title: Dominio SH3

text: Se han encontrado dominios SH3, que se unen a un motivo de consenso R-x-x-K. Ejemplos de ello son los dominios SH3 en la región C-terminal de proteínas adaptadoras como Grb2 y Mona (conocidas como Gads, Grap2, Grf40, GrpL etc.). Otros motivos de unión a SH3 han surgido y siguen surgiendo en el curso de diversos estudios moleculares, poniendo de relieve la versatilidad de este dominio.


title: Dominio SH3

text: Dominios SH3 se encuentran en proteínas de las vías de señalización que regulan el citoesqueleto, la proteína Ras, y la quinasa Src y muchas otros. También regulan el estado de la actividad de proteínas adaptadoras y otras tirosinquinasas y están pensados para aumentar la especificidad de sustrato de la tirosinquinasas por uniéndose lejos del centro catalítico de la quinasa.


title: Dominio SH2

text: El dominio SH2 (del inglés Src Homology 2) es un dominio de proteínas estructuralmente muy conservado en la oncoproteína Src y en muchas otras proteínas de transducción de señales intracelulares.


title: Dominio SH2

text: Las interacciones proteína-proteína desempeñan un papel importante en el crecimiento y desarrollo celular. Los dominios modulares, que son las subunidades de una proteína, moderada estas interacciones mediante la identificación de secuencias cortas de péptidos. Estas secuencias de péptidos determinan las posibles uniones de cada proteína. Uno de los dominios más destacados es el dominio SH2, que desempeña un papel vital en la comunicación celular. Su longitud es de aproximadamente 100 aminoácidos de largo y se encuentra en unas 115 proteínas humanas. En cuanto a su estructura contiene 2 hélices alfa y 3 láminas beta. Investigaciones han demostrado que tiene una elevada afinidad por los residuos de tirosina fosforilada y se sabe que identifica una secuencia de 3 a 6 aminoácidos en el motivo peptídico.


title: Dominio SH2

text: Los dominios SH2 suelen unirse a residuos de tirosina fosforilada en el contexto de un motivo peptídico de mayor tamaño en la proteína diana, y los dominios SH2 dominios representan la mayor clase de dominios de reconocimiento de pTyr.


title: Dominio SH2

text: La fosforilación de residuos de tirosina en una proteína sucede durante la transducción de señales y es llevada a cabo por tirosinquinasas. De esta manera, un sustrato de la fosforilación de la tirosinquinasa actúa como un interruptor para activar la unión a un dominio SH2 contenido en proteínas. La cercana relación entre la tirosinquinasa y los dominios SH2 aparece por su emergencia coordinada durante la evolución de eucariotas.


title: Dominio SH2

text: Los dominios SH2 no están presentes en levaduras y aparecen en la frontera entre los protozoo y animalia en organismos tales como la ameba "Dictyostelium discoideum".


title: Dominio SH2

text: Un examen bioinformático detallado de los dominios SH2 en humanos y ratones revela 120 dominios SH2 encontrados en 115 proteínas codificadas por el genoma humano, lo que representa una rápida tasa de expansión evolutiva entre los dominios SH2.


title: Dominio SH2

text: Un gran número de estructuras de dominios SH2 han sido resueltas y muchas proteínas SH2 han sido estudidadas en ratones knock out.


title: Dominio SH2

text: La función de los dominios SH2 es la de reconocer específicamente el estado fosforilado de los residuos de tirosina. Este proceso constituye un evento fundamental en la transducción de señales a través de membrana, en donde una señal en el compartimento extracelular es detectada por un receptor y es convertida en el compartimento intracelular a una forma química diferente, "i.e." la de una tirosina fosforilada. La fosforilación de la tirosina lleva a la activación de una cascada de interacciones proteína-proteína donde aquellas que contienen el dominio SH2 son reclutadas a sitios con tirosina fosforilada. Este proceso inicia una serie de acontecimientos que eventualmente resultan en la alteración de patrones de expresión génica u otras respuestas celulares.


title: Dominio C1

text: El dominio C1 (también conocido como dominio de unión de ésteres de forbol/diacilglicerol) se une a un importante segundo mensajero como diacilglicerol (DAG), así como a los análogos ésteres de forbol. Estos últimos pueden estimular directamente la proteína quinasa C, (PKC), concretamente a la región N-terminal de la PKC, conocida como C1.


title: Dominio C1

text: Los ésteres de forbol (como PMA) son análogos de DAG y potentes promotores tumorales que causan una variedad de cambios fisiológicos, cuando son administrados a células y tejidos. DAG activa a una familia de proteínas quinasas de serina/treonina, conocidas colectivamente como proteína quinasa C (PKC). Los ésteres de forbol pueden estimular directamente a PKC.


title: Dominio C1

text: La región N-terminal de PKC, conocida como C1, une PMA y DAG de forma dependiente a fosfolípidos y zinc. La región C1 contiene una o dos copias de un dominio rico en cisteína, el cual es de unos cincuenta residuos de longitud, y que es esencial para la unión de DAG/PMA.


title: Dominio C1

text: Los dominios de unión a DAG/PMA unen dos iones de zinc; los ligandos de estos iones metálicos son probablemente las seis cisteínas y dos histidinas que se conservan en este dominio.


title: Dominio Kringle

text: El dominio Kringle es un dominio de proteínas que se pliega en grandes bucles estabilizados por tres enlaces disulfuro. Estos dominos son importantes en las interacciones proteína-proteína con factores de coagulación de la sangre. El nombre proviene del pastel escandinavo kringle, debido a que estas estructuras se asemejan a su forma.


title: Dominio Kringle

text: Los dominios Kringle se han encontrado en plasminógeno, factor de crecimiento de hepatocitos, protrombina, y lipoproteína (a).


title: Dominio Kringle

text: Los dominios Kringle se encuentran en las proteínas de la coagulación de la sangre y fibrinolíticas. Se piensa que estos dominios desempeñan un papel en la unión de mediadores ("e.g." membranas, otras proteínas o fosfolípidos), y en la regulación de la actividad proteolítica. Los dominios Kringle se caracterizan por un bucle triple, una estructura de tres enlaces disulfuro, cuya conformación está definida por una serie de enlaces de hidrógeno y pequeñas piezas de láminas beta antiparalelas. Se encuentran en un número variable de copias en algunas proteínas del plasma, incluyendo la protrombina y activadores de plasminógeno tipo uroquinasa, que son proteasas de serina pertenecientes a la familia S1A de la peptidasa MEROPS.


title: Dominio Kringle

text: ATF; F12; F2; HABP2; HGF; HGFAC; KREMEN1; KREMEN2; LPA; LPAL2; MST1; PIK3IP1; PLAT; PLAU; PLG; PRSS12; ROR1; ROR2;


title: Dominio PAS

text: El dominio PAS es un dominio estructural de proteínas que se encuentra presente en muchas proteínas de señalización donde son utilizados como sensores de señal. Los dominios PAS se encuentran en una gran variedad de organismos desde bacterias a humanos. El dominio Pas debe su nombre a la letra inicial de tres proteínas en las que se encuentra:Muchas proteínas con dominios PAS detectan la señal a través de un cofactor asociado como el hemo.


title: Dominio PDZ

text: El dominio PDZ es un dominio estructural común de 80-90 aminoácidos que se encuentra en proteínas de señalización en bacterias, levaduras, plantas, virus y animales. PDZ es un acrónimo que combina las primeras letras de tres proteínas - proteína de densidad postsináptica (PSD95), una supresora de tumores en "Drosophila" (DlgA), y la proteína zonula occludens-1 (zo-1) - que fueron en las primeras en las cuales se descubrió el dominio. También se hace referencia a estos dominios como DHR (región homóloga Dlg) o GLGF, dominios de (glicina-leucina-glicina-fenilalanina). Estos dominios ayudan a anclar proteínas transmembrana al citoesqueleto y mantener unidos los complejos de señalización.


title: Dominio PX

text: El dominio PX es un dominio estructural de unión a fosfoinositidol involucrado en el marcado de proteínas de la membrana celular. Este dominio fue determinado por vez primera en los dominios p40phox y p47Phox de la NADPH oxidasa (phox hace alusión a ""phagocytic oxidase""). Fue también identificada en muchas otras proteínas involucradas en el tráfico de membranas, incluyendo nexinas, fosfolipasa D y fosfoinositidol 3-quinasa.


title: Dominio PX

text: El dominio PX está estructuralmente conservado en eucariotas, aunque las secuencias aminoacídicas presentan muy poca similitud. Los dominios PX interactúan mayormente con fosfatidilinositol 3-fosfato. Sin embargo algunos de ellos se unen a ácido fosfatídico, fosfatidilinositol 3,4-bifosfato, fosfatidilinositol 3,5-bifosfato, fosfatidilinositol 4,5-bifosfato y fosfatidilinositol 3,4,5-trifosfato. El dominio PX también puede interaccionar con algunos otros dominios y proteínas.


title: Barril beta

text: Un barril beta es una estructura de proteínas formada por una serie de láminas beta que se tuercen y enrollan para formar una estructura cerrada en donde la primera cadena de láminas beta se une a la última a través de enlaces por puente de hidrógeno. Estas láminas beta generalmente forman arreglos antiparalelos. Las estructuras de barril se encuentran comúnmente en porinas y otras proteínas que se atraviesan membranas celulares y proteínas que se unen a ligandos hidrofóbicos en el centro del barril, como en las lipocalinas. Las estructuras de barril tipo porinas son hasta el 2-3% de los genes de una bacteria Gram negativas. En muchos casos, la alternancia de cadenas contienen residuos aminoacídicos polares e hidrofóbicos, de modo que los residuos hidrofóbicos están orientados hacia el interior del barril para formar un núcleo hidrofóbico y los residuos polares están orientados hacia el exterior del barril sobre la superficie expuesta a solvente. Las porinas y otras proteínas de membrana que contienen barriles beta pueden revertir este patrón, con residuos hidrófobos orientados hacia el exterior, donde están en contacto con lípidos, y los residuos hidrófilos orientados hacia el interior del poro.  Todos los barriles-beta se pueden clasificar en función de dos parámetros: el número de cadenas en la lámina beta, n, y el "número de cizalla", S, una medida de la forma escalonada de los capítulos de la lámina beta. Estos dos parámetros (n y S) se relacionan con el ángulo de inclinación de las cadenas de láminas beta en relación con el eje del barril.


title: Barril beta

text: La gran mayoría de los barriles beta posee una de las siguientes topologías:


title: Barril beta

text: Los barriles beta tipo sándwich son los de topologías más simple y consisten en una serie de láminas beta, cada una de las cuales posee enlaces de hidrógenos a la lámina inmediatamenta anterior y posterior en la secuencia primaria.


title: Barril beta

text: Aquellos con topología de tipo greca están conformados por láminas beta adyacentes en el espacio pero no en secuencia. Estos barriles beta generalmente consisten en al menos un motivo estructural en greca unido a una horquilla beta, o dos grecas sucesivas.


title: Barril beta

text: El barril tipo remolino ("jelly-roll" en inglés) es una estructura compleja no local en donde cuatro pares de láminas beta antiparalelas y una sola de ellas adyacente en secuencia, están "envueltos" tridimensionalmente para adoptar la forma de un barril.


title: Barril TIM

text: El barril TIM es un dominio estructural de proteínas muy conservado que consiste en ocho hélices alfa y ocho láminas beta paralelas que se alternan en el esqueleto de la proteína. La estructura debe su nombre a la triosa fosfato isomerasa, una enzima glucolítica muy conservada. Posteriormente se descubrió que los barriles TIM son bastante comunes entre los plegamientos de proteínas conservados.


title: Barril TIM

text: Los barriles TIM son considerados plegamientos α/β, debido a que incluyen un modelo de alternancia de hélices alfa y láminas beta en un único dominio. En un barril TIM las hélices y láminas (por lo general, ocho de cada uno) forman un solenoide que se curva para cerrarse sobre sí mismo en forma de toroide.  Las láminas beta paralelas forman la pared interior del toroide, que le dan su forma de barril, mientras que las hélices alfa forman la pared exterior. Cada lámina beta se conecta con la adyacente en el barril a través de un largo bucle, que incluye una de las hélices. El barril TIM también puede ser pensado, como formada por la superposición de ocho estructuras supersecundarias β-α-β en sentido horario.


