moebiusT7/mmv-wiki-index-ja huggingface dataset:
bsp; ^ Ke, Rongqin; Mignardi, Marco; Pacureanu, Alexandra; Svedlund, Jessica; Botling, Johan; Wählby, Carolina; Nilsson, Mats (2013-07-14). “In situ sequencing for RNA analysis in preserved tissue and cells” (英語). Nature Methods 10 (9): 857–860. doi : 10.1038/nmeth.2563 . ISSN   1548-7091 . PMID   23852452 . https://zenodo.org/record/3426036 .   ^ Ogino, Shuji; Stampfer, Meir (17 March 2010). “Lifestyle Factors and Microsatellite Instability in Colorectal Cancer: The Evolving Field of Molecular Pathological Epidemiology” . Journal of the National Cancer Institute 102 (6): 365–7. doi : 10.1093/jnci/djq031 . PMC   2841039 . PMID   20208016 . https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2841039/ .   ^ Ogino S, Chan AT, Fuchs CS, Giovannucci E. Molecular pathological epidemiology of colorectal neoplasia: an emerging transdisciplinary and interdisciplinary field. Gut 2011; 60: 397-411. ^ Ogino S, Lochhead P, Chan AT, Nishihara R, Cho E, Wolpin BM, Meyerhardt AJ, Meissner A, Schernhammer ES, Fuchs CS, Giovannucci E. Molecular pathological epidemiology of epigenetics: emerging integrative science to analyze environment, host, and disease. Mod Pathol 2013; 26: 465-84. This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子的混沌 分子的混沌 分子的混沌 （ぶんしてきこんとん Molecular chaos；あるいは 分子カオス 、 分子無秩序 などとも訳される）とは、 気体分子運動論 で、衝突する粒子の 位置 と 速度 の間には 相関 がないとする仮定である。つまり衝突回数は、衝突する可能性のある粒子の数の単純な積に比例するものと仮定する。この近似は ジェームズ・クラーク・マクスウェル によって1867年に導入された。 ボルツマン によってStosszahlansatz（衝突数仮定）と ドイツ語 に訳された。 これによって、 力学 に基づく分子運動論の計算は非常に扱いやすいものとなる。なおこの概念自体は、現代の カオス理論 におけるカオスの概念（決定論的に導かれる見かけの乱雑さ）とは別の、微視的 情報 が無視（ 粗視化 ）されたことによる 確率論 的乱雑さを表している。 特に（最初は認識されなかったが）ボルツマンの H定理 （ 1872年 ： エントロピー の不可逆的増大を説明する）でこの仮定が重要な基礎となっている。彼は分子運動論を用いて、完全な無秩序状態ではない 気体 のエントロピーは、分子が衝突することを許せば必ず増大することを示そうとした。これが、「 時間 対称的な力学から不可逆過程が導かれるはずはない」という ロシュミット の反論（時間の矢のパラドックス、可逆性批判）を呼び起こした。このパラドックスへの答え（ 1895年 ）は、「衝突後の2粒子の速度はもはや相関がない」というものであった。ボルツマンは、分子運動の 分布関数 を導入するにあたり、各時間においてこれらの相関は無視できると主張した。これを用いて分布関数に関する ボルツマン方程式 を計算することで、H定理が証明される。 統計力学 の基礎となっている エルゴード仮説 も、この仮定から導くことができる。 このようにして巨視的不可逆性の概念は分子的（微視的）混沌という仮定に還元することができるわけだが、この仮定は分子間に働く クーロン力 が無視できない場合など、必ずしも成り立つわけではなく、一般的な仮定とはいえない。 ^ Maxwell, J. C. (1867). "On the Dynamical Theory of Gases". Philosophical Transactions of the Royal Society of London 157: 49 ^ L. Boltzmann, " Weitere Studien über das Wärmegleichgewicht unter Gasmolekülen ." Sitzungsberichte Akademie der Wissenschaften 66 (1872): 275-370 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子磁石 分子磁石 分子磁石 （ぶんしじしゃく）は、 強磁性体 の 現象 を理解する際に用いられる 概念 。