پامیری‌ها عمدتاً پیرو شاخه نزاری مذهب اسماعیلیه و پیرو آقاخان هستند. بنیاد آقاخان مهم‌ترین سازمان مردم‌نهاد در کوهستان بدخشان است. همچنین 
گزینه‌ها:
از تاکید یک جانبه برخی مسلمانان بر تعلقات گروهی و در نتیجه نفی برخی آزادی ها سرچشمه می گیرد.
اقلیتی از پامیری‌ها با گویش یزغلامی پیرو مذهب سنی‌اند.
پیرو مذهب امام شافعى بوده- و سپس از ابو حنیفه تأثیر گرفته است.
امروزه محدود به جوامع زرتشتی شده اما درگذشته به خوبی میان مسلمانان ساکن ایران به ویژه سلاطین و طبقه مرفه رایج بوده‌است.
جملهٔ کامل: پامیری‌ها عمدتاً پیرو شاخه نزاری مذهب اسماعیلیه و پیرو آقاخان هستند. بنیاد آقاخان مهم‌ترین سازمان مردم‌نهاد در کوهستان بدخشان است. همچنین اقلیتی از پامیری‌ها با گویش یزغلامی پیرو مذهب سنی‌اند.