Sachverhalt: A. Der Gemeinderat Aeugst am Albis erteilte Y.a._ und Y.b._ am 10. Juli 2007 die Baubewilligung für das Bauvorhaben "Teilabbruch und Teilneubau Einfamilienhaus" auf dem Grundstück Kat.-Nr. 444 in der Wohnzone (W2). Als Auflage wurde verfügt, dass keine zusätzlichen Geländeerhöhungen gestattet seien in Bereichen, wo das bestehende Terrain bereits um mehr als 1.5 m höher als das gewachsene Terrain liege; vor Baufreigabe seien der Gemeinde entsprechende Schnittpläne zur Bewilligung einzureichen (Ziff. 2.5). Vor Ausführung der Umgebungsarbeiten sei ein Umgebungsplan zur Bewilligung vorzulegen (Ziff. 2.12). Am 2. Oktober 2007 wurden Änderungen an der Dachneigung bewilligt. B. Am 13. Juli 2010 erteilte der Gemeinderat Aeugst am Albis Y.a._ und Y.b._ die baurechtliche Bewilligung für die Terraingestaltung. Dagegen erhob u.a. X._ Rekurs an die Baurekurskommission II des Kantons Zürich. Diese wies den Rekurs mit Entscheid vom 31. Januar 2012 ab. Die dagegen gerichtete Beschwerde von X._ wies das Verwaltungsgericht des Kantons Zürich am 30. Mai 2012 ab. C. Gegen den verwaltungsgerichtlichen Entscheid hat X._ am 20. August 2012 Beschwerde in öffentlich-rechtlichen Angelegenheiten ans Bundesgericht erhoben. Sie beantragt, der angefochtene Entscheid sei aufzuheben. Die Beschwerdegegner, der Gemeinderat und das Verwaltungsgericht schliessen auf Abweisung der Beschwerde, soweit darauf einzutreten sei. Die Beschwerdeführerin hat auf eine Replik verzichtet.