostra - par arrêt du 6 décembre 2012. La cour cantonale s'est référée à un arrêt de principe du 22 novembre 2012 selon lequel l'art. 75b Cst. ne faisait pas obstacle à la délivrance de permis de construire avant le 1er janvier 2013. Elle a mis à la charge de la recourante 1'000 fr. d'émolument judiciaire. B. Agissant par la voie du recours en matière de droit public, Helvetia Nostra demande au Tribunal fédéral l'annulation de l'arrêt cantonal et le renvoi de la cause à l'autorité de dernière instance, subsidiairement la réforme de l'arrêt attaqué en ce sens que l'autorisation de construire délivrée à l'intimé est annulée. L'effet suspensif a été accordé et la procédure a été suspendue par ordonnance présidentielle du 21 février 2013. Dans des arrêts de principe du 22 mai 2013, le Tribunal fédéral a notamment admis la qualité pour recourir d'Helvetia Nostra (ATF 139 II 271) ainsi que l'applicabilité directe des art. 75b et 197 ch. 9 Cst. (ATF 139 II 243 et 263). Sur le vu de ces arrêts, la procédure a été reprise par ordonnance du 12 juillet 2013 et les parties ont été invitées à se déterminer. Le Tribunal cantonal et la Municipalité de Leysin s'en remettent à justice. Le constructeur a fait savoir qu'un client local désire acquérir un appartement, que la vente d'un deuxième est nécessaire pour démarrer le projet et que les deux derniers appartements pourraient alors être mis en location. Il se prévaut par ailleurs d'une demande de préavis à la commune faite en février 2011.