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メタノケッラ属 メタノケッラ属 メタノサエタ属 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノミクロビウム綱 Methanomicrobia 目 : メタノケッラ目 Methanosarcinales 科 : メタノケッラ科 Methanocellaceae 属 : メタノケッラ属 Methanocella 学名 Methanocella Sakai et al. 2008 種 M. paludicola " M. arvoryzae " メタノケッラ属 （メタノケッラぞく、 Methanocella 、 メタノセラ属 ）は、 水田 から分離された メタン菌 （メタン生成 古細菌 ）である。この属のみでメタノケッラ目メタノケッラ科を構成する。 学名 は ラテン語 で、「メタン（methanum;メタヌム）を生成する 細胞 （cella;ケッラ）」という意味。 この属は 2007年 に培養が報告され、 2008年 に記載されたものである。水田や湖水、泥炭地に生息するメタン菌Rice Claster Iと呼ばれる系統に属しているが、この系統は低濃度の基質に適応しているため純化が難しく、これまで純粋培養は報告されていなかった。そこで、 水素 や 酢酸 を生成する 真正細菌 Syntrophobacter fumaroxidans との共培養により他のメタン菌を排除した後、純粋培養が行われた。これらの系統は特に水田で優占しており、水田からのメタン放出に重要な働きをしていると考えられている。 形態は0.5×2μm程度のグラム陰性の桿菌。水素、 二酸化炭素 あるいは 蟻酸 をメタン生成の基質として利用し、炭素源として酢酸を要求する。増殖は遅く、 Methanocella paludicola の 倍加時間 は4.2日である。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノコックス綱 メタノコックス綱 メタノコックス綱 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノコックス綱 Methanococci 学名 Methanococci Boone 2002 目 メタノコックス目 メタノコックス綱 ( Methanococci )は主に 海洋 に分布する メタン生成古細菌 の1 綱 である。 グラム陰性 で運動性を持つ 球菌 であり、 水素 と 二酸化炭素 、または ギ酸 を資化して 増殖 する。細胞表面は単純 タンパク質 性の薄い 細胞壁 （ S層 ）に包まれているが、機械的強度が弱く 純水 や 界面活性剤 に接触すると容易に 溶菌 する。メタノコックス科は常温性（または弱い好熱性）で海洋沈殿物などの広い嫌気条件、メタノカルドコックス科は超好熱性で 深海 の 熱水噴出孔 などに生息する。GC含量が低く（一般に40%以下）、これにより同じグラム陰性のメタン菌 メタノミクロビウム綱 との区別が可能である。 メタノコックス綱の仲間では Methanocaldococcus jannaschii が最も研究が進んでおり、 古細菌 として初めて全 ゲノム の配列が解読された。古細菌は DNA複製 、 転写 、 翻訳 などに 真核生物 に似たところがあると言われていたが、これによりゲノムレベルで類似していることが実証された。至適条件での世代時間が26分とメタン菌の仲間では2番目に速いため、この他様々な研究に使用されている。 メタノコックス綱は ユリアーキオータ門 の綱の1つで、系統解析からは メタノバクテリウム綱 や メタノピュルス綱 に近縁なことが示されている。下位分類はメタノコックス目以下1目2科4属が設定されている。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノサルキナ属 メタノサルキナ属 メタノサルキナ属 Methanosarcina barkeri 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノミクロビウム綱 Methanomicrobia 目 : メタノサルキナ目 Methanosarcinales 科 : メタノサルキナ科 Methanosarcinaceae 属 : メタノサルキナ属 Methanosarcina 学名 Methanosarcina Kluyver and van Niel 1936 種 #分類 参照 メタノサルキナ属 （ Methanosarcina 、 メタノサルシナ ）は、多様な淡水域・ 哺乳類 の 消化器官 に分布する メタン生成古細菌 である。 水素 のほか 有機酸 や アルコール なども メタン生成 の基質として用いることができる。メタノサルキナの発見は 1930年代 にまで遡り、メタン菌の中でも最も古い部類に入る。 形態は 球菌 が基本で、それらが多数集まったサルキナ様の群体を形成する種も多い。個々の細胞を包む S層 の外側に、 動物 組織に存在する コンドロイチン に似たメタノコンドロイチンを持ち群体を形成する。属名はこの形態に由来しており、ラテン語でメタン+Sarcina（サルキナ、包み）を意味している。 栄養的には通性独立栄養または従属栄養的に増殖する。メタノサルキナはメタン菌の中でも特に多様な物質をメタン生成の基質に利用することが可能であり、水素- 二酸化炭素 系のほかに、 ギ酸 、 酢酸 、 メタノール 、メチルチオール、 メチルアミン 、 一酸化炭素 などを利用することができる。酢酸を基質に反芻動物の胃や メタン発酵 装置でしばしば優占する。 人間 の 大腸 からも分離されている。 ゲノム サイズは記載されている古細菌の中では最大である。 Methanosarcina acetivorans C2Aのゲノムサイズは575万1492 bp 、 ORF は4540箇所であり、解析時は全 原核生物 の中でも4番目に大きいものであった。他に M. barkeri （483万7408bp）、 Methanosarcina mazei （409万6345bp）のゲノムが解読されている。