title: Barril TIM

text: Cabe destacar que, aunque el diagrama de cintas muestra un hueco en el núcleo central, las cadenas laterales de aminoácidos no se muestran en esta representación. El núcleo de la proteína está en realidad ajustadamente empaquetado, en gran medida con residuos aminoácidos hidrofóbicos voluminosos, aunque unas pocas glicinas son necesarias para permitir cierto espacio para un limitado desplazamiento en el centro donde encajan las ocho repeticiones. Las interacciones de empaquetamiento entre las láminas y las hélices está también dominadas por la hidrofobicidad y las ramificaciones de los residuos alifáticos de valina, leucina, isoleucina que conforman alrededor del 40% del total de residuos en las láminas beta.


title: Barril TIM

text: De los aproximadamente 200 residuos requeridos para poder formar un barril TIM, unos 160 son considerados estructuralmente equivalentes entre diferentes proteínas que comparten este tipo de plegamiento. El resto de residuos se encuentran en el bucle de las regiones que vinculan las hélices y las láminas; los bucles en el extremo C-terminal de las láminas beta suelen contener el sitio activo, lo cual es una de las razones de este tipo de plegamiento sea tan común: los residuos necesarios para mantener la estructura y los residuos que llevan a cabo la catálisis enzimática se encuentran en diferentes subconjuntos. La bucles enlazantes pueden ser tan largos que incluso pueden contener otros dominios de proteínas.


title: Plegamiento de Rossmann

text: El plegamiento de Rossmann es un motivo estructural de proteínas de unión a nucleótidos, particularmente al cofactor NAD. La estructura está compuesta por tres o más láminas beta paralelas unidas por dos hélices alfa en el orden topológico: beta-alfa-beta-alfa-beta. Debido a que cada plegamiento de Rossmann a veces puede unirse a un nucleótido, los dominios de unión a dinucleótidos como NAD constan de dos plegamientos de Rossmann emparejados que se unen cada uno a un nucleótido o una fracción de la molécula del cofactor. Los plegamientos de Rossmann únicos pueden unirse a mononucleótidos como el cofactor FMN.


title: Plegamiento de Rossmann

text: El motivo lleva su nombre en honor a Michael Rossmann quien fue el primero en señalar que este era un motivo frecuente en las proteínas de unión a nucleótido.


title: Plegamiento de Rossmann

text: Un estudio moderno del grupo ENIGMA de la Universidad Rutgers (Nueva Jersey) sostiene que este proceso y el movimiento de electrones provocado por el hierro de la ferredoxina fueron fundamentales para el desarrollo del metabolismo de la vida en la tierra o abiogénesis.


title: Repetición rica en leucina

text: Una repetición rica en leucina (LRR por sus siglas en inglés) es un motivo estructural de proteínas que forma un plegamiento en herradura α/β. Se compone de la repetición de 20-30 aminoácidos que se tratan generalmente de residuos del aminoácido hidrofóbico leucina.


title: Repetición rica en leucina

text: Normalmente, cada unidad repetida tiene una estructura tipo lámina beta-giro-hélice alfa, y el dominio ensamblado, compuesto por muchas de estas repeticiones, tiene la forma de una herradura con un interior de láminas paralelas y un exterior de arreglos de hélices alfa. Una cara de la lámina beta y un lado del arreglo de hélices están expuestos al solvente y por ende poseen residuos hidrofílicos. La región entre las hélices y las láminas beta forma el núcleo hidrofóbico de la proteína y está estrechamente empaquetado con residuos de leucina.


title: Repetición rica en leucina

text: Las repeticiones ricas en leucina están con frecuencia involucrados en la formación de las interacciones proteína-proteína.


title: Repetición rica en leucina

text: Los motivos de repeticiones ricas en leucina se han identificado en un gran número de proteínas no relacionadas funcionalmente. El ejemplo más conocido es el inhibidor de la ribonucleasa, pero otras proteínas tales como el regulador de tropomiosina, tropomodulina y los receptores tipo Toll también comparten este motivo. De hecho, el receptor tipo Toll posee diez motivos de repeticiones ricas en leucina sucesivos que sirven para unirse al antígeno.


title: Repetición rica en leucina

text: Aunque la proteína con repeticiones ricas en leucina canónica contiene aproximadamente una hélice para cada lámina beta, las variantes que forman los plegamientos de superhélice beta-alfa a veces en lugar de hélices poseen largos bucles que unen sucesivas láminas beta.


title: Cremallera de leucina

text: Una cremallera de leucina es un motivo estructural supersecundario de proteínas que crea fuerzas de adhesión a través de hélices alfa en paralelo. Es un dominio de dimerización común en proteínas involucradas en la expresión génica.


title: Cremallera de leucina

text: La principal característica del dominio de cremallera de leucina es la predominancia del aminoácido leucina en la posición "d" de la repetición del grupo de siete aminoácidos. Las cremallera de leucina fueron primero identificadas como alineamiento de secuencia de ciertos factores de transcripción en los que se identificaba un patrón común de leucinas cada siete aminoácidos. Posteriormente se descubrió que estas leucinas formaban un núcleo hidrofóbico de una superhélice.


title: Cremallera de leucina

text: Cada mitad de la cremallera de leucina es una corta hélice alfa con un residuo de leucina cada siete posiciones. La conformación estándar de 3,6 residuos por giro de la estructura de hélice alfa cambia ligeramente a 3,5 residuos por giro de hélice. Cada leucina se encuentra en contacto con la leucina de la otra hélice cada dos giros.


title: Cremallera de leucina

text: La familia de factores de transcripción bZip consiste en una región básica que interacciona con el surco mayor de la molécula de ADN a través de enlaces de hidrógeno, y una región hidrofóbica de cierre, que es la responsable de la dimerización.


title: Cremallera de leucina

text: Las proteínas reguladoras con el motivo cremallera de leucina incluyen c-fos y c-jun (el factor de transcripción AP1), son importantes reguladores del desarrollo. Si son producidos en exceso o mutados en un área vital, pueden generar cáncer. Estas proteínas interaccionan con el ADN como dímeros (homo- o hetero-) y son llamadas cremalleras de leucina básicas o bZips por sus siglas en inglés.


title: Rho Scorpii

text: Rho Scorpii (ρ Sco / 5 Scorpii / HD 142669 / HR 5928) es una estrella de magnitud aparente +3,86 situada en la constelación del Escorpión. Se encuentra a 409 años luz del Sistema Solar, perteneciendo —al igual que Antares (α Scorpii), ρ Ophiuchi o 48 Librae— a la Asociación Scorpius Superior, subgrupo de la gran Asociación estelar de Scorpius-Centaurus.


title: Rho Scorpii

text: Rho Scorpii es una estrella azul de la secuencia principal —también catalogada como posible subgigante— de tipo espectral B2 cuya temperatura superficial es 21.150 K. Brilla con una luminosidad 2540 veces superior a la del Sol y su radio es 3,75 veces más grande que el radio solar. Tiene una edad aproximada de 33 millones de años y es 7,5 veces más masiva que el Sol; justo por debajo del límite para estallar como supernova, probablemente finalizará su vida como una enana blanca masiva similar a Sirio B (α Canis Majoris B). Gira sobre sí misma con una velocidad de rotación de al menos 40 km/s, siendo su períodos de rotación inferior a 1,4 días.


title: Rho Scorpii

text: Rho Scorpii es una binaria espectroscópica con un período orbital de 4,003 días. De la estrella acompañante nada se sabe, salvo que se mueve en una órbita relativamente excéntrica (ε = 0,27). Una tenue estrella de magnitud +12,8, visualmente a 40 segundos de arco, también parece formar parte del sistema. Comparte movimiento propio con Rho Scorpii y, si verdaderamente está ligada a la luminosa estrella azul, está separada de ella al menos 4900 UA, completando una órbita en más de 114.000 años.


title: Hélice superenrollada

text: Una hélice superenrollada, o helicoide enrollado (del inglés "coiled coil") es un motivo estructural de proteínas, en donde 2 a 7 hélices alfa se enrollan juntas, siendo los dímeros y los trímeros las formas más comunes. Muchas proteínas tipo hélice superenrollada están involucradas en importantes funciones biológicas tales como la regulación de la expresión génica, tales como los factores de transcripción. Ejemplos notables son las oncoproteínas c-fos y jun, y la proteína muscular tropomiosina.


title: Hélice superenrollada

text: La posibilidad de un motivo estructural de hélice superenrollada fue propuesto para la α-queratina por Francis Crick en 1952, así como el desarrollo de los métodos matemáticos necesarios para determinar su estructura. Esto sucedió poco tiempo después de que la estructura de la hélice alfa fuera propuesta por Linus Pauling "et al." en 1951.


title: Hélice superenrollada

text: Las hélices superenrolladas generalmente poseen un patrón repetido, "hpphppp", de residuos de aminoácidos hidrofóbicos ("h") y polares ("p"), llamada héptada repetitiva. Las posiciones de la héptada repetitiva están marcadas como "abcdefg", donde "a" y "d" son las posiciones hidrofóbicas, ocupadas frecuentemente por isoleucina, leucina o valina. Plegar una secuencia con este patrón repetitivo en una estructura secundaria de hélice alfa provoca que los residuos hidrofóbicos se presenten como una "banda" que gira lentamente a lo largo de la hélice en sentido antihorario, formando una estructura anfipática. La forma más favorable para que dos de estas hélices se organicen en el medio acuosos del citoplasma es envolver las zonas hidrófobas entre sí ubicándose los aminoácidos hidrofílicos hacia el exterior.


title: Hélice superenrollada

text: Debido a esto, el ocultamiento en el interior de las superficies hidrófobicas, proporciona la fuerza termodinámica impulsora para la oligomerización. El ensamblaje en una hélice superenrollada es muy compacto, interaccionando muy íntimamente mediante fuerzas de van der Waals prácticamente todas las cadenas laterales de los residuos d. La compacidad característica de este ensamblaje fue predicha por Francis Crick en 1952 y se conoce como ensamblaje "botón en ojal" ("knobs-into-holes" en inglés).


title: Hélice superenrollada

text: Las hélices alfa pueden ser paralelas o anti-paralelas, y suelen adoptar un enrollamiento en sentido antihorario. Aunque no es termodinámicamente tan favorable, se han observado algunos ejemplos en la naturaleza en sentido horario y se han adoptado también en proteínas sintéticas.


title: Hélice superenrollada

text: Un paso clave en la entrada del VIH en las células humanas es la exposición de una hélice superenrollada trimérica paralela conocida como gp41. El trímero de gp41 normalmente se encuentra cubierto por otra glicoproteína de superficie conocida como gp120, la cual lo protege de los anticuerpos. Luego de unirse a la célula blanco, gp120 experimenta un cambio conformacional que expone al trímero gp41, cuya cola hidrofóbica N-terminal atraviesa la membrana celular de la célula destino. Otros tres hélices de gp41 se pliegan en los surcos de la hélice superenrollada del trímero de gp41, formando un hexámero, acercando la cápside viral y la membrana de la célula diana lo suficientemente como para la fusión. El virus ingresa a la célula y comienza a replicarse. Se han desarrollado fármacos inhibidores que se unen en los surcos de gp41 tales como Fuzeon.


title: Hélice superenrollada

text: El problema general de predecir la estructura plegada de una proteína teniendo solamente la secuencia de aminoácidos no está resuelto. Sin embargo, la hélice superenrollada es uno de los pocos motivos de plegamiento para el cual la relación entre la secuencia de aminoácidos y la estructura plegada final ha sido resuelto. Harbury et al. realizaron el estudio del arquetipo de hélice superenrollada, GCN4, en donde establecieron las normas que gobiernan la forma en que la secuencia del peptídica afecta el estado oligomérico (es decir, el número de hélices alfa en el ensamblaje final). El GCN4 es una hélice superenrollada de 31 aminoácidos (lo que equivale a poco más de cuatro héptades) paralela, dimérica y posee una repetición de isoleucinas y leucinas en la posición "a" y "d", respectivamente. Cuando los aminoácidos en las posiciones A y D se intercambian se obtiene un trímero de hélice superenrollada. Además, mutando las posiciones "a" y "d", ambas a leucina dan lugar a la formación de un tetrámero de hélice superenrollada. Estas representan un simple conjunto de normas para la determinación del estado oligomérico de la hélice superenrollada. Otro aspecto del ensamblaje relativamente bien conocido, al menos en el caso de los dímeros, es que colocando un residuo polar (en particular asparagina, N) en posiciones "a" opuestas fuerza al ensamblaje de hélices paralelas. Este efecto se debe a un enlace de hidrógeno autocomplementario entre estos residuos, el cual quedaría insatisfecho si una asparagina se enlazara con una leucina de la otra hélice.


