Newsgroup: it.politica
Titolo: [OT] Quanti Bytes servono per memorizzare una traccia genetica del DNA?

Cosï¿œ giusto per curiositï¿œ ...
Qualcuno di voi ... lo sa?

 Qualcuno di voi ... lo sa?
 
Dipende dal dna. Piu' o meno da qualche decina di Mb a oltre 300Mb.
 
 

 Dipende dal dna. Piu' o meno da qualche decina di Mb a oltre 300Mb.
 
Io ero a conoscenza di un limite piu' alto, attorno ai 750 Mb.
Comunque sia, l'ordine di grandezza e' giusto.
Per qualche info piu' dettagliata, in questa pagina c'e' la 
dimostazione del teorema di Shannon applicata al dna.
http://www.pandasthumb.org/archives/2004/05/shannon-entropy.html
 
 

 
http://www.pandasthumb.org/archives/2004/05/shannon-entropy.html
 
 
Sono stato sul generale perche' geppo non ha specificato se
intendesse genoma umano o meno.
 
Inoltre dipende anche dall'uso. Quanti byte occorrono per
una foto? Dipende anche ad esempio dal tipo di formato.
 
In base all'utilizzo si puo' pensare ad algoritmi di
compressione.
 
 

x05:
 
Dimenticavo:
 
www.ias.ac.in/pubs/splpubs/pjubileebook/231.pdf
 
 
 


Hai ragione... intendevo umano...
Grazie della risposta...
Diciamo che ï¿œ una quantitï¿œ veramente notevole!
Interessante sarebbe studiare gli algoritmi di ricerca e i loro metodi 
di indicizzazione ad albero...
Con cosï¿œ tante info ... immagino come siano stati ottimizzati!
 

 
www.ias.ac.in/pubs/splpubs/pjubileebook/231.pdf
 
 
Grazie, me lo leggo in pausa pranzo.
 

 ottimizzati!
 
In ambito forense ad esempio (Dna finger-printing) si
comparano parti ben specifiche di dna.
 
Sarebbe scomodo archiaviare e confrontare intere mappature
oltre a computer e tempi fuori portata.
 
 

 
 
"Geppo il Folle"  ha scritto nel messaggio 
news:kd0l1g$mfn$1...@dont-email.me...
 
Così giusto per curiosità ...
Qualcuno di voi ... lo sa?
 
**+
 
IO QUANDO PROGRAMMAVO PER IL C64 ERO PASSATIO DIRETTAMENTE DAL BASIC AL 
LINGUAGGIO MACCHINA PURO E IN QUESTE SETTIMANE STAVO STUDIANDO JHAVA E MI 
SONO TROVATO UN  PO SPAESATO QUINDI HO FATTO PASSO INDIETRO E HO STUDIATO 
PRIMA IL C CHE HO TROVATO FACILE POI SO PASSATO AL C++ (FATTO IN 3 GIORNI) E 
ORA STO STUDIANDO IL JAVA AVANZARTO HO INTENZIONE DI FARE LE APP ANDROIDE E 
POI VENDERLE E GUADAGANCCI TANTI SOLDI APPENA PRONTO TI FARO SAPERE. PER I 
BYTE DEL DNA DIPENDE DA CHE TIPO DI PROGRAMMA USI E DAL LINGUAGGIO DI 
PROGRAMMAZIONE PER S. SE USI IL C O IL JAVA A DEVI COMUNQUE IMPORTARE TUTTE 
LE LIBRERIE (DLL IN WINDOWS) CHE OCCUPANO UN SACCO DI SPAZIO 
 

 
www.ias.ac.in/pubs/splpubs/pjubileebook/231.pdf
 
 
Grazie, me lo leggo in pausa pranzo.
 
***
 
MOSTAI IN PAUSA LAVORO?

 AL C++ (FATTO IN 3 GIORNI) E  ORA STO STUDIANDO IL JAVA
 
Cala il fiasco trinchetto.
 
Per passare alla programmazione ad oggetti (java, C++, net,
python) lo sai solo tu perche' debba essere passato dal C
il cui unico apprendimento utile potrebbe essere la
gestione dei puntatori.
 