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子神経科学 分子神経科学 分子神経科学 （ぶんししんけいかがく、Molecular_neuroscience）は、 動物 の 神経系 に適用された 分子生物学 の概念を研究する 神経科学 の一分野である。 この分野には主に、分子神経解剖学、 神経系 における シグナル伝達 のメカニズム、 遺伝学 と エピジェネティクス が神経発達に及ぼす影響、および神経可塑性と 神経変性疾患 の分子基盤などのトピックがある。分子生物学と同様に、分子神経科学は比較的新しい分野であり変化が激しい。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子科学研究所 分子科学研究所 分子科学研究所 山手キャンパス 正式名称 分子科学研究所 英語名称 Institute for Molecular Science 略称 分子研、IMS 組織形態 大学共同利用機関 所在地 日本 〒 444-8585 愛知県 岡崎市 明大寺町 字西郷中38 北緯34度56分51.7秒 東経137度9分59.1秒 ﻿ / ﻿ 北緯34.947694度 東経137.166417度 ﻿ / 34.947694; 137.166417 座標 : 北緯34度56分51.7秒 東経137度9分59.1秒 ﻿ / ﻿ 北緯34.947694度 東経137.166417度 ﻿ / 34.947694; 137.166417 予算 45億円（2008年度） * 運営費交付金等 33億円 * 科研費等 11億円 人数 職員 * 研究教育職員 70人 * 技術職員 35人 （有期雇用除く 2009年4月1日時点） 院生 （2008年度） * 34人（ 総研大 ） * 12人（その他大学） 所長 渡辺芳人 設立年月日 1975年 4月22日 上位組織 自然科学研究機構 所管 文部科学省 ウェブサイト 分子科学研究所 分子科学研究所 （ぶんしかがくけんきゅうじょ、 英語 : Institute for Molecular Science 、略称： IMS ）は、 自然科学研究機構 を構成する、 愛知県 岡崎市 にある 大学共同利用機関 。略称は 分子研 。 1975年 4月22日 に、 愛知教育大学 の旧図書館を仮庁舎とし、分子構造研究系、電子構造研究系、分子集団研究系の3つの研究系と機器センターをもつ研究所として設立された。分子科学分野における日本の中核的な国立研究所である。 総合研究大学院大学 の大学院生に対する教育も実施している。全国の大学が実験機器を相互利用するプロジェクトである 大学連携研究設備ネットワーク の全国事務局が置かれている。 ^ 自然科学研究機構 予算 2010-04-21 閲覧 ^ 自然科学研究機構 外部資金 2010-04-21 閲覧 ^ 自然科学研究機構 職員数 2010-04-21 閲覧 ^ 自然科学研究機構 大学院教育 2010-04-21 閲覧 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子篩 分子篩 分子篩 （ぶんしふるい、 英 : molecular sieve ）とは、対象とする各物質の 分子 の大きさ（ 分子量 ）に応じてそれら物質を分離する性質を持った物質の総称である。 1932年 にマクベイン (J. W. McBain) が命名した。 また、その効果を 分子篩効果 と呼ぶが、実際には 吸着 など、他の効果と組み合わせて利用されることも多い。状態としては 固体 、 ゲル 、 高分子 の 溶液 がある。物質の分離（ 単離 ）と 分析 に応用される。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子系統学 分子系統学 分子系統学 （ぶんしけいとうがく、 英語 ：molecular phylogenetics）とは、 系統学 のサブジャンルのひとつであり、 生物 のもつ タンパク質 の アミノ酸 配列や 遺伝子 の 塩基配列 を用いて系統解析を行い、生物が 進化 してきた道筋（系統）を理解しようとする学問である。 従来の系統学は形態、発生、化学・生化学的性質といった 表現型 の比較に基づいていたのに対し、分子系統学はそれらの根本にある 遺伝子型 に基づく方法であり、より直接的に生物の進化を推定できると期待される。計算機や理論の発達に加え、20世紀末に遺伝子解析が容易になったことから大いに発展し、 進化生物学 の重要な柱となっている。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子素子 分子素子 →「 分子エレクトロニクス 」および「 en:Molecular scale electronics 」も参照 分子素子 （ぶんしそし）とは 分子 を使用する 素子 。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子結晶 分子結晶 分子結晶 （ぶんしけっしょう）とは 結晶 の分類の1つで、多数の 分子 が分子間の相互作用で規則正しく配列してできている結晶のこと。一般に、 共有結合結晶 や イオン結晶 に比べて柔らかく、融点も低い。分子結晶には ドライアイス （ 二酸化炭素 ）や、 ヨウ素 がある。 分子結晶はさらに分子同士の結合力の種類により分類される。 氷 や ナフタレン の固体が分子結晶の例であり、前者は水分子が 水素結合 で結びついた 水素結合結晶 、後者はナフタレン同士が ファンデルワールス力 で結びついた ファンデルワールス結晶 （分子性結晶）である。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子線エピタキシー法 分子線エピタキシー法 分子線エピタキシー法 （ぶんしせんエピタキシーほう、 MBE ; M olecular B eam E pitaxy）は現在、 半導体 の結晶成長に使われている手法の一つである。 真空蒸着 法に分類され、 物理吸着 を利用する。 