Faits: A. En septembre 2001, X._ est venue du Japon pour travailler dans un restaurant de St-Aubin (NE). Son employeur, Y._, a mis à sa disposition un appartement qu'elle partageait avec un collègue, Z._. B. Le 29 novembre 2005, X._ a informé la police que, entre fin septembre 2001 et fin octobre 2001, elle avait été violée à une vingtaine de reprises par Z._, dans l'appartement fourni par leur employeur. Elle reprochait à celui-ci de n'avoir rien entrepris pour la protéger, alors qu'elle s'était confiée à lui, et d'avoir toléré les agissements de son employé. Une instruction a été ouverte contre le complice et l'auteur présumés. Celui-ci a rapidement admis avoir eu des relations sexuelles avec X._ mais a contesté tout viol de sa part. Le 13 avril 2010, le Ministère public du canton de Neuchâtel a clos la procédure par une décision de non-lieu pour insuffisance de charges. C. Par arrêt du 16 novembre 2010, la Chambre d'accusation du Tribunal cantonal neuchâtelois a rejeté le recours formé par X._ et confirmé la décision de non-lieu. D. X._ forme un recours en matière pénale contre cet arrêt. Elle conclut à son annulation et au renvoi en jugement de Z._ et Y._ devant le tribunal compétent. Elle sollicite également l'octroi de l'assistance judiciaire.