Newsgroup: it.lavoro.informatica
Titolo: Lavorare nella bioinformatica

Ciao. Vorrei sapere se qualcuno di voi lavora in ambito bioinformatico. Vi
faccio questa domanda perchè un'amica biologa mi ha riferito che nel loro
settore esistono questi famigerati bioinformatici, che in realtà di
informatica non sanno nulla, perchè provengono tutti dalla biologia.
Conoscono solo database e un po' di C, se proprio sanno tanto conoscono
anche PERL. Gli enti di ricerca avrebbero bisogno di progettisti software
veri e propri e non di queste "figure" ibride che alla fine sono solo in
grado di fare un lentissimo e sporchissimo datamining, ma non sanno
sviluppare software di simulazione o altro! Pensavo di propormi in questo
settore, ma io di biologia non so nulla. Ecco, giusto per sapere, qualcuno
di voi ci lavora? Grazie 
-- 
questo articolo e` stato inviato via web dal servizio gratuito 
http://www.newsland.it/news
 segnala gli abusi ad 
ab...@newsland.it


Putroppo non ne so nulla ma e' un settore intrigante! Se sai di
qualche occasione di lavoro dalle parti di Ge o Mi e  vuoi un
concorrente in + ..;)

 settore, ma io di biologia non so nulla.
Incompetenti per incompetenti, non pensi che sia più probabile che
preferiscano tenersi quelli che hanno adesso?
bye!

 di voi ci lavora? Grazie 
Esistono dei software che dalla modellazione UML generano direttamente 
il codice (a volte utilizzando una cosa che si chiama morfometria). Sono 
stati inventati apposta perchè a volte è difficile scrivere il codice di 
un sw che deve simulare l'iterazione di N proteine  o effettuare 
un'analisi di una mutazione cancerogena. Non mi sembra sia un campo 
"aperto" a chi di biologia sa niente (o "poco" o anche "abbastanza"!).

A proposito, sento parlare molto bene di Trackwise,
qualcuno lo conosce ?
Ho scritto e chiesto una brochure: mi hanno scritto dicendo che bisoga
contattarli  telefonicamente... ma sono in ISRAELE !
Grazie

 Ciao. Vorrei sapere se qualcuno di voi lavora in ambito bioinformatico. 
Io spesso lavoro in ambito dioinformatico, tipicamente quando non
funziona qualche servizio critico...

 funziona qualche servizio critico...
Ma ROTFL !!!


è un gestionale per il workflow aziendale , c'entra una fava con la 
bioinformatica. 

NC ha scritto:

:-D

  ma io di biologia non so nulla.
quindi non le hai.
Ora non voglio fare il saccente, ma le barriere d'ingresso non sono
cosi' semplici, e non solo pratiche, ma veramente di conoscenze di
base. Per poter lavorare in ambito bioinformatico devi saperne sia di
biologia che di informatica. Poi dipende dalle mansioni che avresti,
ma di solito non puoi prescindere da uno dei due.
Che ne so, potresti lavorare con lo spin labeling per particolari
molecole di un tessuto, per classificarle. Ma se non sai nulla della
Larmor Frequency, il biologo deve passare mezza giornata a spiegarti
come funziona lo spettrografo, e visto che lui lo conosce solo in
pratica (in realta' un fisico saprebbe darti una spiegazione
ragionevole) non ha nessuna voglia di spiegarti prima la biologia e
poi arrancare in qualche spiegazione sulla fisica, a meno che tu non
gli possa portare un GROSSO valore aggiunto (cosa poco probabile nel
99% degli informatici che conosco).
Di contro, un biologo che si arrangia con un po' di informatica, sa
benissimo su cosa sta lavorando, al massimo avra' bisogno di un
consulente informatico una tantum, giusto per settare qualche
programma, e che si occupera' *esclusivamente* dell'aspetto
informatico, perche' e' quello di sua competenza. Di certo non puoi
candidarti per un lavoro per il quale le competenze non le hai. Mi
sembra la base! ;-)

 ha scritto nel messaggio
news:47a8b0de$0$36441$4faf...@reader5.news.tin.it...

super ROTFL

 quindi non le hai.