title: Hélice-bucle-hélice

text: Una hélice-bucle-hélice básica (bHLH por sus siglas en inglés) es un motivo estructural de proteínas que caracteriza a una familia de factores de transcripción.


title: Hélice-bucle-hélice

text: El motivo se caracteriza por dos hélices alfa conectadas por un bucle. En general, los factores de transcripción que incluyen este dominio son diméricos, cada uno con una hélice conteniendo aminoácidos básicos que facilitan la unión a ADN. En general, una hélice es más pequeña, y, debido a la flexibilidad del bucle, permite la dimerización plegándose y empaquetándose contra la otra hélice. La hélice de mayor tamaño generalmente contiene las regiones de unión al ADN. Las proteínas bHLH se unen a la secuencia de consenso llamada caja E, CANNTG. La caja E clásica es CACGTG (palindrómica), sin embargo algunos factores de transcripción bHLH se unen a secuencias no palindrómicas, las cuales en ocasiones son similares a las de la caja E.


title: Hélice-bucle-hélice

text: Debido a que muchos factores de transcripción bHLH son heterodiméricos, su actividad está generalmente altamente regulada por la dimerización de sus subunidades. La expresión de una subunidad o su disponibilidad es con frecuencia controlada, mientras que la otra subunidad es expresada constitutivamente. Muchas de las proteínas reguladoras conocidas, tales como la proteína extramacrochaetae (emc) de "Drosophila", tiene la estructura hélice-bucle-hélice pero carecen de la región básica, haciéndolas incapaces de unirse al ADN por su cuenta. Sin embargo, son capaces de formar heterodimeros con proteínas que tienen la estructura bHLH, e inactivar su capacidad como factores de transcripción.


title: Hélice-giro-hélice

text: En proteínas, la hélice-giro-hélice es uno de los principales motivos de estructura secundaria capaces de unirse al ADN. Se compone de dos hélices α unidas por una breve secuencia lineal de aminoácidos y se encuentra en muchas proteínas que regulan la expresión génica. No debe ser confundida con el dominio hélice-lazo-hélice.


title: Hélice-giro-hélice

text: Su descubrimiento se basó en las similitudes entre los genes de Cro, PAC, y el represor λ, que comparten una secuencia de 20-25 aminoácidos que facilita el reconocimiento por el ADN. El reconocimiento y unión a ADN se hace a través de las dos hélices α, un ocupando el motivo N-terminal y la otra el motivo C-terminal. En la mayoría de los casos, como en el represor Cro, la segunda hélice contribuye más al reconocimiento del ADN y, por tanto, es a menudo llamada la "hélice de reconocimiento". Se une al surco mayor del ADN a través de una serie de puentes de hidrógeno e interacciones de van der Waals con las bases expuestas. La otra hélice α estabiliza la interacción entre proteínas y ADN, pero no juega un papel importante en el reconocimiento.


title: Hélice de poliprolina

text: En proteínas, la hélice de poliprolina habitualmente en sentido antihorario, llamada hélice poliprolina II (PPII o poli-Pro II) la cual se forma cuando todos los residuos secuenciales adoptan los ángulos diedros (φ, ψ) en su columna de aproximadamente (-75 °, 150 °) y poseen isómeros "trans" en sus enlaces peptídicos. Del mismo modo se forma una hélice más compacta y de sentido horario llamada hélice de poliprolina I (PPI, poli Pro-I) cuando todos los residuos adoptan los ángulos diedros (φ, ψ) de aproximadamente (-75 °, 160 °) y posee isómeros "cis" en sus enlaces peptídicos. De los veinte aminoácidos naturales, solo la prolina es la que con mayor probabilidad forme isómeros "cis" en el enlace peptídico, en particular en el enlace X-Pro; factores estéricos y electrónicos favorecen en gran medida el isómero trans en la mayoría de los enlaces peptídicos. Sin embargo, los enlaces peptídicos que sustituyen la prolina con otro "N"-aminoácido sustituto (como la sarcosina) son también susceptibles de adoptar el isómero "cis".


title: Hélice de poliprolina

text: La hélice de poliprolina II es definida por los ángulos diedros (φ,ψ) de (-75°, 150°) e isómeros "trans" de los enlaces peptídicos.La fórmula general de rotación del ángulo Ω por residuo de cualquier hélice de polipéptidos con isómeros "trans" está dada por la ecuación:


title: Hélice de poliprolina

text: La sustitución de los ángulos diedros (φ, ψ) para PPII en esta ecuación resulta en exactamente Ω = -120 °, es decir, la hélice PPII es antihoraria (ya que Ω es negativo) con tres residuos por vuelta. La traslación de residuos es de aproximadamente 3,1 Å. Esta estructura es algo similar a la adoptada en la proteína fibrosa colágeno, que se compone principalmente de prolina, hidroxiprolina y glicina. Las hélices PPII están específicamente enlazadas por dominios SH3, esta unión es importante para muchas interacciones proteína-proteína y las interacciones entre los dominios de una sola proteína.


title: Hélice de poliprolina

text: Los ángulos diedros de la columna de la PPII (-75 °, 150 °) se observan con frecuencia en las proteínas, incluso aminoácidos distintos de prolina. La gráfica de Ramachandran es muy poblada en la región de PPII en la región, en comparación con la región en torno a la hoja beta (-135 °, 135 °). Por ejemplo, la columna de ángulos diedros para PPII se observa con frecuencia la estructura de giros, más comúnmente en el primer residuo de un giro beta tipo II. La "imagen especular" para los ángulos diedros de PPII (75 °, -150 °) es raramente vista, excepto en los polímeros del aminoácido aquiral glicina. El análogo de la hélice PPII en poli-glicina es llamado hélice poli-Gly II.


title: Hélice de poliprolina

text: La hélice de poliprolina I es mucho más densa que la hélice PPII debido a los isómeros "cis" de sus enlaces peptídicos. También es menos frecuente que la conformación PPII porque el isómero "cis" es de mayor energía que la forma "trans". Sus ángulos diedros típicos son (-75°, 160°), similares pero no idénticos a los de la hélice de PPII. Sin embargo la hélice de PPI es en sentido horario y más firmemente enrollada, con unos 3,3 residuos por giro (en lugar de los 3 de PPII). La traslación por residuo también es menor, de unos 1,9 Å. Nuevamente, no hay enlaces de hidrógeno internos en PPI, en ambas debido a que el átomo donante del enlace está ausente y porque el nitrógeno y oxígeno de la amida están demasiado distantes (unos 3,8 Å) y orientados incorrectamente.


title: Hélice de poliprolina

text: La hélice PPII es relativamente abierta y no tiene enlaces de hidrógeno internos, a diferencia de otras estructuras helicoidales secundarias, como la hélice alfa, la hélice 310, la hélice pi o la hélice beta. Los átomos nitrógeno y oxígeno de la amida están demasiado distantes (aproximadamente 3,8 Å) y orientada incorrectamente como para un enlace de hidrógeno. A pesar de que estos dos átomos son aceptores de enlaces de hidrógeno en la prolina; no hay donantes de enlaces debido a la cadena lateral cíclica.


title: Hélice de poliprolina

text: Las hélices de poliprolina son estables y rígidas a pesar de la ausencia de puentes de hidrógeno internos, y se han utilizado como una "regla molecular" en experimentos biofísicos, por ejemplo, para calibrar distancias medidas por FRET. Las interconversiones entre las formas de las hélices de PPI y PPII son lentas, debido a la alta energía de activación de la isomerización X-Pro "cis-trans" (E ≈ 20 kcal/mol); sin embargo, esta interconversión puede ser catalizada por isomerasas específicas conocida como prolil isomerasas o PPIasas.


title: Hélice 310

text: Una hélice 3 es un tipo de estructura secundaria de proteínas poco común. Son más estrechas y más lárgas que una hélice alfa.


title: Hélice 310

text: Los aminoácidos en una hélice 3 están dispuestos en una estructura helicoidal de sentido horario. Cada aminoácido corresponde a 120° de giro en la hélice (es decir, la hélice tiene tres residuos por vuelta) y una traslación de 2,0 Å (0,2 nm) a lo largo del eje de la hélice. El grupo N-H de un aminoácido forma un enlace por puente de hidrógeno con el grupo C=O del aminoácido "tres" residuos anterior; estos enlaces de hidrógeno repetidos "i" + 3 → "i" definen la hélice 3. Estructuras similares incluyen la hélice alfa (con enlaces de hidrógeno "i" + 4 → "i") y la hélice pi (con enlaces de hidrógeno "i" + 5 → "i").


title: Hélice 310

text: Los residuos en una hélice 3 adoptan típicamente ángulos diedros (φ, ψ) cercanos a −49°, −26°, de tal forma que el ángulo ψ de un residuo y el ángulo φ del siguiente suman unos −75°. En comparación, la suma de ángulos diedros de una hélice alfa es de aproximadamente −105°, mientras que los de una hélice pi suman unos −125°.


title: Hélice 310

text: La fórmula general de rotación del ángulo Ω por residuo de cualquier hélice polipeptídica con configuración "trans" está dada por la ecuación:


title: Hélice beta

text: Una hélice beta es una estructura secundaria de proteínas formada de la asociación de láminas beta paralelas en un patrón helicoidal con dos o tres caras. La estructura se estabiliza por puentes de hidrógeno, interacciones proteína-proteína y, a veces por iones metálicos. Se han identificado hélices beta tanto en sentido horario como antihorario.


title: Hélice beta

text: Las hélices beta más simples contienen dos "niveles" de láminas beta conectadas por seis bucles ricos en residuos de glicina que contienen invariablemente una aspartato que se une a un ion de calcio por bucle. Cada capa se compone de series casi planas de láminas beta en paralelo, enlazadas por puentes de hidrógeno y las dos capas juntas formando un núcleo hidrofóbico.


title: Hélice beta

text: Las hélices beta de tres láminas forman un prisma triangular distorsionado en el cual cada cara presenta puentes de hidrógeno paralelos entre láminas. Una de las tres hojas que forman el motivo estructural puede aparecer "doblado" en relación con los otros dos, que se encuentran enfrentados de forma similar a la le hélice beta de doble lámina. Dos de los tres bucles que enlazan las hojas pueden ser de una longitud arbitraria y puede incluso contener otros dominios estructurales, y el tercera se limita a solo dos residuos. Una repetición de hexapéptidos característica encontrado en hélices de ambos sentidos es: formula_1. Las hélices beta de tres láminas son considerablemente más largas que su contraparte de dos láminas.


title: Hélice beta

text: La primera hélice beta se observó en la enzima pectato liasa, que contiene una hélice de siete giros que llega a los 34 Å (3,4 nm) de longitud. Las proteínas de la cola del fago P22, poseen 13 vueltas y su homotrimero ensamblado es de 200 Å (20 nm) de longitud. Su interior está completamente cerrado sin poro central y contiene residuos hidrófobos y residuos neutralizados por puentes de sal.


title: Hélice beta

text: Tanto la pectato liasa como las proteínas de la cola del fago P22 contienen proteínas que forman hélices de sentido horario; en sentido antihorario se han observado en enzimas, como la UDP-N-acetilglucosamina aciltransferasa y la anhidrasa carbónica de archaeas. Otras proteínas que contienen beta hélices son las proteínas anticongelantes del escarabajo "Tenebrio molitor" y la mariposa, "Choristoneura fumiferana", donde treoninas espaciadas regularmente en hélices beta se unen a la superficie de los cristales de hielo e inhiben su crecimiento.


