Sachverhalt: A. Die Staatsanwaltschaft des Kantons Aargau führt gegen C._ und B._ ein Strafverfahren wegen mehrfacher ungetreuer Geschäftsbesorgung bzw. wegen Anstiftung dazu (Art. 158 Ziff. 1 StGB). Anlass gab eine Anzeige der D._ AG (früher: E._ AG), die den beiden vorwirft, mit Hilfe gefälschter Wertgutachten Hypothekardarlehen zum Kauf von Liegenschaften aufgenommen zu haben, wobei die Darlehen den Kaufpreis überstiegen hätten und die Differenz nicht an die kreditnehmenden Gesellschaften, sondern an B._ geflossen sei. Die Staatsanwaltschaft geht davon aus, dass C._ die Darlehen in seiner Funktion als Organvertreter für die E._ AG, die F._ AG und die G._ AG aufnahm und einen Teil des Überschusses an B._ auszahlen liess. Die Überweisungen hätten teilweise auf einer "Provisionsvereinbarung" zwischen B._, C._ und den genannten Gesellschaften beruht. Danach stehe B._ eine Provision von 50 % der "Überfinanzierung" zu, wenn eine Finanzierung durch dessen Hausbank, die H._, zustande komme. Es bestehe der Verdacht, dass B._ C._ zur ungetreuen Geschäftsbesorgung angestiftet habe. Nach Eröffnung des Strafverfahrens hätten die beiden Beschuldigten übereinstimmend ausgesagt, dass die Gelder bei sämtlichen Immobilienkäufen in den Jahren 2010 und 2011 zunächst an A._, einen Notar aus dem Kanton Bern, überwiesen und durch diesen dann weitergeleitet worden seien. Mit Editionsverfügung vom 6. März 2014 forderte die Staatsanwaltschaft A._ auf, Abrechnungen und Belege betreffend den Kauf einer Reihe von Liegenschaften durch die E._ AG, die F._ AG und die G._ AG einzureichen. A._ kam der Aufforderung nach und verlangte gleichzeitig die Siegelung der Unterlagen. Die Staatsanwaltschaft reichte am 17. März 2014 beim Zwangsmassnahmengericht des Kantons Aargau ein Entsiegelungsgesuch ein. Das Zwangsmassnahmengericht ersuchte in der Folge die Justiz-, Gemeinde- und Kirchendirektion (JGK) des Kantons Bern als Aufsichtsbehörde über das Notariat, A._ von seinem Berufsgeheimnis zu entbinden. Mit Entscheid vom 20. Mai 2014 trat die JGK auf das Gesuch nicht ein. Das kantonale Notariatsgesetz vom 22. November 2005 (NG; BSG 169.11) sehe kein Verfahren zur Entbindung vom Berufsgeheimnis vor. Mit Verfügung vom 13. Juni 2014 hiess das Zwangsmassnahmengericht das Entsiegelungsgesuch gut. B. Mit Eingaben vom 21. Juni und 18. Juli 2014 erhebt A._ Beschwerde in Strafsachen ans Bundesgericht. Er beantragt im Wesentlichen, die Verfügung des Zwangsmassnahmengerichts sei aufzuheben. Eventualiter sei anzuordnen, dass jene Dokumente, die dem Berufsgeheimnis unterlägen, weiterhin versiegelt blieben. Subeventualiter sei eine entsprechende Anordnung für sämtliche versiegelten Dokumente zu erlassen und die Sache zum neuen Entscheid ans Zwangsmassnahmengericht zurückzuweisen. Das Zwangsmassnahmengericht, die Oberstaatsanwaltschaft und B._ haben auf eine Vernehmlassung in der Sache verzichtet. C._ verlangt sinngemäss die Abweisung der Beschwerde. Die Staatsanwaltschaft beantragt, auf die Beschwerde sei nicht einzutreten, eventualiter sei sie abzuweisen.