Sachverhalt: A. X._ mietete von A.A._ und B.A._ von 1989 bis Ende 2014 eine Werkstatt- und Lagerhalle. Diese befand sich unterhalb des Hühnerstalls von A.A._ und B.A._. Der Hühnerstall wurde sporadisch gereinigt, wobei das Desinfektionsmittel "Stalldes 03", welches Peroxyessigsäure enthält, eingesetzt wurde. Am 28. Februar 2017 erstattete X._ Strafanzeige gegen A.A._ und B.A._ wegen fahrlässiger Körperverletzung. Er wirft ihnen vor, er sei durch das Desinfektionsmittel "Stalldes 03" vergiftet worden. B. Die Staatsanwaltschaft Emmen stellte das Verfahren am 24. Oktober 2017 ein. Sie auferlegte X._ die Kosten des Untersuchungsverfahrens von Fr. 1'300.-- und verpflichtete ihn, B.A._ eine Anwaltskostenentschädigung von Fr. 972.-- zu bezahlen sowie seine eigenen Anwaltskosten zu tragen. Das Kantonsgericht Luzern wies die Beschwerde von X._ gegen die Einstellungsverfügung am 5. Juli 2018 ab. Es bestätigte die Kostenauferlegung für das Untersuchungsverfahren, gewährte X._ die unentgeltliche Rechtspflege und auferlegte ihm die Kosten für das Beschwerdeverfahren. C. X._ beantragt mit Beschwerde in Strafsachen, der Beschluss des Kantonsgerichts sei aufzuheben und die Strafuntersuchung sei an das Kantonsgericht oder die Staatsanwaltschaft zurückzuweisen zur weiteren Abklärung, insbesondere zur Einholung einer forensisch-toxikologischen Untersuchung einer Gewebeprobe sowie zur Abklärung der noch vorhandenen Spuren in der Halle unter dem Hühnerstall und an den eingelagerten Schallplatten und bei der Autoschwelle von X._. Subeventualiter beantragt er, die genannten Abklärungen seien durch das Bundesgericht vorzunehmen. Die Kosten des Vorverfahrens inkl. Anwaltskosten sowie des kantonsgerichtlichen Verfahrens seien A.A._ und B.A._ aufzuerlegen, eventualiter seien sie zu Lasten der Staatskasse zu verlegen, und die A.A._ und B.A._ (gemeint ist wohl nur B.A._, vgl. oben, Bst. B.) zugesprochene Parteientschädigung sei aufzuheben. X._ ersucht um unentgeltliche Rechtspflege. Am 8. und 30. April 2019 reichte X._ dem Bundesgericht weitere Akten ein.