title: Hélice beta

text: Las hélices beta pueden asociarse entre sí de manera eficaz, ya sea cara a cara (el apareamiento de las caras de su prisma triangular) o de extremo a extremo (formando puentes de hidrógeno). Por lo tanto, las hélices beta pueden ser utilizadas como "etiquetas" para inducir a otras proteínas a asociarse, de forma similar a una superhélice.


title: Hélice pi

text: Una hélice pi (o hélice π) es un tipo de estructura secundaria de proteínas encontrada particularmente en proteínas de membrana.


title: Hélice pi

text: En una hélice pi estándar, los aminoácidos están dispuestos de forma helicoidal en sentido horario. Cada aminoácido corresponde a 87° en el giro de la hélice (es decir, la hélice tiene 4,4 residuos por vuelta) y una traslación de 1,15 Å (0,115 nm) en el eje de la hélice. El grupo N-H de un aminoácido forma un enlace por puente de hidrógeno con el grupo C=O del aminoácido "cinco" residuos anterior; estas repeticiones de enlaces de hidrógeno "i"+5→"i" definen la hélice pi.


title: Hélice pi

text: Los residuos en las hélices pi adoptan ángulos diedros (φ, ψ) de -55°, -70°, de tal forma que el ángulo ψ de un residuo y el ángulo φ del siguiente suman aproximadamente unos -125°.


title: Hélice pi


title: Hélice pi

text: En principio es posible una versión antihoraria de la hélice pi cambiando el signo de los ángulos diedros (φ, ψ) a 55°, 70°. Esta imagen pseudoespecular de la hélice tiene el mismo número de residuos por vuelta (4,1) y una traslación de 1,5 Å por residuo. No es una imagen especular perfecta debido a que los residuos de aminoácidos conservan su quiralidad. Es difícil encontrar una hélice pi larga en proteínas debido a que entre los aminoácidos solo la glicina puede llegar a tomar ángulos diedros φ positivos de 55°.


title: Lámina alfa

text: La lámina alfa es una estructura secundaria hipotética de proteínas, la cual fue propuesta por vez primera por Linus Pauling y Robert Corey en 1951. El patrón de puentes de hidrógeno en una lámina alfa es similar al de una lámina beta, pero la orientación de los grupos carbonilo y amino en el enlace peptídico es diferente; en una lámina alfa aislada, todos los grupos carbonilo están orientados en la misma dirección de un lado del plegamiento, y todos los grupos amino se encuentran orientados en la misma posición pero del lado opuesto de la lámina. Por lo tanto, la lámina alfa acumula una inherente separación de carga electrostática, con un borde de la lámina exponiendo los grupos carbonilo de carga negativa y el borde opuesto exponiendo los grupos de amino cargados positivamente. A diferencia de la hélice alfa y la lámina beta, la configuración de lámina alfa no requiere que todos los residuos de aminoácidos que la componen se encuentren dentro de los límites de una única región de ángulos diedros; en cambio, la lámina alfa contiene residuos de diedros alternando en las tradicionales regiones dextrógiras (αR) y levógiras (αL) helicoidales del espacio de Ramachandran. Aunque la lámina alfa es muy raramente observada en estructuras de proteínas naturales, es una forma estable accesible a las proteínas amiloidogénicas en simulaciones de dinámica molecular. Las láminas alfa también se han observado con cristalografía de rayos X de estructuras de péptidos diseñados.


title: Lámina alfa

text: Cuando Pauling y Corey, propusieron por primera vez la estructura de lámina alfa, sugirieron que estaba de acuerdo con los resultados de difracción en fibras de beta-queratina. Sin embargo, ya que la lámina alfa no parecen ser favorables energéticamente, señalaron que más los más común sería que hubieran láminas beta entre las proteínas normales, y la posterior demostración de que la beta-queratina está formada por láminas beta restaron importancia a la propuesta de láminas alfa. Recientemente, la conformación lámina alfa se ha observado en casos aislados en estado nativo en proteínas resueltas por cristalografía de rayos X o RMN de proteínas, aunque una lámina alfa extendida no se ha identificado en proteínas naturales conocidas. Algunas proteínas que en estado nativo poseen regiones o patrones de enlaces de hidrógeno en lámina alfa incluyen sinaptotagmina, lisozima, y canales de potasio, donde las láminas alfa se encuentran en el poro conductor del ion.


title: Lámina alfa

text: Las conformaciones en lámina alfa se han observado en estructuras cristalizadas de péptidos cortos no naturales, especialmente aquellos que contienen una mezcla de aminoácidos L y D. La primera estructura de cristal observada conteniendo una lámina alfa fue el tripéptido Boc–Ala–a-Ile–Ile–OMe. Otros péptidos que forman estructuras de lámina alfa incluyen dipéptidos y tripéptidos basados en difenil-glicina.


title: Lámina alfa

text: La lámina alfa ha sido propuesto como un posible estado intermedio en el cambio conformacional en la formación de fibras de amiloide por péptidos y proteínas como la beta amiloide, repeticiones de poliglutamina, lisozima, proteínas priónicas y repeticiones de transtiretina, todos los cuales están asociados con enfermedades por mal plegamiento de proteínas. Por ejemplo, el beta amiloide es un importante componente de las placas de amiloide en el cerebro de pacientes con la enfermedad de Alzheimer, y repeticiones de poliglutamina en la proteína huntingtina asociada con la enfermedad de Huntington. Estas proteínas se someten a un cambio conformacional desde estructuras como un ovillo aleatorio o una hélice alfa a estructuras muy ordenadas como una lámina beta encontrada en fibras amiloides. La mayoría de las láminas beta en proteínas conocidas se encuentran "retorcidas" alrededor de 15° para obtener óptimos enlaces de hidrógeno y empaquetamiento estérico, sin embargo, algunas pruebas de cristalografía de electrones indica que al menos algunas fibras amiloide pueden contener láminas "planas" con sólo 1-2,5° de giro. Un intermediario de amiloide en la conformación de lámina alfa se sugiere para explicar algunas características anómalas del proceso de formación de fibras de amiloide, como la evidente dependencia de la secuencia de aminoácidos de la amiloidogénesis a pesar de la creencia de que el plegamiento de amiloide se estabiliza por el propio esqueleto peptídico de la proteína y la aceleración en el proceso de formación de fibras en presencia de un campo magnético.


title: Lámina alfa

text: Xu, utilizando microscopía de fuerza atómica, demostró que la formación de fibras amiloides es un proceso de dos etapas en las que las proteínas primero se agregan en esperas coloidales de unos ~ 20 nm de diámetro. A continuación, las esferas se unen espontáneamente para formar cadenas lineales, que evolucionan en fibras amiloides maduras. La formación de estas cadenas lineales parece estar motivada por el desarrollo de un dipolo electrostático en cada una de las esferas coloidales lo suficientemente fuerte como para superar la repulsión de Coulomb. Esto sugiere un posible mecanismo por el cual la lámina alfa puede promover la agregación amiloide; el enlace peptídico tiene un relativamente grande dipolo electrostático intrínseca, pero normalmente los dipolos de enlaces peptídico cercanos se anulan unos a otros. En la lámina alfa, a diferencia de otras conformaciones, los enlaces péptidicos está orientados en paralelo a fin de que los dipolos de los enlaces individuales puedan sumarse para crear un fuerte dipolo electrostático global.


title: Lámina alfa

text: La proteína lisozima es una de los pocas proteínas que en estado nativo contiene una región de lámina alfa; tanto en pollos como en humanos presenta una estructura en lámina alfa cerca del sitio de una mutación genética conocida que se sabe que causa amiloidosis hereditaria en los humanos, generalmente una enfermedad genética autosómica dominante. Las simulaciones de dinámica molecular de la proteína mutante revelan que la región alrededor de la mutación posee una conformación de lámina alfa. La lisozima es una de las proteínas naturales conocidas que forma fibras amiloides en condiciones experimentales, y tanto la región en lámina alfa nativa y el sitio de la mutación caen en una región mayor identificada como el núcleo de la formación de fibras amiloides.


title: Lámina alfa

text: Se ha sugerido un mecanismo directo para la interconversión entre lámina alfa y lámina beta, sobre la base de péptidos girando en el planto en donde el dipéptido αRαL se invierte para producir un ángulo diedro de conformación ββ. Este proceso también se ha observado en las simulaciones de transtiretina e implicado en determinadas familias de proteínas observadas mediante el examen de su conformación en el ángulo diedro enestructuras cristalinas.


title: Horquilla beta

text: La horquilla beta (o unidad beta-beta) es el motivo de estructura secundaria de proteínas más simple, en donde participan dos láminas beta que se parecen a una horquilla. El motivo consta de dos láminas que se encuentran adyacentes en la estructura primaria en una estructura orientada de forma antiparalela (en el que el extremo N-terminal de una hoja es adyacente al extremo C-terminal de la próxima) y vinculados por una corta secuencia de dos a cinco aminoácidos. La horquilla beta puede ocurrir en forma aislada o como parte de una serie de láminas en régimen de enlaces de hidrógeno que, en conjunto, componen una hoja beta.


title: Horquilla beta

text: Algunos investigadores han utilizado la RMN de proteínas para demostrar que las horquillas beta pueden formarse a partir de cadenas cortas de péptidos aislados en solución acuosa, lo que sugiere que estas horquillas podrían formar sitios de nucleación para el plegado de proteínas.


title: Dedo de cinc

text: Los dedos de zinc son pequeños motivos estructurales de proteínas que pueden coordinar uno o más iones de zinc para ayudar a estabilizar sus pliegues. Normalmente funcionan como módulos de interacción que unen el ADN, ARN, proteínas y moléculas pequeñas. Estas proteínas tienen un rol estructural esencialmente. Este rol puede consistir en bajar la entalpía de plegamiento de una proteína e inducir una conformación activa, o bien, estabilizar una estructura cuaternaria en particular. El zinc también tiene un rol regulativo, es decir, no participa en los varios pasos catalíticos, pero su presencia sí incrementa la rapidez catalítica. El nombre de "dedo de zinc" fue acuñado para describir la hipótesis de la estructura de la unidad repetida del factor de transcripción IIIA en "Xenopus laevis".


title: Dedo de cinc

text: Los dedos de zinc coordinan iones de zinc con una combinación de residuos de cisteína e histidina. Pueden ser clasificados por el tipo y orden de estos residuos de coordinación con el cinc (por ejemplo, Cys2His2, Cys4, y Cys6). Un método más sistemático los clasifica en distintos "grupos de pliegues" basado en la forma de la columna de la proteína en el dominio plegado. El "grupo de pliegues" más común de dedos de zinc es el de tipo Cys2His2 (el "clásico dedo de zinc"), clave triple y cinta de cinc.


title: Dedo de cinc

text: El grupo de plegamiento tipo CisHis es la clase de dedos de zinc mejor caracterizados y son muy comunes en factores de transcripción de mamíferos. Estos dominios adoptan un pliegue ββα y tienen el siguiente motivo de secuencia aminoacídica: X-Cis-X-Cis-X-His-X-His


title: Dedo de cinc

text: Esta clase de dedos de zinc puede tener una variedad de funciones tales como la unión a ARN y las interacciones proteína-proteína, pero es mejor conocido por su papel en la unión a secuencia específica de ADN, en proteínas como Zif268. En estas, los dominios de dedos de zinc se suceden típicamente en repeticiones en tándem con dos, tres o más dedos por el dominio de unión a ADN por proteína. Estos arreglos en tándem se pueden unir al surco mayor del ADN y están normalmente espaciados a intervalos de 3 pares de bases. La α-hélice de cada dominio (a menudo llamada la "hélice de reconocimiento") puede hacer contactos con secuencias específica de bases de ADN; los residuos de una sola hélice de reconocimiento puede contactarse con 4 o más bases para producir un patrón de superposición de contactos con los dedos de zinc adyacente.


title: Dedo de cinc

text: Los miembros de esta clase contiene complejos de cinc binuclear en donde dos iones de zinc están unidos a seis residuos de cisteína. Estos dedos de zinc se pueden encontrar en varios factores de transcripción incluyendo la proteína Gal4 de la levadura.


title: Dedo de cinc

text: Debido a su química de coordinación básica, el zinc no interactúa directamente con el ácido nucleico. En vez de eso, el ion de cinc debe servir un rol estructural, definiendo el plegado y la estructura tridimensional del andamiaje de la proteína en cuestión. Esta estructura, definida por un metal en su centro, es capaz de reconocer su estructura complementaria en el polímero de ácido nucleico.


