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Titolo: 1-butene...divertente :)

http://www.flickr.com/photos/25974562@N05/2578023283/sizes/o/
Questa rappresentazione l'ho costruita con Arguslab per gli orbitali MO 1 e 
2.
Nella legenda del software (qui non risportata) il blu indica la superficie 
positiva ed il rosso negativa.
Gli atomi ibridati sp2 sono i primi due a partire da sx.
Secondo me la superficie dovrebbe essere colorata in modo inverso, proprio 
perché il doppio legame C=C l'ho messo tra C1 e C2 a partire da sinistra 
nella foto.
Quindi dovrebbe essere blu per la presenza del doppio legame.
Che ne pensate?
Fab 


Gli MO 1 e 2 sono quelli a più bassa energia, sono combinazioni
lineari degli orbitali atomici 1s degli atomi di carbonio, quindi non
hanno nulla a che vedere con il doppio legame C=C. Mi aspetto che sia
invece l'HOMO a darci qualche informazione sul doppio legame.

invece l'HOMO a darci qualche informazione sul doppio legame.
concordo, ma rimane il perché del potenziale ripartito in senso inverso...
Fab 


Potenziale? Quella è una rappresentazione di due orbitali molecolari,
cosa c'entra il potenziale?

cosa c'entra il potenziale?
Forse non l'ho specificato errando. Quella č la superficie elettrostatica 
ottenuta con Argus.
Fab 

 Fab
No, credo che tu abbia detto bene nel primo post: quelle sono le
rappresentazioni dei due orbitali molecolari a minore energia del
butene. Sono gli MO del core, il primo non ha nessun nodo, il secondo
ha una superficie nodale che divide la molecola in due. Non c'entra
con il potenziale elettrostatico.


Per una rappresentazione del potenziale elettrostatico del butene puoi
vedere qui:
http://www.flickr.com/photos/procellaria/2580870439/
Ottenuta sempre con ArgusLab

Ottenuta sempre con ArgusLab
ehm...posso chiderti come l'hai ottenuta? :)
Fab 

 Quindi dovrebbe essere blu per la presenza del doppio legame.
Ho detto una cretinata...sono entrato nel pallone.
E' tutto ok..anche io ora mi sento meglio.
:-) 


I passi da fare sono:
1. Ottimizzare la geometria usando AM1 o PM3, un po' meglio AM1
*Disegnare la molecola
*Andare nel menù Calculation
*Selezionare Optimize Geometry
*Nella finestra che si apre selezionare AM1 o PM3 nella sezione
Hamiltonian e far partire il calcolo
2. Calcolare la mappa della densità elettronica e del potenziale
elettrostatico per la geometria di equilibrio
*Vai nel menù Calculation
*Seleziona Energy
*Nella finestra che si apre, nel riquadro Calculate Proprieties
schiaccia il pulsante Surface Proprieties
*Nella finestra che si apre spunta Ground State Electron Density e
Electrostatic Potential e schiaccia il pulsante OK
*Ora tornerai nella finestra del calcolo single point, schiaccia Start
per far partire il calcolo
3. Rappresentazione del potenziale elettrostatico
*Ora hai a disposizione i dati necessari, devi solo metterli in
grafico
*Vai nel menù Surfaces e seleziona Make Surfaces
*Ti si apre una finestra divisa in tre sezioni, nella sezione centrale
seleziona la linguetta Mapped
*Nella sezione di sinistra ci sono le cartelle con i dati a tua
disposizione, se hai calcolato solo densità elettronica e potenziale
elettrostatico solo le rispettive cartelle avranno il simbolo [+],
apri la cartella della densità elettronica e trascina l'icona che
rappresenta i relativi dati nella sezione centrale, nella posizione
Main (Grid 1).
*Apri la cartella del potenziale, sempre nella sezione di sinistra, e
trascina l'inconcina a forma di cubo in Main (Grid 2) nella sezione
centrale
*Schiaccia il pulsante Create>> in basso nella sezione centrale
*Nella sezione di destra apparirà, nella cartella Mapped, un'iconcina
colorata e opaca che rappresenta la tua mappa, selezionala e schiaccia
il pulsante Toggle Display in basso a destra, allora l'iconcina della
mappa diventerà più luminosa
*Schiaccia il pulsante OK e la mappa apparirà sullo schermo
Perché per rappresentare il potenziale abbiamo usato anche la densità
elettronica?
L'uso della densità elettronica è per comodità grafica, prendiamo una
superficie di isodensità e rappresentiamo in grafico il valore del
potenziale elettrostatico su quella superficie sfruttando i colori.
Puoi scgliere a piacimento il valore dell'isodensità, se scegli un
valore grande calcolerai il potenziale vicino ai nuclei e sarà
positivo quasi ovunque, diminuendo il valore della densità la
superficie si allontana dai nuclei. Per modificare il valore della
densità elettronica su cui viene mappato il potenziale seleziona
schiaccia il tasto destro del mouse puntando la superficie e seleziona
Modify Surface; poi modifica il valore in Contour Value.

Piů che esaustivo!
Grazie, ma non esiste un manuale per Argus vero?
Fab

 Fab
La guida integrata nel programma non è male