Devo smentirti su un aspetto. Se vedi le offerte di lavoro all'estero, in
questo campo, non cercano biologi ma informatici. Vogliono persone esperte
in programmazione, basi di dati, modellazione UML, ecc... Le offerte di
lavoro in Italia cercano biologi esperti di informatica, ma sai bene che
il biologo esperto di informatica "vera" non esiste. E' che spesso si
confonde l'informatica con la conoscenza di excel...
Insomma io non penso che le conoscenze di biologia siano fondamentali, da
quello che mi hanno raccontato bisogna trattare dati. Mi chiedevo solo che
tipi di dati sono, ossia se un non esperto di biologia li sa interpretare.


 tirzanello ha scritto:


Il valore aggiunto che può dare un esperto di informatica è la sua
capacità di sintesi e analisi algoritmica. Tutti i problemi (o quasi
tutti) di  bioinformatica sono classificati come [50] o maggiori per chi
ha dimestichezza con la notazione di Knuth. Non c'è bisogno di essere dei
super esperti in biologia, ma ogni corso di bioinformatica all'estero
prevede una  propedeuticità di biologia ad un livello base, teoria dei
segnali e calcolo delle probabilità ad un livello discreto. Esperti di
information retrival o extraction sono molto richiesti in questo campo (
ma non italia, ovviamente).


 tipi di dati sono, ossia se un non esperto di biologia li sa interpretare.
Beh, di "bio" ne so poco, o almeno ho in archivio una conoscienza
molto specifica e circoscritta (diciamo ad alcuni tipi di
spettrografie). Ma di certo non basta un post o un thread per
spiegarle. Detto alla carlona si tratta di confrontare le risposte a
degli stimoli ai protoni della molecola da analizzare, per vedere se
lo spettro di una data molecola "assomiglia" a quello campione. Ovvio
che se non sai cosa c'e' dietro puoi fare delle cappelle mostruose
misinterpretando dati (e reiterando le tue misinterpretazioni nei tuoi
algoritmi). Certo che se ti fai un bel background in biologia il
discorso cambia. Ma ti deve piacere molto, altrimenti sono ca$$i
amari ;-)

 ha dimestichezza con la notazione di Knuth.
dove hai preso questa classificazione? mi sembra azzardata!

tirzanello ha scritto:



Introduction to Bioinformatics,Arthur M.Lesk,Oxford Press, forse è un
libro un po vecchiotto..


 da una tesi sull'argomento?
su cosa vorresti fare la tesi?

 da una tesi sull'argomento?
come dicevo nell'altro post, bioinformatica non e' esattamente il mio
campo (anche se non discosta tantissimo). Comunque, IMHO, per far bene
devi avere una grossa passione, ma veramente grossa, perche' gli
ostacoli e le difficolta' sono tante. Non e' una cosa che si
improvvisa, si costruisce in anni di sacrifici. E comunque devi essere
disposto a spostarti: in italia (per quello che so) c'e' poco, e
sicuramente c'e' poco come formazione. Se veramente ti piace, potresti
provare a dare un occhio agli esami di Biologia, e magari farne
qualcuno, e' un buon inizio per farti una base, e forse l'unico che
non richiede spostamenti troppo grossi. Ma non ti illudere pero': la
strada e' lunga e devi *veramente* volerla portare sino in fondo.

 strada e' lunga e devi *veramente* volerla portare sino in fondo.
e comunque essendo una cosa molto specifica, non ti fare neanche
troppe illusioni sul "dopo", perche' te la devi vedere con gente
*veramente* in gamba (i fisici sono i peggiori/migliori)! E
perche' (secondo la mia esperienza) e' una cosa per la quale inviando
CV non si va avanti, per andare avanti devi avere i contatti giusti, e
rompere le scatole direttamente ai potenziali datori di lavoro, che
sicuramente non stanno in italia, e magari neanche in Europa. Quindi
IMHO e' una cosa che deve veramente piacerti per poter aver successo.
Poi, parlo ad intuito: ripeto che di bioinformatica ne so poco, ma
questa e' la mia impressione.