title: Dedo de cinc

text: Según los estudios basados en bases de datos cristalográficas para metaloproteínas y un detallado examen de la secuencia emergente para dedos de zinc, Berg, propuso una estructura tridimensional. Estudios de EXAFS también respaldaron el sitio tetrahédrico del zinc. Asimismo, estudios de RMN coinciden.


title: Dedo de cinc

text: El RMN ha sido la técnica más recurrentemente usada para el estudio de los dedos de zinc. La espectroscopía de resonancia magnética nuclear (RMN) es una técnica de investigación que explota las propiedades magnéticas de ciertos núcleos atómicos. Este tipo de espectroscopía nos permite determinar las características físicas y químicas de los átomos o de las moléculas que los contienen. Se apoya en el fenómeno de resonancia magnética nuclear en el que el campo magnético intramolecular alrededor de un átomo en una molécula cambia la frecuencia de resonancia, dándonos así acceso a detalles de la estructura electrónica de una molécula y de sus grupos funcionales individuales. Da información acerca de la estructura, la dinámica, estado de reacción y ambiente químico de las moléculas.


title: Dedo de cinc

text: Un reto que presenta el estudio de ciertas proteínas, incluyendo dedos de cinc, es que la formación de cuerpos de exclusión, la toxicidad de proteínas exógenas, la modificación de cadenas laterales, etcétera, influencian la expresión de la proteína y pueden complicar la purificación de la misma. Por lo tanto, ha sido difícil expresar suficientes proteínas para estudiarlas in vitro. En los últimos años se han desarrollado sistemas de expresión fusionados como GST y etiquetamiento con histidina (His-tag por su abreviación en inglés) para facilitar la expresión de proteínas y simplificar la purificación de proteínas.


title: Dedo de cinc

text: Los sistemas de expresión His-tag son ampliamente usados debido a su bajo peso molecular y que no afectan la estructura de la proteína ni sus funciones. Esto significa que no es necesario separar el His-tag de la proteína buscada. Por otra parte, las proteínas fusionadas His-tag pueden ser fácilmente purificadas por una resina de afinidad Ni-NTA. En estudios recientes, los dedos de cinc han sido expresados, separados y purificados usando un sistema His-tag/Ni-NTA. A partir de los efectos del His-tag en las proteínas de dedos de cinc, se pueden evaluar sus propiedades y su estructura. Para esto se pueden usar técnicas de espectrometría como espectroscopía de absorción UV-Vis, espectroscopía de dicroísmo circular (CD), prueba de titulación de ion de Cinc, prueba de degeneración de urea y prueba de actividad de hidrolasa.


title: Dedo de cinc

text: Diversas estrategias se han desarrollado para el diseño de dedos de zinc Cys2His2 que se unan a las secuencias deseadas. Estas incluyen "ensamblaje modular" y estrategias de selección que emplean, ya sea expresión de fagos o sistemas de selección celular. Tales arreglos de dedos de zinc prediseñados pueden ser utilizado en numerosas aplicaciones, tales como factores de transcripción artificiales, metilasas de dedo de zinc, recombinasas de dedo de zinc y nucleasas con dedos de zinc. Factores de transcripción artificiales con matrices de dedos de cinc prediseñados se han utilizado en numerosos estudios científicos y se evalúa un factor de transcripción artificial que activa la expresión de VEGF en seres humanos. Las nucleasas de dedos de zinc se han convertido en reactivos útiles para la manipulación de los genomas de muchos organismos superiores incluyendo "Drosophila melanogaster", "Caenorhabditis elegans", tabaco, y diversos tipos de células de mamíferos, y pez cebra. Un ensayo clínico en curso es la evaluación de las nucleasas de dedos de zinc que interrumpen el gen CCR5 en células T CD4+ humanas como un posible tratamiento para el VIH/SIDA.


title: Dedo de cinc

text: El método más sencillo para generar nuevas matrices de dedos de cinc es combinando pequeños "módulos" de dedos de cinc de especificidad conocida. EL proceso de ensamblaje modular más común combina tres dedos de cinc de los cuales cada uno puede reconocer una secuencia de ADN de 3 pares de bases para generar una matriz de 3 dedos que tenga un sitio de reconocimiento de 9 pares de bases. Otros procedimientos pueden utilizar ya sea módulos de uno o dos dedos para generar matrices de dedos de cinc con seis o más dedos. El principal inconveniente con este procedimiento es que la especificidad de cada uno de los dedos de cinc puede superponerse y puede depender del contexto de los dedos de cinc circundantes y el ADN. Sin métodos para poder tener en cuenta esta "dependencia del contexto", el procedimiento estándar de ensamblaje modular a veces falla a menos que se use para reconocer secuencias de la forma (GNN).


title: Dedo de cinc

text: Numerosos métodos de selección se han utilizado para generar matrices de dedos de cinc capaces de apuntar a las secuencias deseadas. Los esfuerzos iniciales de selección se utilizaron para seleccionar proteínas de unión a ADN expresadas en fagos de un gran conjunto de arreglos de dedos de cinc aleatorios. Los esfuerzos más recientes han utilizado una sistemas de uno y dos híbridos de levadura, bacterias y células de mamífero. Un método aún más reciente para seleccionar los nuevos arreglos de dedos de cinc de bacterias utiliza un sistema de dos híbrido y ha sido denominado "OPEN" por sus creadores. Este sistema combina conjuntos preseleccionados de dedos de cinc individuales que fueron seleccionados para unirse a un triplete y, a continuación, se utiliza una segunda ronda de selección para obtener matrices de 3 dedos capaces de unirse a la secuencia de 9 pares de bases deseado. Este sistema fue desarrollado por el Zinc Finger Consortium como una alternativa a las fuentes comerciales de matrices de dedos de cinc prediseñados.


title: Dedo de cinc

text: Además de ser útiles en lectura, escritura y transcripción de ADN, existen hormonas que hoy usan dedos de zinc. Son estas las mismas hormonas que están fuertemente asociadas con la homeostasis de crecimiento de todo el organismo. Se listan en la siguiente tabla las conexiones de dichas hormonas con la homeostasis de otros elementos (M). Los dedos de cinc tienen también una posible aplicación clínica para la solución de enfermedades. La estrategia se basa en utilizar los dedos de cinc unidos a nucleasas (finger zinc nucleases, ZFN). De esa manera, este complejo introducido en la célula sería capaz de unirse al ADN en unas zonas específicas cercanas a la mutación gracias al reconocimiento de los dedos de cinc, y después las nucleasas actuarían cortando la doble hebra de ADN. Si ahora introducimos una cadena de ADN silvestre (sin la mutación), entonces por recombinación homóloga podríamos arreglar esa mutación. Las ventajas de esta estrategia son: no hay integración de ninguna secuencia (no estamos manipulando el genoma), se realiza una reparación de la secuencia del gen, la eficiencia es muy alta y además no requiere mantener la expresión de algún gen mucho tiempo. Como inconvenientes a esta estrategia encontramos que es probablemente solo válida para terapias ex-vivo, y que las nucleasas tienen alto poder inmunogénico, por lo que aún falta por demostrar su inocuidad.


title: Mano EF

text: La mano EF es un dominio estructural de proteínas de tipo hélice-bucle-hélice que se encuentra en una gran familia de proteínas de unión a calcio. Consta de dos hélices alfa situado aproximadamente perpendicular el uno al otro y unidos por un corto circuito región (por lo general alrededor de 12 aminoácidos) que normalmente se une a iones de calcio. El motivo toma su nombre de la nomenclatura tradicional utilizada para describir la proteína parvalbúmina, que contiene tres de estos motivos, y está probablemente involucrada en la relajación muscular a través de su actividad de unión a calcio.Las manos EF figuran también en cada dominio estructural de la calmodulina y las proteínas de señalización en la proteína muscular troponina-C.


title: Mano EF

text: El ion calcio está unido a ambas columnas de la proteína y por aminoácidos de las cadenas laterales, concretamente por los de los residuos de aminoácidos ácidos, aspartato y glutamato. Estos residuos están cargados negativamente y tendrán una interacción con los iones calcio de carga positiva. El motivo mano EF fue uno de los primeros motivos estructurales cuyos requerimientos de secuencia se analizaron en detalle. Cinco de los residuos del bucle se unen al calcio y por lo tanto tiene una marcada preferencia por las cadenas laterales que contienen oxígeno, especialmente aspartato y glutamato. El sexto de residuos en el bucle debe ser necesariamente una glicina debido a los requerimientos conformacionales de la columna. El resto de residuos son típicamente hidrofóbicos y forman un núcleo hidrofóbico que une y estabiliza las dos hélices.


title: Mano EF

text: En un bucle de una mano EF, el ion de calcio está coordinado en una configuración bipiramidal pentagonal. Los seis residuos que participan en la unión se encuentran en las posiciones 1, 3, 5, 7, 9 y 12; estos residuos se indican como X, Y, Z,-Y,-X y-Z. La Asp o Glu invariante en la posición 12 provee de dos oxígenos para enlazar con el calcio.


title: Mano EF

text: Las manos EF pueden dividirse en dos clases: las proteínas de señalización y proteínas de tampón/transporte. El primer grupo es el más grande e incluye a los más conocidos miembros de la familia como la calmodulina, troponina C y S100B. Estas proteínas suelen sufrir cambios conformacionales dependientes de calcio que exponen el sitio de unión. El último grupo está representado por la calbindina D9k y no cambia su conformación por calcio.


title: Peroxirredoxina

text: Las peroxirredoxinas (Prxs, ) son una ubicua familia de enzimas antioxidantes que controlan los niveles de peróxido inducido por citoquinas, y en consecuencia, median en la transducción de señales en células de mamíferos.


title: Peroxirredoxina

text: Las peroxirredoxinas pueden ser reguladas por cambios en la fosforilación, redox y posibles estados de oligomerización.


title: Peroxirredoxina

text: Se dividen en tres clases:Estas enzimas comparten el mismo mecanismo catalítico, en el que un sitio cisteína activa por redox (cisteína peroxidática), en el sitio activo es oxidada a ácido sulfénico por el peróxido sustrato. El reciclaje del ácido sulfénico de nuevo a un tiol es lo que diferencia a estas tres clases de enzimas, las 2-Cys peroxirredoxinas se reducen por tioles como el glutatión, mientras que las enzimas 1-Cys son reducidas por el ácido ascórbico.


title: Peroxirredoxina

text: Utilizando estructuras cristalinas, se ha podido detallar el ciclo catalítico típico para enzimas 2-Cys Prxs, incluyendo un modelo para el estado oligomérico propuesto regulado por redox, para el control de la actividad enzimática. La inactivación de estas enzimas por sobreoxidación del tiol activo a ácido sulfinico puede ser revertido por sulfirredoxina. La alquil hidroperóxido reductasa (AhpC) es una enzima bacteriana responsable de la reducción de hiperóxidos orgánicos directamente a su forma reducida de ditiol. El antioxidante específico de tiol (TSA) es un importante antioxidante que fisiológicamente constituye una defensa enzimática contra los radicales que contienen azufre. Esta familia contiene AhpC y la TSA, así como proteínas relacionadas.


title: Peroxirredoxina

text: Algunas de las proteínas de esta familia son los alérgenos. Las alergias son reacciones de hipersensibilidad del sistema inmunitario a determinadas sustancias llamadas alérgenos (como el polen, las picaduras, ciertos medicamentos o alimentos) que, en la mayoría de la gente, no presentan síntomas. Un sistema de nomenclatura se ha establecido para los antígenos (alérgenos) que causan alergias atópicas mediadas por IgE en seres humanos. Este sistema de nomenclatura se define por una designación que se compone de las tres primeras letras del género, un espacio, la primera letra del nombre de la especie; un espacio y un número árabe. En el caso de que dos especies tengan los mismos nombres de las denominaciones, se discrimina una de otra mediante la adición de una o más letras (de ser necesario) a cada una de las especies.