高真空のために、原料供給機構より放たれた分子が他の気体分子にぶつかることなく直進し、ビーム状の分子線となるのが名称の由来である。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子置換 分子置換 分子置換 （ぶんしちかん、 英 : molecular replacement 、略称: MR）は、 X線結晶構造解析 における 位相問題 を解決する手法である。MRは、 回折 データの元となる未知の構造に類似した、既に構造が解かれた タンパク質構造 が存在することを前提とする。このような構造は、 相同 性のあるタンパク質であったり、同じ タンパク質の低分解能NMR構造 であったりする。 結晶学者の最初の目標は、 電子密度 マップを得ることである。密度と回折波の関係は以下の通りである。 ρ ( x , y , z ) = 1 V ∑ h ∑ k ∑ l | F h k l | exp ⁡ ( 2 π i ( h x + k y + l z ) + i Φ ( h k l ) ) {\displaystyle \rho (x,y,z)={\frac {1}{V}}\sum _{h}\sum _{k}\sum _{l}|F_{hkl}|\exp(2\pi i(hx+ky+lz)+i\Phi (hkl))} 通常の検出器では、強度 I = F ⋅ F ∗ {\displaystyle I=F\cdot F^{*}} を測定しているので、位相に関する情報（ Φ {\displaystyle \Phi } ）はすべて失われてしまう。そして、位相（ Φ {\displaystyle \Phi } ）がなければ、X線結晶構造解析の実験データ（ 逆格子空間 ）と、原子モデルが組み込まれている実空間の電子密度との間の示された フーリエ変換 が完成しないことになる。MRは、既知の構造の中で最も実験強度にフィットするモデルを見つけようとする。 ^ Ch 10 in "Principles of Protein X-ray Crystallography", by Jan Drenth (2nd Edn.) Springer, 1999 ^ Ramelot, TA; Raman, S; Kuzin, AP; Xiao, R; Ma, LC; Acton, TB; Hunt, JF; Montelione, GT et al. (April 2009). “Improving NMR protein structure quality by Rosetta refinement: a molecular replacement study” . Proteins 75 (1): 147–67. doi : 10.1002/prot.22229 . PMC   3612016 . PMID   18816799 . https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3612016/ .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子蒸留 分子蒸留 分子蒸留 とは 蒸留 の手法の一つ。主として化学薬品製造時の 純度 向上に用いられる。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子記述子 分子記述子 分子記述子 （ 英語 : molecular descriptors ）は、分子の特性などの特徴量を数字に変換したものである。化学、製薬科学、 環境保護政策 、健康研究、および品質管理において役割を果たしており、分子に含まれる化学情報を何らかの形で数学的に処理できるように表記するものであり、TodeschiniとConsonniは次のように定義している。 「分子記述子とは，分子の記号的表現の中にエンコードされた化学情報を，有用な数値や標準化された実験の結果に変換する論理的・数学的手続きの最終結果である」 この定義により、分子記述子は logP 、モル 屈折率 、 双極子 モーメント、 分極率 などの 実験で得られた測定値 、および分子の記号的表現から得られる 理論的分子記述子 の2つに大別され、さらに分子表現の種類によって分類される 理論分子記述子の主な分類は以下の通りである。 0D記述子（構成記述子，カウント記述子など） 1D記述子（構造フラグメントのリスト，フィンガープリントなど） 2D記述子（グラフ不変量など） 3D記述子（例：3D-MoRSE記述子、WHIM記述子、GETAWAY記述子、量子化学記述子、サイズ、立体、表面および体積記述子など） 4D記述子（例：GRID法やCoMFA法から得られるもの、Volsurf） ^ Todeschini, Roberto; Consonni, Viviana (英語). Handbook of Molecular Descriptors . Wiley. ISBN  978-3-527-29913-3 . https://onlinelibrary.wiley.com/doi/book/10.1002/9783527613106   ^ Mauri, Andrea; Consonni, Viviana; Todeschini, Roberto. “Molecular Descriptors” (英語). Handbook of Computational Chemistry . Springer International Publishing. pp. 2065–2093. ISBN  978-3-319-27282-5 . https://link.springer.com/referenceworkentry/10.1007/978-3-319-27282-5_51   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子認識 分子認識 分子認識 （ぶんしにんしき、 英 : molecular recognition ）とは、2つもしくはそれ以上の 分子 が特異的に示す、 水素結合 、 配位結合 、 疎水効果 、 ファンデルワールス力 , π-π相互作用 、 ハロゲン結合 、 静電気力 などによる 相互作用 を示す。