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Titolo: Che tipi di curve sono le Spline smooth?

Che tipi di curve sono le Spline smooth?
Io avrei pensato ad una retta calcolata con il metodo dei minimi quadrati.
Spiego
In lab facciamo un'analisi (TPA) che prevede 6 punti di calibrazione.
In soldoni avremo
Standard    X     Y
Cal 0          0      0.120
Cal 1          1      0.200
Cal 2          2      0.350
Cal 3          5      1.250
Cal 4          10    2.200
Cal 5          15    3.100
con x=Concentrazione e y = Assorbanza
Con il metodo dei minimi quadrati mi calcolo il coefficente angolare della
retta di calibrazione e quindi
mi posso calcolare la concentrazione di un campione incognito se R >= 0.97.
Sulla metodica c'è scritto di utilizzare una Curve Fit Spline smooth.
Dato però che un campione a concentrazione nota mi viene circa il doppio
forse sbaglio curva,secondo il mio capo...
Morgan

 Sulla metodica c'è scritto di utilizzare una Curve Fit Spline smooth.
Che non è un'opzione presente in Excel, probabilmente dovresti usare un 
programma tipo Kaleidagraph o Origin...
Ciao
Tex 


Grazie.

 Sulla metodica c'è scritto di utilizzare una Curve Fit Spline smooth.
Ma non credo che ne hai bisogno. I tuoi punti stanno su una retta.
-- 
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Saluti, VITRIOL

 Ma non credo che ne hai bisogno. I tuoi punti stanno su una retta.
Che ti devo dire.Leggendo su Wikipedia i calcoli mi sembrano un po troppo
complessi per un laboratorio di patologia clinica.Al limite la ditta che ci
fornisce il kit ci avrebbe dato un software per i calcoli.Attualmente "il
capo"
li fa riportando i punti  su carta milimetrata e poi...non me lo
chiedere....
Morgan


 Ma non credo che ne hai bisogno. I tuoi punti stanno su una retta.
I rapporti incrementali tra punti consecutivi non sono poi così omogenei: 
D(0-1) = 0,08
D(1-2) = 0,15
D(2-3) = 0,30
D(3-4) = 0,19
D(4-5) = 0,18
Qual'è la concentrazione del campione che hai usato come test? 
-- 
questo articolo e` stato inviato via web dal servizio gratuito 
http://www.newsland.it/news
 segnala gli abusi ad 
ab...@newsland.it

 chiedere....
http://img54.imageshack.us/img54/3871/dati0jd.png


 Qual'č la concentrazione del campione che hai usato come test?
1 mg/dl
Le assorbanze le ho inserite a memoria ,magari domani me le copio
e le posto.
Morgan


 
http://img54.imageshack.us/img54/3871/dati0jd.png
E' lei.
Le assorbanze precise magari le posto domani.
A me sembra idonea, anche il coefficente di correlazione è ottimo.
Inoltre i valori medi dei campioni incogniti rientrano nei valori attesi.
E' sto controllo che viene il doppio di quello indicato, anche ricostituito
nuovo.
Probabilmete è il primo punto di calibrazione a concentrazione = 0
che viene troppo alto.
Morgan


 e le posto.
Quali sono le unitą di concentrazione per gli standard di calibrazione?
Se anche quelli sono in mg/dl significa che hai usato lo standard di
calibrazione 1 per fare il test. In quel caso avresti dovuto ottenere come
assorbanza lo stesso valore (0,200) che avevi ottenuto nella calibrazione.
Ricordi il valore ottenuto? 
Se poi hai usato la retta per risalire alla concentrazione non avrebbe
dovuto risultarti doppia rispetto a quella nota, anzi avrebbe dovuto
risultarti inferiore. Qualcosa non torna.


 risultarti inferiore. Qualcosa non torna.
E' vero, guarda devo controllare in lab.
Domani posto i dati precisi.
Morgan


> Tex
Ciao
	Mavimo

 Le Spline sono semplici cubiche interpolate tra punto e punto... 
Le spline cubiche, forse.
Ma ci sono spline e spline.
Io non sono mai riuscito a capire quanti tipi ci sono... : )))
saluti,
Peltio
-- 
Invalid address in reply-to

Io non sono mai riuscito a capire quanti tipi ci sono... : )))
http://mathworld.wolfram.com/Spline.html
http://mathworld.wolfram.com/CubicSpline.html
Ciao
-- 
Francesco Giannici
www.mmax.org/iamr
Inviato da X-Privat.Org - Registrazione gratuita 
http://www.x-privat.org/join.php

 -- 
Dunque ,questi i valori precisi
Standard    X     Y
Cal 0          0      0.122
Cal 1          1      0.237
Cal 2          2      0.337
Cal 3          5      0.647
Cal 4          10    1.103
Cal 5          15    1.880
Il controllo viene 0.280 ed ha una concentrazione dichiarata di 1 ng/ml +/-
0.40
Lettura a 450 nm senza sottrazione del bianco.
Rivalutando i dati credo che sia il valore dello standard 5 che non va.
Certo che il controllo ha una variazione dichiarata molto alta.
Morgan


L'eq. retta è  Y = 0,1129X + 0,1002    con R^2 = 0,9889
A occhio mi sembra sballato (sovrastimato) l'ultimo valore (15 --> 1,88)
Se lo elimini , hai:
Y = 0,0977X + 0,1375  con R^2 = 0,9987  e quindi accettabilissimo,
anche se ottieni per lo standard a 1 ng/mg un valore 0,2352 e
a 0,280 corrispondono 1,458 ng/ml
Nino 

 ha scritto nel messaggio
news:awFbg.5589$cX1....@twister2.libero.it...