title: Peroxirredoxina

text: La importancia fisiológica de peroxirredoxinas se ver reflejada por su abundancia relativa (una de las proteínas más abundante en los eritrocitos después de la hemoglobina es la peroxirredoxina 1), así como en estudios de ratones knockout. Los ratones que carecen de peroxirredoxina 1 o 2 desarrollan anemia hemolítica severa, y están predispuestos a ciertos tipos de cáncer hematopoiéticos. Los ratones knockout para peroxirredoxina 1 tienen una reducción del 15% de su expectativa de vida. Ratones knockout para peroxirredoxina 6 son viables y no muestran una patología obvia, pero son más sensibles a determinadas fuentes exógenas de estrés oxidativo, como hiperóxido. Ratones knockout para peroxirredoxina 3 (de la matriz mitocondrial) son viables y no presentan ninguna patología observable. Las peroxirredoxinas 2-Cys de plantas son post-translacionalmente dirigidos a los cloroplastos, donde se encargan de la protección de la membrana fotosintética contra el daño fotooxidativo. La expresión de estos genes depende de señales fotosintéticas de los cloroplastos hacia el núcleo, tales como la disponibilidad del aceptor en el fotosistema I y ABA.


title: Xantina oxidasa

text: La xantina oxidasa es una molibdoflavoenzima distribuida en diversas especies, desde las bacterias hasta los seres humanos y algunos tejidos en mamíferos. Su enfoque de estudio se debe a su afinidad por producir especies reactivas de oxígeno, fenómeno implicado en varios estados patológicos. Esta enzima se encuentra en dos formas, la Xantina Deshidrogenasa NAD+-dependiente, que produce NADH y urato, la cual puede ser transformado en Xantina Oxidasa que es dependiente del oxígeno, la cual origina el anión radical superóxido (O) y peróxido de hidrógeno (HO) y urato.


title: Xantina oxidasa

text: Las siguientes reacciones químicas son catalizadas por la xantina oxidasa:


title: Xantina oxidasa

text: La estructura primaria de la XOR humana contiene una secuencia de 1335 residuos de aminoácidos y presenta 90 % de homología con otros mamíferos.  Por otro lado, la estructura tridimensional se logró obtener a partir de los resultados del análisis de la estructura cristalina de otras enzimas, que al igual que la XOR presentan un cofactor molibdeno, tal es el caso del monóxido de carbono deshidrogenasa (CODH) presente en la bacteria aerobia Oligotropha carboxidovorans, la cual sirve como modelo para la XO, debido a su parecido en la presencia de: el cofactor molibdopterina (Mo-co), 2 centros (Fe-S) y un grupo FAD cómo centros redox. El dominio N-terminal de la XOR contiene 8 residuos de cisteína fuertemente conservados, los cuales sirven como ligandos para unir los centros (Fe-S), cada unión está conformada por 4 cisteínas, en donde la más lejana al grupo N-terminal presenta un plegamiento distinto, característica que diferencia esta enzima de las demás.  Los centros Fe/S son llamados cómo Fe/S I y Fe/S II, con respecto a la distancia que los separa del grupo Mo-co. El centro Fe/S II se encuentra cerca de la superficie de la enzima, dicha distancia de la superficie le permite transferir electrones a su aceptor electrónico fisiológico, FAD, la distancia es de 8.7 A°. La estructura tridimensional de la XOR de leche bovina fue estudiada, encontrando que cada subunidad contiene 3 dominios y 2 segmentos peptídicos conectores, tales son:


title: Xantina oxidasa

text: Los potenciales REDOX de los diferentes centros garantizan que la transferencia electrónica sea termodinámicamente favorable, siendo el sentido de esta transferencia. Mo-co formula_1 Fe/S I formula_1 Fe/S II formula_1 FAD


title: Xantina oxidasa

text: Es una proteína compuesta por su porción apoproteica, que la conforman 2 cadenas polipeptídicas idénticas y 8 centros redox, es un homodímero de 300 Kd de peso molecular, cada subunidad tiene 4 centros redox, 1 molécula de molibdopterina tiene un átomo de molibdeno como cofactor, también tiene 2 centros ferro sulfurados (Fe-S) y contiene 1 molécula de dinucléotido de falvinadenina (FAD). Las dos formas de la enzima (XDH y XO) se pueden interconvertir con la excepción en las aves, ya que estás solo tienen la forma XDH.


title: Xantina oxidasa

text: El gen de la XOR humana (hXOR) está en el brazo corto del cromosoma 2, 2p22, y su estructura ha sido dilucidada. Presenta 36 exones y su estructura exón-intrón está altamente conservada respecto a otras especies como el ratón y difiere significativamente de la estructura del gen en especies menos relacionadas como la Drosofila, cuya estructura es más compacta con solo 4-5 exones. La secuencia del cDNA humano ha sido reportada.


title: Xantina oxidasa

text: Previamente se han mencionado dos formas de la Xantina, tales son la Xantina Deshidrogenasa y la Xantina Oxidasa, el mecanismo para pasar de una a otra se explican a continuación:


title: Xantina oxidasa

text: Conversión reversible. Mediante este proceso la oxidación de grupos sulfhidrilos forman puentes disulfuros intrasubunitarios los cuales permiten la conversión de XDH a XO, mientras que la reducción de estos enlaces opera en sentido contrario. Esta conversión se comprobó con la cromatografía en gel, ya que la formación de puentes disulfuro reduce el volumen hidrodinámico de la enzima y con la electroforesis en gel bidimensional de la XO digerida con quimiotripsina se demostró la presencia de una heterogeneidad conformacional, medida por puentes disulfuros.


title: Xantina oxidasa

text: Conversión irreversible. Para esta conversión se lleva a cabo la proteólisis de la XOR, ambas formas de la XOR experimentan proteólisis limitada por tripsina y quimiotripsina, la primera separa ambas formas de la enzima en la lisina 184 mientras que la segunda divide la XDH en metionina 181, pero la XO la divide en metionina 181 y fenilalanina 560. La proteólisis quimiotríptica previene la conversión reductiva de XO en XDH. Además, los residuos de metionina 181 y lisina 184 están incluidos en un fragmento peptídico hidrofílico expuesto al solvente en ambas formas de la XOR. En contraste, la phe560 pertenece a una región hidrofóbica, por lo que ha sido hipotetizado que tenga poco acceso al solvente en condiciones fisiológicas, y por tanto, baja probabilidad de ser escindida por la quimiotripsina. La observación de que este sitio comienza a ser accesible a la quimiotripsina solamente luego de la conversión de XDH en XO, sugiere que la formación de puentes disulfuros produce cambios conformacionales dentro de la región que contiene a la phe560. Durante la conversión de XDH a XO, los principales cambios involucran al sitio de unión y el FAD, el cual tiene dos efectos importantes en cuanto al uso del oxígeno molecular cómo agente oxidante para la XO, los pasos se describen a continuación: A pesar de estos 2 efectos, el resto de la región del sitio de unión al FAD donde puede unirse el O2 es poco afectada por estos cambios.


title: Xantina oxidasa

text: La principal función de esta metaloenzima es hidroxilar una serie de sustratos, tales como hipoxantina, la cual pasa a xantina y esta a su vez en ácido úrico. Los demás productos serán dinucleótido de nicotinaminadenina reducido (NADH.H+) o (O) y/o (HO) según haya actuado el NAD+ o el (O) como agente reductor para la enzima respectivamente. Gracias a su capacidad generadora de especies reactiva se centra el interés en esta metaloenzima. También hidroxila otros sustratos como N-heterociclos y aldehídos. Ambas formas de la enzima pueden reducir el (O) pero, la unión del NAD+ a la XDH inhibe la unión del (O). Otra función de la xantina es que pueda fungir como una NADH oxidasa, la cual es capaz de donar sus electrones directamente al FAD. Se ha demostrado la capacidad de la enzima para catalizar la reducción de nitratos a nitritos, y de nitritos a óxido nítrico (NO). En estos casos, los nitratos son reducidos por el cofactor de molibdeno, mientras que nitritos son reducidos por el FAD. Liberación del hierro de la ferritina, que puede ocurrir por 2 mecanismos.


title: Xantina oxidasa

text: Xantina Deshidrogenasa: representa 80 % de la XOR funcional in vivo. Xantina Oxidasa: constituye el 20 % restante de la XOR funcional normalmente.


title: Xantina oxidasa

text: El 60 % de la XOR purificada de leche bovina se encuentra en forma inactiva y existe en 2 formas: Demolibdo: Carece de molibdeno, posiblemente de la molécula de molibdopteria y comúnmente constituye el 40 % de la enzima inactiva. Desulfo: Constituye del 30 % al 40 % restante de la enzima que contiene molibdeno.


title: Xantina oxidasa

text: En los mamíferos las mayores concentraciones de estas enzimas se encuentran en el hígado e intestino, sin embargo, hay una variación considerable interespecie que nos indica un amplio rango encontrado en sangre y corazón. Diversos autores usaron técnicas inmunológicas usando anticuerpos anti-XOR, con las cuales se ha detectado XO humana en hepatocitos, sobre todo en región periportal, y las células de Kuffer en el hígado; enterocitos y células globet de yeyuno; glándulas mamarias; células endoteliales de músculo esquelético y riñón; macrófagos y células cebadas; y células epiteliales del tracto biliar, siendo este un indicativo de secreción de XOR hacia la bilis. Estudios de células endoteliales humanas en cultivo, usando anticuerpo anti-XOR de leche humana policlonal fluorescente purificado, mostraron que la enzima se encuentra ubicada tanto en el citosol como en la superficie externa de membrana celular, con predominio en las regiones de contacto intercelular en esta última localización. Se ha sugerido, a partir del uso de anticuerpo monoclonal de ratón en células endoteliales y epiteliales humanas, la localización intravesicular de la XOR intracelularmente, lo cual se ha planteado que pudiera constituir una etapa de almacenamiento previo a su secreción.


title: Xantina oxidasa

text: El sitio activo de la xantina oxidasa está compuesto por una unidad de molibdopterina con el átomo de molibdeno también en coordinación con el oxígeno terminal, átomos de azufre y un hidróxido terminal. En la reacción con xantina para formar ácido úrico, un átomo de oxígeno es transferido del molibdeno a la xantina. La reformación del centro activo de molibdeno ocurre por la adición de agua. Al igual que otras oxidoreductasas conteniendo molibdeno, el átomo de oxígeno introducido al substrato por la xantina oxidasa se origina del agua en lugar del dioxígeno (O).


title: Xantina oxidasa

text: En humanos, la xantina oxidasa es encontrada normalmente en el hígado y no libre en la sangre. Durante un daño severo al hígado, la xantina oxidasa es liberada a la sangre, por lo cual un ensayo para xantina oxidasa en sangre es una forma de determinar si ha ocurrido daño hepático.


title: Xantina oxidasa

text: Debido a que la xantina oxidasa es una ruta metabólica para la formación de ácido úrico, el inhibidor de xantina oxidasa, alopurinol es utilizado en el tratamiento de la gota. Como la xantina oxidasa está involucrada en el metabolismo de la 6-mercaptopurina, se deben tomar recaudos antes de administrar alopurinol en conjunto con 6-mercaptopurina, o su prodroga azatioprina.


title: Xantina oxidasa

text: La xantinuria es una enfermedad genética poco común, donde la ausencia de xantina oxidasa lleva a una elevada concentración de xantina en sangre y puede provocar problemas de salud tales como una falla renal. No existe un tratamiento específico para este desorden, a los enfermos se le indica evitar los alimentos ricos en purinas y mantener una alta ingesta de líquidos.


title: Xantina oxidasa

text: Se ha propuesto la inhibición de xantina oxidasa como un mecanismo para mejorar la salud cardiovascular y los síntomas ligados al síndrome de Lesch Nyhan.


title: Xantina oxidasa

text: Dentro de los inhibidores de la xantina oxidasa se encuentra el alopurinol, oxipurinol, y ácido pítico. Más recientemente, en 2008, se inició la comercialización de un inhibidor de la xantina oxidasa más eficaz en cuanto a reducción del ácido úrico, el febuxostat.


title: Especies reactivas del nitrógeno

text: Las especies reactivas del nitrógeno son una familia de moléculas antimicrobianas derivadas del óxido nítrico (NO·) producido por la actividad enzimática de la óxido nítrico sintasa 2 (NOS2). NOS2 es expresada principalmente en macrófagos luego de la inducción por citoquinas y productos microbianos, particularmente interferón-gamma (IFN-γ) lipopolisacáridos (LPS).