これらの「直接」相互作用に加え、溶液中における分子認識には溶媒も重要な「間接」作用を持つことがある。分子認識における ホスト・ゲスト分子 は 分子相補性 を示す。 ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子論の歴史 分子論の歴史 化学 における 分子論の歴史 （ぶんしろんのれきし、 英 : history of molecular theory ）は、2つ以上の 原子 の間に 強い化学結合 が存在するという概念や考え方の起源をたどるものである。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子論理ゲート 分子論理ゲート ナノエレクトロニクス 単分子エレクトロニクス 分子スケールエレクトロニクス 分子論理ゲート 分子ワイヤ 固体物理ナノエレクトロニクス ナノ回路 ナノワイヤ ナノリソグラフィ NEMS ナノセンサ 関連するアプローチ ナノイオニクス ナノフォトニクス ナノメカニクス 分子論理ゲート （ぶんしろんりゲート）は、1つ以上の物理的・化学的入力と1つの出力に基づく論理演算を行う分子。この分野は、1つの化学的・物理的入力に基づく単純な論理系から、算術計算すなわち モレキュレーター および記憶保持アルゴリズムなどの組み合わせ処理や逐次処理が可能な分子へと進歩を遂げてきた。 単一入力の論理ゲートの場合、可能な出力パターンは4つある。入力が0のとき、出力は0か1であり、入力が1のとき、出力は0か1となる。起こる可能性のある4つの出力ビットパターンは、特定の論理タイプ：PASS 0, YES, NOT, PASS 1に対応している。PASS 0は入力が何でも出力が0である。PASS 1は入力が何でも出力が1である。YESは入力が1のとき1を出力し、NOTはYESの逆であり、入力が1のとき0を出力する。YES論理ゲートの例は以下に示す分子構造である。"1"出力は溶液中にナトリウムイオンが存在する（これが"1"入力となる）場合にのみ与えられる。 分子論理ゲートは、化学過程に基づく入力信号と、 分光法 に基づく出力信号で動作する。初期の水溶液に基づくシステムの1つは、 scheme 1 の化合物 A,B の化学的挙動を用いる。 化合物Aは、 カルシウム に結合できる4つのカルボン酸アニオン基（および顕でない対カチオン）を含む受容体を上に有するプッシュプルオレフィンである。下にあるのは、水素イオンの受容体である キノリン 分子である。論理ゲートは以下のように動作する。Ca 2+ もしくはH + の化学的入力がないと、発色団は390nmで UV/VIS分光法 において最大の 吸光度 を示す。カルシウムが入ると 青方偏移 が起こり、390nmでの吸光度が減少する。同様にプロトンを加えると 赤方偏移 が起こり、両方の陽イオンが水中にあるときは元の390nmでの吸収となる。この系は吸収における XNOR 論理ゲートと 透過率 における XOR 論理ゲートを示す。 化合物 B において、下にある部分でプロトンに結合することもできる 第三級アミノ 基を含む。この系では、両方の陽イオンが得られる場合にのみ 蛍光 が起こる。両方の陽イオンが存在することにより、光誘起電子移動(photoinduced electron transfer, PET)が妨げられ、化合物Bが蛍光を発する。両方もしくはいずれかのイオンがない場合、蛍光は窒素原子もしくは酸素原子もしくはその両方からアントラセニル基への電子移動を伴うPETにより抑制される。両方の受容体がカルシウムイオンとプロトンにそれぞれ結合すると、両方のPETチャネルは遮断される。化合物Bの総体的な結果はAND論理である。なぜなら、"1"（蛍光）の出力は、Ca 2+ とH + の両方が溶液中に存在するとき、すなわち"1"としての値を有するときにのみ起こる。両方の系を並列に動作させ、系Aについては透過率を、系Bについては蛍光を見ると、結果として式1+1=2を再現することができる 半加算器 となる。 系Bを変更したものでは、2つではなく3つの化学入力がAND論理ゲートで同時に処理される。増強された 蛍光 信号は、それぞれの アミン 、フェニルジアミノカーボキシレート、クラウンエーテル受容体との
Bの総体的な結果はAND論理である。なぜなら、"1"（蛍光）の出力は、Ca 2+ とH + の両方が溶液中に存在するとき、すなわち"1"としての値を有するときにのみ起こる。両方の系を並列に動作させ、系Aについては透過率を、系Bについては蛍光を見ると、結果として式1+1=2を再現することができる 半加算器 となる。 系Bを変更したものでは、2つではなく3つの化学入力がAND論理ゲートで同時に処理される。増強された 蛍光 信号は、それぞれの アミン 、フェニルジアミノカーボキシレート、クラウンエーテル受容体との相互作用による過剰のプロトン、亜鉛、ナトリウムイオンの存在下でのみ観察される。処理方式は上述と同様に働く（受容体から励起されたアントラセン蛍光団への競合光誘起電子移動反応の妨害により蛍光が観察される）。イオン入力が1つ、2つ、もしくは3つ全てがないときは蛍光出力が低くなる。各受容体は特定のイオンに対して選択的であるので、他のイオン濃度が増加しても高い蛍光は生じない。各入力の特定のものの濃度閾値には、AND論理の組み合わせと一致する蛍光出力を達成するために到達しなければならない。このプロトタイプは、将来的には疾患スクリーニングのためのポイントオブケア医療診断応用に拡張される可能性を潜在的に持っている。 同様の設定で、以下に示す分子論理ゲートは、酸化還元蛍光スイッチから電気化学スイッチを持った多入力論理ゲートへの進展を示している。この2入力AND論理ゲートは、第3級アミンプロトン受容体とテトラチアフルバレン酸化還元給与体を組み入れている。