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Titolo: SW per stimare energie di attivazione ed energie libere di reazione

Sarà già stato chiesto e risposto, ma siccome nel ramo SW da 
un anno all'altro può cambiare molto ...
Siete a conoscenza di un SW FREEWARE (e che giri anche su 
Winzozz) per stimare la variazione di energia libera di una 
reazione e la corrispettiva energia di attivazione ?
Si intende che sia possibile disegnare molecole e/o 
importare le strutture esportabili da altri pacchetti comuni 
(tipo chemsketch o chemdraw).
GRazie di ogni dritta e segnalazione
Ah ... poi magari qualche dritta futura ...
ciao
Soviet

Programmi ce ne sono, ma in genere non possono venire usati a scatola
chiusa. I più noti programmi che fanno i conti sono GAMESS e Gaussian,
entrambi possono essere usati attraverso un'interfaccia grafica. Una
buona interfaccia grafica per entrambi è Chem3D presente nel pacchetto
ChemOffice (solo che non è free).
Altro pacchetto software, che comprende sia interfaccia grafica che
programma per fare i conti è SPARTAN (neppure questo è free).
Il calcolo dell'energia libera di reazione per reazioni in cui tutte
le specie chimiche sono in fase gassosa è relativamente semplice, la
procedura è la seguente:
1. Scegliere il metodo e basis set con cui eseguire i calcoli
2. Ottimizzare la geometria di tutte le molecole con metodo e basis
set selezionati
3. Calcolare energia di punto zero e correzione termica per ogni
molecola
4. Fare la somma algebrica di tutti i contributi
In soluzione le cose sono più complesse.
Per l'energia di attivazione è più difficile. Sia GAMESS che Gaussian
hanno subroutine in grado di individuare lo stato di transizione di
una reazione, da cui si può risalire all'energia di attivazione. Per
il calcolo dell'energia dello stato di transizione i metodi buoni però
sono pochi.
Secondo me ti sarebbe utile la lettura del testo "Essentials of
Computational Chemistry - Theories and Models" C.J.Cramer - Wiley
È un libro molto accessibile e ben fatto.
http://rapidshare.com/files/127768591/Essentials_Of_Computational_Chemistry_Theories_And_Models.Cramer.C.J.2002.pdf.rar

Procellaria ha scritto:
 > Altro pacchetto software, che comprende sia interfaccia grafica che
 > programma per fare i conti è SPARTAN (neppure questo è free).
Visto che hai citato programmi non free, mi permetto di segnalare
il sofisticato HyperChem Pro 8.0. Vedere "Calculation of Entropies
and Free Energies" in questa pagina:
www.hyper.com/Products/HyperChemProfessional/75Overview/tabid/361/Default.aspx
Sempre da quella pagina, ci si può scaricare una presentazione
PowerPoint che ne illustra tutte le funzionalità di base.
Qui si trova l'elenco dei loro software per chimici:
 
http://www.hyper.com/Products/tabid/354/Default.aspx
Btw, a livello puramente didattico-amatoriale ed entro i limiti
del numero di specie chimiche selezionabili dal menu a tendina,
questo calcolatore online potrebbe essere di qualche interesse:
 
http://www.shodor.org/UNChem/advanced/thermo/thermocalc.html
(nel frame più in basso a sinistra si trovano altri calcolatori).
Bye,
   *GB*

 
http://rapidshare.com/files/127768591/Essentials_Of_Computational_Chemistry_Theories_And_Models.Cramer.C.J.2002.pdf.rar
(:8)
L'unica cosa divertente è che mi chiedo cosa consideri un 
testo INACCESSIBILE !
Cmq grazie delle informazioni
ciao
Soviet

Appena ho tempo guardo tutto. Intanto ringrazio anche te per 
le numerose segnalazioni.
P.S. negli anni 90 avevo un hyperchem che fungeva (ora non è 
compatibile con XP), ed era free ... Ma è ancora Free ?
ciao
Soviet
*GB* ha scritto:


 testo INACCESSIBILE !
Mi ricordo che qualche anno fa Mauro Prencipe ti aveva consigliato il
McWeeny come testo introduttivo alla chimica quantistica, un consiglio
veramente scellerato, come primo approccio alla materia quel testo è
proprio inappropriato.
Ciao.



me ne sono procurato una copia, quando lo provo farò sapere. Come
primo impatto non sembra molto user-friendly.

 proprio inappropriato.
Azz che memoria di ferro ! Io questo fatto non me lo 
ricordavo nemmeno più (anche se mi ricordo di Prencipe, che 
purtroppo è tra i non pochi in gamba che non frequentano più 
il NG).
ciao



a me manca mbaudino
ciao

 ciao

 conosco.
Sto girandoci da varie ore dentro ... mi ci sono perso.
Non ho esattamente idea di cosa mi serva :-\
Paradossale che sono partito pensando che non ci fosse quasi 
niente, e mi accorgo che c'è una varietà sterminata di 
programmi.
In effetti non riesco a capire se e quale/i possa/no fare al 
caso mio (ho necessità, penserei, modeste, specie come 
precisione) ... Probabilmente è sempre il solito fatto che 
non possiedo le basi per capire il linguaggio delle 
spiegazioni, non è che non ci siano i commenti.
CUT ALL
riciao
Soviet

Che genere di sistemi intendi studiare? Se vuoi posso farti io i
conti.
Ciao

 Ciao

 > Ciao