Dato poi che il codice gestito come la memoria gestita
occupa la stragrande maggioranza della programmazione in
net (garbage collector) ma anche in java, appare ovvio che
tu stia scrivendo stronzate.
 
 

 AL C++ (FATTO IN 3 GIORNI) E  ORA STO STUDIANDO IL JAVA
 
Cala il fiasco trinchetto.
 
Per passare alla programmazione ad oggetti (java, C++, net,
python) lo sai solo tu perche' debba essere passato dal C
il cui unico apprendimento utile potrebbe essere la
gestione dei puntatori.
 
***
 
IGNORAnte PRESUNTUOSO.. IO PROGRAMMO FACILMENTE IN LINGUAGGIO MACCHINE DEL 
C64 E HO REAlizzato MOLTI GIOCHI E UTILITY CHE ANCORA OGHGI SI TROVANO NELLE 
COLLECTION PERO NOPN AVEVO MAI STUDIATO ALTRI LINGUAGGI (SOLO PHP CSS E 
ROBAccia simile) QUINDI PRIMA DEL JAVA OCCORREVA UN A COSA INTERMEDIA COME 
IL C CHE PER INFORMAZIONE E IL LINGUAGGIO ANCORA OGGI PIU UTILIZZATO AL 
MONDO SEGUITO DA JAVA E C++ ALLA TERZA POSIZIONE INFORMATI MEGLIO LA 
GESTIONE DEI PUNTATORI E COSA ELEMENTARE MA IO SONO ABITUATO A USARE 
DIRETTAMENTE I REGISTRI DI MEMORIA DELLA CPU (ACCUMULATORE ECC) E MI FA 
SKIFO LAVORARE SULLA RAM
 
Dato poi che il codice gestito come la memoria gestita
occupa la stragrande maggioranza della programmazione in
net (garbage collector) ma anche in java, appare ovvio che
tu stia scrivendo stronzate.
 
***
 
JAVA MI FA SKIFO E UN LINGUAGGIO DI MERDA ADATTO AGLI IGNORANTI COME TE CHE 
NON SANNO GESTIRE LA MEMORIA MA SONO OBLIGATO A USARLO PER SVILUPPARE 
FANTASDTICHE APP PER ANDROID CHE TI VENDERO A PESO D'ORO SUL MARKETY
 

 UN A COSA INTERMEDIA COME  IL C 
 
Rotfl.
 
Stai all'informatica come radicale sta alla matematica.
 
 

 
 
"x05"  ha scritto nel messaggio news:rp.54...@x05.it...
 

***
 
AHAHAHAHAH NON CAPISCI UN KAZZO!!! TE LO SPIEGO COSI: TU CHE SEI ABBITUIATO 
A LINGUAGGI FACILI TI TROVI MEGLIO A PASSARE DAL BASIC AL JAVA, IO CHE SO 
ABITUATO A LINGUAGGI ESTREMI (LINGUAGGIO MACCHINA PURO) SE VOGLIO FARE PASSO 
INDIETRO NON VADO SU QUELLO PIU FACILE (JAVA) MA BENSI SU QUELLO A LIVWELLO 
MEDIO (C) PER PIOI PASSARE AL PIU FACILE JAVA
 
CAPISCI SIAMO DIAMENTRALMENTE DIVERSI TU SEI UMANO IO MOLTO PIU AVANZATA 
(RAGGIONO A LIVELLO MACCHINA)
 

 
 
"PokerPro781"  ha scritto nel messaggio news:kd0tfh$371$1...@tdi.cu.mi.it...

***
 
SIGNIFICA CHE IO EPR COMPRENDERE CIO CHE FA LOP JAVA DEVO SAPERE COSA 
ACCADER NELLA MEMORIA E NON HO MODO DI SAPEERLO COKL JAVA PERCHE FA TUTTO 
AUTOMATICAMENTE E QUINDI FA SKIFO APPENA AVRO FATTO DELLE APP TI MANDO LA 
LISTA COI PREZZI FARO ANCHE UN LETTORE DI NEWSGOUP EFFICIENTE PER ANDROID 
CHE MANCA SUL MARKET 
 

 Così giusto per curiosità ... Qualcuno di voi ... lo sa?
 