これらの基は、アントラセンに結合した時に、溶液の酸濃度と酸化能力に関する情報を同時に処理することができる。 Gunnlaugssonらにより提案された下に示すINHIBIT論理ゲートは、キレート錯体にTb 3+ イオンを取り込んでいる。この2入力論理ゲートは、この種のもので最初のものであり、化学入力と燐光出力で非可換の挙動を示す。2酸素（入力1）が存在するときは常に抑制され、 燐光 は観測されない（出力0）。出力1を観測するためには第2の入力であるH + が存在しなければならない。これは2入力INHIBIT真理値表から理解することができる。 他のXOR論理ゲートシステムでは、化学的性質は scheme 3 に示される 擬ロタキサン に基づいている。有機溶液中では、電子が不足した ジアザピレニウム 塩（棒）と クラウンエーテル の電子が過剰な2,3-ジオキ ナフタレン 単一体（輪）は、 電荷移動錯体 の形成により自己組織化する。 トリブチルアミンのような付加された 第3級アミン は、ジアザピレンと1:2の付加物を形成し、合成物はほどかれる。この過程には、遊離クラウンエーテルから生じる343nmでの発光強度の増加が伴う。付加された トリフルオロメタンスルホン酸 はアミンと反応し、過程は元に戻る。過剰の酸は プロトン化 によりクラウンエーテルを固定し、再び錯体がほどかれる。 フルオレセイン に基づく 全加算器 のシステムは1+1+1=3を計算することができる。 分子順序論理は、D. Marguliesらにより例証されている。そこでは、相互接続されたいくつかのAND論理ゲートを並列に組み入れることと等しい電子セキュリティデバイスの処理機能に似た分子キーパッド鍵を実証している。この分子は、 ATM の電子キーパッドを模倣している。出力信号は、入力の組み合わせだけではなく、入力の正しい順序にも依存する。すなわち、正しいパスワードを入力する必要がある。分子は、鉄(III)に結合するシデロホアに結合さ
に基づく 全加算器 のシステムは1+1+1=3を計算することができる。 分子順序論理は、D. Marguliesらにより例証されている。そこでは、相互接続されたいくつかのAND論理ゲートを並列に組み入れることと等しい電子セキュリティデバイスの処理機能に似た分子キーパッド鍵を実証している。この分子は、 ATM の電子キーパッドを模倣している。出力信号は、入力の組み合わせだけではなく、入力の正しい順序にも依存する。すなわち、正しいパスワードを入力する必要がある。分子は、鉄(III)に結合するシデロホアに結合されたピレンおよびフルオレセイン蛍光体を用いて設計され、溶液の酸性によりフルオレセイン蛍光体の蛍光特性が変化する。 この分野のさらなる発展により、分子論理ゲートがIT産業における半導体にとって代わることもあるかもしれない。そのような分子系は、半導体がナノ寸法に近づくときに生じる問題を理論的に克服することができる。分子論理ゲートはシリコンのものよりも用途が広く、重ね合わせ論理のような現象は半導体エレクトロニクスでは得られない。Avourisらにより実証されたもののような乾燥分子ゲートは、小さいサイズ、類似構造、データ処理能力から半導体デバイスの代用となる可能性があることが証明されている。Avourisは、カーボンナノチューブの束からなるNOT論理ゲートを明らかにした。ナノチューブは隣接領域において異なるドープをされて2つの相補型電界効果トランジスタを形成する。この束は満足する条件が満たされた場合のみNOTゲートとして動作する。 化学論理ゲートの新たな潜在的用途の探究が続いている。近年の研究 では 光線力学療法 のための論理ゲート応用が例証されている。クラウンエーテルおよびスペーサーで分離された2つのピリジル基に結合したボディパイ染料（下記参照）はAND論理ゲートに従って作動する。この分子は三重項酸素を細胞傷害性一重項酸素に変換することにより、比較的高いナトリウムおよびプロトンイオン濃度の条件下で660nmの照射の際に光線力学作用物質として働く。このプロトタイプの例は、正常な細胞におけるものと比較して腫瘍組織におけるより高いナトリウムレベルおよび低いpHを利用するであろう。これら2つのガンに関係する細胞パラメータが満たされると吸光度スペクトルに変化が観測される。この技術は非侵襲的かつ特異的なものであるため、悪性腫瘍の治療に有用となりうる。 分子論理ゲートはde Silvaの「原理証明」に見られる設定と非常によく似た変調器を処理することができるが、同じ分子に異なる論理回路を組み込んでいる。このような機能は統合論理といい、A. Coskun, E. U. AkkayaらによるBODIPYベースの半減算器論理ゲートにより例証されている（下記参照） 。565nmと660nmの2つの異なる波長でモニターすると、XORとINHIBITの論理ゲートが各々の波長で得られる。 THF 中のこの化合物の光学的研究により、565nmでの吸光度ピークと660nmの発光ピークが明らかになる。酸を加えることにより第3級アミンのプロトン化が内部電荷移動をもたらすため、両方のピークで浅色シフトが起こる。観察される発光の色は黄色である。強塩基を加えるとフェノールのヒドロキシル基は脱プロトン化され、結果光誘起電子移動が起こり分子が非発光となる。酸と塩基の両方を加えると、第3級アミンはプロトン化されない一方ヒドロキシル基はプロトン化されたままであり結果的にPETとICTの両方が存在しないため、赤色の分子発光が観察される。発光強度が大きく異なるため、この単一分