Infatti ottengo i tuoi stessi risultati usando solo i primi 5 calibratori
per costruite la retta
con il metodo dei minimi quadrati.Il 6° calibratore dovrebbe cadere attorno
a 1,600 per
ottenere una retta con gli stessi m e q.
Cmq ritornando alla mia domanda originale, mi sembra che impostare una curva
di calibrazione
con il metodo dei minimi quadrati possa andare bene in questo caso invece di
usare una Spline che
ammetto di non sapere impostare.
P.S.
Per chi si vuole divertire ecco i risultati misurati in doppio dei campioni
sconosciuti.
1    0.185  0.190
2    0.223  0.237
3    0.078  0.080
4    0.131  0.104
5    0.160  0.194
6    0.125  0.107
7    0.152  0.150
8    0.113  0.105
9    0.048  0.077
10  0.114  0.128
11  0.081  0.086
12  0.123  0.123
13  0.213  0.210
Morgan

Intanto prima di tutto per una calibrazione lineare spettrofotometrica
una retta con l'equazione ricavata con i minimi quadrati mi pare piu'
che sufficente.
I tuoi dati incogniti mi paiono un po' ballerini, ma probabilmente sono
cosi di loro.
La cosa piu' logica che mi viene in mente e' che la retta di
calibrazione non sia stata fatta bene o contaminata.
Fai tu le diluizioni del tpa? O vengono gia in kit? e quanto le
conservi in frigo?
Hai fatto diluizioni totali 1:2 nei samples e ti sei dimenticato di
moltiplicare per 2 i risultati?
Il metodo e' quello  del human  tissue plasminogen activator antigen
(tPA) o dell'acido teraftalico (TPA)?
Se e' il tPA che e' quello che mi sembra visto le concentrazioni in
nano i risultati che ottieni in assorbanza sembrano di piu' per una
retta a 30 ng/ml e non a 15 ng/ml.
Ciao
Andrea

 ha scritto nel messaggio
news:1148144950.6...@j33g2000cwa.googlegroups.com...

Ciao Andrea
Il TPA a cui mi riferisco è l'antigene polipeptidico tissutale dosato con un
kit della iDL
http://www.idl.se/tpacyk.asp
viene utilizzato come indice di proliferazione e quindi  nel follow-up di
pazienti
con tumore accertato.
La tecnica è in ELISA e non prevede pre diluizioni e dei campioni e degli
standard.
I dati si riferiscono ad un kit nuovo.
Morgan

 
http://mathworld.wolfram.com/CubicSpline.html
Eh, ogni tanto ci bazzico sul sito di Weisstein, ma in questo caso non 
esaurisce mica l'argomento.
Qui dice qualcosa di più:
http://en.wikipedia.org/wiki/Spline_(mathematics)
"Splines may be used for interpolation and/or smoothing of either 
one-dimensional or multi-dimensional data. Spline functions for 
interpolation are normally determined as the minimizers of suitable 
measures of roughness (for example integral squared curvature) subject 
to the interpolation constraints. Smoothing splines may be viewed as 
generalizations of interpolation splines where the functions are 
determined to minimize a weighted combination of the average squared 
approximation error over observed data and the roughness measure."
Sostanzialmente, per rispondere all'OT, una smooth spline è una spline 
adattata (e non interpolante). Ma dell'uno e dell'altro tipo se ne 
possono trovare di diversi tipi a seconda delle condizioni di 
continuità che devono rispettare (fino a quale derivata ad esempio), 
delle funzioni 'base' che compongono i vari tratti eccetera eccetera.
In particolare, nel caso delle spline interpolanti cubiche, in cui in 
ogni sottointervallo la spline è un polinomio di grado tre con derivate 
prima e seconda continue è necessario specificare due ulteriori 
condizioni se si vuole risolvere il sistema per i coefficineti 
incogniti.
Questo può essere fatto in diversi modi, ad esempio fornendo il valore 
della derivata prima ai due punti estremi (spline cubica completa), 
oppure imponendone il valore in modo più o meno arbitrario (se la si fa 
annullare si ottiene quella che si chiama spline naturale). In certi 
casi è possibile imporre una condizione di continuità su derivata prima 
e seconda in modo circolare. In altri si utilizza l'estrapolazione per 
inferire il valore della derivata prima agli estremi basandosi sui 
valori assunti nei punti interni...
Insomma, io ancora non ho capito quanti tipi di spline ci sono. : )


 Sostanzialmente, per rispondere all'OT, 
OP, non OT.
Original Poster.
: ]