Che intendi per "traccia genetica", esattamente ? 
Non capisco bene.
 
Comunque il DNA e' un vero e proprio linguaggio, ossia un modo 
per trasferire informazione (se lo sai leggere, ovviamente).
 
Perche' vedi : 
 
il DNA e' modellizzabile (cioe' : e' fatto come) in due binari del
treno con le traversine. Ok ? 
 
Allora ci sono 4 tipi di MEZZE traversine diverse nel DNA e cioe'
Adenina, Timina, Citosina, Guanina (A,T,C,G). Sono elementi chimici
diversi.
 
La MEZZA traversina Adenina si lega (per formare una traversina 
intera) solo alla Timina, e la Citosina solo alla Guanina. 
E se vedi il binario in orizzontale, A "sotto" e T "sopra" e' 
diverso da A "sopra" e T "sotto", e questo vale anche per 
le altre due.
 
Un gene e' un pezzo di lunghezza data del DNA (non ricordo adesso
quanto e' lungo, ossia quante traversine abbia) e in base a quanto 
detto sopra potrebbe ad esempio essere cosi' : 
AT, TA, CG, GC ... E' una sequenza di simboli simile all' alfabeto
morse : ti "parla", lo vedi ? Fai questo e fai quello.  
 
Un gene regola certe funzioni del corpo. Per esempio supponi
che un gene (e solo uno, e quel gene, ossia quello specifico pezzo
di DNA posto in quella precisa posizione : ossia un pezzo di binario
che comincia ad es. dall traversina 1000 alla traversina 1001)
regoli il colore degli occhi.
 
Facciamo finta che il gene sia composto da sole 2 traversine.
Allora queste possono essere solo le seguenti : 
 
AT, TA
TA, AT
CG, GC
GC, CG
AT, GC
AT, CG
TA, GC
TA, CG
GC, AT
 
 
 
 
 
 

Il giorno lunedì 14 gennaio 2013 13:28:11 UTC+1, Massimiliano Catanese ha scritto:
(omissis) 
 
Scusa mi e' saltato il post. Vabbe' ma tanto non frega una sega 
a nessuno, immagino. Ciao.


Ahah una delle cose più sensate che tu abbia mai scritto. L'applicassi più spesso questo NG sarebbe migliore.

 ha scritto nel messaggio 
news:kd0tj8$393$1...@tdi.cu.mi.it...

CONOSCI IL TURBO PASCAL? E' ROBBBA VECCIA... 
 
 

 
 
"Pinco Pallino�"  ha scritto nel messaggio 
news:50f41d9f$0$13273$4faf...@reader2.news.tin.it...

***
 
CERTO LO INSEGNAVANO A SCUOLA NEGLI ANNI 90. UN SERVE A UN CAZZO 
 


AMARCORD...
Mi sembri bolognese...come il rag�!
 


Ma sai cosa è un database?
Che c'entra il linguaggio?
 
Un programma che legge i dati lo puoi scrivere anche in dialetto 
bergamasco...
Ma a me interessava capire la dimensione del tracciato record... grosso 
modo.
La struttura di una tabella...
Non certo come fare l'interfaccia o le routine per il recupero dei dati.

 Qualcuno di voi ... lo sa?
 
 
il bigliettino da visita " scommetto punto e trattino, impari a
saltare " è passato, ora sto di nuovo su The~Parliament, vorrei anche
stampare un po' di copie " Aqueen "
http://www.youtube.com/watch?v=enLLayYncPI
 
 
ciak
riccardo

 Qualcuno di voi ... lo sa?
 
Chiedilo a Balanzone ernesto ahahahahahah 
 

 SACCO DI SPAZIO
 
 
Ma sai cosa ï¿œ un database?
Che c'entra il linguaggio?
 
*** CERTOC HE LO SO ORA TU DIMMI COSA FAS QUESTO PROGRAMMA IN LINGUAGGIO 
MACCHINA PURO E TRADUCIMELO IN UN TUO LINGUAGGIO A PIACERE OK?
 