度ピークと660nmの発光ピークが明らかになる。酸を加えることにより第3級アミンのプロトン化が内部電荷移動をもたらすため、両方のピークで浅色シフトが起こる。観察される発光の色は黄色である。強塩基を加えるとフェノールのヒドロキシル基は脱プロトン化され、結果光誘起電子移動が起こり分子が非発光となる。酸と塩基の両方を加えると、第3級アミンはプロトン化されない一方ヒドロキシル基はプロトン化されたままであり結果的にPETとICTの両方が存在しないため、赤色の分子発光が観察される。発光強度が大きく異なるため、この単一分子は算術演算、ナノスケールレベルでの減算を実行することができる。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子軌道 分子軌道 分子軌道 （ぶんしきどう）または 分子オービタル （ 英 : molecular orbital 、略称: MO）は、 分子 中の各 電子 の波の様な振る舞いを記述する一電子 波動関数 のことである。 分子軌道法 において中心的な役割を果たし、電子に対する シュレーディンガー方程式 を、 一電子近似 を用いて解くことによって得られる。 1個の電子の位置ベクトル r {\displaystyle {\boldsymbol {r}}} の関数であり、 ϕ i ( r ) {\displaystyle \phi _{i}({\boldsymbol {r}})} と表される。 原子 に対する 原子軌道 に対応するものである。 この関数は、特定の領域に 電子 を見い出す確率といった化学的、物理学的性質を計算するために使うことができる。「オービタル」（ 英 : orbital ）という用語は、「 one-electron orbital wave function : 1電子オービタル（軌道〔 orbit 〕のような）波動関数」の略称として1932年に ロバート・マリケン によって導入された。初歩レベルでは、分子軌道は関数が顕著な振幅を持つ空間の「領域」を描写するために使われる。分子軌道は大抵、分子のそれぞれの 原子 の 原子軌道 あるいは 混成軌道 や原子群の分子軌道を結合させて構築される。分子軌道は ハートリー-フォック法 や 自己無撞着場 （SCF）法を用いて定量的に計算することができる。 ^ Mulliken, Robert S. (July 1932). “Electronic Structures of Polyatomic Molecules and Valence. II. General Considerations”. Physical Review 41 (1): 49–71. Bibcode :  1932PhRv...41...49M . doi : 10.1103/PhysRev.41.49 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子軌道ダイアグラム 分子軌道ダイアグラム 分子軌道ダイアグラム （ぶんしきどう ダイアグラム 、 英 : molecular orbital diagram 、MOダイアグラム、分子軌道概略図）は、一般に 分子軌道法 、具体的には原子軌道による線形結合法（ LCAO法 ）の観点から 分子 中の 化学結合 を説明するための定性的表現手法である。これらの理論の基本原理は、原子が結合し分子を作る時に一定数の 原子軌道 が組み合わさり同数の 分子軌道 を形成するが、関与する 電子 は軌道間で再配分できる、というものである。この手法は、 二水素 、 二酸素 、 一酸化炭素 といった単純な 二原子分子 に非常によく適しているが、 メタン といった多原子分子について議論する時はより複雑となる。MOダイアグラムは何故ある分子は存在できるが一方は存在できないのか、結合がどの程度強いのか、そしてどの 電子遷移 が起こり得るのかを説明する。本項では以後、MOは分子軌道を、AOは原子軌道を意味する。 ^ Clayden, Jonathan; Greeves, Nick; Warren, Stuart; Wothers, Peter (2001). Organic Chemistry (1st ed.). Oxford University Press. pp. 96–103. ISBN  978-0-19-850346-0   ^ Organic Chemistry , Third Edition, Marye Anne Fox, James K. Whitesell, 2003 , ISBN 978-0-7637-3586-9 ^ Organic Chemistry 3rd Ed. 2001 , Paula Yurkanis Bruice, ISBN 0-13-017858-6 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子軌道法 分子軌道法 電子構造 論 原子価結合法 コールソン＝フィッシャー理論 一般化された原子価結合 現代原子価結合 分子軌道法 ハートリー＝フォック法 半経験的分子軌道法 メラー＝プレセット法 配置間相互作用法 結合クラスター法 多配置自己無撞着場 量子化学複合手法 量子モンテカルロ 原子軌道による線形結合法 密度汎関数理論 時間依存密度汎関数法 トーマス＝フェルミ模型 オービタルフリー密度汎関数理論 電子バンド構造 ほとんど自由な電子モデル 強結合近似 マフィンティン近似 k·p摂動論 空格子近似 量子化学 において、 分子軌道法 （ぶんしきどうほう、 英 : M olecular O rbital method ）、通称「 MO法 」とは、 原子 に対する 原子軌道 の考え方を、そのまま 分子 に対して適用したものである。 分子軌道法では、 分子 中の 電子 が 原子 間 結合 として存在しているのではなく、原子核や他の電子の影響を受けて分子全体を動きまわるとして、分子の構造を決定する。 この分子中の一電子波動関数である「 分子軌道 」を求める シュレーディンガー方程式 は、非常に単純な分子、例えば 水素分子イオン （H 2 + ）では回転楕円体座標を使って厳密に解くことができる。しかしながら、通常は分子軌道を求めるのは困難であるため、分子軌道 波動関数 ψ j M O {\displaystyle \psi _{j}^{\mathrm {MO} }} は、既知のn個の 原子軌道 χ i A O {\displaystyle \chi _{i}^{\mathrm {AO} }} の 線形結合 （ 重ね合わせ ）で表せると仮定する。 