Faits: A. A._ a déposé plainte pénale le 22 décembre 2010 contre X._ pour viol et contrainte. En substance, elle a expliqué être venue en Suisse en 1995, à l'âge de 15 ans, pour garder les enfants de sa cousine B._ et de son époux X._, en qualité de jeune fille au pair. Au mois de janvier 2002, celui-ci se serait rendu dans sa chambre, se serait couché à côté d'elle dans le lit et, malgré ses protestations, se serait mis sur elle après s'être déshabillé. Elle aurait tenté de le repousser, mais il l'aurait maintenue, lui aurait enlevé le bas de son pyjama et l'aurait pénétrée vaginalement, sans préservatif. Il aurait agi une seconde fois quelques jours plus tard, menaçant de dire ce qui s'était passé à ses parents pour qu'elle se laisse faire. A la suite de ces événements, A._, qui n'aurait jamais eu de relations sexuelles auparavant, est tombée enceinte. X._ lui aurait interdit de parler de ces événements à son épouse. Dès lors que la jeune femme n'avait plus de permis de séjour et de travail en Suisse, il l'aurait menacée de la dénoncer aux autorités si elle parlait. A son retour d'un voyage au Portugal la même année, elle a affirmé avoir rapporté à B._ que l'enfant était le fils de l'époux de celle-ci et qu'il l'avait violée. Elle a accouché le 28 octobre 2002. X._ l'aurait en outre menacée d'enlever son fils si elle quittait le domicile, de sorte qu'elle y est restée jusqu'au 1er mai 2009. Elle a précipitamment quitté les lieux à la suite d'une dispute au cours de laquelle il lui aurait serré le cou. Elle a notamment articulé des prétentions civiles à hauteur de 20'000 fr. à titre de tort moral. X._ a contesté les faits qui lui étaient reprochés. Il a soutenu que A._ aurait tenté de le séduire et que les rapports sexuels entretenus auraient été consentis. Celle-ci lui aurait annoncé ainsi qu'à son épouse le jour de son départ, soit le 1er mai 2009, qu'il était le père de l'enfant né en 2002. Il n'aurait en outre jamais menacé ou levé la main sur elle. Entendue sur ces faits, B._ a contesté avoir été informée avant le départ de A._ de chez eux en 2009 que son époux était le père du fils de celle-ci. S'agissant des circonstances dans lesquelles l'enfant avait été conçu, elle a affirmé n'avoir appris les accusations de viol qu'à l'ouverture de l'enquête pénale, lorsque son mari a été convoqué par la police. B. Par ordonnance du 28 mars 2013, le Procureur de l'arrondissement de La Côte a prononcé le classement de la procédure pénale dirigée contre X._. C. Par arrêt du 5 juin 2013, la Chambre des recours pénale du Tribunal cantonal du canton de Vaud a rejeté le recours de A._. D. Cette dernière forme un recours en matière pénale au Tribunal fédéral contre cet arrêt, concluant, avec suite de dépens, à son annulation. Elle sollicite par ailleurs l'assistance judiciaire.