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Titolo: esame in vista...

nonostante anni di chimica non mi entra in testa con sicurezza il come 
identificare, nelle molecole complesse come i farmaci, se i gruppi sono 
acidi o basici.
Posso farlo solo guardando la struttura e gli eventuali doppietti 
elettronici o devo imparare a memoria tutti i gruppi , eterocicli etc e la 
loro acidit�? esiste una tabella chiara sui pka dei gruppi funzionali nelle 
molecole organiche?
Per l'individuazione dei centri chirali nelle molecole basta basarsi sul 
principio, questo carbonio � legato a 4 gruppi differenti = � chirale?
Ufff non mi sta pi� niente e ho dimenticato le basi della chimica =(!!!!
grazie a tutti
e scusate lo sfogo... 

 Ufff non mi sta più niente e ho dimenticato le basi della chimica =(!!!!


 principio, questo carbonio � legato a 4 gruppi differenti = � chirale?
A voler essere preciso, un carbonio (o un atomo) non � mai "chirale", che � 
propriet� della molecola nella sua interezza, si deve dire che � un "centro 
stereogenico" o "stereocentro" (cio� un elemento che conferisce chiralit� 
alla molecola in cui � inserito)... poi nel linguaggio spiccio si pu� al 
limite accettare ma tenendo ben presente la differenza.
Per quanto riguarda la domanda, la risposta breve � che quella dei 4 gruppi 
diffrenti non � condizione n� sufficiente (es. gli isomeri "meso" hanno due 
o pi� stereocentri ma non sono chirali perch� simmetrici) n� necessaria 
(alleni, bifenili, eliceni e varie altre molecole sono chirali senza avere 
carboni sostituiti da 4 gruppi diversi) perch� una molecola sia chirale.
E' anche vero che queste sono eccezioni, e nella maggioranza dei casi un 
carbonio con 4 gruppi diversi � una fonte di chiralilt� della molecola; se 
poi sei fai il percorso inverso, e sei certo che la molecola � chirale, in 
effetti un carbonio siffatto � un ottimo indiziato ;)
-- 
Piero
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www.flickr.com/photos/pieroprv

esiste una tabella chiara sui pka dei gruppi funzionali nelle 
molecole organiche?
A questa rispondo io, ho trovato un sito con moltissime Ka 
http://www.chem.wisc.edu/areas/reich/pkatable/index.htm
magari potrebbe interessare


si giusto, bellissima. La raccolta di Bordwell è imponente e 
anche graficamente condita ...
occhio però che la gran parte dei valori sono in DMSO (che 
consente di coprire un ampio range e sostanze non 
misurabili, undetectable in acqua, specie per acidi 
debolissimi/basi fortissime, ma cmq vari ordini di grandezza 
diversi dalla scala in acqua). Ma non è la scala acquosa.
per mero esempio, l'acqua stessa, misurata "in acqua", 
prende il valore un po' convenzionale di 15,7 (pKa) -> in 
DMSO il dato risulta 31,4
t-BuOH : in acqua attorno a 18, in DMSO 32,2
Non so se esista una formula semplice di conversione tra le 
due scale ... in realtà temo non ne esista nemmeno una 
complessa, perché di certo sono implicate alcune variabili 
costanti (i rapporti tra le due costanti di autoprotolisi 
dei due mezzi) ed altre non costanti (il rapporto di 
stabilizzazione relativa, per solvatazione, della base 
coniugata e dell'acido coniugato, e questi non sono mai 
particolarmente semplici).
Es. l'indolo in acqua, se non sbaglio, è nella zona 14-16, 
in DMSO passa a 23. Come si nota il crollo è enormemente 
meno marcato che non per gli alcooli.
Credo sia dovuto al fatto che il DMSO di per sé è molto 
bravo a solvatare i cationi e i donatori di legame H 
(alcooli, fenoli e acidi carbossilici sono buoni donatori, 
le ammine lo sono meno), ed è inefficace nel solvatare gli 
anioni. Questo gioca contro gli alcooli.
D'altra parte la delocalizzazione interna per risonanza (e 
anche l'alta polarizzabilità intrinseca) stabilizzano gli 
anioni di per sé a prescindere dal solvente, e questo aiuta 
gli azoli aromatici (e tioli).
Il tiofenolo in acqua sta sul 7, in DMSO cade a solo 10,3
Il fenolo già (che pure un pochino risonante è) cede da 10 a 18.
l'isopropanolo crolla da 16-17 fino a 30
acido acetico (con risonanza) da 4,75 a 12,6
Per dire che, al di la di trend vaghi più o meno 
razionalizzabili, in senso quantitativo io delle facili 
correlazioni non ce le vedo -> ergo se occorrono dati 
acquosi precisi, quelli in DMSO non sono sufficienti, se non 
per stime di ordini di grandezza, e presi con le pinze come 
ho accennato per mostrare grosse differenze nei cali.
ciao
Soviet

si giusto, bellissima. La raccolta di Bordwell è imponente e
anche graficamente condita ...
occhio però che la gran parte dei valori sono in DMSO (che
consente di coprire un ampio range e sostanze non
misurabili, undetectable in acqua, specie per acidi
debolissimi/basi fortissime, ma cmq vari ordini di grandezza
diversi dalla scala in acqua). Ma non è la scala acquosa.
Dopo 3 ore di calcoli perchè non trovavo un confronto con le mie tabelle mi 
sono reso conto che la misurazione è in DMSO =\,
Ora mi chiedo, visto che con il DMSO si possono misurare molte più sostanze 
perchè non viene preso come standard?

 sostanze perchè non viene preso come standard ?
Prima la ragione più "stupida" : perché l'acqua è il 
solvente più comune ed importante in assoluto, e per 
convenzione tutto quello che si può riferire ad essa ci 
viene riferito.
Altra ragione meno stupida : proprio la non trasferibilità 
diretta, in realtà costringe a mantenere praticamente tante 
scale quanti i solventi utili (e nessuno vieta di costruirne 
altre, alla bisogna, almeno basandosi su relazioni lineari 
di energia libera).
Nella maggior parte delle occasioni serve esattamente 
riferirsi all'acqua e al comportamento in acqua, in tal caso 
a che servirebbe la scala in DMSO, per quanto completa ?
Inoltre, sebbene meno livellante (specie verso le basi 
forti) anche il DMSO lo è. In nessun solvente mantiene 
consistenza la misura di acidi più forti del "solvoacido" e 
di basi più forti della "solvobase".
In DMSO la solvobase è il dimsyl anion : CH3SOCH2(-)  che se 
non ricordo male avrebbe un pKa intorno a 30 (ma non sono 
poi troppo sicuro). In DMSO rimangono cmq non misurabili 
tutti i litio alchili ed arili, male gli idruri salini tipo 
potassio KH, e di nuovo sforano gli anioni di ammine 
secondarie alifatiche (LDA, LTMP) e gli ossidi salini tipo 
Na2O, BaO etc.
Spero che trovi nel PDF i pK che ti servono ... oppure 
lanciati in altre ricerche
ciao
Soviet