ψ j M O = ∑ i = 1 n c i j χ i A O {\displaystyle \psi _{j}^{\mathrm {MO} }=\sum _{i=1}^{n}c_{ij}\chi _{i}^{\mathrm {AO} }} ここで展開係数 c i j {\displaystyle c_{ij}} について、 基底状態 については、時間依存しない シュレーディンガー方程式 にこの式を代入し、 変分原理 を適用することで決定できる。この方法は LCAO （原子軌道の線型結合、Linear Combination of Atomic Orbital）近似と呼ばれる。もし χ i A O {\displaystyle \chi _{i}^{\mathrm {AO} }} が 完全系 を成すならば、任意の分子軌道を χ i A O {\displaystyle \chi _{i}^{\mathrm {AO} }} で表せる。 また ユニタリ変換 することで、量子化学計算における収束を速くすることができる。分子軌道法はしばしば 原子価結合法 と比較されることがある。 ^ Daintith, J. (2004). Oxford Dictionary of Chemistry . New York: Oxford University Press. ISBN  0-19-860918-3   ^ Licker, Mark, J. (2004). McGraw-Hill Concise Encyclopedia of Chemistry . New York: McGraw-Hill. ISBN  0-07-143953-6   This article is issued from Wikipedia . The text is av
ry . New York: Oxford University Press. ISBN  0-19-860918-3   ^ Licker, Mark, J. (2004). McGraw-Hill Concise Encyclopedia of Chemistry . New York: McGraw-Hill. ISBN  0-07-143953-6   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子進化 分子進化 遺伝学 主要項目 染色体 DNA RNA ゲノム 遺伝 ヌクレオチド 突然変異 遺伝的変異 概要 目次 歴史・トピック 遺伝学入門 歴史 進化 ( 分子進化 ) 集団遺伝学 メンデルの法則 量的遺伝学 分子遺伝学 研究 遺伝学者 DNAシークエンシング 遺伝子工学 ゲノミクス ( テンプレート) 遺伝医学 分野 古典遺伝学 保全遺伝学 分子遺伝学 集団遺伝学 個別化医療 オーダメイド医療  カテゴリ 分子進化 （ぶんししんか、 英 :Molecular evolution）とは、世代を経るレベルの長期間における、 DNA 、 RNA 、および タンパク質 といった細胞分子の配列構成の変化である。 進化生物学 や 集団遺伝学 の原理にしたがって、分子や細胞レベルでの生物の変化を解釈しようとする。 分子進化の主要トピックは、一塩基多型の生じやすさ（進化速度）やその影響効果、 中立進化 vs. 自然選択 、新しい遺伝子の起源、複雑な形質の遺伝的特徴、種分化の遺伝的基盤、発生過程の進化、およびゲノムや表現型を変化させる進化的な力である。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子進化のほぼ中立説 分子進化のほぼ中立説 分子進化のほぼ中立説 （ぶんししんかのほぼちゅうりつせつ）、または、 弱有害突然変異体仮説 （じゃくゆうがいとつぜんへんいたいかせつ）とは、 分子進化の中立説 から発展し、分子レベルでの弱有害突然変異(あるいは、弱有利突然変異)が生物進化に及ぼす効果を理論的に説明する仮説である。 ほぼ中立説は1973年に 太田朋子 によって提唱され (この時点では弱有害突然変異の効果のみ含む)、1990年代初頭にほぼ中立である弱有利突然変異と弱有害突然変異の効果を含む説に拡張された。 ほぼ中立説が 木村資生 の中立説と異なる点は次のとおりである。 中立説では自然淘汰の影響を受けない完全な中立突然変異に主題を置き、進化速度は集団サイズとは相関がなく、中立突然変異率に等しくなると論じた。 一方、ほぼ中立説では集団サイズと分子進化速度の相関を予想している。簡単に説明すれば、 遺伝的浮動 は弱有害突然変異を集団中に固定する力であるが、大きい集団では遺伝的浮動の効果は弱い。ゆえに、大きい集団では小さい集団よりもゆっくり進化が進むということである。 ^ Ohta, Tomoko (1973-11-09). “Slightly Deleterious Mutant Substitutions in Evolution”. Nature 246 (5428): 96–98. doi : 10.1038/246096a0 . PMID   4585855 .   This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子遺伝学 分子遺伝学 遺伝学 主要項目 染色体 DNA RNA ゲノム 遺伝 ヌクレオチド 突然変異 遺伝的変異 概要 目次 歴史・トピック 遺伝学入門 歴史 進化 ( 分子進化 ) 集団遺伝学 メンデルの法則 量的遺伝学 分子遺伝学 研究 遺伝学者 DNAシークエンシング 遺伝子工学 ゲノミクス ( テンプレート) 遺伝医学 分野 古典遺伝学 保全遺伝学 分子遺伝学 集団遺伝学 個別化医療 オーダメイド医療  カテゴリ 分子遺伝学 （ぶんしいでんがく、 英語 ：molecular genetics）は 生物学 の研究分野であるが、二つの異なる分野を指す。 