به طور کلی متخصص داخلی مترونیدازول را برای درمان عفونت‌های انگلی دستگاه گوارش از جمله عفونت‌های ژیاردیا در روده‌ی کوچک، انواع آمیبیازیس (روده‌ای و خارج روده‌ای) تجویز می کند. همچنین 
گزینه‌ها:
از قرص میزوپروستال برای کاهش خط ابتلا به بیماری زخم معده هم استفاده می‌شود.
برخی از دندانپزشکان، استفاده مناسب از مسواک، نخ دندان و دهانشویه ضد باکتری را جهت درمان بیماری های لثه توصیه می کنند.
انگل وارد جریان خون شده و به اندام‌های داخلی مختلفی مانند کبد، قلب، ریه‌ها و مغز می‌رود و باعث آبسه، عفونت، بیماری شدید و حتی مرگ شود.
مترونیدازول به تنهایی یا در ترکیب با آنتی بیوتیک‌های دیگر در درمان آبسه‌ ناشی از باکتری‌های بی هوازی استفاده می‌شود.
جملهٔ کامل: به طور کلی متخصص داخلی مترونیدازول را برای درمان عفونت‌های انگلی دستگاه گوارش از جمله عفونت‌های ژیاردیا در روده‌ی کوچک، انواع آمیبیازیس (روده‌ای و خارج روده‌ای) تجویز می کند. همچنین مترونیدازول به تنهایی یا در ترکیب با آنتی بیوتیک‌های دیگر در درمان آبسه‌ ناشی از باکتری‌های بی هوازی استفاده می‌شود.