title: Especies reactivas del nitrógeno

text: Son producidas en animales a través de la reacción del óxido nítrico (NO·) con superóxido (O) para formar peroxinitrito (ONOO).


title: Especies reactivas del nitrógeno

text: Actúan en conjunto con las especies reactivas del oxígeno en el daño celular, provocando estrés nitrosativo.


title: Especies reactivas del nitrógeno

text: Las especies reactivas del nitrógeno también son producidas de forma continua por las plantas como subproductos del metabolismo aeróbico o en respuesta al estrés.


title: Nitrotirosina

text: La nitrotirosina es un producto de la nitración de tirosina mediado por especies reactivas del nitrógeno tales como el anión peroxinitrito y dióxido de nitrógeno. Es detectado en algunas condiciones patológicas y es considerado como un marcador del estrés oxidativo dependiente de NO. La nitrotirosina es encontrada en algunos tejidos afectados por algunas afecciones, como por ejemplo en la córnea en queratocono.


title: Peroxinitrito

text: El peroxinitrito es un anión de fórmula ONOO. Es un isómero de valencia inestable del nitrato, NO, el cual posee idéntica fórmula pero una estructura diferente. Aunque el ácido peroxinitroso es altamente reactivo, su base conjugada, el peroxinitrito es estable en una solución básica. Es preparado por la reacción del peróxido de hidrógeno con nitrito:


title: Peroxinitrito

text: El peroxinitrito es un agente oxidante y nitrante. Debido a sus propiedades oxidantes, el peroxinitrito puede dañar una gran variedad de moléculas en las células, incluyendo el ADN y las proteínas. La formación de peroxinitrito "in vivo" ha sido asociado a la reacción del radical libre superóxido con el radical libre óxido nítrico:


title: Peroxinitrito

text: El emparejamiento resultante de estos dos radicales libres resultan en peroxinitrito, una molécula que en sí misma no es un radical libre, pero que es un poderoso oxidante.


title: Peroxinitrito

text: En el laboratorio, una solución de peroxinitrito puede ser preparada tratando peróxido de hidrógeno acidificado con una solución de nitrito de sodio, seguida de una rápida adición de NaOH. Su concentración es indicada por la absorbancia a 302 nm (pH 12, λ = 1670 M cm).


title: Peroxinitrito

text: ONOO reacciona como nucleófilo con el dióxido de carbono. "In vivo", la concentración de dióxido de carbono es de aproximadamente 1 mM, y su reacción con ONOO ocurre rápidamente. Aunque, bajo condiciones fisiológicas, la reacción de ONOO con dióxido de carbono para formar nitrosoperoxicarbonato (ONOOCO) es por lejos la ruta predominante para el ONOO. ONOOCO se homoliza para formar carbonato radical y dióxido de nitrógeno, de nuevo como un par de radicales. Aproximadamente el 66% del tiempo, estos dos radicales se recombinan para formar dióxido de carbono y nitrato. El restante 33% del tiempo, estos dos radicales escapan la caja de solvente y se transforman en radicales libres. Son estos dos radicales, los que se piensa que provocan daño celular relacionado con el peroxinitrito.


title: Peroxidación lipídica

text: La peroxidación lipídica o lipoperoxidación hace referencia a la degradación oxidativa de los lípidos. Es el proceso a través del cual los radicales libres capturan electrones de los lípidos en las membranas celulares. Este proceso es iniciado por un mecanismo de reacción en cadena de un radical libre. En la mayoría de los casos afecta los ácidos grasos poliinsaturados, debido a que contienen múltiples dobles enlaces entre los cuales se encuentran los grupos metileno (-CH-) que poseen hidrógenos particularmente reactivos. Al igual que cualquier reacción con radicales, esta se modela en tres pasos fundamentales: iniciación, propagación y terminación.


title: Peroxidación lipídica

text: La iniciación es el paso en donde el radical de ácido graso es producido. Los iniciadores en células vivas más notables son especies reactivas del oxígeno, tales como OH·, el cual combina con un hidrógeno para dar lugar a agua y a un ácido graso radical.


title: Peroxidación lipídica

text: El ácido graso radical no es una molécula muy estable, de modo que reacciona rápidamente con oxígeno molecular, creando de este modo un ácido graso peroxil radical. El mismo también es una especie muy inestable por lo cual reacciona con otro ácido graso dando lugar a un ácido graso radical diferente y a un peróxido lípido o un peróxido cíclico si ha reaccionado consigo mismo. Este ciclo continúa ya que el nuevo ácido graso radical se comporta de la misma manera.


title: Peroxidación lipídica

text: Cuando un radical reacciona, siempre produce otro radical, es por ello que se trata de un mecanismo de reacción en cadena. La reacción radical se detendrá cuando dos radicales reaccionan y producen una especie no radical. Esto ocurre solamente cuando la concentración de especies radicales es lo suficientemente alta como para que exista la probabilidad de que se encuentren dos radicales. Los organismos han evolucionado diferentes moléculas que aceleran el proceso de terminación atrapando radicales libres, protegiendo de esta manera la membrana celular. Uno de estos importantes antioxidantes es la vitamina E. Otros antioxidantes de importancia incluyen las enzimas superóxido dismutasa, catalasa y peroxidasa.


title: Peroxidación lipídica

text: Si la reacción no es terminada con rapidez, habrá daño en la membrana celular, que consiste principalmente de lípidos. De esta manera la fototerapia puede provocar la hemólisis rompiendo la membrana de los eritrocitos.


title: Peroxidación lipídica

text: Además, los productos finales de la peroxidación lipídica pueden ser mutagénicos y carcinogénicos. Por ejemplo el producto final malondialdehído reacciona con la deoxiadenosina y la deoxiguanosina del ADN, formando aductos de ADN, principalmente MG.


title: Peroxidación lipídica

text: Ciertos ensayos diagnóstico están disponibles para la cuantificación de productos finales de la peroxidación lipídica, específicamente el malondialdehído (MDA). El ensayo más comúnmente utilizado es llamado TBARS.


title: Vicepresidente de la República de China

text: El Vicepresidente de la República de China (chino tradicional: 中華民國副總統; chino simplificado: 中华民国副总统; Tongyong Pinyin: JhōngHuáMínGuó FùJǒngTǒng; Hanyu Pinyin: Zhōnghuámínguó Fùzǒngtǒng; Wade-Giles: Chung-Hua Min-Kuo Fu Tsung-T'ung) es el segundo oficial ejecutivo de mayor rango en la República de China. El cargo es llamado de manera informal como Vicepresidente de Taiwán (台灣副總統).


title: Primer ministro de la República de China

text: El presidente del Yuan Ejecutivo (chino tradicional: 行政院長; pinyin: Xíng Zhèng Yuàn Zhǎng; Wade-Giles: Hsing Cheng Yüan Chang), conocido informalmente como presidente del Gobierno de la República de China, o también primer ministro de la República de China, es el jefe del Yuan Ejecutivo, el poder ejecutivo de la República de China, que administra las islas de Taiwán, Penghu, Kinmen y Matsu. El jefe de Gobierno es nombrado por el presidente de la República de China sin la aprobación de la Yuan Legislativo.


text: Anterior al establecimiento del Yuan Ejecutivo en 1928, el primer ministro era conocido como primer ministro del Gabinete en 1912. A partir de 1914 pasó a llamársele secretario de Estado y, a partir de 1916, presidente del Consejo de Estado en el Gobierno de Beiyang. En 1928, el gobierno del Kuomintang estableció el Ejecutivo Yuan y Tan Yankai fue nombrado primer presidente del mismo.


text: Nota: El gobierno imperial de la dinastía Qing creó el "Gabinete de la Familia Imperial" en mayo de 1911. Tras el Levantamiento de Wuchang en octubre del mismo año provocó la abolición del Gabinete en noviembre y el nombramiento de Yuan Shikai como jefe del Gobierno. Poco después, en marzo de 1912, el Gobierno imperial colapsó.


title: Feng Guozhang

text: Féng Guózhāng (chino tradicional: 馮國璋; chino simplificado: 冯国璋; Wade-Giles: Feng Kuo-chang; nombre de cortesía: Huafu 華甫 o 華符; Hejian, Hebei, 7 de enero de 1859-Pekín, 12 de diciembre de 1919) fue un militar chino, general del Ejército de Beiyang, miembro de la camarilla de Beiyang y político en los primeros años de la República de China. Fundó el bando Zhili, destacada camarilla político-militar de comienzos de la época de los caudillos militares, opuesta a la rival de Anhui.


title: Feng Guozhang

text: Gobernador militar de Zhili entre 1912 y 1913 y de Jiangsu entre 1913 y 1917, fungió como vicepresidente entre 1916 y 1917 tras la muerte de Yuan Shikai y más tarde como presidente en funciones (1917-1918).


title: Feng Guozhang

text: Fue el menor de una familia campesina de cuatro hermanos; aunque todos recibieron instrucción en los clásicos, la familia no pudo costear la educación de Feng ya que había vendido todas su propiedades para sufragar a sus hermanos mayores. Tuvo que ponerse a trabajar en diversos oficios y abandonó una academia en la que había ingresado por falta de dinero. Con 27 años marchó a Taku, donde un tío abuelo trabajaba en las oficinas de un batallón del Ejército de Anhui; Feng logró ingresar en la misma unidad, como ordenanza de su comandante. Este le recomendó a Li Hongzhang como alumno para la nueva Academia Militar de Beiyang que Li acababa de fundar en 1885. Buen alumno, solicitó una excedencia temporal para presentarse a un examen en el funcionariado imperial, que aprobó, aunque suspendió el siguiente; ese mismo año, 1888, volvió a la academia, de donde se licenció en 1890. Otros destacados caudillos militares del periodo republicano también cursaron estudios en la Academia Militar de Beiyang. Permaneció un año como instructor en la academia antes de partir a Port Arthur en 1891 desde donde realizó diversos viajes por Manchuria que fueron de utilidad al Ejército años más tarde en la guerra contra Japón.


title: Feng Guozhang

text: En 1895 se le nombró agregado militar del nuevo embajador en Japón, donde conoció a destacados militares nipones y se familiarizó con las medidas modernizadoras del Ejército japonés. En el Nuevo Ejército formado por Yuan Shikai por encargo imperial, Feng ocupó la oficina de instrucción de la Academia de Hsiaochan, gracias a la buen impresión que Yuan recibió de las observaciones de Feng sobre el sistema militar japonés. Acompañó a Yuan a Shandong en 1899 cuando este fue nombrado gobernador de la provincia y participó en las operaciones contra los boxers. Pronto uno de los principales colaboradores de Yuan, este le asignó el departamento de instrucción y adiestramiento de la Academia Militar de Baoding, que Yuan fundó tras recibir el Gobierno de la provincia de Zhili en 1901. Durante la primera década del siglo XX, tuvo un papel destacado en los intentos del Imperio por reformar sus fuerzas armadas; en 1903 pasó a encabezar la sección de instrucción de una nueva comisión para la reorganización del Ejército, y era responsable de la centralización de la administración militar, la unificación del adiestramiento y la extensión de esta a las provincias que carecían de ella. En 1905 visitó Japón para observar unas maniobras militares que sirvieron de modelo para las del Ejército de Beiyang. En 1907 ingresó en el organismo que dos años más tarde se convertiría en el Estado Mayor chino. A pesar de la caída en desgracia temporal de Yuan Shikai en 1909, Feng siguió siendo fiel a su antiguo superior, en contra de la política imperial de favorecer mandos manchúes en el Imperio.


title: Feng Guozhang

text: Al mando de uno de los dos ejércitos —el 2º ejército— que el Gobierno envió para aplastar las revueltas de 1911, facilitó las maniobras que permitieron a Yuan forzar la abdicación que puso fin a la monarquía en China y convertirse en presidente de la nueva república. Durante los combates, la corte le otorgó el título de barón de segunda clase por su captura de Hanyang el 27 de noviembre de 1911, a pesar de que en realidad seguía las directrices de Yuan sobre cuándo combatir y cuándo negociar con los rebeldes. A finales de año, entregó el mando de sus fuerzas a Duan Qirui y regresó a Pekín. Gracias a sus anteriores contactos con oficiales manchúes, tuvo un destacado papel en la aceptación por parte de estos de la abdicación del último emperador de la dinastía. Comenzó entonces a mandar el Ejército de Guardias, que se convirtió en la base de su poder. Presidió la junta militar de la oficina presidencial una vez que Yuan asumió la presidencia de la nueva república.