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノサルシナ-フェナジンヒドロゲナーゼ メタノサルシナ-フェナジンヒドロゲナーゼ メタノサルシナ-フェナジンヒドロゲナーゼ 識別子 EC番号 1.12.98.3 CAS登録番号 9027-05-8 データベース IntEnz IntEnz view BRENDA BRENDA entry ExPASy NiceZyme view KEGG KEGG entry MetaCyc metabolic pathway PRIAM profile PDB 構造 RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum 遺伝子オントロジー AmiGO / QuickGO 検索 PMC articles PubMed articles NCBI proteins メタノサルシナ-フェナジンヒドロゲナーゼ （methanosarcina-phenazine hydrogenase）は、次の 化学反応 を 触媒 する 酸化還元酵素 である。 H 2 + 2-(2,3-ジヒドロペンタプレニルオキシ)フェナジン ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } 2-ジヒドロペンタプレニルオキシフェナジン 反応式の通り、この酵素の 基質 は H 2 と2-(2,3-ジヒドロペンタプレニルオキシ)フェナジン、生成物は2-ジヒドロペンタプレニルオキシフェナジンである。 組織名は hydrogen:2-(2,3-dihydropentaprenyloxy)phenazine oxidoreductase で、別名にmethanophenazine hydrogenase、methylviologen-reducing hydrogenaseがある。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノスパエラ属 メタノスパエラ属 メタノスパエラ属 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノバクテリウム綱 Methanobacteria 目 : メタノバクテリウム目 Methanobacteriales 科 : メタノバクテリウム科 Methanobacteriaceae 属 : メタノスパエラ属 Methanosphaera 学名 Methanosphaera Miller and Wolin 1985 下位分類（種） M. cuniculi M. stadtmanae メタノスパエラ属 （メタノスファエラ属、-ぞく、 Methanosphaera ）は、メタノバクテリウム科に属す メタン菌 の一 属 である。主に 哺乳類 の 大腸 にみられ、 1985年 に ヒト から分離、報告された。 腸内環境によく適応しており、増殖条件は常温（37℃程度）、中性の強い嫌気環境である。大腸では Bacteroides などの 真正細菌 の活動により、 有機物 が 酢酸 、 水素 、 二酸化炭素 、 メタノール などに分解されるため、これらを基質に増殖している。 外観は1μm程度の 球菌 。大半が 桿菌 の メタノバクテリウム綱 の中では例外的である。シュードムレインより構成される 細胞壁 を持ち、 グラム染色 では陽性を示す。一般的に 鞭毛 を持たず、運動能力はない。細胞壁と鞭毛の有無は他のメタノバクテリウム綱と類似している。 栄養的には、水素-二酸化炭素や 蟻酸 をメタン生成の基質に用いるメタノバクテリウム綱他属とは異なり、この系を欠いており、代わりに メタノミクロビウム綱 の一部菌種と同様にメタノールを水素で還元してメタン生成とプロトン濃度勾配の形成（ ATP 合成）を行う。この他、増殖に炭素源として酢酸と二酸化炭素を要求するが、これらをメタン生成の基質として用いることはできない。 2006年 に Methanosphaera stadtmanae について全 ゲノム の解読が報告された。ゲノムサイズは176万7403 bp 、ORF1534箇所。GC含率は28%と異常に低く、 古細菌 の中で最も低い。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノテルムス属 メタノテルムス属 メタノテルムス属 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノバクテリウム綱 Methanobacteria 目 : メタノバクテリウム目 Methanobacteriales 科 : メタノテルムス科 Methanothermaceae 属 : メタノテルムス属 Methanothermus 学名 Methanothermus Stetter 1982 下位分類（種） M. fervidus M. sociabilis メタノテルムス属 （-ぞく、 Methanothermus 、メタノサーマス）は グラム陽性 、偏性嫌気性、超好熱性の メタン生成古細菌 の1属である。メタン菌の中でも好熱性はかなり高い部類に属し、1980年代初頭のごく短期間であるが、最も増殖温度が高い生物として知られていた。 1981年 に アイスランド の熱水泉より発見、報告された。形態は3×0.3-4μm程の 鞭毛 を持たない 桿菌 で、運動性はない。 細胞壁 はシュードムレインであり、グラム染色では陽性に染まる。これらの特徴は Methanobacterium と類似するが、メタノバクテリウム科の Methanothermobacter などと比べても明らかに生育温度が高く、 抗原抗体反応 の傾向も異なることから、メタノバクテリウム目にメタノテルムス科が新設された。細胞表面の珍しい構造としては、シュードムレインの外側にさらに S層 があること（ほかのメタノバクテリウム綱はS層を欠く）、中央付近で架橋されたH型カルドアーキオール（C80）をコア脂質に持つ点などがある。 熱水中の 水素 と 二酸化炭素 から メタン を合成する独立栄養生物であり、それ以外の基質、 蟻酸 や メタノール などは利用しない。 