Newsgroup: it.comp.macintosh
Titolo: [Lungo]L'angolo del PhD e del PostDoc

Vorrei aprire una discussione sui software che al PhD/PostDoc
meladotato non dovrebbero mancare.
Includiamo pure software free e non, meglio se a prezzi ragionevoli o
con sconti educational.
Il perche' di questo post e' presto detto: sono stufo di avere/provare
ennemila software che non so usare o uso male o magari semplicemente
inutili. Troppo dispersivo. Vorrei pochi strumenti ma utili, di cui
approfondirne l'uso. Mi serve quindi una mano.
Inizio io con la roba che uso/usacchio (una microscoperrima parte del
software che ho installato da quando ho un mac).
Ah, io faccio simulazioni molecolari.
Scrivere e far di conto e publishing
- Iwork
- Neooffice (cosi' non siamo tagliamo fuori il mondo openoffice)
- latex e textmaker
- pdflab (free per manipolare pdf)
- latexit
Aggregatori di idee/progetti/note
- Evernote (free)
- Devon Think (se paga e lo uso poco o niente)
Grafica
- X11
- Copernicus (cattura video e immagini, free)
- ishowu HD (screencasts. lo uso per tutorials)
- Seashore (tipo gimp ma molto base)
- Geogebra (diagrammi e schemi di geometria)
- gnuplot
- xmgrace
- plot (se vi riesce di farlo funzionare bene... io non tanto)
- gimp o inkscape
Bibliografia e gestione papers
- Papers (si paga e c'e' la versione iphone/ipod)
- Mendeley (free, tipo Pages con sincronizzazione online... bello
bello)
Programmazione
- Xcode
- Komodo Edit (editor free multilinguaggio)
- linguaggi vari tipo python (con ipython)/perl/fortran/g77
Connessioni remote, ports, virtualizzazione
- VMware Fusion (se paga, ma compatibilita' con vmplayer e vmware)
- fink e/o macports
- sshfs (connessioni via ssh)
Per la chimica:
- Marvin Beans
- VMD
- Molden (via fink o macports)
- Avogadro
Quello che ancora non ho trovato per fare...
- I poster delle conferenze (sto provando la demo di omnigraffle...
vorrei qualcosa dai risultati *sburoni*, quindi no latex. Pages mi
sembra un po' limitato)
- Estrarre punti da un grafico salvato come immagine (esempio da un
articolo con un grafico di energie devo estrarne i valori numerici)
Quello che ho e non so per cosa usare.. magari voi si:
- Mellel 2.7
- MacJournal
- Devon Agent
- Text Mate (per python e' orribile...  o non capisco come fargli fare
un'indentazione decente)
ipod touch/iphone:
quickoffice (si paga)
notebooks (si paga)
evernote
papers
whiteboard
airmouse
converter
imoledraw
imolebuilder
A voi la palla
--
ilnonno


-- 
Living in Barbaropoli
http://www.barbaropoli.com


yep, lo sapevo. ma si paga comunque :)
--
ilnonno

 articolo con un grafico di energie devo estrarne i valori numerici)
GraphClick.
Vale ogni dollaro dei pochi che costa ($8).
http://www.arizona-software.ch/graphclick/
-- 
Riccardo Campana
pabel...@gmail.com
"Physics is like sex: sure, it may give some practical
results, but that's not why we do it"  (Richard Feynman)

 sembra un po' limitato)
Mah... qui vedo molti usare Adobe Illustrator. Inkscape magari ti torna
utile...


vero verissimo MA, dai un'opportunita' a mendeley, se non altro per il
servizio di sincronizzazione col tuo account online (500mb di storage
per i papers).
--
ilnonno


eccolo... mi ero riproposto di provarlo, poi persi il nome del
programma e non ci pensai piu' (uso g3data sotto linux)
ora vado a scaricarmelo, grazie :)
--
ilnonno

 - Matlab
che costicchia (a dir poco).
in alternativa (free) c'e' octave e scilab.
Ciao Jack

 in alternativa (free) c'e' octave e scilab.
Ma un disegnatore di diagrammi a blocchi che calcoli le fdt e imposti le 
simulazioni in linguaggio matlab/octave non c'è? Io leggendo una ml 
apple avevo proprio scoperto SmileLab ma in effetti mi sembra abbastanza 
diverso.
Scilab con il passaggio a 5 è molto confuso, inoltre il port per mac non 
è una priorità per loro. Per tacer del cane.*
Visti gli script che trovai per esportare uno schema db da Omnigraffle a 
varie implementazioni SQL immagino si potrebbe costruire uno script che 
esporti da Omnigraffle verso uno script octave, ma si finisce sempre a 
lavorare con Applescript ma la sintassi si arzigogola velocemente quando 
le espressioni non sono banali e Scrip Editor fa veramente pena. Ci 
vorrebbe quell'IDE per Applescript a pagamento di cui mi sfugge il nome 
ma per una esigenza del genere non vale la pena...
*il cane è l'interfaccia in questo contesto