title: Feng Guozhang

text: En diciembre de 1911, se le nombró vicegobernador militar de Chahar. Tras fungir como gobernador de la provincia de Zhili (desde septiembre de 1913), fue gobernador de la de Jiangsu entre diciembre de 1913 y 1917, ya en el periodo republicano. Durante la Segunda Revolución, dirigió uno de los dos ejércitos enviados por Yuan contra los rebeldes que actuó en el bajo Yangzi. Tras un asedio de cincuenta días, capturó Nankín, importante centro del Guomindang, el 1 de septiembre de 1913. Convertido para entonces en uno de los principales lugartenientes de Yuan Shikai, su nombramiento como gobernador de la rica Jiangsu le proporcionó cierta autonomía frente a su antiguo mentor. Los intentos de Yuan de reforzar su control de las provincias aumentó las tensiones entre sus él y sus subordinados, incluido Feng.


title: Feng Guozhang

text: Feng rompió relaciones con Yuan Shikai en 1915 cuando este último se proclamó emperador. Feng había acudido a la capital en junio de 1915 para confirmar los rumores sobre los planes monárquicos de Yuan y este los había negado; las posteriores maniobras a favor de la restauración enemistaron a Feng con el presidente. De sus antiguos colaboradores, fue el que más claramente se opuso a los intentos de Yuan de convertirse en emperador. Yuan quiso nombrar a Feng duque, llamándolo a la capital para sustituirle por un oficial más leal a su persona, pero este declinó. Entonces Yuan ordenó a un almirante que asesinara a Feng, pero el almirante fue descubierto y asesinado a su vez. Feng se mantuvo en Nankín, donde comandaba las tropas que controlaban el Yanzi, uniéndose a la oposición anti-Yuan, aunque al principio no abiertamente. Cuando estalló la revuelta en contra de Yuan en Yunnan en diciembre de 1915, Feng no apoyó a Yuan. A comienzos de 1916, Yuan nombró a Feng jefe del Estado Mayor y comandante de las fuerzas que debían aplastar la rebelión y le llamó a Pekín, pero Feng no acudió, excusándose por enfermedad. En marzo comenzó a coaligarse con otros militares de Beiyang para oponerse a la restauración; la extensión de la rebelión hizo que Feng se mostrase cada vez más abiertamente opuesto a Yuan, aunque su posición pública siguió siendo ambigua. Durante la primavera, trató de asegurarse la sucesión de la presidencia y de formar un nuevo centro de poder en torno suyo. En mayo presidió una conferencia que acabó recomendando, a pesar de la oposición de algunos militares, la dimisión de Yuan.


title: Feng Guozhang

text: Su clara ambición por el puesto produjo hostilidad entre algunos militares y el nombramiento del vicepresidente Li Yuanhong como presidente y la instalación de Duan Qirui como figura central del Gobierno de Pekín frustraron sus aspiraciones. Mantuvo, sin embargo, su gran poder con centro en Nankín y su destacado puesto como uno de los principales caudillos militares de la camarilla de Beiyang.


title: Feng Guozhang

text: Posteriormente fungió como vicepresidente durante la presidencia de Li Yuanhong (20 de octubre de 1916-1917), aunque permaneció en Nankín, ya que el puesto carecía de poder real. La oposición de Duan deseaba que se convirtiese en su contrapeso en el Gobierno. Feng medió entre Duan y el presidente Li a propósito de la disputa de ambos por la entrada del país en la Primera Guerra Mundial a comienzos de 1917. Logró una reconciliación temporal y se mostró típicamente ambiguo sobre la cuestión que les enfrentaba.


title: Feng Guozhang

text: Durante la ocupación de Pekín por Zhang Xun en julio de 1917, Feng fue nombrado presidente en funciones, posición que mantuvo cuando Li renunció formalmente. Solo aceptó el cargo cuando se aseguró que tres de sus partidarios continuarían controlando otras tantas provincias a los largo del Yangzi. Feng seguía mandando personalmente dos divisiones, la 15ª que le acompañó como guardia presidencial a Pekín, y la 16ª, que permaneció en Nankín.


title: Feng Guozhang

text: Asumió el cargo de Presidente de la República de China el 1 de agosto de 1917, pero solo después de asegurarse de que sus partidarios seguirían controlando las provincias del Yangzi que eran la base de su poder: Jiangsu, Jiangxi y Hubei. Su legitimidad fue puesta en duda cuando la Asamblea Nacional no quiso reconocerlo. El 14 de agosto, China decidió participar en la Primera Guerra Mundial de parte de los Aliados luego de la creciente evidencia que el Imperio alemán estaba apoyando el golpe de Zhang así como por la creciente presión del primer ministro Duan Qirui. Envió 135 000 soldados a batallones laborales al frente occidental, Mesopotamia y al África Oriental Alemana. También envió tropas a Rusia a asistir en la Intervención Aliada.


title: Feng Guozhang

text: Sun Yat Sen estableció un Gobierno rival en Cantón en septiembre de 1917 y declaró la guerra poco después ese mismo mes, en un intento fallido de obtener reconocimiento internacional. Feng quiso resolver de manera pacífica el conflicto entre el norte y el sur lo que produjo la renuncia de Duan como protesta tras los reveses militares sufridos ante los rebeldes en noviembre de 1917. Feng consideraba que la reunificación militar de las provincias rebeldes del sur solo beneficiaría a Duan, que aumentaría su poder. Debido a la presión del bando Anhui y de Zhang Zuolin y otros militares, debió nombrar nuevamente a Duan presidente del Gobierno en marzo de 1918. La política de aplastamiento militar de la rebelión favorecida por Duan fracasó con las derrotas de noviembre de 1917, pero Feng tampoco logró la reunificación por medio de las negociaciones entre ese mes y marzo de 1918 ante la falta de respaldo de los militares del norte. A pesar de su incapacidad para atraer seguidores e inspirar lealtad hacia su persona, en 1917 Feng ya se había convertido en un serio rival para Duan. La rivalidad entre ambos acabó con la cohesión de la camarilla de Beiyang, que se dividió en dos, la camarilla de Anhui formada por los partidarios de Duan y la Zhili, por los de Feng. A diferencia de su colega y rival Duan Qirui, no tenía facilidad para hacerse con seguidores y partidarios. Sus alianzas eran efímeras y basadas en el interés mutuo.


title: Feng Guozhang

text: Feng finalizó su mandato presidencial de cinco años el 10 de octubre y dimitió junto con Duan; murió en Pekín al año siguiente por neumonía. Mientras que Duan se aseguró un puesto de poder al mando del Ejército de Participación en la Guerra formado gracias a los préstamos japoneses con el objetivo teórico de crear una fuerza capaz de participar en la Primera Guerra Mundial, Feng tras el fin de su mandato perdió su base de poder. Los opositores a Duan siguieron considerándole, no obstante, la cabeza de la nueva camarilla de Zhili, provincia natal de Feng. La reelección de Feng era imposible por el control que Duan tenía del Parlamento. En agosto se vio obligado a otorgar su apoyo al candidato de compromiso de Duan, Xu Shichang, un prestigioso funcionario, antiguo colaborador de Yuan Shikai. Cao Kun, ya alejado de Duan, le sucedió al frente de la camarilla de Zhili.


title: Xu Shichang

text: Xu Shichang (chino: 徐世昌; pinyin: Xú Shìchāng; Wade-Giles: Hsü Shih-ch'ang; nombre de cortesía: Ju-ren, 菊人) (20 de octubre de 1855-5 de junio de 1939) fue presidente de la República de China (del Gobierno de Pekín) desde el 10 de octubre de 1918 al 2 de junio de 1922.


title: Xu Shichang

text: Nació en Tianjin, provincia de Zhili, y fue amigo íntimo de Yuan Shikai.


title: Xu Shichang

text: Durante la monarquía fue gobernador de Manchuria, ministro de correos y comunicaciones, ministro de la junta de gobierno o gran consejero y, al final de la dinastía Qing, fue nombrado jefe del Estado Mayor a pesar de ser un civil. En 1886, alcanzó el más alto rango del funcionariado imperial.


title: Xu Shichang

text: En 1914 fue nombrado Secretario de Estado (presidente del Gobierno) pero renunció en 1915 como protesta a las ambiciones imperiales de Yuan. Retornó al puesto luego de la renuncia de Yuan a la monarquía.


title: Xu Shichang

text: Se retira más tarde a Tianjin.


title: Xu Shichang

text: Su elección a la presidencia en 1918 fue impulsada por Duan Qirui y su bando Anhui, al ver Duan sus posibilidades de alcanzar la presidencia anuladas por su fracaso en recuperar por la fuerza las provincias rebeldes del sur. Fue elegido por ser civil (y no contar así con una fuerza militar propia), prestigioso funcionario, ser el colaborador cercano de Yuan Shikai más importante aún con vida y cercano al Ejército de Beiyang y porque era neutral entre los bandos Anhui y Zhili, rivales. Se le consideraba además un candidato aceptable para las provincias rebeldes del sur. Duan se ofreció a abandonar el gobierno a la vez que Feng Guozhang (dirigente de la camarilla de Zhili), si este respaldaba a Xu, cosa que este hizo el .


title: Xu Shichang

text: Aceptó la presidencia con el objetivo de lograr la reunificación entre las camarillas del norte y entre los gobiernos del norte y del sur. En octubre logró la elección, pero la vicepresidencia quedó vacante. Ya en su discurso de toma de posesión indicó su intención de tratar de lograr la reunificación nacional. A los pocos días ofreció a los dirigentes del sur comenzar las conversaciones de paz, tratando a la vez de lograr el apoyo de los caudillos militares del norte hostiles a las negociaciones con el sur. Tras una oposición inicial el fin de la Primera Guerra Mundial (que hacía necesaria una rápida reunificación para presentarse como un país fuerte en las negociaciones de paz de París) y la popularidad de la iniciativa del presidente, hicieron que los militares abandonasen aparentemente su oposición al trato con el gobierno rebelde de Cantón. El parlamento, dominado por la camarilla de Anhui de Duan Qirui, favorable a la solución militar del conflicto, también trató de estorbar la acción de Xu.


title: Xu Shichang

text: En diciembre, el respaldo internacional y el anuncio de Japón del cese de los préstamos (que alimentaban a la camarilla de Anhui), reforzó la postura del presidente y acalló la oposición a su decisión de negociar con el sur. A la vez, Xu pudo nombrar un nuevo gabinete más afín a su persona y menos controlado por Duan.


title: Xu Shichang

text: Las conversaciones entre los dos gobiernos chinos comenzaron formalmente el , tras numerosos tanteos y negociaciones extraoficiales que confirmaron la posibilidad de un acuerdo entre las parte. El día 13 el presidente de la delegación septentrional informaba al primer ministro de los grandes avances de las negociaciones quedando como cuestión principal de desacuerdo la situación del parlamento. El gobierno y el presidente estaban dispuestos a disolver el parlamento del norte elegido en 1918 si el sur insistía en ello, pero este, dominado por Duan, no estaba dispuesto a aceptar un acuerdo sobre esa base. Por su parte, los parlamentarios del sur elegidos en 1919 para sustituir a aquellos del parlamento de 1917 que no se habían trasladado a Cantón tampoco admitían su destitución. Ante esta postura de los dos parlamentos las conversaciones fracasaron en mayo.


title: Xu Shichang

text: El fracaso de las negociaciones de reunificación supuso un gran golpe para el prestigio de Xu, que se convirtió de un plumazo en una mera figura sin poder real en la política nacional ante su incapacidad para reconstruir la unidad nacional. Su desprestigio definitivo se debió a su gestión del Movimiento del Cuatro de Mayo.


title: Xu Shichang

text: Realizó una masiva celebración en Pekín tras la victoria china en la Primera Guerra Mundial el 18 de noviembre de 1918. Envió tropas a la Intervención Aliada en la Guerra Civil Rusa.