至適増殖温度は80-90 °C 、生育温度は最高で97 °C にまで達し、メタン菌の仲間でも Methanopyrus kandleri （122 °C ）に次ぐ好熱性の高さである。発見当時は Sulfolobus solfataricus （87 °C ）の記録を10℃更新し、同年 Pyrodictium occultum （110 °C ）が報告されるまでの短期間であるが、最も高温で増殖できる生物であった。 生育温度が高すぎることや、 有機物 による増殖阻害があることなどから、 メタン発酵 を含め工業的な利用は殆どされていない。利用例は分子生物学的研究に限られ、特に古細菌型 ヒストン や ヌクレオソーム についての研究論文でよく名前を見かける。 全ゲノムは、2010年に Methanothermus fervidus のものが解読されている。ゲノムサイズは1,243,342bpしかなく、自由生活性生物としては極端に小さい。 ^ Anderson I, Djao OD, Misra M, et al. (November 20, 2010). “Complete genome sequence of Methanothermus fervidus type strain (V24S)” . Stand Genomic Sci. 3 (3): 315–324. doi : 10.4056/sigs.1283367 . PMC   3035299 . PMID   21304736 . https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC
M, et al. (November 20, 2010). “Complete genome sequence of Methanothermus fervidus type strain (V24S)” . Stand Genomic Sci. 3 (3): 315–324. doi : 10.4056/sigs.1283367 . PMC   3035299 . PMID   21304736 . https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3035299/ .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノトサウルス メタノトサウルス メタノトサウルス 地質時代 三畳紀 分類 ドメイン : 真核生物 Eukaryota 界 : 動物界 Animalia 門 : 脊索動物門 Chordata 亜門 : 脊椎動物亜門 Vertebrata 綱 : 爬虫綱 Reptilia 亜綱 : 双弓亜綱 Diapsida 上目 : 鰭竜上目 Sauropterygia 目 : 偽竜目 Nothosauria 科 : ノトサウルス科 Nothosauridae 属 : メタノトサウルス属 Metanothosaurus 学名 Metanothosaurus Yabe & Shikama, 1948 種 M. nipponicus （ 模式種 ） メタノトサウルス （稲井竜、 Metanothosaurus nipponicus ）は、 1939年 ( 昭和 14年)に発見された海棲 爬虫類 である。和名、「 稲井竜 」(いないりゅう)として知られている。その名前の由来は、発掘地の地層である 三畳系 稲井層群。 偽竜 類として記載された（ 魚竜 とする説もある）。2014年の研究において 疑問名 とされている。 ^ Takahashi, Yui; Nakajima, Yasuhisa; Sato, Tamaki (2014-10). “An Early Triassic Ichthyopterygian Fossil from the Osawa Formation in Minamisanriku Town, Miyagi Prefecture, Japan” . Paleontological Research 18 (4): 258–262. doi : 10.2517/2014pr023 . ISSN   1342-8144 . https://doi.org/10.2517/2014pr023 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノトリクス属 メタノトリクス属 メタノトリクス属 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノミクロビウム綱 Methanomicrobia 目 : メタノサルキナ目 Methanosarcinales 科 : "メタノサエタ科" " Methanosaetaceae " 属 : メタノトリクス属 Methanothrix 学名 Methanothrix Huser et al. 1983 種 M. soehngenii （= Methanosaeta concilii ） M. thermoacetophila M. thermophila "M. harundinacea" （= Methanosaeta harundinacea ） メタノトリクス属 （ Methanothrix ）は、 メタン 醗酵槽などから見つかる 酢酸 資化性の メタン菌 （メタン生成 古細菌 ）である。この属のみで"メタノサエタ科"を構成する。 学名 は、メタン菌であることと形状から、 メタン + ギリシア語 のthrix（髪）より。 かねてより、 Methanosaeta （ メタノサエタ属 ）と Methanothrix （ メタノトリクス属） どちらが有効か論争となっていたが、 Methanosaeta は非合法名と裁定され、 Methanothrix が有効となった。ただし、 Methanosaeta harundinacea の再分類、Methanosaetaceae（メタノサエタ科）の訂正は2018年現在行われていない。