00100111101111011111111111100000
10101111101111110000000000010100
10101111101001000000000000100000
10101111101001010000000000100100
10101111101000000000000000011000
10101111101000000000000000011100
10001111101011100000000000011100
10001111101110000000000000011000
00000001110011100000000000011001
00100101110010000000000000000001
00101001000000010000000001100101
10101111101010000000000000011100
00000000000000000111100000010010
00000011000011111100100000100001
00010100001000001111111111110111
10101111101110010000000000011000
00111100000001000001000000000000
10001111101001010000000000011000
00001100000100000000000011101100
00100100100001000000010000110000
10001111101111110000000000010100
00100111101111010000000000100000
00000011111000000000000000001000
00000000000000000001000000100001 
 

 Chiedilo a Balanzone ernesto ahahahahahah
 
una traccia non da' il tracciato ovvero " esistenza " per quella cosa
lì ci vuole una cellula.
una traccia è un bastoncino di amminoacido il quale insieme ad altri
due si muove nella sua danza a saltelli per cadere su se stesso in un
progressivo movimento: la vita.
http://www.burghhouse.org.uk/events/exhibitions.aspx
 
Minimalist Metropolitan Infinitive Momento
basta con le chiacchiere metropolitane, ora addirittura la morte nera,
voglio essere infinito: clonato!
 
ciak
riccardo
 
 
 


Per quale cpu ï¿œ scritto?
E' scritto a 8/16/32/64 bit?
 
 
cmq questa ï¿œ proprio una pagliacciata...
hanno inventato i disassembler... lo sai?
O pensi di programmare ancora con gli interruttori...
 
ti facevo meno idiota... mi sbagliavo!
 

 
 
"Geppo il Folle"  ha scritto nel messaggio 
news:kd2v7f$plu$1...@dont-email.me...

STUPIDOTTO ESSENDO RIGHE COMPOSTE DA 32 NUMERI SECONDO TE QUANTO CAZZO DI 
BIT SONO? E UN 32 BIT NO?
 
cmq questa ï¿œ proprio una pagliacciata...
hanno inventato i disassembler... lo sai?
O pensi di programmare ancora con gli interruttori...
 
IO SUL C64 PROGRAMMAVO IN BINARIO NON USAVO MANCO I DECIMALI O ESADECIMALI 
COSI AVEVO IL VANTAGGIO DI NON DOVER CALCOLRARE I BIT MA AVEVO GIA UN 
DISEGNO DEL MODLELO
 
ti facevo meno idiota... mi sbagliavo!
 
AHAHAHAHAHAHAHA
 
CMQ IL CODICE SERVE A  calcolaRE e stampaRE la somma dei quadrati dei primi 
100 interi
 
ECCO LA SUA TRADUZIONE IN ASSEMBLY:
 
.text
.align 2
.globl main
main:
subu $sp, $sp, 32
sw $ra, 20($sp)
sd $a0, 32($sp)
sw $0, 24($sp)
sw $0, 28($sp)
loop:
lw $t6, 28($sp)
mul $t7, $t6, $t6
lw $t8, 24($sp)
addu $t9, $t8, $t7
sw $t9, 24($sp)
addu $t0, $t6, 1
sw $t0, 28($sp)
ble$t0, 100, loop
la $a0, str
lw $a1, 24($sp)
jal printf
move$v0, $0
lw $ra, 20($sp)
ddu $sp, $sp, 32
jr $ra
.data
.align 0
str:
.asciiz "The sum from 0 .. 100 is %d\n"
 
LO CAPISCI ORA O PER TE E ANCORA ARRABO? TE LO RISCRIVO IN BASIC? 
ROTFLLLLLLLLLLLLLLL
 
 


LOL
 
	    int n = 0;
             double sum = 0;
             for (n = 1; n <= 100; n++)
             {
                 sum += n * n;
             }
 
             System.Windows.Forms.MessageBox.Show("sum:" + sum);

 L'applicassi più spesso questo NG sarebbe migliore.
 
Se tu tirassi le cuoia, poi, il miglioramento sarebbe 
ancora piu' evidente.
 
 

(reduce + (map #(* % %) (range 1 100)))

 
 
"Cicap"  ha scritto nel messaggio 
news:4d5f36b9-c0b3-4912...@googlegroups.com...
 
