در دستگاه‌های میکروفلوئیدیک می‌توان سلول‌ها و پروتئین‌ها را در طرح‌ها و هندسه‌های متفاوتی قرار داد به صورتی که یکی از دیواره‌های کانال در معرض قرار بگیرد (که با توجه به رفتارها و فعل و انفعالات ای که ما مورد نظر داریم تا بررسی کنیم طراحی می‌شود مثلاً ممکن است ما سنجش کوروم (Quorum) را مد نظر داشته باشیم یا مثلاً ممکن است ما بخواهیم بررسی کنیم که همکاری چندین نوع سلول در کنار هم چگونه انجام خواهد شد) اکثر کشت‌های سلولی با وارد کردن سلول‌ها به محیط کشت ای انجام شده‌است که به خوبی تهویه می‌شود و رسیدن مواد مورد نیاز و برداشت مواد زائد در آن به خوبی انجام می‌شود و اصطلاحاً دارای پرفیوژن خوبی است (در واقع ما سلول‌ها را می‌گذاریم تا وارد این محیط شوند به همین علت از اصطلاح علمی آشنا کردن یا introduction به جای وارد کردن استفاده می‌شود) این پروسه به این منظور انجام می‌شود تا آن جمعیت سلولی که می‌خواهیم شبیه‌سازی کنیم را در دستگاه‌های میکرو فلوئیدیک کلاسیک کانال نزدیک ایجاد کنیم و سلول‌هایمان را به آن سمت تمایز بدهیم. در این کار برای حمایت کردن از رشد سلول (برآورده کردن مواد مورد نیاز سلول‌ها، دور کردن مواد دفعی سلول‌ها و کمک به سلول‌ها برای تمایز به سمتی که مورد نظر ما هست) و مطالعهٔ همزمان چندین نوع سلول در یک دستگاه منفرد با کانالِ در معرض چالش‌هایی که مطرح است این است که برهم کنش بین سلول‌ها با هم باید در این محیط دقیقاً کنترل شود زیرا زمان‌بندی و مکان تعامل بسیار مهم است. به چندین روش از جمله اصلاح طراحی دستگاه و طراحی آن به طریق مناسب، استفاده از میکروفلوئیدهای قطره ای و مرتب‌سازی سلولها می‌توان سلول‌ها را به سمت جایگاهی که باید قرار بگیرند آدرس دهی کرد.Kaigala, G. V. , Lovchik, R. D. , & Delamarche, E. (2012). Microfluidics in the “open Space” for performing localized chemistry on biological interfaces. "Angewandte Chemie - International Edition", "51"(45), 11224–11240. https://doi.org/10.1002/anie.201201798 این امر نه تنها باعث می‌شود که دستکاری در محیطی که سلول‌ها در آن زندگی می‌کنند خیلی آسان‌تر انجام شود، بلکه داشتن یک دیواره کانال باز (که در میکرو فلوئیدیک باز ممکن است زیرا از یک دیواره کانال در معرض استفاده می‌کنیم) امکان درک بهتر تعامل بیولوژیکی در این مورد را فراهم می‌آورد. ایجاد طراحی‌های سکوهای میکرو فلوئیدیک با محفظه‌های مختلف که جدا و دارای ابعاد مختلف هستند، امکان تولید و کشت انواع مختلف سلول را فراهم می‌آورد. این دستگاه‌ها اغلب تشکیل قطرات را برای محاصره کردن سلول‌ها و به عنوان این که بتوانیم انتقال دهمی و برای واکنش در دو یا چند مرحله به صورت غیرمستقیم انجام می‌دهند، و این امکان را می ایجاد می‌کنند تا با استفاده از شرایط مختلف بتوانیم آنالیزهای موازی متعددی را انجام دهیم.Casavant, B. P. , Berthier, E. , Theberge, A. B. , Berthier, J. , Montanez-Sauri, S. I. , Bischel, L. L. , … Beebe, D. J. (2013). Suspended microfluidics. "Proceedings of the National Academy of Sciences", "110"(25), 10111–10116. https://doi.org/10.1073/pnas.1302566110 میکروفلوئیدیک باز همچنین با مرتب‌سازی سلول‌های فعال شده با فلورسانس (FACS) همراه شده‌است و این همکاری امکان آن را فراهم کرده‌است تا سلول‌ها را در محفظه طبقه‌بندی شده جداگانه ای در یک شبکه میکرو فلوئیدیک باز برای کشت در محیط در معرض قرار دهند. قرار گرفتن در معرض یکی از دیواره‌های کانال مسئله تبخیر و در نتیجه از بین رفتن سلول را به وجود می‌آورد، اما این مسئله را می‌توان با استفاده از میکروفلوئیدهای قطره ای که قطرات حاوی سلول در روغن فلوئوره غرق می‌شوند به حداقل رساند. اگرچه تبخیر یکی از مضرات اصلی استفاده از سیستم میکرو فلوئیدیک باز برای کشت سلولی است، اما مزایای آن در مقایسه با استفاده از سیستم بسته شامل سهولت دستکاری و دسترسی به سلول‌ها می‌شود. در موارد خاص مانند مطالعه انتقال مواد مخدر و عملکرد ریه‌ها با استفاده از سلول‌های اپیتلیوم آلوئول، قرار گرفتن در معرض هوا برای ایجاد ریه‌ها نه تنها مفید بلکه ضروری است.