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノナトロナルカエウム・テルモピルム メタノナトロナルカエウム・テルモピルム メタノナトロナルカエウム・テルモピルム 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノナトロナルカエウム綱 Methanonatronarchaeia 目 : メタノナトロナルカエウム目 Methanonatronarchaeales 科 : メタノナトロナルカエウム科 Methanonatronarchaeaceae 属 : メタノナトロナルカエウム属 Methanonatronarchaeum 種 : M. テルモピルム M. thermophilum 学名 Methanonatronarchaeum thermophilum Sorokin et al. 2018 メタノナトロナルカエウム・テルモピルム （ Methanonatronarchaeum thermophilum ）は、 2018年 に記載された 好塩性 の メタン生成 古細菌 である。好アルカリ性と強い好塩性、弱い好熱性を示す。 学名 は「熱を好む、メタン（生成）好アルカリ性古細菌」といったほどの意味である。 高度好塩菌 の系統の姉妹群とみなされており、2018年8月現在、この種のみで（単型）メタノナトロナルカエウム綱を形成する。 シベリア 南西部 アルタイ地方 クルンダ草原にある、超塩水ソーダ湖の嫌気性沈殿物より分離された。運動性を有する 球菌 で、コロニーはピンク色を呈する。 メタン生成 の基質としては、 メタノール 、 メチルアミン 、 ジメチルスルフィド などを最終電子受容体として、 ギ酸 などのC1メチル化合物や 水素 を電子供与体として利用する。生育には炭素源として 酢酸 や 酵母 抽出物が必要である。増殖の最適条件は、48 °C 、pH9.5、4mol/L（ナトリウムイオン濃度）。最高増殖温度は55 °C である。 ^ Manuel Ferrer et al. (2018). “Proteomic Analysis of Methanonatronarchaeum thermophilum AMET1, a Representative of a Putative New Class of Euryarchaeota, “Methanonatronarchaeia””. Genes (Basel). 9 (2). doi : 10.3390/genes9020028 .   ^ Sorokin, D.Y., et al. (2018). “Methanonatronarchaeum thermophilum gen. nov., sp. nov. and 'Candidatus Methanohalarchaeum thermophilum', extremely halo(natrono)philic methyl-reducing methanogens from hypersaline lakes comprising a new euryarchaeal class Methanonatronarchaeia classis nov.”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68 (7): 2199-2208. doi : 10.1099/ijsem.0.002810 .   ^ Sorokin, D.Y., et al. (2015). “Methanogenesis at e
educing methanogens from hypersaline lakes comprising a new euryarchaeal class Methanonatronarchaeia classis nov.”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68 (7): 2199-2208. doi : 10.1099/ijsem.0.002810 .   ^ Sorokin, D.Y., et al. (2015). “Methanogenesis at extremely haloalkaline conditions in the soda lakes of Kulunda Steppe (Altai, Russia).”. FEMS Microbiol Ecol. 91 : 4. doi : 10.1093/femsec/fiv016 .   ^ a b c d Dimitry Y. Sorokin et al. (2017). “Discovery of extremely halophilic, methyl-reducing euryarchaea provides insights into the evolutionary origin of methanogenesis”. Nat Microbiol. . doi : 10.1038/nmicrobiol.2017.81 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノバクテリウム属 メタノバクテリウム属 メタノバクテリウム属 分類 ドメイン : 古細菌 archaea 界 : メタノバクテリウム界 Methanobacteriati 門 : メタノバクテリウム門 Methanobacteriota 綱 : メタノバクテリウム綱 Methanobacteria 目 : メタノバクテリウム目 Methanobacteriales 科 : メタノバクテリウム科 Methanobacteriaceae 属 : メタノバクテリウム属 Methanobacterium 学名 Methanobacterium Kluyver and van Niel 1936 種 M. aarhusense M. alcaliphilum M. beijingense M. bryantii M. congolense M. curvum M. espanolae M. formicicum M. ivanovii M. oryzae M. palustre M. subterraneum M. thermaggregans M. uliginosum メタノバクテリウム属 ( Methanobacterium )とはメタノバクテリウム科 (Methanobacteriaceae) の 属 の一つである 。 名前とは裏腹に 細菌 ではなく 古細菌 であり、それどころか本属は 古細菌 ドメインのタイプ属に指定されている。