(reduce + (map #(* % %) (range 1 100)
 
***
 
qQUINDI HO DIMOSTRATIO CHE VOI 2 SIETE SUPERFICIALI E CAPIRE SOLO IL BASIC 
INVECE IO SONO MOLTO PIU INTELIGENTE E VADO IN PROFONDITA NELLA 
PROGRAMMAZIONE COSI COME ANZCHE NELLA POLITICA. E IO VOTO SILVIO BERLUSCONI 
APPUNTO PERKE HO STUDIATO BENE LA POLITICA E SO CHE LUI E MEGLIO DI TUTTI I 
LADRI DELLA SINISRTRA
 
)) 
 


Sei sempre un genio! Non c'e' niente da fare!
 
:-)
 
 

 (reduce + (map #(* % %) (range 1 100)))
 
Bello questo!
Che linguaggio �?
:-)
 


Ah perchè quello sopra sarebbe basic?

 due si muove nella sua danza a saltelli per cadere su se stesso
 
 
Spiace per la Fiorentina, i viola presero tre bastoncini e la squadra
cadde su stessa, eliminata dalla Coppa Italia contro la Roma; i tiri
di Aquilani, Borja Valero e Quadrado, meritavano più fortuna,
purtroppo la scienza calcio laseromania foot-ball play station non si
risparmia nienTO, il calcio scommesse produce assai ricchezza.
 
Ed anche questa è vista in quel di Dante, rimuda Riccardomustodario è
il più grande artista d'ogni tempo e dove.
 
ciak
riccardo


 compressione.
 
In merito agli algoritmi di compressione, mi hai ricordato una storia 
del 2006. Cercavo lavoro e bussai alla porta di questo tizio qui :)
http://www.inf.fu-berlin.de/inst/ag-ki/rojas_home/pmwiki/pmwiki.php?n=Main.HomePage
 
 
 
Era l'anno in cui cercava rinforzi per il suo gruppo e il progetto era 
l'auto autonoma (il modello su cui stava lavorando era quello di destra 
nel banner).
http://autonomos.inf.fu-berlin.de/
 
 
Come colloquio di lavoro (che alla fine duro' quasi 3 settimane) il 
tizio mi chiese di ideare un modello migliore di sensore rotante.
 
E' quel tronco di cono ribaltato che vedi sul tetto delle due auto. 
Quell'aggeggio altro non e' che un laser a impulsi che ruota (ruotava) 
a 30 Hz. La luce riflessa viene catturata da delle ottiche e processata 
on-the-fly, di modo che l'auto riconosca gli ostacoli e possa prendere 
decisioni per evitarli.
 
Il throughput era ovviamente importante. Come fare a migliorare la 
percezione degli ostacoli senza dover montare dentro l'auto un cluster?
 
Allora pensai a due cose: rilevare la polarizzazione della luce 
riflessa (per poter distinguere non solo la posizione dell'ostacolo, ma 
anche il tipo di ostacolo) + un sistema ottico che, come un mirino 
adattabile, scartasse gli ostacoli meno importanti e si concentrasse su 
quelli ritenuti importanti.
 
La prima parte era immediata, la seconda meno.
 
Mi venne la seguente idea. Vedi questa?
http://personalpages.manchester.ac.uk/staff/p.dudek/projects/scamp/scamp.jpg
 
 
E' un'esempio di "programmable focal plane" (array). Ogni singolo 
tassello e' singolarmente programmabile. L'avrei montata dietro (e non 
sul) al piano focale del sensore, di modo che l'immagine dell'ostacolo 
venisse proiettata (ancorche' ribaltata) sulla array.
http://personalpages.manchester.ac.uk/staff/p.dudek/projects/scamp/focal-plane.gif
 
 
 
Algoritmo:
- 1° frame a risoluzione bassa (tipo settori di 9x9)
- 2° frame: a seconda dei settori "interessanti" (o interessati, da un 
certo tipo di luce), si istruisce la array di aumentare la risoluzione 
solo in una parte dell'immagine e trascura gli altri. L'effetto "mirino 
dinamico"
- 3° e cosi' via ...
 