塩基配列 の比較から 生物の進化 を議論する分野と、遺伝現象の仕組みを分子のレベルで理解しようとする分野である。 ^ Carroll, S. B., Grenier, J. K., & Weatherbee, S. D. (2013). From DNA to diversity: molecular genetics and the evolution of animal design. John Wiley & Sons. This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子量 分子量 分子量 （ぶんしりょう、 英語 : molecular weight ）または 相対分子質量 （そうたいぶんししつりょう、 英語 : relative molecular mass ）とは、物質1 分子 の 質量 の 統一原子質量単位 （静止して 基底状態 にある自由な 炭素 12 ( 12 C) 原子 の質量の1/12）に対する 比 であり、分子中に含まれる 原子量 の総和に等しい。 本来、核種組成の値によって変化する無名数である。しかし、特に断らない限り、天然の核種組成を持つと了解され、その場合には、構成元素の天然の核種組成に基づいた相対原子質量（ 原子量 ）を用いて算出される。 ^ IUPAC. “ IUPAC GOLD BOOK - relative molecular mass, M r ”. 2014年1月24日閲覧。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子鋳型法 分子鋳型法 分子鋳型法 （ぶんしいがたほう、Molecular Template Method）、或いは テンプレート法 とは、 MCM-41 などに代表される メソポーラスシリカ などを、 界面活性剤 の 分子集合体 を型（template）にして、 ゾルゲル法 で合成する方法である。 界面活性剤分子は、溶液中の濃度や、溶液の温度、圧力などの条件により、ベシクルや ミセル といった分子集合体を形成する。この分子集合体を型にして、隙間に金属酸化物を形成させるのが、この方法の基本である。 例えば、MCM-41では、棒状ミセルの集合体であるヘキサゴナル構造を分子鋳型としている。この状態で、シリカの原料である TEOS （オルトケイ酸テトラエチル）などの金属アルコキシドの加水分解・重縮合反応を進行させると、分子鋳型の表面にシリカ（主に アモルファス ）が形成する。これを焼成する事で、有機分子である界面活性剤を取り除くと、分子鋳型の部分が空いた、即ち、多孔質のシリカ粒子が得られる。 通常、得られる多孔質材料の孔径は、界面活性剤分子の疎水鎖の長さに左右される。 しかし、疎水鎖は、構造上の自由度が大きい為、精密に制御する事は出来ない。 そこで、分子鋳型を、単一の界面活性剤溶液ではなく、複数成分を用いた混合系にする場合もある。この場合、混合比を変える事で、細孔径を精密に制御出来る。 ベシクルを型にしてシリカを合成すると、シリカの中空粒子を合成する事が出来る。（シリカの中空粒子自体は、この方法以外にも、 エマルション や バブル を利用して合成出来るが、粒子径は分子鋳型法より大きい。） これまでの文章から類推すると、得られるシリカの中空粒子は、当然、ベシクルの大きさに等しくなるはずであるが、実際には必ずしもそうはならず、小さい粒子が得られる事がある。メカニズムは不明（仮説の段階）であるが、この場合、ベシクルを鋳型（テンプレート）と呼ぶのは、語感的な意味で不正確と考えられる。その為、こういった場合は、鋳型（テンプレート）ではなく、構造指向剤（structure directing agent）などと呼ばれる。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子間力 分子間力 分子間力 （ ぶんしかんりょく 、 （ 英 : intermolecular force ）は、 分子 同士や 高分子 内の離れた部分の間に働く 電磁気学 的な 力 である。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.
分子集合体 分子集合体 分子集合体 （ぶんししゅうごうたい）とは、一般的には、 界面活性剤 分子が、溶液中の濃度や、溶液の温度、圧力などの条件によって集合したものをいう。 一般に、界面活性剤を水に溶かすと、溶液表面に集合する。これは、界面活性剤には疎水鎖がある為である。疎水鎖とは、言うなれば油の性質を持つものであって、水とは分離したがる為、溶液表面へと集合する事によって、溶液全体を安定化させるのである。 しかし、濃度を上げていくと、表面がびっしりと界面活性剤で覆われてしまい、これ以上、表面に集合する事が出来なくなる。すると、界面活性剤は、互いの疎水鎖を内側に集合させた、球状の、 ミセル と呼ばれる分子集合体を形成する。この時の濃度を、 臨界ミセル濃度 （cmc）と呼ぶ。 ジェミニ型界面活性剤 のうち、特に、4以上の オリゴマー では、界面活性剤分子が溶液表面に吸着するよりも、溶液中で プレミセル と呼ばれる、数分子からなる分子集合体を形成した方が系が安定になる事がある。この場合、表面張力の低下は、濃度の増加と必ずしも相関を示さない濃度域が、低濃度側に現れる事がある。この濃度域では、プレミセルの形成と、溶液表面への吸着との間で平衡が成立しているものと推察されている。 分子集合体には、他にも様々なものがあり、細胞膜に酷似したベシクルと呼ばれる内側に水層を持った分子集合体や、平面状に集合した ラメラ構造 、ミセルが結合して棒状になった棒状ミセル、棒状ミセルが集合したヘキサゴナル構造、棒状ミセルの特異的な例である紐状ミセルがある。 尚、 液晶 も分子集合体の一種であり、ラメラ構造などは液晶の性質を示す事がある。 This article is issued from Wikipedia . The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.