細菌に特徴的な生体高分子、 ムレイン を細胞膜から欠いている 。 Methanobacterium 属は 嫌気性 で、多くは非運動性である。メタン生成の基質としては、 ギ酸 あるいは 水素分子 + 二酸化炭素 の両方、あるいはどちらかを使用するものが多い。一部の種は 一酸化炭素 や アルコール も用いることができる。嫌気消化槽やその排水、 温泉 、 哺乳類 の 消化器官 など、比較的暖かい低酸素の環境に広く分布する。 ^ NCBI も参照の事。 webpage on Methanobacterium . Data extracted from the “ NCBI taxonomy resources ”. National Center for Biotechnology Information . 2007年3月19日閲覧。 ^ 類似物質であるシュードムレインを持つが、真正細菌のペプチドグリカンとは構造が異なる ^ Boone, David R. (2015) (英語). Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria . John Wiley & Sons, Ltd. doi : 10.1002/9781118960608.gbm00495/full . ISBN  9781118960608 . http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/9781118960608.gbm00495/abstract   ^ Wasserfallen, A. (2000). “Phylogenetic analysis of 18 thermophilic Methanobacterium isolates supports the proposals to create a new genus, Methanothermobacter gen. nov., and to reclassify several isolates in three s
9781118960608.gbm00495/abstract   ^ Wasserfallen, A. (2000). “Phylogenetic analysis of 18 thermophilic Methanobacterium isolates supports the proposals to create a new genus, Methanothermobacter gen. nov., and to reclassify several isolates in three species, Methanothermobacter thermautotrophicus comb. nov., Methanothermobacter wolfeii comb. nov., and Methanothermobacter marburgensis sp. nov”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 50 (1): 43–53. doi : 10.1099/00207713-50-1-43 . ISSN   1466-5026 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノバクテリウム界 メタノバクテリウム界 メタノバクテリウム界 Thermococcus gammatolerans 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : メタノバクテリウム界 Methanobacteriati 学名 Methanobacteriati (Garrity & Holt) Oren & Göker 2024 下位分類（門） メタノバクテリウム門 テルモコックス綱 メタノバクテリウム綱 メタノコックス綱 メタノピュルス綱 テルモプラズマ門 テルモプラズマ綱 ハロバクテリウム門 アルカエオグロブス綱 メタノサルシナ綱 メタノナトロナルカエウム綱 ハロバクテリウム綱 メタノバクテリウム界 ( Methanobacteriati )は、 メタノバクテリウム属 を タイプ属 とする 古細菌 の 界 である。 歴史的事情により 細菌界 を意味する -bacteriati という語尾が付いているが、本界は 細菌 ドメインではなく古細菌ドメインに所属している。 ユリアーキオータ界 （Euryarchaeota）とも呼ばれることがあるが、 国際原核生物命名規約 （ICNP）に基く正当な名称ではない。 主に16S rRNA系統解析によって他の古細菌と区別されている。 テルモプロテウス界 との比較では、DNAポリメラーゼや細胞分裂機構の差異が大きい。 メタン生成菌 や 高度好塩菌 、超 好熱菌 、好熱好酸菌、 硫酸還元菌 、嫌気的メタン酸化菌など多様な古細菌が含まれる。 ^ Göker, Markus; Oren, Aharon (2024). “Valid publication of names of two domains and seven kingdoms of prokaryotes” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 74 (1): 006242. doi : 10.1099/ijsem.0.006242 . ISSN   1466-5034 . PMID   38252124 . https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.006242 .   ^ Woese, CR; Kandler O, Wheelis ML (1990). “Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya”. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 : 4576–4579. PMID   2112744 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノバクテリウム綱 メタノバクテリウム綱 メタノバクテリウム綱 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : メタノバクテリウム綱 Methanobacteria 学名 Methanobacteria Boone 2002 目 メタノバクテリウム目 メタノバクテリウム綱 ( Methanobacteria )は 古細菌 ユリアーキオータ門 に属す 綱 の1つであり、 動物 の 消化器官 、 熱水泉 、 下水 、 湖沼 、その他広い 淡水 系に分布する メタン菌 である。メタノ バクテリア という 学名 がつけられているが、これは命名上の優先権のある Methano bacterium のためであり、本綱は細菌（バクテリア）ではなく古細菌（アーキア）である。 多くは グラム陽性 で運動性を持たない 桿菌 であり、 水素 と 二酸化炭素 を資化して メタン を生成することで 増殖 する。一部の種は ギ酸 、 メタノール 、 プロパノール なども利用できる。分離源は比較的多様で、メタノバクテリウム科は 脊椎動物 や シロアリ の 消化器官 、深い 地下水 、 下水 、 水田 、湖沼の沈殿物など。メタノテルムス科は 熱水泉 より分離された。メタンを生成することで嫌気条件における 有機物 分解の最終段階を担っている。 人間 の 口腔 や 結腸 から検出される腸内古細菌としてのメタン菌もその殆どがメタノバクテリウム科に属している。 細胞壁 はシュードムレインと呼ばれる糖ペプチドより成るが、これはメタノバクテリウム綱と近縁の メタノピュルス綱 のみの特徴であり、他の古細菌や 真正細菌 はこの構造を持たない。このため古細菌の中では例外的に グラム陽性 に染色される。メタノピュルス綱も同様のグラム陽性桿菌であるが、メタノピュルス綱に属す生物はいずれも100 °C を大きく超える温度で増殖が可能なのに対し、メタノバクテリウム綱は最高でも Methanothermus sociabilis の97 °C が限界であり、生育温度で区別がつけられる。シュードムレイン自体は真正細菌の細胞壁ムレイン（ ペプチドグリカン ）に類似しており、ムレインと同じように機械的強度が強く細胞に 浸透圧 変化に対する抵抗性を持たせるが、その構造と合成系の違いにより β-ラクタム系抗生物質 や リゾチーム の作用は受けない。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノバクテリウム門 メタノバクテリウム門 メタノバクテリウム門 Thermococcus kodakarensis の電子顕微鏡写真 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : メタノバクテリウム界 Methanobacteriati 門 : メタノバクテリウム門 Methanobacteriota 学名 Methanobacteriota Garrity and Holt 2023 綱 メタノバクテリウム綱 メタノコックス綱 Methanopyria テルモコックス綱 メタノバクテリウム門 （ Methanobacteriota ）は、メタノバクテリウム属を タイプ属 とする 古細菌 の 門 である。学名にbacteriotaが付いているが、 細菌 （バクテリア）ではない。 旧Euryarchaeotaと同義とされ、LPSNもこれを採用している。一方で、その後メタノバクテリウム門'を分割する形でハロバクテリウム門とテルモプラズマ門が提唱されており、これらを含まない立場もある。 ^ a b Göker, Markus; Oren, Aharon (2023-09-11). “Valid publication of four additional phylum names” (英語). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 73 (9). doi : 10.1099/ijsem.0.006024 . ISSN   1466-5026 . PMID   37695645 . https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.006024 .   ^ “ Phylum: Methanobacteriota ”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature . 2024年7月18日閲覧。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノピュルス・カンドレリ メタノピュルス・カンドレリ メタノピュルス・カンドレリ 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : メタノバクテリウム界 Methanobacteriati 門 : メタノバクテリウム門 Methanobacteriota 綱 : メタノピュルス綱 Methanopyri 目 : メタノピュルス目 Methanopyrales 科 : メタノピュルス科 Methanopyraceae 属 : メタノピュルス属 Methanopyrus 種 : M. カンドレリ Methanopyrus kandleri 学名 Methanopyrus kandleri Kurr et al. 1992 メタノピュルス・カンドレリ （ メタノパイラス- メタノピルス- Methanopyrus kandleri ）は、 深海 の 熱水噴出孔 などに生息する グラム陽性 桿菌 偏性嫌気性の 超好熱 メタン菌 （ メタン 生成 古細菌 ）である。複数の培養株が知られるが、いずれも100℃を大きく上回る温度での増殖が可能。このうちの一つである116株（Strain 116）は、122 °C もの高温で増殖が可能な 生物 であると報告されている。 学名 の由来は、属名が「methan-um」（ 羅 : メタン ）+「 ο 」（ 希 : 接続母音）+「 πῦρ 」（希: 炎）+「us」（羅: 男性名詞屈折語尾）。