Non fu mai realizzato da me (ne' ottenni il lavoro), poi non so. 
Secondo me l'idea non era malvagia. Ci sarebbe potuto essere un 
problema di latenza:
 
1) dati i 30 Hz / 2*Pi, quanti frame erano necessari per adattare 
l'array sull'immagine dell'ostacolo, prima che uscisse dal fuoco causa 
rotazione?
2) quale distanza massima e minima per l'ostacolo?
 
Secondo me qui ci si sarebbe potuti sbizzarrire molto ottimizzando l'algoritmo.
 

 - 3° e cosi' via ...
 
Così via un bel corno, quello ieri l'altro ha rotto due frame. Due
quadri non sono in esposizione ed ora devo acquistare altre due clip
frame etc. Ha avuto il coraggio di asserire avevo procurato una
scatola rotta, la medesima gliela ho lasciata anche quando siamo
usciti dall'auto per andare in galleria, allora è stato più accorto e
si è reso conto la scatola era sana. Poi due persone sono entrate da
una porta secondaria, blindata, la quale doveva essere chiusa,
ridevano, sembravano due fantasmi, allora ho pensato: il quadro del
Parlamento, eventualmente, ha un solo fantasma.
neurino ma tu sei uno zombie?
 
ciak
riccardo


 venisse proiettata (ancorche' ribaltata) sulla array.
http://personalpages.manchester.ac.uk/staff/p.dudek/projects/scamp/fo.
..


 neurino ma tu sei uno zombie?
 
Non lo escluderei.
Alle volte mi sveglio con un alito da oltretomba che non ti sto a dire.
 

 impulsi che ruota (ruotava)  a 30 Hz.
 
A quanto mi risulta (ma dovrei controllare) le ricerche per
l'utilizzo in questo di laser stanno continuando e mi pare
che l'audi stessa abbia un prototipo con un laser montato.
 
Sempre a cazzotto, mi sembra pero' sia utilizzato per la
scansione 3d con algoritmi di collisione virtuale il cui
principio e' quello classico della collimazione di oggetti
dei game.
 
Oltre a questo, una parte essenziale e' la rilevazione di
movimento e il calcolo dell'eventuale oggetto in movimento.
 
Se non  mi risulta male, con la sola scansione 3d si
ottiene un oggetto monco e per fare le cose ben fatte,
occorrono una serie di sensori da affiancare alle
rilevazione 3d.
 
Con la mia piccola esperienza per la parte di automotive di
cui mi occupo e in relazione allo sviluppo di un sistema di
gestione integrale, questa parte e' stata risolta con
l'interazione tra diversi sensori (ridondanti) su linea
tcp/ip.
 
Il sistema interroga ogni tot di tempo l'intero range di
ip, decodifica il segnale sia digitale che analogico
(4-20mA) riconosce il tipo di sensore e lo confronta con il
resto del gruppo che e' deputato ad un determinato compito.
 
 

 Alle volte mi sveglio con un alito da oltretomba che non ti sto a dire.
 
rivolgiti a Bersani acqua basica che ristabilisce equilibrio tra i
sali e pepe corporei.
ma che fine ha fatto Vanolone?
 
ciak
riccardo
 

 Alle volte mi sveglio con un alito da oltretomba che non ti sto a dire.
 
Lo presentiamo a John Dillinger? verrebbe fuori un thread interessante
saluti
mm
 
-- 
 
 
questo articolo e` stato inviato via web dal servizio gratuito 
http://www.newsland.it/news
 segnala gli abusi ad 
ab...@newsland.it
 
 
 

 Lo presentiamo a John Dillinger? verrebbe fuori un thread interessante
 
Preferisco di gran lunga il primo, per la leggerezza della vita che 
appare dai suoi folli interventi. Dillinger invece e' prete dentro, ci 
tiene a fare le prediche. Non fa per me e non si rende giustizia a 
Sirepopemundo-o-quello-che-e', a mio parere.
 


 
gwbasic?
 

 appare dai suoi folli interventi. 
 
Concordo sulla leggerezza, ma faccio fatica  farmi piacere gli utenti
-fobi, 
nel caso di remunda omofobi.