 ilnonno
-- 
-riko

 buona parte dei pythonisti macchisti italiani.
 probailmente non capisco io. il mio problema e' che non uso solo mac
e quando modificavo il codice scritto con textmate in un editor
diverso in linux, tutta l'indentazione andava a donnine di facili
costumi. ecco perche' uso il triste komodo edit, almeno lo ho uguale
anche per linux e non mi scombussola il codice.
Se hai suggerimenti, sono tutto orecchioni aperti :)
--
ilnonno

 utile...
sto provando scribus
--
ilnonno

 è una priorità per loro. Per tacer del cane.*
si, effettivamente scilab l'ho usato sotto linux, so che c'e' il
porting su osx (via fink) ma non ho idea di quanto funzioni.
L'interfaccia di scilab fa schifo, ma tempo fa (un paio di anni
almeno) mi era stato detto da gente all'interno che la stavano
riscrivendo. Si vede che non hanno ancora finito oppure hanno mollato.
Peccato.
Ciao Jack

 riscrivendo. Si vede che non hanno ancora finito oppure hanno mollato.
No è che c'è stato un riassestamento dei team di sviluppo tra INRIA e 
chi sviluppava Scicos che se non sbaglio ora si chiama ScicosLab, questo 
in concomitanza con il passaggio dalla versione 4 alla 5.
Scicos mi pare sia rimasto al codebase 4 ma ha una versione GTK che 
dovrebbe andare senza X11 su OS X, Scilab nella versione 5 non ha come 
target il supporto a OS X.
Mi sono informato un po' perché volevo compilare la 5 ma è un macello, 
l'interfaccia ad ogni modo fa pena.

 anche per linux e non mi scombussola il codice.
Per esempio imparare a *non* usare i tab da nessuna parte. Cosa comunque
saggia e giusta, visto che sono fonte di magagne. Poi uno spazio e' uno
spazio cazzo. Quattro spazi... indovina :)
-- 
-riko


g3data e graphclick lo fanno. non c'e' nessun segmento di linea:
clicchi sugli assi per dare la scala e inizia a cliccare dei punti sul
grafico. Alla fine hai una serie di punti. poi se vuoi interpoli,
fitti, estrapoli etc., ma il programma da' solo una serie di punti.
Con lo zoom non e' poi difficile riuscire a cliccare su una linea.
--
ilnonno

 wrote:

Eeeh... lo so. Purtroppo mi ritrovo anche con codice scritto da altri
espressamente per matlab (-> usa alcuni oggetti o alcune feature
grafiche proprie di matlab) e quindi octave me lo gioco...
E qui abbiamo 5 floating per un istituto di 500 persone... (e' vero che
poi loi usano al massimo in 10/15)
d

 varie implementazioni SQL 
Quali adoperi?
-- 
ciao, Ric

 Quali adoperi?
Quello di zenspider che mi pare in origine fosse PostgreSQL e SQLite, 
l'ho modificato leggermente per MySQL.

 Con lo zoom non e' poi difficile riuscire a cliccare su una linea.
Questa e' tutta roba *manuale*. Tu vuoi un programma che lo faccia o
sbaglio? Quello che fa il tuo occhio il programma fatica tantissimo a
meno di, come dicevo un po' di messaggi fa, qualche tipo di punto facile
da individuare.
-- 
-riko

 l'ho modificato leggermente per MySQL.
Ah, immagino che ti riferisca a Graffle2SQL: lo provo.
Avevo trovato altri esempi che stabilivano la connessione con il db, ma
danno un errore in compilazione.
Ad ogni modo, un file testuale con l'SQL va pi� che bene.
PS Se ti va di condividire anche la versione per MySQL, mi farebbe
piacere riceverla.
In ogni caso, grazie della dritta.
-- 
ciao, Ric

 piacere riceverla.
Sì, non è nulla di particolare, erano piccole modifiche tipo che la 
versione SQLite aveva un drop che a mysql non piaceva oppure che usava i 
doppi apici che non piacevano, se vuoi te la mando.

On Oct 31, 9:45 am, 
r...@despammed.com
 (Enrico Franchi) wrote:

no no manuale mi va benissimo.
--
ilnonno

 doppi apici che non piacevano, se vuoi te la mando.
Grazie. Ti scrivo in privata.
Tra l'altro sto provando lo script, ma non funziona (legge correttamente
il nome degli elementi, ma poi restuisce un error "Should know the table
name by now" number -2700 from �script� to item).
O non gli piace Omnigraffle 5 oppure ci vuole Omnigraffle Pro...
-- 
ciao, Ric

 O non gli piace Omnigraffle 5 oppure ci vuole Omnigraffle Pro...
Io uso il 4.