種小名は微生物学者「 Otto Kandler 」への献名で、そのラテン語名 Kandlerus を 属格 とした kandleri カンドレリーが採用されている。ラテン語として語形成を行うと、 Methanopyrus kandleri （古典ラテン語の音写はメタノピュルス・カンドレリー）となり、全体として「カントラー氏の、炎を好むメタン菌」といった意味を帯びる。 Methanopyrus 属には、 Methanopyrus kandleri 種が属する。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノフラン メタノフラン メタノフランa 物質名 IUPAC名 6-[[3-[[3-[2-[4-[[5-(アミノメチル)-3-フリル]メトキシ]フェニル]エチルカルバモイル]-1-カルボキシピロピル]カルバモイル]-1-カルボキシプロピル]カルバモイル]ヘキサン-1,3,4-トリカルボン酸 識別情報 3D model ( JSmol ) Interactive image SMILES C1=CC(=CC=C1CCNC(=O)CCC(C(=O)O)NC(=O)CCC(C(=O)O)NC(=O)CCC(C(CCC(=O)O)C(=O)O)C(=O)O)OCC2=COC(=C2)CN 性質 化学式 C 34 H 44 N 4 O 15 モル質量 748.739  g·mol −1 特記無き場合、データは 標準状態 (25 °C [77 °F], 100 kPa) におけるものである。 メタノフラン （Methanofuran）は、 メタン菌 に見られる 有機化合物 である。Rがトリカルボキシヘプタノイル基のときメタノフラン、グルタミル-グルタミルのときメタノフランb、トリカルボキシ-2-ヒドロキシヘプタノイル基のときメタノフランcと呼ぶ。 ^ Thauer, R. K., "Biochemistry of methanogenesis: a tribute to Marjory Stephenson", Microbiology, 1998, 144, 2377-2406. This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノブレウィバクテル属 メタノブレウィバクテル属 メタノブレウィバクテル属 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : メタノバクテリウム界 Methanobacteriati 門 : メタノバクテリウム門 Methanobacteriota 綱 : メタノバクテリウム綱 Methanobacteria 目 : メタノバクテリウム目 Methanobacteriales 科 : メタノバクテリウム科 Methanobacteriaceae 属 : メタノブレウィバクテル属 Methanobrevibacter 学名 Methanobrevibacter Balch and Wolfe 1981 下位分類（種） M. ruminantium （タイプ種） M. smithii ほか計16種 （詳細は #分類（種） 参照） メタノブレウィバクテル属 （ メタノブレビバクター属 、-ぞく、 Methanobrevibacter ）は、代表的な メタン菌 の一属。 哺乳類 や シロアリ などの 消化器官 、 水田 、湖沼、海洋汚泥、ぬれた土など広範囲の嫌気環境に分布する。人体から最も多く分離される 古細菌 もこの属で、 腸内古細菌 として 結腸 内にも生息している。基準種は M. ruminantium 、 ゲノム は2007年に M. smithii ATCC 35061株について解読完了（1.853M bp ）。 外観は比較的短い 桿菌 。シュードムレインより構成される 細胞壁 を持ち、 グラム染色 では陽性を示す。常温の中性環境を好み、 真正細菌 が排出した 水素 あるいは 有機酸 （ギ酸など）からメタンを合成してエネルギーを得ている。ある種の細菌と共生関係を持つものも知られるほか、ヒト体内から、この種に寄生する古細菌やウイルスも報告されている。2025年7月現在16種がこの属に属しており、古細菌としては Thermococcus や Halorubrum に次いで大きな属である。 生育温度 - 10～45℃程度 生育pH - pH7付近 抗生物質感受性 - 古細菌であるため、広い抗生物質（ ペニシリン 、 セファロスポリン 、 バンコマイシン 、 ストレプトマイシン 、 ゲンタマイシン 、 シプロフロキサシン 、 クリンダマイシン など）に対して強い抵抗性を示す。 クロラムフェニコール は有効であるが、抵抗性が高く作用には非常に高濃度を要する。細菌をターゲットに開発された抗生物質以外では、反芻動物やヒト便秘症患者に対し、多くの古細菌に対して抗生物質的に作用する スタチン の使用が評価されている。この他、嫌気性の抗原虫・細菌薬である メトロニダゾール でほぼ除去されることが報告されている。 学名 はmethanum（メタヌム;メタン）+ brevis（ブレウィス;短い）+ bacter（バクテル;棒）であり、 ラテン語 でメタン（を生成する）短桿菌の意。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
メタノマッシリイコックス・ルミニュエンシス メタノマッシリイコックス・ルミニュエンシス メタノマッシリイコックス・ルミニュエンシス 分類 ドメイン : 古細菌 Archaea 界 : ユリアーキオータ界 Euryarchaeota 門 : ユリアーキオータ門 Euryarchaeota 綱 : テルモプラズマ綱 Thermoplasmata 目 : メタノマッシリイコックス目 Methanomassiliicoccales 科 : メタノマッシリイコックス科 Methanomassiliicoccaceae 属 : メタノマッシリイコックス属 Methanomassiliicoccus 種 : M. ルミニュエンシス M. luminyensis 学名 Methanomassiliicoccus luminyensis Dridi et al. 2012 メタノマッシリイコックス・ルミニュエンシス （ Methanomassiliicoccus luminyensis ）は、 ヒト 糞便から分離された メタン生成 古細菌 である。 フランス 居住の86歳男性のサンプルから発見された。 メタノール 、 モノメチルアミン 、 ジメチルアミン 、 トリメチルアミン の何れかと 水素 の組み合わせで メタン を生成し、増殖する。 水素 + 二酸化炭素 、 ギ酸 、 酢酸 は利用しない。大半の 抗生物質 に強い抵抗性を示し、 グラム陽性 であるが アンピシリン をはじめとする β-ラクタム系抗生物質 は一切効果がなく、同様に ストレプトマイシン 、 テトラサイクリン 、 バンコマイシン なども無効である。一部の抗癌殺菌剤や抗原虫薬、高濃度の クロラムフェニコール によって増殖が阻害される。0.85μm程度のサイズの 球菌 で、 TEM 画像で透明に映る厚い層とその外側の薄い層で示される細胞壁を持つ。 鞭毛 をもたず、運動性はない。 ゲノム サイズは2.6M bp 、 ORF は2,613個。これはヒトから分離されたメタン菌としては最大サイズである。 系統的には Candidatus "Aciduliprofundum boonei"に最も近く、 テルモプラズマ綱 にメタノマッシリイコックス目が設置されている。2018年8月現在、記載種は本種のみであり単型であるが、全ゲノムが解読されている Candidatus "Methanomassiliicoccus intestinalis"など数系統が知られている。 高齢になるに従って保有者は増加するが、本種が健康に与える影響は不明である。 動脈硬化 を誘発する有害な トリメチルアミン を分解する能力を有するため、心臓血管疾患の予防目的での使用が提案されている。 ^ a b c d Bédis Dridi et al. (2012). “Methanomassiliicoccus luminyensis gen. nov., sp. nov., a methanogenic archaeon isolated from human faeces”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62 : 1902-1907. doi : 10.1099/ijs.0.033712-0 .   ^ Lang K et al. (2015). “New mode of energy metabolism in the seventh order of methanogens as revealed
aeon isolated from human faeces”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62 : 1902-1907. doi : 10.1099/ijs.0.033712-0 .   ^ Lang K et al. (2015). “New mode of energy metabolism in the seventh order of methanogens as revealed by comparative genome analysis of “Candidatus methanoplasma termitum””. Appl Environ Microbiol. 81 (4): 1338-52. doi : 10.1128/AEM.03389-14 .   ^ Lena Kröninger et al. (2017). “Growth Characteristics of Methanomassiliicoccus luminyensis and Expression of Methyltransferase Encoding Genes”. Archaea . doi : 10.1155/2017/2756573 .   ^ a b Dridi, B., et al. (2011). “The antimicrobial resistance pattern of cultured human methanogens reflects the unique phylogenetic position of archaea”. J Antimicrob Chemother 66 : 9. doi : 10.1093/jac/dkr251 .   ^ a b Gorlas, A., et al. (2012). “Complete genome sequence of Methanomassiliicoccus luminyensis, the largest genome of a human-associated Archaea species”. J. Bacteriol. 194 (17): 4745. doi : 10.1128/JB.00956-12 .   ^ Dridi, B., et al. (2012). “Age‐related prevalence of Methanomassiliicoccus luminyensis in the human gut microbiome”. APMIS 120 : 10. doi : 10.1111/j.1600-0463.2012.02899.x .   ^ Brugère, J.F., et al. (2014). “Archaebiotics: proposed therapeutic use of archaea to prevent trimethylaminuria and cardiovascular disease.”. Gut Microbes. 5 (1): 5-10. doi : 10.4161/gmic.26749 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4
herapeutic use of archaea to prevent trimethylaminuria and cardiovascular disease.”. Gut Microbes. 5 (1): 5-10. doi : 10.4161/gmic.26749 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.